# emapper version: emapper-2.0.1 emapper DB: 2.0 # # time: Thu Apr 13 21:31:19 2023 #query_name seed_eggNOG_ortholog seed_ortholog_evalue seed_ortholog_score best_tax_level Preferred_name GOs EC KEGG_ko KEGG_Pathway KEGG_Module KEGG_Reaction KEGG_rclass BRITE KEGG_TC CAZy BiGG_Reaction taxonomic scope eggNOG OGs best eggNOG OG COG Functional cat. eggNOG free text desc. Z1_00001 34506.g664 1.8e-195 688.3 Bilateria Metazoa 3AI1H@33154,3BXPE@33208,3DE5Z@33213,COG0468@1,KOG1433@2759 NA|NA|NA L Mitochondrial DNA repair protein recA homolog Z1_00002 529507.PMI0374 3.9e-87 327.4 Proteus ygaD GO:0003674,GO:0003824,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019159 3.5.1.42 ko:K03742,ko:K03743 ko00760,map00760 R02322 RC00100 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RH2Y@1224,1S5WH@1236,3Z16K@583,COG1546@1,COG1546@2 NA|NA|NA S Competence-damaged protein Z1_00003 529507.PMI0373 5.6e-217 760.0 Proteus lplT ko:K08227 ko00000,ko02000 2.A.1.42 Bacteria 1QTWR@1224,1RWM9@1236,3Z2GI@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_00004 529507.PMI0372 0.0 1397.9 Proteus aas GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006644,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008779,GO:0008922,GO:0009058,GO:0009987,GO:0015645,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016878,GO:0019637,GO:0019752,GO:0031224,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.40,6.2.1.20 ko:K05939 ko00071,ko00564,map00071,map00564 R01406,R04864 RC00014,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_3034 Bacteria 1MWDY@1224,1RRXF@1236,3Z1HT@583,COG0204@1,COG0204@2,COG0318@1,COG0318@2 NA|NA|NA I Plays a role in lysophospholipid acylation. Transfers fatty acids to the 1-position via an enzyme-bound acyl-ACP intermediate in the presence of ATP and magnesium. Its physiological function is to regenerate phosphatidylethanolamine from 2-acyl-glycero-3-phosphoethanolamine (2-acyl-GPE) formed by transacylation reactions or degradation by phospholipase A1 Z1_00005 529507.PMI0371 4.7e-88 330.5 Proteus aroK GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004765,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019438,GO:0019632,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046872,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615 2.7.1.71,4.2.3.4 ko:K00891,ko:K13829,ko:K15546 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02412,R03083 RC00002,RC00078,RC00847 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03000 iAPECO1_1312.APECO1_1620,iECOK1_1307.ECOK1_0367,iECS88_1305.ECS88_0383,iUMN146_1321.UM146_15425,iUTI89_1310.UTI89_C0407,iYL1228.KPN_00332 Bacteria 1RDCT@1224,1S7WF@1236,3Z0XH@583,COG0703@1,COG0703@2 NA|NA|NA F Catalyzes the specific phosphorylation of the 3-hydroxyl group of shikimic acid using ATP as a cosubstrate Z1_00006 529507.PMI0370 9.3e-231 805.8 Proteus proA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004350,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006560,GO:0006561,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0055114,GO:0055129,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.2.1.41 ko:K00147 ko00330,ko00332,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00330,map00332,map01100,map01110,map01130,map01230 M00015 R03313 RC00684 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iB21_1397.B21_00243,iECBD_1354.ECBD_3376,iECB_1328.ECB_00240,iECD_1391.ECD_00240,iLJ478.TM0293,iYL1228.KPN_00280,iYO844.BSU13130 Bacteria 1MUGJ@1224,1RMAY@1236,3Z1XW@583,COG0014@1,COG0014@2 NA|NA|NA E Catalyzes the NADPH-dependent reduction of L-glutamate 5-phosphate into L-glutamate 5-semialdehyde and phosphate. The product spontaneously undergoes cyclization to form 1-pyrroline-5- carboxylate Z1_00007 529507.PMI0369 5.2e-201 706.8 Proteus proB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004349,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006560,GO:0006561,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016597,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019202,GO:0019752,GO:0031406,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055129,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901973 2.7.2.11 ko:K00931 ko00330,ko00332,ko01100,ko01130,ko01230,map00330,map00332,map01100,map01130,map01230 M00015 R00239 RC00002,RC00043 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUBG@1224,1RM7X@1236,3Z0VE@583,COG0263@1,COG0263@2 NA|NA|NA F Catalyzes the transfer of a phosphate group to glutamate to form L-glutamate 5-phosphate Z1_00008 529507.PMI0368 9.6e-73 279.3 Proteus crl GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K11926 ko00000,ko03000 Bacteria 1N4UT@1224,1S3WH@1236,292QM@1,2ZQ8E@2,3Z2JP@583 NA|NA|NA K Binds to the sigma-S subunit of RNA polymerase, activating expression of sigma-S-regulated genes. Stimulates RNA polymerase holoenzyme formation and may bind to several other sigma factors, such as sigma-70 and sigma-32 Z1_00009 529507.PMI0367 9.9e-241 839.0 Proteus frsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0006109,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009894,GO:0016020,GO:0016298,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019222,GO:0043470,GO:0044238,GO:0050789,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090 ko:K11750 ko00000,ko01000 Bacteria 1N5CG@1224,1RR2Y@1236,3Z1ZG@583,COG1073@1,COG1073@2 NA|NA|NA S Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1100) Z1_00010 529507.PMI0366 7.4e-85 319.7 Proteus gpt GO:0000310,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004422,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006166,GO:0006177,GO:0006188,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0032261,GO:0032263,GO:0032264,GO:0032265,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042451,GO:0042455,GO:0043094,GO:0043101,GO:0043173,GO:0043174,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046037,GO:0046040,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0097292,GO:0097293,GO:1901068,GO:1901070,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.4.2.22 ko:K00769,ko:K07101 ko00230,ko01100,ko01110,map00230,map01100,map01110 R01229,R02142 RC00063,RC00122 ko00000,ko00001,ko01000 iSbBS512_1146.SbBS512_E0235 Bacteria 1MWNE@1224,1RQ4C@1236,3Z1A7@583,COG2236@1,COG2236@2 NA|NA|NA F Acts on guanine, xanthine and to a lesser extent hypoxanthine Z1_00011 529507.PMI0364 2.4e-278 964.1 Proteus pepD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008235,GO:0008237,GO:0008238,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016805,GO:0019538,GO:0034641,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070011,GO:0070573,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K01270 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R00899,R04951 RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 iPC815.YPO3230,iSBO_1134.SBO_0243 Bacteria 1MUWK@1224,1RP5F@1236,3Z1FX@583,COG2195@1,COG2195@2 NA|NA|NA E aminoacyl-histidine dipeptidase (XAA-His dipeptidase) (beta-alanyl-histidine dipeptidase) (carnosinase) (peptidase D) K01270 Z1_00012 529507.PMI0363 0.0 1429.1 Proteus fhuA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02014 ko00000,ko02000 1.B.14 Bacteria 1MV0X@1224,1T1GW@1236,3Z23I@583,COG4774@1,COG4774@2 NA|NA|NA M TonB dependent receptor Z1_00013 529507.PMI0362 2.1e-199 701.4 Proteus dinB GO:0000731,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003887,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006301,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019985,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 2.7.7.7 ko:K02346,ko:K03502 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUUH@1224,1RMFM@1236,3Z2F3@583,COG0389@1,COG0389@2 NA|NA|NA L Poorly processive, error-prone DNA polymerase involved in untargeted mutagenesis. Copies undamaged DNA at stalled replication forks, which arise in vivo from mismatched or misaligned primer ends. These misaligned primers can be extended by PolIV. Exhibits no 3'-5' exonuclease (proofreading) activity. May be involved in translesional synthesis, in conjunction with the beta clamp from PolIII Z1_00014 529507.PMI0361 6e-160 570.1 Proteus glpQ 3.1.4.46 ko:K01126 ko00564,map00564 R01030,R01470 RC00017,RC00425 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWIS@1224,1RSM5@1236,3Z296@583,COG0584@1,COG0584@2 NA|NA|NA C Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family Z1_00015 529507.PMI0360 2.5e-35 154.1 Proteus yjbJ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1QG4R@1224,1TDHF@1236,3Z2XW@583,COG3237@1,COG3237@2 NA|NA|NA S CsbD-like Z1_00016 529507.PMI0359 1.4e-31 141.7 Proteus Z012_07620 2.7.1.180 ko:K03734,ko:K05952 ko00000,ko01000 Bacteria 1QG6H@1224,1TDJD@1236,3Z332@583,COG2991@1,COG2991@2 NA|NA|NA S (Na+)-NQR maturation NqrM Z1_00017 529507.PMI0358 9.4e-186 656.0 Proteus apbE 2.7.1.180 ko:K03734 ko00000,ko01000 Bacteria 1MW6K@1224,1RNMZ@1236,3Z26W@583,COG1477@1,COG1477@2 NA|NA|NA H Flavin transferase that catalyzes the transfer of the FMN moiety of FAD and its covalent binding to the hydroxyl group of a threonine residue in a target flavoprotein Z1_00018 529507.PMI0357 1.1e-239 835.5 Proteus nqrF GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030001,GO:0030964,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0048037,GO:0050136,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071949,GO:0097159,GO:0098796,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494 1.6.5.8 ko:K00351 ko00000,ko01000 Bacteria 1QTUV@1224,1RPG5@1236,3Z0VY@583,COG2871@1,COG2871@2 NA|NA|NA C NQR complex catalyzes the reduction of ubiquinone-1 to ubiquinol by two successive reactions, coupled with the transport of Na( ) ions from the cytoplasm to the periplasm. The first step is catalyzed by NqrF, which accepts electrons from NADH and reduces ubiquinone-1 to ubisemiquinone by a one-electron transfer pathway Z1_00019 529507.PMI0356 9.5e-101 372.9 Proteus nqrE GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030001,GO:0030964,GO:0032991,GO:0044425,GO:0050136,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055114,GO:0098796,GO:1902494 1.6.5.8 ko:K00350 ko00000,ko01000 Bacteria 1R33S@1224,1RMWV@1236,3Z29X@583,COG2209@1,COG2209@2 NA|NA|NA C NQR complex catalyzes the reduction of ubiquinone-1 to ubiquinol by two successive reactions, coupled with the transport of Na( ) ions from the cytoplasm to the periplasm. NqrA to NqrE are probably involved in the second step, the conversion of ubisemiquinone to ubiquinol Z1_00020 585.DR95_3637 2.7e-106 391.3 Proteus nqrD GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030001,GO:0030964,GO:0032991,GO:0044425,GO:0044464,GO:0050136,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055114,GO:0071944,GO:0098796,GO:1902494 1.6.5.8 ko:K00349 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUZR@1224,1RNFE@1236,3Z2I1@583,COG1347@1,COG1347@2 NA|NA|NA C NQR complex catalyzes the reduction of ubiquinone-1 to ubiquinol by two successive reactions, coupled with the transport of Na( ) ions from the cytoplasm to the periplasm. NqrA to NqrE are probably involved in the second step, the conversion of ubisemiquinone to ubiquinol Z1_00021 529507.PMI0354 7e-144 516.5 Proteus nqrC GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0008150,GO:0008152,GO:0010181,GO:0015672,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030001,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055114,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 1.6.5.8 ko:K00348 ko00000,ko01000 Bacteria 1MVDI@1224,1RR85@1236,3Z1Y7@583,COG2869@1,COG2869@2 NA|NA|NA C NQR complex catalyzes the reduction of ubiquinone-1 to ubiquinol by two successive reactions, coupled with the transport of Na( ) ions from the cytoplasm to the periplasm. NqrA to NqrE are probably involved in the second step, the conversion of ubisemiquinone to ubiquinol Z1_00022 529507.PMI0353 5.9e-238 829.7 Proteus nqrB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 1.6.5.8 ko:K00347,ko:K21163 ko01059,ko01130,map01059,map01130 M00824 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1QTUU@1224,1RMGH@1236,3Z0VC@583,COG1805@1,COG1805@2 NA|NA|NA C NQR complex catalyzes the reduction of ubiquinone-1 to ubiquinol by two successive reactions, coupled with the transport of Na( ) ions from the cytoplasm to the periplasm. NqrA to NqrE are probably involved in the second step, the conversion of ubisemiquinone to ubiquinol Z1_00023 34506.g683 3.5e-260 903.7 Bilateria Metazoa 2D1GV@1,2SI2U@2759,3AIRA@33154,3BYFA@33208,3DE5D@33213 NA|NA|NA S NQRA C-terminal domain Z1_00024 529507.PMI0351 5.3e-141 506.9 Proteus yafK Bacteria 1MXY6@1224,1RPXT@1236,3Z27N@583,COG3034@1,COG3034@2 NA|NA|NA S L,D-transpeptidase catalytic domain Z1_00025 529507.PMI0350 1.9e-149 535.0 Proteus yafJ Bacteria 1MU1J@1224,1RNEK@1236,3Z2J7@583,COG0121@1,COG0121@2 NA|NA|NA S Glutamine amidotransferases class-II Z1_00026 529507.PMI0349 1.4e-101 375.6 Proteus gmhA GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008968,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 5.3.1.28 ko:K03271,ko:K12961 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00064 R05645,R09768,R09769 RC00434 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko03036 Bacteria 1NVIE@1224,1RP6M@1236,3Z1MX@583,COG0279@1,COG0279@2 NA|NA|NA G Catalyzes the isomerization of sedoheptulose 7-phosphate in D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate Z1_00027 529507.PMI0348 0.0 1610.9 Proteus fadE GO:0003674,GO:0003824,GO:0003995,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016627,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0033539,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044464,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072329,GO:1901575 ko:K06445 ko00071,ko01100,ko01212,map00071,map01100,map01212 M00087 R01175,R01279,R03777,R03857,R03990,R04751,R04754 RC00052,RC00076 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSbBS512_1146.SbBS512_E0217 Bacteria 1MUDR@1224,1RPM5@1236,3Z153@583,COG1960@1,COG1960@2 NA|NA|NA C acyl-CoA dehydrogenase YafH of Escherichia coli K06445 Z1_00028 529507.PMI0347 1.8e-234 818.1 Proteus lysA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008836,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046451,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.7.2.4,4.1.1.20 ko:K01586,ko:K12526 ko00260,ko00261,ko00270,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00260,map00261,map00270,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00017,M00018,M00525,M00526,M00527 R00451,R00480 RC00002,RC00043,RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iG2583_1286.G2583_3495 Bacteria 1MUA6@1224,1RMI2@1236,3Z2AU@583,COG0019@1,COG0019@2 NA|NA|NA E Specifically catalyzes the decarboxylation of meso- diaminopimelate (meso-DAP) to L-lysine Z1_00029 529507.PMI0346 2.5e-172 611.3 Proteus lysR GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016053,GO:0019222,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0048518,GO:0050789,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 Bacteria 1MX2A@1224,1RPHN@1236,3Z1HY@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K LysR substrate binding domain Z1_00030 529507.PMI0345 5.7e-169 600.1 Proteus Bacteria 1MW16@1224,1RPNX@1236,3Z1XG@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K LysR substrate binding domain Z1_00031 529507.PMI0344 4.3e-158 563.9 Proteus Bacteria 1NGQE@1224,1RMI3@1236,3Z13T@583,COG0491@1,COG0491@2 NA|NA|NA S Metallo-beta-lactamase superfamily Z1_00032 529507.PMI0343 9.3e-121 439.5 Proteus ko:K07396 ko00000 Bacteria 1RA76@1224,1RSJ2@1236,3Z2QV@583,COG3531@1,COG3531@2 NA|NA|NA O Protein-disulfide isomerase Z1_00033 529507.PMI0342 1.3e-108 399.1 Proteus hofD 3.4.23.43 ko:K02464,ko:K02506,ko:K02654 ko03070,map03070 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko02035,ko02044 3.A.15,3.A.15.2 Bacteria 1QCRM@1224,1T8I0@1236,3Z2YI@583,COG1989@1,COG1989@2 NA|NA|NA NOU Type IV leader peptidase family Z1_00034 529507.PMI0341 4.7e-134 483.8 Proteus rsmE GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016436,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0070042,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.193 ko:K09761 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MXCU@1224,1RPBN@1236,3Z1SM@583,COG1385@1,COG1385@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the N3 position of the uracil ring of uridine 1498 (m3U1498) in 16S rRNA. Acts on the fully assembled 30S ribosomal subunit Z1_00035 529507.PMI0340 1.6e-182 645.2 Proteus gshB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004363,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006518,GO:0006575,GO:0006749,GO:0006750,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0019184,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042601,GO:0042763,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.2,6.3.2.3 ko:K01919,ko:K01920,ko:K05844 ko00270,ko00480,ko01100,map00270,map00480,map01100 M00118 R00497,R00894,R10993,R10994 RC00064,RC00090,RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009 iECED1_1282.ECED1_3410,iECP_1309.ECP_2941 Bacteria 1MVUA@1224,1RMU0@1236,3Z1A2@583,COG0189@1,COG0189@2 NA|NA|NA H Prokaryotic glutathione synthetase, N-terminal domain Z1_00036 529507.PMI0339 1.3e-99 369.0 Proteus yqgE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K07735 ko00000,ko03000 Bacteria 1RCXM@1224,1S3YV@1236,3Z310@583,COG1678@1,COG1678@2 NA|NA|NA K Uncharacterized ACR, COG1678 Z1_00037 529507.PMI0338 1.7e-72 278.5 Proteus yqgF GO:0000966,GO:0000967,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008408,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0022613,GO:0034470,GO:0034471,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040007,GO:0042254,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 ko:K07447 ko00000,ko01000 Bacteria 1RDHZ@1224,1S96Q@1236,3Z2JR@583,COG0816@1,COG0816@2 NA|NA|NA J Could be a nuclease involved in processing of the 5'-end of pre-16S rRNA Z1_00038 529507.PMI0337 1.5e-183 648.7 Proteus yggR GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K02669 ko00000,ko02035,ko02044 3.A.15.2 Bacteria 1MU3J@1224,1RN8G@1236,3Z2H1@583,COG2805@1,COG2805@2 NA|NA|NA NU Type II/IV secretion system protein Z1_00039 529507.PMI0336 1.4e-127 462.2 Proteus yggS GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008144,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0097159,GO:1901363 ko:K06997 ko00000 Bacteria 1MWN7@1224,1RNPM@1236,3Z2QU@583,COG0325@1,COG0325@2 NA|NA|NA S Pyridoxal phosphate Z1_00040 529507.PMI0335 1.1e-142 512.7 Proteus proC 1.5.1.2 ko:K00286 ko00330,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00330,map01100,map01110,map01130,map01230 M00015 R01248,R01251,R03291,R03293 RC00054,RC00083 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R5J1@1224,1RNQK@1236,3Z2FR@583,COG0345@1,COG0345@2 NA|NA|NA E Catalyzes the reduction of 1-pyrroline-5-carboxylate (PCA) to L-proline Z1_00041 529507.PMI0334 9e-93 346.3 Proteus yggT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02221 ko00000,ko02044 Bacteria 1RCZV@1224,1S6DW@1236,3Z1K4@583,COG0762@1,COG0762@2 NA|NA|NA S YGGT family Z1_00042 529507.PMI0333 2e-106 391.7 Proteus rdgB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009144,GO:0009146,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0035870,GO:0036220,GO:0036222,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046983,GO:0047429,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576 3.6.1.66,5.1.1.3 ko:K01776,ko:K02428 ko00230,ko00471,ko01100,map00230,map00471,map01100 R00260,R00426,R00720,R01855,R02100,R02720,R03531 RC00002,RC00302 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iEC55989_1330.EC55989_3247,iECO111_1330.ECO111_3702,iECSE_1348.ECSE_3222,iECW_1372.ECW_m3212,iEKO11_1354.EKO11_0774,iEcE24377_1341.EcE24377A_3298,iWFL_1372.ECW_m3212 Bacteria 1MUK5@1224,1S27C@1236,3Z1H6@583,COG0127@1,COG0127@2 NA|NA|NA F Pyrophosphatase that catalyzes the hydrolysis of nucleoside triphosphates to their monophosphate derivatives, with a high preference for the non-canonical purine nucleotides XTP (xanthosine triphosphate), dITP (deoxyinosine triphosphate) and ITP. Seems to function as a house-cleaning enzyme that removes non-canonical purine nucleotides from the nucleotide pool, thus preventing their incorporation into DNA RNA and avoiding chromosomal lesions Z1_00043 529507.PMI0332 1.9e-222 778.1 Proteus hemN GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 Bacteria 1MU76@1224,1RN6I@1236,3Z1ES@583,COG0635@1,COG0635@2 NA|NA|NA H Involved in the biosynthesis of porphyrin-containing compound Z1_00044 529507.PMI0331 3.6e-166 590.9 Proteus fatB ko:K02016 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1R54Y@1224,1RZ1I@1236,3Z1CU@583,COG4607@1,COG4607@2 NA|NA|NA P Periplasmic binding protein Z1_00045 529507.PMI0330 1e-128 466.1 Proteus yggN Bacteria 1MXU1@1224,1RPHU@1236,28H6P@1,2Z7J1@2,3Z1Y4@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2884) Z1_00046 529507.PMI0329 5.7e-169 600.1 Proteus glsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004359,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006537,GO:0006541,GO:0006543,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009064,GO:0009065,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016054,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901607 3.5.1.2 ko:K01425 ko00220,ko00250,ko00471,ko01100,ko04724,ko04727,ko04964,ko05206,ko05230,map00220,map00250,map00471,map01100,map04724,map04727,map04964,map05206,map05230 R00256,R01579 RC00010,RC02798 ko00000,ko00001,ko01000 iYO844.BSU02430 Bacteria 1MWB5@1224,1RMY9@1236,3Z15P@583,COG2066@1,COG2066@2 NA|NA|NA E Belongs to the glutaminase family Z1_00047 529507.PMI0328 5.1e-56 223.4 Proteus yggL GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09923 ko00000 Bacteria 1RH3U@1224,1S6UT@1236,3Z2PK@583,COG3171@1,COG3171@2 NA|NA|NA S Protein with unknown function (DUF469) Z1_00048 529507.PMI0327 1.4e-138 498.8 Proteus trmB GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008176,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016423,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0034708,GO:0036265,GO:0040007,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043527,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0106004,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1902494,GO:1990234 2.1.1.297,2.1.1.33,2.4.99.12,2.4.99.13,2.4.99.14,2.4.99.15 ko:K02493,ko:K02527,ko:K03439 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060,M00080 R04658,R05074,R09763,R10806 RC00003,RC00009,RC00077,RC00247,RC03279 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005,ko03012,ko03016 GT30 Bacteria 1MUWJ@1224,1RMFG@1236,3Z1KA@583,COG0220@1,COG0220@2 NA|NA|NA J Catalyzes the formation of N(7)-methylguanine at position 46 (m7G46) in tRNA Z1_00049 529507.PMI0326 2.3e-206 724.5 Proteus mutY GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 ko:K03575 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUD4@1224,1RMBT@1236,3Z36X@583,COG1194@1,COG1194@2 NA|NA|NA L A G-specific adenine glycosylase Z1_00050 529507.PMI0325 2.1e-47 194.5 Proteus yggX GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0034599,GO:0042221,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887 Bacteria 1MZ2V@1224,1S964@1236,3Z2WF@583,COG2924@1,COG2924@2 NA|NA|NA C Could be a mediator in iron transactions between iron acquisition and iron-requiring processes, such as synthesis and or repair of Fe-S clusters in biosynthetic enzymes Z1_00051 34506.g627 1.2e-202 712.2 Eukaryota Eukaryota 2EDSR@1,2SJBZ@2759 NA|NA|NA S Transglycosylase SLT domain Z1_00053 55207.KP22_20670 1.7e-26 125.2 Gammaproteobacteria proV 3.6.3.32 ko:K02000 ko02010,map02010 M00208 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.12 Bacteria 1N4KQ@1224,1S8WX@1236,COG3620@1,COG3620@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_00055 529507.PMI0308 3.9e-139 500.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1P1PW@1224,1SRNH@1236,COG2236@1,COG2236@2 NA|NA|NA F Acts on guanine, xanthine and to a lesser extent hypoxanthine Z1_00056 529507.PMI0307 0.0 1466.1 Proteus speC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004586,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006576,GO:0006595,GO:0006596,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008216,GO:0008295,GO:0009058,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0019842,GO:0030170,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042401,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097164,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.1.1.17,4.1.1.19 ko:K01581,ko:K01585 ko00330,ko00480,ko01100,ko01110,ko01130,map00330,map00480,map01100,map01110,map01130 M00133,M00134 R00566,R00670 RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECW_1372.ECW_m0743,iEcHS_1320.EcHS_A3126,iWFL_1372.ECW_m0743 Bacteria 1MWK4@1224,1RMVF@1236,3Z1MT@583,COG1982@1,COG1982@2 NA|NA|NA E orn Lys Arg decarboxylase Z1_00057 529507.PMI0306 2.2e-241 841.3 Gammaproteobacteria potE GO:0000064,GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015171,GO:0015179,GO:0015203,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015318,GO:0015489,GO:0015491,GO:0015496,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015711,GO:0015807,GO:0015822,GO:0015846,GO:0015847,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098655,GO:0098656,GO:0099516,GO:1902047,GO:1902475,GO:1903352,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03294,ko:K03756 ko00000,ko02000 2.A.3.2 iAF1260.b0692,iB21_1397.B21_00640,iBWG_1329.BWG_0551,iE2348C_1286.E2348C_0581,iECABU_c1320.ECABU_c07430,iECBD_1354.ECBD_2969,iECB_1328.ECB_00648,iECDH10B_1368.ECDH10B_0758,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0650,iECD_1391.ECD_00648,iECIAI1_1343.ECIAI1_0668,iECNA114_1301.ECNA114_0628,iECO103_1326.ECO103_0686,iECO26_1355.ECO26_0754,iECP_1309.ECP_0710,iECSE_1348.ECSE_0751,iECSF_1327.ECSF_0627,iECW_1372.ECW_m0742,iEKO11_1354.EKO11_3188,iETEC_1333.ETEC_0708,iEcDH1_1363.EcDH1_2945,iEcolC_1368.EcolC_2964,iJO1366.b0692,iJR904.b0692,iSSON_1240.SSON_0643,iUMNK88_1353.UMNK88_728,iWFL_1372.ECW_m0742,iY75_1357.Y75_RS03590,ic_1306.c0776 Bacteria 1MUA2@1224,1RPP7@1236,COG0531@1,COG0531@2 NA|NA|NA E Catalyzes both the uptake and excretion of putrescine. The uptake of putrescine is dependent on the membrane potential and the excretion involves putrescine-ornithine antiporter activity Z1_00058 529507.PMI0305 2.3e-119 434.9 Gammaproteobacteria nemR ko:K16137 ko00000,ko03000 Bacteria 1RA4T@1224,1RNQH@1236,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_00059 585.DR95_3670 7e-210 736.5 Gammaproteobacteria ko:K02022,ko:K12542 M00330 ko00000,ko00002,ko02000,ko02044 3.A.1.109.4,8.A.1 Bacteria 1MUI8@1224,1RNK4@1236,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Type I secretion membrane fusion protein, HlyD Z1_00060 585.DR95_3671 0.0 1287.7 Gammaproteobacteria hlyB ko:K12541 ko02010,map02010 M00330 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02044 3.A.1.109.3,3.A.1.109.4 Bacteria 1R2T0@1224,1SBE1@1236,COG2274@1,COG2274@2 NA|NA|NA V COG2274 ABC-type bacteriocin lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain Z1_00061 585.DR95_3672 7.9e-214 749.6 Bacteria ko:K12543 M00330 ko00000,ko00002,ko02000,ko02044 1.B.17,3.A.1.109.4 Bacteria COG1538@1,COG1538@2 NA|NA|NA MU efflux transmembrane transporter activity Z1_00062 199310.c0363 0.0 1917.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1P8N9@1224,1S7XA@1236,COG2911@1,COG2911@2 NA|NA|NA U Protein conserved in bacteria Z1_00063 585.DR95_1646 3.1e-46 192.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1N166@1224,1SAE9@1236,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_00064 585.DR95_1645 5.3e-68 264.6 Bacteria ykgA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009438,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016070,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019172,GO:0019243,GO:0019249,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032774,GO:0032787,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046185,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 ko:K05804 M00647,M00767 ko00000,ko00002,ko03000,ko03036 Bacteria COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_00065 529507.PMI0304 1.8e-212 745.0 Proteus Bacteria 1NWGD@1224,1SP6S@1236,2EWEA@1,33VU4@2,3Z345@583 NA|NA|NA Z1_00066 529507.PMI0303 4.7e-91 340.5 Proteus Bacteria 1QCTS@1224,1SSDN@1236,3Z33R@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00067 529507.PMI0302 9.1e-95 352.8 Proteus ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1P1VH@1224,1SRD1@1236,3Z32A@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00068 529507.PMI0301 9.3e-74 282.7 Proteus Bacteria 1QGMD@1224,1TE28@1236,2F7TJ@1,31IXS@2,3Z3J2@583 NA|NA|NA Z1_00069 529507.PMI0300 9.5e-135 486.1 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1RBJK@1224,1S2BW@1236,3Z37I@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_00070 529507.PMI0299 0.0 1625.9 Proteus Bacteria 1P744@1224,1RN8Z@1236,3Z36I@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_00071 529507.PMI0298 2e-100 371.7 Proteus GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1QG6I@1224,1TDJE@1236,3Z333@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00072 529507.PMI0297 4.3e-95 354.0 Proteus GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1QG4J@1224,1SMZJ@1236,3Z2X4@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00073 529507.PMI0296 6.9e-41 172.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1QTJ0@1224,1SW7V@1236,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_00074 529507.PMI0295 4.6e-146 523.9 Proteus Bacteria 1PDSN@1224,1RWM6@1236,3Z3JU@583,COG3710@1,COG3710@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_00076 529507.PMI0293 1.2e-177 629.0 Gammaproteobacteria treR GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03485 ko00000,ko03000 Bacteria 1QQPR@1224,1RRC9@1236,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K trehalose Z1_00077 529507.PMI0291 7e-267 926.0 Proteus treP 2.7.1.193,2.7.1.199,2.7.1.201,2.7.1.208,2.7.1.211 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02778,ko:K02779,ko:K02790,ko:K02791,ko:K02802,ko:K02803,ko:K02804,ko:K02809,ko:K02810,ko:K02817,ko:K02818,ko:K02819 ko00010,ko00500,ko00520,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02060,map05111 M00265,M00266,M00267,M00269,M00270,M00271 R00811,R02738,R02780,R04111,R05199 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.1.15,4.A.1.1.2,4.A.1.1.3,4.A.1.1.5,4.A.1.1.7,4.A.1.2.1,4.A.1.2.10,4.A.1.2.11,4.A.1.2.12,4.A.1.2.13,4.A.1.2.2,4.A.1.2.4,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6,4.A.1.2.8,4.A.1.2.9 Bacteria 1MVVJ@1224,1RRDA@1236,3Z2X7@583,COG1263@1,COG1263@2,COG1264@1,COG1264@2 NA|NA|NA G phosphotransferase system, EIIB Z1_00078 529507.PMI0290 0.0 1829.3 Gammaproteobacteria trePP GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016787,GO:0030312,GO:0044464,GO:0071944 2.4.1.216,2.4.1.8,3.1.3.12,3.2.1.28 ko:K00691,ko:K01087,ko:K01194,ko:K03731 ko00500,ko01100,map00500,map01100 R00010,R01555,R02778 RC00017,RC00049 ko00000,ko00001,ko00537,ko01000 GH37,GH65 Bacteria 1MWJE@1224,1RPN6@1236,COG1554@1,COG1554@2 NA|NA|NA G hydrolase family 65, central catalytic Z1_00079 529507.PMI0289 2.2e-119 434.9 Gammaproteobacteria pgmB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004805,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005984,GO:0005991,GO:0005992,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008801,GO:0009058,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0019203,GO:0030312,GO:0034637,GO:0040007,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044262,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046351,GO:0046872,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901576 2.4.1.64,3.1.3.12,3.2.1.28,5.4.2.6 ko:K01087,ko:K01194,ko:K01838,ko:K05342 ko00500,ko01100,map00500,map01100 R00010,R02727,R02728,R02778,R11310 RC00017,RC00049,RC00408 ko00000,ko00001,ko00537,ko01000 GH37,GH65 Bacteria 1NDNW@1224,1S1Z7@1236,COG0637@1,COG0637@2 NA|NA|NA G beta-phosphoglucomutase Z1_00080 529507.PMI0288 1.3e-262 911.8 Proteus rafY Bacteria 1N7W6@1224,1RNWG@1236,2DBE3@1,2Z8QE@2,3Z28B@583 NA|NA|NA S Porin-like glycoporin RafY Z1_00081 529507.PMI0287 5.4e-239 833.2 Proteus 3.5.1.6,3.5.1.87 ko:K06016 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00046 R00905,R04666 RC00096 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVUX@1224,1RPPD@1236,3Z21W@583,COG0624@1,COG0624@2 NA|NA|NA E Peptidase family M20/M25/M40 Z1_00082 529507.PMI0286 1.8e-156 558.5 Proteus 3.1.21.4 ko:K01155,ko:K15773 ko00000,ko01000,ko02048,ko03000 Bacteria 1R6X3@1224,1S37W@1236,3Z1JD@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_00083 529507.PMI0282 9.1e-257 892.9 Proteus 3.4.24.40 ko:K01406 ko01503,map01503 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU7T@1224,1S0EK@1236,3Z2NN@583,COG2931@1,COG2931@2 NA|NA|NA Q Zinc-dependent metalloprotease Z1_00084 529507.PMI0282 0.0 1079.3 Proteus 3.4.24.40 ko:K01406 ko01503,map01503 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU7T@1224,1S0EK@1236,3Z2NN@583,COG2931@1,COG2931@2 NA|NA|NA Q Zinc-dependent metalloprotease Z1_00085 529507.PMI0281 2.6e-307 1060.8 Proteus 3.4.24.40 ko:K01406 ko01503,map01503 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU7T@1224,1S0EK@1236,3Z2NN@583,COG2931@1,COG2931@2 NA|NA|NA Q Zinc-dependent metalloprotease Z1_00086 529507.PMI0279 1.8e-265 921.4 Proteus 3.4.24.40 ko:K01406 ko01503,map01503 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU7T@1224,1RWAD@1236,3Z0ZN@583,COG2931@1,COG2931@2 NA|NA|NA Q Serine 3-dehydrogenase Z1_00087 529507.PMI0278 0.0 1108.2 Proteus prtD ko:K12536 ko02010,map02010 M00328 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02044 3.A.1.110 Bacteria 1NTI5@1224,1T1HR@1236,3Z1IP@583,COG4618@1,COG4618@2 NA|NA|NA V alkaline protease (AprA) secretion protein AprD Z1_00088 529507.PMI0277 1.8e-232 811.6 Proteus aprE ko:K02022,ko:K12534,ko:K12537,ko:K16300 M00327,M00328,M00571 ko00000,ko00002,ko02000,ko02044 8.A.1,8.A.1.3.3 Bacteria 1MUI8@1224,1RNK4@1236,3Z10Q@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Type I secretion membrane fusion protein, HlyD Z1_00089 529507.PMI0276 1.1e-239 835.5 Proteus lipD ko:K12538 M00328 ko00000,ko00002,ko02000,ko02044 1.B.17.1 Bacteria 1Q498@1224,1RS7N@1236,3Z2FF@583,COG1538@1,COG1538@2 NA|NA|NA MU Outer membrane efflux protein Z1_00090 529507.PMI0275 8e-307 1058.9 Proteus arnT 2.4.2.43 ko:K07264 ko01503,map01503 M00721 R09773,R09774,R09781 RC00005 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 Bacteria 1NMIZ@1224,1RMA2@1236,3Z2AW@583,COG1807@1,COG1807@2 NA|NA|NA M Catalyzes the transfer of the L-Ara4N moiety of the glycolipid undecaprenyl phosphate-alpha-L-Ara4N to lipid A. The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_00091 529507.PMI0274 1.3e-54 218.8 Proteus 4.1.1.44 ko:K01607 ko00362,ko01100,ko01120,ko01220,map00362,map01100,map01120,map01220 R03470 RC00938 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MZ80@1224,1SA74@1236,3Z2T3@583,COG0599@1,COG0599@2 NA|NA|NA O Antioxidant protein with alkyl hydroperoxidase activity. Required for the reduction of the AhpC active site cysteine residues and for the regeneration of the AhpC enzyme activity Z1_00092 529507.PMI0273 2.3e-63 248.1 Proteus yhdN Bacteria 1NAHU@1224,1S9DD@1236,2D7FD@1,32TNY@2,3Z2NV@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1992) Z1_00093 529507.PMI0272 8e-288 995.7 Proteus ydaH ko:K12942 ko00000 Bacteria 1MUJ1@1224,1RMAI@1236,3Z1FE@583,COG2978@1,COG2978@2 NA|NA|NA H AbgT putative transporter family Z1_00094 529507.PMI0271 5.6e-55 219.9 Proteus Bacteria 1N8AN@1224,1SDHA@1236,3Z2X1@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_00095 529507.PMI0270 3.6e-154 550.8 Proteus mrfJ Bacteria 1R62W@1224,1S1AI@1236,28I77@1,2Z8A2@2,3Z2SJ@583 NA|NA|NA Z1_00096 529507.PMI0269 1.3e-96 359.0 Proteus yfcP GO:0005575,GO:0005623,GO:0007155,GO:0008150,GO:0009289,GO:0022610,GO:0042995,GO:0044464 Bacteria 1RIHS@1224,1S6QB@1236,3Z2A2@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00097 529507.PMI0268 4.1e-78 297.4 Proteus yfcQ ko:K12521 ko00000,ko02044 Bacteria 1REAV@1224,1S7WR@1236,3Z2IP@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00098 529507.PMI0267 7.6e-97 359.8 Proteus ko:K12521 ko00000,ko02044 Bacteria 1REAV@1224,1S7WR@1236,3Z0ZE@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00099 529507.PMI0266 3e-139 501.1 Proteus yfcS ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1MY06@1224,1RN7Y@1236,3Z1SE@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_00100 529507.PMI0265 0.0 1758.0 Proteus mrfC Bacteria 1P744@1224,1RN8Z@1236,3Z1XK@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Psort location OuterMembrane, score Z1_00101 529507.PMI0264 1.5e-100 372.1 Proteus GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1RHJU@1224,1S70G@1236,3Z0ZB@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial Z1_00102 529507.PMI0263 1.3e-88 332.4 Proteus mrpA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1RC0B@1224,1S22C@1236,3Z1J0@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00103 529507.PMI0262 8.5e-107 392.9 Proteus ko:K04763,ko:K07357,ko:K07358 ko00000,ko03036 Bacteria 1R6F9@1224,1S0TK@1236,3Z0XU@583,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Phage integrase family Z1_00104 529507.PMI0261 1.7e-51 208.4 Proteus Bacteria 1N8AN@1224,1SDHA@1236,3Z2X1@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_00105 529507.PMI0260 1.4e-161 575.5 Proteus mrfJ Bacteria 1R62W@1224,1S1AI@1236,28I77@1,2Z8A2@2,3Z2SJ@583 NA|NA|NA Z1_00106 529507.PMI0259 5e-93 347.1 Proteus yfcP GO:0005575,GO:0005623,GO:0007155,GO:0008150,GO:0009289,GO:0022610,GO:0042995,GO:0044464 Bacteria 1RIHS@1224,1S6QB@1236,3Z2A2@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00107 529507.PMI0258 3e-90 337.8 Proteus yfcQ ko:K12521 ko00000,ko02044 Bacteria 1REAV@1224,1S7WR@1236,3Z2IP@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00108 529507.PMI0257 1.2e-97 362.5 Proteus ko:K12521 ko00000,ko02044 Bacteria 1REAV@1224,1S7WR@1236,3Z0ZE@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00109 585.DR95_1667 9.9e-111 406.4 Proteus yfcS Bacteria 1MY06@1224,1RN7Y@1236,3Z1SE@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_00110 529507.PMI0255 0.0 1757.7 Proteus mrfC Bacteria 1P744@1224,1RN8Z@1236,3Z1XK@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Psort location OuterMembrane, score Z1_00111 529507.PMI0254 2.8e-88 331.3 Proteus GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1RC0B@1224,1S22C@1236,3Z1J0@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00112 529507.PMI0252 3.7e-176 624.0 Proteus rnz GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016891,GO:0016893,GO:0016896,GO:0031123,GO:0034414,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042779,GO:0042780,GO:0042781,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043628,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0090503,GO:0140098,GO:1901360,GO:1905267 3.1.26.11 ko:K00784 ko03013,map03013 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1Q4PW@1224,1RR5K@1236,3Z2MR@583,COG1234@1,COG1234@2 NA|NA|NA J ribonuclease Z Z1_00113 529507.PMI0251 2.7e-120 438.0 Proteus Bacteria 1P1BR@1224,1RQX3@1236,3Z2MD@583,COG2323@1,COG2323@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF421) Z1_00114 529507.PMI0250 3.2e-14 85.5 Proteus ko:K03646 ko00000,ko02000 2.C.1.2 Bacteria 1N99G@1224,1SEMR@1236,3Z2QA@583,COG3064@1,COG3064@2 NA|NA|NA M Membrane Z1_00115 529507.PMI0249 0.0 1295.8 Proteus betT ko:K02168 ko00000,ko02000 2.A.15.1.3,2.A.15.1.4 Bacteria 1MV0K@1224,1RP3E@1236,3Z19W@583,COG1292@1,COG1292@2 NA|NA|NA M Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family Z1_00116 529507.PMI0248 6.6e-75 286.6 Proteus hpaR Bacteria 1RCY7@1224,1S49H@1236,3Z2NE@583,COG1846@1,COG1846@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein Z1_00118 529507.PMI0246 9.2e-92 342.8 Proteus hpaC 1.5.1.36 ko:K00484 ko00350,ko00740,ko01100,ko01120,ko01220,map00350,map00740,map01100,map01120,map01220 R02698,R03299,R05705,R09748,R09750 RC00046,RC00126 ko00000,ko00001,ko01000 iSFV_1184.SFV_4374,iSF_1195.SF4373,iSFxv_1172.SFxv_4767,iS_1188.S4643 Bacteria 1NESS@1224,1RQY7@1236,3Z21Z@583,COG1853@1,COG1853@2 NA|NA|NA C Flavin reductase like domain Z1_00119 529507.PMI0245 3.6e-274 950.3 Proteus dtpB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006855,GO:0006857,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015318,GO:0015333,GO:0015672,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035442,GO:0035443,GO:0035672,GO:0035673,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042887,GO:0042891,GO:0042895,GO:0042937,GO:0042938,GO:0042939,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071916,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1902600,GO:1904680 ko:K03305 ko00000 2.A.17 iECH74115_1262.ECH74115_4843,iECSP_1301.ECSP_4476,iECs_1301.ECs4368,iZ_1308.Z4896 Bacteria 1MW6W@1224,1RM8P@1236,3Z224@583,COG3104@1,COG3104@2 NA|NA|NA U Proton-dependent permease that transports di- and tripeptides Z1_00120 529507.PMI0244 8.8e-33 145.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1RJJN@1224,1S6WP@1236,COG2314@1,COG2314@2 NA|NA|NA NU TM2 domain containing protein Z1_00121 529507.PMI0243 5.2e-206 723.4 Proteus fbaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004332,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006094,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016832,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019318,GO:0019319,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0019899,GO:0030312,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0035375,GO:0042866,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046364,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 4.1.2.13 ko:K01624 ko00010,ko00030,ko00051,ko00680,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00030,map00051,map00680,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00001,M00003,M00165,M00167,M00344,M00345 R01068,R01070,R01829,R02568 RC00438,RC00439,RC00603,RC00604 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MURX@1224,1RQUC@1236,3Z1ED@583,COG0191@1,COG0191@2 NA|NA|NA G Fructose-bisphosphate aldolase class-II Z1_00122 529507.PMI0242 9e-212 742.7 Proteus pgk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004618,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042866,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 2.7.2.3,5.3.1.1 ko:K00927,ko:K01803 ko00010,ko00051,ko00562,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00051,map00562,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00001,M00002,M00003,M00165,M00166,M00308,M00552 R01015,R01512 RC00002,RC00043,RC00423 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iSbBS512_1146.SbBS512_E3351 Bacteria 1MUNU@1224,1RMUQ@1236,3Z19T@583,COG0126@1,COG0126@2 NA|NA|NA F Phosphoglycerate kinase Z1_00123 529507.PMI0241 2.4e-192 677.9 Proteus epd GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004365,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006081,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008614,GO:0008615,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019318,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043891,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046483,GO:0048001,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051287,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 1.2.1.12,1.2.1.72 ko:K00134,ko:K03472 ko00010,ko00710,ko00750,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04066,ko05010,map00010,map00710,map00750,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04066,map05010 M00001,M00002,M00003,M00124,M00165,M00166,M00308,M00552 R01061,R01825 RC00149,RC00242 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 iYL1228.KPN_03356 Bacteria 1MU93@1224,1RMBM@1236,3Z1EE@583,COG0057@1,COG0057@2 NA|NA|NA H Catalyzes the NAD-dependent conversion of D-erythrose 4- phosphate to 4-phosphoerythronate Z1_00124 34506.g1328 0.0 1318.9 Rhabditida Nematoda 1M0S1@119089,38B8B@33154,3BPTA@33208,3DDY6@33213,40R30@6231,4154G@6236,COG0021@1,KOG0523@2759 NA|NA|NA G Transketolase, thiamine diphosphate binding domain Z1_00125 529507.PMI0239 9.1e-80 302.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1N051@1224,1SB0J@1236,COG1475@1,COG1475@2 NA|NA|NA K ParB-like nuclease domain Z1_00126 529507.PMI0238 3.4e-216 757.3 Proteus ko:K02016 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MUSZ@1224,1RPUH@1236,3Z3IM@583,COG0614@1,COG0614@2 NA|NA|NA P Periplasmic binding protein Z1_00127 529507.PMI0237 1.5e-214 751.9 Gammaproteobacteria ko:K05820,ko:K08161 ko00000,ko02000 2.A.1.2.20,2.A.1.27 Bacteria 1MUBP@1224,1RNXS@1236,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator Superfamily Z1_00128 529507.PMI0236 3.7e-226 790.4 Gammaproteobacteria odh 1.5.1.28 ko:K04940 ko00000,ko01000 Bacteria 1N5KQ@1224,1S1KJ@1236,COG0240@1,COG0240@2 NA|NA|NA C NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase, alpha-helical domain Z1_00129 529507.PMI0235 1.9e-189 668.3 Proteus cbs 4.2.1.22 ko:K01697 ko00260,ko00270,ko01100,ko01130,ko01230,map00260,map00270,map01100,map01130,map01230 M00035,M00338 R00891,R01290,R04942 RC00056,RC00069,RC00256,RC00489,RC01246 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUBE@1224,1RN6J@1236,3Z26Y@583,COG0031@1,COG0031@2 NA|NA|NA E Pyridoxal-phosphate dependent enzyme Z1_00130 529507.PMI0234 1.3e-273 948.3 Gammaproteobacteria 4.1.1.20 ko:K01586 ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R00451 RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1Q548@1224,1RQ3F@1236,COG0019@1,COG0019@2 NA|NA|NA E decarboxylase Z1_00131 529507.PMI0233 0.0 1383.2 Gammaproteobacteria fcuA ko:K02014 ko00000,ko02000 1.B.14 Bacteria 1MVZD@1224,1RN2P@1236,COG4774@1,COG4774@2 NA|NA|NA P receptor Z1_00132 529507.PMI0232 0.0 1290.8 Gammaproteobacteria frgA Bacteria 1MVUU@1224,1RPN4@1236,COG4264@1,COG4264@2 NA|NA|NA Q Siderophore biosynthesis protein Z1_00133 529507.PMI0231 1e-153 549.3 Gammaproteobacteria 4.1.3.25,4.1.3.34 ko:K01644,ko:K18292 ko00660,ko01100,ko02020,map00660,map01100,map02020 R00237,R00362 RC00067,RC00502,RC01118,RC01205 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW0A@1224,1RNEJ@1236,COG2301@1,COG2301@2 NA|NA|NA G Belongs to the HpcH HpaI aldolase family Z1_00134 529507.PMI0230 2.5e-136 491.5 Proteus fhuC_1 3.6.3.34 ko:K02013 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MVKU@1224,1RN86@1236,3Z1BS@583,COG1120@1,COG1120@2 NA|NA|NA HP AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_00135 529507.PMI0229 1.1e-184 652.5 Proteus irp6B ko:K02015 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MV9W@1224,1RMST@1236,3Z1GY@583,COG0609@1,COG0609@2 NA|NA|NA P ABC 3 transport family Z1_00136 471874.PROSTU_00699 1.1e-28 132.5 Bacteria Bacteria COG1813@1,COG1813@2 NA|NA|NA K peptidyl-tyrosine sulfation Z1_00137 471874.PROSTU_04239 2.4e-104 385.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RIQM@1224,1S7D8@1236,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M pilus assembly Z1_00138 471874.PROSTU_04240 7.6e-62 243.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NK45@1224,1SHJB@1236,2DSG8@1,33G11@2 NA|NA|NA S CS1 type fimbrial major subunit Z1_00139 471874.PROSTU_04241 0.0 1355.5 Providencia ko:K21966 ko00000,ko02044 Bacteria 1R2PY@1224,1RMJX@1236,3Z8SZ@586,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Psort location OuterMembrane, score Z1_00140 471874.PROSTU_04242 3e-189 667.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1N0BI@1224,1S9SR@1236,2DSHR@1,32UT6@2 NA|NA|NA Z1_00142 529507.PMI0228 4.6e-140 503.8 Proteus dnaQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042575,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044776,GO:0045004,GO:0045005,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0061695,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:1901360,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7,3.1.26.4 ko:K02342,ko:K14159 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MV8Z@1224,1RNHQ@1236,3Z278@583,COG0847@1,COG0847@2 NA|NA|NA L DNA polymerase III is a complex, multichain enzyme responsible for most of the replicative synthesis in bacteria. The epsilon subunit contain the editing function and is a proofreading 3'-5' exonuclease Z1_00143 529507.PMI0227 8e-90 336.3 Proteus rnhA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004523,GO:0004540,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006271,GO:0006273,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016891,GO:0016893,GO:0019439,GO:0022616,GO:0033567,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0043137,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0097159,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901576 3.1.26.4 ko:K03469 ko03030,map03030 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032 Bacteria 1RCZ1@1224,1S3YC@1236,3Z2CK@583,COG0328@1,COG0328@2 NA|NA|NA L Endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA- DNA hybrids Z1_00144 585.DR95_1690 1.2e-121 442.6 Proteus yafS Bacteria 1QTWC@1224,1RS4G@1236,3Z1XA@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA Q Methyltransferase domain Z1_00145 529507.PMI0225 1.8e-144 518.5 Proteus gloB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004416,GO:0005488,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009438,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0019243,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046185,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901615 3.1.2.6 ko:K01069 ko00620,map00620 R01736 RC00004,RC00137 ko00000,ko00001,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c02250 Bacteria 1MU8Q@1224,1S22I@1236,3Z2T7@583,COG0491@1,COG0491@2 NA|NA|NA S Hydroxyacylglutathione hydrolase Z1_00146 529507.PMI0224 2.4e-253 880.9 Proteus mltD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0008932,GO:0008933,GO:0009893,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0019222,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043085,GO:0044093,GO:0044464,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050790,GO:0051341,GO:0051353,GO:0061783,GO:0065007,GO:0065009 ko:K08307,ko:K12204 ko00000,ko01000,ko01011,ko02044 3.A.7.10.1,3.A.7.9.1 Bacteria 1MWKE@1224,1RMFZ@1236,3Z26T@583,COG0741@1,COG0741@2,COG1388@1,COG1388@2 NA|NA|NA M COG0741 Soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory proteins (some contain LysM invasin domains) Z1_00147 529507.PMI0223 0.0 1097.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1MW2F@1224,1RQFY@1236,COG3961@1,COG3961@2 NA|NA|NA GH Belongs to the TPP enzyme family Z1_00148 34506.g941 4.4e-242 843.6 Rhabditida Nematoda 1KXRD@119089,38C60@33154,3BBN0@33208,3CTA5@33213,40B1E@6231,40YZS@6236,COG0471@1,KOG1281@2759 NA|NA|NA P Sodium:sulfate symporter transmembrane region Z1_00149 34506.g940 1.6e-238 831.6 Rhabditida Nematoda 1M7XN@119089,3AEMG@33154,3BXA6@33208,3DEA8@33213,40QZ2@6231,4172H@6236,COG0148@1,KOG2670@2759 NA|NA|NA G Enolase, N-terminal domain Z1_00150 529507.PMI0220 0.0 1090.9 Proteus pyrG GO:0001775,GO:0002376,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003883,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006241,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008283,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009147,GO:0009148,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009208,GO:0009209,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016020,GO:0016874,GO:0016879,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0032943,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0040007,GO:0042098,GO:0042100,GO:0042110,GO:0042113,GO:0042221,GO:0042455,GO:0042493,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045321,GO:0046036,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046649,GO:0046651,GO:0050896,GO:0055086,GO:0070661,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 6.3.4.2 ko:K01937 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00052 R00571,R00573 RC00010,RC00074 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_1276,iECO103_1326.ECO103_3323,iNJ661.Rv1699,iPC815.YPO3377 Bacteria 1MUIT@1224,1RM92@1236,3Z1SG@583,COG0504@1,COG0504@2 NA|NA|NA F Catalyzes the ATP-dependent amination of UTP to CTP with either L-glutamine or ammonia as the source of nitrogen. Regulates intracellular CTP levels through interactions with the four ribonucleotide triphosphates Z1_00151 529507.PMI0218 1.2e-143 515.8 Proteus mazG GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006195,GO:0006203,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006244,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009144,GO:0009146,GO:0009147,GO:0009149,GO:0009151,GO:0009155,GO:0009164,GO:0009166,GO:0009199,GO:0009200,GO:0009203,GO:0009204,GO:0009208,GO:0009210,GO:0009211,GO:0009213,GO:0009215,GO:0009217,GO:0009218,GO:0009219,GO:0009222,GO:0009223,GO:0009259,GO:0009261,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009267,GO:0009394,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019692,GO:0019693,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0034656,GO:0042454,GO:0042594,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046046,GO:0046047,GO:0046051,GO:0046052,GO:0046060,GO:0046061,GO:0046070,GO:0046075,GO:0046076,GO:0046080,GO:0046081,GO:0046131,GO:0046133,GO:0046135,GO:0046386,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0047429,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071496,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072523,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901658 3.6.1.66,3.6.1.9 ko:K02428,ko:K02499,ko:K04765 ko00230,ko00240,ko00760,ko00770,ko01100,map00230,map00240,map00760,map00770,map01100 R00086,R00087,R00103,R00287,R00426,R00515,R00662,R00720,R01855,R02100,R02720,R03004,R03036,R03531,R11323 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036 iAF1260.b2781,iBWG_1329.BWG_2516,iE2348C_1286.E2348C_3048,iEC55989_1330.EC55989_3056,iECDH10B_1368.ECDH10B_2948,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2691,iECH74115_1262.ECH74115_4041,iECIAI1_1343.ECIAI1_2889,iECO103_1326.ECO103_3324,iECO111_1330.ECO111_3505,iECO26_1355.ECO26_3851,iECOK1_1307.ECOK1_3155,iECP_1309.ECP_2762,iECSE_1348.ECSE_3039,iECSP_1301.ECSP_3733,iECW_1372.ECW_m2990,iECs_1301.ECs3641,iEKO11_1354.EKO11_0987,iEcDH1_1363.EcDH1_0907,iEcE24377_1341.EcE24377A_3085,iEcHS_1320.EcHS_A2925,iEcolC_1368.EcolC_0931,iG2583_1286.G2583_3433,iJO1366.b2781,iJR904.b2781,iSBO_1134.SBO_2662,iSSON_1240.SSON_2938,iSbBS512_1146.SbBS512_E3092,iUMN146_1321.UM146_02665,iUMNK88_1353.UMNK88_3464,iUTI89_1310.UTI89_C3150,iWFL_1372.ECW_m2990,iY75_1357.Y75_RS14470,iZ_1308.Z4096 Bacteria 1MVKM@1224,1RNVU@1236,3Z2WX@583,COG1694@1,COG3956@2 NA|NA|NA S MazG nucleotide pyrophosphohydrolase domain Z1_00152 529507.PMI0217 0.0 1500.0 Proteus relA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008728,GO:0008893,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009150,GO:0009259,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0015949,GO:0015969,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016778,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016794,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030312,GO:0031667,GO:0033865,GO:0033875,GO:0034032,GO:0034035,GO:0034641,GO:0042278,GO:0042578,GO:0042594,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044464,GO:0046128,GO:0046483,GO:0050896,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:1901068,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901657 2.7.6.5,3.1.7.2 ko:K00951,ko:K01139 ko00230,map00230 R00336,R00429 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 iSFV_1184.SFV_2673 Bacteria 1MU44@1224,1RN3H@1236,3Z1SD@583,COG0317@1,COG0317@2 NA|NA|NA KT In eubacteria ppGpp (guanosine 3'-diphosphate 5-' diphosphate) is a mediator of the stringent response that coordinates a variety of cellular activities in response to changes in nutritional abundance Z1_00153 529507.PMI0216 6.3e-254 882.9 Proteus rlmD GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008169,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016436,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0070041,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.190 ko:K03215 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MV3A@1224,1RN1D@1236,3Z1EQ@583,COG2265@1,COG2265@2 NA|NA|NA J Catalyzes the formation of 5-methyl-uridine at position 1939 (m5U1939) in 23S rRNA Z1_00154 529507.PMI0215 1.9e-291 1007.7 Proteus dgt GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006195,GO:0006203,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008832,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009144,GO:0009146,GO:0009151,GO:0009155,GO:0009166,GO:0009200,GO:0009204,GO:0009215,GO:0009217,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009394,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016793,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019692,GO:0030145,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046070,GO:0046386,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050897,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072523,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576 3.1.5.1 ko:K01129 ko00230,map00230 R01856 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iSF_1195.SF0152 Bacteria 1MVQ2@1224,1RPVJ@1236,3Z1V2@583,COG0232@1,COG0232@2 NA|NA|NA F dGTPase preferentially hydrolyzes dGTP over the other canonical NTPs Z1_00155 529507.PMI0214 4.9e-128 463.8 Proteus mtnN GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006555,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008477,GO:0008652,GO:0008782,GO:0008930,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009086,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016787,GO:0016798,GO:0016799,GO:0017144,GO:0019284,GO:0019752,GO:0033353,GO:0034641,GO:0042278,GO:0042802,GO:0043094,GO:0043102,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046128,GO:0046394,GO:0046439,GO:0046483,GO:0046498,GO:0046500,GO:0051186,GO:0055086,GO:0071265,GO:0071267,GO:0071704,GO:0072521,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901657 3.2.2.9 ko:K01243 ko00270,ko01100,ko01230,map00270,map01100,map01230 M00034,M00609 R00194,R01401 RC00063,RC00318 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO3384,iSBO_1134.SBO_0148 Bacteria 1MY5S@1224,1RNSF@1236,3Z17M@583,COG0775@1,COG0775@2 NA|NA|NA F Catalyzes the irreversible cleavage of the glycosidic bond in both 5'-methylthioadenosine (MTA) and S- adenosylhomocysteine (SAH AdoHcy) to adenine and the corresponding thioribose, 5'-methylthioribose and S-ribosylhomocysteine, respectively Z1_00156 529507.PMI0213 1e-145 522.7 Proteus btuF GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0015889,GO:0015893,GO:0019842,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031419,GO:0031975,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042597,GO:0044464,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051181,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0097159,GO:1901363 ko:K02016,ko:K06858 ko02010,map02010 M00240,M00241 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.13,3.A.1.14 iECH74115_1262.ECH74115_0168,iECSP_1301.ECSP_0159,iECs_1301.ECs0162,iZ_1308.Z0169 Bacteria 1MWVF@1224,1RMV8@1236,3Z291@583,COG0614@1,COG0614@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex BtuCDF involved in vitamin B12 import. Binds vitamin B12 and delivers it to the periplasmic surface of BtuC Z1_00157 529507.PMI0206 6.1e-60 236.5 Proteus erpA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016226,GO:0019538,GO:0022607,GO:0031163,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051604,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564 ko:K13628,ko:K15724 ko00000,ko03016 Bacteria 1RHCW@1224,1S675@1236,3Z2T2@583,COG0316@1,COG0316@2 NA|NA|NA C Iron-sulphur cluster biosynthesis Z1_00158 529507.PMI0205 3.2e-250 870.5 Proteus hemL GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006782,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016869,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0040007,GO:0042168,GO:0042286,GO:0042440,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046501,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 5.4.3.8 ko:K01845 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R02272 RC00677 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iSB619.SA_RS08395,iUMNK88_1353.UMNK88_158 Bacteria 1MUY5@1224,1RM7N@1236,3Z12V@583,COG0001@1,COG0001@2 NA|NA|NA H Aminotransferase class-III Z1_00159 529507.PMI0204 0.0 1526.9 Proteus mrcB GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0008238,GO:0008289,GO:0008360,GO:0008658,GO:0008955,GO:0009002,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031406,GO:0031975,GO:0033218,GO:0033293,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042277,GO:0042546,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070008,GO:0070011,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071723,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901681 2.4.1.129,3.4.16.4 ko:K03814,ko:K05365 ko00550,map00550 R04519 RC00005,RC00049 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko01011 GT51 iECIAI39_1322.ECIAI39_0153,iSBO_1134.SBO_0138,iSbBS512_1146.SbBS512_E0140,iYL1228.KPN_00164 Bacteria 1QTST@1224,1RNHV@1236,3Z16T@583,COG0744@1,COG0744@2 NA|NA|NA M Cell wall formation. Synthesis of cross-linked peptidoglycan from the lipid intermediates. The enzyme has a penicillin-insensitive transglycosylase N-terminal domain (formation of linear glycan strands) and a penicillin-sensitive transpeptidase C-terminal domain (cross-linking of the peptide subunits) Z1_00160 529507.PMI0203 0.0 1561.2 Proteus hrpB 3.6.4.13 ko:K03579 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUEQ@1224,1RR1B@1236,3Z1U1@583,COG1643@1,COG1643@2 NA|NA|NA L ATP-dependent helicase C-terminal Z1_00161 529507.PMI0202 6.6e-133 479.9 Proteus sfsA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005975,GO:0006355,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0044238,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K06206 ko00000 Bacteria 1MUC3@1224,1RQ95@1236,3Z23T@583,COG1489@1,COG1489@2 NA|NA|NA S Sugar fermentation stimulation protein Z1_00162 529507.PMI0200 3.9e-78 297.4 Proteus dksA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K06204 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko03000,ko03009,ko03021 Bacteria 1RD08@1224,1S47H@1236,3Z2KF@583,COG1734@1,COG1734@2 NA|NA|NA T Transcription factor that acts by binding directly to the RNA polymerase (RNAP). Required for negative regulation of rRNA expression and positive regulation of several amino acid biosynthesis promoters. Also required for regulation of fis expression Z1_00164 529507.PMI0198 2.1e-252 877.9 Proteus pcnB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004652,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006276,GO:0006378,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0031123,GO:0031124,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043631,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070566,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 2.7.7.19,2.7.7.72 ko:K00970,ko:K00974 ko03013,ko03018,map03013,map03018 R09382,R09383,R09384,R09386 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1MVCS@1224,1RMBG@1236,3Z21K@583,COG0617@1,COG0617@2 NA|NA|NA H Adds poly(A) tail to the 3' end of many RNAs, which usually targets these RNAs for decay. Plays a significant role in the global control of gene expression, through influencing the rate of transcript degradation, and in the general RNA quality control Z1_00165 529507.PMI0197 6.3e-90 336.7 Proteus folK GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003848,GO:0005488,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016778,GO:0043167,GO:0043169,GO:0046872 2.7.6.3,4.1.2.25 ko:K00950,ko:K13940 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03503,R03504 RC00002,RC00017,RC00721,RC00943 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0136,iEcDH1_1363.EcDH1_3460,iJN746.PP_4698,iSBO_1134.SBO_0131 Bacteria 1MZH8@1224,1S63J@1236,3Z1DE@583,COG0801@1,COG0801@2 NA|NA|NA H 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase (HPPK) Z1_00166 529507.PMI0196 1.3e-142 512.3 Proteus panB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003864,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006573,GO:0006575,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033317,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 2.1.2.11 ko:K00606 ko00770,ko01100,ko01110,map00770,map01100,map01110 M00119 R01226 RC00022,RC00200 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iB21_1397.B21_00132,iE2348C_1286.E2348C_0137,iECBD_1354.ECBD_3485,iECB_1328.ECB_00133,iECD_1391.ECD_00133,iPC815.YPO3401 Bacteria 1MU3B@1224,1RM8D@1236,3Z22F@583,COG0413@1,COG0413@2 NA|NA|NA H Catalyzes the reversible reaction in which hydroxymethyl group from 5,10-methylenetetrahydrofolate is transferred onto alpha-ketoisovalerate to form ketopantoate Z1_00167 529507.PMI0195 6.9e-153 546.6 Proteus panC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004592,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006573,GO:0006575,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033317,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 6.3.2.1 ko:K01918 ko00410,ko00770,ko01100,ko01110,map00410,map00770,map01100,map01110 M00119 R02473 RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_0142,iECSP_1301.ECSP_0134,iECs_1301.ECs0137,iG2583_1286.G2583_0137,iZ_1308.Z0144 Bacteria 1MV1S@1224,1RMEG@1236,3Z2F1@583,COG0414@1,COG0414@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of pantoate with beta-alanine in an ATP-dependent reaction via a pantoyl-adenylate intermediate Z1_00168 34506.g820 1e-63 249.2 Bilateria Metazoa 2SPGD@2759,3AMB9@33154,3C0CY@33208,3DGPG@33213,COG0853@1 NA|NA|NA H Aspartate decarboxylase Z1_00169 529507.PMI0193 9.4e-115 419.5 Proteus uhpA ko:K02282,ko:K07686,ko:K07687,ko:K07689,ko:K20264 ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02024,map02025,map02026,map05111 M00473,M00474,M00475,M00818 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko02035,ko02044 Bacteria 1QW4D@1224,1RVMQ@1236,3Z151@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_00170 529507.PMI0192 4.4e-283 979.9 Proteus uhpB 2.7.13.3 ko:K07675,ko:K14988,ko:K20263 ko02020,ko02024,map02020,map02024 M00473,M00522,M00818 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1QUAD@1224,1RMGY@1236,3Z19A@583,COG3851@1,COG3851@2 NA|NA|NA T two-component sensor histidine kinase UhpB, phosphorylates UhpA K07675 Z1_00171 529507.PMI0191 1e-259 902.1 Proteus uhpC ko:K02445,ko:K07783 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.1.4.3,2.A.1.4.4,2.A.1.4.6 Bacteria 1MX4V@1224,1RMB3@1236,3Z0X6@583,COG2271@1,COG2271@2 NA|NA|NA G Major Facilitator Superfamily Z1_00172 529507.PMI0190 2.4e-192 677.9 Proteus afuA ko:K02012 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MXZ8@1224,1RPPC@1236,3Z1NW@583,COG1840@1,COG1840@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_00173 529507.PMI0189 0.0 1310.8 Proteus afuB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02011 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MXZZ@1224,1RY3W@1236,3Z11Z@583,COG1178@1,COG1178@2 NA|NA|NA P transport system permease Z1_00174 529507.PMI0188 1.5e-194 685.3 Proteus fbpC GO:0000041,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005381,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006826,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0034220,GO:0034755,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043492,GO:0046873,GO:0046915,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 3.6.3.30 ko:K02010 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MU3I@1224,1RMTS@1236,3Z2BT@583,COG3842@1,COG3842@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex FbpABC involved in Fe(3 ) ions import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_00175 529507.PMI0187 7.7e-252 875.9 Proteus dsdA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008721,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009636,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016840,GO:0016841,GO:0017144,GO:0019478,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0033554,GO:0036088,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042737,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0046416,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051410,GO:0051716,GO:0070178,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:0098754,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901698 4.3.1.18 ko:K01753 ko00260,map00260 R00221 RC02600 ko00000,ko00001,ko01000 iECED1_1282.ECED1_2813,iLF82_1304.LF82_0525,iNRG857_1313.NRG857_11890 Bacteria 1MUJS@1224,1RNBW@1236,3Z244@583,COG3048@1,COG3048@2 NA|NA|NA E Pyridoxal-phosphate dependent enzyme Z1_00176 529507.PMI0186 6.2e-233 813.1 Proteus dsdX GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008028,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0008643,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015128,GO:0015144,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015804,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0022889,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032329,GO:0033554,GO:0034219,GO:0034220,GO:0035429,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042873,GO:0042879,GO:0042940,GO:0042942,GO:0042943,GO:0042945,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03299,ko:K13629 ko00000,ko02000 2.A.8,2.A.8.1.5 Bacteria 1MUFG@1224,1RNGE@1236,3Z27S@583,COG2610@1,COG2610@2 NA|NA|NA EG GntP family permease Z1_00177 529507.PMI0184 1.7e-181 641.7 Proteus dsdC GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K13636 ko00000,ko03000 Bacteria 1MWY0@1224,1RNMN@1236,3Z148@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00178 529507.PMI0183 0.0 1264.2 Proteus gsp GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008884,GO:0008885,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016880,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 3.5.1.78,6.3.1.8 ko:K01460 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R01917,R01918 RC00090,RC00096 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_3484 Bacteria 1MW6V@1224,1RQAP@1236,3Z164@583,COG0754@1,COG0754@2 NA|NA|NA E Glutathionylspermidine synthase preATP-grasp Z1_00179 529507.PMI0182 7.4e-46 189.5 Proteus Bacteria 1QCRZ@1224,1T8II@1236,3Z2ZC@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_00180 642227.HA49_05160 8.8e-13 80.9 Tatumella Bacteria 1R7A4@1224,1RYR6@1236,2CJUB@1,2Z9DV@2,4BVU0@82986 NA|NA|NA S Protein involved in biological_process Z1_00181 529507.PMI0178 2.7e-77 294.7 Gammaproteobacteria ko:K06887,ko:K11903 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1RAGF@1224,1S2BN@1236,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S type VI secretion system effector, Hcp1 family Z1_00182 34506.g662 9.2e-106 389.4 Bilateria Metazoa 2SDDK@2759,3AVKP@33154,3C41Q@33208,3DKRY@33213,COG3470@1 NA|NA|NA P Fe2+ transport protein Z1_00183 529507.PMI0175 1.6e-55 221.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1QTWM@1224,1T2G6@1236,COG4454@1,COG4454@2 NA|NA|NA P Cupredoxin-like domain Z1_00184 529507.PMI0174 4.4e-144 517.3 Proteus efeU ko:K07243 ko00000,ko02000 2.A.108.1,2.A.108.2 Bacteria 1MX1M@1224,1S4R0@1236,3Z1DF@583,COG0672@1,COG0672@2 NA|NA|NA P Iron permease FTR1 family Z1_00185 529507.PMI0173 4.5e-166 590.5 Proteus efeO GO:0000041,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006826,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009636,GO:0015684,GO:0016020,GO:0030001,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042221,GO:0042597,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0070838,GO:0071944,GO:0072511 ko:K07224,ko:K07243 ko00000,ko02000 2.A.108.1,2.A.108.2,2.A.108.2.3 Bacteria 1MWFR@1224,1RNWE@1236,3Z1TB@583,COG2822@1,COG2822@2 NA|NA|NA P periplasmic lipoprotein involved in iron transport Z1_00186 529507.PMI0172 6.5e-248 862.8 Proteus efeB ko:K16301 ko00000,ko01000,ko02000 2.A.108.2.3 Bacteria 1MUEE@1224,1RNXN@1236,3Z2BQ@583,COG2837@1,COG2837@2 NA|NA|NA C Dyp-type peroxidase family Z1_00187 529507.PMI0171 1.4e-124 452.2 Proteus Bacteria 1RAF8@1224,1T9Z3@1236,3Z2VT@583,COG1414@1,COG1414@2 NA|NA|NA K IclR helix-turn-helix domain Z1_00188 529507.PMI0170 0.0 1585.9 Proteus Bacteria 1NR6J@1224,1RZM3@1236,3Z2CI@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Molybdopterin oxidoreductase Z1_00189 529507.PMI0169 4e-109 400.6 Proteus ko:K07307 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1MU5T@1224,1S16W@1236,3Z247@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_00190 529507.PMI0168 7.8e-146 523.1 Proteus ko:K07308,ko:K07312 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1RDI6@1224,1S437@1236,3Z1KX@583,COG3302@1,COG3302@2 NA|NA|NA S DMSO reductase anchor subunit (DmsC) Z1_00191 529507.PMI0167 2.4e-93 348.2 Proteus lemA ko:K03744 ko00000 Bacteria 1MVH0@1224,1RP1N@1236,3Z0US@583,COG1704@1,COG1704@2 NA|NA|NA S LemA family Z1_00192 529507.PMI0166 2.7e-169 601.3 Proteus htpX ko:K03799 M00743 ko00000,ko00002,ko01000,ko01002 Bacteria 1MVU4@1224,1RPJ5@1236,3Z0WN@583,COG0501@1,COG0501@2 NA|NA|NA O Peptidase family M48 Z1_00193 529507.PMI0165 1.1e-23 115.2 Proteus ydcY GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N4XF@1224,1SJIJ@1236,2D0NU@1,32T8Y@2,3Z32I@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2526) Z1_00194 529507.PMI0164 5.9e-222 776.5 Proteus yceI ko:K08369 ko00000,ko02000 2.A.1 Bacteria 1MVQQ@1224,1RXEZ@1236,3Z161@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Uncharacterised MFS-type transporter YbfB Z1_00195 529507.PMI0163 1.8e-136 491.9 Proteus yadH GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MUH1@1224,1RP0Z@1236,3Z1IW@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 type transporter Z1_00196 529507.PMI0162 3.3e-172 610.9 Proteus yadG GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016020,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K01990,ko:K09695 ko02010,map02010 M00252,M00254 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1,3.A.1.102 Bacteria 1MUW7@1224,1RMC5@1236,3Z1PB@583,COG1131@1,COG1131@2 NA|NA|NA V (ABC) transporter Z1_00197 529507.PMI0161 1.8e-124 451.8 Proteus can GO:0003674,GO:0003824,GO:0004089,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008270,GO:0015976,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914 4.2.1.1 ko:K01673 ko00910,map00910 R00132,R10092 RC02807 ko00000,ko00001,ko01000 iNJ661.Rv3273,iSBO_1134.SBO_0115,iSbBS512_1146.SbBS512_E0119 Bacteria 1NGFN@1224,1RSY6@1236,3Z13J@583,COG0288@1,COG0288@2 NA|NA|NA H Reversible hydration of carbon dioxide Z1_00198 34506.g1417 3.8e-96 357.5 Rhabditida Nematoda 1M6XP@119089,38C8X@33154,3BCYI@33208,3CRZY@33213,40PEW@6231,415GD@6236,COG0634@1,KOG3367@2759 NA|NA|NA F Phosphoribosyl transferase domain Z1_00199 529507.PMI0159 4.8e-309 1066.2 Proteus cueO GO:0003674,GO:0003824,GO:0004322,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010273,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0016722,GO:0016724,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042221,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0046688,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0055114,GO:0061687,GO:0097501,GO:0098754,GO:1990169 ko:K04753,ko:K14588 ko00000 iECH74115_1262.ECH74115_0130,iECSP_1301.ECSP_0124,iSbBS512_1146.SbBS512_E0116 Bacteria 1MU0J@1224,1RQ4N@1236,3Z1IE@583,COG2132@1,COG2132@2 NA|NA|NA Q Multi-copper Z1_00200 529507.PMI0158 1.1e-56 225.7 Proteus yacC Bacteria 1RH3T@1224,1S639@1236,2B1X9@1,31UDJ@2,3Z2VP@583 NA|NA|NA S Type II secretion system pilotin lipoprotein (PulS_OutS) Z1_00201 529507.PMI0157 5.8e-178 630.2 Proteus yhjN ko:K07120 ko00000 Bacteria 1MUFS@1224,1RQKZ@1236,3Z1C5@583,COG3180@1,COG3180@2 NA|NA|NA S Pfam:AmoA Z1_00202 529507.PMI0156 9.9e-73 279.3 Proteus Bacteria 1N6QA@1224,1S922@1236,3Z2ZG@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_00203 529507.PMI0155 1.6e-172 612.8 Proteus Bacteria 1QD0E@1224,1T8V1@1236,29ECH@1,301AG@2,3Z3GU@583 NA|NA|NA Z1_00204 529507.PMI0154 2.1e-114 418.3 Proteus Bacteria 1MUM7@1224,1RRQ8@1236,3Z1EP@583,COG2964@1,COG2964@2 NA|NA|NA S YheO-like PAS domain Z1_00205 529507.PMI0153 2.8e-114 417.9 Proteus Bacteria 1RAHE@1224,1S2WD@1236,3Z2JU@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_00206 529507.PMI0152 8.7e-234 815.8 Proteus Bacteria 1MX45@1224,1RYPA@1236,3Z157@583,COG5441@1,COG5441@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0261) Z1_00207 529507.PMI0151 6.5e-156 556.6 Proteus Bacteria 1MXTY@1224,1RYFS@1236,3Z0YQ@583,COG5564@1,COG5564@2 NA|NA|NA S Phosphoenolpyruvate hydrolase-like Z1_00208 529507.PMI0150 6.6e-162 576.6 Proteus dapB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006591,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0047530,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901605 1.4.1.12,1.4.1.16,1.4.1.26 ko:K03340,ko:K21672 ko00300,ko00310,ko00330,ko00472,ko01100,ko01110,ko01230,map00300,map00310,map00330,map00472,map01100,map01110,map01230 M00526 R02755,R02825,R04200,R04201,R04687,R04688 RC00006,RC00249,RC00790 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1QUE1@1224,1T1VG@1236,3Z14P@583,COG3804@1,COG3804@2 NA|NA|NA S Catalyzes the reversible NADPH-dependent reductive amination of L-2-amino-6-oxopimelate, the acyclic form of L- tetrahydrodipicolinate, to generate the meso compound, D,L-2,6- diaminopimelate Z1_00209 529507.PMI0149 3.1e-248 864.0 Proteus yisQ ko:K03327 ko00000,ko02000 2.A.66.1 Bacteria 1MVRV@1224,1RNQ7@1236,3Z125@583,COG0534@1,COG0534@2 NA|NA|NA V MatE Z1_00210 529507.PMI0148 1.8e-92 345.5 Proteus Bacteria 1QGKY@1224,1TE1P@1236,29YYN@1,30KVG@2,3Z3IE@583 NA|NA|NA Z1_00211 529507.PMI0147 9e-242 842.4 Proteus pepT 3.4.11.4 ko:K01258 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MV7D@1224,1RMKZ@1236,3Z1NJ@583,COG2195@1,COG2195@2 NA|NA|NA E Cleaves the N-terminal amino acid of tripeptides Z1_00212 529507.PMI0146 1.1e-240 839.0 Proteus dcuD_1 ko:K03326 ko00000,ko02000 2.A.61.1 Bacteria 1MWBG@1224,1S01Z@1236,3Z1TG@583,COG3069@1,COG3069@2 NA|NA|NA C C4-dicarboxylate anaerobic carrier Z1_00213 529507.PMI0145 5e-235 820.1 Proteus yhaM GO:0000096,GO:0000098,GO:0001101,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009093,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019448,GO:0019450,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042221,GO:0043200,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044273,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0046439,GO:0050896,GO:0071704,GO:0080146,GO:1901367,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901698,GO:1901700 Bacteria 1MW81@1224,1RP1R@1236,3Z2H9@583,COG3681@1,COG3681@2 NA|NA|NA S Serine dehydratase alpha chain Z1_00214 529507.PMI0144 8.7e-184 649.4 Proteus yjiA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017111,GO:0033554,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1MVZV@1224,1RQDY@1236,3Z1VQ@583,COG0523@1,COG0523@2 NA|NA|NA S CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain Z1_00215 471881.PROPEN_02916 1.6e-34 151.4 Proteus yjiX GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1N6TY@1224,1S8VA@1236,3Z2ZA@583,COG2879@1,COG2879@2 NA|NA|NA S Selenoprotein, putative Z1_00216 529507.PMI0142 0.0 1404.0 Proteus cstA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071944 ko:K06200 ko00000 Bacteria 1MWF9@1224,1RMG4@1236,3Z2H2@583,COG1966@1,COG1966@2 NA|NA|NA T 5TM C-terminal transporter carbon starvation CstA Z1_00217 529507.PMI0141 1.8e-110 405.2 Proteus recR GO:0000731,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K06187 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MV9Q@1224,1RN99@1236,3Z1TQ@583,COG0353@1,COG0353@2 NA|NA|NA L May play a role in DNA repair. It seems to be involved in an RecBC-independent recombinational process of DNA repair. It may act with RecF and RecO Z1_00218 529507.PMI0140 2.9e-51 207.6 Proteus ybaB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0097159,GO:1901363 ko:K06187,ko:K09747 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1RGZD@1224,1S5WU@1236,3Z30C@583,COG0718@1,COG0718@2 NA|NA|NA S Binds to DNA and alters its conformation. May be involved in regulation of gene expression, nucleoid organization and DNA protection Z1_00219 529507.PMI0139 0.0 1175.6 Proteus dnaX GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0030234,GO:0030337,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042575,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043846,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050790,GO:0061695,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0090304,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02343 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MVCK@1224,1RMIA@1236,3Z0ZS@583,COG2812@1,COG2812@2 NA|NA|NA H DNA polymerase III is a complex, multichain enzyme responsible for most of the replicative synthesis in bacteria. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity Z1_00220 529507.PMI0138 4.9e-99 367.1 Proteus apt GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003999,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006144,GO:0006166,GO:0006168,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009113,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009163,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042440,GO:0042451,GO:0042455,GO:0042802,GO:0043094,GO:0043096,GO:0043101,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043174,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046083,GO:0046084,GO:0046112,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.4.2.7 ko:K00759 ko00230,ko01100,map00230,map01100 R00190,R01229,R04378 RC00063 ko00000,ko00001,ko01000,ko04147 iUTI89_1310.UTI89_C0496,ic_1306.c0588 Bacteria 1MVZ6@1224,1S2N9@1236,3Z0XI@583,COG0503@1,COG0503@2 NA|NA|NA F Catalyzes a salvage reaction resulting in the formation of AMP, that is energically less costly than de novo synthesis Z1_00221 529507.PMI0137 4.9e-88 330.5 Proteus priC GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006270,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 ko:K04067 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1RIA6@1224,1S5VE@1236,3Z2QM@583,COG3923@1,COG3923@2 NA|NA|NA L Primosomal replication protein priC Z1_00222 529507.PMI0136 8.1e-20 102.1 Proteus ybaM GO:0006950,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0036460,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1NGAT@1224,1SGE4@1236,2EHYU@1,33BQB@2,3Z34G@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2496) Z1_00223 529507.PMI0135 0.0 2135.5 Proteus kefA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006884,GO:0008150,GO:0008361,GO:0009987,GO:0009992,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019725,GO:0030104,GO:0032535,GO:0042592,GO:0044464,GO:0048878,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090066 ko:K05802,ko:K06994,ko:K15771,ko:K22051 ko02010,map02010 M00491 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 1.A.23.1.1,1.A.23.1.2,1.A.23.1.3,3.A.1.1.16,3.A.1.1.2 Bacteria 1MWSA@1224,1RMYY@1236,3Z211@583,COG1196@1,COG1196@2,COG3264@1,COG3264@2 NA|NA|NA DM Mechanosensitive ion channel Z1_00224 529507.PMI0134 3.1e-59 234.2 Proteus ychN GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0034214,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051259,GO:0065003,GO:0071840 ko:K06039 ko00000 Bacteria 1RDFR@1224,1S3RB@1236,3Z2NT@583,COG1553@1,COG1553@2 NA|NA|NA P DsrE/DsrF-like family Z1_00225 529507.PMI0133 3.7e-114 417.5 Proteus acrR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03577 M00647 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1N659@1224,1RPXN@1236,3Z27A@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K MAATS-type transcriptional repressor, C-terminal region Z1_00226 529507.PMI0132 8.3e-213 746.1 Proteus acrA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015238,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015721,GO:0015849,GO:0015850,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046677,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098796,GO:1902495,GO:1990281,GO:1990351 ko:K03585 ko01501,ko01503,map01501,map01503 M00646,M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000,ko03036 2.A.6.2,8.A.1.6 iSDY_1059.SDY_0456 Bacteria 1MU78@1224,1RPI1@1236,3Z1WT@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion Z1_00227 529507.PMI0131 0.0 1988.4 Proteus acrB ko:K18138 ko01501,ko01503,map01501,map01503 M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.6.2 Bacteria 1MU48@1224,1RMBN@1236,3Z1ZE@583,COG0841@1,COG0841@2 NA|NA|NA V AcrB/AcrD/AcrF family Z1_00228 529507.PMI0130 2.1e-63 248.1 Proteus tomB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0008150,GO:0009987,GO:0042710,GO:0044010,GO:0044764,GO:0051704,GO:0097159,GO:1901363 ko:K19162 ko00000,ko02048 Bacteria 1RA3M@1224,1S20M@1236,28PF7@1,2ZC6G@2,3Z2TN@583 NA|NA|NA S Biofilm formation regulator YbaJ Z1_00229 529507.PMI0129 3e-30 137.1 Proteus hha GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0010468,GO:0019222,GO:0032879,GO:0040012,GO:0040017,GO:0043900,GO:0043901,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051270,GO:0051272,GO:0060255,GO:0065007,GO:1900190,GO:1900191,GO:2000145,GO:2000147 ko:K05839 ko00000,ko02048 Bacteria 1MZDE@1224,1S995@1236,2CN5N@1,32SGA@2,3Z31J@583 NA|NA|NA S Haemolysin expression modulating protein Z1_00231 529507.PMI0128 6.2e-165 586.6 Proteus tesB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009259,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016289,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033865,GO:0033875,GO:0034032,GO:0034641,GO:0035383,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0046483,GO:0047617,GO:0051186,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072329,GO:0072521,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901575 ko:K10805 ko01040,map01040 ko00000,ko00001,ko01000,ko01004 iAF1260.b0452,iB21_1397.B21_00408,iBWG_1329.BWG_0334,iEC55989_1330.EC55989_0466,iECBD_1354.ECBD_3203,iECB_1328.ECB_00404,iECDH10B_1368.ECDH10B_0408,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0437,iECD_1391.ECD_00404,iECH74115_1262.ECH74115_0541,iECIAI1_1343.ECIAI1_0456,iECIAI39_1322.ECIAI39_0221,iECO103_1326.ECO103_0429,iECO111_1330.ECO111_0485,iECO26_1355.ECO26_0487,iECSE_1348.ECSE_0478,iECSP_1301.ECSP_0520,iECUMN_1333.ECUMN_0492,iECW_1372.ECW_m0524,iECs_1301.ECs0506,iEKO11_1354.EKO11_3394,iETEC_1333.ETEC_0505,iEcDH1_1363.EcDH1_3157,iEcE24377_1341.EcE24377A_0488,iEcHS_1320.EcHS_A0529,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0496,iEcolC_1368.EcolC_3163,iG2583_1286.G2583_0564,iJO1366.b0452,iSSON_1240.SSON_0440,iUMNK88_1353.UMNK88_505,iWFL_1372.ECW_m0524,iY75_1357.Y75_RS02335,iZ_1308.Z0564,ic_1306.c0571 Bacteria 1MV9R@1224,1RPFI@1236,3Z22G@583,COG1946@1,COG1946@2 NA|NA|NA I acyl-CoA thioesterase II Z1_00232 529507.PMI0127 1.9e-239 834.7 Proteus amtB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015291,GO:0015292,GO:0015669,GO:0015670,GO:0015696,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019755,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098655 ko:K03320 ko00000,ko02000 1.A.11 iEcE24377_1341.EcE24377A_0487 Bacteria 1NR9F@1224,1RNKF@1236,3Z2GQ@583,COG0004@1,COG0004@2 NA|NA|NA P Ammonium Transporter Family Z1_00233 529507.PMI0126 1.3e-54 218.8 Proteus glnK GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006808,GO:0008150,GO:0042802,GO:0045848,GO:0048518,GO:0050789,GO:0065007 ko:K04751,ko:K04752 ko02020,map02020 ko00000,ko00001 Bacteria 1RGWK@1224,1S67I@1236,3Z2TD@583,COG0347@1,COG0347@2 NA|NA|NA K Nitrogen regulatory protein P-II Z1_00234 529507.PMI0125 0.0 1127.9 Proteus mdlB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008144,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015399,GO:0015405,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0033036,GO:0034040,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K06147,ko:K18890 ko02010,map02010 M00707 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.106,3.A.1.106.13,3.A.1.106.5,3.A.1.109,3.A.1.21 Bacteria 1MUBM@1224,1RMUR@1236,3Z0VZ@583,COG1132@1,COG1132@2 NA|NA|NA P ABC transporter Z1_00235 529507.PMI0124 0.0 1107.4 Proteus mdlA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008144,GO:0016020,GO:0016021,GO:0017076,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K06148,ko:K18889 ko02010,map02010 M00707 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1,3.A.1.106.13,3.A.1.106.5 Bacteria 1MUBM@1224,1RMUR@1236,3Z1HP@583,COG1132@1,COG1132@2 NA|NA|NA V Involved in lipid A export and possibly also in glycerophospholipid export and for biogenesis of the outer membrane. Transmembrane domains (TMD) form a pore in the inner membrane and the ATP-binding domain (NBD) is responsible for energy generation Z1_00236 529507.PMI0123 1.4e-80 305.4 Proteus ybaO GO:0000096,GO:0000098,GO:0001101,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006725,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009093,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016054,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031334,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0043170,GO:0043200,GO:0043254,GO:0043436,GO:0043565,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044273,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046395,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901698,GO:1901700,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000142,GO:2000144,GO:2001141 ko:K03719,ko:K05800 ko00000,ko03000,ko03036 Bacteria 1RDB3@1224,1S2E1@1236,3Z2HA@583,COG1522@1,COG1522@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix ASNC type Z1_00237 529507.PMI0122 3.2e-132 477.6 Proteus queC 6.3.4.20 ko:K06920 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R09978 RC00959 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MU5V@1224,1RMG9@1236,3Z1K7@583,COG0603@1,COG0603@2 NA|NA|NA F Catalyzes the ATP-dependent conversion of 7-carboxy-7- deazaguanine (CDG) to 7-cyano-7-deazaguanine (preQ(0)) Z1_00238 529507.PMI0121 1.9e-68 265.0 Proteus tesC GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016289,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0047617,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 ko:K07107,ko:K12500 ko00000,ko01000,ko01004 Bacteria 1REIH@1224,1S40Z@1236,3Z2X3@583,COG0824@1,COG0824@2 NA|NA|NA S Acyl-ACP thioesterase Z1_00239 529507.PMI0120 1e-57 229.2 Proteus comEA ko:K02237 M00429 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.11.1,3.A.11.2 Bacteria 1QG52@1224,1TDHT@1236,3Z2ZI@583,COG1555@1,COG1555@2 NA|NA|NA L Helix-hairpin-helix motif Z1_00240 529507.PMI0119 0.0 1106.7 Proteus ppiD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006457,GO:0008150,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0061077,GO:0071575,GO:0071944,GO:0098552 5.2.1.8 ko:K01802,ko:K03769,ko:K03770 ko00000,ko01000,ko03110 Bacteria 1MWV0@1224,1RMT5@1236,3Z0WW@583,COG0760@1,COG0760@2 NA|NA|NA O peptidylprolyl isomerase Z1_00241 529507.PMI0118 5.1e-41 173.3 Proteus hupB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006323,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010556,GO:0016043,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051276,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2001141 ko:K03530 ko00000,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MZ5B@1224,1S8VH@1236,3Z3HF@583,COG0776@1,COG0776@2 NA|NA|NA L Histone-like DNA-binding protein which is capable of wrapping DNA to stabilize it, and thus to prevent its denaturation under extreme environmental conditions Z1_00242 529507.PMI0117 0.0 1502.6 Proteus lon GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004176,GO:0004252,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006515,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017171,GO:0019538,GO:0030163,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051603,GO:0070011,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.4.21.53 ko:K01338 ko04112,map04112 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUV2@1224,1RPCB@1236,3Z19U@583,COG0466@1,COG0466@2 NA|NA|NA O ATP-dependent serine protease that mediates the selective degradation of mutant and abnormal proteins as well as certain short-lived regulatory proteins. Required for cellular homeostasis and for survival from DNA damage and developmental changes induced by stress. Degrades polypeptides processively to yield small peptide fragments that are 5 to 10 amino acids long. Binds to DNA in a double-stranded, site-specific manner Z1_00243 529507.PMI0116 1.5e-239 835.1 Proteus clpX GO:0000166,GO:0000502,GO:0002020,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004176,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009376,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019538,GO:0019899,GO:0019904,GO:0030163,GO:0030164,GO:0030312,GO:0030554,GO:0031333,GO:0031597,GO:0032271,GO:0032272,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043254,GO:0043335,GO:0044087,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051301,GO:0051704,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097718,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1902494,GO:1904949,GO:1905368,GO:1905369 ko:K03544 ko04112,map04112 ko00000,ko00001,ko03110 Bacteria 1MVQK@1224,1RN9N@1236,3Z24X@583,COG1219@1,COG1219@2 NA|NA|NA O ATP-dependent specificity component of the Clp protease. It directs the protease to specific substrates. Can perform chaperone functions in the absence of ClpP Z1_00244 471881.PROPEN_02971 6.2e-111 406.8 Proteus clpP GO:0000502,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004176,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006515,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009376,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010498,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017171,GO:0019538,GO:0019899,GO:0030163,GO:0031597,GO:0032991,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051117,GO:0051603,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1902494,GO:1904949,GO:1905368,GO:1905369 3.4.21.92 ko:K01358 ko04112,ko04212,map04112,map04212 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MV46@1224,1RNR6@1236,3Z0V8@583,COG0740@1,COG0740@2 NA|NA|NA O Cleaves peptides in various proteins in a process that requires ATP hydrolysis. Has a chymotrypsin-like activity. Plays a major role in the degradation of misfolded proteins Z1_00245 529507.PMI0114 1.7e-235 821.6 Proteus tig GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006464,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0036211,GO:0042802,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043170,GO:0043335,GO:0043412,GO:0044183,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0050896,GO:0051083,GO:0061077,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K03545 ko00000 Bacteria 1MUJP@1224,1RNZE@1236,3Z27Q@583,COG0544@1,COG0544@2 NA|NA|NA D Involved in protein export. Acts as a chaperone by maintaining the newly synthesized protein in an open conformation. Functions as a peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Z1_00246 529507.PMI0113 2.3e-53 214.5 Proteus bolA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008360,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051604,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097428,GO:0097659,GO:0106035,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 ko:K05527,ko:K22066 ko00000,ko03000,ko03029 Bacteria 1MZG5@1224,1S91G@1236,3Z2XB@583,COG0271@1,COG0271@2 NA|NA|NA T BolA-like protein Z1_00247 529507.PMI0112 4.3e-98 364.0 Proteus yajG ko:K07286 ko00000 Bacteria 1MZ1N@1224,1RPG1@1236,3Z1JJ@583,COG3056@1,COG3056@2 NA|NA|NA M Uncharacterized lipoprotein Z1_00248 529507.PMI0111 3.1e-281 973.8 Proteus ampG GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015318,GO:0015672,GO:0015835,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1901264,GO:1902600 ko:K08218 ko01501,map01501 M00628 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.1.25 Bacteria 1MUZ8@1224,1T1NH@1236,3Z2CF@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Acetyl-coenzyme A transporter 1 Z1_00249 529507.PMI0110 1.7e-257 894.8 Proteus dbpA GO:0000027,GO:0000166,GO:0000339,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003724,GO:0003725,GO:0003729,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008135,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010501,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016281,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033677,GO:0034458,GO:0034459,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0042623,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043531,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070035,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140097,GO:0140098,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.6.4.13 ko:K05591,ko:K05592 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009,ko03019 Bacteria 1MU49@1224,1RQ36@1236,3Z1T8@583,COG0513@1,COG0513@2 NA|NA|NA JKL DEAD-box RNA helicase involved in the assembly of the 50S ribosomal subunit. Has an RNA-dependent ATPase activity, which is specific for 23S rRNA, and a 3' to 5' RNA helicase activity that uses the energy of ATP hydrolysis to destabilize and unwind short rRNA duplexes Z1_00250 529507.PMI0109 5.2e-152 543.5 Proteus yfeN Bacteria 1R4VQ@1224,1RRVS@1236,28ICJ@1,2Z8EW@2,3Z1D0@583 NA|NA|NA S Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx Z1_00251 529507.PMI0108 6.4e-160 570.1 Proteus cyoA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009319,GO:0009486,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0015002,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015453,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019646,GO:0019693,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0032991,GO:0034220,GO:0034641,GO:0042773,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0048037,GO:0048038,GO:0048039,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071575,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0098552,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1902600 1.10.3.10,1.10.3.12 ko:K02297,ko:K02826 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00416,M00417 R09492,R11335 RC00061,RC00819 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.1,3.D.4.5 iE2348C_1286.E2348C_0367,iJN746.PP_0812,iSB619.SA_RS05175 Bacteria 1MWHZ@1224,1RP4H@1236,3Z1IZ@583,COG1622@1,COG1622@2 NA|NA|NA C Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain Z1_00252 529507.PMI0107 0.0 1324.7 Proteus cyoB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009319,GO:0009486,GO:0009987,GO:0015002,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015453,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0019646,GO:0020037,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046872,GO:0046906,GO:0046914,GO:0048037,GO:0048038,GO:0048039,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071944,GO:0097159,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:1901363,GO:1902494,GO:1902600 1.10.3.10,1.10.3.12,1.9.3.1 ko:K02274,ko:K02298,ko:K02827 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00155,M00416,M00417 R00081,R09492,R11335 RC00016,RC00061,RC00819 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.1,3.D.4.2,3.D.4.3,3.D.4.4,3.D.4.5,3.D.4.6 Bacteria 1MU7S@1224,1RPC3@1236,3Z1G9@583,COG0843@1,COG0843@2 NA|NA|NA C Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family Z1_00253 529507.PMI0106 1.4e-107 395.6 Proteus cyoC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009319,GO:0009486,GO:0009987,GO:0015002,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015453,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0019646,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:1902494,GO:1902600 ko:K02299 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00417 ko00000,ko00001,ko00002 3.D.4.5 iPC815.YPO3166 Bacteria 1MUCK@1224,1RN9D@1236,3Z2ST@583,COG1845@1,COG1845@2 NA|NA|NA C cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III Z1_00254 529507.PMI0105A 2e-52 211.5 Proteus cyoD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009319,GO:0009486,GO:0009987,GO:0015002,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015453,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0019646,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:1902494,GO:1902600 ko:K02300 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00417 ko00000,ko00001,ko00002 3.D.4.5 iAF1260.b0429,iB21_1397.B21_00384,iBWG_1329.BWG_0311,iE2348C_1286.E2348C_0364,iEC042_1314.EC042_0467,iEC55989_1330.EC55989_0443,iECBD_1354.ECBD_3229,iECB_1328.ECB_00380,iECDH10B_1368.ECDH10B_0385,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0414,iECD_1391.ECD_00380,iECED1_1282.ECED1_0452,iECH74115_1262.ECH74115_0513,iECIAI1_1343.ECIAI1_0432,iECIAI39_1322.ECIAI39_0244,iECO103_1326.ECO103_0406,iECO111_1330.ECO111_0462,iECO26_1355.ECO26_0464,iECOK1_1307.ECOK1_0409,iECP_1309.ECP_0489,iECS88_1305.ECS88_0425,iECSE_1348.ECSE_0454,iECSF_1327.ECSF_0389,iECSP_1301.ECSP_0497,iECUMN_1333.ECUMN_0468,iECW_1372.ECW_m0501,iECs_1301.ECs0483,iEKO11_1354.EKO11_3417,iEcDH1_1363.EcDH1_3180,iEcE24377_1341.EcE24377A_0464,iEcHS_1320.EcHS_A0504,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0469,iEcolC_1368.EcolC_3204,iG2583_1286.G2583_0541,iJO1366.b0429,iJR904.b0429,iLF82_1304.LF82_0407,iNRG857_1313.NRG857_02020,iSBO_1134.SBO_0323,iSSON_1240.SSON_0412,iUMN146_1321.UM146_15215,iUMNK88_1353.UMNK88_479,iUTI89_1310.UTI89_C0452,iWFL_1372.ECW_m0501,iY75_1357.Y75_RS02215,iYL1228.KPN_00391,iZ_1308.Z0532 Bacteria 1RHE5@1224,1S6KQ@1236,3Z2RC@583,COG3125@1,COG3125@2 NA|NA|NA C Prokaryotic Cytochrome C oxidase subunit IV Z1_00255 34506.g909 1.7e-154 552.0 Metazoa Metazoa 39IZD@33154,3CNTC@33208,COG0109@1,COG1845@1,KOG1380@2759,KOG4664@2759 NA|NA|NA C Cytochrome c oxidase subunit III Z1_00256 34506.g908 1.2e-242 845.5 Bilateria Metazoa 2D7JX@1,2T6ID@2759,390KC@33154,3BZ19@33208,3DD6Z@33213 NA|NA|NA S Sugar (and other) transporter Z1_00257 529507.PMI0103 1.1e-82 312.8 Proteus yajQ GO:0000049,GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009987,GO:0017076,GO:0019001,GO:0030554,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032561,GO:0033554,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K09767 ko00000 Bacteria 1RDTF@1224,1S3RU@1236,3Z2NW@583,COG1666@1,COG1666@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF520) Z1_00258 529507.PMI0102 3.2e-180 637.5 Proteus panE GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006573,GO:0006575,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008677,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033317,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042398,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 1.1.1.169 ko:K00077 ko00770,ko01100,ko01110,map00770,map01100,map01110 M00119 R02472 RC00726 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iYO844.BSU15110 Bacteria 1P0AW@1224,1RR49@1236,3Z1BU@583,COG1893@1,COG1893@2 NA|NA|NA H Catalyzes the NADPH-dependent reduction of ketopantoate into pantoic acid Z1_00259 529507.PMI0101 1.7e-108 398.7 Proteus thiJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006464,GO:0006517,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009100,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019538,GO:0022613,GO:0030091,GO:0033554,GO:0034599,GO:0036211,GO:0036524,GO:0036525,GO:0042026,GO:0042221,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071704,GO:0071840,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901564 2.7.11.1,3.5.1.124 ko:K03152,ko:K05520,ko:K05687,ko:K12132 ko05012,map05012 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko01002,ko04147 Bacteria 1N7T2@1224,1RSBI@1236,3Z1ZU@583,COG0693@1,COG0693@2 NA|NA|NA S DJ-1/PfpI family Z1_00261 243265.plu3055 1.1e-28 132.9 Gammaproteobacteria ko:K19160 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1NCPG@1224,1SET9@1236,2EDK2@1,337I6@2 NA|NA|NA S Toxin YafO, type II toxin-antitoxin system Z1_00262 529507.PMI0097 1.1e-270 938.7 Proteus thiI GO:0000049,GO:0002937,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.8.1.4 ko:K03151 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07461 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 iECNA114_1301.ECNA114_0400,iECO26_1355.ECO26_0455,iECSF_1327.ECSF_0383,iSDY_1059.SDY_0307 Bacteria 1MWD3@1224,1RNZT@1236,3Z0XE@583,COG0301@1,COG0301@2,COG0607@1,COG0607@2 NA|NA|NA H Catalyzes the ATP-dependent transfer of a sulfur to tRNA to produce 4-thiouridine in position 8 of tRNAs, which functions as a near-UV photosensor. Also catalyzes the transfer of sulfur to the sulfur carrier protein ThiS, forming ThiS-thiocarboxylate. This is a step in the synthesis of thiazole, in the thiamine biosynthesis pathway. The sulfur is donated as persulfide by IscS Z1_00263 529507.PMI0096 1.5e-37 161.8 Proteus xseB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008855,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009318,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0019439,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575,GO:1902494 3.1.11.6 ko:K03602 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1N72V@1224,1SC7N@1236,3Z2VB@583,COG1722@1,COG1722@2 NA|NA|NA L Bidirectionally degrades single-stranded DNA into large acid-insoluble oligonucleotides, which are then degraded further into small acid-soluble oligonucleotides Z1_00264 529507.PMI0095 1.1e-167 595.9 Proteus ispA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004161,GO:0004337,GO:0004659,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006721,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016114,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019637,GO:0033383,GO:0033384,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045337,GO:0045338,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 2.5.1.1,2.5.1.10,2.5.1.29,2.5.1.90 ko:K00795,ko:K02523,ko:K13789 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00364,M00366 R01658,R02003,R02061,R09248 RC00279 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01006 iPC815.YPO3176,iSFV_1184.SFV_0386 Bacteria 1MWNG@1224,1RMKY@1236,3Z14M@583,COG0142@1,COG0142@2 NA|NA|NA H Polyprenyl synthetase Z1_00265 529507.PMI0094 0.0 1248.0 Proteus dxs GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008614,GO:0008615,GO:0008654,GO:0008661,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009240,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016744,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019288,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030145,GO:0030975,GO:0030976,GO:0032787,GO:0034641,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0042816,GO:0042819,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046490,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901661,GO:1901663,GO:1901681 2.2.1.7 ko:K01662 ko00730,ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00730,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R05636 RC00032 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEcSMS35_1347.EcSMS35_0456,iJN746.PP_0527 Bacteria 1MUSJ@1224,1RNQD@1236,3Z1P2@583,COG1154@1,COG1154@2 NA|NA|NA F Catalyzes the acyloin condensation reaction between C atoms 2 and 3 of pyruvate and glyceraldehyde 3-phosphate to yield 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP) Z1_00266 529507.PMI0093 4.4e-68 263.8 Proteus rbsD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006014,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008643,GO:0009056,GO:0015144,GO:0015145,GO:0015146,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015407,GO:0015591,GO:0015608,GO:0015611,GO:0015749,GO:0015750,GO:0015752,GO:0016052,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019303,GO:0019321,GO:0019323,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034219,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042802,GO:0043211,GO:0043492,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0051119,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071704,GO:1901575 5.4.99.62 ko:K06726 ko02010,map02010 R08247 RC02247 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b3748,iBWG_1329.BWG_3439,iECDH10B_1368.ECDH10B_3936,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3636,iECH74115_1262.ECH74115_5184,iECSP_1301.ECSP_4798,iECs_1301.ECs4690,iETEC_1333.ETEC_4039,iEcDH1_1363.EcDH1_4219,iJO1366.b3748,iJR904.b3748,iY75_1357.Y75_RS18330 Bacteria 1RI53@1224,1S60T@1236,3Z2KA@583,COG1869@1,COG1869@2 NA|NA|NA G Catalyzes the interconversion of beta-pyran and beta- furan forms of D-ribose Z1_00267 529507.PMI0092 1.1e-281 975.3 Proteus rbsA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008643,GO:0015144,GO:0015145,GO:0015146,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015407,GO:0015591,GO:0015608,GO:0015611,GO:0015749,GO:0015750,GO:0015752,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034219,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043190,GO:0043211,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051119,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 3.6.3.17 ko:K10441,ko:K10542 ko02010,map02010 M00212,M00214 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.2.1,3.A.1.2.13,3.A.1.2.19,3.A.1.2.3 iEC55989_1330.EC55989_4224,iECSE_1348.ECSE_4039,iECW_1372.ECW_m4052,iEcE24377_1341.EcE24377A_4265,iWFL_1372.ECW_m4052,iYL1228.KPN_04154 Bacteria 1MU22@1224,1RMCH@1236,3Z1GS@583,COG1129@1,COG1129@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex RbsABC involved in ribose import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_00268 529507.PMI0091 3.8e-155 554.3 Proteus rbsC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0015144,GO:0015145,GO:0015146,GO:0015591,GO:0015749,GO:0015750,GO:0015752,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034219,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051119,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K03549,ko:K10440 ko02010,map02010 M00212 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.72,3.A.1.2.1,3.A.1.2.13,3.A.1.2.19 iAF1260.b3750,iAPECO1_1312.APECO1_2713,iB21_1397.B21_03581,iBWG_1329.BWG_3441,iE2348C_1286.E2348C_4060,iEC042_1314.EC042_4137,iEC55989_1330.EC55989_4225,iECABU_c1320.ECABU_c42350,iECBD_1354.ECBD_4280,iECB_1328.ECB_03636,iECDH10B_1368.ECDH10B_3938,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3638,iECED1_1282.ECED1_4440,iECH74115_1262.ECH74115_5186,iECIAI1_1343.ECIAI1_3934,iECNA114_1301.ECNA114_3899,iECO103_1326.ECO103_4407,iECO111_1330.ECO111_4584,iECO26_1355.ECO26_4828,iECOK1_1307.ECOK1_4199,iECS88_1305.ECS88_4172,iECSE_1348.ECSE_4040,iECSF_1327.ECSF_3598,iECSP_1301.ECSP_4800,iECUMN_1333.ECUMN_4280,iECs_1301.ECs4692,iEcDH1_1363.EcDH1_4217,iEcE24377_1341.EcE24377A_4266,iEcHS_1320.EcHS_A3966,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4118,iEcolC_1368.EcolC_4244,iJO1366.b3750,iJR904.b3750,iLF82_1304.LF82_1817,iNRG857_1313.NRG857_18675,iUMN146_1321.UM146_18940,iUMNK88_1353.UMNK88_4562,iUTI89_1310.UTI89_C4305,iY75_1357.Y75_RS18320,ic_1306.c4678 Bacteria 1MX7D@1224,1RNTS@1236,3Z2HP@583,COG1172@1,COG1172@2 NA|NA|NA P Branched-chain amino acid transport system / permease component Z1_00269 529507.PMI0090 5.9e-155 553.5 Proteus rbsB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006935,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009605,GO:0015144,GO:0015145,GO:0015749,GO:0015750,GO:0015752,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0030246,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031975,GO:0034219,GO:0036094,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0042597,GO:0044425,GO:0044464,GO:0048029,GO:0050896,GO:0050918,GO:0051119,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944 ko:K02058,ko:K10439 ko02010,ko02030,map02010,map02030 M00212,M00221 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.2,3.A.1.2.1,3.A.1.2.13,3.A.1.2.19 Bacteria 1NRXG@1224,1RPBV@1236,3Z1CP@583,COG1879@1,COG1879@2 NA|NA|NA G Periplasmic binding protein Z1_00270 529507.PMI0089 2e-169 601.7 Proteus rbsK 2.7.1.15 ko:K00852 ko00030,map00030 R01051,R02750 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV5B@1224,1RNVY@1236,3Z1TF@583,COG0524@1,COG0524@2 NA|NA|NA H Catalyzes the phosphorylation of ribose at O-5 in a reaction requiring ATP and magnesium. The resulting D-ribose-5- phosphate can then be used either for sythesis of nucleotides, histidine, and tryptophan, or as a component of the pentose phosphate pathway Z1_00271 529507.PMI0088 8.9e-184 649.4 Proteus rbsR GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0043565,GO:0044212,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K02529,ko:K03604 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVUR@1224,1RN2K@1236,3Z286@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K Periplasmic binding proteins and sugar binding domain of LacI family Z1_00272 529507.PMI0085 6.6e-59 233.0 Proteus phnA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K06193 ko01120,map01120 ko00000 Bacteria 1RGUU@1224,1S60W@1236,3Z2R7@583,COG2824@1,COG2824@2 NA|NA|NA P PhnA Zinc-Ribbon Z1_00273 529507.PMI0084 1.3e-184 652.1 Proteus thiL GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009030,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009229,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0017076,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042357,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046483,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.4.16 ko:K00946 ko00730,ko01100,map00730,map01100 M00127 R00617 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSFV_1184.SFV_0382,iYO844.BSU05900 Bacteria 1MU9X@1224,1RNHU@1236,3Z14I@583,COG0611@1,COG0611@2 NA|NA|NA H Catalyzes the ATP-dependent phosphorylation of thiamine- monophosphate (TMP) to form thiamine-pyrophosphate (TPP), the active form of vitamin B1 Z1_00274 529507.PMI0083 6.7e-69 266.5 Proteus nusB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006353,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K03625 ko00000,ko03009,ko03021 Bacteria 1RHFZ@1224,1S6AJ@1236,3Z2JT@583,COG0781@1,COG0781@2 NA|NA|NA K Involved in transcription antitermination. Required for transcription of ribosomal RNA (rRNA) genes. Binds specifically to the boxA antiterminator sequence of the ribosomal RNA (rrn) operons Z1_00275 529507.PMI0082 1.5e-77 295.4 Proteus ribH GO:0000906,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0017144,GO:0018130,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042726,GO:0042727,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.78 ko:K00794 ko00740,ko01100,ko01110,map00740,map01100,map01110 M00125 R04457 RC00960 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iLJ478.TM1825,iSB619.SA_RS08940,iSFV_1184.SFV_0380 Bacteria 1RD9J@1224,1S3WD@1236,3Z2JB@583,COG0054@1,COG0054@2 NA|NA|NA H Catalyzes the formation of 6,7-dimethyl-8- ribityllumazine by condensation of 5-amino-6-(D- ribitylamino)uracil with 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate. This is the penultimate step in the biosynthesis of riboflavin Z1_00276 529507.PMI0081 7.1e-217 759.6 Proteus ribD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008703,GO:0008835,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009451,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019239,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042726,GO:0042727,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.1.1.193,3.5.4.26 ko:K11752 ko00740,ko01100,ko01110,ko02024,map00740,map01100,map01110,map02024 M00125 R03458,R03459 RC00204,RC00933 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iB21_1397.B21_00366,iECBD_1354.ECBD_3247,iECB_1328.ECB_00362,iECD_1391.ECD_00362,iECED1_1282.ECED1_0437,iECNA114_1301.ECNA114_0391,iECSF_1327.ECSF_0374,iEcolC_1368.EcolC_3219,iJN746.PP_0514,iLF82_1304.LF82_1880,iNRG857_1313.NRG857_01945,iYL1228.KPN_00366,ic_1306.c0524 Bacteria 1MUWT@1224,1RN2M@1236,3Z16A@583,COG0117@1,COG0117@2,COG1985@1,COG1985@2 NA|NA|NA H Converts 2,5-diamino-6-(ribosylamino)-4(3h)-pyrimidinone 5'-phosphate into 5-amino-6-(ribosylamino)-2,4(1h,3h)- pyrimidinedione 5'-phosphate Z1_00277 529507.PMI0080 1.5e-77 295.4 Proteus nrdR GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0017076,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K07738 ko00000,ko03000 Bacteria 1RE7V@1224,1S3P9@1236,3Z1YE@583,COG1327@1,COG1327@2 NA|NA|NA K Negatively regulates transcription of bacterial ribonucleotide reductase nrd genes and operons by binding to NrdR- boxes Z1_00278 529507.PMI0079 7.3e-167 593.2 Proteus secF GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030312,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033036,GO:0042886,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944 ko:K03072,ko:K03074,ko:K12257 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 2.A.6.4,3.A.5.2,3.A.5.7 Bacteria 1MU74@1224,1RNTY@1236,3Z140@583,COG0341@1,COG0341@2 NA|NA|NA U Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the SecYEG preprotein conducting channel. SecDF uses the proton motive force (PMF) to complete protein translocation after the ATP-dependent function of SecA Z1_00279 529507.PMI0078 0.0 1135.6 Proteus secD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033036,GO:0042886,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944 ko:K03072 ko03060,ko03070,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 2.A.6.4,3.A.5.2,3.A.5.7 Bacteria 1MV5U@1224,1RMIQ@1236,3Z240@583,COG0342@1,COG0342@2 NA|NA|NA U Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the SecYEG preprotein conducting channel. SecDF uses the proton motive force (PMF) to complete protein translocation after the ATP-dependent function of SecA Z1_00280 529507.PMI0077 1.5e-50 205.3 Proteus yajC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031522,GO:0032991,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03210 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.2 Bacteria 1MZT2@1224,1S9NV@1236,3Z2QC@583,COG1862@1,COG1862@2 NA|NA|NA U Preprotein translocase subunit Z1_00281 529507.PMI0076 5.7e-227 793.1 Proteus tgt GO:0002097,GO:0002099,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008479,GO:0008616,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009163,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034404,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034660,GO:0042455,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046116,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.4.2.29 ko:K00773 R03789,R10209 RC00063 ko00000,ko01000,ko03016 iECW_1372.ECW_m0475,iWFL_1372.ECW_m0475 Bacteria 1MUCA@1224,1RMY3@1236,3Z2EC@583,COG0343@1,COG0343@2 NA|NA|NA F Catalyzes the base-exchange of a guanine (G) residue with the queuine precursor 7-aminomethyl-7-deazaguanine (PreQ1) at position 34 (anticodon wobble position) in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr). Catalysis occurs through a double-displacement mechanism. The nucleophile active site attacks the C1' of nucleotide 34 to detach the guanine base from the RNA, forming a covalent enzyme-RNA intermediate. The proton acceptor active site deprotonates the incoming PreQ1, allowing a nucleophilic attack on the C1' of the ribose to form the product. After dissociation, two additional enzymatic reactions on the tRNA convert PreQ1 to queuine (Q), resulting in the hypermodified nucleoside queuosine (7-(((4,5-cis-dihydroxy-2- cyclopenten-1-yl)amino)methyl)-7-deazaguanosine) Z1_00282 529507.PMI0075 1e-201 709.1 Proteus queA GO:0002097,GO:0002099,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008616,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009163,GO:0009314,GO:0009451,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016853,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034404,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034660,GO:0042455,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046116,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051075,GO:0055086,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.4.2.29,2.4.99.17 ko:K00773,ko:K07568 R03789,R10209 RC00063 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUH3@1224,1RMKW@1236,3Z27H@583,COG0809@1,COG0809@2 NA|NA|NA F Transfers and isomerizes the ribose moiety from AdoMet to the 7-aminomethyl group of 7-deazaguanine (preQ1-tRNA) to give epoxyqueuosine (oQ-tRNA) Z1_00283 529507.PMI0074 2.6e-111 407.9 Proteus acpH GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008770,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042578,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:0140096,GO:1901576 3.1.4.14 ko:K08682 ko00770,map00770 R01623 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1606,iE2348C_1286.E2348C_0339,iECNA114_1301.ECNA114_0381,iECOK1_1307.ECOK1_0384,iECS88_1305.ECS88_0399,iECSF_1327.ECSF_0364,iPC815.YPO3193,iUMN146_1321.UM146_15340,iUTI89_1310.UTI89_C0426 Bacteria 1MZ59@1224,1S9IZ@1236,3Z0YT@583,COG3124@1,COG3124@2 NA|NA|NA S Acyl carrier protein phosphodiesterase Z1_00284 529507.PMI0073 2.2e-113 414.8 Proteus ahpC 1.11.1.15 ko:K03386,ko:K20011 ko04214,map04214 ko00000,ko00001,ko01000,ko04147 Bacteria 1MWPY@1224,1RN4S@1236,3Z2HR@583,COG0450@1,COG0450@2 NA|NA|NA O C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin Z1_00285 529507.PMI0072 0.0 1161.7 Proteus ggt 2.3.2.2,3.4.19.13 ko:K00681 ko00430,ko00460,ko00480,ko01100,map00430,map00460,map00480,map01100 R00494,R01262,R01687,R03867,R03916,R03970,R03971,R04935 RC00064,RC00090,RC00096 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUV6@1224,1RMIT@1236,3Z11R@583,COG0405@1,COG0405@2 NA|NA|NA M Gamma-glutamyltranspeptidase Z1_00286 529507.PMI0070 1.4e-123 448.7 Proteus ydhY Bacteria 1MUIE@1224,1RZEF@1236,3Z1HV@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_00287 529507.PMI0069 0.0 1458.4 Proteus ydhV GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016614,GO:0030151,GO:0033719,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043546,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363 1.2.7.5 ko:K03738 ko00030,ko01100,ko01120,ko01200,map00030,map01100,map01120,map01200 M00309 R08571 RC00242 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MWBB@1224,1RSCT@1236,3Z1VI@583,COG2414@1,COG2414@2 NA|NA|NA C Aldehyde ferredoxin oxidoreductase, N-terminal domain Z1_00288 529507.PMI0068 1.1e-130 472.6 Proteus ydhW Bacteria 1RBE4@1224,1S3H4@1236,28VFF@1,2ZHI0@2,3Z1UE@583 NA|NA|NA Z1_00289 529507.PMI0067 5.3e-132 476.9 Proteus ydhX GO:0005575,GO:0005623,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464 ko:K08353,ko:K08358 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10149,R10150 RC02823,RC03109 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.10,5.A.3.5 Bacteria 1R5IV@1224,1RR1Z@1236,3Z0VD@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_00290 529507.PMI0066 2e-146 525.0 Proteus ydhU GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03620,ko:K08354 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10149 RC02823 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.5 Bacteria 1R4HB@1224,1RSIU@1236,3Z18Z@583,COG4117@1,COG4117@2 NA|NA|NA C Prokaryotic cytochrome b561 Z1_00291 529507.PMI0065 5.4e-106 391.0 Proteus ydhT Bacteria 1R6VT@1224,1S0US@1236,2DBJN@1,2Z9MR@2,3Z1M7@583 NA|NA|NA Z1_00292 529507.PMI0064 6.6e-84 316.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1N7BJ@1224,1SG3F@1236,2B385@1,336QN@2 NA|NA|NA S Enterobacterial putative membrane protein (DUF943) Z1_00293 471874.PROSTU_00175 2.3e-157 561.6 Providencia Bacteria 1QJZU@1224,1TI2D@1236,2AWCT@1,31N8N@2,3Z9XF@586 NA|NA|NA Z1_00294 529507.PMI0055 5.6e-46 189.9 Proteus MA20_05215 ko:K15773 ko00000,ko02048,ko03000 Bacteria 1N8VE@1224,1SDTV@1236,3Z3FY@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_00295 529507.PMI0054 1.8e-253 881.3 Proteus hipA 2.7.11.1 ko:K07154 ko00000,ko01000,ko01001,ko02048 Bacteria 1N458@1224,1RMP7@1236,3Z35U@583,COG3550@1,COG3550@2 NA|NA|NA S Pfam:HipA_N Z1_00296 529507.PMI0053 8.1e-241 839.3 Proteus brnQ GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005304,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015188,GO:0015190,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015658,GO:0015711,GO:0015803,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015818,GO:0015820,GO:0015829,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903785,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03311 ko00000 2.A.26 iAF1260.b0401,iB21_1397.B21_00353,iBWG_1329.BWG_0283,iEC042_1314.EC042_0433,iECBD_1354.ECBD_3260,iECB_1328.ECB_00349,iECDH10B_1368.ECDH10B_0357,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0386,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_3208,iECD_1391.ECD_00349,iECH74115_1262.ECH74115_0478,iECIAI1_1343.ECIAI1_0401,iECO103_1326.ECO103_0375,iECO111_1330.ECO111_0430,iECO26_1355.ECO26_0433,iECSE_1348.ECSE_0422,iECSP_1301.ECSP_0465,iECUMN_1333.ECUMN_0438,iECW_1372.ECW_m0470,iECs_1301.ECs0451,iEKO11_1354.EKO11_3448,iEcDH1_1363.EcDH1_3208,iEcE24377_1341.EcE24377A_0431,iEcHS_1320.EcHS_A0471,iEcolC_1368.EcolC_3232,iG2583_1286.G2583_0509,iJO1366.b0401,iJR904.b0401,iSBO_1134.SBO_0295,iSDY_1059.SDY_0336,iSSON_1240.SSON_0378,iSbBS512_1146.SbBS512_E0320,iUMNK88_1353.UMNK88_451,iWFL_1372.ECW_m0470,iY75_1357.Y75_RS02070,iZ_1308.Z0499 Bacteria 1MVIF@1224,1RR3P@1236,3Z176@583,COG1114@1,COG1114@2 NA|NA|NA U Component of the transport system for branched-chain amino acids Z1_00297 529507.PMI0052 9.5e-247 859.0 Proteus phoR GO:0000155,GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0004721,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016036,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016311,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0035556,GO:0036211,GO:0042578,GO:0042594,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 2.7.13.3 ko:K02484,ko:K07636 ko02020,map02020 M00434 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1MWF3@1224,1RN0F@1236,3Z0YS@583,COG5002@1,COG5002@2 NA|NA|NA T Domain of unknown function (DUF3329) Z1_00298 529507.PMI0051 6.2e-128 463.4 Proteus Bacteria 1MY2Z@1224,1RN41@1236,3Z219@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB Z1_00299 529507.PMI0050 1.3e-229 802.0 Proteus sbcD GO:0000014,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1990238 ko:K03547 ko00000,ko03400 Bacteria 1MVV6@1224,1RP83@1236,3Z1HF@583,COG0420@1,COG0420@2 NA|NA|NA L SbcCD cleaves DNA hairpin structures. These structures can inhibit DNA replication and are intermediates in certain DNA recombination reactions. The complex acts as a 3'- 5' double strand exonuclease that can open hairpins. It also has a 5' single-strand endonuclease activity Z1_00300 529507.PMI0049 0.0 2088.5 Proteus sbcC GO:0000014,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008408,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1990238 ko:K03546 ko00000,ko03400 Bacteria 1MVTQ@1224,1RQFM@1236,3Z280@583,COG0419@1,COG0419@2 NA|NA|NA L exonuclease Z1_00301 529507.PMI0048 3.3e-109 401.0 Proteus ko:K07078 ko00000 Bacteria 1PG88@1224,1RP63@1236,3Z1SA@583,COG3560@1,COG3560@2 NA|NA|NA S Nitroreductase family Z1_00302 471881.PROPEN_03046 4.6e-49 200.3 Gammaproteobacteria ko:K06218 ko00000,ko02048 Bacteria 1N07K@1224,1S9WA@1236,COG2026@1,COG2026@2 NA|NA|NA DJ ParE-like toxin of type II bacterial toxin-antitoxin system Z1_00303 471881.PROPEN_03047 3e-34 150.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1MZ92@1224,1S8Y1@1236,2DAFR@1,32TVC@2 NA|NA|NA S ParD-like antitoxin of type II bacterial toxin-antitoxin system Z1_00304 34506.g1323 2.2e-311 1074.3 Bilateria 3.1.3.5 ko:K01081,ko:K19970 ko00230,ko00240,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00760,map01100,map01110 R00183,R00511,R00963,R01126,R01227,R01569,R01664,R01968,R02088,R02102,R02323,R02719,R03346 RC00017 ko00000,ko00001,ko00537,ko01000,ko04090 Metazoa 38CIK@33154,3BAV2@33208,3CZ0N@33213,COG0737@1,KOG4419@2759 NA|NA|NA F Belongs to the 5'-nucleotidase family Z1_00305 529507.PMI0046 1.5e-151 542.0 Proteus rns 3.1.27.1 ko:K01166 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1PTUN@1224,1S1C0@1236,3Z28T@583,COG3719@1,COG3719@2 NA|NA|NA J Ribonuclease T2 family Z1_00306 529507.PMI0045 0.0 1312.4 Proteus cpdB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004112,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008252,GO:0008254,GO:0008663,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009166,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042578,GO:0042597,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576 3.1.3.5,3.1.3.6,3.1.4.16 ko:K01119,ko:K08693 ko00230,ko00240,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00760,map01100,map01110 R00183,R00511,R00963,R01126,R01227,R01562,R01569,R01664,R01877,R01968,R02088,R02102,R02148,R02370,R02719,R03537,R03538,R03929,R05135 RC00017,RC00078,RC00296 ko00000,ko00001,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_4773,iECH74115_1262.ECH74115_5730,iECNA114_1301.ECNA114_4436,iECSP_1301.ECSP_5315,iECW_1372.ECW_m4577,iECs_1301.ECs5191,iEKO11_1354.EKO11_4095,iEcE24377_1341.EcE24377A_4783,iG2583_1286.G2583_5043,iWFL_1372.ECW_m4577,iYO844.BSU07840,iZ_1308.Z5824 Bacteria 1MU11@1224,1RMQV@1236,3Z2CP@583,COG0737@1,COG0737@2 NA|NA|NA F 2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase Z1_00307 585.DR95_1862 5.4e-228 796.6 Proteus ompH GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K10940,ko:K11929 ko05111,map05111 ko00000,ko00001,ko02000 1.B.1.1.2,1.B.1.8.1 Bacteria 1QTIC@1224,1SDGU@1236,3Z2BM@583,COG3203@1,COG3203@2 NA|NA|NA M Gram-negative porin Z1_00308 529507.PMI0043 2.7e-163 581.3 Proteus rdgC GO:0000018,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009295,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043590,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051171,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363 ko:K03554 ko00000,ko03400 Bacteria 1MXPR@1224,1RMNN@1236,3Z1I9@583,COG2974@1,COG2974@2 NA|NA|NA J May be involved in recombination Z1_00309 529507.PMI0042 7.2e-39 166.0 Proteus yedF GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0019725,GO:0033554,GO:0042592,GO:0048878,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008 ko:K04085 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1N0EX@1224,1S9V5@1236,3Z306@583,COG0425@1,COG0425@2 NA|NA|NA O Sulfurtransferase TusA Z1_00310 529507.PMI0041 7.7e-238 829.3 Proteus yedE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07112 ko00000 Bacteria 1PF9B@1224,1RNE8@1236,3Z15N@583,COG2391@1,COG2391@2 NA|NA|NA S Sulphur transport Z1_00311 529507.PMI0040 1.3e-190 672.2 Proteus hypE GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0018193,GO:0018198,GO:0018249,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0046892,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564 ko:K04655 ko00000 Bacteria 1MVCC@1224,1RQBE@1236,3Z2AY@583,COG0309@1,COG0309@2 NA|NA|NA O AIR synthase related protein, N-terminal domain Z1_00312 529507.PMI0039 4.5e-224 783.5 Proteus hypD ko:K04654 ko00000 Bacteria 1MU1F@1224,1RRTQ@1236,3Z24E@583,COG0409@1,COG0409@2 NA|NA|NA O Hydrogenase formation hypA family Z1_00313 529507.PMI0038 3.4e-42 177.2 Proteus hupF ko:K03605,ko:K03618,ko:K04653 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1RGXH@1224,1S96I@1236,3Z2UD@583,COG0298@1,COG0298@2 NA|NA|NA O HupF/HypC family Z1_00314 529507.PMI0037 8.2e-173 613.2 Proteus hypB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016151,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017111,GO:0019538,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564 ko:K03189,ko:K04652 ko00000,ko03110 Bacteria 1MVBD@1224,1RN9Y@1236,3Z1EW@583,COG0378@1,COG0378@2 NA|NA|NA KO hydrogenase accessory protein Z1_00315 529507.PMI0036 9.1e-89 332.8 Proteus hybE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0006091,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008199,GO:0009055,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016491,GO:0019538,GO:0022900,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051604,GO:0055114,GO:0070678,GO:0071704,GO:1901564 Bacteria 1N813@1224,1S4PE@1236,3Z2H8@583,COG1773@1,COG1773@2 NA|NA|NA C [NiFe]-hydrogenase assembly, chaperone, HybE Z1_00316 529507.PMI0035 1.8e-81 308.5 Proteus hybD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016485,GO:0016787,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0051604,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.23.51 ko:K03605,ko:K08315 ko00000,ko01000,ko01002 iAF987.Gmet_3329 Bacteria 1RE1C@1224,1S4H2@1236,3Z1KS@583,COG0680@1,COG0680@2 NA|NA|NA C Hydrogenase maturation protease Z1_00317 529507.PMI0034 0.0 1174.5 Proteus hybC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0016151,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031232,GO:0031236,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098567 1.12.99.6 ko:K06281 ko00633,ko01120,map00633,map01120 R08034 RC00250 ko00000,ko00001,ko01000 ic_1306.c3731 Bacteria 1MWFJ@1224,1RMC3@1236,3Z0ZJ@583,COG0374@1,COG0374@2 NA|NA|NA C Nickel-dependent hydrogenase Z1_00318 529507.PMI0033 3.7e-221 773.9 Proteus hybB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 iAPECO1_1312.APECO1_3427,iE2348C_1286.E2348C_3282,iECABU_c1320.ECABU_c34010,iECOK1_1307.ECOK1_3414,iECS88_1305.ECS88_3377,iUMN146_1321.UM146_01380,iUTI89_1310.UTI89_C3417 Bacteria 1MWYI@1224,1RMUY@1236,3Z1CW@583,COG5557@1,COG5557@2 NA|NA|NA C Ni Fe-hydrogenase 2 b-type cytochrome subunit Z1_00319 529507.PMI0032 8.7e-203 712.6 Proteus hybA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0006066,GO:0006071,GO:0006091,GO:0006113,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016052,GO:0019400,GO:0019405,GO:0019563,GO:0019588,GO:0019662,GO:0019751,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042597,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046164,GO:0046174,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901575,GO:1901615,GO:1901616 ko:K00124 ko00630,ko00680,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map01100,map01120,map01200 R00519 RC02796 ko00000,ko00001 Bacteria 1MU1B@1224,1RPF5@1236,3Z1ZZ@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S dicluster domain Z1_00320 529507.PMI0031 5.1e-220 770.0 Proteus hybO GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031232,GO:0031236,GO:0042597,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051540,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098567 1.12.2.1,1.12.99.6 ko:K06282,ko:K18008 ko00633,ko01120,map00633,map01120 R08034 RC00250 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWAC@1224,1RNTJ@1236,3Z1Y2@583,COG1740@1,COG1740@2 NA|NA|NA C NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit Z1_00323 529507.PMI0030 1.1e-69 269.2 Proteus exbD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031647,GO:0031992,GO:0032991,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797 ko:K03559,ko:K03560 ko00000,ko02000 1.A.30.2.1,1.A.30.2.2 iPC815.YPO0683 Bacteria 1RDJZ@1224,1S3TA@1236,3Z2JD@583,COG0848@1,COG0848@2 NA|NA|NA U Biopolymer transport protein ExbD/TolR Z1_00324 529507.PMI0029 1.9e-154 552.0 Proteus exbB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031647,GO:0031992,GO:0032991,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050821,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797 ko:K03561,ko:K03562 ko01120,map01120 ko00000,ko02000 1.A.30.2.1,1.A.30.2.2 iSBO_1134.SBO_3000,iSbBS512_1146.SbBS512_E3434 Bacteria 1MXHR@1224,1RND2@1236,3Z1YR@583,COG0811@1,COG0811@2 NA|NA|NA U MotA/TolQ/ExbB proton channel family Z1_00325 529507.PMI0028 3.5e-227 793.9 Proteus metC 2.5.1.48,4.4.1.11,4.4.1.8 ko:K01739,ko:K01760,ko:K01761 ko00270,ko00450,ko00920,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00270,map00450,map00920,map01100,map01110,map01130,map01230 M00017 R00654,R00782,R00999,R01286,R01288,R02408,R02508,R03217,R03260,R04770,R04941,R04944,R04945,R04946 RC00020,RC00056,RC00069,RC00196,RC00348,RC00382,RC00420,RC00488,RC00710,RC01209,RC01210,RC01245,RC02303,RC02848,RC02866 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU9E@1224,1RQI0@1236,3Z2HJ@583,COG0626@1,COG0626@2 NA|NA|NA E cystathionine beta-lyase (CHL) (beta-cystathionase) (cysteine lyase) K01760 Z1_00326 529507.PMI0027 3.3e-118 431.0 Proteus yghB GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032505,GO:0043093,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051301,GO:0055085,GO:0071944 Bacteria 1N2EF@1224,1RQKN@1236,3Z1EG@583,COG0586@1,COG0586@2 NA|NA|NA S SNARE associated Golgi protein Z1_00327 529507.PMI0025 4.3e-222 776.9 Proteus yqhD GO:0000302,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004033,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008106,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0018455,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0055114,GO:1901700,GO:1990002 ko:K00100,ko:K08325,ko:K19955 ko00640,ko00650,ko01120,map00640,map00650,map01120 R02528,R03544,R03545 RC00087,RC00739 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1QUBJ@1224,1RP7C@1236,3Z0VH@583,COG1979@1,COG1979@2 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_00328 529507.PMI0024 9.1e-158 562.8 Proteus dkgA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004033,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0008106,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0042180,GO:0042182,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046185,GO:0051596,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901575 1.1.1.346 ko:K06221 R08878 RC00089 ko00000,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_4323,iECSP_1301.ECSP_3988 Bacteria 1MWFS@1224,1RMX6@1236,3Z162@583,COG0656@1,COG0656@2 NA|NA|NA S Aldo/keto reductase family Z1_00329 529507.PMI0023 0.0 4492.6 Proteus ratA 3.2.1.4,3.4.17.14,3.5.1.28 ko:K01179,ko:K01449,ko:K07260,ko:K13735 ko00500,ko00550,ko01100,ko01502,ko02020,ko05100,map00500,map00550,map01100,map01502,map02020,map05100 M00651 R04112,R06200,R11307,R11308 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko01011,ko01504 GH5,GH9 Bacteria 1MX9S@1224,1RPK7@1236,3Z1I6@583,COG1388@1,COG1388@2,COG5492@1,COG5492@2 NA|NA|NA M Evidence 3 Function proposed based on presence of conserved amino acid motif, structural feature or limited homology Z1_00330 529507.PMI0021 0.0 2101.6 Proteus carB GO:0000050,GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004087,GO:0004088,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005951,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016053,GO:0016597,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016884,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019627,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0019856,GO:0030554,GO:0031406,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043177,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071941,GO:0071944,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 6.3.5.5 ko:K01955 ko00240,ko00250,ko01100,map00240,map00250,map01100 M00051 R00256,R00575,R01395,R10948,R10949 RC00002,RC00010,RC00043,RC02750,RC02798,RC03314 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b0033,iBWG_1329.BWG_0031,iECDH10B_1368.ECDH10B_0034,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0031,iECUMN_1333.ECUMN_0034,iEcDH1_1363.EcDH1_3566,iJO1366.b0033,iJR904.b0033,iPC815.YPO0482,iY75_1357.Y75_RS00170,iYL1228.KPN_00041 Bacteria 1MUDZ@1224,1RPIU@1236,3Z1VX@583,COG0458@1,COG0458@2 NA|NA|NA F carbamoyl-phosphate synthase large Z1_00331 529507.PMI0020 3e-223 780.8 Proteus carA GO:0000050,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004088,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005951,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006541,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016884,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019627,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0019856,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0040007,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071941,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 6.3.5.5 ko:K01956 ko00240,ko00250,ko01100,map00240,map00250,map01100 M00051 R00256,R00575,R01395,R10948,R10949 RC00002,RC00010,RC00043,RC02750,RC02798,RC03314 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1950,iNJ661.Rv1383,iUTI89_1310.UTI89_C0036,ic_1306.c0040 Bacteria 1MUB9@1224,1RMAW@1236,3Z2G5@583,COG0505@1,COG0505@2 NA|NA|NA F Glutamine amidotransferase class-I Z1_00332 529507.PMI0019 3.8e-148 530.8 Proteus dapB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008839,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016628,GO:0019752,GO:0019877,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.17.1.8 ko:K00215,ko:K03546 ko00261,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00261,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R04198,R04199 RC00478 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iIT341.HP0510,iLJ478.TM1520,iSbBS512_1146.SbBS512_E0035 Bacteria 1MUCT@1224,1RMCZ@1236,3Z28X@583,COG0289@1,COG0289@2 NA|NA|NA E Catalyzes the conversion of 4-hydroxy- tetrahydrodipicolinate (HTPA) to tetrahydrodipicolinate Z1_00333 529507.PMI0018 2.9e-176 624.4 Proteus ispH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009240,GO:0009987,GO:0016491,GO:0019288,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042380,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046490,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051538,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901576 1.17.7.4,2.7.4.25 ko:K00945,ko:K02945,ko:K03527 ko00240,ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,ko03010,map00240,map00900,map01100,map01110,map01130,map03010 M00052,M00096,M00178 R00158,R00512,R01665,R05884,R08210 RC00002,RC01137,RC01487 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03011 iECIAI1_1343.ECIAI1_0030,iECW_1372.ECW_m0028,iEKO11_1354.EKO11_3884,iEcHS_1320.EcHS_A0031,iEcolC_1368.EcolC_3626,iIT341.HP0400,iLJ478.TM1444,iPC815.YPO0477,iSFV_1184.SFV_0023,iSF_1195.SF0026,iSFxv_1172.SFxv_0027,iS_1188.S0028,iWFL_1372.ECW_m0028,iYL1228.KPN_00024 Bacteria 1MU7G@1224,1RMN8@1236,3Z0VG@583,COG0761@1,COG0761@2 NA|NA|NA IM Catalyzes the conversion of 1-hydroxy-2-methyl-2-(E)- butenyl 4-diphosphate (HMBPP) into a mixture of isopentenyl diphosphate (IPP) and dimethylallyl diphosphate (DMAPP). Acts in the terminal step of the DOXP MEP pathway for isoprenoid precursor biosynthesis Z1_00334 529507.PMI0017 1.9e-80 305.1 Proteus fkpB GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0061077,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 5.2.1.8 ko:K03774,ko:K03775 ko00000,ko01000,ko03110 Bacteria 1RHD1@1224,1S5YP@1236,3Z1DV@583,COG1047@1,COG1047@2 NA|NA|NA G FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Z1_00335 529507.PMI0016 5.4e-92 343.6 Proteus lspA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034645,GO:0042157,GO:0042158,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097304,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.4.23.36 ko:K03101 ko03060,map03060 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1RGV9@1224,1S60E@1236,3Z3D7@583,COG0597@1,COG0597@2 NA|NA|NA MU This protein specifically catalyzes the removal of signal peptides from prolipoproteins Z1_00336 529507.PMI0015 0.0 1927.9 Proteus ileS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004822,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006428,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.5 ko:K01870 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03656 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iG2583_1286.G2583_0027,iPC815.YPO0475 Bacteria 1MVBQ@1224,1RMTF@1236,3Z18S@583,COG0060@1,COG0060@2 NA|NA|NA J amino acids such as valine, to avoid such errors it has two additional distinct tRNA(Ile)-dependent editing activities. One activity is designated as 'pretransfer' editing and involves the hydrolysis of activated Val-AMP. The other activity is designated 'posttransfer' editing and involves deacylation of mischarged Val-tRNA(Ile) Z1_00337 529507.PMI0014 2.2e-176 624.8 Proteus ribF GO:0003674,GO:0003824,GO:0003919,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008531,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016779,GO:0044237,GO:0070566 2.7.1.26,2.7.7.2 ko:K11753 ko00740,ko01100,ko01110,map00740,map01100,map01110 M00125 R00161,R00549 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iETEC_1333.ETEC_0025,iJN746.PP_0602 Bacteria 1MV9I@1224,1RN44@1236,3Z1G6@583,COG0196@1,COG0196@2 NA|NA|NA H FAD synthetase Z1_00338 529507.PMI0013 9.4e-37 159.1 Proteus rpsT GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0004857,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008073,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030234,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0042979,GO:0043043,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050790,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070181,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02968 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ94@1224,1S9AI@1236,3Z2YA@583,COG0268@1,COG0268@2 NA|NA|NA J Binds directly to 16S ribosomal RNA Z1_00339 529507.PMI0012 9.7e-169 599.4 Proteus nhaR GO:0001121,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001140,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031334,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000142,GO:2000144,GO:2001141 ko:K03717 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVHT@1224,1RN7G@1236,3Z272@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00340 529507.PMI0011 8.8e-207 726.1 Proteus nhaA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005451,GO:0005488,GO:0005543,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006883,GO:0006885,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008289,GO:0008324,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015081,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015299,GO:0015318,GO:0015385,GO:0015491,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019725,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030641,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035725,GO:0042592,GO:0043157,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046873,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051453,GO:0055065,GO:0055067,GO:0055078,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098771,GO:0099516,GO:1901611,GO:1901612,GO:1902600 ko:K03313 ko00000,ko02000 2.A.33.1 iSF_1195.SF0016,iSFxv_1172.SFxv_0017,iS_1188.S0018 Bacteria 1MW15@1224,1RNDE@1236,3Z1M6@583,COG3004@1,COG3004@2 NA|NA|NA P Na( ) H( ) antiporter that extrudes sodium in exchange for external protons Z1_00341 529507.PMI0010 5.7e-179 633.6 Proteus dnaJ GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010556,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016020,GO:0016032,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0016989,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022607,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042026,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051087,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051704,GO:0055114,GO:0060255,GO:0061077,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0140096,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901576,GO:1903506,GO:2001141 ko:K03686 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1MVMS@1224,1RNHY@1236,3Z2HB@583,COG0484@1,COG0484@2 NA|NA|NA O ATP binding to DnaK triggers the release of the substrate protein, thus completing the reaction cycle. Several rounds of ATP-dependent interactions between DnaJ, DnaK and GrpE are required for fully efficient folding. Also involved, together with DnaK and GrpE, in the DNA replication of plasmids through activation of initiation proteins Z1_00342 529507.PMI0009 0.0 1203.0 Proteus dnaK GO:0000166,GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006950,GO:0006986,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010556,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0016989,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018995,GO:0019219,GO:0019222,GO:0020003,GO:0022607,GO:0030430,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0033643,GO:0033646,GO:0033655,GO:0034620,GO:0035639,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043230,GO:0043531,GO:0043656,GO:0043657,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044183,GO:0044215,GO:0044216,GO:0044217,GO:0044421,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051087,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051716,GO:0060255,GO:0061077,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065010,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140110,GO:1901265,GO:1901363,GO:1903506,GO:2001141 ko:K04043 ko03018,ko04212,ko05152,map03018,map04212,map05152 ko00000,ko00001,ko03019,ko03029,ko03110,ko04147 1.A.33.1 Bacteria 1MVEN@1224,1RMDD@1236,3Z2FD@583,COG0443@1,COG0443@2 NA|NA|NA O autoregulated heat shock proteins K04043 Z1_00343 34506.g930 1.2e-103 382.5 Rhabditida moc-2 Nematoda 1KWQ5@119089,3A5XP@33154,3BSRG@33208,3DAHT@33213,40E0V@6231,410P7@6236,COG0303@1,KOG2371@2759 NA|NA|NA H Probable molybdopterin binding domain Z1_00344 529507.PMI0007 1.4e-27 130.6 Proteus ko:K07126 ko00000 Bacteria 1MWPA@1224,1RPI3@1236,3Z26N@583,COG0790@1,COG0790@2 NA|NA|NA S Sel1-like repeats. Z1_00345 529507.PMI0006 7.7e-177 626.3 Proteus tal GO:0003674,GO:0003824,GO:0004801,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006098,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009052,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016744,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019693,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051156,GO:0051186,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072524,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564 2.2.1.2 ko:K00616,ko:K08314 ko00030,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00004,M00007 R01827 RC00439,RC00604 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MWQ8@1224,1RMS0@1236,3Z1CB@583,COG0176@1,COG0176@2 NA|NA|NA F Transaldolase is important for the balance of metabolites in the pentose-phosphate pathway Z1_00346 529507.PMI0005 1.7e-142 511.9 Proteus yaaA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0033194,GO:0042221,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:1901700 ko:K09861 ko00000 Bacteria 1MUAF@1224,1RMTD@1236,3Z1K3@583,COG3022@1,COG3022@2 NA|NA|NA S Peroxide stress protein YaaA Z1_00347 529507.PMI0004 0.0 5260.7 Proteus Bacteria 1RCUZ@1224,1S3JW@1236,3Z2DH@583,COG2931@1,COG2931@2 NA|NA|NA Q COG2931 RTX toxins and related Ca2 -binding proteins Z1_00348 34506.g874 1.2e-244 852.0 Bilateria Metazoa 38DB9@33154,3BI93@33208,3D0F1@33213,COG0498@1,KOG2616@2759 NA|NA|NA E 2-oxobutyrate metabolic process Z1_00349 529507.PMI0002 3.7e-176 624.0 Proteus thrB GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004413,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006555,GO:0006566,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009086,GO:0009088,GO:0009092,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019202,GO:0019752,GO:0040007,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.7.1.39 ko:K00872 ko00260,ko01100,ko01110,ko01120,ko01230,map00260,map01100,map01110,map01120,map01230 M00018 R01771 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECSE_1348.ECSE_0003,iJN678.thrB,iLJ478.TM0545,iSB619.SA_RS06620 Bacteria 1MW8I@1224,1RMYR@1236,3Z2A9@583,COG0083@1,COG0083@2 NA|NA|NA F Catalyzes the ATP-dependent phosphorylation of L- homoserine to L-homoserine phosphate Z1_00350 529507.PMI0001 0.0 1596.6 Proteus thrA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004072,GO:0004412,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009090,GO:0009092,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019202,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.3,2.7.2.4 ko:K00003,ko:K00928,ko:K12524,ko:K12525 ko00260,ko00261,ko00270,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00260,map00261,map00270,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00016,M00017,M00018,M00033,M00525,M00526,M00527 R00480,R01773,R01775 RC00002,RC00043,RC00087 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0002,iEcDH1_1363.EcDH1_3594,iSFV_1184.SFV_0001 Bacteria 1MW3H@1224,1RN1G@1236,3Z0Z1@583,COG0460@1,COG0460@2,COG0527@1,COG0527@2 NA|NA|NA E belongs to the aspartokinase family Z1_00351 34506.g1408 6.7e-133 479.9 Bilateria Metazoa 2EAXC@1,2SH3K@2759,3AIHB@33154,3BXEX@33208,3DDZX@33213 NA|NA|NA T Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_00352 529507.PMI3718 1.6e-82 312.0 Proteus creA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K05805 ko00000 Bacteria 1RDMP@1224,1S29X@1236,3Z2S1@583,COG3045@1,COG3045@2 NA|NA|NA S CreA protein Z1_00353 529507.PMI3717 3e-175 620.9 Proteus rob GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019172,GO:0019243,GO:0019249,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043436,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046185,GO:0046394,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 ko:K05804,ko:K13653 M00647,M00767 ko00000,ko00002,ko03000,ko03036 Bacteria 1MWTF@1224,1RQMF@1236,3Z2F7@583,COG2207@1,COG2207@2,COG3708@1,COG3708@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_00354 529507.PMI3716 4.6e-117 427.2 Proteus gpmB 5.4.2.12 ko:K15634 ko00010,ko00260,ko00680,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00260,map00680,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00001,M00002,M00003 R01518 RC00536 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iZ_1308.Z5997 Bacteria 1NPC4@1224,1RSEU@1236,3Z1WN@583,COG0406@1,COG0406@2 NA|NA|NA F Phosphoglycerate mutase family Z1_00355 34506.g1406 6.4e-96 356.7 Bilateria Metazoa 2S3KM@2759,3A77F@33154,3C03X@33208,3DGCI@33213,COG1986@1 NA|NA|NA F Protein of unknown function DUF84 Z1_00356 529507.PMI3714 1.2e-49 202.2 Proteus trpR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009072,GO:0009308,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0034641,GO:0042430,GO:0043436,GO:0043565,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901605,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03720 ko00000,ko03000 Bacteria 1MYB2@1224,1S6RH@1236,3Z2Y9@583,COG2973@1,COG2973@2 NA|NA|NA K This protein is an aporepressor. When complexed with L- tryptophan it binds the operator region of the trp operon (5'- ACTAGT-'3') and prevents the initiation of transcription. The complex also regulates trp repressor biosynthesis by binding to its regulatory region Z1_00357 529507.PMI3713 0.0 1273.1 Proteus slt GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008932,GO:0008933,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0009274,GO:0016740,GO:0016757,GO:0030203,GO:0030288,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043170,GO:0044464,GO:0061783,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K08309 ko00000,ko01000,ko01011 GH23 iETEC_1333.ETEC_4747,iPC815.YPO0452 Bacteria 1MV3F@1224,1RMS8@1236,3Z1GR@583,COG0741@1,COG0741@2 NA|NA|NA M Soluble lytic murein transglycosylase L domain Z1_00358 529507.PMI3712 0.0 1098.2 Proteus yjjK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006417,GO:0006448,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017148,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0034248,GO:0034249,GO:0043021,GO:0043022,GO:0044877,GO:0045900,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:2000112,GO:2000113 3.6.3.25 ko:K06020 ko00000,ko01000 Bacteria 1MU37@1224,1RPWS@1236,3Z1UZ@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ABC transporter Z1_00359 529507.PMI3709 2.6e-138 498.0 Proteus tonB ko:K03832 ko00000,ko02000 2.C.1.1 Bacteria 1MZXC@1224,1S7EM@1236,3Z2FS@583,COG0810@1,COG0810@2 NA|NA|NA M TonB C terminal Z1_00360 529507.PMI3708 3.3e-100 370.9 Proteus fecI ko:K03088 ko00000,ko03021 Bacteria 1N6SV@1224,1S570@1236,3Z226@583,COG1595@1,COG1595@2 NA|NA|NA K ECF sigma factor Z1_00361 529507.PMI3707 1.9e-186 658.3 Proteus ko:K07165 ko00000 Bacteria 1MZCK@1224,1SYD8@1236,3Z2QQ@583,COG3712@1,COG3712@2 NA|NA|NA PT Domain of unknown function (DUF4880) Z1_00362 529507.PMI3706 0.0 1853.6 Proteus yddB Bacteria 1MXAE@1224,1RWWH@1236,3Z1HK@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA P Secretin and TonB N terminus short domain Z1_00363 529507.PMI3705 0.0 1107.4 Proteus yddA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008144,GO:0016020,GO:0016021,GO:0017076,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K02471 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.203.11,3.A.1.203.4 Bacteria 1MW09@1224,1RPQA@1236,3Z18B@583,COG4178@1,COG4178@2 NA|NA|NA P SbmA/BacA-like family Z1_00364 529507.PMI3704 0.0 1835.5 Proteus pqqL ko:K07263 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1NAH6@1224,1RNKC@1236,3Z1K2@583,COG0612@1,COG0612@2 NA|NA|NA S Peptidase, M16 Z1_00365 529507.PMI3703 5e-72 276.9 Proteus ko:K15977 ko00000 Bacteria 1MZC7@1224,1SANJ@1236,3Z2TC@583,COG2259@1,COG2259@2 NA|NA|NA S DoxX Z1_00366 529507.PMI3702 0.0 1339.3 Proteus fadH GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008670,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016628,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032553,GO:0032787,GO:0033542,GO:0033543,GO:0034440,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071949,GO:0072329,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575 1.3.1.34 ko:K00219 ko00000,ko01000 Bacteria 1MVE0@1224,1RNM8@1236,3Z15U@583,COG0446@1,COG0446@2,COG1902@1,COG1902@2 NA|NA|NA C 2,4-dienoyl-CoA reductase NADPH (2,4-dienoyl coenzyme A reductase) K00219 Z1_00368 34506.g1426 1.5e-217 761.9 Rhabditida Nematoda 1M6IB@119089,38WEE@33154,3C6GK@33208,3DMFB@33213,40P2I@6231,414X3@6236,COG1301@1,KOG3787@2759 NA|NA|NA E Sodium:dicarboxylate symporter family Z1_00369 529507.PMI3700 4.6e-120 437.2 Proteus yqjA GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0022857,GO:0032505,GO:0043093,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051301,GO:0055085,GO:0071944 Bacteria 1MU30@1224,1RNS5@1236,3Z23A@583,COG0586@1,COG0586@2 NA|NA|NA S SNARE associated Golgi protein Z1_00370 529507.PMI3699 2.8e-32 144.4 Proteus yqjD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0043021,GO:0043024,GO:0044464,GO:0044877,GO:0060187,GO:0071944 ko:K07184 ko00000 Bacteria 1N6X7@1224,1S9QF@1236,3Z2TW@583,COG4575@1,COG4575@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF883) Z1_00371 529507.PMI3698 5.6e-60 236.9 Proteus yqjE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RHS9@1224,1S5UU@1236,3Z2MB@583,COG5393@1,COG5393@2 NA|NA|NA S Putative Actinobacterial Holin-X, holin superfamily III Z1_00372 529507.PMI3697 1.2e-46 192.2 Proteus yqjK GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N7E9@1224,1SCW7@1236,2E52J@1,32ZVT@2,3Z3GK@583 NA|NA|NA S YqjK-like protein Z1_00373 529507.PMI3696 3.6e-64 250.8 Proteus yqjF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K15977,ko:K18305 M00644 ko00000,ko00002,ko02000 Bacteria 1MZVP@1224,1S8UI@1236,3Z30Z@583,COG2259@1,COG2259@2 NA|NA|NA S DoxX Z1_00374 529507.PMI3695 3.4e-166 590.9 Proteus yhaJ GO:0001130,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003700,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031334,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000142,GO:2000144,GO:2001141 ko:K10972 ko00000,ko03000 Bacteria 1MZTA@1224,1RN7R@1236,3Z24K@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00375 529507.PMI3694 5e-133 480.3 Proteus yhaK ko:K06911 ko00000 Bacteria 1MWSY@1224,1RMSK@1236,3Z25H@583,COG1741@1,COG1741@2 NA|NA|NA S Pirin Z1_00376 529507.PMI3693 2.6e-163 581.3 Proteus rsmI GO:0000154,GO:0000451,GO:0000453,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016434,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070677,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.198 ko:K07056 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MU0E@1224,1RM7U@1236,3Z0Y4@583,COG0313@1,COG0313@2 NA|NA|NA H Catalyzes the 2'-O-methylation of the ribose of cytidine 1402 (C1402) in 16S rRNA Z1_00377 529507.PMI3692 0.0 1145.2 Proteus lpoA GO:0000270,GO:0003674,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030203,GO:0030234,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031241,GO:0031975,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098772,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K07121 ko00000 Bacteria 1MUHR@1224,1RXX4@1236,3Z1B0@583,COG3107@1,COG3107@2 NA|NA|NA M LppC putative lipoprotein Z1_00378 529507.PMI3691 3e-68 264.2 Proteus yraN ko:K07460 ko00000 Bacteria 1N6VN@1224,1SC8A@1236,3Z2YZ@583,COG0792@1,COG0792@2 NA|NA|NA L Uncharacterised protein family UPF0102 Z1_00379 471881.PROPEN_03188 1.2e-103 382.5 Proteus gmhA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006275,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030174,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032298,GO:0042802,GO:0045740,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051171,GO:0051173,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0090329,GO:2000105,GO:2000112 2.7.1.167,2.7.1.33,2.7.7.70,5.3.1.28 ko:K03271,ko:K03272,ko:K03525,ko:K12961 ko00540,ko00770,ko01100,map00540,map00770,map01100 M00064,M00120 R02971,R03018,R04391,R05644,R05645,R05646,R09768,R09769 RC00002,RC00017,RC00078,RC00434 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko03036 Bacteria 1NJ8X@1224,1RS1Y@1236,3Z1FK@583,COG0279@1,COG0279@2 NA|NA|NA G SIS domain Z1_00380 529507.PMI3689 2.2e-94 351.7 Proteus yraP GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032153,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MUZ2@1224,1RY2B@1236,3Z0UG@583,COG2823@1,COG2823@2 NA|NA|NA S bacterial OsmY and nodulation domain Z1_00381 529507.PMI3688 8.1e-111 406.4 Proteus ureG ko:K03189,ko:K04652 ko00000,ko03110 iJN678.ureG Bacteria 1MVBD@1224,1RP5R@1236,3Z2F4@583,COG0378@1,COG0378@2 NA|NA|NA F Facilitates the functional incorporation of the urease nickel metallocenter. This process requires GTP hydrolysis, probably effectuated by UreG Z1_00382 529507.PMI3687 1.4e-121 442.2 Proteus ureF ko:K03188 ko00000 Bacteria 1MW8Q@1224,1RP91@1236,3Z1Q7@583,COG0830@1,COG0830@2 NA|NA|NA J Required for maturation of urease via the functional incorporation of the urease nickel metallocenter Z1_00383 529507.PMI3686 6.4e-79 300.1 Proteus ureE ko:K03187 ko00000 Bacteria 1MZQZ@1224,1S6R9@1236,3Z1QM@583,COG2371@1,COG2371@2 NA|NA|NA J Involved in urease metallocenter assembly. Binds nickel. Probably functions as a nickel donor during metallocenter assembly Z1_00384 529507.PMI3685 0.0 1146.3 Proteus ureC 3.5.1.5 ko:K01428 ko00220,ko00230,ko00791,ko01100,ko01120,ko05120,map00220,map00230,map00791,map01100,map01120,map05120 R00131 RC02798,RC02806 ko00000,ko00001,ko01000 iJN746.PP_2845 Bacteria 1MU5P@1224,1RN78@1236,3Z1KY@583,COG0804@1,COG0804@2 NA|NA|NA E Belongs to the metallo-dependent hydrolases superfamily. Urease alpha subunit family Z1_00385 529507.PMI3684 6.2e-54 216.5 Proteus ureB 3.5.1.5 ko:K01427,ko:K01428,ko:K01429,ko:K14048 ko00220,ko00230,ko00791,ko01100,ko01120,ko05120,map00220,map00230,map00791,map01100,map01120,map05120 R00131 RC02798,RC02806 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RGW0@1224,1S8UP@1236,3Z2Q9@583,COG0832@1,COG0832@2 NA|NA|NA E Urease beta subunit Z1_00386 34506.g1361 8.9e-47 192.6 Bilateria Metazoa 2QPKB@2759,39RES@33154,3BKZ9@33208,3CVDG@33213,COG0804@1 NA|NA|NA F Urease alpha-subunit, N-terminal domain Z1_00387 529507.PMI3682 7.9e-162 576.2 Proteus ureD ko:K03190 ko00000 Bacteria 1RABD@1224,1RSB2@1236,3Z1NT@583,COG0829@1,COG0829@2 NA|NA|NA J Required for maturation of urease via the functional incorporation of the urease nickel metallocenter Z1_00388 529507.PMI3681 4.3e-152 543.9 Proteus ureR Bacteria 1Q19X@1224,1RPD4@1236,3Z2KD@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K Induces the synthesis of acid phosphatase (AppA) and several other polypeptides (such as AppBC) during the deceleration phase of growth. It also acts as a transcriptional repressor for one group of proteins that are synthesized preferentially in exponential growth and for one group synthesized only in the stationary phase. Also involved in the stabilization of the sigma stress factor RpoS during stress conditions Z1_00389 529507.PMI3680 9.4e-124 449.5 Proteus mtgA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008955,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043164,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044464,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.4.1.129,3.4.16.4 ko:K03814,ko:K05365 ko00550,map00550 R04519 RC00005,RC00049 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko01011 GT51 Bacteria 1RDAQ@1224,1RMGB@1236,3Z2GY@583,COG0744@1,COG0744@2 NA|NA|NA M Peptidoglycan polymerase that catalyzes glycan chain elongation from lipid-linked precursors Z1_00390 529507.PMI3679 4.8e-115 420.6 Proteus elbB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006629,GO:0006720,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009893,GO:0009987,GO:0019216,GO:0019222,GO:0019747,GO:0031323,GO:0031325,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045828,GO:0045834,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:1901576 Bacteria 1MW2K@1224,1RMDJ@1236,3Z1AT@583,COG3155@1,COG3155@2 NA|NA|NA Q Displays glyoxalase activity, catalyzing the conversion of glyoxal to glycolate Z1_00391 529507.PMI3678 0.0 1446.0 Proteus arcB GO:0000155,GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009927,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0031224,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 2.7.13.3 ko:K07648 ko02020,ko02026,map02020,map02026 M00456 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1NRP8@1224,1RWM5@1236,3Z2NJ@583,COG0642@1,COG0745@1,COG0745@2,COG2198@1,COG2198@2,COG2205@2 NA|NA|NA KT Histidine kinase Z1_00392 529507.PMI3677 0.0 2952.2 Proteus gltB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004355,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006537,GO:0006541,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0015930,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0019676,GO:0019740,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045181,GO:0046394,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.4.1.13,1.4.1.14,1.4.7.1 ko:K00265,ko:K00284 ko00250,ko00630,ko00910,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00250,map00630,map00910,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 R00021,R00093,R00114,R00248,R10086 RC00006,RC00010,RC02799 ko00000,ko00001,ko01000 iBWG_1329.BWG_2914,iECDH10B_1368.ECDH10B_3387,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_0495,iEcDH1_1363.EcDH1_0495,iPC815.YPO3557 Bacteria 1MU7B@1224,1RN2W@1236,3Z2AC@583,COG0067@1,COG0067@2,COG0069@1,COG0069@2,COG0070@1,COG0070@2 NA|NA|NA E glutamate synthase NADPH large chain precursor (glutamate synthase alpha subunit) (NADPH-GOGAT) (GLTS alpha chain) K00265 Z1_00393 529507.PMI3676 2e-274 951.0 Proteus gltD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004355,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006537,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0015930,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045181,GO:0046394,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.4.1.13,1.4.1.14 ko:K00266 ko00250,ko00910,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00250,map00910,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 R00093,R00114,R00248 RC00006,RC00010,RC02799 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_3503,iYL1228.KPN_03625 Bacteria 1MU2H@1224,1RMY7@1236,3Z2DU@583,COG0493@1,COG0493@2 NA|NA|NA C Flavin-binding monooxygenase-like Z1_00394 529507.PMI3675 8.9e-221 772.7 Proteus GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0008150,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015849,GO:0046942,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702 ko:K03326 ko00000,ko02000 2.A.61.1 Bacteria 1NVYD@1224,1RYSA@1236,3Z1DJ@583,COG3069@1,COG3069@2 NA|NA|NA C C4-dicarboxylate anaerobic carrier Z1_00395 529507.PMI3674 8.7e-245 852.4 Proteus abgA ko:K12940 ko00000,ko01002 Bacteria 1MUIV@1224,1RRJI@1236,3Z26M@583,COG1473@1,COG1473@2 NA|NA|NA S Peptidase dimerisation domain Z1_00396 529507.PMI3673 3.1e-192 677.6 Gammaproteobacteria 5.4.99.60,5.4.99.61 ko:K06042 ko00860,ko01100,map00860,map01100 R05177,R05814 RC01292,RC01980 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWN0@1224,1RQA6@1236,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_00397 529507.PMI3672 5.5e-89 333.6 Proteus sspB GO:0000502,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0008150,GO:0009376,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0010604,GO:0019222,GO:0019899,GO:0031597,GO:0032781,GO:0032991,GO:0042176,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043085,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043462,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0045732,GO:0046983,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050790,GO:0051117,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051336,GO:0051345,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1902494,GO:1904949,GO:1905368,GO:1905369,GO:1990904 ko:K03600,ko:K09985 ko00000,ko03021 Bacteria 1MZ2Q@1224,1S8WT@1236,3Z2J3@583,COG2969@1,COG2969@2 NA|NA|NA S Stringent starvation protein B Z1_00398 529507.PMI3671 1.7e-116 425.2 Proteus sspA GO:0001000,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009991,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019899,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031667,GO:0042594,GO:0043175,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0080090,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03599 ko00000,ko02000,ko03021 1.A.12.3.1 Bacteria 1MXJD@1224,1RP12@1236,3Z2KX@583,COG0625@1,COG0625@2 NA|NA|NA O stringent starvation protein A Z1_00399 471881.PROPEN_03215 4e-63 247.3 Proteus rpsI GO:0000462,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016070,GO:0016072,GO:0019538,GO:0022613,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030490,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02996 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RD4A@1224,1S3Q7@1236,3Z2NB@583,COG0103@1,COG0103@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein S9/S16 Z1_00400 529507.PMI3669 3.4e-76 290.8 Proteus rplM GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016020,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070180,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02871 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RA11@1224,1S280@1236,3Z0Y2@583,COG0102@1,COG0102@2 NA|NA|NA J This protein is one of the early assembly proteins of the 50S ribosomal subunit, although it is not seen to bind rRNA by itself. It is important during the early stages of 50S assembly Z1_00401 529507.PMI3668 2.6e-208 731.1 Proteus zapE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0032153,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051301 ko:K06916 ko00000,ko03036 Bacteria 1MUUW@1224,1RMTJ@1236,3Z1ZA@583,COG1485@1,COG1485@2 NA|NA|NA D Reduces the stability of FtsZ polymers in the presence of ATP Z1_00402 529507.PMI3667 1e-58 232.6 Proteus yhcB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K09908 ko00000 Bacteria 1RE90@1224,1S3S2@1236,3Z2XZ@583,COG3105@1,COG3105@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1043) Z1_00403 529507.PMI3666 9.9e-250 869.0 Proteus degQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004252,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0030163,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0042597,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051603,GO:0070011,GO:0071575,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 1.3.1.74,3.4.21.107 ko:K04771,ko:K04772,ko:K08070 ko01503,ko02020,map01503,map02020 M00728 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1MU63@1224,1RN9T@1236,3Z1SX@583,COG0265@1,COG0265@2 NA|NA|NA M Belongs to the peptidase S1C family Z1_00404 529507.PMI3665 1.2e-194 685.6 Proteus degS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004252,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006457,GO:0006508,GO:0006515,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0010033,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0030163,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0031975,GO:0033554,GO:0035966,GO:0035967,GO:0042221,GO:0042597,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051603,GO:0051716,GO:0051788,GO:0061077,GO:0070011,GO:0070887,GO:0071218,GO:0071310,GO:0071575,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.4.21.107 ko:K04691,ko:K04771,ko:K04772 ko01503,ko02020,map01503,map02020 M00728 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1MU63@1224,1RN9T@1236,3Z1K1@583,COG0265@1,COG0265@2 NA|NA|NA O Trypsin Z1_00405 529507.PMI3664 2e-194 684.9 Proteus Bacteria 1R4AR@1224,1RMPA@1236,28ISW@1,2Z8RZ@2,3Z0V4@583 NA|NA|NA Z1_00406 529507.PMI3663 4.6e-171 607.1 Proteus Bacteria 1N81Q@1224,1SD0I@1236,2BG42@1,32A0R@2,3Z39G@583 NA|NA|NA Z1_00407 529507.PMI3662 5.5e-242 843.2 Proteus Bacteria 1R9T3@1224,1SYHS@1236,3Z388@583,COG0846@1,COG0846@2 NA|NA|NA K SIR2-like domain Z1_00408 529507.PMI3661 1.6e-235 821.6 Proteus murA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008760,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.7 ko:K00790 ko00520,ko00550,ko01100,map00520,map00550,map01100 R00660 RC00350 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 Bacteria 1MUH7@1224,1RN91@1236,3Z1IH@583,COG0766@1,COG0766@2 NA|NA|NA M Cell wall formation. Adds enolpyruvyl to UDP-N- acetylglucosamine Z1_00409 529507.PMI3660 8.9e-40 169.1 Proteus yrbA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540 ko:K07390 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1N1WJ@1224,1SCAR@1236,3Z2UF@583,COG5007@1,COG5007@2 NA|NA|NA K BolA-like protein Z1_00410 529507.PMI3659 1.3e-45 188.7 Proteus mlaB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0033554,GO:0042221,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051716 ko:K02066,ko:K04749,ko:K07122 ko02010,map02010 M00210,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko03021 3.A.1.27,3.A.1.27.3 Bacteria 1NGIE@1224,1SD2Q@1236,3Z2ZF@583,COG3113@1,COG3113@2 NA|NA|NA S STAS domain Z1_00411 529507.PMI3658 1.5e-112 412.1 Proteus ttg2D ko:K07323 ko02010,map02010 M00210 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27.3 Bacteria 1NKFA@1224,1RNJW@1236,3Z2JA@583,COG2854@1,COG2854@2 NA|NA|NA Q MlaC protein Z1_00412 529507.PMI3657 3.9e-93 347.4 Proteus mlaD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005543,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008289,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02067 ko02010,map02010 M00210,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27 Bacteria 1NCUG@1224,1RQ0Y@1236,3Z2C8@583,COG1463@1,COG1463@2 NA|NA|NA Q MlaD protein Z1_00413 529507.PMI3656 5.9e-135 486.9 Proteus mlaE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02066 ko02010,map02010 M00210,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27 Bacteria 1MVPN@1224,1RM9H@1236,3Z1HD@583,COG0767@1,COG0767@2 NA|NA|NA Q Permease MlaE Z1_00414 529507.PMI3655 2e-149 535.0 Proteus mlaF GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0008144,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K02065 ko02010,map02010 M00210,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27 Bacteria 1MUSD@1224,1RMCJ@1236,3Z2D6@583,COG1127@1,COG1127@2 NA|NA|NA Q ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_00415 529507.PMI3654 1.4e-162 578.9 Proteus Z012_08255 ko:K07301 ko00000,ko02000 2.A.19.5 Bacteria 1MU3R@1224,1RMRD@1236,3Z1J6@583,COG0530@1,COG0530@2 NA|NA|NA P Sodium/calcium exchanger protein Z1_00416 529507.PMI3653 1e-176 625.9 Proteus kdsD GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005996,GO:0006082,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016053,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0019146,GO:0019294,GO:0019752,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046364,GO:0046394,GO:0046400,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 5.3.1.13 ko:K06041 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00063 R01530 RC00541 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iECH74115_1262.ECH74115_4519,iECSP_1301.ECSP_4172,iECs_1301.ECs4076,iPC815.YPO3577,iSFV_1184.SFV_3227,iSFxv_1172.SFxv_3550,iYL1228.KPN_03607,iZ_1308.Z4560 Bacteria 1MUXD@1224,1RMT9@1236,3Z0YJ@583,COG0517@1,COG0517@2,COG0794@1,COG0794@2 NA|NA|NA M Domain in cystathionine beta-synthase and other proteins. Z1_00417 529507.PMI3652 5.4e-98 363.6 Proteus kdsC GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008781,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016311,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019143,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0042578,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070567,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 3.1.3.45 ko:K03270 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00063 R03350 RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iECO26_1355.ECO26_4302 Bacteria 1RH85@1224,1S6D0@1236,3Z25R@583,COG1778@1,COG1778@2 NA|NA|NA S Involved in the biosynthesis of lipopolysaccharides (LPSs). Catalyzes the hydrolysis of 3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate (KDO 8-P) to 3-deoxy-D-manno-octulosonate (KDO) and inorganic phosphate Z1_00418 529507.PMI3651 3.4e-103 380.9 Proteus lptC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0017089,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0033036,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046836,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944,GO:1901264 ko:K02040,ko:K11719 ko02010,ko02020,ko05152,map02010,map02020,map05152 M00222 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 1.B.42.1,3.A.1.7 iB21_1397.B21_03015,iECBD_1354.ECBD_0543,iECB_1328.ECB_03064,iECD_1391.ECD_03064 Bacteria 1RA1Y@1224,1SDZE@1236,3Z2BG@583,COG3117@1,COG3117@2 NA|NA|NA S Involved in the assembly of lipopolysaccharide (LPS). Required for the translocation of LPS from the inner membrane to the outer membrane. Facilitates the transfer of LPS from the inner membrane to the periplasmic protein LptA. Could be a docking site for LptA Z1_00419 529507.PMI3650 2.5e-92 344.7 Proteus lptA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009279,GO:0010876,GO:0015920,GO:0016020,GO:0017089,GO:0019867,GO:0030288,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044462,GO:0044464,GO:0046836,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944,GO:1901264 ko:K09774 ko00000,ko02000 1.B.42.1 iB21_1397.B21_03016,iECBD_1354.ECBD_0542,iECB_1328.ECB_03065,iECD_1391.ECD_03065 Bacteria 1N776@1224,1RPM7@1236,3Z1D8@583,COG1934@1,COG1934@2 NA|NA|NA S Involved in the assembly of lipopolysaccharide (LPS). Required for the translocation of LPS from the inner membrane to the outer membrane. May form a bridge between the inner membrane and the outer membrane, via interactions with LptC and LptD, thereby facilitating LPS transfer across the periplasm Z1_00420 529507.PMI3649 1.4e-130 472.2 Proteus lptB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015221,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015437,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034040,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901264,GO:1901505,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K01990,ko:K06861 ko02010,map02010 M00254,M00320 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 1.B.42.1,3.A.1 Bacteria 1MU8M@1224,1RPW1@1236,3Z1YA@583,COG1137@1,COG1137@2 NA|NA|NA S Branched-chain amino acid ATP-binding cassette transporter Z1_00421 34506.g1247 2e-269 934.5 Bilateria Metazoa 2SJCF@2759,3AGTB@33154,3BZH8@33208,3DDTA@33213,COG1508@1 NA|NA|NA K Sigma-54 factor, core binding domain Z1_00422 529507.PMI3647 1e-44 185.7 Proteus hpf GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006417,GO:0006448,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015935,GO:0016020,GO:0017148,GO:0019222,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043024,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045900,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071944,GO:0080090,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K05808,ko:K05809 ko00000,ko03009 Bacteria 1MZHW@1224,1S8U1@1236,3Z2VZ@583,COG1544@1,COG1544@2 NA|NA|NA J Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein Z1_00423 529507.PMI3646 1.2e-76 292.4 Proteus ptsN GO:0001932,GO:0001934,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004857,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009401,GO:0009893,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010562,GO:0010604,GO:0015144,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019207,GO:0019209,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019887,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022898,GO:0030234,GO:0030295,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031399,GO:0031401,GO:0032147,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032409,GO:0032412,GO:0032879,GO:0033674,GO:0034219,GO:0034762,GO:0034765,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042327,GO:0043085,GO:0043086,GO:0043269,GO:0043549,GO:0044092,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045859,GO:0045860,GO:0045937,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051338,GO:0051347,GO:0055085,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071702,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090563,GO:0098772,GO:1901698 2.7.1.194,2.7.1.202 ko:K02768,ko:K02769,ko:K02770,ko:K02806,ko:K02821 ko00051,ko00053,ko01100,ko01120,ko02060,map00051,map00053,map01100,map01120,map02060 M00273,M00283,M00550 R03232,R07671 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.2.1,4.A.7.1 Bacteria 1RD0E@1224,1S668@1236,3Z2I9@583,COG1762@1,COG1762@2 NA|NA|NA G Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 Z1_00424 34506.g1248 1.4e-158 565.5 Bilateria Metazoa 2SDIY@2759,3AG2X@33154,3BXW9@33208,3DE88@33213,COG1660@1 NA|NA|NA S P-loop ATPase protein family Z1_00425 529507.PMI3644 6e-42 176.4 Proteus ptsO GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006808,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008643,GO:0009401,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0019538,GO:0036211,GO:0042221,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0065007,GO:0071702,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901698 2.7.1.121,2.7.1.202,2.7.3.9 ko:K02768,ko:K02784,ko:K05881,ko:K08483,ko:K08485,ko:K11183,ko:K11189 ko00051,ko00561,ko01100,ko01120,ko02060,map00051,map00561,map01100,map01120,map02060 M00273 R01012,R03232 RC00015,RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.2.1,8.A.7,8.A.8.1.1 Bacteria 1PCB4@1224,1SX86@1236,3Z2VN@583,COG1925@1,COG1925@2 NA|NA|NA G PTS HPr component phosphorylation site Z1_00426 34506.g1249 1.9e-68 265.0 Bilateria Metazoa 2EKF2@1,2SQC2@2759,3AM2H@33154,3C0I0@33208,3DH13@33213 NA|NA|NA S Rnk N-terminus Z1_00427 529507.PMI3642 1.5e-247 861.7 Proteus pmbA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564 ko:K03592 ko00000,ko01002 Bacteria 1MUVW@1224,1RPJF@1236,3Z1BG@583,COG0312@1,COG0312@2 NA|NA|NA S Putative modulator of DNA gyrase Z1_00428 34506.g1048 8.1e-94 349.7 Bilateria Metazoa 2SCGM@2759,3ABZ1@33154,3BW7Z@33208,3DG0E@33213,COG3028@1 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF615) Z1_00429 529507.PMI3640 1.1e-46 192.2 Proteus yhcO ko:K03623 ko00000 Bacteria 1NEIE@1224,1T8IB@1236,3Z2Z5@583,COG2732@1,COG2732@2 NA|NA|NA K Barstar (barnase inhibitor) Z1_00430 529507.PMI3639 1.5e-86 325.5 Proteus GO:0005575,GO:0005576 ko:K03628,ko:K15125 ko03018,ko05133,map03018,map05133 ko00000,ko00001,ko00536,ko03019,ko03021 Bacteria 1RI58@1224,1S651@1236,3Z2N7@583,COG4290@1,COG4290@2 NA|NA|NA F ribonuclease Z1_00431 529507.PMI3638 1.2e-269 935.3 Proteus tldD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564 ko:K03568 ko00000,ko01002 Bacteria 1MUSK@1224,1RMA5@1236,3Z1VG@583,COG0312@1,COG0312@2 NA|NA|NA S Putative modulator of DNA gyrase Z1_00432 529507.PMI3637 1.7e-159 568.5 Proteus ramA 3.5.1.77,3.5.5.1 ko:K01459,ko:K01501,ko:K11206 ko00380,ko00460,ko00627,ko00643,ko00910,ko01120,map00380,map00460,map00627,map00643,map00910,map01120 R00540,R01887,R03093,R03542,R05591,R07855 RC00315,RC00325,RC00617,RC00959,RC02811 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MUUB@1224,1RNVZ@1236,3Z20A@583,COG0388@1,COG0388@2 NA|NA|NA S Nitrilase cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase Z1_00433 529507.PMI3636 0.0 2530.0 Proteus yhdP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MXWF@1224,1RNUK@1236,3Z1FR@583,COG3164@1,COG3164@2 NA|NA|NA S Membrane Z1_00434 34506.g897 1.8e-273 948.0 Bilateria Metazoa 2QPXM@2759,39K7A@33154,3BHNU@33208,3DE56@33213,COG1530@1 NA|NA|NA J Ribonuclease E/G family Z1_00435 529507.PMI3634 8e-100 369.8 Proteus maf GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0030145,GO:0030312,GO:0036218,GO:0036221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0047429,GO:0071944 2.1.1.190 ko:K03215,ko:K06287 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1RH6H@1224,1S41D@1236,3Z15T@583,COG0424@1,COG0424@2 NA|NA|NA D Maf-like protein Z1_00436 529507.PMI3633 1.5e-88 332.0 Proteus mreD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008150,GO:0008360,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022603,GO:0022604,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944 ko:K03571 ko00000,ko03036 9.B.157.1 Bacteria 1RER7@1224,1S4DE@1236,3Z22P@583,COG2891@1,COG2891@2 NA|NA|NA M Involved in formation of the rod shape of the cell. May also contribute to regulation of formation of penicillin-binding proteins Z1_00437 529507.PMI3632 8.1e-188 662.9 Proteus mreC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007163,GO:0008150,GO:0008360,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030428,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042546,GO:0043621,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071554,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071963 ko:K03570 ko00000,ko03036 9.B.157.1 Bacteria 1N8ZS@1224,1RMK4@1236,3Z11G@583,COG1792@1,COG1792@2 NA|NA|NA M rod shape-determining protein MreC Z1_00438 34506.g1007 1.5e-189 668.7 Bilateria Metazoa 3AAUP@33154,3BUN1@33208,3DDHV@33213,COG0443@1,KOG0100@2759 NA|NA|NA O Cell division protein FtsA Z1_00439 529507.PMI3630 3.3e-183 647.5 Proteus yhdH GO:0003674,GO:0003824,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016628,GO:0043957,GO:0055114 ko:K19745 ko00640,ko01100,map00640,map01100 R00919 RC00095 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV3W@1224,1RMHG@1236,3Z1DI@583,COG0604@1,COG0604@2 NA|NA|NA C Zinc-binding dehydrogenase Z1_00440 529507.PMI3629 3.8e-78 297.4 Proteus aroQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0003855,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009423,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046417,GO:0071704,GO:1901576 3.4.13.9,4.2.1.10 ko:K01271,ko:K03785,ko:K03786 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R03084 RC00848 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002 iIT341.HP1038,iJN746.PP_0560 Bacteria 1RDDT@1224,1S3PX@1236,3Z12Y@583,COG0757@1,COG0757@2 NA|NA|NA E Catalyzes a trans-dehydration via an enolate intermediate Z1_00441 529507.PMI3628 6.6e-73 280.0 Proteus accB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003989,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009305,GO:0009987,GO:0016049,GO:0016053,GO:0016421,GO:0016874,GO:0016885,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032787,GO:0036211,GO:0040007,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901576 2.3.1.12 ko:K00627,ko:K02160 ko00010,ko00020,ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00010,map00020,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00307,M00376 R00209,R00742,R02569 RC00004,RC00040,RC00367,RC02742,RC02857 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iYL1228.KPN_03664 Bacteria 1RCXA@1224,1S3YP@1236,3Z122@583,COG0511@1,COG0511@2 NA|NA|NA I first, biotin carboxylase catalyzes the carboxylation of the carrier protein and then the transcarboxylase transfers the carboxyl group to form malonyl-CoA Z1_00442 529507.PMI3627 3.1e-256 890.6 Proteus accC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004075,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010565,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0019216,GO:0019217,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032787,GO:0042304,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045717,GO:0045833,GO:0045922,GO:0046394,GO:0046890,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051055,GO:0062012,GO:0062014,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0080090,GO:1901576 6.3.4.14,6.4.1.2 ko:K01961 ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00376 R00742,R04385 RC00040,RC00253,RC00367 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSF_1195.SF3294 Bacteria 1MU4H@1224,1RMNB@1236,3Z1ZM@583,COG0439@1,COG0439@2 NA|NA|NA I Biotin carboxylase C-terminal domain Z1_00443 529507.PMI3626 3.9e-40 170.2 Proteus yhdT Bacteria 1MZ8K@1224,1S8QV@1236,3Z301@583,COG3924@1,COG3924@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF997) Z1_00444 529507.PMI3625 4.1e-262 910.2 Proteus panF GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006855,GO:0008028,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015233,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015849,GO:0015887,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034220,GO:0035461,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042887,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051181,GO:0051182,GO:0051184,GO:0051185,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072349,GO:0090482,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03307,ko:K14392 ko00000,ko02000 2.A.21,2.A.21.1 iE2348C_1286.E2348C_3528,iECED1_1282.ECED1_3917,iECP_1309.ECP_3351 Bacteria 1QUAY@1224,1RP9P@1236,3Z1GH@583,COG4145@1,COG4145@2 NA|NA|NA H Belongs to the sodium solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family Z1_00445 529507.PMI3624 1.9e-166 591.7 Proteus prmA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006480,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008757,GO:0009987,GO:0016278,GO:0016279,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018011,GO:0018012,GO:0018022,GO:0018023,GO:0018193,GO:0018194,GO:0018205,GO:0019538,GO:0031365,GO:0032259,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K02687 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MUPC@1224,1RNAR@1236,3Z1BM@583,COG2264@1,COG2264@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L11 methyltransferase Z1_00446 34506.g1649 7.3e-183 646.4 Eukaryota Eukaryota COG0042@1,KOG2333@2759 NA|NA|NA J tRNA dihydrouridine synthase activity Z1_00447 471881.PROPEN_03275 4.3e-46 190.3 Proteus fis GO:0000018,GO:0000229,GO:0000785,GO:0000786,GO:0000787,GO:0000789,GO:0000976,GO:0000984,GO:0000985,GO:0001017,GO:0001046,GO:0001047,GO:0001067,GO:0001121,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001140,GO:0001216,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008301,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016032,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019042,GO:0019045,GO:0019046,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031421,GO:0032359,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044374,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044815,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045911,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046983,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051704,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03557,ko:K07712 ko02020,ko05111,map02020,map05111 M00497 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko03000,ko03036,ko03400 Bacteria 1N7MJ@1224,1SD35@1236,3Z2U5@583,COG2901@1,COG2901@2 NA|NA|NA K Activates ribosomal RNA transcription. Plays a direct role in upstream activation of rRNA promoters Z1_00448 529507.PMI3621 2.9e-30 138.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1N4MM@1224,1SB20@1236,2EBD4@1,32VQD@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1240) Z1_00449 291112.PAU_00412 1.9e-23 115.2 Gammaproteobacteria GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1R717@1224,1RYDC@1236,COG4104@1,COG4104@2 NA|NA|NA S PAAR repeat-containing protein Z1_00450 1166016.W5S_0554 2.5e-15 88.6 Pectobacterium Bacteria 1MSKC@122277,1QFF9@1224,1TCPE@1236,2BGYW@1,32AZ0@2 NA|NA|NA Z1_00451 529507.PMI3620 2.3e-152 545.0 Proteus Bacteria 1NQZA@1224,1SJUF@1236,2BZG4@1,33RRG@2,3Z2Z0@583 NA|NA|NA S Psort location CytoplasmicMembrane, score Z1_00452 529507.PMI3619 5.4e-220 770.0 Proteus cynX GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009439,GO:0009440,GO:0009987,GO:0016020,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044281,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K03449 ko00000,ko02000 2.A.1.17 iEcSMS35_1347.EcSMS35_0372 Bacteria 1MXGT@1224,1RRH1@1236,3Z2B6@583,COG2807@1,COG2807@2 NA|NA|NA P Major Facilitator Superfamily Z1_00453 34506.g1651 7.6e-137 493.0 Eukaryota Eukaryota COG0584@1,KOG2258@2759 NA|NA|NA C glycerophosphodiester phosphodiesterase activity Z1_00454 34506.g1652 1.1e-250 872.1 Bilateria Metazoa 2EADI@1,2SGMM@2759,3AEH4@33154,3BX09@33208,3DFMJ@33213 NA|NA|NA S Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_00455 529507.PMI3616 4.2e-153 547.4 Proteus ugpA GO:0001406,GO:0001407,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015169,GO:0015605,GO:0015711,GO:0015748,GO:0015794,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0032991,GO:0034220,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055052,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098656,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901264,GO:1901505,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K05814,ko:K15771 ko02010,map02010 M00198,M00491 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.1.16,3.A.1.1.2,3.A.1.1.3 iSFxv_1172.SFxv_3786 Bacteria 1MVAP@1224,1RNQF@1236,3Z127@583,COG1175@1,COG1175@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_00456 529507.PMI3615 4.6e-149 533.9 Proteus ugpE ko:K05815 ko02010,map02010 M00198 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.1.3 Bacteria 1MUWS@1224,1RMKG@1236,3Z1CY@583,COG0395@1,COG0395@2 NA|NA|NA P probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane Z1_00457 34506.g1653 9.3e-203 712.6 Bilateria Metazoa 39XFJ@33154,3BJBU@33208,3DDNH@33213,COG1132@1,KOG0055@2759 NA|NA|NA Q TOBE domain Z1_00458 529507.PMI3613 1.1e-130 472.6 Proteus ycaL GO:0003674,GO:0003824,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0016787,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K07387 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1NK9F@1224,1RQSJ@1236,3Z1ZV@583,COG0501@1,COG0501@2 NA|NA|NA M Peptidase family M48 Z1_00459 529507.PMI3612 2e-80 305.1 Proteus Bacteria 1QCSM@1224,1T8JG@1236,3Z316@583,COG1846@1,COG1846@2 NA|NA|NA K MarR family Z1_00460 529507.PMI3611 2.5e-209 734.6 Proteus yvmA Bacteria 1MW19@1224,1SJQW@1236,3Z18V@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Sugar (and other) transporter Z1_00461 529507.PMI3610 3.8e-72 277.3 Proteus panZ GO:0006082,GO:0006508,GO:0006575,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016485,GO:0019538,GO:0019752,GO:0031638,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042398,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0050790,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051604,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 Bacteria 1RIN3@1224,1S494@1236,3Z3GF@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_00462 529507.PMI3609 3e-212 744.2 Proteus glxK 2.7.1.165 ko:K00865 ko00260,ko00561,ko00630,ko01100,ko01120,ko01130,map00260,map00561,map00630,map01100,map01120,map01130 R08572 RC00002,RC00428 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MVG9@1224,1RMC6@1236,3Z0ZT@583,COG1929@1,COG1929@2 NA|NA|NA G Glycerate kinase family Z1_00463 529507.PMI3608 2e-152 545.0 Proteus rpoH GO:0000150,GO:0000976,GO:0000984,GO:0000985,GO:0000988,GO:0000990,GO:0001017,GO:0001046,GO:0001047,GO:0001067,GO:0001121,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001140,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009009,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016987,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031421,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043254,GO:0043565,GO:0044087,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140097,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000142,GO:2001141 ko:K03089 ko00000,ko03021 Bacteria 1MVWR@1224,1RMFR@1236,3Z1KC@583,COG0568@1,COG0568@2 NA|NA|NA K Sigma factors are initiation factors that promote the attachment of RNA polymerase to specific initiation sites and are then released. This sigma factor is involved in regulation of expression of heat shock genes Z1_00464 529507.PMI3607 1.1e-173 615.9 Proteus ftsX GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008150,GO:0009274,GO:0009276,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0032153,GO:0040007,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0071944 ko:K09811,ko:K09812 ko02010,map02010 M00256 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko03036 3.A.1.140 Bacteria 1MU65@1224,1RYBV@1236,3Z1RB@583,COG2177@1,COG2177@2 NA|NA|NA D Part of the ABC transporter FtsEX involved in cellular division Z1_00465 529507.PMI3606 1.4e-121 442.2 Proteus ftsE GO:0000166,GO:0000287,GO:0000910,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0007049,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008356,GO:0009898,GO:0009966,GO:0009987,GO:0010646,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019897,GO:0019898,GO:0022402,GO:0022603,GO:0022607,GO:0023051,GO:0030145,GO:0030554,GO:0031234,GO:0032153,GO:0032506,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042173,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043937,GO:0043938,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045881,GO:0046677,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051094,GO:0051301,GO:0065007,GO:0070297,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090529,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902531 ko:K09811,ko:K09812 ko02010,map02010 M00256 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko03036 3.A.1.140 Bacteria 1MVQ4@1224,1RMZA@1236,3Z11A@583,COG2884@1,COG2884@2 NA|NA|NA D ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_00466 529507.PMI3605 3.6e-178 631.7 Proteus ftsY GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006605,GO:0006612,GO:0006613,GO:0006614,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042886,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045047,GO:0045184,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0070972,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072594,GO:0072599,GO:0072657,GO:0090150,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03110 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.2,3.A.5.7 Bacteria 1MUDU@1224,1RNIN@1236,3Z1XE@583,COG0552@1,COG0552@2,COG3064@1,COG3064@2 NA|NA|NA D Involved in targeting and insertion of nascent membrane proteins into the cytoplasmic membrane. Acts as a receptor for the complex formed by the signal recognition particle (SRP) and the ribosome-nascent chain (RNC). Interaction with SRP-RNC leads to the transfer of the RNC complex to the Sec translocase for insertion into the membrane, the hydrolysis of GTP by both Ffh and FtsY, and the dissociation of the SRP-FtsY complex into the individual components Z1_00467 529507.PMI3604 1.6e-108 398.7 Proteus rsmD GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008990,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0052913,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.171 ko:K08316 R07234 RC00003 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MXKW@1224,1RN21@1236,3Z1E2@583,COG0742@1,COG0742@2 NA|NA|NA H Specifically methylates the guanine in position 966 of 16S rRNA in the assembled 30S particle Z1_00468 529507.PMI3603 1.7e-47 194.9 Proteus yhhL ko:K08993 ko00000 Bacteria 1N00W@1224,1SA2V@1236,3Z32U@583,COG3776@1,COG3776@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1145) Z1_00469 529507.PMI3602 2.3e-63 248.1 Proteus yhhM Bacteria 1RDRA@1224,1S5XK@1236,2AHZY@1,318D9@2,3Z2Q1@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2500) Z1_00470 529507.PMI3601 6.1e-106 390.2 Proteus yhhN GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1PN0I@1224,1RNUV@1236,3Z259@583,COG3714@1,COG3714@2 NA|NA|NA S YhhN family Z1_00471 529507.PMI3600 0.0 1445.6 Proteus zntA GO:0000041,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005385,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006824,GO:0006829,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008551,GO:0009636,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010043,GO:0010312,GO:0015075,GO:0015086,GO:0015087,GO:0015094,GO:0015099,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015675,GO:0015691,GO:0015692,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016463,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0034220,GO:0035444,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046686,GO:0046873,GO:0046915,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070574,GO:0070838,GO:0071577,GO:0071944,GO:0072509,GO:0072511,GO:0090662,GO:0097501,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098754,GO:0099131,GO:0099132,GO:1990359 3.6.3.3,3.6.3.5 ko:K01534 ko00000,ko01000 3.A.3.6 iLF82_1304.LF82_3723,iNRG857_1313.NRG857_17200,iUMNK88_1353.UMNK88_4239,iYL1228.KPN_03835 Bacteria 1MU08@1224,1RN2C@1236,3Z216@583,COG2217@1,COG2217@2,COG2608@1,COG2608@2 NA|NA|NA P E1-E2 ATPase Z1_00472 529507.PMI3599 0.0 1966.8 Proteus mexB ko:K03296,ko:K18138 ko01501,ko01503,map01501,map01503 M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.6.2 Bacteria 1MU48@1224,1RMBN@1236,3Z1ZE@583,COG0841@1,COG0841@2 NA|NA|NA V AcrB/AcrD/AcrF family Z1_00473 529507.PMI3598 3.7e-210 737.3 Proteus mexA ko:K03585 ko01501,ko01503,map01501,map01503 M00646,M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000,ko03036 2.A.6.2,8.A.1.6 Bacteria 1MU78@1224,1RPI1@1236,3Z1WT@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion Z1_00474 529507.PMI3033 4.8e-224 783.5 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00475 529507.PMI3043 2.4e-74 284.6 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00476 529507.PMI3597 1.6e-41 174.9 Proteus tusA GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0003674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0019725,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042592,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048878,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090407,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K04085 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MZA5@1224,1S8TC@1236,3Z33N@583,COG0425@1,COG0425@2 NA|NA|NA J Sulfur carrier protein involved in sulfur trafficking in the cell. Part of a sulfur-relay system required for 2-thiolation during synthesis of 2-thiouridine of the modified wobble base 5- methylaminomethyl-2-thiouridine (mnm(5)s(2)U) in tRNA. Interacts with IscS and stimulates its cysteine desulfurase activity. Accepts an activated sulfur from IscS, which is then transferred to TusD, and thus determines the direction of sulfur flow from IscS to 2-thiouridine formation. Also appears to be involved in sulfur transfer for the biosynthesis of molybdopterin Z1_00477 529507.PMI3596 3e-119 434.5 Proteus yhhQ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008616,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009163,GO:0009987,GO:0016020,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042455,GO:0043094,GO:0043174,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0046116,GO:0046483,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072531,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659,GO:1990397 ko:K09125 ko00000 Bacteria 1MVQU@1224,1RNX0@1236,3Z11N@583,COG1738@1,COG1738@2 NA|NA|NA U Involved in the import of queuosine (Q) precursors, required for Q precursor salvage Z1_00478 529507.PMI3595 3.5e-205 720.7 Proteus gldA 1.1.1.6 ko:K00005 ko00561,ko00640,ko01100,map00561,map00640,map01100 R01034,R10715,R10717 RC00029,RC00117,RC00670 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWAE@1224,1RN9F@1236,3Z2CJ@583,COG0371@1,COG0371@2 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_00479 529507.PMI3594 2.2e-234 817.8 Proteus glpC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0022900,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046872,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071944 1.1.5.3 ko:K00113 ko00564,ko01110,map00564,map01110 R00848 RC00029 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWTK@1224,1RQ9M@1236,3Z21E@583,COG0247@1,COG0247@2 NA|NA|NA C anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C K00113 Z1_00480 529507.PMI3593 1.5e-247 861.7 Proteus glpB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004368,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006072,GO:0006091,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009061,GO:0009987,GO:0010181,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016901,GO:0019637,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046168,GO:0046434,GO:0048037,GO:0050662,GO:0052646,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575 1.1.5.3 ko:K00112 ko00564,ko01110,map00564,map01110 R00848 RC00029 ko00000,ko00001,ko01000 iB21_1397.B21_02127,iEC042_1314.EC042_2485,iECBD_1354.ECBD_1418,iECB_1328.ECB_02168,iECD_1391.ECD_02168,iECUMN_1333.ECUMN_2582,iEcHS_1320.EcHS_A2383,iUMNK88_1353.UMNK88_2792 Bacteria 1MU3K@1224,1RP77@1236,3Z1PH@583,COG3075@1,COG3075@2 NA|NA|NA C Conversion of glycerol 3-phosphate to dihydroxyacetone. Uses fumarate or nitrate as electron acceptor Z1_00481 529507.PMI3592 0.0 1102.8 Proteus glpA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004368,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006072,GO:0006091,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016901,GO:0019637,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046168,GO:0046434,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0052646,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575 1.1.5.3 ko:K00111 ko00564,ko01110,map00564,map01110 R00848 RC00029 ko00000,ko00001,ko01000 iSDY_1059.SDY_2436 Bacteria 1MUMY@1224,1RUEK@1236,3Z2EN@583,COG0578@1,COG0578@2 NA|NA|NA C Belongs to the FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase family Z1_00482 529507.PMI3591 2.8e-265 920.6 Proteus glpT GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006817,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008643,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015114,GO:0015144,GO:0015166,GO:0015168,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015301,GO:0015315,GO:0015318,GO:0015527,GO:0015698,GO:0015711,GO:0015748,GO:0015791,GO:0015793,GO:0015794,GO:0015850,GO:0016020,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034219,GO:0034220,GO:0035435,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:0099516,GO:1901264,GO:1901618 ko:K02445 ko00000,ko02000 2.A.1.4.3 iECH74115_1262.ECH74115_3377,iECIAI39_1322.ECIAI39_2383,iECSP_1301.ECSP_3115,iECs_1301.ECs3125,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2392,iG2583_1286.G2583_2780,iSFV_1184.SFV_2312,iZ_1308.Z3498 Bacteria 1MX4V@1224,1RMB3@1236,3Z1IJ@583,COG2271@1,COG2271@2 NA|NA|NA G Major Facilitator Superfamily Z1_00483 529507.PMI3590 6.6e-209 733.0 Proteus glpQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008081,GO:0008889,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042578,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044462,GO:0044464,GO:0046872,GO:0071944 3.1.4.46 ko:K01126 ko00564,map00564 R01030,R01470 RC00017,RC00425 ko00000,ko00001,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_2331,iECSF_1327.ECSF_2119 Bacteria 1MVWZ@1224,1RRBP@1236,3Z2HG@583,COG0584@1,COG0584@2 NA|NA|NA C Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family Z1_00484 529507.PMI3589 7.3e-183 646.4 Proteus epmA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006430,GO:0006464,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016755,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0036211,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0052868,GO:0071704,GO:0071915,GO:0072580,GO:0072581,GO:0090304,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K04568 ko00000,ko01000,ko03012 Bacteria 1MU97@1224,1RMR9@1236,3Z1EU@583,COG2269@1,COG2269@2 NA|NA|NA J With EpmB is involved in the beta-lysylation step of the post-translational modification of translation elongation factor P (EF-P). Catalyzes the ATP-dependent activation of (R)-beta-lysine produced by EpmB, forming a lysyl-adenylate, from which the beta- lysyl moiety is then transferred to the epsilon-amino group of a conserved specific lysine residue in EF-P Z1_00485 529507.PMI3588 0.0 1207.6 Proteus frdA GO:0000104,GO:0000166,GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0022607,GO:0022900,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032991,GO:0033554,GO:0036094,GO:0040011,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045283,GO:0045284,GO:0045333,GO:0048037,GO:0048870,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051674,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0070925,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071949,GO:0071973,GO:0097159,GO:0097588,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901265,GO:1901363 1.3.5.1,1.3.5.4 ko:K00239,ko:K00244 ko00020,ko00190,ko00620,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko02020,ko05134,map00020,map00190,map00620,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map02020,map05134 M00009,M00011,M00149,M00150,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_4621,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4625,iNJ661.Rv1552,iPC815.YPO0360 Bacteria 1MU5M@1224,1RMU2@1236,3Z177@583,COG1053@1,COG1053@2 NA|NA|NA C Fumarate reductase flavoprotein C-term Z1_00486 529507.PMI3587 3.6e-142 510.8 Proteus frdB GO:0000104,GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006928,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0022607,GO:0022900,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032991,GO:0040011,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045283,GO:0045284,GO:0045333,GO:0048037,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051538,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051674,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0070925,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071973,GO:0097588,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803 1.3.5.1,1.3.5.4 ko:K00240,ko:K00245 ko00020,ko00190,ko00620,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko02020,map00020,map00190,map00620,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map02020 M00009,M00011,M00149,M00150,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iNJ661.Rv1553,iPC815.YPO0359,iSDY_1059.SDY_4397 Bacteria 1MVHS@1224,1RNWR@1236,3Z2GW@583,COG0479@1,COG0479@2 NA|NA|NA C Belongs to the succinate dehydrogenase fumarate reductase iron-sulfur protein family Z1_00487 529507.PMI3586 9.2e-68 262.7 Proteus frdC GO:0000104,GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006928,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008177,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016635,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032991,GO:0040011,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045283,GO:0045284,GO:0045333,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0070925,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071973,GO:0097588,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803 ko:K00246 ko00020,ko00190,ko00620,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko02020,map00020,map00190,map00620,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map02020 M00009,M00011,M00150,M00173 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002 iYL1228.KPN_04551 Bacteria 1RD34@1224,1S419@1236,3Z2KT@583,COG3029@1,COG3029@2 NA|NA|NA C Seems to be involved in the anchoring of the catalytic components of the fumarate reductase complex to the cytoplasmic membrane Z1_00488 529507.PMI3585 9.9e-61 239.2 Proteus frdD GO:0000104,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006113,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008177,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016635,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045283,GO:0045284,GO:0045333,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803 ko:K00247 ko00020,ko00190,ko00620,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko02020,map00020,map00190,map00620,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map02020 M00009,M00011,M00150,M00173 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002 iNJ661.Rv1555,iPC815.YPO0357,ic_1306.c5239 Bacteria 1RDZD@1224,1S3W5@1236,3Z2Q5@583,COG3080@1,COG3080@2 NA|NA|NA C Seems to be involved in the anchoring of the catalytic components of the fumarate reductase complex to the cytoplasmic membrane Z1_00489 529507.PMI3584 1.9e-47 194.9 Proteus sugE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046618,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K11741 ko00000,ko02000 2.A.7.1 Bacteria 1MZ6P@1224,1S8TD@1236,3Z2W6@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA U Small Multidrug Resistance protein Z1_00490 529507.PMI3583 7.3e-46 189.5 Proteus hypC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0010467,GO:0019538,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044238,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564,GO:1902670 ko:K04653 ko00000 Bacteria 1RGXH@1224,1S96I@1236,3Z2VU@583,COG0298@1,COG0298@2 NA|NA|NA O HupF/HypC family Z1_00491 529507.PMI3582 8e-60 236.1 Proteus hypA ko:K04651 ko00000,ko03110 Bacteria 1MZJH@1224,1S5WG@1236,3Z2S8@583,COG0375@1,COG0375@2 NA|NA|NA C Probably plays a role in a hydrogenase nickel cofactor insertion step Z1_00492 529507.PMI3581 5.4e-106 390.2 Proteus hydN ko:K05796,ko:K12136 ko00000,ko01000 Bacteria 1PENN@1224,1RS57@1236,3Z13F@583,COG1142@1,COG1142@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_00493 529507.PMI3580 5.1e-298 1029.6 Proteus fhlA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2000142,GO:2001141 ko:K02584,ko:K12146,ko:K12266,ko:K15836,ko:K21009 ko02020,ko02025,ko05132,map02020,map02025,map05132 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1QTT3@1224,1T1G7@1236,3Z0V5@583,COG2203@1,COG2203@2,COG3604@1,COG3604@2 NA|NA|NA KT Domain present in phytochromes and cGMP-specific phosphodiesterases. Z1_00494 529507.PMI3579 5.1e-167 593.6 Proteus Bacteria 1RGKN@1224,1S56H@1236,3Z2K0@583,COG4340@1,COG4340@2 NA|NA|NA S 2OG-Fe dioxygenase Z1_00495 529507.PMI3577 0.0 1140.6 Proteus fdhF GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015942,GO:0015944,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0030151,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071704 1.17.1.10,1.17.1.9,1.17.99.7 ko:K00123,ko:K05299,ko:K22015 ko00630,ko00680,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map00720,map01100,map01120,map01200 M00377 R00134,R00519 RC02796 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECBD_1354.ECBD_3953,iHN637.CLJU_c06990 Bacteria 1QTZB@1224,1T1JA@1236,3Z1T7@583,COG3383@1,COG3383@2 NA|NA|NA C formate dehydrogenase Z1_00496 529507.PMI3577 3.7e-75 287.3 Proteus fdhF GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015942,GO:0015944,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0030151,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071704 1.17.1.10,1.17.1.9,1.17.99.7 ko:K00123,ko:K05299,ko:K22015 ko00630,ko00680,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map00720,map01100,map01120,map01200 M00377 R00134,R00519 RC02796 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECBD_1354.ECBD_3953,iHN637.CLJU_c06990 Bacteria 1QTZB@1224,1T1JA@1236,3Z1T7@583,COG3383@1,COG3383@2 NA|NA|NA C formate dehydrogenase Z1_00497 529507.PMI3576 0.0 1116.7 Proteus eptB 2.7.8.42,2.7.8.43 ko:K03760,ko:K12975 ko00540,ko01503,map00540,map01503 M00722,M00723 R11204,R11205,R11555,R11556,R11557 RC00002,RC00017,RC00428 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1MWS7@1224,1RMNG@1236,3Z1K6@583,COG2194@1,COG2194@2 NA|NA|NA S membrane-associated metal-dependent hydrolase Z1_00498 529507.PMI3575 2.4e-220 771.2 Proteus lctO ko:K10530 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUEZ@1224,1RPA1@1236,3Z23F@583,COG1304@1,COG1304@2 NA|NA|NA C FMN-dependent dehydrogenase Z1_00499 529507.PMI3574 5.9e-123 446.8 Proteus narI GO:0001666,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008940,GO:0009055,GO:0009061,GO:0009325,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016661,GO:0019645,GO:0020037,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0036293,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044799,GO:0045333,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050896,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0070482,GO:0071944,GO:0097159,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901363,GO:1902494,GO:1990204 1.7.5.1 ko:K00370,ko:K00374,ko:K02575 ko00910,ko01120,ko02020,map00910,map01120,map02020 M00529,M00530,M00615,M00804 R00798,R01106,R09497 RC02812 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 2.A.1.8,5.A.3.1 iNJ661.Rv1164,iSF_1195.SF1230 Bacteria 1MXGZ@1224,1RPTD@1236,3Z2FI@583,COG2181@1,COG2181@2 NA|NA|NA C Nitrate reductase gamma subunit Z1_00500 529507.PMI3573 2.9e-128 464.5 Proteus narJ GO:0001666,GO:0003674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016530,GO:0022607,GO:0034622,GO:0036293,GO:0042126,GO:0042128,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051131,GO:0065003,GO:0070482,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071941,GO:0140104,GO:2001057 1.7.5.1 ko:K00370,ko:K00373,ko:K17052 ko00910,ko01120,ko02020,map00910,map01120,map02020 M00529,M00530,M00804 R00798,R01106,R09497 RC02812 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 5.A.3.1,5.A.3.8 iE2348C_1286.E2348C_1350,iECABU_c1320.ECABU_c15020,iECO103_1326.ECO103_1331,iECO111_1330.ECO111_1557,iLF82_1304.LF82_1462,iNRG857_1313.NRG857_06280,iYO844.BSU37260,ic_1306.c1687 Bacteria 1MY4E@1224,1RQ23@1236,3Z11Q@583,COG2180@1,COG2180@2 NA|NA|NA C nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone Z1_00501 529507.PMI3572 0.0 1078.2 Proteus narH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008940,GO:0009055,GO:0009061,GO:0009325,GO:0009898,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016661,GO:0022900,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031235,GO:0032991,GO:0042126,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044799,GO:0045333,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051538,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098562,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204,GO:2001057 1.7.5.1 ko:K00371 ko00910,ko01120,ko02020,map00910,map01120,map02020 M00529,M00530,M00804 R00798,R01106,R09497 RC02812 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 5.A.3.1 iAF987.Gmet_1021,iEcE24377_1341.EcE24377A_1376 Bacteria 1MW9Q@1224,1RNMJ@1236,3Z1YB@583,COG1140@1,COG1140@2 NA|NA|NA C respiratory nitrate reductase 1 beta chain K00371 Z1_00502 529507.PMI3571 0.0 2613.6 Proteus narG GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 1.7.5.1 ko:K00370,ko:K17050 ko00910,ko01120,ko02020,map00910,map01120,map02020 M00529,M00530,M00804 R00798,R01106,R09497 RC02812 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 5.A.3.1,5.A.3.8 Bacteria 1MW9S@1224,1RQ27@1236,3Z174@583,COG5013@1,COG5013@2 NA|NA|NA C respiratory nitrate reductase 1 alpha chain K00370 Z1_00503 529507.PMI3570 8.1e-260 902.5 Proteus narK ko:K02575 ko00910,map00910 M00615 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.1.8 Bacteria 1MU27@1224,1RMUK@1236,3Z158@583,COG2223@1,COG2223@2 NA|NA|NA P nitrate nitrite transporter Z1_00504 529507.PMI3569 0.0 1130.2 Proteus narX GO:0000155,GO:0000160,GO:0001101,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0004721,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010167,GO:0016020,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016311,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0033554,GO:0035556,GO:0036211,GO:0042221,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044464,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071229,GO:0071241,GO:0071249,GO:0071250,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080033,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902170 2.7.13.3 ko:K07673,ko:K07674 ko02020,map02020 M00471,M00472 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1MWZT@1224,1RNPP@1236,3Z1PJ@583,COG3850@1,COG3850@2 NA|NA|NA T Histidine kinase Z1_00505 529507.PMI3568 3e-111 407.9 Proteus narL GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032991,GO:0032993,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0062012,GO:0065007,GO:0080090,GO:0090352,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903314,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K07684 ko02020,map02020 M00471 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1NQH7@1224,1RNXI@1236,3Z2FE@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_00506 529507.PMI3567 1e-162 579.3 Proteus ko:K10972 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVGZ@1224,1RRFH@1236,3Z0VB@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00507 529507.PMI3566 2.3e-75 288.1 Proteus Bacteria 1RHF1@1224,1S411@1236,3Z2MW@583,COG4125@1,COG4125@2 NA|NA|NA S Chlorhexidine efflux transporter Z1_00508 529507.PMI3565 1.6e-35 154.8 Proteus Bacteria 1QG64@1224,1TDIZ@1236,2BTU4@1,32P1U@2,3Z32P@583 NA|NA|NA Z1_00509 529507.PMI3560 2.6e-130 471.5 Proteus ko:K07090 ko00000 Bacteria 1R7DA@1224,1RUND@1236,3Z3AW@583,COG0730@1,COG0730@2 NA|NA|NA S Sulfite exporter TauE/SafE Z1_00510 529507.PMI3559 0.0 1136.7 Proteus bccA 6.3.4.14,6.4.1.2,6.4.1.3 ko:K11263 ko00061,ko00280,ko00620,ko00630,ko00640,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00280,map00620,map00630,map00640,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00741 R00742,R01859,R04385 RC00040,RC00097,RC00253,RC00367,RC00609 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1P6RE@1224,1RSJH@1236,3Z3D8@583,COG4770@1,COG4770@2 NA|NA|NA I carboxylase Z1_00511 529507.PMI3558 7.2e-297 1025.8 Proteus ybgK Bacteria 1MU9H@1224,1RR39@1236,3Z297@583,COG1984@1,COG1984@2,COG2049@1,COG2049@2 NA|NA|NA E Allophanate hydrolase subunit 2 Z1_00513 529507.PMI3557 6.8e-139 500.0 Proteus ybgL ko:K07160 ko00000 Bacteria 1MUYV@1224,1RSCZ@1236,3Z13Z@583,COG1540@1,COG1540@2 NA|NA|NA S LamB/YcsF family Z1_00514 529507.PMI3556 6.2e-219 766.5 Proteus ycsG Bacteria 1P45T@1224,1RPT0@1236,3Z1NC@583,COG1914@1,COG1914@2 NA|NA|NA P Natural resistance-associated macrophage protein Z1_00515 529507.PMI3555 3.5e-120 437.6 Proteus Bacteria 1Q2IV@1224,1S05M@1236,3Z209@583,COG1802@1,COG1802@2 NA|NA|NA K FCD Z1_00520 529507.PMI3554 1.3e-96 359.0 Proteus hemG GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004729,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016634,GO:0016635,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032553,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042168,GO:0042440,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0070818,GO:0070819,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.3.5.3 ko:K00230 ko00860,ko01100,ko01110,map00860,map01100,map01110 M00121 R09489 RC00885 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b3850,iAF987.Gmet_2953,iAPECO1_1312.APECO1_2607,iB21_1397.B21_03690,iBWG_1329.BWG_3526,iE2348C_1286.E2348C_4162,iECABU_c1320.ECABU_c43520,iECBD_1354.ECBD_4175,iECB_1328.ECB_03741,iECDH10B_1368.ECDH10B_4039,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3727,iECD_1391.ECD_03741,iECED1_1282.ECED1_4552,iECH74115_1262.ECH74115_5289,iECIAI1_1343.ECIAI1_4043,iECNA114_1301.ECNA114_4159,iECOK1_1307.ECOK1_4319,iECS88_1305.ECS88_4298,iECSF_1327.ECSF_3707,iECSP_1301.ECSP_4903,iECs_1301.ECs4778,iEcDH1_1363.EcDH1_4131,iEcHS_1320.EcHS_A4073,iEcolC_1368.EcolC_4160,iG2583_1286.G2583_4648,iJO1366.b3850,iJR904.b3850,iLF82_1304.LF82_0981,iNRG857_1313.NRG857_19220,iSDY_1059.SDY_3895,iUMN146_1321.UM146_19505,iUMNK88_1353.UMNK88_4678,iUTI89_1310.UTI89_C4435,iY75_1357.Y75_RS17835,iZ_1308.Z5372,ic_1306.c4797 Bacteria 1RAH2@1224,1S372@1236,3Z390@583,COG4635@1,COG4635@2 NA|NA|NA CH Flavodoxin domain Z1_00521 529507.PMI3553 6.2e-271 939.5 Proteus trkH GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005261,GO:0005267,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015079,GO:0015267,GO:0015318,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022803,GO:0022838,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0030955,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031420,GO:0034220,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046983,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K03498,ko:K03499 ko00000,ko02000 2.A.38.1,2.A.38.4 iPC815.YPO3762,iSFV_1184.SFV_3651 Bacteria 1MUIJ@1224,1RMN6@1236,3Z1TJ@583,COG0168@1,COG0168@2 NA|NA|NA P Low-affinity potassium transport system. Interacts with Trk system potassium uptake protein TrkA Z1_00522 529507.PMI3552 1.8e-110 405.2 Proteus yigZ 2.1.1.45,3.4.13.9 ko:K00560,ko:K01271 ko00240,ko00670,ko01100,ko01523,map00240,map00670,map01100,map01523 M00053 R02101 RC00219,RC00332 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002 Bacteria 1NFJC@1224,1RPBF@1236,3Z23U@583,COG1739@1,COG1739@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1949) Z1_00523 529507.PMI3551 1.9e-266 924.5 Proteus pepQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008235,GO:0008237,GO:0008238,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016805,GO:0019538,GO:0030145,GO:0034641,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070011,GO:0070573,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.4.11.9,3.4.13.9 ko:K01262,ko:K01271 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MURT@1224,1RMKT@1236,3Z0ZH@583,COG0006@1,COG0006@2 NA|NA|NA E Splits dipeptides with a prolyl residue in the C- terminal position Z1_00524 529507.PMI3550 0.0 1416.4 Proteus fadB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003857,GO:0004165,GO:0004300,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008692,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016856,GO:0016860,GO:0016863,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 1.1.1.35,4.2.1.17,5.1.2.3,5.3.3.8 ko:K01782,ko:K01825 ko00071,ko00280,ko00281,ko00310,ko00362,ko00380,ko00410,ko00640,ko00650,ko00903,ko00930,ko01040,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00071,map00280,map00281,map00310,map00362,map00380,map00410,map00640,map00650,map00903,map00930,map01040,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00032,M00087 R01975,R03026,R03045,R03276,R04137,R04170,R04203,R04204,R04224,R04737,R04738,R04739,R04740,R04741,R04744,R04745,R04746,R04748,R04749,R04756,R05066,R05305,R06411,R06412,R06941,R06942,R07935,R07951,R08093,R08094 RC00029,RC00099,RC00117,RC00241,RC00525,RC00831,RC00834,RC00896,RC01078,RC01086,RC01095,RC01098,RC01103,RC01217,RC02115 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iLF82_1304.LF82_0614,iNRG857_1313.NRG857_19200 Bacteria 1MU9P@1224,1RMZ8@1236,3Z17T@583,COG1024@1,COG1024@2,COG1250@1,COG1250@2 NA|NA|NA I Involved in the aerobic and anaerobic degradation of long-chain fatty acids via beta-oxidation cycle. Catalyzes the formation of 3-oxoacyl-CoA from enoyl-CoA via L-3-hydroxyacyl-CoA. It can also use D-3-hydroxyacyl-CoA and cis-3-enoyl-CoA as substrate Z1_00525 529507.PMI3549 2.1e-216 758.1 Proteus fadA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003988,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016408,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 2.3.1.16 ko:K00632 ko00071,ko00280,ko00281,ko00362,ko00592,ko00642,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01212,map00071,map00280,map00281,map00362,map00592,map00642,map01100,map01110,map01120,map01130,map01212 M00087,M00113 R00829,R00927,R01177,R03778,R03858,R03991,R04546,R04742,R04747,R05506,R05586,R07891,R07895,R07899,R08091,R08095 RC00004,RC00326,RC00405,RC01702,RC02728,RC02898,RC02955 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2612,iECNA114_1301.ECNA114_4154,iECOK1_1307.ECOK1_4314,iECP_1309.ECP_4058,iECS88_1305.ECS88_4293,iECSF_1327.ECSF_3702,iEcE24377_1341.EcE24377A_4364,iLF82_1304.LF82_0613,iNRG857_1313.NRG857_19195,iPC815.YPO3767 Bacteria 1MU5G@1224,1RM93@1236,3Z1XQ@583,COG0183@1,COG0183@2 NA|NA|NA I Catalyzes the final step of fatty acid oxidation in which acetyl-CoA is released and the CoA ester of a fatty acid two carbons shorter is formed Z1_00526 529507.PMI3547 1.4e-130 472.2 Proteus fre GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0019538,GO:0030091,GO:0030234,GO:0042602,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050790,GO:0050896,GO:0052875,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0098772,GO:1901564 1.16.1.3,1.17.1.1,1.5.1.41 ko:K00523,ko:K02823,ko:K05368,ko:K18248,ko:K20256 ko00240,ko00520,ko00627,ko00740,ko00860,ko01100,ko01120,ko02024,map00240,map00520,map00627,map00740,map00860,map01100,map01120,map02024 M00637 R00097,R00823,R00825,R03391,R03392,R05705 RC00126,RC00192,RC00220,RC00230 br01602,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSF_1195.SF3920,iSFxv_1172.SFxv_4273,iS_1188.S3832 Bacteria 1MV72@1224,1RPH5@1236,3Z2VK@583,COG0543@1,COG0543@2 NA|NA|NA C COG0543 2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductases Z1_00527 529507.PMI3546 4.1e-294 1016.5 Proteus ubiD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008694,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.1.1.61,4.1.1.98 ko:K03182,ko:K16239 ko00130,ko00627,ko01100,ko01110,ko01120,map00130,map00627,map01100,map01110,map01120 M00117 R01238,R04985,R04986 RC00391 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO111_1330.ECO111_4669,iIT341.HP0396 Bacteria 1MU62@1224,1RNH8@1236,3Z17G@583,COG0043@1,COG0043@2 NA|NA|NA H Belongs to the UbiD family Z1_00528 529507.PMI3545 2.6e-137 494.6 Proteus pepE 3.4.13.21 ko:K05995 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1NBN5@1224,1RYUM@1236,3Z1WR@583,COG3340@1,COG3340@2 NA|NA|NA E Peptidase family S51 Z1_00529 529507.PMI3542 3.7e-90 337.4 Proteus rfaH GO:0001000,GO:0001073,GO:0001121,GO:0001124,GO:0003674,GO:0003676,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006354,GO:0006355,GO:0006417,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008494,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019899,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032774,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043175,GO:0043244,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045182,GO:0045727,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090079,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K02601,ko:K05785 ko00000,ko03000,ko03009,ko03021 Bacteria 1N01W@1224,1S91B@1236,3Z3AV@583,COG0250@1,COG0250@2 NA|NA|NA K Enhances distal genes transcription elongation in a specialized subset of operons that encode extracytoplasmic components. RfaH is recruited into a multi-component RNA polymerase complex by the ops element, which is a short conserved DNA sequence located downstream of the main promoter of these operons. Once bound, RfaH suppresses pausing and inhibits Rho- dependent and intrinsic termination at a subset of sites. Termination signals are bypassed, which allows complete synthesis of long RNA chains Z1_00530 529507.PMI3541 2.3e-134 485.0 Proteus tatC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008320,GO:0008565,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009977,GO:0015031,GO:0015291,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015450,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033281,GO:0034613,GO:0042802,GO:0042886,GO:0042887,GO:0043953,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046907,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0065002,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:1904680 ko:K03118 ko03060,ko03070,map03060,map03070 M00336 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 2.A.64 Bacteria 1MVAY@1224,1RPRN@1236,3Z22K@583,COG0805@1,COG0805@2 NA|NA|NA U Part of the twin-arginine translocation (Tat) system that transports large folded proteins containing a characteristic twin-arginine motif in their signal peptide across membranes. Together with TatB, TatC is part of a receptor directly interacting with Tat signal peptides Z1_00531 529507.PMI3540 2.3e-82 311.6 Proteus tatB ko:K03116,ko:K03117 ko03060,ko03070,map03060,map03070 M00336 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 2.A.64 Bacteria 1N73F@1224,1SD9K@1236,3Z12H@583,COG1826@1,COG1826@2 NA|NA|NA U Part of the twin-arginine translocation (Tat) system that transports large folded proteins containing a characteristic twin-arginine motif in their signal peptide across membranes. Together with TatC, TatB is part of a receptor directly interacting with Tat signal peptides. TatB may form an oligomeric binding site that transiently accommodates folded Tat precursor proteins before their translocation Z1_00532 529507.PMI3539 1.6e-36 158.3 Proteus tatA ko:K03116 ko03060,ko03070,map03060,map03070 M00336 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 2.A.64 Bacteria 1N6S4@1224,1SCC7@1236,3Z30S@583,COG1826@1,COG1826@2 NA|NA|NA U Part of the twin-arginine translocation (Tat) system that transports large folded proteins containing a characteristic twin-arginine motif in their signal peptide across membranes. TatA could form the protein-conducting channel of the Tat system Z1_00533 529507.PMI3538 0.0 1097.4 Proteus ubiB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016020,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 ko:K03688 ko00000 iYL1228.KPN_04331 Bacteria 1MU1Z@1224,1RNQM@1236,3Z2HQ@583,COG0661@1,COG0661@2 NA|NA|NA H Is probably a protein kinase regulator of UbiI activity which is involved in aerobic coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis Z1_00534 529507.PMI3537 3.1e-113 414.5 Proteus yigP GO:0006082,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0019752,GO:0032150,GO:0042180,GO:0042181,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046417,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 ko:K03690 ko00000 Bacteria 1RCK6@1224,1S2WQ@1236,3Z129@583,COG3165@1,COG3165@2 NA|NA|NA S SCP-2 sterol transfer family Z1_00535 34506.g643 1.7e-139 501.9 Rhabditida Nematoda 1M0QM@119089,3AG1W@33154,3BYBM@33208,3DE85@33213,40R1E@6231,4173S@6236,COG2226@1,KOG1540@2759 NA|NA|NA H Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT) Z1_00536 529507.PMI3535 2.1e-241 841.3 Proteus rmuC GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 ko:K09760 ko00000 Bacteria 1MWHV@1224,1RMB8@1236,3Z0W9@583,COG1322@1,COG1322@2 NA|NA|NA S RmuC family Z1_00537 529507.PMI3534 5.1e-98 363.6 Proteus dedA 3.6.1.27 ko:K03975,ko:K19302 ko00550,map00550 R05627 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 Bacteria 1R0F3@1224,1RPDS@1236,3Z2ID@583,COG0586@1,COG0586@2 NA|NA|NA S SNARE associated Golgi protein Z1_00538 529507.PMI3533 3.2e-144 517.7 Proteus 3.1.3.48 ko:K01104 ko00000,ko01000 Bacteria 1R4XF@1224,1RMPM@1236,3Z25N@583,COG2365@1,COG2365@2 NA|NA|NA T Tyrosine phosphatase family Z1_00539 529507.PMI3532 3e-139 501.1 Proteus udp GO:0003674,GO:0003824,GO:0004850,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006218,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009164,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0019439,GO:0022607,GO:0030955,GO:0031420,GO:0033554,GO:0034214,GO:0034641,GO:0034655,GO:0034656,GO:0042454,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046108,GO:0046131,GO:0046133,GO:0046135,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051716,GO:0055086,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901657,GO:1901658 2.4.2.3 ko:K00757 ko00240,ko00983,ko01100,map00240,map00983,map01100 R01876,R02484,R08229 RC00063 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2630,iB21_1397.B21_03667,iECABU_c1320.ECABU_c43290,iECBD_1354.ECBD_4198,iECB_1328.ECB_03718,iECD_1391.ECD_03718,iECNA114_1301.ECNA114_4136,iECOK1_1307.ECOK1_4296,iECP_1309.ECP_4040,iECS88_1305.ECS88_4275,iECSF_1327.ECSF_3683,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4208,iLF82_1304.LF82_2357,iNRG857_1313.NRG857_19105,iUMN146_1321.UM146_19385,iUMNK88_1353.UMNK88_4655 Bacteria 1P0EC@1224,1RN3N@1236,3Z1AB@583,COG2820@1,COG2820@2 NA|NA|NA F Catalyzes the reversible phosphorylytic cleavage of uridine and deoxyuridine to uracil and ribose- or deoxyribose-1- phosphate. The produced molecules are then utilized as carbon and energy sources or in the rescue of pyrimidine bases for nucleotide synthesis Z1_00540 529507.PMI3531 1.6e-64 251.9 Proteus yidB Bacteria 1N7FF@1224,1S9KM@1236,3Z2QG@583,COG3753@1,COG3753@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF937) Z1_00541 529507.PMI3530 8.6e-145 519.6 Proteus Bacteria 1RBEF@1224,1SKF1@1236,28SK3@1,2ZEWE@2,3Z239@583 NA|NA|NA Z1_00542 529507.PMI3529 0.0 1540.8 Proteus metE GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003871,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006520,GO:0006555,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008172,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008652,GO:0008705,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009086,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019538,GO:0019752,GO:0030312,GO:0032259,GO:0034641,GO:0035999,GO:0036211,GO:0040007,GO:0042084,GO:0042085,GO:0042558,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0050667,GO:0051186,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.1.1.14 ko:K00549 ko00270,ko00450,ko01100,ko01110,ko01230,map00270,map00450,map01100,map01110,map01230 M00017 R04405,R09365 RC00035,RC00113,RC01241 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_4130,iECO103_1326.ECO103_4334,iECO111_1330.ECO111_4657,iECO26_1355.ECO26_4756,iECW_1372.ECW_m4131,iEKO11_1354.EKO11_4528,iPC815.YPO3788,iWFL_1372.ECW_m4131 Bacteria 1MUI9@1224,1RMBA@1236,3Z1TA@583,COG0620@1,COG0620@2 NA|NA|NA E Catalyzes the transfer of a methyl group from 5- methyltetrahydrofolate to homocysteine resulting in methionine formation Z1_00543 529507.PMI3528 1.4e-183 648.7 Proteus metR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016597,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031406,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03576 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUIX@1224,1RRF3@1236,3Z2H5@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00544 529507.PMI3527 1.1e-164 585.9 Proteus yigM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MWMC@1224,1RQST@1236,3Z28F@583,COG0697@1,COG0697@2 NA|NA|NA EG EamA-like transporter family Z1_00545 529507.PMI3526 4.1e-287 993.4 Proteus yjcE GO:0003674,GO:0005215,GO:0005451,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0006814,GO:0006873,GO:0006885,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015079,GO:0015081,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015299,GO:0015318,GO:0015385,GO:0015386,GO:0015491,GO:0015672,GO:0016020,GO:0019725,GO:0022804,GO:0022821,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030641,GO:0034220,GO:0035725,GO:0042592,GO:0044464,GO:0046873,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051453,GO:0055067,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098659,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098719,GO:0098739,GO:0098771,GO:0099516,GO:0099587,GO:1902600 ko:K03316 ko00000 2.A.36 Bacteria 1MW5T@1224,1RPH6@1236,3Z12T@583,COG0025@1,COG0025@2 NA|NA|NA P NhaP-type Na H and K H antiporters Z1_00546 529507.PMI3525 3.6e-93 347.4 Proteus speG_2 ko:K03825 ko00000,ko01000 Bacteria 1QTY5@1224,1S6M9@1236,3Z24D@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_00547 529507.PMI3524 1.3e-235 822.0 Proteus pbuG ko:K06901 ko00000,ko02000 2.A.1.40 Bacteria 1MUV0@1224,1RMBE@1236,3Z1SI@583,COG2252@1,COG2252@2 NA|NA|NA S Permease family Z1_00548 529507.PMI3523 2e-206 724.9 Proteus yfkF Bacteria 1R8UR@1224,1T1TJ@1236,3Z23J@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_00549 529507.PMI3522 1.6e-105 388.7 Proteus Bacteria 1RAFM@1224,1S2CX@1236,3Z2E8@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_00550 34506.g1024 9.8e-158 562.8 Chromadorea Nematoda 1KXQQ@119089,38DVB@33154,3BAWZ@33208,3CRI5@33213,40CRN@6231,COG1230@1,KOG1484@2759 NA|NA|NA P Cation efflux family Z1_00551 529507.PMI3520 7.9e-45 186.0 Proteus ilvN GO:0003674,GO:0003824,GO:0003984,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005948,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006549,GO:0006573,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009097,GO:0009099,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016744,GO:0019752,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494,GO:1990234 2.2.1.6 ko:K01653 ko00290,ko00650,ko00660,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00650,map00660,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R00006,R00014,R00226,R03050,R04672,R04673,R08648 RC00027,RC00106,RC01192,RC02744,RC02893 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b3670,iAPECO1_1312.APECO1_2782,iB21_1397.B21_03496,iBWG_1329.BWG_3361,iE2348C_1286.E2348C_3985,iEC042_1314.EC042_4025,iECABU_c1320.ECABU_c41570,iECBD_1354.ECBD_0033,iECB_1328.ECB_03554,iECDH10B_1368.ECDH10B_3853,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3555,iECD_1391.ECD_03554,iECED1_1282.ECED1_4366,iECH74115_1262.ECH74115_5103,iECIAI1_1343.ECIAI1_3846,iECIAI39_1322.ECIAI39_4272,iECNA114_1301.ECNA114_3825,iECO111_1330.ECO111_4494,iECO26_1355.ECO26_4913,iECOK1_1307.ECOK1_4123,iECP_1309.ECP_3877,iECS88_1305.ECS88_4095,iECSE_1348.ECSE_3954,iECSF_1327.ECSF_3518,iECSP_1301.ECSP_4721,iECUMN_1333.ECUMN_4201,iECW_1372.ECW_m3968,iECs_1301.ECs4611,iEKO11_1354.EKO11_0033,iETEC_1333.ETEC_3964,iEcDH1_1363.EcDH1_0033,iEcE24377_1341.EcE24377A_4179,iEcHS_1320.EcHS_A3883,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4037,iEcolC_1368.EcolC_0029,iG2583_1286.G2583_4464,iJO1366.b3670,iJR904.b3670,iLF82_1304.LF82_1110,iNRG857_1313.NRG857_18305,iPC815.YPO2294,iSFV_1184.SFV_3839,iSF_1195.SF3791,iSFxv_1172.SFxv_4123,iSSON_1240.SSON_3624,iS_1188.S3977,iUMN146_1321.UM146_18560,iUMNK88_1353.UMNK88_4479,iUTI89_1310.UTI89_C4226,iWFL_1372.ECW_m3968,iY75_1357.Y75_RS18770,iYL1228.KPN_04073,iZ_1308.Z5164,ic_1306.c4595 Bacteria 1N065@1224,1S73I@1236,3Z2UH@583,COG0440@1,COG0440@2 NA|NA|NA H ACT domain Z1_00552 529507.PMI3519 0.0 1114.4 Proteus ilvB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003984,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005948,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006549,GO:0006573,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009097,GO:0009099,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016744,GO:0019752,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494,GO:1990234 2.2.1.6 ko:K01652 ko00290,ko00650,ko00660,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00650,map00660,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R00006,R00014,R00226,R03050,R04672,R04673,R08648 RC00027,RC00106,RC01192,RC02744,RC02893 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSDY_1059.SDY_4155 Bacteria 1MU6U@1224,1RMQQ@1236,3Z1PY@583,COG0028@1,COG0028@2 NA|NA|NA H subunit K01652 Z1_00554 529507.PMI3517 4.9e-129 467.2 Proteus ko:K07090 ko00000 Bacteria 1R7DA@1224,1RUND@1236,3Z27G@583,COG0730@1,COG0730@2 NA|NA|NA S Sulfite exporter TauE/SafE Z1_00555 529507.PMI3516 2.7e-149 534.6 Proteus ko:K15835,ko:K19337 ko00000,ko03000 Bacteria 1R4YJ@1224,1S0N7@1236,3Z2F0@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain, rpiR family Z1_00556 529507.PMI3515 2.4e-248 864.4 Proteus ybbF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009401,GO:0015144,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034219,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0090563,GO:0090588 2.7.1.193,2.7.1.199,2.7.1.201,2.7.1.208,2.7.1.211 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02778,ko:K02779,ko:K02790,ko:K02791,ko:K02802,ko:K02803,ko:K02804,ko:K02809,ko:K02810,ko:K02818,ko:K02819 ko00010,ko00500,ko00520,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02060,map05111 M00265,M00266,M00267,M00269,M00270,M00271 R00811,R02738,R02780,R04111,R05199 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.1.15,4.A.1.1.2,4.A.1.1.3,4.A.1.1.5,4.A.1.1.7,4.A.1.2.1,4.A.1.2.10,4.A.1.2.11,4.A.1.2.12,4.A.1.2.13,4.A.1.2.2,4.A.1.2.4,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6,4.A.1.2.8,4.A.1.2.9 Bacteria 1N3C1@1224,1RQMX@1236,3Z1CG@583,COG1263@1,COG1263@2,COG1264@1,COG1264@2 NA|NA|NA G Phosphotransferase system, EIIC Z1_00557 34506.g1026 3.3e-161 574.3 Eukaryota GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0019200,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046835,GO:0071704 2.7.1.15 ko:K00852 ko00030,map00030 R01051,R02750 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota COG0524@1,KOG2855@2759 NA|NA|NA G carbohydrate kinase activity Z1_00558 529507.PMI3513 3.3e-169 600.9 Proteus rbsK 2.7.1.15 ko:K00852 ko00030,map00030 R01051,R02750 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV5B@1224,1RMRS@1236,3Z2KW@583,COG0524@1,COG0524@2 NA|NA|NA H Catalyzes the phosphorylation of ribose at O-5 in a reaction requiring ATP and magnesium. The resulting D-ribose-5- phosphate can then be used either for sythesis of nucleotides, histidine, and tryptophan, or as a component of the pentose phosphate pathway Z1_00559 34506.g1027 1.3e-119 435.6 Opisthokonta 4.1.2.4 ko:K01619 ko00030,map00030 R01066 RC00436,RC00437 ko00000,ko00001,ko01000 Opisthokonta 38FG8@33154,COG0274@1,KOG3981@2759 NA|NA|NA F deoxyribose-phosphate aldolase activity Z1_00560 529507.PMI3511 3.7e-145 520.8 Proteus deoR ko:K11534 ko00000,ko03000 Bacteria 1MY40@1224,1RR32@1236,3Z16C@583,COG1349@1,COG1349@2 NA|NA|NA K DeoR C terminal sensor domain Z1_00561 529507.PMI3510 3.3e-219 767.3 Proteus rtcB 6.5.1.3 ko:K14415,ko:K18148 ko01501,map01501 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUHA@1224,1RN50@1236,3Z3A0@583,COG1690@1,COG1690@2 NA|NA|NA S tRNA-splicing ligase RtcB Z1_00562 529507.PMI3509 3.8e-113 414.1 Proteus prfH ko:K02839 ko00000,ko03012 Bacteria 1R9YA@1224,1RR3F@1236,3Z3BF@583,COG1186@1,COG1186@2 NA|NA|NA J RF-1 domain Z1_00563 529507.PMI3508 5.4e-37 159.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1RFET@1224,1SVYG@1236,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain Z1_00564 529507.PMI3507 1.1e-74 285.8 Gammaproteobacteria ko:K07454 ko00000 Bacteria 1NE0N@1224,1RNM6@1236,COG3440@1,COG3440@2 NA|NA|NA V HNH endonuclease Z1_00565 34506.g1236 2.6e-67 261.2 Eukaryota Eukaryota 2CZY8@1,2SC3Z@2759 NA|NA|NA S Putative transposase DNA-binding domain Z1_00566 529507.PMI3543 2.2e-114 418.3 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00567 529507.PMI3034 2.6e-64 251.1 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00568 471874.PROSTU_01001 6.7e-18 96.3 Gammaproteobacteria ko:K07454 ko00000 Bacteria 1NE0N@1224,1RNM6@1236,COG3440@1,COG3440@2 NA|NA|NA V HNH endonuclease Z1_00570 529507.PMI3501 1.8e-281 974.5 Proteus dgt GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006195,GO:0006203,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008832,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009144,GO:0009146,GO:0009151,GO:0009155,GO:0009166,GO:0009200,GO:0009204,GO:0009215,GO:0009217,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009394,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016793,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019692,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042578,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046070,GO:0046386,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072523,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576 3.1.5.1 ko:K01129 ko00230,map00230 R01856 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MVQ2@1224,1RPVJ@1236,3Z1V2@583,COG0232@1,COG0232@2 NA|NA|NA F dGTPase preferentially hydrolyzes dGTP over the other canonical NTPs Z1_00571 529507.PMI3500 1.9e-135 488.4 Gammaproteobacteria cca 2.7.7.19,2.7.7.72 ko:K00970,ko:K00974 ko03013,ko03018,map03013,map03018 R09382,R09383,R09384,R09386 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1N0PX@1224,1SE4X@1236,COG0617@1,COG0617@2 NA|NA|NA J tRNA 3'-terminal CCA addition Z1_00572 203122.Sde_3856 3e-13 81.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1R89B@1224,1RR33@1236,28K7A@1,2Z9VF@2 NA|NA|NA Z1_00573 529507.PMI3497 6.7e-220 769.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1Q0ND@1224,1SDZ7@1236,2BM3G@1,32FKQ@2 NA|NA|NA S Beta protein Z1_00574 529507.PMI3496 7.1e-228 796.2 Gammaproteobacteria ko:K18831 ko00000,ko02048,ko03000 Bacteria 1MZHS@1224,1T0BK@1236,COG2856@1,COG2856@2,COG5499@1,COG5499@2 NA|NA|NA K Pfam:DUF955 Z1_00575 529507.PMI3495 3.8e-44 183.7 Bacteria ko:K19166 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria COG4680@1,COG4680@2 NA|NA|NA K protein conserved in bacteria Z1_00576 1124991.MU9_117 4.6e-17 92.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1MU23@1224,1RMJ1@1236,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_00579 529507.PMI3467 1.3e-232 812.0 Proteus ampH GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004180,GO:0005488,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0008360,GO:0008658,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0016787,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0031406,GO:0033218,GO:0033293,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0044238,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070011,GO:0071704,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901681 3.4.16.4 ko:K18988 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1MVPR@1224,1RPF1@1236,3Z1P1@583,COG1680@1,COG1680@2 NA|NA|NA V Beta-lactamase Z1_00580 529507.PMI3466 1.1e-192 679.1 Proteus lptG GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0032991,GO:0033036,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901264,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K11720 ko02010,map02010 M00320 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 1.B.42.1 iSSON_1240.SSON_4447 Bacteria 1MVW3@1224,1RM8H@1236,3Z1I4@583,COG0795@1,COG0795@2 NA|NA|NA S Predicted permease YjgP/YjgQ family Z1_00581 529507.PMI3465 6.5e-196 689.9 Proteus lptF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015221,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015437,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034040,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901264,GO:1901505,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K07091,ko:K11720 ko02010,map02010 M00320 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 1.B.42.1 iECED1_1282.ECED1_5114,iUMNK88_1353.UMNK88_5207 Bacteria 1MUF2@1224,1RMN5@1236,3Z2GM@583,COG0795@1,COG0795@2 NA|NA|NA S Predicted permease YjgP/YjgQ family Z1_00582 529507.PMI3464 3.4e-288 996.9 Proteus pepA GO:0001073,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006276,GO:0006310,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0016787,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019904,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042150,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043244,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0097718,GO:0140096,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 3.4.11.1,3.4.11.23 ko:K01255,ko:K07751 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R00899,R04951 RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUF9@1224,1RNM1@1236,3Z1DP@583,COG0260@1,COG0260@2 NA|NA|NA E Presumably involved in the processing and regular turnover of intracellular proteins. Catalyzes the removal of unsubstituted N-terminal amino acids from various peptides Z1_00583 529507.PMI3463 1.5e-79 302.0 Proteus holC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006275,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009360,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030174,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032298,GO:0032991,GO:0042575,GO:0043846,GO:0043847,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045740,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051054,GO:0051171,GO:0051173,GO:0060255,GO:0061695,GO:0065007,GO:0080090,GO:0090329,GO:1902494,GO:1990234,GO:2000105,GO:2000112 2.7.7.7 ko:K02339 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MZ3V@1224,1S94K@1236,3Z2DX@583,COG2927@1,COG2927@2 NA|NA|NA L DNA polymerase III chi subunit, HolC Z1_00584 529507.PMI3462 0.0 1956.0 Proteus valS GO:0000287,GO:0002161,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004832,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006418,GO:0006438,GO:0006450,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032268,GO:0032270,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045727,GO:0045903,GO:0046483,GO:0046872,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0052689,GO:0060255,GO:0061475,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2000112 6.1.1.9 ko:K01873 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03665 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iECH74115_1262.ECH74115_5779,iECNA114_1301.ECNA114_4481,iECO26_1355.ECO26_5428,iECSP_1301.ECSP_5359,iECs_1301.ECs5235,iG2583_1286.G2583_5088,iJN746.PP_0977,iSBO_1134.SBO_4182,iSSON_1240.SSON_4443,iYL1228.KPN_04663,iZ_1308.Z5870 Bacteria 1MV7B@1224,1RNEB@1236,3Z19K@583,COG0525@1,COG0525@2 NA|NA|NA J amino acids such as threonine, to avoid such errors, it has a posttransfer editing activity that hydrolyzes mischarged Thr-tRNA(Val) in a tRNA-dependent manner Z1_00585 529507.PMI3461 2.9e-90 337.8 Proteus yjgM ko:K03828 ko00000,ko01000 Bacteria 1RAJC@1224,1S1YW@1236,3Z2Q3@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) family Z1_00586 529507.PMI3460 6.9e-25 119.0 Proteus Bacteria 1NC5P@1224,1SEQS@1236,2E4XM@1,32ZRK@2,3Z32Y@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4223) Z1_00587 529507.PMI3459 8.6e-167 592.8 Proteus yhhW_3 ko:K06911 ko00000 Bacteria 1MWIP@1224,1RNVM@1236,3Z2NX@583,COG1741@1,COG1741@2 NA|NA|NA S Belongs to the pirin family Z1_00588 529507.PMI3458 6.8e-56 223.4 Proteus rraB GO:0003674,GO:0004857,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008428,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0016071,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019899,GO:0030234,GO:0031323,GO:0031324,GO:0032069,GO:0032074,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043086,GO:0043170,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045934,GO:0046483,GO:0046700,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051336,GO:0051346,GO:0060255,GO:0060698,GO:0060699,GO:0060700,GO:0060701,GO:0060702,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K09893 ko00000,ko03019 Bacteria 1RDKS@1224,1S4A6@1236,3Z31M@583,COG3076@1,COG3076@2 NA|NA|NA S Globally modulates RNA abundance by binding to RNase E (Rne) and regulating its endonucleolytic activity. Can modulate Rne action in a substrate-dependent manner by altering the composition of the degradosome Z1_00589 529507.PMI3457 6.4e-190 669.8 Proteus argF GO:0000050,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004585,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006591,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016743,GO:0019627,GO:0019752,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042450,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071941,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.1.3.3 ko:K00611 ko00220,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00220,map01100,map01110,map01130,map01230 M00029,M00844 R01398 RC00096 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b0273,iECDH10B_1368.ECDH10B_0261,iECS88_1305.ECS88_4841,iHN637.CLJU_RS12430,iJO1366.b0273,iJR904.b0273,iY75_1357.Y75_RS01410 Bacteria 1MUFM@1224,1RQ59@1236,3Z1R9@583,COG0078@1,COG0078@2 NA|NA|NA E Reversibly catalyzes the transfer of the carbamoyl group from carbamoyl phosphate (CP) to the N(epsilon) atom of ornithine (ORN) to produce L-citrulline Z1_00591 529507.PMI3455 3.3e-172 610.9 Proteus pyrB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004070,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016743,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.3.2 ko:K00609 ko00240,ko00250,ko01100,map00240,map00250,map01100 M00051 R01397 RC00064,RC02850 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iZ_1308.Z5856 Bacteria 1MWAB@1224,1RPSV@1236,3Z11U@583,COG0540@1,COG0540@2 NA|NA|NA F Belongs to the ATCase OTCase family Z1_00592 529507.PMI3454 4.9e-81 307.0 Proteus pyrI GO:0003674,GO:0003824,GO:0004070,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016743,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.3.2 ko:K00608,ko:K00610 ko00240,ko00250,ko01100,map00240,map00250,map01100 M00051 R01397 RC00064,RC02850 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1RB7J@1224,1S2BM@1236,3Z221@583,COG1781@1,COG1781@2 NA|NA|NA F Involved in allosteric regulation of aspartate carbamoyltransferase Z1_00593 529507.PMI3452 1e-63 249.2 Proteus yjgF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006566,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009066,GO:0009636,GO:0009987,GO:0016787,GO:0019239,GO:0019752,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051082,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901605 3.5.99.10 ko:K09022 R11098,R11099 RC03275,RC03354 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZ3J@1224,1S5XS@1236,3Z2J9@583,COG0251@1,COG0251@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease L-PSP Z1_00594 529507.PMI3451 0.0 1446.8 Proteus nrdD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008998,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016491,GO:0016725,GO:0016728,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019001,GO:0019103,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0030554,GO:0031250,GO:0032552,GO:0032553,GO:0032554,GO:0032555,GO:0032556,GO:0032558,GO:0032559,GO:0032560,GO:0032564,GO:0032567,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046385,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051065,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 1.1.98.6 ko:K21636 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00053 R11633,R11634,R11635,R11636 RC00613 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_4713,iPC815.YPO3454 Bacteria 1MWMS@1224,1RNHS@1236,3Z25I@583,COG1328@1,COG1328@2 NA|NA|NA F Anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase Z1_00595 529507.PMI3450 3.6e-87 327.4 Proteus nrdG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008998,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016491,GO:0016725,GO:0016728,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0031250,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046385,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 1.97.1.4 ko:K04068 R04710 ko00000,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_4563 Bacteria 1RA7S@1224,1S20X@1236,3Z2SM@583,COG0602@1,COG0602@2 NA|NA|NA C Activation of anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase under anaerobic conditions by generation of an organic free radical, using S-adenosylmethionine and reduced flavodoxin as cosubstrates to produce 5'-deoxy-adenosine Z1_00596 529507.PMI3449 2.6e-29 134.0 Proteus Bacteria 1NGKE@1224,1SH9B@1236,2EFUY@1,339M4@2,3Z2YD@583 NA|NA|NA Z1_00597 529507.PMI3448 2e-64 251.5 Proteus Bacteria 1NC7Z@1224,1SE6R@1236,2CHUB@1,339EI@2,3Z2WG@583 NA|NA|NA Z1_00598 529507.PMI3447 6.9e-80 303.1 Proteus yhbP GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09979 ko00000 Bacteria 1RH76@1224,1S6F1@1236,3Z30E@583,COG3787@1,COG3787@2 NA|NA|NA S Belongs to the UPF0306 family Z1_00599 529507.PMI3446 6.5e-35 152.9 Proteus Bacteria 1QCSC@1224,1T8J2@1236,2B3K6@1,31W9F@2,3Z308@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1471) Z1_00600 529507.PMI3445 2.3e-44 184.5 Proteus yhbQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008408,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 ko:K07461 ko00000 Bacteria 1N6PA@1224,1SCBH@1236,3Z2Y1@583,COG2827@1,COG2827@2 NA|NA|NA L GIY-YIG catalytic domain Z1_00601 529507.PMI3444 5.2e-92 343.6 Proteus yhbS GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043543,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564 ko:K03824 ko00000,ko01000 Bacteria 1RA42@1224,1S2G0@1236,3Z1IR@583,COG3153@1,COG3153@2 NA|NA|NA S Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_00602 529507.PMI3443 4.8e-96 357.1 Proteus yhbT GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K08303 ko05120,map05120 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1RB7T@1224,1RMJD@1236,3Z24H@583,COG3154@1,COG3154@2 NA|NA|NA I SCP-2 sterol transfer family Z1_00603 529507.PMI3442 8.8e-192 676.0 Proteus yhbU ko:K08303 ko05120,map05120 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUQG@1224,1RP6X@1236,3Z1X2@583,COG0826@1,COG0826@2 NA|NA|NA O Peptidase family U32 Z1_00604 529507.PMI3441 1.6e-168 598.6 Proteus yhbV Bacteria 1MWFW@1224,1RMWM@1236,3Z255@583,COG0826@1,COG0826@2 NA|NA|NA O protease Z1_00605 529507.PMI3440 1.8e-175 621.7 Gammaproteobacteria ydeQ ko:K07350 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1NQXE@1224,1RQSD@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00606 529507.PMI3439 5.9e-91 340.1 Gammaproteobacteria ydeR ko:K07349 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1RC12@1224,1S36F@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00607 529507.PMI3438 9.9e-97 359.4 Gammaproteobacteria fimF ko:K07348 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1R6J8@1224,1S138@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00608 529507.PMI3437 0.0 1374.8 Gammaproteobacteria fimD GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009297,GO:0009987,GO:0015267,GO:0015288,GO:0015473,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022857,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0043711,GO:0044085,GO:0044462,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071840,GO:0071944 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Usher protein Z1_00609 529507.PMI3437 1.4e-27 128.3 Gammaproteobacteria fimD GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009297,GO:0009987,GO:0015267,GO:0015288,GO:0015473,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022857,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0043711,GO:0044085,GO:0044462,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071840,GO:0071944 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Usher protein Z1_00610 529507.PMI3436 3.8e-125 454.1 Gammaproteobacteria fimC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0008150,GO:0009987,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044183,GO:0044464,GO:0061077 ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1R3T9@1224,1RS56@1236,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M chaperone Z1_00611 529507.PMI3435 1.5e-95 355.5 Gammaproteobacteria fimA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0007155,GO:0008150,GO:0009289,GO:0022610,GO:0042802,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1QI7Y@1224,1S07V@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00612 529507.PMI3434 9e-212 742.7 Proteus ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1R4QG@1224,1RTXK@1236,3Z192@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 type transporter Z1_00613 529507.PMI3433 6.8e-204 716.5 Proteus ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MXKS@1224,1S2NW@1236,3Z1Z7@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 family transporter protein Z1_00614 529507.PMI3432 3.9e-168 597.4 Proteus farA ko:K01993,ko:K02005 ko00000 Bacteria 1MXZV@1224,1S2IJ@1236,3Z0XW@583,COG1566@1,COG1566@2 NA|NA|NA V Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion Z1_00615 529507.PMI3431 2e-308 1064.3 Proteus yehU GO:0000160,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016310,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019538,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564 2.7.13.3 ko:K02478,ko:K07704 ko02020,map02020 M00492 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 iECW_1372.ECW_m2327,iWFL_1372.ECW_m2327 Bacteria 1QUB1@1224,1T1RX@1236,3Z0XZ@583,COG3275@1,COG3275@2 NA|NA|NA T sensory kinase in two-component system with YehT K07704 Z1_00616 34506.g5026 2.7e-134 484.6 Bilateria Metazoa 2SM38@2759,3AFWP@33154,3BZ73@33208,3DEWW@33213,COG3279@1 NA|NA|NA KT LytTr DNA-binding domain Z1_00617 529507.PMI3429 4.9e-63 246.9 Proteus Bacteria 1NNSB@1224,1SHIF@1236,2DSCT@1,33FK4@2,3Z3FX@583 NA|NA|NA Z1_00619 529507.PMI3428 7.6e-233 812.8 Proteus yihN Bacteria 1MXUC@1224,1RRF8@1236,3Z3D3@583,COG2271@1,COG2271@2 NA|NA|NA G Major Facilitator Superfamily Z1_00620 529507.PMI3427 1.4e-65 255.4 Proteus 3.5.99.10 ko:K09022 R11098,R11099 RC03275,RC03354 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZ3J@1224,1S5XS@1236,3Z3F3@583,COG0251@1,COG0251@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease L-PSP Z1_00621 529507.PMI3426 1.2e-185 655.6 Proteus Bacteria 1N9ED@1224,1S0I7@1236,3Z36G@583,COG1082@1,COG1082@2 NA|NA|NA G Xylose isomerase-like TIM barrel Z1_00622 529507.PMI3425 7.7e-120 436.4 Proteus Bacteria 1MVV9@1224,1RSB8@1236,3Z3AI@583,COG2964@1,COG2964@2 NA|NA|NA S YheO-like PAS domain Z1_00623 529507.PMI3424 0.0 1148.7 Proteus deaD GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003724,GO:0003725,GO:0003727,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006417,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009895,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010501,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010628,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019439,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031330,GO:0032268,GO:0032270,GO:0033554,GO:0033592,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034655,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043487,GO:0043488,GO:0043489,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045727,GO:0045934,GO:0046483,GO:0046700,GO:0048255,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051716,GO:0060255,GO:0061013,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070035,GO:0070417,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097617,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575,GO:1902369,GO:1902373,GO:1903311,GO:1903312,GO:2000112 3.6.4.13 ko:K05591,ko:K05592 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009,ko03019 Bacteria 1MU49@1224,1RMWA@1236,3Z1F3@583,COG0513@1,COG0513@2 NA|NA|NA JKL DEAD-box RNA helicase involved in various cellular processes at low temperature, including ribosome biogenesis, mRNA degradation and translation initiation Z1_00624 34506.g416 3.1e-164 584.3 Bilateria Metazoa 2SJ18@2759,3AJ4W@33154,3BXBM@33208,3DDSV@33213,COG4785@1 NA|NA|NA S Tetratricopeptide repeat Z1_00625 529507.PMI3422 0.0 1342.0 Proteus pnp GO:0000166,GO:0000175,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0004654,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016896,GO:0017076,GO:0019001,GO:0019222,GO:0019439,GO:0030312,GO:0030551,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034641,GO:0034655,GO:0035438,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0048519,GO:0050789,GO:0050896,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140098,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575 2.7.7.8 ko:K00962 ko00230,ko00240,ko03018,map00230,map00240,map03018 M00394 R00437,R00438,R00439,R00440 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1MVB9@1224,1RNBF@1236,3Z1S3@583,COG1185@1,COG1185@2 NA|NA|NA J polyribonucleotide nucleotidyltransferase Z1_00626 529507.PMI3421 4.2e-40 170.2 Proteus rpsO GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006378,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031123,GO:0031124,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043631,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02956 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ2W@1224,1S8U6@1236,3Z32T@583,COG0184@1,COG0184@2 NA|NA|NA J Ribosomal_S15 Z1_00627 529507.PMI3420 6.3e-179 633.3 Proteus truB GO:0000049,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016556,GO:0016853,GO:0016866,GO:0031119,GO:0034337,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1990481 5.4.99.25 ko:K03177 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MV0N@1224,1RMKP@1236,3Z271@583,COG0130@1,COG0130@2 NA|NA|NA J Responsible for synthesis of pseudouridine from uracil- 55 in the psi GC loop of transfer RNAs Z1_00628 529507.PMI3419 1.8e-63 248.4 Proteus rbfA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0022613,GO:0030490,GO:0033554,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 ko:K02834 ko00000,ko03009 Bacteria 1MZPE@1224,1S9AF@1236,3Z2NH@583,COG0858@1,COG0858@2 NA|NA|NA J One of several proteins that assist in the late maturation steps of the functional core of the 30S ribosomal subunit. Associates with free 30S ribosomal subunits (but not with 30S subunits that are part of 70S ribosomes or polysomes). Required for efficient processing of 16S rRNA. May interact with the 5'-terminal helix region of 16S rRNA Z1_00629 529507.PMI3418 0.0 1392.5 Proteus infB GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003743,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019538,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034641,GO:0034645,GO:0036094,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097216,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02519 ko00000,ko03012,ko03029 Bacteria 1MV26@1224,1RM9X@1236,3Z1IB@583,COG0532@1,COG0532@2,COG3064@1,COG3064@2 NA|NA|NA J One of the essential components for the initiation of protein synthesis. Protects formylmethionyl-tRNA from spontaneous hydrolysis and promotes its binding to the 30S ribosomal subunits. Also involved in the hydrolysis of GTP during the formation of the 70S ribosomal complex Z1_00630 529507.PMI3417 7.9e-277 959.1 Proteus nusA GO:0001000,GO:0001121,GO:0001125,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006353,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019899,GO:0019904,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043175,GO:0043244,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K02600 ko00000,ko03009,ko03021 Bacteria 1MWT7@1224,1RNQS@1236,3Z0XS@583,COG0195@1,COG0195@2 NA|NA|NA K Participates in both transcription termination and antitermination Z1_00631 529507.PMI3416 1.3e-72 278.9 Proteus rimP GO:0000028,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K09748 ko00000,ko03009 Bacteria 1RDP2@1224,1S3Y7@1236,3Z25X@583,COG0779@1,COG0779@2 NA|NA|NA J Required for maturation of 30S ribosomal subunits Z1_00634 529507.PMI3415 3.4e-50 204.1 Proteus secG GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006605,GO:0006612,GO:0006613,GO:0006614,GO:0006616,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008320,GO:0008565,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016043,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031522,GO:0032978,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0042886,GO:0042887,GO:0043952,GO:0044464,GO:0045047,GO:0045184,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0061024,GO:0065002,GO:0070727,GO:0070972,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072594,GO:0072599,GO:0072657,GO:0090150,GO:1904680 ko:K03075 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.2 Bacteria 1N8MF@1224,1SD3P@1236,3Z2SB@583,COG1314@1,COG1314@2 NA|NA|NA U Preprotein translocase SecG subunit Z1_00635 529507.PMI3414 2.1e-252 877.9 Proteus glmM GO:0003674,GO:0003824,GO:0004614,GO:0004615,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006040,GO:0006047,GO:0006048,GO:0006139,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008966,GO:0009058,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009987,GO:0016310,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036211,GO:0040007,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046349,GO:0046483,GO:0046777,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 5.4.2.10 ko:K03431 ko00520,ko01100,ko01130,map00520,map01100,map01130 R02060 RC00408 ko00000,ko00001,ko01000 iAF987.Gmet_1886,iLJ478.TM0184,iSB619.SA_RS11275,iSBO_1134.SBO_3206 Bacteria 1MU24@1224,1RMR2@1236,3Z225@583,COG1109@1,COG1109@2 NA|NA|NA G Catalyzes the conversion of glucosamine-6-phosphate to glucosamine-1-phosphate Z1_00636 529507.PMI3413 3.4e-152 544.3 Proteus folP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004156,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042221,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042493,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0046655,GO:0046656,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.15 ko:K00796 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03066,R03067 RC00121,RC00842 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO103_1326.ECO103_3924,iPC815.YPO3501 Bacteria 1MUIR@1224,1RM8G@1236,3Z1HX@583,COG0294@1,COG0294@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of para-aminobenzoate (pABA) with 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin diphosphate (DHPt-PP) to form 7,8-dihydropteroate (H2Pte), the immediate precursor of folate derivatives Z1_00637 529507.PMI3412 0.0 1264.6 Proteus ftsH GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004176,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009057,GO:0010468,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019222,GO:0019538,GO:0030145,GO:0030163,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043273,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050896,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098796,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K03798 M00742 ko00000,ko00002,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1MU6J@1224,1RME8@1236,3Z2DI@583,COG0465@1,COG0465@2 NA|NA|NA D Belongs to the AAA ATPase family Z1_00638 529507.PMI3411 6.1e-114 416.8 Proteus ftsJ GO:0000027,GO:0000154,GO:0000451,GO:0000453,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008650,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016436,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.166 ko:K02427 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MW1C@1224,1RN5M@1236,3Z2HN@583,COG0293@1,COG0293@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the uridine in position 2552 of 23S rRNA at the 2'-O position of the ribose in the fully assembled 50S ribosomal subunit Z1_00639 529507.PMI3410 2.4e-44 184.5 Proteus yhbY GO:0000027,GO:0000028,GO:0000966,GO:0000967,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0034470,GO:0034471,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0042274,GO:0043021,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360,GO:1990275 ko:K07574 ko00000,ko03009 Bacteria 1N8K5@1224,1SDIM@1236,3Z2YC@583,COG1534@1,COG1534@2 NA|NA|NA J CRS1_YhbY Z1_00640 529507.PMI3409 1.3e-79 302.4 Proteus greA GO:0001098,GO:0001108,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006354,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016020,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0032784,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046677,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03624 ko00000,ko03021 Bacteria 1RCXW@1224,1S3UP@1236,3Z28N@583,COG0782@1,COG0782@2 NA|NA|NA K Necessary for efficient RNA polymerase transcription elongation past template-encoded arresting sites. The arresting sites in DNA have the property of trapping a certain fraction of elongating RNA polymerases that pass through, resulting in locked ternary complexes. Cleavage of the nascent transcript by cleavage factors such as GreA or GreB allows the resumption of elongation from the new 3'terminus. GreA releases sequences of 2 to 3 nucleotides Z1_00641 34506.g785 2.5e-272 944.1 Eukaryota GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0008238,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0070008,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 Eukaryota 2S3R5@2759,COG2027@1 NA|NA|NA M D-Ala-D-Ala carboxypeptidase 3 (S13) family Z1_00642 529507.PMI3407 2.3e-215 754.6 Proteus obg GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006996,GO:0007059,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019003,GO:0022607,GO:0022611,GO:0022613,GO:0022618,GO:0032502,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034622,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042254,GO:0042255,GO:0043021,GO:0043023,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090069,GO:0090071,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03979 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MUGZ@1224,1RMFQ@1236,3Z2BC@583,COG0536@1,COG0536@2 NA|NA|NA S An essential GTPase which binds GTP, GDP and possibly (p)ppGpp with moderate affinity, with high nucleotide exchange rates and a fairly low GTP hydrolysis rate. Plays a role in control of the cell cycle, stress response, ribosome biogenesis and in those bacteria that undergo differentiation, in morphogenesis control Z1_00643 529507.PMI3406 3.1e-40 170.6 Proteus rpmA GO:0000027,GO:0001558,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0040008,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042256,GO:0042273,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090069,GO:0090070,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902626,GO:1990904 ko:K02899 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZGH@1224,1S8R2@1236,3Z2UB@583,COG0211@1,COG0211@2 NA|NA|NA J Ribosomal L27 protein Z1_00644 529507.PMI3405 2.6e-49 201.1 Proteus rplU GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02888 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZEW@1224,1S5VB@1236,3Z2TK@583,COG0261@1,COG0261@2 NA|NA|NA J This protein binds to 23S rRNA in the presence of protein L20 Z1_00645 529507.PMI3404 3.5e-177 627.5 Proteus ispB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004659,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006066,GO:0006629,GO:0006720,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016093,GO:0016094,GO:0016740,GO:0016765,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046165,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901661,GO:1901663 2.5.1.30,2.5.1.90 ko:K00805,ko:K02523 ko00900,ko01110,map00900,map01110 R09247,R09248 RC00279 ko00000,ko00001,ko01000,ko01006 iYL1228.KPN_03597,ic_1306.c3945 Bacteria 1MUK6@1224,1RPR7@1236,3Z10U@583,COG0142@1,COG0142@2 NA|NA|NA H Polyprenyl synthetase Z1_00646 529507.PMI3403 7.9e-70 269.6 Proteus Bacteria 1N47J@1224,1S8W2@1236,3Z2KV@583,COG2932@1,COG2932@2 NA|NA|NA K Putative transcription regulator (DUF1323) Z1_00647 529507.PMI3402 1.6e-60 238.4 Proteus Bacteria 1N3DR@1224,1SBU6@1236,3Z30M@583,COG2932@1,COG2932@2 NA|NA|NA K Mu DNA-binding domain Z1_00648 529507.PMI3401 5.3e-43 179.9 Proteus sfsB ko:K07724 ko00000,ko03000 Bacteria 1N8W7@1224,1S966@1236,3Z2UW@583,COG3423@1,COG3423@2 NA|NA|NA K Winged helix-turn-helix DNA-binding Z1_00649 529507.PMI3400 1.4e-167 595.5 Proteus mdh GO:0003674,GO:0003824,GO:0004470,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006108,GO:0006113,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016615,GO:0016999,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0019898,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042866,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072350,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 1.1.1.37 ko:K00024 ko00020,ko00270,ko00620,ko00630,ko00680,ko00710,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00270,map00620,map00630,map00680,map00710,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00012,M00168,M00173,M00346,M00374,M00620,M00740 R00342,R07136 RC00031 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEcolC_1368.EcolC_0470 Bacteria 1MV57@1224,1RMAX@1236,3Z0XY@583,COG0039@1,COG0039@2 NA|NA|NA C Catalyzes the reversible oxidation of malate to oxaloacetate Z1_00650 529507.PMI3399 2.1e-79 301.6 Proteus argR GO:0000820,GO:0000821,GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001216,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006521,GO:0006525,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009064,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010565,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016043,GO:0016597,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019752,GO:0022607,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031329,GO:0031333,GO:0031334,GO:0031406,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033238,GO:0033241,GO:0034214,GO:0034618,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042150,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043254,GO:0043436,GO:0043565,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051259,GO:0060255,GO:0062012,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140110,GO:1900079,GO:1900081,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901605,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000142,GO:2000143,GO:2000144,GO:2000282,GO:2001141 ko:K03402 ko00000,ko03000 Bacteria 1N2AF@1224,1RSF7@1236,3Z28G@583,COG1438@1,COG1438@2 NA|NA|NA K Regulates arginine biosynthesis genes Z1_00651 529507.PMI3398 7e-272 942.6 Proteus murC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044464 6.3.2.4,6.3.2.45,6.3.2.8 ko:K01921,ko:K01924,ko:K02558 ko00471,ko00473,ko00550,ko01100,ko01502,map00471,map00473,map00550,map01100,map01502 R01150,R03193 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iSDY_1059.SDY_4251 Bacteria 1MUC5@1224,1RMMT@1236,3Z1HB@583,COG0773@1,COG0773@2 NA|NA|NA M Reutilizes the intact tripeptide L-alanyl-gamma-D- glutamyl-meso-diaminopimelate by linking it to UDP-N- acetylmuramate Z1_00652 529507.PMI3397 3.4e-191 674.1 Proteus fbp GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005984,GO:0005985,GO:0005986,GO:0005996,GO:0006000,GO:0006002,GO:0006006,GO:0006094,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016051,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0019318,GO:0019319,GO:0019637,GO:0022607,GO:0030388,GO:0034637,GO:0042132,GO:0042578,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046351,GO:0046364,GO:0050308,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901576 3.1.3.11 ko:K03841 ko00010,ko00030,ko00051,ko00680,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko04152,ko04910,map00010,map00030,map00051,map00680,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map04152,map04910 M00003,M00165,M00167,M00344 R00762,R04780 RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iUTI89_1310.UTI89_C4836,ic_1306.c5329 Bacteria 1MW0E@1224,1RNFF@1236,3Z1YY@583,COG0158@1,COG0158@2 NA|NA|NA F Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain Z1_00653 529507.PMI3396 2.5e-97 361.3 Proteus ppa GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004427,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006793,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050355 3.6.1.1 ko:K01507 ko00190,map00190 ko00000,ko00001,ko01000 iPC815.YPO3521 Bacteria 1RA2F@1224,1RPVD@1236,3Z1B7@583,COG0221@1,COG0221@2 NA|NA|NA C Catalyzes the hydrolysis of inorganic pyrophosphate (PPi) forming two phosphate ions Z1_00654 529507.PMI3395 4.1e-204 717.2 Proteus setB Bacteria 1R5BM@1224,1S85Y@1236,3Z2D8@583,COG2211@1,COG2211@2 NA|NA|NA G Major Facilitator Superfamily Z1_00655 529507.PMI3394 1e-248 865.5 Proteus Bacteria 1NSHK@1224,1SKAM@1236,3Z19X@583,COG1898@1,COG1898@2 NA|NA|NA M dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase Z1_00656 529507.PMI3393 8.3e-41 172.6 Proteus Bacteria 1QGM1@1224,1TE1S@1236,2AMHR@1,31CDB@2,3Z3IK@583 NA|NA|NA Z1_00657 529507.PMI3392 3.9e-62 243.8 Proteus ytfP GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1RH3X@1224,1S68T@1236,3Z31P@583,COG2105@1,COG2105@2 NA|NA|NA S Gamma-glutamyl cyclotransferase, AIG2-like Z1_00658 529507.PMI3391 0.0 2472.6 Proteus ytfN GO:0002790,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032940,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042886,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046903,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0097347 ko:K09800 ko00000,ko02000 Bacteria 1MUVD@1224,1RMMF@1236,3Z233@583,COG2911@1,COG2911@2 NA|NA|NA S TamB, inner membrane protein subunit of TAM complex Z1_00659 529507.PMI3390 0.0 1187.2 Proteus ytfM GO:0002790,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031975,GO:0032940,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042886,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045203,GO:0046903,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0097347 ko:K07278 ko00000,ko02000 1.B.33.2.4 Bacteria 1MUKM@1224,1RNQ3@1236,3Z1DG@583,COG0729@1,COG0729@2 NA|NA|NA M POTRA domain TamA domain 1 Z1_00660 529507.PMI3389 1.6e-119 435.3 Proteus msrA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008113,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0019538,GO:0030091,GO:0033744,GO:0036456,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564 1.8.4.11 ko:K07304 ko00000,ko01000 iECSE_1348.ECSE_4525 Bacteria 1MVUS@1224,1RNWU@1236,3Z1U5@583,COG0225@1,COG0225@2 NA|NA|NA C Has an important function as a repair enzyme for proteins that have been inactivated by oxidation. Catalyzes the reversible oxidation-reduction of methionine sulfoxide in proteins to methionine Z1_00661 529507.PMI3388 6.8e-251 872.8 Proteus ytfL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03699 ko00000,ko02042 Bacteria 1MV3P@1224,1T1MS@1236,3Z1M3@583,COG1253@1,COG1253@2 NA|NA|NA P Hemolysins and related proteins containing CBS domains Z1_00662 529507.PMI3387 3.6e-31 140.2 Proteus ytfK Bacteria 1MZ8V@1224,1S908@1236,2CTIP@1,32STK@2,3Z2Z6@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1107) Z1_00663 529507.PMI3386 6.4e-99 366.7 Proteus ytfJ ko:K07109 ko00000 Bacteria 1REC3@1224,1S3X5@1236,3Z123@583,COG3054@1,COG3054@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (YtfJ_HI0045) Z1_00664 529507.PMI3385 3.2e-138 497.7 Proteus cysQ GO:0000103,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008252,GO:0008441,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0046872 3.1.3.7 ko:K01082 ko00920,ko01100,ko01120,ko01130,map00920,map01100,map01120,map01130 R00188,R00508 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 iAPECO1_1312.APECO1_2172,iE2348C_1286.E2348C_4545,iEC042_1314.EC042_4695,iEC55989_1330.EC55989_4774,iECABU_c1320.ECABU_c47840,iECIAI1_1343.ECIAI1_4448,iECIAI39_1322.ECIAI39_4686,iECO103_1326.ECO103_5013,iECO111_1330.ECO111_5101,iECO26_1355.ECO26_5384,iECOK1_1307.ECOK1_4735,iECP_1309.ECP_4468,iECSE_1348.ECSE_4520,iECSF_1327.ECSF_4108,iECUMN_1333.ECUMN_4751,iECW_1372.ECW_m4578,iEKO11_1354.EKO11_4094,iEcE24377_1341.EcE24377A_4785,iEcHS_1320.EcHS_A4468,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4694,iLF82_1304.LF82_0422,iNRG857_1313.NRG857_21455,iSBO_1134.SBO_4229,iSDY_1059.SDY_4385,iSSON_1240.SSON_4399,iSbBS512_1146.SbBS512_E4758,iUMN146_1321.UM146_21355,iUTI89_1310.UTI89_C4823,iWFL_1372.ECW_m4578,ic_1306.c5313 Bacteria 1N0GY@1224,1RP5A@1236,3Z1J1@583,COG1218@1,COG1218@2 NA|NA|NA P Inositol monophosphatase family Z1_00665 529507.PMI3384 6.2e-111 406.8 Proteus fklB GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005527,GO:0005528,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0036211,GO:0042597,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901363,GO:1901564 5.2.1.8 ko:K03773 ko00000,ko01000,ko03110 Bacteria 1RDA1@1224,1RPMP@1236,3Z2DS@583,COG0545@1,COG0545@2 NA|NA|NA O Domain amino terminal to FKBP-type peptidyl-prolyl isomerase Z1_00666 529507.PMI3383 4.9e-276 956.4 Proteus gabD 1.2.1.16,1.2.1.20,1.2.1.79 ko:K00135 ko00250,ko00310,ko00350,ko00650,ko00760,ko01100,ko01120,map00250,map00310,map00350,map00650,map00760,map01100,map01120 M00027 R00713,R00714,R02401 RC00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU1V@1224,1RMBQ@1236,3Z2AA@583,COG1012@1,COG1012@2 NA|NA|NA C Aldehyde dehydrogenase family Z1_00667 529507.PMI3380 1.6e-122 445.3 Proteus adcA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010035,GO:0010038,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031975,GO:0033554,GO:0034224,GO:0042221,GO:0042594,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046686,GO:0046870,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0120127 ko:K09815 ko02010,map02010 M00242 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15.3,3.A.1.15.5 Bacteria 1MXFK@1224,1RPWU@1236,3Z2I3@583,COG3443@1,COG3443@2 NA|NA|NA S ZinT (YodA) periplasmic lipocalin-like zinc-recruitment Z1_00668 471881.PROPEN_03644 5.3e-14 82.4 Proteus rpmJ GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02919 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1NGBJ@1224,1SCR7@1236,3Z3JP@583,COG0257@1,COG0257@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L36 Z1_00669 529507.PMI3379 1.3e-40 171.8 Proteus rpmE2 GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02909 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ4D@1224,1S8V5@1236,3Z2ZP@583,COG0254@1,COG0254@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L31 Z1_00670 529507.PMI3378 2.6e-99 368.2 Proteus ytfB ko:K07268,ko:K07269 ko00000 Bacteria 1R4XK@1224,1S430@1236,3Z207@583,COG3061@1,COG3061@2 NA|NA|NA M Opacity-associated protein A N-terminal motif Z1_00671 529507.PMI3377 2.4e-72 278.1 Proteus rplI GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0070180,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02939 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RD0R@1224,1S3WS@1236,3Z342@583,COG0359@1,COG0359@2 NA|NA|NA J ribosomal protein L9 Z1_00672 1005994.GTGU_02012 1.1e-33 148.7 Gammaproteobacteria rpsR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0048027,GO:0070181,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02963 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ8U@1224,1S8R8@1236,COG0238@1,COG0238@2 NA|NA|NA J Binds as a heterodimer with protein S6 to the central domain of the 16S rRNA, where it helps stabilize the platform of the 30S subunit Z1_00673 529507.PMI3375 2e-52 211.5 Proteus priB GO:0000228,GO:0000428,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003688,GO:0003690,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005657,GO:0005658,GO:0005694,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006269,GO:0006270,GO:0006276,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030880,GO:0030894,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043565,GO:0043596,GO:0043601,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044454,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0055029,GO:0061695,GO:0070013,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990077,GO:1990099,GO:1990234,GO:1990837 ko:K02686 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1RHIE@1224,1S6H5@1236,3Z2TE@583,COG2965@1,COG2965@2 NA|NA|NA L Binds single-stranded DNA at the primosome assembly site (PAS) Z1_00674 529507.PMI3374 5.1e-66 256.9 Proteus rpsF GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0048027,GO:0070181,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 4.3.1.19 ko:K01754,ko:K02990 ko00260,ko00290,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01230,ko03010,map00260,map00290,map01100,map01110,map01130,map01200,map01230,map03010 M00178,M00570 R00220,R00996 RC00418,RC02600 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03011,ko03029 Bacteria 1RH82@1224,1S5VU@1236,3Z2K4@583,COG0360@1,COG0360@2 NA|NA|NA J Binds together with S18 to 16S ribosomal RNA Z1_00675 529507.PMI3373 4.8e-134 483.8 Proteus rlmB GO:0000154,GO:0000451,GO:0000453,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070039,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.185,2.1.1.34 ko:K00556,ko:K03214,ko:K03218,ko:K22132 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MWCM@1224,1RN2F@1236,3Z2F6@583,COG0566@1,COG0566@2 NA|NA|NA J Belongs to the class IV-like SAM-binding methyltransferase superfamily. RNA methyltransferase TrmH family. RlmB subfamily Z1_00676 529507.PMI3372 0.0 1584.3 Proteus rnr GO:0000175,GO:0003674,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004386,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0008997,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016896,GO:0017111,GO:0019222,GO:0019439,GO:0034458,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034655,GO:0034660,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0048519,GO:0050789,GO:0050896,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K12573 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1MUS6@1224,1RMQE@1236,3Z16M@583,COG0557@1,COG0557@2 NA|NA|NA J 3'-5' exoribonuclease that releases 5'-nucleoside monophosphates and is involved in maturation of structured RNAs Z1_00677 529507.PMI3371 7.9e-73 279.6 Proteus nsrR GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032991,GO:0032993,GO:0043565,GO:0044212,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K13771 ko05132,map05132 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1N05H@1224,1S8SJ@1236,3Z2N8@583,COG1959@1,COG1959@2 NA|NA|NA K Nitric oxide-sensitive repressor of genes involved in protecting the cell against nitrosative stress. May require iron for activity Z1_00678 529507.PMI3370 1.3e-246 858.6 Proteus purA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004019,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006167,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016874,GO:0016879,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042451,GO:0042455,GO:0044208,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046033,GO:0046040,GO:0046085,GO:0046086,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046390,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 6.3.4.4 ko:K01939 ko00230,ko00250,ko01100,map00230,map00250,map01100 M00049 R01135 RC00458,RC00459 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_4393,iECSF_1327.ECSF_4063,iJN746.PP_4889 Bacteria 1MU5B@1224,1RNEW@1236,3Z23D@583,COG0104@1,COG0104@2 NA|NA|NA F Plays an important role in the de novo pathway of purine nucleotide biosynthesis. Catalyzes the first committed step in the biosynthesis of AMP from IMP Z1_00679 529507.PMI3368 5.3e-168 597.0 Proteus hflC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0032991,GO:0043086,GO:0043170,GO:0044092,GO:0044238,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050790,GO:0050896,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071575,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098796,GO:0140096,GO:1901564 ko:K04087 M00742 ko00000,ko00002,ko01000 Bacteria 1MV7R@1224,1RM8Z@1236,3Z0Z6@583,COG0330@1,COG0330@2 NA|NA|NA O HflC and HflK could regulate a protease Z1_00680 529507.PMI3367 1.2e-193 682.6 Proteus hflK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0032991,GO:0043086,GO:0043170,GO:0044092,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050790,GO:0050896,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071575,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098796,GO:0140096,GO:1901564 ko:K04088 M00742 ko00000,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUM2@1224,1RMUG@1236,3Z2PH@583,COG0330@1,COG0330@2 NA|NA|NA O HflC and HflK could encode or regulate a protease Z1_00681 529507.PMI3366 1.6e-241 841.6 Proteus hflX GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006417,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006518,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0016043,GO:0016310,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019001,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022411,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032561,GO:0032790,GO:0032984,GO:0032988,GO:0034248,GO:0034641,GO:0034645,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036289,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043023,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051246,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0072344,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903008,GO:2000112 ko:K03665 ko00000,ko03009 Bacteria 1MUA0@1224,1RN7V@1236,3Z1V5@583,COG2262@1,COG2262@2 NA|NA|NA S GTPase that associates with the 50S ribosomal subunit and may have a role during protein synthesis or ribosome biogenesis Z1_00682 529507.PMI3365 3.6e-45 187.2 Proteus hfq GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003681,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006378,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006417,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016246,GO:0016441,GO:0016458,GO:0017148,GO:0019222,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0030423,GO:0031047,GO:0031123,GO:0031124,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034250,GO:0034622,GO:0034641,GO:0035194,GO:0040029,GO:0040033,GO:0043170,GO:0043631,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045727,GO:0045974,GO:0045975,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:2000112,GO:2000113 ko:K03666 ko02024,ko03018,ko05111,map02024,map03018,map05111 ko00000,ko00001,ko03019,ko03036 Bacteria 1MZM1@1224,1S8W0@1236,3Z2XF@583,COG1923@1,COG1923@2 NA|NA|NA J RNA chaperone that binds small regulatory RNA (sRNAs) and mRNAs to facilitate mRNA translational regulation in response to envelope stress, environmental stress and changes in metabolite concentrations. Also binds with high specificity to tRNAs Z1_00683 529507.PMI3364 2.2e-176 624.8 Proteus miaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006417,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009451,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0033554,GO:0034248,GO:0034470,GO:0034605,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040007,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043555,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051246,GO:0051716,GO:0052381,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1990497,GO:2000112,GO:2000765 2.5.1.75 ko:K00791 ko00908,ko01100,ko01110,map00908,map01100,map01110 R01122 RC02820 ko00000,ko00001,ko01000,ko01006,ko03016 Bacteria 1MUB2@1224,1RMDU@1236,3Z1UH@583,COG0324@1,COG0324@2 NA|NA|NA J Catalyzes the transfer of a dimethylallyl group onto the adenine at position 37 in tRNAs that read codons beginning with uridine, leading to the formation of N6-(dimethylallyl)adenosine (i(6)A) Z1_00684 529507.PMI3363 0.0 1291.9 Proteus mutL GO:0000018,GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030554,GO:0031323,GO:0032300,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1990391 ko:K03572 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MV61@1224,1RM89@1236,3Z1J7@583,COG0323@1,COG0323@2 NA|NA|NA L This protein is involved in the repair of mismatches in DNA. It is required for dam-dependent methyl-directed DNA mismatch repair. May act as a molecular matchmaker , a protein that promotes the formation of a stable complex between two or more DNA-binding proteins in an ATP-dependent manner without itself being part of a final effector complex Z1_00685 529507.PMI3362 2e-223 781.6 Proteus amiB GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0007049,GO:0008150,GO:0008745,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032505,GO:0042597,GO:0043093,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061783 3.5.1.28 ko:K01448 ko01503,map01503 M00727 R04112 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01011,ko03036 iG2583_1286.G2583_4996 Bacteria 1MUQK@1224,1RMP1@1236,3Z138@583,COG0860@1,COG0860@2 NA|NA|NA M N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase Z1_00686 529507.PMI3361 4.1e-83 313.9 Proteus yjeE GO:0000166,GO:0002949,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043531,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0070525,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 ko:K06925 ko00000,ko03016 Bacteria 1RGYU@1224,1S6IB@1236,3Z2RM@583,COG0802@1,COG0802@2 NA|NA|NA S Threonylcarbamoyl adenosine biosynthesis protein TsaE Z1_00687 529507.PMI3360 7.5e-227 792.7 Proteus queG GO:0003674,GO:0003824,GO:0006091,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008616,GO:0009055,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009163,GO:0009987,GO:0016491,GO:0018130,GO:0019438,GO:0022900,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042455,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046116,GO:0046483,GO:0052693,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 1.17.99.6 ko:K18979 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MV1H@1224,1RMD9@1236,3Z152@583,COG1600@1,COG1600@2 NA|NA|NA C Catalyzes the conversion of epoxyqueuosine (oQ) to queuosine (Q), which is a hypermodified base found in the wobble positions of tRNA(Asp), tRNA(Asn), tRNA(His) and tRNA(Tyr) Z1_00688 529507.PMI3359 2.6e-37 161.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1N8QY@1224,1SFWC@1236,COG2161@1,COG2161@2 NA|NA|NA D Antitoxin component of a toxin-antitoxin (TA) module Z1_00689 529507.PMI3358 5.5e-50 203.4 Gammaproteobacteria GO:0002790,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0030255,GO:0032940,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042886,GO:0043684,GO:0044097,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046903,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0097159,GO:1901363 ko:K19092 ko00000,ko02048 Bacteria 1REHT@1224,1SCDD@1236,COG3668@1,COG3668@2 NA|NA|NA S ParE toxin of type II toxin-antitoxin system, parDE Z1_00693 529507.PMI3357 3.7e-99 367.5 Proteus orn GO:0000175,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004532,GO:0004536,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008297,GO:0008310,GO:0008408,GO:0008946,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0016896,GO:0019439,GO:0034611,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0140097,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K13288 ko03008,map03008 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009,ko03019 Bacteria 1R9WX@1224,1S217@1236,3Z2FP@583,COG1949@1,COG1949@2 NA|NA|NA L 3'-to-5' exoribonuclease specific for small oligoribonucleotides Z1_00694 529507.PMI3356 1.8e-195 688.3 Proteus rsgA GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019003,GO:0022613,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0036094,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 3.1.3.100 ko:K06949 ko00730,ko01100,map00730,map01100 R00615,R02135 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 iAF1260.b4161,iBWG_1329.BWG_3876,iECDH10B_1368.ECDH10B_4356,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_4021,iEKO11_1354.EKO11_4148,iEcDH1_1363.EcDH1_3829,iEcolC_1368.EcolC_3849,iJO1366.b4161,iUMNK88_1353.UMNK88_5099,iY75_1357.Y75_RS21675 Bacteria 1MUEF@1224,1RMMB@1236,3Z2E4@583,COG1162@1,COG1162@2 NA|NA|NA S One of several proteins that assist in the late maturation steps of the functional core of the 30S ribosomal subunit. Helps release RbfA from mature subunits. May play a role in the assembly of ribosomal proteins into the subunit. Circularly permuted GTPase that catalyzes slow GTP hydrolysis, GTPase activity is stimulated by the 30S ribosomal subunit Z1_00695 529507.PMI3355 4.9e-173 613.6 Proteus psd GO:0003674,GO:0003824,GO:0004609,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0019637,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 4.1.1.65 ko:K01613 ko00564,ko01100,ko01110,map00564,map01100,map01110 M00093 R02055 RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_4379,iECSF_1327.ECSF_4049 Bacteria 1MVT4@1224,1RN1U@1236,3Z2K5@583,COG0688@1,COG0688@2 NA|NA|NA I Catalyzes the formation of phosphatidylethanolamine (PtdEtn) from phosphatidylserine (PtdSer) Z1_00696 529507.PMI3354 0.0 2060.4 Proteus yjeP ko:K05802,ko:K22051 ko00000,ko02000 1.A.23.1.1,1.A.23.1.2,1.A.23.1.3 Bacteria 1MWSA@1224,1RMYY@1236,3Z1FC@583,COG3206@1,COG3206@2,COG3264@1,COG3264@2 NA|NA|NA M Mechanosensitive ion channel inner membrane domain 1 Z1_00697 529507.PMI3353 6e-112 410.2 Proteus allS ko:K10972 ko00000,ko03000 Bacteria 1MZTA@1224,1RN7R@1236,3Z2J1@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K LysR substrate binding domain Z1_00698 529507.PMI3352 2.5e-89 334.7 Proteus ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1N294@1224,1S5GD@1236,3Z2QI@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00699 529507.PMI3350 5.4e-121 440.3 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1NU06@1224,1SMR8@1236,3Z14N@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_00700 529507.PMI3349 0.0 1656.3 Proteus ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z1ND@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU usher protein Z1_00701 529507.PMI3348 2.6e-191 674.5 Proteus Bacteria 1R5WQ@1224,1S80K@1236,3Z1FQ@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_00702 529507.PMI3034 2.4e-74 284.6 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00703 529507.PMI2338 1.5e-222 778.5 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_00704 529507.PMI3347 2.3e-150 538.1 Proteus yigL GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0033883,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050308 iUTI89_1310.UTI89_C4390 Bacteria 1MV02@1224,1RP1D@1236,3Z170@583,COG0561@1,COG0561@2 NA|NA|NA S Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase Z1_00705 529507.PMI3346 5e-195 686.8 Proteus pldB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004620,GO:0004622,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016298,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016787,GO:0016788,GO:0044238,GO:0044464,GO:0052689,GO:0071704,GO:0071944 3.1.1.5 ko:K01048 ko00564,map00564 ko00000,ko00001,ko01000 iETEC_1333.ETEC_4102,iEcHS_1320.EcHS_A4049 Bacteria 1MWDA@1224,1RRJP@1236,3Z2C2@583,COG2267@1,COG2267@2 NA|NA|NA I Serine aminopeptidase, S33 Z1_00706 529507.PMI3345 0.0 1229.5 Proteus recQ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005657,GO:0005694,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009295,GO:0009378,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017116,GO:0017117,GO:0030894,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033202,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043138,GO:0043140,GO:0043142,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043590,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1902494,GO:1904949 3.6.4.12 ko:K03654 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVGG@1224,1RMPG@1236,3Z21D@583,COG0514@1,COG0514@2 NA|NA|NA L RQC Z1_00707 529507.PMI3344 1.3e-170 605.5 Proteus pldA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004620,GO:0004623,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008970,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016298,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031975,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045203,GO:0046872,GO:0046983,GO:0052689,GO:0071944 3.1.1.32,3.1.1.4 ko:K01058 ko00564,ko00565,ko00590,ko00591,ko00592,ko01100,ko01110,map00564,map00565,map00590,map00591,map00592,map01100,map01110 R01315,R01316,R01317,R02053,R02054,R04034,R07064,R07379,R07387,R07859,R07860 RC00020,RC00037,RC00041,RC00094 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_4201,iECUMN_1333.ECUMN_4347,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4188 Bacteria 1PC8I@1224,1RMJH@1236,3Z15Y@583,COG2829@1,COG2829@2 NA|NA|NA M Phospholipase A1 Z1_00708 529507.PMI3343 1.6e-79 302.0 Proteus yigI GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N5HF@1224,1RNAK@1236,3Z17J@583,COG2050@1,COG2050@2 NA|NA|NA Q Thioesterase superfamily Z1_00709 529507.PMI3342 2.9e-162 577.8 Proteus rarD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071944 ko:K05786 ko00000,ko02000 2.A.7.7 Bacteria 1MX5G@1224,1RMAC@1236,3Z1FM@583,COG2962@1,COG2962@2 NA|NA|NA S EamA-like transporter family Z1_00710 529507.PMI3341 2.7e-62 244.6 Proteus Bacteria 1QG5Y@1224,1TDIT@1236,29RA9@1,30CBW@2,3Z32C@583 NA|NA|NA Z1_00711 529507.PMI3340 0.0 1431.4 Proteus uvrD GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006289,GO:0006298,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015616,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017116,GO:0022607,GO:0031297,GO:0032392,GO:0032508,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043142,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045005,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051276,GO:0051716,GO:0065003,GO:0070035,GO:0070581,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901576 3.6.4.12 ko:K03656,ko:K03657 ko03420,ko03430,map03420,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MU0G@1224,1RNJI@1236,3Z210@583,COG0210@1,COG0210@2 NA|NA|NA L DNA helicase Z1_00712 529507.PMI3339 3.4e-137 494.2 Proteus yigB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0017144,GO:0018130,GO:0022611,GO:0032502,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042578,GO:0042726,GO:0042727,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043726,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.1.3.10,3.1.3.102,3.1.3.104 ko:K07025,ko:K20862,ko:K20866 ko00010,ko00740,ko01100,ko01110,ko01120,map00010,map00740,map01100,map01110,map01120 M00125 R00548,R00947,R07280 RC00017,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1N0I6@1224,1RQ41@1236,3Z2U3@583,COG1011@1,COG1011@2 NA|NA|NA S Hydrolase Z1_00713 529507.PMI3338 1.2e-166 592.4 Proteus xerC GO:0000150,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006276,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008907,GO:0009009,GO:0009037,GO:0009987,GO:0015074,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042150,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048476,GO:0071139,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363 ko:K03733 ko00000,ko03036 Bacteria 1MUJJ@1224,1RMJG@1236,3Z17W@583,COG4973@1,COG4973@2 NA|NA|NA D Phage integrase, N-terminal SAM-like domain Z1_00714 529507.PMI3337 2.4e-130 471.5 Proteus yigA ko:K09921 ko00000 Bacteria 1R4BP@1224,1S9SC@1236,3Z1FN@583,COG3159@1,COG3159@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF484 Z1_00715 529507.PMI3336 1.3e-156 558.9 Proteus dapF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008837,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016855,GO:0019752,GO:0036361,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0047661,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 5.1.1.7 ko:K01778 ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00527 R02735 RC00302 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECED1_1282.ECED1_4494 Bacteria 1MWDH@1224,1RMGV@1236,3Z2N3@583,COG0253@1,COG0253@2 NA|NA|NA E Catalyzes the stereoinversion of LL-2,6- diaminoheptanedioate (L,L-DAP) to meso-diaminoheptanedioate (meso- DAP), a precursor of L-lysine Z1_00716 529507.PMI3335 7.1e-22 109.0 Proteus yifL Bacteria 1NHR0@1224,1SGSW@1236,3Z32J@583,COG5567@1,COG5567@2 NA|NA|NA N Prokaryotic lipoprotein-attachment site Z1_00717 529507.PMI3334 2.1e-54 218.0 Proteus cyaY GO:0003674,GO:0003824,GO:0004322,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008199,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0016491,GO:0016530,GO:0016722,GO:0016724,GO:0018282,GO:0018283,GO:0019538,GO:0019725,GO:0022607,GO:0030003,GO:0031163,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034986,GO:0036211,GO:0042221,GO:0042592,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046916,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0051716,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0071704,GO:0071840,GO:0098771,GO:0140104,GO:1901564 1.16.3.1 ko:K06202,ko:K19054 ko00860,map00860 R00078 RC02758 ko00000,ko00001,ko01000,ko03029 iECW_1372.ECW_m4108,iEKO11_1354.EKO11_4552,iWFL_1372.ECW_m4108 Bacteria 1RH9A@1224,1S5UP@1236,3Z2SH@583,COG1965@1,COG1965@2 NA|NA|NA P Frataxin-like domain Z1_00718 529507.PMI3333 0.0 1778.5 Proteus cyaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004016,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006171,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009187,GO:0009190,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009975,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016849,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046058,GO:0046390,GO:0046483,GO:0052652,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.6.1.1 ko:K05851 ko00230,ko02026,ko05111,map00230,map02026,map05111 R00089,R00434 RC00295 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2672,iECOK1_1307.ECOK1_4253,iECS88_1305.ECS88_4229,iUMN146_1321.UM146_19155,iUTI89_1310.UTI89_C4365 Bacteria 1PI5T@1224,1RMPZ@1236,3Z1IV@583,COG3072@1,COG3072@2 NA|NA|NA F adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (adenylyl cyclase) K05851 Z1_00719 529507.PMI3332 2.8e-171 607.8 Proteus hemC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004418,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006782,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0018065,GO:0018130,GO:0018160,GO:0018193,GO:0018198,GO:0019438,GO:0019538,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0036211,GO:0042168,GO:0042440,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046501,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.107,2.5.1.61,4.2.1.75 ko:K01749,ko:K13542 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R00084,R03165,R03194 RC00003,RC00871,RC01861,RC02317 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_4275,iECH74115_1262.ECH74115_5243,iECIAI1_1343.ECIAI1_3991,iECO103_1326.ECO103_4362,iECO111_1330.ECO111_4628,iECO26_1355.ECO26_4784,iECSE_1348.ECSE_4086,iEKO11_1354.EKO11_4554,iHN637.CLJU_RS15760,iPC815.YPO3849 Bacteria 1MU56@1224,1RMQ8@1236,3Z1WJ@583,COG0181@1,COG0181@2 NA|NA|NA H Tetrapolymerization of the monopyrrole PBG into the hydroxymethylbilane pre-uroporphyrinogen in several discrete steps Z1_00720 529507.PMI3331 6.9e-133 479.9 Proteus hemD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004852,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006782,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0042168,GO:0042440,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046501,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.107,2.5.1.61,4.2.1.75 ko:K01719,ko:K01749,ko:K02496,ko:K13542,ko:K13543 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R00084,R03165,R03194 RC00003,RC00871,RC01861,RC02317 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_0187,iSBO_1134.SBO_3815 Bacteria 1MWZD@1224,1RM9K@1236,3Z14T@583,COG1587@1,COG1587@2 NA|NA|NA H Uroporphyrinogen-III synthase HemD Z1_00721 34506.g1437 2.4e-223 781.2 Bilateria Metazoa 2D1C0@1,2SHJ7@2759,3AGFM@33154,3BXBB@33208,3DFXH@33213 NA|NA|NA S HemX, putative uroporphyrinogen-III C-methyltransferase Z1_00722 529507.PMI3329 8e-227 792.7 Proteus hemY GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02498 ko00000 Bacteria 1MU7A@1224,1RMRG@1236,3Z249@583,COG3071@1,COG3071@2 NA|NA|NA H HemY protein N-terminus Z1_00723 529507.PMI3328 7.4e-52 209.5 Proteus Bacteria 1QG4W@1224,1TDHK@1236,29DRC@1,300P7@2,3Z2YS@583 NA|NA|NA Z1_00728 529507.PMI3327 3.2e-138 497.7 Proteus rffM GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0046378,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 2.4.1.180,2.4.1.187 ko:K02852,ko:K05946 ko05111,map05111 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 GT26 iLF82_1304.LF82_1862 Bacteria 1N1HD@1224,1RP6P@1236,3Z116@583,COG1922@1,COG1922@2 NA|NA|NA F Catalyzes the synthesis of Und-PP-GlcNAc-ManNAcA (Lipid II), the second lipid-linked intermediate involved in enterobacterial common antigen (ECA) synthesis Z1_00729 529507.PMI3326 3e-251 874.0 Proteus wzyE GO:0000271,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044464,GO:0046378,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 ko:K02853 ko00000,ko01000,ko01003 Bacteria 1MVRX@1224,1RR2C@1236,2DB7H@1,2Z7MA@2,3Z1B5@583 NA|NA|NA S Probably involved in the polymerization of enterobacterial common antigen (ECA) trisaccharide repeat units Z1_00730 529507.PMI3325 3.5e-210 737.3 Proteus rffT GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008417,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0036065,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0046378,GO:0070085,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 2.4.1.325 ko:K02853,ko:K12582 R10303 RC00005,RC00049 ko00000,ko01000,ko01003 GT56 iETEC_1333.ETEC_4075,iSFV_1184.SFV_3711,iSF_1195.SF3867,iSFxv_1172.SFxv_4213,iS_1188.S3893 Bacteria 1PBI5@1224,1RQBD@1236,3Z1WY@583,COG0554@1,COG0554@2 NA|NA|NA H Catalyzes the synthesis of Und-PP-GlcNAc-ManNAcA-Fuc4NAc (Lipid III), the third lipid-linked intermediate involved in ECA synthesis Z1_00731 529507.PMI3324 1.1e-218 765.8 Proteus wzxE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03328,ko:K16693 ko00000,ko02000 2.A.66.2,2.A.66.2.3 iSDY_1059.SDY_3956 Bacteria 1MV5E@1224,1RP0A@1236,3Z0YX@583,COG2244@1,COG2244@2 NA|NA|NA U Mediates the transbilayer movement of Und-PP-GlcNAc- ManNAcA-Fuc4NAc (lipid III) from the inner to the outer leaflet of the cytoplasmic membrane during the assembly of enterobacterial common antigen (ECA) Z1_00732 34506.g926 2.8e-218 764.2 Bilateria Metazoa 2S4C7@2759,3A83Q@33154,3CCYG@33208,3DAH3@33213,COG0399@1 NA|NA|NA E DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family Z1_00733 529507.PMI3322 7.3e-132 476.5 Proteus wecD GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046378,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 2.3.1.210 ko:K16704 ko00000,ko01000 iAF1260.b3790,iBWG_1329.BWG_3472,iECBD_1354.ECBD_4249,iECDH10B_1368.ECDH10B_3979,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3672,iECIAI39_1322.ECIAI39_2997,iECNA114_1301.ECNA114_3928,iEcDH1_1363.EcDH1_4186,iEcolC_1368.EcolC_4213,iJO1366.b3790,iJR904.b3790,iSFV_1184.SFV_3714,iY75_1357.Y75_RS18130 Bacteria 1PHCJ@1224,1RYNF@1236,3Z25C@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Catalyzes the acetylation of dTDP-fucosamine (dTDP-4- amino-4,6-dideoxy-D-galactose) to dTDP-Fuc4NAc, which is utilized in the biosynthesis of the enterobacterial common antigen (ECA) Z1_00734 529507.PMI3321 3.5e-168 597.4 Proteus rfbA GO:0000271,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008879,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009117,GO:0009141,GO:0009147,GO:0009200,GO:0009211,GO:0009219,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009262,GO:0009394,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019299,GO:0019300,GO:0019305,GO:0019318,GO:0019319,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0030312,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0040007,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045226,GO:0046075,GO:0046364,GO:0046379,GO:0046383,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072527,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 2.7.7.24 ko:K00973 ko00521,ko00523,ko00525,ko01130,map00521,map00523,map00525,map01130 M00793 R02328 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iNJ661.Rv0334,iUMNK88_1353.UMNK88_4598,iYL1228.KPN_04289 Bacteria 1MU0X@1224,1RMTR@1236,3Z1VC@583,COG1209@1,COG1209@2 NA|NA|NA H Catalyzes the formation of dTDP-glucose, from dTTP and glucose 1-phosphate, as well as its pyrophosphorolysis Z1_00735 34506.g925 5.5e-208 729.9 Rhabditida Nematoda 1KYEF@119089,39ADA@33154,3BF2W@33208,3CWS2@33213,40FTF@6231,40UIK@6236,COG1004@1,COG1088@1,KOG0747@2759,KOG2666@2759 NA|NA|NA G Male sterility protein Z1_00736 529507.PMI3319 1.8e-242 844.7 Proteus wecC GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046378,GO:0055114,GO:0071704,GO:0089714,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 1.1.1.336 ko:K02472,ko:K02474 ko00520,ko05111,map00520,map05111 R03317,R06894 RC00291 ko00000,ko00001,ko01000,ko01005 iECSE_1348.ECSE_4070 Bacteria 1MUC6@1224,1RMX0@1236,3Z0VS@583,COG0677@1,COG0677@2 NA|NA|NA C Catalyzes the four-electron oxidation of UDP-N-acetyl-D- mannosamine (UDP-ManNAc), reducing NAD( ) and releasing UDP-N- acetylmannosaminuronic acid (UDP-ManNAcA) Z1_00737 529507.PMI3318 1.7e-215 755.0 Proteus wecB GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008761,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046378,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 5.1.3.14 ko:K01791 ko00520,ko01100,ko05111,map00520,map01100,map05111 M00362 R00420 RC00290 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iECOK1_1307.ECOK1_4232,iECS88_1305.ECS88_4208,iECs_1301.ECs4719,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4150,iG2583_1286.G2583_4580,iPC815.YPO3864,iSDY_1059.SDY_3962,iSSON_1240.SSON_3958,iUMN146_1321.UM146_19070,iZ_1308.Z5297 Bacteria 1MWZN@1224,1RPNC@1236,3Z2DW@583,COG0381@1,COG0381@2 NA|NA|NA M Catalyzes the reversible epimerization at C-2 of UDP-N- acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) and thereby provides bacteria with UDP-N-acetylmannosamine (UDP-ManNAc), the activated donor of ManNAc residues Z1_00738 529507.PMI3317 1.7e-193 681.8 Proteus wzzE GO:0000271,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009246,GO:0009987,GO:0016051,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0046378,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 ko:K05789,ko:K05790 ko00000,ko01005 iAF1260.b3785,iB21_1397.B21_03612,iBWG_1329.BWG_3467,iECBD_1354.ECBD_4254,iECB_1328.ECB_03663,iECDH10B_1368.ECDH10B_3974,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3667,iECD_1391.ECD_03663,iECH74115_1262.ECH74115_5218,iECIAI1_1343.ECIAI1_3972,iECSP_1301.ECSP_4833,iECUMN_1333.ECUMN_4310,iETEC_1333.ETEC_4067,iEcDH1_1363.EcDH1_4191,iEcE24377_1341.EcE24377A_4296,iEcHS_1320.EcHS_A4002,iJO1366.b3785,iSF_1195.SF3859,iS_1188.S3901,iSbBS512_1146.SbBS512_E4136,iUMNK88_1353.UMNK88_4594,iY75_1357.Y75_RS18155 Bacteria 1MW70@1224,1RRBS@1236,3Z13Y@583,COG3765@1,COG3765@2 NA|NA|NA M Modulates the polysaccharide chain length of enterobacterial common antigen (ECA) Z1_00739 529507.PMI3316 9.5e-200 702.6 Proteus wecA GO:0000271,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008963,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009246,GO:0009274,GO:0009276,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0030145,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0042546,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045229,GO:0046378,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 2.7.8.33,2.7.8.35,5.1.3.14 ko:K01791,ko:K02851 ko00520,ko01100,ko05111,map00520,map01100,map05111 M00362 R00420,R08856 RC00002,RC00290 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 iAF987.Gmet_1505,iECSF_1327.ECSF_3624 Bacteria 1MWYW@1224,1RNAP@1236,3Z1Y3@583,COG0472@1,COG0472@2 NA|NA|NA H Catalyzes the transfer of the GlcNAc-1-phosphate moiety from UDP-GlcNAc onto the carrier lipid undecaprenyl phosphate (C55-P), yielding GlcNAc-pyrophosphoryl-undecaprenyl (GlcNAc-PP- C55) Z1_00740 529507.PMI3314 1.2e-233 815.5 Proteus rho GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006353,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 ko:K02887,ko:K03628 ko03010,ko03018,map03010,map03018 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011,ko03019,ko03021 Bacteria 1MUCF@1224,1RP95@1236,3Z1VN@583,COG1158@1,COG1158@2 NA|NA|NA K Facilitates transcription termination by a mechanism that involves Rho binding to the nascent RNA, activation of Rho's RNA-dependent ATPase activity, and release of the mRNA from the DNA template Z1_00741 529507.PMI3313 6.7e-56 223.0 Proteus trxA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004791,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0016671,GO:0019725,GO:0033554,GO:0034599,GO:0042221,GO:0042592,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045454,GO:0047134,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1990748 ko:K03671 ko04621,ko05418,map04621,map05418 ko00000,ko00001,ko03110 iECW_1372.ECW_m4079,iECs_1301.ECs4714,iEKO11_1354.EKO11_4576,iG2583_1286.G2583_4574,iSBO_1134.SBO_3791,iSDY_1059.SDY_3968,iSF_1195.SF3854,iSSON_1240.SSON_3952,iS_1188.S3905,iWFL_1372.ECW_m4079,iZ_1308.Z5291 Bacteria 1MZBB@1224,1S5WR@1236,3Z2RW@583,COG3118@1,COG3118@2 NA|NA|NA O Thioredoxin Z1_00742 529507.PMI3312 9e-237 825.9 Proteus rhlB GO:0003674,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0010501,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019439,GO:0019904,GO:0034641,GO:0034655,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0070035,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097718,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 3.6.4.13 ko:K03732 ko03018,map03018 M00394 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03019 Bacteria 1MU49@1224,1RMWA@1236,3Z2GV@583,COG0513@1,COG0513@2 NA|NA|NA F Belongs to the DEAD box helicase family Z1_00743 529507.PMI3311 1.4e-270 938.3 Proteus gppA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006807,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008894,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0015949,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042594,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071496,GO:0071704,GO:1901360 3.6.1.11,3.6.1.40 ko:K01524 ko00230,map00230 R03409 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c42590,iECED1_1282.ECED1_4463 Bacteria 1MV35@1224,1RN3V@1236,3Z1R0@583,COG0248@1,COG0248@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of pppGpp to ppGpp. Guanosine pentaphosphate (pppGpp) is a cytoplasmic signaling molecule which together with ppGpp controls the stringent response , an adaptive process that allows bacteria to respond to amino acid starvation, resulting in the coordinated regulation of numerous cellular activities Z1_00744 529507.PMI3310 0.0 1330.1 Proteus rep GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006268,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007049,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022402,GO:0032392,GO:0032508,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044786,GO:0044787,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051276,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901576 3.6.4.12 ko:K03656,ko:K03657 ko03420,ko03430,map03420,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MU0G@1224,1RNJI@1236,3Z0V9@583,COG0210@1,COG0210@2 NA|NA|NA L it can initiate unwinding at a nick in the DNA. It binds to the single-stranded DNA and acts in a progressive fashion along the DNA in the 3' to 5' direction Z1_00745 529507.PMI3309 3.1e-37 160.6 Proteus Bacteria 1PTFU@1224,1TE0H@1236,2AE8S@1,3142U@2,3Z3GY@583 NA|NA|NA Z1_00746 471881.PROPEN_00590 1.3e-44 185.3 Proteus yafQ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004540,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016892,GO:0016894,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019538,GO:0022411,GO:0032984,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0042221,GO:0042710,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043565,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044010,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044764,GO:0044877,GO:0046483,GO:0046677,GO:0046700,GO:0048519,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051704,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0097159,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 ko:K19157 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1N9NX@1224,1SCBQ@1236,3Z3H3@583,COG3041@1,COG3041@2 NA|NA|NA S ParE toxin of type II toxin-antitoxin system, parDE Z1_00747 34506.g681 2e-280 971.1 Bilateria Metazoa 2QQBF@2759,38GR1@33154,3BZI1@33208,3DFRU@33213,COG0059@1 NA|NA|NA E ketol-acid reductoisomerase, mitochondrial-like Z1_00748 529507.PMI3304 2.5e-169 601.3 Proteus ilvY GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 ko:K02521 ko00000,ko03000 Bacteria 1MZX1@1224,1RNFR@1236,3Z1E4@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00749 529507.PMI3303 6.1e-296 1022.7 Proteus ilvA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004794,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006549,GO:0006566,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009097,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016597,GO:0016829,GO:0016840,GO:0016841,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0031406,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 4.3.1.19 ko:K01754 ko00260,ko00290,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00290,map01100,map01110,map01130,map01200,map01230 M00570 R00220,R00996 RC00418,RC02600 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2699 Bacteria 1MVWJ@1224,1RMY6@1236,3Z279@583,COG1171@1,COG1171@2 NA|NA|NA E Catalyzes the anaerobic formation of alpha-ketobutyrate and ammonia from threonine in a two-step reaction. The first step involved a dehydration of threonine and a production of enamine intermediates (aminocrotonate), which tautomerizes to its imine form (iminobutyrate). Both intermediates are unstable and short- lived. The second step is the nonenzymatic hydrolysis of the enamine imine intermediates to form 2-ketobutyrate and free ammonia. In the low water environment of the cell, the second step is accelerated by RidA Z1_00750 529507.PMI3302 0.0 1214.1 Proteus ilvD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004160,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006549,GO:0006573,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009097,GO:0009099,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 4.2.1.9 ko:K01687 ko00290,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R01209,R04441,R05070 RC00468,RC01714 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_1259,iECIAI39_1322.ECIAI39_3015 Bacteria 1MUTQ@1224,1RMP2@1236,3Z1C0@583,COG0129@1,COG0129@2 NA|NA|NA H Belongs to the IlvD Edd family Z1_00751 529507.PMI3301 4e-178 630.6 Proteus ilvE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004084,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006531,GO:0006532,GO:0006551,GO:0006573,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009098,GO:0009099,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.6.1.21,2.6.1.42 ko:K00824,ko:K00826 ko00270,ko00280,ko00290,ko00310,ko00330,ko00360,ko00472,ko00473,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00270,map00280,map00290,map00310,map00330,map00360,map00472,map00473,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00036,M00119,M00570 R01090,R01148,R01214,R01582,R02199,R02459,R02851,R02924,R05053,R10991 RC00006,RC00008,RC00025,RC00036 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iB21_1397.B21_03597,iECBD_1354.ECBD_4269,iECB_1328.ECB_03648,iECD_1391.ECD_03648,iECO103_1326.ECO103_4394 Bacteria 1MVB0@1224,1RP6Z@1236,3Z18D@583,COG0115@1,COG0115@2 NA|NA|NA E Belongs to the class-IV pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase family Z1_00752 529507.PMI3300 6.5e-44 183.0 Proteus ilvM GO:0003674,GO:0003824,GO:0003984,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016744,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.2.1.6 ko:K01653,ko:K11258 ko00290,ko00650,ko00660,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00650,map00660,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R00006,R00014,R00226,R03050,R04672,R04673,R08648 RC00027,RC00106,RC01192,RC02744,RC02893 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MZ9W@1224,1S8VQ@1236,3Z30U@583,COG3978@1,COG3978@2 NA|NA|NA S ACT domain Z1_00753 529507.PMI3299 0.0 1079.3 Proteus ilvG 2.2.1.6 ko:K01652 ko00290,ko00650,ko00660,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00650,map00660,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R00006,R00014,R00226,R03050,R04672,R04673,R08648 RC00027,RC00106,RC01192,RC02744,RC02893 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU6U@1224,1RMQQ@1236,3Z1PC@583,COG0028@1,COG0028@2 NA|NA|NA H acetolactate synthase Z1_00754 529507.PMI3297 3e-284 983.8 Proteus comM GO:0003674,GO:0003824,GO:0004176,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019538,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044238,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K07391 ko00000 Bacteria 1MU4R@1224,1RMB9@1236,3Z274@583,COG0606@1,COG0606@2 NA|NA|NA O Magnesium chelatase, subunit ChlI Z1_00755 529507.PMI3296 2.5e-58 231.1 Proteus yifE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006996,GO:0007059,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051276,GO:0071840 ko:K09897 ko00000 Bacteria 1RD72@1224,1S3NW@1236,3Z2ZU@583,COG3085@1,COG3085@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF Z1_00756 529507.PMI3295 2e-149 535.0 Proteus hdfR GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 Bacteria 1MXXA@1224,1RREE@1236,3Z2GN@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Negatively regulates the transcription of the flagellar master operon flhDC by binding to the upstream region of the operon Z1_00764 529507.PMI3294 2.3e-88 331.6 Proteus yrdA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051259,GO:0051260,GO:0065003,GO:0070206,GO:0070207,GO:0071840 ko:K08279,ko:K08699 ko00000 Bacteria 1RD76@1224,1RPB6@1236,3Z2XJ@583,COG0663@1,COG0663@2 NA|NA|NA S Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) Z1_00765 529507.PMI3293 7.3e-45 186.0 Proteus Bacteria 1QCUA@1224,1T8MG@1236,2E6QS@1,300YT@2,3Z34N@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1488) Z1_00766 529507.PMI3292 1e-153 549.3 Proteus aroE GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004764,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009423,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019632,GO:0019752,GO:0032787,GO:0036094,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901615 1.1.1.25 ko:K00014 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02413 RC00206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_3165,iECOK1_1307.ECOK1_3701,iECS88_1305.ECS88_3669,iECUMN_1333.ECUMN_3755,iSBO_1134.SBO_3275,iUMN146_1321.UM146_16315,iUTI89_1310.UTI89_C3726 Bacteria 1MVH4@1224,1RPB7@1236,3Z1GV@583,COG0169@1,COG0169@2 NA|NA|NA E Involved in the biosynthesis of the chorismate, which leads to the biosynthesis of aromatic amino acids. Catalyzes the reversible NADPH linked reduction of 3-dehydroshikimate (DHSA) to yield shikimate (SA) Z1_00767 529507.PMI3291 1.5e-103 382.1 Proteus tsaC GO:0000049,GO:0000166,GO:0002949,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003725,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006450,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061710,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070525,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 2.7.7.87 ko:K07479,ko:K07566 R10463 RC00745 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MVPM@1224,1S610@1236,3Z0X8@583,COG0009@1,COG0009@2 NA|NA|NA J Required for the formation of a threonylcarbamoyl group on adenosine at position 37 (t(6)A37) in tRNAs that read codons beginning with adenine. Catalyzes the conversion of L-threonine, HCO(3)(-) CO(2) and ATP to give threonylcarbamoyl-AMP (TC-AMP) as the acyladenylate intermediate, with the release of diphosphate Z1_00768 529507.PMI3290 5.6e-87 327.0 Proteus yrdD GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005506,GO:0008270,GO:0043167,GO:0043169,GO:0046872,GO:0046914,GO:0097159,GO:1901363 5.99.1.2 ko:K03169,ko:K07479 ko00000,ko01000,ko03032 Bacteria 1MX2E@1224,1RQ85@1236,3Z1ZR@583,COG0551@1,COG0551@2 NA|NA|NA L Topoisomerase DNA binding C4 zinc finger Z1_00769 529507.PMI3289 2.4e-212 744.6 Proteus dprA ko:K04096 ko00000 Bacteria 1MVF6@1224,1RPJE@1236,3Z1RV@583,COG0758@1,COG0758@2 NA|NA|NA LU DNA recombination-mediator protein A Z1_00770 529507.PMI3288 5.5e-89 333.6 Proteus def GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008270,GO:0008463,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0018193,GO:0018206,GO:0019538,GO:0031365,GO:0036211,GO:0042586,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043686,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:1901564 3.5.1.88 ko:K01462 ko00000,ko01000 Bacteria 1RA2P@1224,1S247@1236,3Z20Q@583,COG0242@1,COG0242@2 NA|NA|NA J Removes the formyl group from the N-terminal Met of newly synthesized proteins. Requires at least a dipeptide for an efficient rate of reaction. N-terminal L-methionine is a prerequisite for activity but the enzyme has broad specificity at other positions Z1_00771 529507.PMI3287 5.1e-181 640.2 Proteus fmt GO:0003674,GO:0003824,GO:0004479,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006418,GO:0006431,GO:0006464,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0019538,GO:0019752,GO:0019988,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0036211,GO:0040007,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071951,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.176,2.1.2.9 ko:K00604,ko:K03500 ko00670,ko00970,map00670,map00970 R03940 RC00026,RC00165 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 iECABU_c1320.ECABU_c37050,iECUMN_1333.ECUMN_3761,ic_1306.c4048 Bacteria 1MU4Q@1224,1RP1T@1236,3Z266@583,COG0223@1,COG0223@2 NA|NA|NA J Attaches a formyl group to the free amino group of methionyl-tRNA(fMet). The formyl group appears to play a dual role in the initiator identity of N-formylmethionyl-tRNA by promoting its recognition by IF2 and preventing the misappropriation of this tRNA by the elongation apparatus Z1_00772 529507.PMI3286 1.2e-246 858.6 Proteus sun GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008169,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009383,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016434,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0030312,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.176 ko:K03500 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MWPE@1224,1RN8X@1236,3Z1UI@583,COG0144@1,COG0144@2,COG0781@1,COG0781@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the cytosine at position 967 (m5C967) of 16S rRNA Z1_00773 529507.PMI3285 1.2e-252 878.6 Proteus trkA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015672,GO:0016020,GO:0022857,GO:0030001,GO:0034220,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0098655 ko:K03499,ko:K05571 ko00000,ko02000 2.A.38.1,2.A.38.4,2.A.63.1,2.A.63.2 iE2348C_1286.E2348C_3552 Bacteria 1MW8R@1224,1RNVQ@1236,3Z19G@583,COG0569@1,COG0569@2 NA|NA|NA C TrkA-N domain Z1_00774 529507.PMI3284 4.7e-67 260.4 Proteus mscL GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006884,GO:0008150,GO:0008361,GO:0008381,GO:0009987,GO:0009992,GO:0015075,GO:0015267,GO:0015318,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0019725,GO:0022803,GO:0022836,GO:0022838,GO:0022857,GO:0030104,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032535,GO:0034220,GO:0042592,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048878,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090066 ko:K03282 ko00000,ko02000 1.A.22.1 Bacteria 1RHG8@1224,1S3PD@1236,3Z2IX@583,COG1970@1,COG1970@2 NA|NA|NA M Channel that opens in response to stretch forces in the membrane lipid bilayer. May participate in the regulation of osmotic pressure changes within the cell Z1_00775 529507.PMI3283 5.1e-30 136.3 Proteus arfA GO:0000049,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0034248,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043023,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044877,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051246,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072344,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2000112 ko:K09890 ko00000,ko03012 Bacteria 1N709@1224,1SDRD@1236,3Z34I@583,COG3036@1,COG3036@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function Z1_00776 529507.PMI3282 7.1e-71 273.1 Proteus zntR GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001121,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001140,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K13638,ko:K19591 M00769 ko00000,ko00002,ko01504,ko03000 Bacteria 1MZ3P@1224,1SA5G@1236,3Z2NU@583,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K MerR, DNA binding Z1_00777 529507.PMI3281 5.6e-62 243.4 Proteus rplQ GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02879,ko:K16193 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RCWN@1224,1S3QK@1236,3Z2S7@583,COG0203@1,COG0203@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L17 Z1_00778 529507.PMI3280 7e-181 639.8 Proteus rpoA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003899,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006354,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034062,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:0097747,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 2.7.7.6 ko:K03040 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020 M00183 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400 Bacteria 1MU75@1224,1RMU3@1236,3Z1FF@583,COG0202@1,COG0202@2 NA|NA|NA K DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates Z1_00779 529507.PMI3279 2.2e-108 398.3 Proteus rpsD GO:0000028,GO:0000900,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006355,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006450,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010628,GO:0010629,GO:0015935,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030371,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034250,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043244,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045182,GO:0045727,GO:0045903,GO:0045947,GO:0048027,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090079,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903506,GO:1990145,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02986 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MW0U@1224,1RQ38@1236,3Z2SQ@583,COG0522@1,COG0522@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins, it binds directly to 16S rRNA where it nucleates assembly of the body of the 30S subunit Z1_00780 1005994.GTGU_03001 1.3e-66 258.8 Gammaproteobacteria rpsK GO:0000028,GO:0000462,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030490,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048027,GO:0065003,GO:0070181,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02948 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RD0A@1224,1S3Q2@1236,COG0100@1,COG0100@2 NA|NA|NA J Located on the platform of the 30S subunit, it bridges several disparate RNA helices of the 16S rRNA. Forms part of the Shine-Dalgarno cleft in the 70S ribosome Z1_00781 529507.PMI3277 3.9e-57 227.3 Proteus rpsM GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0019538,GO:0022613,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02952 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RD1G@1224,1S3NX@1236,3Z3E3@583,COG0099@1,COG0099@2 NA|NA|NA J Located at the top of the head of the 30S subunit, it contacts several helices of the 16S rRNA. In the 70S ribosome it contacts the 23S rRNA (bridge B1a) and protein L5 of the 50S subunit (bridge B1b), connecting the 2 subunits Z1_00782 529507.PMI3275 3.6e-241 840.5 Proteus secY GO:0002790,GO:0003674,GO:0005048,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006605,GO:0006612,GO:0006613,GO:0006614,GO:0006616,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008320,GO:0008565,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031522,GO:0032940,GO:0032978,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033218,GO:0033365,GO:0034613,GO:0042277,GO:0042886,GO:0042887,GO:0043952,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045047,GO:0045184,GO:0046903,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0061024,GO:0065002,GO:0070727,GO:0070972,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072594,GO:0072599,GO:0072657,GO:0090150,GO:1904680 ko:K03076 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5 Bacteria 1MVU7@1224,1RNJV@1236,3Z25W@583,COG0201@1,COG0201@2 NA|NA|NA U The central subunit of the protein translocation channel SecYEG. Consists of two halves formed by TMs 1-5 and 6-10. These two domains form a lateral gate at the front which open onto the bilayer between TMs 2 and 7, and are clamped together by SecE at the back. The channel is closed by both a pore ring composed of hydrophobic SecY resides and a short helix (helix 2A) on the extracellular side of the membrane which forms a plug. The plug probably moves laterally to allow the channel to open. The ring and the pore may move independently Z1_00783 471881.PROPEN_03410 2.2e-70 271.6 Proteus rplO GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02876 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RDC8@1224,1S3P6@1236,3Z12Z@583,COG0200@1,COG0200@2 NA|NA|NA J Binds to the 23S rRNA Z1_00784 471881.PROPEN_03409 1e-24 118.6 Proteus rpmD GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02907 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1N6ZE@1224,1SC8N@1236,3Z32Q@583,COG1841@1,COG1841@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L30p/L7e Z1_00785 529507.PMI3272 8e-85 319.7 Proteus rpsE GO:0000028,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990145,GO:1990904 ko:K02988 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MUS4@1224,1RNEV@1236,3Z2FG@583,COG0098@1,COG0098@2 NA|NA|NA J Located at the back of the 30S subunit body where it stabilizes the conformation of the head with respect to the body Z1_00786 529507.PMI3271 3.6e-55 220.7 Proteus rplR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008097,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02881 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RGY7@1224,1S5V2@1236,3Z2R3@583,COG0256@1,COG0256@2 NA|NA|NA J This is one of the proteins that binds and probably mediates the attachment of the 5S RNA into the large ribosomal subunit, where it forms part of the central protuberance Z1_00787 529507.PMI3270 6.5e-93 346.7 Proteus rplF GO:0000027,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070180,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02933 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1R9YZ@1224,1S1Z1@1236,3Z2RA@583,COG0097@1,COG0097@2 NA|NA|NA J This protein binds to the 23S rRNA, and is important in its secondary structure. It is located near the subunit interface in the base of the L7 L12 stalk, and near the tRNA binding site of the peptidyltransferase center Z1_00788 529507.PMI3269 2.8e-64 251.1 Proteus rpsH GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009894,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010608,GO:0015935,GO:0016043,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031329,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043487,GO:0043488,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0061013,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903311,GO:1990904 ko:K02994 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RDG3@1224,1S452@1236,3Z2KE@583,COG0096@1,COG0096@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins, it binds directly to 16S rRNA central domain where it helps coordinate assembly of the platform of the 30S subunit Z1_00789 529507.PMI3268 7.4e-49 199.5 Proteus rpsN GO:0000028,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02954 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZDT@1224,1S62N@1236,3Z2P2@583,COG0199@1,COG0199@2 NA|NA|NA J Binds 16S rRNA, required for the assembly of 30S particles and may also be responsible for determining the conformation of the 16S rRNA at the A site Z1_00790 471881.PROPEN_03402 3.2e-95 354.4 Proteus rplE GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008097,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02931 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MUU9@1224,1RPE1@1236,3Z28Z@583,COG0094@1,COG0094@2 NA|NA|NA J This is 1 of the proteins that binds and probably mediates the attachment of the 5S RNA into the large ribosomal subunit, where it forms part of the central protuberance. In the 70S ribosome it contacts protein S13 of the 30S subunit (bridge B1b), connecting the 2 subunits Z1_00791 529507.PMI3266 1.3e-48 198.7 Proteus rplX GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02895 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZQD@1224,1S973@1236,3Z2RI@583,COG0198@1,COG0198@2 NA|NA|NA J One of two assembly initiator proteins, it binds directly to the 5'-end of the 23S rRNA, where it nucleates assembly of the 50S subunit Z1_00792 471881.PROPEN_03400 3.5e-61 240.7 Proteus rplN GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0070180,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02874 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RCWZ@1224,1S3Z3@1236,3Z2J4@583,COG0093@1,COG0093@2 NA|NA|NA J Binds to 23S rRNA. Forms part of two intersubunit bridges in the 70S ribosome Z1_00793 529507.PMI3264 1.5e-39 168.3 Proteus rpsQ GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0065003,GO:0070181,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02961 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZIK@1224,1S8SS@1236,3Z31C@583,COG0186@1,COG0186@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins, it binds specifically to the 5'-end of 16S ribosomal RNA Z1_00794 1124991.MU9_302 7.4e-23 112.5 Gammaproteobacteria rpmC GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02904 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1N6PR@1224,1SCBN@1236,COG0255@1,COG0255@2 NA|NA|NA J Belongs to the universal ribosomal protein uL29 family Z1_00795 529507.PMI3262 5.1e-69 266.9 Proteus rplP GO:0000027,GO:0000049,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02878 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RA0Z@1224,1S201@1236,3Z2K8@583,COG0197@1,COG0197@2 NA|NA|NA J Binds 23S rRNA and is also seen to make contacts with the A and possibly P site tRNAs Z1_00796 529507.PMI3261 7.7e-126 456.4 Proteus rpsC GO:0000028,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02982 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MUAI@1224,1RN0P@1236,3Z10S@583,COG0092@1,COG0092@2 NA|NA|NA J Binds the lower part of the 30S subunit head. Binds mRNA in the 70S ribosome, positioning it for translation Z1_00797 529507.PMI3260 7.8e-52 209.5 Proteus rplV GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005844,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042788,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02890 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RH0W@1224,1S5XT@1236,3Z2RN@583,COG0091@1,COG0091@2 NA|NA|NA J The globular domain of the protein is located near the polypeptide exit tunnel on the outside of the subunit, while an extended beta-hairpin is found that lines the wall of the exit tunnel in the center of the 70S ribosome Z1_00798 471881.PROPEN_03394 1.2e-45 188.7 Proteus rpsS GO:0000028,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02965 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RGYX@1224,1S5VT@1236,3Z2TX@583,COG0185@1,COG0185@2 NA|NA|NA J Protein S19 forms a complex with S13 that binds strongly to the 16S ribosomal RNA Z1_00799 529507.PMI3258 1.9e-155 555.1 Proteus rplB GO:0000027,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02886 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MVTD@1224,1RMGR@1236,3Z2F5@583,COG0090@1,COG0090@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins. Required for association of the 30S and 50S subunits to form the 70S ribosome, for tRNA binding and peptide bond formation. It has been suggested to have peptidyltransferase activity Z1_00800 471881.PROPEN_03392 1.7e-45 188.3 Proteus rplW GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02892 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZXX@1224,1S8VX@1236,3Z2P5@583,COG0089@1,COG0089@2 NA|NA|NA J One of the early assembly proteins it binds 23S rRNA. One of the proteins that surrounds the polypeptide exit tunnel on the outside of the ribosome. Forms the main docking site for trigger factor binding to the ribosome Z1_00801 529507.PMI3256 5.7e-101 373.6 Proteus rplD GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003700,GO:0003723,GO:0003735,GO:0004857,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005844,GO:0005886,GO:0006355,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008428,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030234,GO:0030312,GO:0030371,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032069,GO:0032074,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042788,GO:0043043,GO:0043086,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045182,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051336,GO:0051346,GO:0060255,GO:0060698,GO:0060699,GO:0060700,GO:0060701,GO:0060702,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0098772,GO:0140110,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02926,ko:K16193 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MXPF@1224,1RNNK@1236,3Z2QR@583,COG0088@1,COG0088@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L4/L1 family Z1_00802 529507.PMI3255 8.2e-111 406.4 Proteus rplC GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010628,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0031323,GO:0031325,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090069,GO:0090070,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000232,GO:2000234 ko:K02906 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MUST@1224,1RMK9@1236,3Z1PZ@583,COG0087@1,COG0087@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins, it binds directly near the 3'-end of the 23S rRNA, where it nucleates assembly of the 50S subunit Z1_00803 1005058.UMN179_01159 2e-49 201.4 Pasteurellales rpsJ GO:0001072,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006355,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0015935,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043244,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0140110,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903506,GO:1990904,GO:2000112,GO:2001141 ko:K02946 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RGWF@1224,1S3QX@1236,1Y8M8@135625,COG0051@1,COG0051@2 NA|NA|NA J Involved in the binding of tRNA to the ribosomes Z1_00804 529507.PMI3253 6.4e-84 316.6 Proteus bfr GO:0003674,GO:0003824,GO:0004322,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006880,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016722,GO:0016724,GO:0019725,GO:0020037,GO:0030003,GO:0042592,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046906,GO:0046914,GO:0046916,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051179,GO:0051235,GO:0051238,GO:0051641,GO:0051651,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0097159,GO:0097577,GO:0098771,GO:1901363 1.16.3.1 ko:K03594 ko00860,map00860 R00078 RC02758 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RCW7@1224,1S45S@1236,3Z1ZI@583,COG2193@1,COG2193@2 NA|NA|NA P Iron-storage protein, whose ferroxidase center binds Fe(2 ) ions, oxidizes them by dioxygen to Fe(3 ), and participates in the subsequent Fe(3 ) oxide mineral core formation within the central cavity of the protein complex Z1_00805 529507.PMI3252 7.6e-31 139.0 Proteus bfd GO:0003674,GO:0005488,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540 ko:K02192 ko00000 Bacteria 1QCTP@1224,1T8KM@1236,3Z33E@583,COG2906@1,COG2906@2 NA|NA|NA P BFD-like [2Fe-2S] binding domain Z1_00806 529507.PMI3251 9.4e-225 785.8 Proteus tuf GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02358 ko00000,ko03012,ko03029,ko04147 Bacteria 1MVC0@1224,1RMYX@1236,3Z0W8@583,COG0050@1,COG0050@2 NA|NA|NA J This protein promotes the GTP-dependent binding of aminoacyl-tRNA to the A-site of ribosomes during protein biosynthesis Z1_00812 529507.PMI3250 1.9e-175 621.7 Proteus coaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004594,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015936,GO:0015937,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.1.33 ko:K00867 ko00770,ko01100,map00770,map01100 M00120 R02971,R03018,R04391 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3838,iECH74115_1262.ECH74115_5439,iECSE_1348.ECSE_4265,iECSF_1327.ECSF_3833,iECSP_1301.ECSP_5045,iECW_1372.ECW_m4332,iEcDH1_1363.EcDH1_4016,iEcolC_1368.EcolC_4046,iPC815.YPO3758,iSFV_1184.SFV_4047,iSFxv_1172.SFxv_4418,iWFL_1372.ECW_m4332,iZ_1308.Z5545 Bacteria 1MV3M@1224,1RNXX@1236,3Z2JE@583,COG1072@1,COG1072@2 NA|NA|NA H pantothenic acid kinase Z1_00813 529507.PMI3249 7.5e-180 636.3 Proteus birA GO:0000166,GO:0000976,GO:0000984,GO:0001017,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003824,GO:0004077,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009305,GO:0009374,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0017053,GO:0017076,GO:0017144,GO:0018130,GO:0018271,GO:0019538,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030554,GO:0031406,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032787,GO:0032991,GO:0033218,GO:0033293,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042364,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043565,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046983,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901681,GO:1990837 2.7.1.33,6.3.4.15 ko:K01947,ko:K03524,ko:K04096 ko00770,ko00780,ko01100,map00770,map00780,map01100 M00120 R01074,R02971,R03018,R04391,R05145 RC00002,RC00017,RC00043,RC00070,RC00096,RC02896 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03000 Bacteria 1MWCC@1224,1RNGC@1236,3Z1H8@583,COG0340@1,COG0340@2,COG1654@1,COG1654@2 NA|NA|NA H Acts both as a biotin-- acetyl-CoA-carboxylase ligase and a biotin-operon repressor. In the presence of ATP, BirA activates biotin to form the BirA-biotinyl-5'-adenylate (BirA-bio- 5'-AMP or holoBirA) complex. HoloBirA can either transfer the biotinyl moiety to the biotin carboxyl carrier protein (BCCP) subunit of acetyl-CoA carboxylase, or bind to the biotin operator site and inhibit transcription of the operon Z1_00814 529507.PMI3248 1.1e-200 705.7 Proteus murB GO:0000166,GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008360,GO:0008762,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045229,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.3.1.98 ko:K00075 ko00520,ko00550,ko01100,map00520,map00550,map01100 R03191,R03192 RC02639 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iECED1_1282.ECED1_4683,iECUMN_1333.ECUMN_4498_AT6,iLF82_1304.LF82_1416,iNRG857_1313.NRG857_19845 Bacteria 1MXDH@1224,1RNXK@1236,3Z1PT@583,COG0812@1,COG0812@2 NA|NA|NA M Cell wall formation Z1_00821 529507.PMI3247 1.2e-157 562.4 Proteus murI GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008881,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016855,GO:0030203,GO:0034645,GO:0036361,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0047661,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 5.1.1.3 ko:K01776 ko00471,ko01100,map00471,map01100 R00260 RC00302 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iAPECO1_1312.APECO1_2496,iEC042_1314.EC042_4342,iECOK1_1307.ECOK1_4443,iECS88_1305.ECS88_4426,iPC815.YPO3909,iUMN146_1321.UM146_20110,iUTI89_1310.UTI89_C4562 Bacteria 1NAI2@1224,1RPU9@1236,3Z2BX@583,COG0796@1,COG0796@2 NA|NA|NA M Provides the (R)-glutamate required for cell wall biosynthesis Z1_00822 529507.PMI3246 0.0 1247.6 Proteus btuB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0006810,GO:0006811,GO:0008150,GO:0015075,GO:0015267,GO:0015318,GO:0015889,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019904,GO:0022803,GO:0022838,GO:0022857,GO:0031224,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051181,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705 ko:K16092 ko00000,ko02000 1.B.14.3 iECB_1328.ECB_03851,iECP_1309.ECP_4183,iSF_1195.SF4048,iS_1188.S3696 Bacteria 1MW63@1224,1RMFJ@1236,3Z1YQ@583,COG4206@1,COG4206@2 NA|NA|NA P Involved in the active translocation of vitamin B12 (cyanocobalamin) across the outer membrane to the periplasmic space. It derives its energy for transport by interacting with the trans-periplasmic membrane protein TonB Z1_00823 529507.PMI3245 2.8e-207 727.6 Proteus trmA GO:0000049,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016300,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019843,GO:0030488,GO:0030696,GO:0030697,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901363 2.1.1.190,2.1.1.35 ko:K00557,ko:K03215 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MY45@1224,1RN2B@1236,3Z0X0@583,COG2265@1,COG2265@2 NA|NA|NA J Dual-specificity methyltransferase that catalyzes the formation of 5-methyluridine at position 54 (m5U54) in all tRNAs, and that of position 341 (m5U341) in tmRNA (transfer-mRNA) Z1_00824 529507.PMI3244 2.5e-68 264.6 Proteus yijD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RH5N@1224,1S68Y@1236,2ARMX@1,31GYK@2,3Z315@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1422) Z1_00825 529507.PMI3243 8.9e-119 433.0 Proteus fabR GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K22105 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUJ5@1224,1RN9W@1236,3Z1Z5@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Represses the transcription of fabB, involved in unsaturated fatty acid (UFA) biosynthesis. By controlling UFA production, FabR directly influences the physical properties of the membrane bilayer Z1_00826 34506.g968 9.3e-272 942.2 Rhabditida Nematoda 1M0KG@119089,3AGF4@33154,3BY0B@33208,3DDBR@33213,40QWD@6231,4171F@6236,COG1249@1,KOG1335@2759 NA|NA|NA C Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain Z1_00827 529507.PMI3241 6.1e-171 606.7 Proteus oxyR GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001131,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0033554,GO:0043254,GO:0043565,GO:0044087,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051409,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1903506,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000142,GO:2001141 ko:K04761 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1MVA1@1224,1RPAJ@1236,3Z1ZT@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_00828 34506.g969 4e-259 900.2 Rhabditida Nematoda 1M6MR@119089,38CSU@33154,3BCPR@33208,3CWDR@33213,40P5T@6231,41522@6236,COG0165@1,KOG1316@2759 NA|NA|NA E Argininosuccinate lyase C-terminal Z1_00829 529507.PMI3239 2.8e-232 810.8 Proteus argG GO:0000050,GO:0000053,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004055,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006575,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0019627,GO:0019752,GO:0034641,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0071941,GO:0072350,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 6.3.4.5 ko:K01940 ko00220,ko00250,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko05418,map00220,map00250,map01100,map01110,map01130,map01230,map05418 M00029,M00844,M00845 R01954 RC00380,RC00629 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iJN678.argG,iSB619.SA_RS04675 Bacteria 1MV0Y@1224,1RMEC@1236,3Z28S@583,COG0137@1,COG0137@2 NA|NA|NA H Belongs to the argininosuccinate synthase family. Type 1 subfamily Z1_00830 529507.PMI3238 1.4e-136 492.3 Proteus argB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003991,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016597,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019752,GO:0031406,GO:0033554,GO:0034618,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.3.1.1,2.7.2.8 ko:K00930,ko:K14682 ko00220,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00028 R00259,R02649 RC00002,RC00004,RC00043,RC00064 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2508,iB21_1397.B21_03793,iEC55989_1330.EC55989_4441,iECB_1328.ECB_03844,iECDH10B_1368.ECDH10B_4147,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3827,iECD_1391.ECD_03844,iECH74115_1262.ECH74115_5419,iECIAI1_1343.ECIAI1_4167,iECO103_1326.ECO103_4715,iECOK1_1307.ECOK1_4431,iECS88_1305.ECS88_4414,iECSE_1348.ECSE_4252,iETEC_1333.ETEC_4227,iEcE24377_1341.EcE24377A_4498,iEcHS_1320.EcHS_A4193,iEcolC_1368.EcolC_4057,iSbBS512_1146.SbBS512_E4445,iUMN146_1321.UM146_20050,iUMNK88_1353.UMNK88_4797,iUTI89_1310.UTI89_C4550,iY75_1357.Y75_RS17255 Bacteria 1MU17@1224,1RNKK@1236,3Z137@583,COG0548@1,COG0548@2 NA|NA|NA F Catalyzes the ATP-dependent phosphorylation of N-acetyl- L-glutamate Z1_00831 529507.PMI3237 2.9e-190 671.0 Proteus argC GO:0003674,GO:0003824,GO:0003942,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.2.1.38 ko:K00145 ko00220,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00028,M00845 R03443 RC00684 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iLJ478.TM1782,iSSON_1240.SSON_4131,iYO844.BSU11190 Bacteria 1MVJ6@1224,1RNMX@1236,3Z2QX@583,COG0002@1,COG0002@2 NA|NA|NA C N-acetyl-glutamate semialdehyde dehydrogenase Z1_00832 529507.PMI3236 2e-227 794.7 Proteus argE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008652,GO:0008777,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019213,GO:0019752,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050897,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 3.5.1.16 ko:K01438 ko00220,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00028,M00845 R00669,R09107 RC00064,RC00300 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_4488 Bacteria 1MVBR@1224,1RNDG@1236,3Z2DG@583,COG0624@1,COG0624@2 NA|NA|NA E Belongs to the peptidase M20A family. ArgE subfamily Z1_00833 529507.PMI3235 0.0 1148.3 Proteus poxB GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006090,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016903,GO:0019752,GO:0019842,GO:0022607,GO:0030976,GO:0032787,GO:0036094,GO:0042802,GO:0042867,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0046872,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0052737,GO:0052738,GO:0055114,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072329,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901681 1.2.3.3,1.2.5.1 ko:K00156,ko:K00158 ko00620,ko01100,map00620,map01100 R00207,R03145 RC00860,RC02745 ko00000,ko00001,ko01000 iSF_1195.SF0826,iSFxv_1172.SFxv_0895,iS_1188.S0867 Bacteria 1MWKP@1224,1RNYT@1236,3Z14Z@583,COG0028@1,COG0028@2 NA|NA|NA EH Belongs to the TPP enzyme family Z1_00834 529507.PMI3234 4.2e-139 500.7 Proteus Bacteria 1R5HX@1224,1S1UZ@1236,2Z7NA@2,3Z1NF@583,arCOG09719@1 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3100) Z1_00835 529507.PMI3233 1.2e-71 275.8 Proteus Bacteria 1RCVM@1224,1S303@1236,2DC0W@1,2ZCA7@2,3Z1MP@583 NA|NA|NA Z1_00836 529507.PMI3232 3.7e-229 800.4 Proteus yxeP ko:K12940 ko00000,ko01002 Bacteria 1MUIV@1224,1RQAM@1236,3Z1TM@583,COG1473@1,COG1473@2 NA|NA|NA S Peptidase dimerisation domain Z1_00837 529507.PMI3231 1.4e-192 678.7 Proteus cysB ko:K13634 ko00000,ko03000 Bacteria 1PP0W@1224,1S0K5@1236,3Z1CA@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K LysR substrate binding domain Z1_00838 529507.PMI3230 2.5e-270 937.6 Proteus proP GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006865,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007231,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015101,GO:0015199,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015318,GO:0015651,GO:0015652,GO:0015653,GO:0015672,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015824,GO:0015838,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031460,GO:0033554,GO:0034220,GO:0035524,GO:0042538,GO:0043090,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0065007,GO:0071214,GO:0071470,GO:0071472,GO:0071474,GO:0071475,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072349,GO:0072488,GO:0089718,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098657,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098739,GO:0104004,GO:1902600,GO:1903825,GO:1905039,GO:1905647 ko:K03762 ko00000,ko02000 2.A.1.6.4 iUTI89_1310.UTI89_C4705,ic_1306.c5116 Bacteria 1MU46@1224,1RNIM@1236,3Z25E@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA EGP Osmosensory transporter coiled coil Z1_00839 529507.PMI3229 5.7e-285 986.1 Proteus phrB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003904,GO:0003913,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006464,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0018298,GO:0019538,GO:0033554,GO:0034641,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901564 4.1.99.3 ko:K01669 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MV9Y@1224,1RNGJ@1236,3Z1BW@583,COG0415@1,COG0415@2 NA|NA|NA H Belongs to the DNA photolyase family Z1_00840 529507.PMI3228 2.1e-193 681.4 Proteus Bacteria 1PDSP@1224,1RXFS@1236,3Z3F6@583,COG1216@1,COG1216@2 NA|NA|NA S Glycosyl transferase, family 2 Z1_00841 529507.PMI3227 0.0 1736.9 Proteus ppc GO:0003674,GO:0003824,GO:0004611,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008964,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350 4.1.1.31 ko:K01595 ko00620,ko00680,ko00710,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00620,map00680,map00710,map00720,map01100,map01120,map01200 M00168,M00170,M00171,M00172,M00173,M00346,M00374 R00345 RC02741 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN678.ppc,iSFV_1184.SFV_4025 Bacteria 1MUD5@1224,1RPTP@1236,3Z1K5@583,COG2352@1,COG2352@2 NA|NA|NA H Forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle Z1_00842 529507.PMI3226 2.4e-19 100.5 Proteus Bacteria 1QD27@1224,1T8X6@1236,29EF3@1,301D0@2,3Z3JT@583 NA|NA|NA Z1_00843 529507.PMI3225 1.1e-87 329.3 Proteus yqhA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03535 ko00000,ko02000 2.A.1.14.1 Bacteria 1RANN@1224,1S2DE@1236,3Z38F@583,COG2862@1,COG2862@2 NA|NA|NA S Uncharacterized protein family, UPF0114 Z1_00844 529507.PMI3224 0.0 1595.9 Proteus metL GO:0003674,GO:0003824,GO:0004072,GO:0004412,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009090,GO:0009092,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019202,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.3,2.7.2.4 ko:K00003,ko:K00928,ko:K12524,ko:K12525 ko00260,ko00261,ko00270,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00260,map00261,map00270,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00016,M00017,M00018,M00033,M00525,M00526,M00527 R00480,R01773,R01775 RC00002,RC00043,RC00087 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iUMNK88_1353.UMNK88_4778,iYL1228.KPN_04234 Bacteria 1MW3H@1224,1RN1G@1236,3Z1W1@583,COG0460@1,COG0460@2,COG0527@1,COG0527@2 NA|NA|NA E Homoserine dehydrogenase Z1_00845 34506.g1235 3.4e-219 767.3 Rhabditida Nematoda 1KUK3@119089,38CST@33154,3BFVK@33208,3CXAE@33213,40APF@6231,40XK2@6236,COG0626@1,KOG0053@2759 NA|NA|NA E vitamin B6 binding Z1_00846 529507.PMI3222 1.4e-53 215.3 Proteus metJ GO:0000096,GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006555,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009066,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0140110,GO:1901564,GO:1901605,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03764 ko00000,ko03000 Bacteria 1RH3B@1224,1S5ZV@1236,3Z2QK@583,COG3060@1,COG3060@2 NA|NA|NA K This regulatory protein, when combined with SAM (S- adenosylmethionine) represses the expression of the methionine regulon and of enzymes involved in SAM synthesis Z1_00847 1141663.OOC_11601 2e-196 691.8 Gammaproteobacteria yjjJ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0097159,GO:1901363 2.7.11.1 ko:K07154 ko00000,ko01000,ko01001,ko02048 Bacteria 1QJ5P@1224,1RP64@1236,COG3550@1,COG3550@2 NA|NA|NA K HipA domain protein Z1_00848 529507.PMI3220 6.5e-36 156.0 Proteus rpmE GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02909 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ69@1224,1SCMH@1236,3Z2YJ@583,COG0254@1,COG0254@2 NA|NA|NA J Binds the 23S rRNA Z1_00849 529507.PMI3219 0.0 1484.5 Proteus priA GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006268,GO:0006270,GO:0006276,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010212,GO:0010332,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0032392,GO:0032508,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042221,GO:0042623,GO:0043138,GO:0043140,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0046483,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901576 ko:K04066 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUUZ@1224,1RPZ7@1236,3Z1ZP@583,COG1198@1,COG1198@2 NA|NA|NA L Involved in the restart of stalled replication forks. Recognizes and binds the arrested nascent DNA chain at stalled replication forks. It can open the DNA duplex, via its helicase activity, and promote assembly of the primosome and loading of the major replicative helicase DnaB onto DNA Z1_00850 529507.PMI3218 4e-195 687.2 Proteus cytR GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K05499 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVUR@1224,1RN8T@1236,3Z1S2@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K Periplasmic binding protein-like domain Z1_00851 529507.PMI3217 5.4e-128 463.8 Proteus ftsN GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022402,GO:0022607,GO:0030428,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032506,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061640,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090529,GO:1902410,GO:1903047 ko:K03591 ko00000,ko03036 Bacteria 1PWIT@1224,1RNC1@1236,3Z2PC@583,COG3087@1,COG3087@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein that activates septal peptidoglycan synthesis and constriction of the cell. Acts on both sides of the membrane, via interaction with FtsA in the cytoplasm and interaction with the FtsQBL complex in the periplasm. These interactions may induce a conformational switch in both FtsA and FtsQBL, leading to septal peptidoglycan synthesis by FtsI and associated synthases Z1_00852 529507.PMI3216 1.2e-91 342.4 Proteus hslV GO:0000166,GO:0000287,GO:0000502,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004298,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009266,GO:0009376,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016787,GO:0017076,GO:0019538,GO:0019904,GO:0022607,GO:0030163,GO:0030554,GO:0031597,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034214,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051603,GO:0065003,GO:0070003,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1902494,GO:1904949,GO:1905368,GO:1905369 3.4.25.2 ko:K01419 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MVF2@1224,1RP7P@1236,3Z1S4@583,COG5405@1,COG5405@2 NA|NA|NA O Protease subunit of a proteasome-like degradation complex believed to be a general protein degrading machinery Z1_00853 529507.PMI3215 3e-243 847.4 Proteus hslU GO:0000166,GO:0000287,GO:0000502,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009266,GO:0009376,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019538,GO:0019904,GO:0022607,GO:0030554,GO:0031597,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034214,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043335,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051259,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902494,GO:1904949,GO:1905368,GO:1905369 ko:K03667 ko00000,ko03110 Bacteria 1MVK9@1224,1RMYV@1236,3Z21X@583,COG1220@1,COG1220@2 NA|NA|NA O this subunit has chaperone activity. The binding of ATP and its subsequent hydrolysis by HslU are essential for unfolding of protein substrates subsequently hydrolyzed by HslV. HslU recognizes the N-terminal part of its protein substrates and unfolds these before they are guided to HslV for hydrolysis Z1_00854 529507.PMI3214 3.9e-162 577.4 Proteus menA GO:0000287,GO:0002094,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004659,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0006766,GO:0006775,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016765,GO:0032194,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042362,GO:0042371,GO:0042373,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0046428,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 2.5.1.74 ko:K02548 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R05617,R06858,R10757 RC02935,RC02936,RC03264 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01006 iECH74115_1262.ECH74115_5387,iG2583_1286.G2583_4737 Bacteria 1MXQQ@1224,1RPW5@1236,3Z2SR@583,COG1575@1,COG1575@2 NA|NA|NA H 1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase Z1_00855 529507.PMI3213 1e-90 339.3 Proteus rraA GO:0003674,GO:0004857,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008428,GO:0009892,GO:0009894,GO:0009895,GO:0010605,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030234,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031329,GO:0031330,GO:0032069,GO:0032074,GO:0043086,GO:0044092,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051336,GO:0051346,GO:0060255,GO:0060699,GO:0060700,GO:0060701,GO:0060702,GO:0065007,GO:0065009,GO:0080090,GO:0098772,GO:1902369 ko:K02553 ko00000,ko03019 iJR904.b3929 Bacteria 1RH18@1224,1RS9U@1236,3Z2A0@583,COG0684@1,COG0684@2 NA|NA|NA H Globally modulates RNA abundance by binding to RNase E (Rne) and regulating its endonucleolytic activity. Can modulate Rne action in a substrate-dependent manner by altering the composition of the degradosome. Modulates RNA-binding and helicase activities of the degradosome Z1_00856 529507.PMI3212 1.3e-30 138.7 Proteus zapB GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0032153,GO:0032505,GO:0042802,GO:0043093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051301 2.1.1.80,3.1.1.61 ko:K09892,ko:K13924 ko02020,ko02030,map02020,map02030 M00506 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02022,ko02035,ko03036 Bacteria 1MZJE@1224,1S8TG@1236,3Z33M@583,COG3074@1,COG3074@2 NA|NA|NA D Non-essential, abundant cell division factor that is required for proper Z-ring formation. It is recruited early to the divisome by direct interaction with FtsZ, stimulating Z-ring assembly and thereby promoting cell division earlier in the cell cycle. Its recruitment to the Z-ring requires functional FtsA or ZipA Z1_00857 529507.PMI3211 4e-150 537.3 Proteus glpF ko:K02440 ko00000,ko02000 1.A.8.1,1.A.8.2 Bacteria 1MXTJ@1224,1RP2X@1236,3Z27T@583,COG0580@1,COG0580@2 NA|NA|NA U Major intrinsic protein Z1_00858 529507.PMI3210 4.8e-298 1029.6 Proteus glpK GO:0003674,GO:0003824,GO:0004370,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006066,GO:0006071,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019400,GO:0019405,GO:0019563,GO:0019751,GO:0033554,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046164,GO:0046174,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901615,GO:1901616 2.7.1.30 ko:K00864 ko00561,ko01100,ko03320,ko04626,map00561,map01100,map03320,map04626 R00847 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko04147 iE2348C_1286.E2348C_4230,iECNA114_1301.ECNA114_4065,iECSF_1327.ECSF_3786 Bacteria 1MUP7@1224,1RMAF@1236,3Z0W0@583,COG0554@1,COG0554@2 NA|NA|NA F Key enzyme in the regulation of glycerol uptake and metabolism. Catalyzes the phosphorylation of glycerol to yield sn- glycerol 3-phosphate Z1_00859 529507.PMI3209 3.2e-217 760.8 Proteus emrD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K08154 ko00000,ko02000 2.A.1.2.9 Bacteria 1N0VD@1224,1RN3X@1236,3Z1IQ@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Multidrug resistance protein D Z1_00860 529507.PMI3208 1.6e-137 495.4 Proteus fpr GO:0000166,GO:0000302,GO:0000303,GO:0000305,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004324,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006000,GO:0006001,GO:0006790,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0010035,GO:0016043,GO:0016052,GO:0016226,GO:0016491,GO:0016730,GO:0016731,GO:0019318,GO:0019320,GO:0022607,GO:0031163,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051186,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071949,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901700 1.18.1.2,1.19.1.1 ko:K00528,ko:K05784 ko00362,ko00364,ko00622,ko01100,ko01120,ko01220,map00362,map00364,map00622,map01100,map01120,map01220 M00551 R05290,R05291,R05428,R05621,R05622,R05665,R08100,R08101,R08108,R08109,R08110,R10159 RC00270,RC01378,RC01450,RC01910 br01602,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_3072,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4364,iYL1228.KPN_04002 Bacteria 1MW37@1224,1RR95@1236,3Z2X8@583,COG1018@1,COG1018@2 NA|NA|NA C COG1018 Flavodoxin reductases (ferredoxin-NADPH reductases) family 1 Z1_00861 529507.PMI3207 4.9e-75 287.0 Proteus yiiR GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RD1M@1224,1S2CI@1236,3Z2XN@583,COG3152@1,COG3152@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF805) Z1_00862 529507.PMI3206 3.5e-109 401.0 Proteus yiiQ Bacteria 1R3S9@1224,1S0JQ@1236,2CM5I@1,2Z94B@2,3Z24T@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1454) Z1_00863 34506.g1019 1e-139 502.7 Rhabditida Nematoda 1M0NK@119089,3AF0M@33154,3BYE6@33208,3DFAF@33213,40QZ4@6231,4172J@6236,COG0149@1,KOG1643@2759 NA|NA|NA G Triosephosphate isomerase Z1_00864 529507.PMI3204 2.1e-188 664.8 Proteus sbp GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006790,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008272,GO:0009987,GO:0015698,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043199,GO:0044237,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0072348,GO:1901681 ko:K02048 ko00920,ko02010,map00920,map02010 M00185 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.6.1,3.A.1.6.3 ic_1306.c4869 Bacteria 1MUAU@1224,1RMAR@1236,3Z27E@583,COG1613@1,COG1613@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_00865 34506.g340 7.3e-183 646.4 Rhabditida Nematoda 1KTKE@119089,38C5Z@33154,3B9JD@33208,3CRRX@33213,40B91@6231,40TNF@6236,COG0205@1,KOG2440@2759 NA|NA|NA F Catalyzes the phosphorylation of D-fructose 6-phosphate to fructose 1,6-bisphosphate by ATP, the first committing step of glycolysis Z1_00866 529507.PMI3202 1.5e-135 488.8 Proteus Bacteria 1MWCY@1224,1S0E4@1236,3Z2EY@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_00867 291112.PAU_01579 1.6e-136 492.7 Gammaproteobacteria wabK Bacteria 1QEP7@1224,1RZIT@1236,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M glycosyl transferase group 1 Z1_00868 1247024.JRLH01000005_gene2454 6.5e-92 344.4 Gammaproteobacteria waaB GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008194,GO:0008378,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008921,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0035250,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 ko:K02840 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT4 Bacteria 1PDRU@1224,1S0YU@1236,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M lipopolysaccharide-1,6-galactosyltransferase activity Z1_00869 529507.PMI3200 2.6e-95 354.8 Proteus cpxP GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031975,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051082,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K06006 ko00000,ko03110 Bacteria 1RIYB@1224,1S628@1236,3Z2IR@583,COG3678@1,COG3678@2 NA|NA|NA NPTU Heavy-metal resistance Z1_00870 529507.PMI3199 3.8e-125 454.1 Proteus Bacteria 1MVCB@1224,1RMW7@1236,3Z2GE@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_00871 529507.PMI3198 2.7e-255 887.5 Proteus Bacteria 1MUAK@1224,1RPDY@1236,3Z2DE@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T His Kinase A (phosphoacceptor) domain Z1_00872 29495.EA26_02065 1.2e-136 493.0 Vibrionales vioA GO:0005575,GO:0005576,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010106,GO:0019725,GO:0030003,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0042592,GO:0042594,GO:0043207,GO:0044403,GO:0044419,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0052173,GO:0052200,GO:0052564,GO:0052572,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071496,GO:0075136,GO:0098771 2.6.1.33 ko:K13308,ko:K20429 ko00523,ko01130,map00523,map01130 M00797 R02773 RC00006,RC00781 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUPN@1224,1RQ7S@1236,1Y2IM@135623,COG0399@1,COG0399@2 NA|NA|NA E DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family Z1_00873 674977.VMC_14680 1.2e-55 223.8 Gammaproteobacteria wbtK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0030312,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RGMI@1224,1S525@1236,COG0463@1,COG0463@2 NA|NA|NA M COG0463 Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis Z1_00874 1535422.ND16A_2042 8.7e-61 240.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NIE0@1224,1S67F@1236,COG4122@1,COG4122@2 NA|NA|NA S WbqC-like protein family Z1_00875 457396.CSBG_00483 4.6e-76 291.6 Clostridiaceae 1.1.1.384,2.6.1.102 ko:K13010,ko:K13327 ko00520,ko00523,ko01130,map00520,map00523,map01130 M00801,M00802 R05526,R10460 RC00006,RC00781,RC00897 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko01007 Bacteria 1V9T5@1239,24P9M@186801,36NIW@31979,COG0399@1,COG0399@2 NA|NA|NA M UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose aminotransferase Z1_00876 457396.CSBG_00484 5.1e-49 200.7 Clostridia 5.1.3.2 ko:K01784 ko00052,ko00520,ko01100,map00052,map00520,map01100 M00361,M00362,M00632 R00291,R02984 RC00289 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1V830@1239,24BKX@186801,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA M GDP-mannose 4,6 dehydratase Z1_00877 457396.CSBG_00484 4e-47 194.1 Clostridia 5.1.3.2 ko:K01784 ko00052,ko00520,ko01100,map00052,map00520,map01100 M00361,M00362,M00632 R00291,R02984 RC00289 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1V830@1239,24BKX@186801,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA M GDP-mannose 4,6 dehydratase Z1_00878 28152.DJ57_429 2.3e-50 204.9 Gammaproteobacteria tagD 2.7.7.15,2.7.7.39 ko:K00968,ko:K00980 ko00440,ko00564,ko01100,ko05231,map00440,map00564,map01100,map05231 M00090 R00856,R01890,R02590 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1RAJP@1224,1S65A@1236,COG0615@1,COG0615@2 NA|NA|NA IM cytidylyltransferase Z1_00879 1387197.AWGA01000074_gene106 3.1e-61 242.7 Gammaproteobacteria rfbX GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0033554,GO:0042221,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071944 ko:K03328,ko:K18799 ko00000,ko01005,ko02000 2.A.66.2,2.A.66.2.1 Bacteria 1R9XE@1224,1S2YR@1236,COG2244@1,COG2244@2 NA|NA|NA S Polysaccharide biosynthesis protein Z1_00880 484022.Fphi_1473 1.7e-58 233.4 Gammaproteobacteria 2.7.8.12,3.4.15.1 ko:K01283,ko:K09809 ko04614,ko04924,ko05142,ko05410,map04614,map04924,map05142,map05410 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04090,ko04147 Bacteria 1N0YG@1224,1SBJU@1236,COG1887@1,COG1887@2 NA|NA|NA M PFAM CDP-glycerol poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase Z1_00881 1292035.H476_2158 3.3e-27 129.4 Clostridia Bacteria 1VW5T@1239,2514I@186801,2C9DQ@1,337D6@2 NA|NA|NA Z1_00882 1292035.H476_2157 1.5e-60 240.0 Firmicutes Bacteria 1UKCT@1239,COG1216@1,COG1216@2 NA|NA|NA S Glycosyltransferase like family 2 Z1_00883 571.MC52_27010 6.6e-41 174.9 Gammaproteobacteria pglH GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006464,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006629,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008194,GO:0008378,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008921,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009103,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0018193,GO:0018196,GO:0018279,GO:0019538,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0035250,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043413,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070085,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903509 2.4.1.187,2.4.1.292 ko:K05946,ko:K16701,ko:K17249 ko05111,map05111 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 GT26,GT4 Bacteria 1MZ17@1224,1S1S7@1236,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M Glycosyl transferases group 1 Z1_00884 591023.AM202_0157 5.2e-81 307.8 Pasteurellales amsE ko:K16702 ko00000,ko01000,ko01003 GT2 Bacteria 1R8MZ@1224,1S2PU@1236,1Y73Q@135625,COG1215@1,COG1215@2 NA|NA|NA M Glycosyltransferases involved in cell wall biogenesis Z1_00885 1141663.OOC_02372 4.5e-145 520.8 Providencia gne GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 5.1.3.26 ko:K19997 ko00000,ko01000 Bacteria 1MX2J@1224,1RPHW@1236,3Z9M6@586,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA M NAD(P)H-binding Z1_00886 529507.PMI3189 3.3e-214 750.7 Proteus ugd GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003979,GO:0005975,GO:0005976,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009242,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0046377,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576 1.1.1.22 ko:K00012 ko00040,ko00053,ko00520,ko01100,map00040,map00053,map00520,map01100 M00014,M00129,M00361,M00362 R00286 RC00291 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_2287 Bacteria 1MW5U@1224,1RMVW@1236,3Z1YT@583,COG1004@1,COG1004@2 NA|NA|NA C UDP binding domain Z1_00887 585.DR95_3080 8.6e-95 352.8 Proteus trmL GO:0001510,GO:0002128,GO:0002130,GO:0002131,GO:0002132,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016300,GO:0016427,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0052665,GO:0052666,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.1.1.207 ko:K03216 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1RCY4@1224,1S3PI@1236,3Z2CT@583,COG0219@1,COG0219@2 NA|NA|NA J Methylates the ribose at the nucleotide 34 wobble position in the two leucyl isoacceptors tRNA(Leu)(CmAA) and tRNA(Leu)(cmnm5UmAA). Catalyzes the methyl transfer from S- adenosyl-L-methionine to the 2'-OH of the wobble nucleotide Z1_00888 1196322.A370_01438 9.4e-45 187.6 Clostridia Bacteria 1V74B@1239,2517N@186801,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M transferase activity, transferring glycosyl groups Z1_00889 529507.PMI3186 9.5e-103 379.4 Proteus Bacteria 1RHGV@1224,1S6CQ@1236,3Z1BI@583,COG1045@1,COG1045@2 NA|NA|NA H Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) Z1_00890 34506.g778 1.1e-150 539.3 Rhabditida Nematoda 1M7C0@119089,3A14N@33154,3BPWS@33208,3D6RB@33213,40PUQ@6231,415YQ@6236,COG0110@1,KOG4750@2759 NA|NA|NA E Serine acetyltransferase, N-terminal Z1_00891 34506.g779 2.8e-185 654.4 Bilateria Metazoa 39XXB@33154,3BXF0@33208,3DD4H@33213,COG0240@1,KOG2711@2759 NA|NA|NA C Glycerol-3-phosphate dehydrogenase Z1_00892 529507.PMI3183 9.3e-83 312.8 Proteus secB GO:0002790,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006605,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0032940,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042886,GO:0043952,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046903,GO:0046907,GO:0051082,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0072321 ko:K03071 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044,ko03110 3.A.5 Bacteria 1RI75@1224,1S62H@1236,3Z13R@583,COG1952@1,COG1952@2 NA|NA|NA U One of the proteins required for the normal export of preproteins out of the cell cytoplasm. It is a molecular chaperone that binds to a subset of precursor proteins, maintaining them in a translocation-competent state. It also specifically binds to its receptor SecA Z1_00893 529507.PMI3182 2.3e-72 278.1 Proteus yibN GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.8.1.1,2.8.1.2 ko:K01011 ko00270,ko00920,ko01100,ko01120,ko04122,map00270,map00920,map01100,map01120,map04122 R01931,R03105,R03106 RC00214 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MZ83@1224,1S8ZI@1236,3Z29G@583,COG0607@1,COG0607@2 NA|NA|NA P Rhodanese Homology Domain Z1_00894 34506.g780 7.3e-258 896.0 Rhabditida Nematoda 1M0M0@119089,38E0X@33154,3BWQB@33208,3DFGH@33213,40QX0@6231,4171Q@6236,COG0621@1,KOG2492@2759 NA|NA|NA T Uncharacterized protein family UPF0004 Z1_00895 529507.PMI3180 4.4e-175 620.9 Proteus envC GO:0000920,GO:0001896,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008219,GO:0009273,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0012501,GO:0016020,GO:0016787,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032153,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042546,GO:0042597,GO:0043085,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044464,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051301,GO:0051336,GO:0051345,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071554,GO:0071840,GO:0071944 ko:K06194,ko:K21471 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 1.A.34.1.2 Bacteria 1MY3E@1224,1RPQP@1236,3Z22T@583,COG4942@1,COG4942@2 NA|NA|NA D Peptidase family M23 Z1_00896 529507.PMI3179 1.5e-172 612.1 Proteus yibQ ko:K09798 ko00000 Bacteria 1N3JP@1224,1RNKH@1236,3Z29R@583,COG2861@1,COG2861@2 NA|NA|NA S Divergent polysaccharide deacetylase Z1_00897 529507.PMI3178 2.2e-201 708.0 Proteus tdh GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006563,GO:0006564,GO:0006566,GO:0006567,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008270,GO:0008652,GO:0008743,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009066,GO:0009068,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019752,GO:0030145,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046395,GO:0046870,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901607 1.1.1.103 ko:K00060 ko00260,map00260 R01465 RC00525 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_3926,iECUMN_1333.ECUMN_4133,iPC815.YPO0060 Bacteria 1MV9A@1224,1RMNY@1236,3Z1WF@583,COG1063@1,COG1063@2 NA|NA|NA C Catalyzes the NAD( )-dependent oxidation of L-threonine to 2-amino-3-ketobutyrate Z1_00898 529507.PMI3177 3.7e-221 773.9 Proteus kbl GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008710,GO:0008890,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016407,GO:0016408,GO:0016453,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016874,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0032787,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0070279,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.3.1.29,2.3.1.47 ko:K00639,ko:K00652 ko00260,ko00780,ko01100,map00260,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R00371,R03210,R10124 RC00004,RC00039,RC00394,RC02725 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iECW_1372.ECW_m3896,iEKO11_1354.EKO11_0103,iPC815.YPO0059,iWFL_1372.ECW_m3896 Bacteria 1MVVH@1224,1RNS6@1236,3Z2ET@583,COG0156@1,COG0156@2 NA|NA|NA H Catalyzes the cleavage of 2-amino-3-ketobutyrate to glycine and acetyl-CoA Z1_00899 529507.PMI3176 4.3e-180 637.1 Proteus hldD GO:0000166,GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008712,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0070401,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903509 5.1.3.20 ko:K03274 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00064 R05176 RC01291 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iPC815.YPO0058,iYL1228.KPN_03963 Bacteria 1MVE4@1224,1RP2S@1236,3Z2BZ@583,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA F Catalyzes the interconversion between ADP-D-glycero- beta-D-manno-heptose and ADP-L-glycero-beta-D-manno-heptose via an epimerization at carbon 6 of the heptose Z1_00900 529507.PMI3175 3.5e-199 700.7 Proteus rfaF GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008713,GO:0008920,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 ko:K02843 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT9 iECH74115_1262.ECH74115_4993,iECSP_1301.ECSP_4617,iECs_1301.ECs4498,iG2583_1286.G2583_4359,iZ_1308.Z5047 Bacteria 1MXA2@1224,1RMBF@1236,3Z0XC@583,COG0859@1,COG0859@2 NA|NA|NA M Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) Z1_00901 529507.PMI3174 2.9e-176 624.4 Proteus rfaC GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008713,GO:0008920,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 ko:K02841 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT9 iB21_1397.B21_03429,iECBD_1354.ECBD_0105,iECB_1328.ECB_03478,iECD_1391.ECD_03478,iECNA114_1301.ECNA114_3774,iECSF_1327.ECSF_3456,iSF_1195.SF3661,iS_1188.S4107 Bacteria 1MYZA@1224,1RPMN@1236,3Z186@583,COG0859@1,COG0859@2 NA|NA|NA M Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) Z1_00902 529507.PMI3172 5.3e-174 617.1 Proteus waaQ ko:K02841,ko:K02843,ko:K02849 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT9 Bacteria 1R4IT@1224,1RQF5@1236,3Z37J@583,COG0859@1,COG0859@2 NA|NA|NA M Glycosyl transferase Z1_00903 529507.PMI3171 2.2e-187 661.4 Proteus walW Bacteria 1MX6K@1224,1RYP1@1236,3Z21Q@583,COG0726@1,COG0726@2 NA|NA|NA G Lipopolysaccharide biosynthesis protein Z1_00904 585.DR95_3096 5e-177 627.1 Proteus rfaQ ko:K02849 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT9 Bacteria 1MYZA@1224,1RR6K@1236,3Z0W2@583,COG0859@1,COG0859@2 NA|NA|NA M Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) Z1_00905 585.DR95_3097 1.7e-199 701.8 Proteus rfaG ko:K02844 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT4 Bacteria 1NE3V@1224,1RQE3@1236,3Z2PB@583,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M Catalyzes the addition of the first glucose residue to the LPS core Z1_00906 585.DR95_3098 4.1e-182 644.0 Proteus rfaB 2.4.1.291 ko:K17248 ko00000,ko01000,ko01003 GT4 Bacteria 1QFQQ@1224,1RPY4@1236,3Z19S@583,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M Glycosyltransferase Family 4 Z1_00907 529507.PMI3167 7.7e-241 839.3 Proteus kdtA 2.4.99.12,2.4.99.13,2.4.99.14,2.4.99.15 ko:K02527 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060,M00080 R04658,R05074,R09763 RC00009,RC00077,RC00247 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT30 iIT341.HP0957 Bacteria 1MU9F@1224,1RNBR@1236,3Z1RG@583,COG1519@1,COG1519@2 NA|NA|NA H 3-Deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase (kdotransferase) Z1_00908 529507.PMI3166 1.8e-144 518.5 Proteus waaE ko:K12984 ko00000,ko01000,ko01003,ko01005,ko02000 4.D.1.3 GT2 Bacteria 1QU2Q@1224,1T1NF@1236,3Z147@583,COG1216@1,COG1216@2 NA|NA|NA H Glycosyl transferase family 2 Z1_00909 529507.PMI3165 7.8e-85 319.7 Proteus coaD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004595,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015936,GO:0015937,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0070566,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.7.3 ko:K00954 ko00770,ko01100,map00770,map01100 M00120 R03035 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO0053,iSDY_1059.SDY_4064 Bacteria 1RD9F@1224,1S41J@1236,3Z21T@583,COG0669@1,COG0669@2 NA|NA|NA F Reversibly transfers an adenylyl group from ATP to 4'- phosphopantetheine, yielding dephospho-CoA (dPCoA) and pyrophosphate Z1_00910 529507.PMI3164 2.6e-157 561.2 Proteus fpg GO:0000702,GO:0000703,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003684,GO:0003824,GO:0003906,GO:0004518,GO:0004519,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006285,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008534,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016798,GO:0016799,GO:0019104,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363 3.2.2.23,4.2.99.18 ko:K10563 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVM5@1224,1RP3J@1236,3Z1GM@583,COG0266@1,COG0266@2 NA|NA|NA L Involved in base excision repair of DNA damaged by oxidation or by mutagenic agents. Acts as DNA glycosylase that recognizes and removes damaged bases. Has a preference for oxidized purines, such as 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8-oxoG). Has AP (apurinic apyrimidinic) lyase activity and introduces nicks in the DNA strand. Cleaves the DNA backbone by beta-delta elimination to generate a single-strand break at the site of the removed base with both 3'- and 5'-phosphates Z1_00911 529507.PMI3163 2.3e-221 774.6 Proteus rfaL ko:K02847,ko:K16567 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko02000 9.B.67.4,9.B.67.5 Bacteria 1QAGT@1224,1RY8K@1236,3Z2WQ@583,COG3307@1,COG3307@2 NA|NA|NA M O-antigen ligase Z1_00912 529507.PMI3162 1.9e-217 761.5 Proteus walM Bacteria 1PIF6@1224,1S09H@1236,3Z25A@583,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M Glycosyl transferases group 1 Z1_00913 529507.PMI3161 1.6e-213 748.4 Proteus walN Bacteria 1MUTA@1224,1T844@1236,3Z2B1@583,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M Glycosyl transferase group 1 Z1_00914 529507.PMI3160 3e-192 677.6 Proteus ko:K02849 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT9 Bacteria 1N6DZ@1224,1SYI0@1236,3Z29C@583,COG0859@1,COG0859@2 NA|NA|NA H Glycosyltransferase family 9 (heptosyltransferase) Z1_00915 529507.PMI3159 9.9e-216 755.7 Proteus walR ko:K00754 ko00000,ko01000 GT4 Bacteria 1MU9C@1224,1RZRG@1236,3Z251@583,COG0438@1,COG0438@2 NA|NA|NA M glycosyl transferase group 1 Z1_00916 529507.PMI3158 5.5e-22 109.4 Proteus rpmG GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02913 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1N6QV@1224,1SCEJ@1236,3Z326@583,COG0267@1,COG0267@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L33 Z1_00917 529507.PMI3157 1.2e-35 155.2 Proteus rpmB GO:0000027,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02902 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZ57@1224,1S8UG@1236,3Z2YU@583,COG0227@1,COG0227@2 NA|NA|NA J Ribosomal L28 family Z1_00918 529507.PMI3156 7.7e-123 446.4 Proteus radC ko:K03630 ko00000 Bacteria 1MXZ5@1224,1RP86@1236,3Z0ZG@583,COG2003@1,COG2003@2 NA|NA|NA E RadC-like JAB domain Z1_00919 529507.PMI3155 2.4e-223 781.2 Proteus coaBC GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004632,GO:0004633,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0010181,GO:0015936,GO:0015937,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0032553,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.1.1.36,6.3.2.5 ko:K01598,ko:K13038 ko00770,ko01100,map00770,map01100 M00120 R03269,R04231 RC00064,RC00090,RC00822 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC042_1314.EC042_3945,iECUMN_1333.ECUMN_4154,iJN746.PP_5285,iSBO_1134.SBO_3641 Bacteria 1MVQP@1224,1RMKQ@1236,3Z1T2@583,COG0452@1,COG0452@2 NA|NA|NA H Catalyzes two steps in the biosynthesis of coenzyme A. In the first step cysteine is conjugated to 4'-phosphopantothenate to form 4-phosphopantothenoylcysteine, in the latter compound is decarboxylated to form 4'-phosphopantotheine Z1_00920 529507.PMI3154 3.2e-80 304.3 Proteus dut GO:0000166,GO:0000287,GO:0001882,GO:0001884,GO:0002134,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004170,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006226,GO:0006244,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009147,GO:0009149,GO:0009157,GO:0009162,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009176,GO:0009177,GO:0009200,GO:0009204,GO:0009211,GO:0009213,GO:0009219,GO:0009221,GO:0009223,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009264,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019103,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019692,GO:0022607,GO:0032549,GO:0032551,GO:0032553,GO:0032557,GO:0032991,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046078,GO:0046080,GO:0046081,GO:0046385,GO:0046386,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0047429,GO:0051259,GO:0051260,GO:0055086,GO:0065003,GO:0070206,GO:0070207,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072527,GO:0072528,GO:0072529,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 3.6.1.23,4.1.1.36,6.3.2.5 ko:K01520,ko:K13038 ko00240,ko00770,ko00983,ko01100,map00240,map00770,map00983,map01100 M00053,M00120 R02100,R03269,R04231,R11896 RC00002,RC00064,RC00090,RC00822 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 Bacteria 1RA7P@1224,1S233@1236,3Z13Q@583,COG0756@1,COG0756@2 NA|NA|NA F This enzyme is involved in nucleotide metabolism it produces dUMP, the immediate precursor of thymidine nucleotides and it decreases the intracellular concentration of dUTP so that uracil cannot be incorporated into DNA Z1_00921 529507.PMI3153 8.8e-102 376.3 Proteus slmA GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0000918,GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0007049,GO:0007346,GO:0008150,GO:0009295,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010564,GO:0010948,GO:0010974,GO:0016043,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022402,GO:0022607,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031333,GO:0032271,GO:0032272,GO:0032465,GO:0032466,GO:0032506,GO:0032954,GO:0032955,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043547,GO:0043565,GO:0043590,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044093,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045786,GO:0045930,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051726,GO:0051782,GO:0060255,GO:0061640,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090529,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1901891,GO:1901892,GO:1902410,GO:1902412,GO:1902413,GO:1903047,GO:1903436,GO:1903437,GO:1903506,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K05501 ko00000,ko03000,ko03036 Bacteria 1MWF7@1224,1RPZ6@1236,3Z1DU@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA D Required for nucleoid occlusion (NO) phenomenon, which prevents Z-ring formation and cell division over the nucleoid. Acts as a DNA-associated cell division inhibitor that binds simultaneously chromosomal DNA and FtsZ, and disrupts the assembly of FtsZ polymers. SlmA-DNA-binding sequences (SBS) are dispersed on non-Ter regions of the chromosome, preventing FtsZ polymerization at these regions Z1_00922 529507.PMI3152 1e-116 426.0 Proteus pyrE GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004588,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019856,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.4.2.10 ko:K00762 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00051 R01870 RC00611 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2819,iECIAI39_1322.ECIAI39_4161,iEcSMS35_1347.EcSMS35_3977,iUTI89_1310.UTI89_C4186 Bacteria 1MW6F@1224,1RQYG@1236,3Z1NH@583,COG0461@1,COG0461@2 NA|NA|NA F Catalyzes the transfer of a ribosyl phosphate group from 5-phosphoribose 1-diphosphate to orotate, leading to the formation of orotidine monophosphate (OMP) Z1_00923 529507.PMI3151 4.2e-127 460.7 Proteus rph GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004540,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016075,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019439,GO:0022613,GO:0031123,GO:0031125,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034655,GO:0034660,GO:0034661,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043628,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 2.7.7.56,3.6.1.66 ko:K00989,ko:K02428 ko00230,map00230 R00426,R00720,R01855,R02100,R02720,R03531 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MVFZ@1224,1RNTB@1236,3Z1G5@583,COG0689@1,COG0689@2 NA|NA|NA J Phosphorolytic exoribonuclease that removes nucleotide residues following the -CCA terminus of tRNA and adds nucleotides to the ends of RNA molecules by using nucleoside diphosphates as substrates Z1_00924 529507.PMI3150 1.6e-149 535.4 Proteus yicC GO:0000175,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0009022,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016075,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016896,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0034660,GO:0034661,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 Bacteria 1MWRA@1224,1RMAB@1236,3Z1WU@583,COG1561@1,COG1561@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1732) Z1_00925 598467.BrE312_3432 4.7e-29 133.3 Gammaproteobacteria ko:K19165 ko00000,ko02048 Bacteria 1N99I@1224,1SC1V@1236,COG2161@1,COG2161@2 NA|NA|NA D Antitoxin component of a toxin-antitoxin (TA) module Z1_00926 406818.XBJ1_4380 2.1e-56 224.9 Gammaproteobacteria doc ko:K07341 ko00000,ko02048 Bacteria 1N1FW@1224,1S3YM@1236,COG3654@1,COG3654@2 NA|NA|NA S Death ON curing protein Z1_00927 983545.Glaag_3978 3.9e-45 187.2 Alteromonadaceae ko:K20391 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1N2MZ@1224,1S667@1236,468I4@72275,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_00928 983545.Glaag_3979 1.7e-10 70.9 Alteromonadaceae 2.7.11.1 ko:K07154 ko00000,ko01000,ko01001,ko02048 Bacteria 1N458@1224,1RNYG@1236,466EG@72275,COG3550@1,COG3550@2 NA|NA|NA S Pfam:HipA_N Z1_00929 529507.PMI3138 1.2e-158 565.8 Proteus murQ GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006022,GO:0006040,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009254,GO:0016787,GO:0016801,GO:0016803,GO:0016829,GO:0016835,GO:0030203,GO:0043170,GO:0046348,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901575 4.2.1.126 ko:K07106 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R08555 RC00397,RC00746 ko00000,ko00001,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_3658,iECSP_1301.ECSP_3375,iECs_1301.ECs3299,iG2583_1286.G2583_2959 Bacteria 1MVDR@1224,1RN3P@1236,3Z0WD@583,COG2103@1,COG2103@2 NA|NA|NA S Specifically catalyzes the cleavage of the D-lactyl ether substituent of MurNAc 6-phosphate, producing GlcNAc 6- phosphate and D-lactate. Together with AnmK, is also required for the utilization of anhydro-N-acetylmuramic acid (anhMurNAc) either imported from the medium or derived from its own cell wall murein, and thus plays a role in cell wall recycling Z1_00930 585.DR95_3118 2.9e-107 394.8 Proteus ko:K07126 ko00000 Bacteria 1NEX5@1224,1SG3H@1236,3Z3EH@583,COG0790@1,COG0790@2 NA|NA|NA S Sel1-like repeats. Z1_00931 471881.PROPEN_00771 2e-74 285.0 Proteus MA20_05250 Bacteria 1MZUT@1224,1S4BD@1236,3Z37N@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_00932 34506.g1197 1e-260 905.6 Bilateria Metazoa 3AIN5@33154,3BX14@33208,3DEXZ@33213,COG1167@1,KOG0634@2759 NA|NA|NA E helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor Z1_00933 529507.PMI3137 2.4e-101 374.8 Proteus ksgA1 Bacteria 1RATY@1224,1S1YM@1236,3Z2QD@583,COG3963@1,COG3963@2 NA|NA|NA I Ribosomal RNA adenine dimethylase Z1_00934 34506.g732 9.1e-214 749.2 Rhabditida Nematoda 1M6TC@119089,3AH2F@33154,3CN80@33208,3DD8F@33213,40HK7@6231,415A6@6236,COG0136@1,KOG4777@2759 NA|NA|NA E Semialdehyde dehydrogenase, dimerisation domain Z1_00935 529507.PMI3135 0.0 1595.5 Proteus gyrB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003918,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007059,GO:0008094,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009295,GO:0009330,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016853,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034335,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051276,GO:0061505,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097659,GO:0140097,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 5.99.1.3 ko:K02470 ko00000,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MVKT@1224,1RNB2@1236,3Z1RP@583,COG0187@1,COG0187@2 NA|NA|NA L A type II topoisomerase that negatively supercoils closed circular double-stranded (ds) DNA in an ATP-dependent manner to modulate DNA topology and maintain chromosomes in an underwound state. Negative supercoiling favors strand separation, and DNA replication, transcription, recombination and repair, all of which involve strand separation. Also able to catalyze the interconversion of other topological isomers of dsDNA rings, including catenanes and knotted rings. Type II topoisomerases break and join 2 DNA strands simultaneously in an ATP-dependent manner Z1_00936 529507.PMI3134 6.9e-206 723.0 Proteus recF GO:0000731,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0018130,GO:0019438,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071897,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 ko:K03629 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MX8N@1224,1RN5P@1236,3Z2DT@583,COG1195@1,COG1195@2 NA|NA|NA L it is required for DNA replication and normal SOS inducibility. RecF binds preferentially to single-stranded, linear DNA. It also seems to bind ATP Z1_00937 529507.PMI3133 1.5e-200 705.3 Proteus dnaN GO:0003674,GO:0003824,GO:0003887,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006271,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0022616,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042575,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0061695,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02338 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MVD9@1224,1RMNP@1236,3Z29D@583,COG0592@1,COG0592@2 NA|NA|NA L Confers DNA tethering and processivity to DNA polymerases and other proteins. Acts as a clamp, forming a ring around DNA (a reaction catalyzed by the clamp-loading complex) which diffuses in an ATP-independent manner freely and bidirectionally along dsDNA. Initially characterized for its ability to contact the catalytic subunit of DNA polymerase III (Pol III), a complex, multichain enzyme responsible for most of the replicative synthesis in bacteria Z1_00938 529507.PMI3132 2.7e-263 914.1 Proteus dnaA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003688,GO:0003690,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006270,GO:0006275,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010556,GO:0016020,GO:0017076,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034645,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051171,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576,GO:1990837,GO:2000112 ko:K02313 ko02020,ko04112,map02020,map04112 ko00000,ko00001,ko03032,ko03036 Bacteria 1MU5H@1224,1RNHP@1236,3Z1SN@583,COG0593@1,COG0593@2 NA|NA|NA L it binds specifically double-stranded DNA at a 9 bp consensus (dnaA box) 5'-TTATC CA A CA A-3'. DnaA binds to ATP and to acidic phospholipids Z1_00939 471881.PROPEN_00782 8.5e-16 88.6 Proteus rpmH GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02914 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1NGGS@1224,1SGDJ@1236,3Z33Z@583,COG0230@1,COG0230@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L34 Z1_00940 529507.PMI3130 9.6e-55 219.2 Proteus rnpA GO:0000966,GO:0001682,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004526,GO:0004540,GO:0004549,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005655,GO:0005730,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016891,GO:0016893,GO:0030677,GO:0030681,GO:0031123,GO:0031404,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032991,GO:0033204,GO:0034414,GO:0034470,GO:0034471,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040007,GO:0042301,GO:0042779,GO:0042780,GO:0042781,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043199,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043628,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044452,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070013,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0097159,GO:0099116,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901681,GO:1902494,GO:1902555,GO:1905267,GO:1905348,GO:1990904 3.1.26.5 ko:K03536,ko:K08998 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MZQE@1224,1S90M@1236,3Z2TZ@583,COG0594@1,COG0594@2 NA|NA|NA J RNaseP catalyzes the removal of the 5'-leader sequence from pre-tRNA to produce the mature 5'-terminus. It can also cleave other RNA substrates such as 4.5S RNA. The protein component plays an auxiliary but essential role in vivo by binding to the 5'-leader sequence and broadening the substrate specificity of the ribozyme Z1_00941 34506.g826 0.0 1075.1 Eukaryota Eukaryota COG0706@1,KOG1239@2759 NA|NA|NA U membrane insertase activity Z1_00942 34506.g827 6.7e-251 872.8 Rhabditida ko:K03650 R08701 RC00053,RC00209,RC00870 ko00000,ko01000,ko03016 Nematoda 1KYY3@119089,38CEV@33154,3BE5G@33208,3CV3A@33213,40G7Q@6231,40XDX@6236,COG0486@1,KOG1191@2759 NA|NA|NA J Belongs to the TRAFAC class TrmE-Era-EngA-EngB-Septin- like GTPase superfamily. TrmE GTPase family Z1_00943 90371.CY43_19940 1.1e-228 798.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1R598@1224,1S00Q@1236,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_00944 90371.CY43_19945 2e-61 241.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1NJDU@1224,1SIQI@1236,COG3311@1,COG3311@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain Z1_00945 90371.CY43_19950 6e-77 293.9 Gammaproteobacteria repA 2.7.11.1 ko:K08282 ko00000,ko01000 Bacteria 1RAPA@1224,1SFYE@1236,28MWI@1,2ZB3T@2 NA|NA|NA S Plasmid encoded RepA protein Z1_00947 90371.CY43_19960 0.0 1855.1 Salmonella traN ko:K12058 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MW96@1224,1RYPT@1236,28KC1@1,2Z9Z1@2,3ZNFF@590 NA|NA|NA S Type-1V conjugative transfer system mating pair stabilisation Z1_00948 90371.CY43_19965 1.8e-98 365.2 Gammaproteobacteria ko:K02402 ko02020,ko02024,ko02026,ko02040,map02020,map02024,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1R5IB@1224,1RZAZ@1236,2CFTS@1,2ZBG4@2 NA|NA|NA N Flagellar transcriptional activator (FlhC) Z1_00949 90371.CY43_19970 1e-105 389.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NVQR@1224,1SP1C@1236,2F4RN@1,33XEI@2 NA|NA|NA Z1_00953 90371.CY43_19990 0.0 2103.9 Gammaproteobacteria ko:K12056 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MXCR@1224,1RPZR@1236,COG4678@1,COG4678@2 NA|NA|NA G PFAM TraG-like protein, N-terminal region Z1_00954 90371.CY43_19995 3.2e-251 874.0 Salmonella ko:K12072 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MWD0@1224,1RSK4@1236,28MTB@1,2ZB1J@2,3ZNE6@590 NA|NA|NA S Conjugative relaxosome accessory transposon protein Z1_00955 90371.CY43_20000 2.7e-157 561.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1N1MH@1224,1RQYK@1236,2DF4G@1,32U4K@2 NA|NA|NA Z1_00956 90371.CY43_20005 2e-75 288.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1NPHN@1224,1T6AA@1236,2E9KU@1,333TJ@2 NA|NA|NA Z1_00960 90371.CY43_20025 4.6e-177 627.1 Gammaproteobacteria ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1QVWI@1224,1T2KT@1236,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Integrase Z1_00961 90371.CY43_20030 0.0 1098.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1NBQK@1224,1S0VR@1236,COG0210@1,COG0210@2 NA|NA|NA L helicase Z1_00962 90371.CY43_20035 0.0 1275.8 Proteobacteria ko:K07459 ko00000 Bacteria 1MXAH@1224,COG1196@1,COG1196@2,COG3593@1,COG3593@2 NA|NA|NA L ATP-dependent endonuclease of the OLD family Z1_00963 90371.CY43_20040 0.0 1715.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1ND93@1224,1RZ0J@1236,COG1404@1,COG1404@2 NA|NA|NA O COG1404 Subtilisin-like serine proteases Z1_00964 90371.CY43_20045 6.7e-176 623.2 Gammaproteobacteria ftsH1 Bacteria 1MVVP@1224,1RY8X@1236,COG0464@1,COG0464@2 NA|NA|NA O COG0464 ATPases of the AAA class Z1_00965 90371.CY43_20050 8.5e-102 376.3 Salmonella Bacteria 1MXXT@1224,1S08N@1236,3ZMPS@590,COG1961@1,COG1961@2 NA|NA|NA L Resolvase, N terminal domain Z1_00966 106648.BBLJ01000085_gene4449 6e-196 689.9 Moraxellaceae ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1MVAN@1224,1RMSS@1236,3NNA6@468,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Phage integrase family Z1_00967 90371.CY43_20110 8.5e-157 559.7 Gammaproteobacteria penP 3.5.2.6 ko:K17836,ko:K18698,ko:K18699,ko:K18795,ko:K19217 ko00311,ko01130,ko01501,map00311,map01130,map01501 M00627,M00628 R06363 RC01499 br01600,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1NMW4@1224,1RWGW@1236,COG2367@1,COG2367@2 NA|NA|NA V Beta-lactamase Z1_00968 106648.BBLJ01000085_gene4447 2.7e-55 221.1 Moraxellaceae emrE ko:K03297,ko:K18975 ko00000,ko02000 2.A.7.1,2.A.7.1.11 Bacteria 1MZ54@1224,1S8SG@1236,3NP14@468,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Small Multidrug Resistance protein Z1_00969 106648.BBLJ01000085_gene4446 9.8e-152 542.7 Moraxellaceae folP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004156,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.15 ko:K00796,ko:K18824,ko:K18974 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03066,R03067 RC00121,RC00842 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MUIR@1224,1S1B0@1236,3NMJF@468,COG0294@1,COG0294@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of para-aminobenzoate (pABA) with 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin diphosphate (DHPt-PP) to form 7,8-dihydropteroate (H2Pte), the immediate precursor of folate derivatives Z1_00971 702113.PP1Y_Mpl8424 1.3e-31 143.7 Proteobacteria Bacteria 1NNS0@1224,2DVIP@1,33W39@2 NA|NA|NA Z1_00972 573.JG24_00025 2.2e-105 388.3 Proteobacteria Bacteria 1RG1B@1224,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, tetR family Z1_00973 573.JG24_00030 9.9e-209 732.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1QUD3@1224,1SSF5@1236,COG2271@1,COG2271@2 NA|NA|NA G Major facilitator Superfamily Z1_00974 573.JG24_00035 2.8e-168 597.8 Gammaproteobacteria ycbJ ko:K06979 M00760 br01600,ko00000,ko00002,ko01504 Bacteria 1RBVX@1224,1S39J@1236,COG3173@1,COG3173@2 NA|NA|NA S Phosphotransferase enzyme family Z1_00975 1263831.F543_22730 2.6e-137 494.6 Gammaproteobacteria ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase and inactivated derivatives Z1_00976 34506.g1578 2e-275 954.5 Bilateria Metazoa 3AFZJ@33154,3BXYG@33208,3DE7Z@33213,COG0306@1,KOG2493@2759 NA|NA|NA P Phosphate transporter family Z1_00977 529507.PMI3012 1.6e-227 795.0 Proteus yhiN GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K07007 ko00000 Bacteria 1MUGC@1224,1RNCW@1236,3Z2B9@583,COG2081@1,COG2081@2 NA|NA|NA S HI0933-like protein Z1_00980 529507.PMI3014 7e-135 486.5 Proteus yhhW GO:0003674,GO:0003824,GO:0008127,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016701,GO:0016702,GO:0051213,GO:0055114 ko:K06911 ko00000 Bacteria 1MVSW@1224,1RNVS@1236,3Z1WP@583,COG1741@1,COG1741@2 NA|NA|NA S Pirin Z1_00981 529507.PMI3015 0.0 1104.7 Proteus pckA GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004611,GO:0004612,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006094,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0016051,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0017076,GO:0019318,GO:0019319,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046364,GO:0046872,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901576 4.1.1.49 ko:K01610 ko00010,ko00020,ko00620,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00020,map00620,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00003,M00170 R00341 RC00002,RC02741 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSB619.SA_RS09060,iSF_1195.SF3422,iUTI89_1310.UTI89_C3903,iYO844.BSU30560 Bacteria 1MWXN@1224,1RPM0@1236,3Z1U7@583,COG1866@1,COG1866@2 NA|NA|NA F Belongs to the phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP) family Z1_00982 529507.PMI3016 2.8e-165 587.8 Proteus hslO GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0031647,GO:0036506,GO:0042026,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044183,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0065007,GO:0065008 ko:K04083 ko00000,ko03110 Bacteria 1MUMU@1224,1RMP3@1236,3Z18K@583,COG1281@1,COG1281@2 NA|NA|NA O Redox regulated molecular chaperone. Protects both thermally unfolding and oxidatively damaged proteins from irreversible aggregation. Plays an important role in the bacterial defense system toward oxidative stress Z1_00983 529507.PMI3017 4.6e-70 270.4 Proteus hslR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003723,GO:0003727,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009451,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016070,GO:0033554,GO:0034605,GO:0034641,GO:0043021,GO:0043023,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 ko:K04762 ko00000,ko03110 Bacteria 1MZR6@1224,1S8VU@1236,3Z2I5@583,COG1188@1,COG1188@2 NA|NA|NA J S4 RNA-binding domain Z1_00984 529507.PMI3018 0.0 1373.2 Proteus yrfF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1N39T@1224,1RN16@1236,28IJR@1,2Z8KK@2,3Z1MQ@583 NA|NA|NA S Intracellular growth attenuator protein IgaA Z1_00985 529507.PMI3019 3.7e-99 367.5 Proteus nudE GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0019144,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872 ko:K08312 ko00230,map00230 R01054 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_3067,iE2348C_1286.E2348C_3641,iECABU_c1320.ECABU_c38150,iECED1_1282.ECED1_4056,iECNA114_1301.ECNA114_3494,iECOK1_1307.ECOK1_3810,iECP_1309.ECP_3483,iECS88_1305.ECS88_3783,iECSF_1327.ECSF_3218,iLF82_1304.LF82_1531,iNRG857_1313.NRG857_16815,iUMN146_1321.UM146_17040,iUTI89_1310.UTI89_C3895,ic_1306.c4167 Bacteria 1RCX7@1224,1S3ZE@1236,3Z1UR@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L NUDIX domain Z1_00986 34506.g1583 6.5e-145 520.0 Bilateria Metazoa 2SP96@2759,3AKJ4@33154,3C0F1@33208,3DGWG@33213,COG1464@1 NA|NA|NA T NLPA lipoprotein Z1_00987 529507.PMI3021 0.0 1633.6 Proteus mrcA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0008238,GO:0008360,GO:0008658,GO:0008955,GO:0009002,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031406,GO:0033218,GO:0033293,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042546,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070008,GO:0070011,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901681 2.4.1.129,3.4.16.4 ko:K05366 ko00550,ko01100,ko01501,map00550,map01100,map01501 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko01011 GT51 Bacteria 1MU5A@1224,1RM7J@1236,3Z2EX@583,COG5009@1,COG5009@2 NA|NA|NA M penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-binding protein A) includes penicillin-insensitive transglycosylase (peptidoglycan TGase) Z1_00988 529507.PMI3022 1.3e-156 558.9 Proteus hofM GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0015976,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K02461,ko:K02662,ko:K02663,ko:K12288 ko03070,ko05111,map03070,map05111 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.15 Bacteria 1QD1G@1224,1T8KU@1236,3Z33S@583,COG4972@1,COG4972@2 NA|NA|NA NU Pilus assembly protein Z1_00989 529507.PMI3023 2.4e-99 368.2 Proteus pilN ko:K02662,ko:K02663,ko:K12289 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1QG6M@1224,1TDJH@1236,3Z334@583,COG3166@1,COG3166@2 NA|NA|NA NU PFAM Fimbrial assembly family protein Z1_00990 529507.PMI3024 5.7e-89 333.6 Proteus Bacteria 1QCTM@1224,1T8KJ@1236,2AQ5X@1,31FBE@2,3Z33B@583 NA|NA|NA Z1_00991 529507.PMI3025 3.9e-204 717.2 Proteus pilQ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0015976,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575 ko:K02507,ko:K02666 ko00000,ko02035,ko02044 3.A.15.2 Bacteria 1QTT6@1224,1RN3Z@1236,3Z102@583,COG4796@1,COG4796@2 NA|NA|NA U Bacterial type II/III secretion system short domain Z1_00992 471881.PROPEN_01260 1e-91 342.8 Proteus aroK GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004765,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009423,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019438,GO:0019632,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0046872,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615 2.7.1.71,4.2.3.4 ko:K00891,ko:K13829 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02412,R03083 RC00002,RC00078,RC00847 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUFJ@1224,1RPF6@1236,3Z0Z5@583,COG0703@1,COG0703@2 NA|NA|NA F Catalyzes the specific phosphorylation of the 3-hydroxyl group of shikimic acid using ATP as a cosubstrate Z1_00993 529507.PMI3027 6.9e-206 723.0 Proteus aroB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003856,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009423,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016838,GO:0019438,GO:0019752,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051287,GO:0070403,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.1.71,4.2.3.4 ko:K01735,ko:K13829 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02412,R03083 RC00002,RC00078,RC00847 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b3389,iBWG_1329.BWG_3080,iECDH10B_1368.ECDH10B_3564,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3268,iECNA114_1301.ECNA114_3486,iEcDH1_1363.EcDH1_0324,iIT341.HP0283,iJO1366.b3389,iJR904.b3389,iY75_1357.Y75_RS20275 Bacteria 1MUBK@1224,1RN4I@1236,3Z15A@583,COG0337@1,COG0337@2 NA|NA|NA E 3-dehydroquinate synthase Z1_00994 529507.PMI3028 2.5e-135 488.4 Proteus damX GO:0003674,GO:0005488,GO:0005539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0030428,GO:0032153,GO:0042834,GO:0044464,GO:0097367 ko:K03112 ko00000 Bacteria 1Q1YI@1224,1RRJF@1236,3Z2MY@583,COG3266@1,COG3266@2 NA|NA|NA D Cell division protein DamX Z1_00995 529507.PMI3029 3.4e-157 560.8 Proteus dam GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006270,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006304,GO:0006305,GO:0006306,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007049,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008757,GO:0009007,GO:0009008,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022402,GO:0032259,GO:0032775,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044728,GO:0044786,GO:0044787,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901681,GO:1902292,GO:1902328,GO:1904047 2.1.1.72 ko:K06223 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko02048,ko03032,ko03400 Bacteria 1P85S@1224,1RMNW@1236,3Z2IS@583,COG0338@1,COG0338@2 NA|NA|NA H D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase Z1_00996 529507.PMI3030 1.7e-125 455.3 Proteus rpe GO:0003674,GO:0003824,GO:0004750,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0019321,GO:0019323,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:1901575 5.1.3.1 ko:K01783 ko00030,ko00040,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map00040,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00004,M00007 R01529 RC00540 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO0155,iYL1228.KPN_03757 Bacteria 1MUZM@1224,1RN3K@1236,3Z1N2@583,COG0036@1,COG0036@2 NA|NA|NA G Ribulose-phosphate 3 epimerase family Z1_00997 529507.PMI3031 5.6e-132 476.9 Proteus gph GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008967,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0031404,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 3.1.3.18 ko:K01091 ko00630,ko01100,ko01110,ko01130,map00630,map01100,map01110,map01130 R01334 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iSBO_1134.SBO_3372,iSbBS512_1146.SbBS512_E3762,iYL1228.KPN_03756 Bacteria 1RDDY@1224,1S3QD@1236,3Z309@583,COG0546@1,COG0546@2 NA|NA|NA G phosphoglycolate phosphatase Z1_00998 529507.PMI3032 2e-194 684.9 Proteus trpS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004830,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006436,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.2 ko:K01867 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03664 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iAF1260.b3384,iB21_1397.B21_03188,iBWG_1329.BWG_3075,iEC042_1314.EC042_3645,iECBD_1354.ECBD_0363,iECB_1328.ECB_03236,iECDH10B_1368.ECDH10B_3559,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3263,iECD_1391.ECD_03236,iECUMN_1333.ECUMN_3842,iECW_1372.ECW_m3639,iEKO11_1354.EKO11_0361,iEcDH1_1363.EcDH1_0329,iEcHS_1320.EcHS_A3580,iEcolC_1368.EcolC_0329,iJO1366.b3384,iLF82_1304.LF82_2316,iNRG857_1313.NRG857_16750,iPC815.YPO0157,iUMNK88_1353.UMNK88_4150,iWFL_1372.ECW_m3639,iY75_1357.Y75_RS20300 Bacteria 1MV4T@1224,1RNDC@1236,3Z1MR@583,COG0180@1,COG0180@2 NA|NA|NA J Tryptophanyl-tRNA synthetase Z1_00999 529507.PMI3035 3e-127 461.1 Proteus yiiM GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009404,GO:0009407,GO:0009636,GO:0009987,GO:0019748,GO:0042221,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0098754 Bacteria 1RAPM@1224,1RRB8@1236,3Z1N6@583,COG2258@1,COG2258@2 NA|NA|NA S 3-alpha domain Z1_01000 529507.PMI3036 5.3e-118 430.3 Proteus sodA GO:0000302,GO:0000303,GO:0000305,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004784,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006801,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009268,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010269,GO:0010447,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016721,GO:0019430,GO:0030145,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034614,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071291,GO:0071450,GO:0071451,GO:0072593,GO:0097159,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901363,GO:1901700,GO:1901701,GO:1990748 1.15.1.1 ko:K04564 ko04013,ko04068,ko04146,ko04211,ko04212,ko04213,ko05016,map04013,map04068,map04146,map04211,map04212,map04213,map05016 ko00000,ko00001,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_4213,iECSF_1327.ECSF_3769 Bacteria 1MVW2@1224,1RP7X@1236,3Z0YM@583,COG0605@1,COG0605@2 NA|NA|NA C Destroys radicals which are normally produced within the cells and which are toxic to biological systems Z1_01001 529507.PMI3037 0.0 1340.9 Proteus acsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003987,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006083,GO:0006084,GO:0006085,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006476,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016405,GO:0016787,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016878,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018394,GO:0019213,GO:0019427,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033558,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034421,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035383,GO:0035384,GO:0035601,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043543,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043687,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045733,GO:0046390,GO:0046395,GO:0046483,GO:0050218,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071616,GO:0071704,GO:0072329,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0098732,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 6.2.1.1 ko:K01895 ko00010,ko00620,ko00640,ko00680,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00620,map00640,map00680,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00357 R00235,R00236,R00316,R00926,R01354 RC00004,RC00012,RC00043,RC00070,RC02746,RC02816 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iE2348C_1286.E2348C_4392,iYL1228.KPN_04478 Bacteria 1MUF5@1224,1RMNZ@1236,3Z107@583,COG0365@1,COG0365@2 NA|NA|NA I Catalyzes the conversion of acetate into acetyl-CoA (AcCoA), an essential intermediate at the junction of anabolic and catabolic pathways. Acs undergoes a two-step reaction. In the first half reaction, Acs combines acetate with ATP to form acetyl- adenylate (AcAMP) intermediate. In the second half reaction, it can then transfer the acetyl group from AcAMP to the sulfhydryl group of CoA, forming the product AcCoA Z1_01002 529507.PMI3038 1.5e-49 201.8 Proteus yjcH Bacteria 1MZF3@1224,1SCCK@1236,3Z2VV@583,COG3162@1,COG3162@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF485 Z1_01003 529507.PMI3039 2.9e-296 1023.8 Proteus actP GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006846,GO:0006847,GO:0006855,GO:0008028,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015123,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015654,GO:0015698,GO:0015710,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035433,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042891,GO:0042895,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K14393 ko00000,ko02000 2.A.21.7 iB21_1397.B21_03899,iECBD_1354.ECBD_3965,iECD_1391.ECD_03939 Bacteria 1MVJ8@1224,1RN0R@1236,3Z26U@583,COG4147@1,COG4147@2 NA|NA|NA S Belongs to the sodium solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family Z1_01004 529507.PMI3040 4.5e-311 1072.8 Proteus yhbX GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044464,GO:0046401,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 2.7.8.42,2.7.8.43 ko:K03760,ko:K12975,ko:K19353 ko00540,ko01503,map00540,map01503 M00722,M00723 R11204,R11205,R11555,R11556,R11557 RC00002,RC00017,RC00428 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1MWS7@1224,1SYHV@1236,3Z0WC@583,COG2194@1,COG2194@2 NA|NA|NA S Sulfatase Z1_01005 529507.PMI3044 2.9e-125 454.5 Proteus lutC ko:K00782 ko00000 Bacteria 1N67T@1224,1RNC6@1236,3Z2M0@583,COG1556@1,COG1556@2 NA|NA|NA S LUD domain Z1_01006 529507.PMI3045 1.5e-277 961.4 Proteus lutB ko:K18929 ko00000 iSF_1195.SF0259,iSFxv_1172.SFxv_0274,iS_1188.S0280 Bacteria 1MV6J@1224,1RQEA@1236,3Z2AR@583,COG0247@1,COG0247@2,COG1139@1,COG1139@2 NA|NA|NA C Domain of unknown function (DUF3390) Z1_01007 529507.PMI3046 3.8e-139 500.7 Proteus lutA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K18928 ko00000 iEC042_1314.EC042_0340,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0338 Bacteria 1MWTK@1224,1RMVZ@1236,3Z214@583,COG0247@1,COG0247@2 NA|NA|NA C Cysteine-rich domain Z1_01012 529507.PMI3047 6.4e-125 453.4 Proteus yieP GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K19776 ko00000,ko03000 Bacteria 1MV83@1224,1RR9F@1236,3Z270@583,COG2186@1,COG2186@2 NA|NA|NA K FCD Z1_01013 529507.PMI3048 3e-243 847.4 Proteus hsrA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 Bacteria 1QTWJ@1224,1T1QY@1236,3Z26J@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA P Major Facilitator Superfamily Z1_01014 34506.g1369 1.7e-168 598.6 Rhabditida Nematoda 1KVMS@119089,38FCH@33154,3BIFE@33208,3D1UT@33213,40CUR@6231,40Z89@6236,COG0524@1,KOG2855@2759 NA|NA|NA G Catalyzes the phosphorylation of ribose at O-5 in a reaction requiring ATP and magnesium. The resulting D-ribose-5- phosphate can then be used either for sythesis of nucleotides, histidine, and tryptophan, or as a component of the pentose phosphate pathway Z1_01015 34506.g1370 1.6e-277 961.4 Bilateria Metazoa 2R89P@2759,3A8ZG@33154,3BZ9E@33208,3DF9Z@33213,COG0714@1 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3763) Z1_01016 529507.PMI3051 3.3e-272 943.7 Proteus viaA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0016020,GO:0032781,GO:0043085,GO:0043462,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050790,GO:0051336,GO:0051345,GO:0065007,GO:0065009 Bacteria 1N1RQ@1224,1RPQT@1236,3Z1AR@583,COG2425@1,COG2425@2 NA|NA|NA S VWA domain containing CoxE-like protein Z1_01017 529507.PMI3052 7.4e-191 672.9 Proteus asnA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004071,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006528,GO:0006529,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016211,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016880,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 6.3.1.1 ko:K01914 ko00250,ko00460,ko01100,ko01110,ko01230,map00250,map00460,map01100,map01110,map01230 R00483 RC00010 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2719,iECOK1_1307.ECOK1_4193,iECS88_1305.ECS88_4166,iUMN146_1321.UM146_18910,iUTI89_1310.UTI89_C4299 Bacteria 1MVWF@1224,1RN79@1236,3Z11B@583,COG2502@1,COG2502@2 NA|NA|NA F Aspartate-ammonia ligase Z1_01018 529507.PMI3053 1.5e-77 295.4 Proteus asnC GO:0001101,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016597,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031406,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043200,GO:0043565,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1901698,GO:1901700,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03718 ko00000,ko03000 Bacteria 1MWPX@1224,1RRPA@1236,3Z2RJ@583,COG1522@1,COG1522@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix ASNC type Z1_01019 529507.PMI3054 1.7e-78 298.5 Proteus mioC GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0010181,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051302,GO:0065007,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K06205 ko00000 Bacteria 1N30T@1224,1S403@1236,3Z2KY@583,COG0716@1,COG0716@2 NA|NA|NA C Flavodoxin Z1_01020 529507.PMI3055 0.0 1249.2 Proteus gidA GO:0000166,GO:0001510,GO:0002097,GO:0002098,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009451,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 ko:K03495 R08701 RC00053,RC00209,RC00870 ko00000,ko03016,ko03036 Bacteria 1MU6F@1224,1RMM1@1236,3Z273@583,COG0445@1,COG0445@2 NA|NA|NA D NAD-binding protein involved in the addition of a carboxymethylaminomethyl (cmnm) group at the wobble position (U34) of certain tRNAs, forming tRNA-cmnm(5)s(2)U34 Z1_01021 529507.PMI3056 6.1e-114 416.8 Proteus rsmG GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036265,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070043,GO:0070475,GO:0070476,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.170 ko:K03501 ko00000,ko01000,ko03009,ko03036 Bacteria 1MY0K@1224,1RMRZ@1236,3Z23V@583,COG0357@1,COG0357@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the N7 position of guanine in position 527 of 16S rRNA Z1_01022 529507.PMI3057 2.4e-57 228.0 Proteus atpI GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044464,GO:0044769,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02116 ko00000,ko00194 3.A.2.1 iSSON_1240.SSON_3880 Bacteria 1RITN@1224,1S767@1236,3Z2ZQ@583,COG3312@1,COG3312@2 NA|NA|NA C ATP synthase I chain Z1_01023 529507.PMI3058 9.3e-147 526.2 Proteus atpB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0033177,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042777,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045263,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02108 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194,ko03110 3.A.2.1 iAPECO1_1312.APECO1_2725,iE2348C_1286.E2348C_4048,iEC042_1314.EC042_4125,iECABU_c1320.ECABU_c42230,iECED1_1282.ECED1_4428,iECIAI39_1322.ECIAI39_4342,iECNA114_1301.ECNA114_3887,iECOK1_1307.ECOK1_4187,iECP_1309.ECP_3937,iECS88_1305.ECS88_4160,iECSF_1327.ECSF_3586,iECUMN_1333.ECUMN_4268,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4106,iLF82_1304.LF82_0192,iNRG857_1313.NRG857_18615,iUMN146_1321.UM146_18880,iUMNK88_1353.UMNK88_4550,iUTI89_1310.UTI89_C4293,ic_1306.c4666 Bacteria 1MV87@1224,1RPHK@1236,3Z1TV@583,COG0356@1,COG0356@2 NA|NA|NA C it plays a direct role in the translocation of protons across the membrane Z1_01024 471881.PROPEN_00854 8.4e-32 142.5 Proteus atpE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0032991,GO:0033177,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036442,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045263,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0046961,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02110 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 3.A.2.1 Bacteria 1N1NA@1224,1S9MD@1236,32S3K@2,3Z30J@583,COG0636@1 NA|NA|NA C F(1)F(0) ATP synthase produces ATP from ADP in the presence of a proton or sodium gradient. F-type ATPases consist of two structural domains, F(1) containing the extramembraneous catalytic core and F(0) containing the membrane proton channel, linked together by a central stalk and a peripheral stalk. During catalysis, ATP synthesis in the catalytic domain of F(1) is coupled via a rotary mechanism of the central stalk subunits to proton translocation Z1_01025 529507.PMI3060 1.6e-58 232.3 Proteus atpF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031225,GO:0032991,GO:0033177,GO:0034220,GO:0036442,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045263,GO:0046933,GO:0046961,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0099131,GO:0099132,GO:1902600 ko:K02109 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 3.A.2.1 e_coli_core.b3736,iAF1260.b3736,iB21_1397.B21_03564,iBWG_1329.BWG_3427,iE2348C_1286.E2348C_4046,iEC042_1314.EC042_4123,iEC55989_1330.EC55989_4211,iECABU_c1320.ECABU_c42210,iECBD_1354.ECBD_4296,iECB_1328.ECB_03620,iECDH10B_1368.ECDH10B_3923,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3624,iECD_1391.ECD_03620,iECED1_1282.ECED1_4426,iECH74115_1262.ECH74115_5172,iECIAI1_1343.ECIAI1_3920,iECIAI39_1322.ECIAI39_4340,iECO103_1326.ECO103_4422,iECO111_1330.ECO111_4570,iECO26_1355.ECO26_4842,iECOK1_1307.ECOK1_4185,iECP_1309.ECP_3935,iECS88_1305.ECS88_4158,iECSE_1348.ECSE_4026,iECSF_1327.ECSF_3584,iECSP_1301.ECSP_4786,iECUMN_1333.ECUMN_4266,iECW_1372.ECW_m4039,iECs_1301.ECs4678,iEKO11_1354.EKO11_4609,iETEC_1333.ETEC_4027,iEcDH1_1363.EcDH1_4231,iEcE24377_1341.EcE24377A_4252,iEcHS_1320.EcHS_A3952,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4104,iEcolC_1368.EcolC_4258,iG2583_1286.G2583_4532,iJO1366.b3736,iJR904.b3736,iSDY_1059.SDY_4012,iSFV_1184.SFV_3762,iSF_1195.SF3816,iSFxv_1172.SFxv_4159,iSSON_1240.SSON_3883,iS_1188.S3952,iSbBS512_1146.SbBS512_E4185,iUMN146_1321.UM146_18870,iUMNK88_1353.UMNK88_4548,iUTI89_1310.UTI89_C4291,iWFL_1372.ECW_m4039,iY75_1357.Y75_RS18390,iZ_1308.Z5234,ic_1306.c4664 Bacteria 1RHZ0@1224,1S402@1236,3Z2HW@583,COG0711@1,COG0711@2 NA|NA|NA C Component of the F(0) channel, it forms part of the peripheral stalk, linking F(1) to F(0) Z1_01026 529507.PMI3061 1.4e-87 328.9 Proteus atpH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0032991,GO:0033178,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036442,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045260,GO:0045261,GO:0045262,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0046961,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02113 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 3.A.2.1 iSF_1195.SF3815,iSFxv_1172.SFxv_4157,iS_1188.S3953 Bacteria 1MVRH@1224,1S8X2@1236,3Z12C@583,COG0712@1,COG0712@2 NA|NA|NA C F(1)F(0) ATP synthase produces ATP from ADP in the presence of a proton or sodium gradient. F-type ATPases consist of two structural domains, F(1) containing the extramembraneous catalytic core and F(0) containing the membrane proton channel, linked together by a central stalk and a peripheral stalk. During catalysis, ATP synthesis in the catalytic domain of F(1) is coupled via a rotary mechanism of the central stalk subunits to proton translocation Z1_01027 529507.PMI3062 8.1e-285 985.7 Proteus atpA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030312,GO:0032991,GO:0033178,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0040007,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045260,GO:0045261,GO:0045262,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 3.6.3.14 ko:K02111 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194,ko01000 3.A.2.1 iIT341.HP1134,iSB619.SA_RS10975,iSbBS512_1146.SbBS512_E4187 Bacteria 1MUG7@1224,1RP4V@1236,3Z1AF@583,COG0056@1,COG0056@2 NA|NA|NA F Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane. The alpha chain is a regulatory subunit Z1_01028 529507.PMI3063 3.7e-154 550.8 Proteus atpG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030312,GO:0032991,GO:0033178,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036442,GO:0040007,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045260,GO:0045261,GO:0045262,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0046961,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02115 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 3.A.2.1 iLJ478.TM1611,iSSON_1240.SSON_3886,iYL1228.KPN_04138 Bacteria 1MU28@1224,1RNWJ@1236,3Z11E@583,COG0224@1,COG0224@2 NA|NA|NA C Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane. The gamma chain is believed to be important in regulating ATPase activity and the flow of protons through the CF(0) complex Z1_01029 529507.PMI3064 6.8e-259 899.4 Proteus atpD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0032991,GO:0033178,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036442,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045260,GO:0045261,GO:0045262,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0046961,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 3.6.3.14 ko:K02112 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194,ko01000 3.A.2.1 e_coli_core.b3732,iAF1260.b3732,iAPECO1_1312.APECO1_2729,iB21_1397.B21_03560,iBWG_1329.BWG_3423,iE2348C_1286.E2348C_4042,iEC042_1314.EC042_4119,iEC55989_1330.EC55989_4207,iECABU_c1320.ECABU_c42160,iECBD_1354.ECBD_4300,iECB_1328.ECB_03616,iECDH10B_1368.ECDH10B_3919,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3620,iECD_1391.ECD_03616,iECED1_1282.ECED1_4422,iECH74115_1262.ECH74115_5168,iECIAI1_1343.ECIAI1_3916,iECIAI39_1322.ECIAI39_4336,iECNA114_1301.ECNA114_3881,iECO103_1326.ECO103_4426,iECO111_1330.ECO111_4566,iECO26_1355.ECO26_4846,iECOK1_1307.ECOK1_4181,iECP_1309.ECP_3931,iECS88_1305.ECS88_4154,iECSE_1348.ECSE_4022,iECSF_1327.ECSF_3580,iECSP_1301.ECSP_4782,iECUMN_1333.ECUMN_4262,iECW_1372.ECW_m4035,iECs_1301.ECs4674,iEKO11_1354.EKO11_4613,iETEC_1333.ETEC_4023,iEcDH1_1363.EcDH1_4235,iEcE24377_1341.EcE24377A_4247,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4100,iEcolC_1368.EcolC_4262,iG2583_1286.G2583_4528,iJO1366.b3732,iJR904.b3732,iLF82_1304.LF82_0194,iNRG857_1313.NRG857_18585,iPC815.YPO4121,iSFV_1184.SFV_3758,iSF_1195.SF3812,iSFxv_1172.SFxv_4154,iSSON_1240.SSON_3887,iS_1188.S3956,iSbBS512_1146.SbBS512_E4189,iUMN146_1321.UM146_18850,iUMNK88_1353.UMNK88_4544,iUTI89_1310.UTI89_C4285,iWFL_1372.ECW_m4035,iY75_1357.Y75_RS18410,iZ_1308.Z5230,ic_1306.c4658 Bacteria 1MUFU@1224,1RN6U@1236,3Z105@583,COG0055@1,COG0055@2 NA|NA|NA F Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane. The catalytic sites are hosted primarily by the beta subunits Z1_01030 529507.PMI3065 3.9e-69 267.3 Proteus atpC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015672,GO:0015985,GO:0015986,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0032991,GO:0033178,GO:0034220,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044769,GO:0045259,GO:0045260,GO:0045261,GO:0045262,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046933,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0090662,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902600 ko:K02114 ko00190,ko00195,ko01100,map00190,map00195,map01100 M00157 ko00000,ko00001,ko00002,ko00194 3.A.2.1 iHN637.CLJU_RS01195,iJN746.PP_5412,iSbBS512_1146.SbBS512_E4190 Bacteria 1RHE4@1224,1S25H@1236,3Z2JS@583,COG0355@1,COG0355@2 NA|NA|NA C Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane Z1_01031 529507.PMI3066 1.2e-258 898.7 Proteus glmU GO:0000270,GO:0000271,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003977,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006040,GO:0006047,GO:0006048,GO:0006139,GO:0006629,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019134,GO:0019438,GO:0030203,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042546,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046349,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0070569,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.157,2.7.7.23 ko:K04042 ko00520,ko01100,ko01130,map00520,map01100,map01130 M00362 R00416,R05332 RC00002,RC00004,RC00166 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECED1_1282.ECED1_4420,iYL1228.KPN_04135 Bacteria 1MUPH@1224,1RNKE@1236,3Z0X5@583,COG1207@1,COG1207@2 NA|NA|NA M Catalyzes the last two sequential reactions in the de novo biosynthetic pathway for UDP-N-acetylglucosamine (UDP- GlcNAc). The C-terminal domain catalyzes the transfer of acetyl group from acetyl coenzyme A to glucosamine-1-phosphate (GlcN-1-P) to produce N-acetylglucosamine-1-phosphate (GlcNAc-1-P), which is converted into UDP-GlcNAc by the transfer of uridine 5- monophosphate (from uridine 5-triphosphate), a reaction catalyzed by the N-terminal domain Z1_01032 529507.PMI3067 0.0 1175.2 Proteus glmS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004360,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006002,GO:0006040,GO:0006047,GO:0006048,GO:0006139,GO:0006464,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016769,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043413,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046349,GO:0046483,GO:0055086,GO:0070085,GO:0070548,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.6.1.16 ko:K00820 ko00250,ko00520,ko01100,ko01130,ko04931,map00250,map00520,map01100,map01130,map04931 R00768 RC00010,RC00163,RC02752 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 iE2348C_1286.E2348C_4039,iEC042_1314.EC042_4115,iECIAI39_1322.ECIAI39_4333,iECNA114_1301.ECNA114_3878,iECOK1_1307.ECOK1_4178,iECSF_1327.ECSF_3577,iECUMN_1333.ECUMN_4259,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4097,iLF82_1304.LF82_0844,iNRG857_1313.NRG857_18570,iSFV_1184.SFV_3755,iSF_1195.SF3809,iSFxv_1172.SFxv_4151,iS_1188.S3959,iUMN146_1321.UM146_18835,iUTI89_1310.UTI89_C4281 Bacteria 1MW4K@1224,1RMVN@1236,3Z20H@583,COG0449@1,COG0449@2 NA|NA|NA H aminotransferase isomerizing Z1_01033 471881.PROPEN_00842 7.1e-158 563.1 Gammaproteobacteria cysA2 3.6.3.30 ko:K02010 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MU3I@1224,1RMTS@1236,COG3842@1,COG3842@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex FbpABC involved in Fe(3 ) ions import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_01034 471881.PROPEN_00842 3e-15 86.7 Gammaproteobacteria cysA2 3.6.3.30 ko:K02010 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MU3I@1224,1RMTS@1236,COG3842@1,COG3842@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex FbpABC involved in Fe(3 ) ions import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_01035 529507.PMI3070 2.3e-309 1067.4 Proteus ko:K02011 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MXZZ@1224,1RY3W@1236,3Z3A9@583,COG1178@1,COG1178@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01036 529507.PMI3071 8.4e-190 669.5 Proteus HA62_21480 ko:K02012 ko02010,map02010 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MXZ8@1224,1RPPC@1236,3Z353@583,COG1840@1,COG1840@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_01037 529507.PMI3072 1.6e-210 738.4 Proteus Bacteria 1R7JH@1224,1TA1W@1236,3Z3C9@583,COG0665@1,COG0665@2 NA|NA|NA E FAD dependent oxidoreductase Z1_01038 529507.PMI3075 6.1e-40 169.9 Proteus Bacteria 1NAHX@1224,1SDTH@1236,2EBD4@1,335DU@2,3Z3HK@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1240) Z1_01040 529507.PMI3079 8e-151 539.7 Proteus phnX 2.6.1.37,3.1.3.18,3.11.1.1 ko:K01091,ko:K03430,ko:K05306 ko00440,ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,map00440,map00630,map01100,map01110,map01120,map01130 R00747,R01334,R04152 RC00008,RC00017,RC00062,RC00368 ko00000,ko00001,ko01000,ko01007 Bacteria 1MX6B@1224,1RQPM@1236,3Z3BB@583,COG0637@1,COG0637@2 NA|NA|NA S Belongs to the HAD-like hydrolase superfamily. PhnX family Z1_01041 529507.PMI3080 2.6e-208 731.1 Proteus cpg2 3.4.17.11 ko:K01295 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUSU@1224,1RNIW@1236,3Z14E@583,COG0624@1,COG0624@2 NA|NA|NA E Peptidase dimerisation domain Z1_01042 529507.PMI3081 3.1e-251 874.0 Proteus ycgA Bacteria 1MY1J@1224,1RS2M@1236,3Z1M4@583,COG1288@1,COG1288@2 NA|NA|NA S C4-dicarboxylate anaerobic carrier Z1_01043 529507.PMI3082 2.2e-111 408.3 Proteus tetR ko:K18476 M00668 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1RD7Z@1224,1S7EE@1236,3Z372@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Tetracyclin repressor, C-terminal all-alpha domain Z1_01044 529507.PMI3083 2.3e-193 681.4 Proteus ko:K03543 M00701 ko00000,ko00002,ko02000 8.A.1.1 Bacteria 1MU7I@1224,1RRGJ@1236,3Z38Y@583,COG1566@1,COG1566@2 NA|NA|NA V HlyD membrane-fusion protein of T1SS Z1_01045 529507.PMI3084 1.3e-282 978.4 Proteus ko:K03446 M00701 ko00000,ko00002,ko02000 2.A.1.3 Bacteria 1QTUX@1224,1T1I2@1236,3Z380@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA EGP COG0477 Permeases of the major facilitator superfamily Z1_01046 529507.PMI3085 2.7e-79 301.2 Proteus copG Bacteria 1MZ9V@1224,1S9CQ@1236,3Z33J@583,COG3019@1,COG3019@2 NA|NA|NA S metal-binding protein Z1_01047 529507.PMI3086 1.1e-118 432.6 Gammaproteobacteria ko:K07346 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1RDUX@1224,1S6IY@1236,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain protein Z1_01048 471874.PROSTU_03391 5.9e-144 518.1 Providencia htrE_3 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1R41Y@1224,1RZN3@1236,3Z85Q@586,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU fimbrial usher protein Z1_01049 1141663.OOC_09073 3.4e-17 94.4 Providencia htrE_3 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1R41Y@1224,1RZN3@1236,3Z85Q@586,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU fimbrial usher protein Z1_01050 529507.PMI3089 6.6e-116 423.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1NG3Q@1224,1SEZ6@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01051 529507.PMI3090 1.2e-117 429.1 Proteobacteria Bacteria 1RIGE@1224,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Protein of unknown function (DUF1120) Z1_01052 529507.PMI3091 9.8e-115 419.5 Bacteria Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_01053 529507.PMI3092 3.9e-119 434.1 Proteobacteria Bacteria 1RIGE@1224,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Protein of unknown function (DUF1120) Z1_01054 529507.PMI3093 3.6e-67 260.8 Proteus ygiW Bacteria 1N9HJ@1224,1SCD7@1236,3Z2VC@583,COG3111@1,COG3111@2 NA|NA|NA S Bacterial OB fold (BOF) protein Z1_01055 529507.PMI3094 6.7e-99 366.7 Proteus SEN0012 Bacteria 1N1ZN@1224,1S58Y@1236,3Z2K9@583,COG0705@1,COG0705@2 NA|NA|NA S Rhomboid family Z1_01056 529507.PMI3095 3.1e-175 620.9 Proteus nagK 2.7.1.59 ko:K00884 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R01201 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU94@1224,1RNHE@1236,3Z16H@583,COG1940@1,COG1940@2 NA|NA|NA GK ROK family Z1_01057 529507.PMI3096 2.9e-61 241.1 Proteus Bacteria 1QGMZ@1224,1TE2Y@1236,2BRRK@1,32KRE@2,3Z3JJ@583 NA|NA|NA Z1_01058 529507.PMI3097 0.0 1365.9 Proteus bcsA 2.4.1.12 ko:K00694,ko:K20541 ko00500,ko01100,ko02026,map00500,map01100,map02026 R02889 RC00005 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko02000 4.D.3.1.2,4.D.3.1.5,4.D.3.1.6 GT2 Bacteria 1MWF8@1224,1RPJ6@1236,3Z3AS@583,COG1215@1,COG1215@2 NA|NA|NA M Cellulose synthase Z1_01059 529507.PMI3098 0.0 1559.7 Proteus ko:K08086,ko:K20541 ko00000,ko02000 4.D.3.1.6 Bacteria 1QU9W@1224,1T1QX@1236,3Z3E1@583,COG3170@1,COG3170@2 NA|NA|NA NU Bacterial cellulose synthase subunit Z1_01060 529507.PMI3099 0.0 2323.1 Proteus ko:K02453,ko:K02656,ko:K20543 ko03070,ko05111,map03070,map05111 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.55.3,3.A.15 Bacteria 1MVB8@1224,1RPSN@1236,3Z3BS@583,COG0457@1,COG0457@2,COG3063@1,COG3063@2 NA|NA|NA NU Cellulose synthase operon protein C C-terminus (BCSC_C) Z1_01061 529507.PMI3100 2.3e-86 324.7 Proteus acsD Bacteria 1RI72@1224,1S8PW@1236,2AMDP@1,31C94@2,3Z37V@583 NA|NA|NA S Cellulose synthase subunit D Z1_01062 529507.PMI3101 1.5e-166 592.0 Proteus Bacteria 1RGCV@1224,1RWM7@1236,3Z3C1@583,COG2199@1,COG2199@2 NA|NA|NA T diguanylate cyclase Z1_01063 529507.PMI3102 1.2e-182 645.6 Proteus galU 2.7.7.9 ko:K00963 ko00040,ko00052,ko00500,ko00520,ko01100,ko01130,map00040,map00052,map00500,map00520,map01100,map01130 M00129,M00361,M00362,M00549 R00289 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MV5F@1224,1RNDX@1236,3Z36C@583,COG1210@1,COG1210@2 NA|NA|NA M Nucleotidyl transferase Z1_01064 529507.PMI3103 4e-203 713.8 Proteus celC GO:0005575,GO:0005576 3.2.1.4 ko:K20542 ko00000,ko01000 GH8 Bacteria 1MW17@1224,1RNEU@1236,3Z355@583,COG3405@1,COG3405@2 NA|NA|NA G Glycosyl hydrolases family 8 Z1_01065 529507.PMI3104 0.0 1092.4 Proteus GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0046401,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 ko:K01138 ko00000,ko01000 Bacteria 1MXT1@1224,1RPX0@1236,3Z1U8@583,COG1368@1,COG1368@2 NA|NA|NA M Sulfatase Z1_01066 529507.PMI3105 0.0 1226.8 Proteus selB GO:0000049,GO:0000166,GO:0001514,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006417,GO:0006451,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009069,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0016259,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019003,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034248,GO:0034641,GO:0034645,GO:0035368,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051246,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:2000112 ko:K03833 ko00000,ko03012 Bacteria 1MWXH@1224,1RQJI@1236,3Z1VA@583,COG3276@1,COG3276@2 NA|NA|NA J Elongation factor SelB, winged helix Z1_01067 529507.PMI3106 9.6e-261 905.6 Proteus selA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004125,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016070,GO:0016259,GO:0016260,GO:0016740,GO:0016785,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034660,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097056,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.9.1.1 ko:K01042 ko00450,ko00970,map00450,map00970 R08219 RC01246 ko00000,ko00001,ko01000 iECP_1309.ECP_3693,iSbBS512_1146.SbBS512_E4006 Bacteria 1MWXI@1224,1RN73@1236,3Z2HI@583,COG1921@1,COG1921@2 NA|NA|NA J Converts seryl-tRNA(Sec) to selenocysteinyl-tRNA(Sec) required for selenoprotein biosynthesis Z1_01068 529507.PMI3107 1.1e-172 612.5 Proteus fdhE GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006091,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008199,GO:0009061,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015980,GO:0019538,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051604,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564 ko:K02380 ko00000 Bacteria 1NK06@1224,1RQC4@1236,3Z1RS@583,COG3058@1,COG3058@2 NA|NA|NA O Necessary for formate dehydrogenase activity Z1_01069 529507.PMI3108 2.5e-118 431.4 Proteus fdoI GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009326,GO:0009987,GO:0015942,GO:0015944,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016903,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032787,GO:0032991,GO:0033554,GO:0036397,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0050896,GO:0051716,GO:0052738,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:1902494 ko:K00127 ko00630,ko00680,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map01100,map01120,map01200 R00519 RC02796 ko00000,ko00001 Bacteria 1MXFQ@1224,1RNHH@1236,3Z18H@583,COG2864@1,COG2864@2 NA|NA|NA C Prokaryotic cytochrome b561 Z1_01070 529507.PMI3109 1.3e-184 652.1 Proteus fdoH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009326,GO:0009898,GO:0009987,GO:0015942,GO:0015944,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016903,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031235,GO:0032787,GO:0032991,GO:0036397,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0052738,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098562,GO:1902494 ko:K00124 ko00630,ko00680,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map01100,map01120,map01200 R00519 RC02796 ko00000,ko00001 iAF1260.b3893,iAPECO1_1312.APECO1_2572,iB21_1397.B21_03727,iBWG_1329.BWG_3563,iEC042_1314.EC042_4267,iEC55989_1330.EC55989_4370,iECABU_c1320.ECABU_c43980,iECBD_1354.ECBD_4132,iECB_1328.ECB_03778,iECDH10B_1368.ECDH10B_4083,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3764,iECD_1391.ECD_03778,iECED1_1282.ECED1_4596,iECIAI1_1343.ECIAI1_4097,iECIAI39_1322.ECIAI39_3106,iECO103_1326.ECO103_4634,iECO26_1355.ECO26_4693,iECOK1_1307.ECOK1_4361,iECP_1309.ECP_4105,iECS88_1305.ECS88_4341,iECSE_1348.ECSE_4179,iECUMN_1333.ECUMN_4423,iECW_1372.ECW_m4202,iEKO11_1354.EKO11_4464,iEcDH1_1363.EcDH1_4091,iEcE24377_1341.EcE24377A_4422,iEcHS_1320.EcHS_A4121,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4279,iEcolC_1368.EcolC_4125,iJO1366.b3893,iJR904.b3893,iLF82_1304.LF82_0634,iNRG857_1313.NRG857_19435,iSBO_1134.SBO_3907,iSFV_1184.SFV_3602,iSF_1195.SF3969,iSSON_1240.SSON_4062,iS_1188.S3779,iUMN146_1321.UM146_19695,iUMNK88_1353.UMNK88_4726,iUTI89_1310.UTI89_C4480,iWFL_1372.ECW_m4202,iY75_1357.Y75_RS17605,iYL1228.KPN_04189,ic_1306.c4843 Bacteria 1MU1B@1224,1RNFG@1236,3Z1U2@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C Formate dehydrogenase N, transmembrane Z1_01071 34506.g886 0.0 1673.7 Bilateria Metazoa 2D1YQ@1,2SJU5@2759,39QV3@33154,3CR31@33208,3E786@33213 NA|NA|NA S Molydopterin dinucleotide binding domain Z1_01072 34506.g885 8.5e-110 402.9 Metazoa Metazoa 2SYYV@2759,3AT9Q@33154,3C4RA@33208,COG0243@1 NA|NA|NA C Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain Z1_01073 529507.PMI3112 3.7e-151 540.8 Proteus fdhD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0043085,GO:0043546,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0097159,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901363 ko:K02379 ko00000 Bacteria 1NRU0@1224,1RNFH@1236,3Z18T@583,COG1526@1,COG1526@2 NA|NA|NA J Required for formate dehydrogenase (FDH) activity. Acts as a sulfur carrier protein that transfers sulfur from IscS to the molybdenum cofactor prior to its insertion into FDH Z1_01074 529507.PMI3113 3e-52 210.7 Gammaproteobacteria ko:K03824 ko00000,ko01000 Bacteria 1QXR8@1224,1T3H8@1236,COG3153@1,COG3153@2 NA|NA|NA S acetyltransferase Z1_01075 529507.PMI3113 4.8e-76 290.4 Gammaproteobacteria ko:K03824 ko00000,ko01000 Bacteria 1QXR8@1224,1T3H8@1236,COG3153@1,COG3153@2 NA|NA|NA S acetyltransferase Z1_01076 529507.PMI3114 3.3e-174 617.5 Proteus Bacteria 1R3TT@1224,1RS1X@1236,3Z3AD@583,COG3307@1,COG3307@2 NA|NA|NA M TupA-like ATPgrasp Z1_01077 529507.PMI3115 1.1e-103 382.5 Proteus Bacteria 1P5IY@1224,1SVA2@1236,292IY@1,2ZQ2Z@2,3Z26A@583 NA|NA|NA Z1_01078 529507.PMI3116 9.5e-191 672.5 Proteus ramA_1 Bacteria 1MXG5@1224,1RS6S@1236,3Z0UN@583,COG0388@1,COG0388@2 NA|NA|NA S Carbon-nitrogen hydrolase Z1_01079 529507.PMI3117 1.5e-158 565.5 Proteus Bacteria 1R6K4@1224,1S2KD@1236,3Z1D2@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_01080 529507.PMI3118 1e-142 512.7 Proteus Bacteria 1RH0K@1224,1S5Z6@1236,2AIMU@1,31946@2,3Z361@583 NA|NA|NA Z1_01081 529507.PMI3119 3.6e-191 674.1 Proteus trxA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004791,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0016671,GO:0019725,GO:0033554,GO:0034599,GO:0042221,GO:0042592,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045454,GO:0047134,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1990748 ko:K03671 ko04621,ko05418,map04621,map05418 ko00000,ko00001,ko03110 Bacteria 1QSEX@1224,1RR0Y@1236,3Z1RU@583,COG3118@1,COG3118@2 NA|NA|NA O Protein of unknown function (DUF560) Z1_01082 529507.PMI3120 0.0 2049.6 Proteus FrpB2 ko:K02014,ko:K16087 ko00000,ko02000 1.B.14,1.B.14.2 Bacteria 1R4GA@1224,1RQNP@1236,3Z1HI@583,COG1629@1,COG1629@2,COG4771@2 NA|NA|NA P Receptor Z1_01083 529507.PMI3121 1.2e-135 489.2 Proteus tonB ko:K03832,ko:K07261 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011,ko02000 2.C.1.1 Bacteria 1MZHE@1224,1SBCG@1236,3Z25Y@583,COG0810@1,COG0810@2 NA|NA|NA U Interacts with outer membrane receptor proteins that carry out high-affinity binding and energy dependent uptake into the periplasmic space of specific substrates. It could act to transduce energy from the cytoplasmic membrane to specific energy- requiring processes in the outer membrane, resulting in the release into the periplasm of ligands bound by these outer membrane proteins Z1_01084 529507.PMI3122 0.0 1303.9 Proteus Bacteria 1NYUR@1224,1TD6I@1236,2F6I4@1,33Z14@2,3Z2EH@583 NA|NA|NA Z1_01085 529507.PMI3123 2.2e-181 641.3 Proteus Bacteria 1N1XC@1224,1T0A2@1236,3Z0VF@583,COG5555@1,COG5555@2 NA|NA|NA N Calcineurin-like phosphoesterase Z1_01086 529507.PMI3124 1.4e-78 298.9 Proteus ycdZ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RA69@1224,1S1YX@1236,28NYX@1,2ZBVY@2,3Z2N2@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1097) Z1_01087 529507.PMI3125 9.7e-255 885.6 Proteus hipA GO:0000166,GO:0000287,GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009279,GO:0009297,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0015267,GO:0015288,GO:0015473,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0018105,GO:0018193,GO:0018209,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019867,GO:0022607,GO:0022611,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022857,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030312,GO:0030313,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031975,GO:0032502,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0032993,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036289,GO:0042710,GO:0043086,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043565,GO:0043711,GO:0044010,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044462,GO:0044464,GO:0044764,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046777,GO:0046872,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051704,GO:0055085,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:0140110,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 2.7.11.1 ko:K07154 ko00000,ko01000,ko01001,ko02048 Bacteria 1MVAB@1224,1RR5N@1236,3Z38D@583,COG3550@1,COG3550@2 NA|NA|NA S Pfam:HipA_N Z1_01088 529507.PMI3126 3.4e-39 167.2 Proteus hipB GO:0000976,GO:0000984,GO:0000985,GO:0001017,GO:0001046,GO:0001047,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K15773 ko00000,ko02048,ko03000 Bacteria 1QB4Y@1224,1T6NQ@1236,3Z3GC@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_01090 702113.PP1Y_Mpl8424 1.3e-31 143.7 Proteobacteria Bacteria 1NNS0@1224,2DVIP@1,33W39@2 NA|NA|NA Z1_01091 237609.PSAKL28_31200 3.7e-48 197.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RHG3@1224,1SD48@1236,COG1695@1,COG1695@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_01092 237609.PSAKL28_31190 6.4e-213 746.5 Gammaproteobacteria chrA ko:K07240 ko00000,ko02000 2.A.51.1 Bacteria 1MUBW@1224,1RPNP@1236,COG2059@1,COG2059@2 NA|NA|NA P Chromate Z1_01093 106648.BBLJ01000085_gene4446 9.8e-152 542.7 Moraxellaceae folP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004156,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.15 ko:K00796,ko:K18824,ko:K18974 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03066,R03067 RC00121,RC00842 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MUIR@1224,1S1B0@1236,3NMJF@468,COG0294@1,COG0294@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of para-aminobenzoate (pABA) with 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin diphosphate (DHPt-PP) to form 7,8-dihydropteroate (H2Pte), the immediate precursor of folate derivatives Z1_01094 106648.BBLJ01000085_gene4447 2.7e-55 221.1 Moraxellaceae emrE ko:K03297,ko:K18975 ko00000,ko02000 2.A.7.1,2.A.7.1.11 Bacteria 1MZ54@1224,1S8SG@1236,3NP14@468,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Small Multidrug Resistance protein Z1_01095 543728.Vapar_5656 6.9e-91 340.5 Betaproteobacteria aadA 2.7.7.47 ko:K00984 ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1QVMI@1224,2VPQJ@28216,COG1708@1,COG1708@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4111) Z1_01096 177439.DP0311 1.4e-59 236.1 Deltaproteobacteria folA 1.1.1.262,1.5.1.3 ko:K00097,ko:K00287,ko:K18589,ko:K18590 ko00670,ko00750,ko00790,ko01100,ko01523,map00670,map00750,map00790,map01100,map01523 M00124,M00126,M00840 R00936,R00937,R00939,R00940,R02235,R02236,R05681,R05837,R07406,R11765 RC00089,RC00109,RC00110,RC00158,RC00675,RC01475 br01600,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 iJN746.PP_5132 Bacteria 1RH0P@1224,2WQA3@28221,42UMS@68525,COG0262@1,COG0262@2 NA|NA|NA H Key enzyme in folate metabolism. Catalyzes an essential reaction for de novo glycine and purine synthesis, and for DNA precursor synthesis Z1_01097 1134474.O59_002520 3e-195 687.6 Cellvibrio ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1FI9T@10,1MVAN@1224,1RMSS@1236,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Phage integrase, N-terminal SAM-like domain Z1_01098 228410.NE0837 7.9e-29 134.0 Betaproteobacteria Bacteria 1NQGB@1224,2VZJI@28216,COG2200@1,COG2200@2 NA|NA|NA T Domain of unknown function (DUF3330) Z1_01099 1263831.F543_22730 2.6e-137 494.6 Gammaproteobacteria ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase and inactivated derivatives Z1_01100 94122.Shewana3_4319 9.6e-95 352.8 Shewanellaceae Bacteria 1R3XB@1224,1RSC2@1236,2QCQQ@267890,COG1961@1,COG1961@2 NA|NA|NA L PFAM Resolvase, N-terminal domain Z1_01101 94122.Shewana3_4318 0.0 1894.8 Shewanellaceae Bacteria 1MUIU@1224,1STMP@1236,2QDS9@267890,COG4644@1,COG4644@2 NA|NA|NA L PFAM transposase Tn3 family protein Z1_01102 1115512.EH105704_16_00340 7.4e-67 259.6 Escherichia Bacteria 1NIE9@1224,1SWUJ@1236,3XRBC@561,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_01103 411468.CLOSCI_03331 5.4e-129 466.8 Lachnoclostridium cat 2.3.1.28 ko:K19271 br01600,ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1UY81@1239,2214S@1506553,24853@186801,COG4845@1,COG4845@2 NA|NA|NA H This enzyme is an effector of chloramphenicol resistance in bacteria Z1_01104 477184.KYC_21881 1.1e-234 818.9 Alcaligenaceae tetA ko:K08151,ko:K08153 M00668,M00717 ko00000,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.1.2.38,2.A.1.2.39,2.A.1.2.4,2.A.1.2.41,2.A.1.2.68,2.A.1.2.75,2.A.1.2.8 Bacteria 1MVSH@1224,2VKJ3@28216,3T5Q9@506,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Sugar (and other) transporter Z1_01105 477184.KYC_21886 1.1e-121 442.6 Alcaligenaceae tetR ko:K18476 M00668 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1REPQ@1224,2VSX5@28216,3T3AP@506,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Tetracycline repressor protein Z1_01106 535289.Dtpsy_2129 1e-72 279.6 Comamonadaceae merR ko:K08365,ko:K19057,ko:K19591,ko:K19592 M00768,M00769 ko00000,ko00002,ko01504,ko03000 Bacteria 1MZ3P@1224,2VJ8D@28216,4ADIC@80864,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K Transcription regulator MerR DNA binding Z1_01107 535289.Dtpsy_2131 4.8e-39 166.8 Comamonadaceae merP ko:K08364 ko00000,ko02000 1.A.72.1 Bacteria 1N95B@1224,2VSRA@28216,4AF00@80864,COG2608@1,COG2608@2 NA|NA|NA P Mercury scavenger that specifically binds to one mercury ion and which passes it to the mercuric reductase (MerA) via the MerT protein Z1_01108 535289.Dtpsy_2132 9.2e-74 282.7 Comamonadaceae merC ko:K19058 ko00000,ko02000 1.A.72.4 Bacteria 1RCXF@1224,28P0Z@1,2VQUF@28216,2ZBXF@2,4AEHX@80864 NA|NA|NA S MerC mercury resistance protein Z1_01109 535289.Dtpsy_2133 0.0 1077.4 Comamonadaceae merA 1.16.1.1 ko:K00520 ko00000,ko01000 Bacteria 1MU2U@1224,2VH3T@28216,4AAYF@80864,COG1249@1,COG1249@2 NA|NA|NA C Resistance to Hg(2 ) in bacteria appears to be governed by a specialized system which includes mercuric reductase. MerA protein is responsible for volatilizing mercury as Hg(0) Z1_01110 1484157.PSNIH2_20690 6.7e-57 226.5 Gammaproteobacteria ko:K08365,ko:K18997,ko:K19057,ko:K19591 M00769 ko00000,ko00002,ko01504,ko03000,ko03036 Bacteria 1REDD@1224,1S4JC@1236,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K MerR HTH family regulatory protein Z1_01111 1484157.PSNIH2_20700 7.8e-134 483.0 Pantoea Bacteria 1N299@1224,1SKKE@1236,3W2RJ@53335,COG2200@1,COG2200@2 NA|NA|NA T Putative diguanylate phosphodiesterase Z1_01112 1134474.O59_002514 2.6e-236 824.3 Cellvibrio tniA ko:K07497 ko00000 Bacteria 1FII6@10,1PG4W@1224,1TB3D@1236,COG2801@1,COG2801@2 NA|NA|NA L Integrase core domain Z1_01113 1166130.H650_00265 2.6e-137 494.6 Enterobacter ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,3X3BR@547,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase IS66 family Z1_01114 1035839.AFNK01000027_gene1328 1.2e-157 562.4 Pasteurellales strB 2.7.1.72 ko:K04343 M00766 R02225 RC00002,RC00078 br01600,ko00000,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MW4R@1224,1S2D2@1236,1Y9I1@135625,COG3570@1,COG3570@2 NA|NA|NA V Aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase Z1_01115 178901.AmDm5_1379 4.1e-155 553.9 Alphaproteobacteria ymdC 2.7.1.87,2.7.1.95 ko:K00897,ko:K10673,ko:K19299 M00766 br01600,ko00000,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MXWC@1224,2U6V8@28211,COG3231@1,COG3231@2 NA|NA|NA J Phosphotransferase enzyme family Z1_01116 1051646.VITU9109_06924 2.8e-143 514.6 Vibrionales folP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004156,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.15 ko:K00796,ko:K18824 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03066,R03067 RC00121,RC00842 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MUIR@1224,1RM8G@1236,1XTE1@135623,COG0294@1,COG0294@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of para-aminobenzoate (pABA) with 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin diphosphate (DHPt-PP) to form 7,8-dihydropteroate (H2Pte), the immediate precursor of folate derivatives Z1_01117 1159870.KB907784_gene3262 9.8e-124 449.9 Betaproteobacteria repC Bacteria 1QJ65@1224,2W61U@28216,COG5527@1,COG5527@2 NA|NA|NA L Replication protein C (RepC) Z1_01118 1166130.H650_00265 2.6e-137 494.6 Enterobacter ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,3X3BR@547,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase IS66 family Z1_01119 1035839.AFNK01000044_gene985 6.5e-159 566.6 Pasteurellales penP 3.5.2.6 ko:K17836,ko:K18698,ko:K18795,ko:K19217 ko00311,ko01130,ko01501,map00311,map01130,map01501 M00627,M00628 R06363 RC01499 br01600,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1NMW4@1224,1RWGW@1236,1Y9Q6@135625,COG2367@1,COG2367@2 NA|NA|NA V Beta-lactamase Z1_01120 573.JG24_02200 8.1e-94 349.7 Gammaproteobacteria tnpR Bacteria 1R482@1224,1S2PK@1236,COG1961@1,COG1961@2 NA|NA|NA L Resolvase, N terminal domain Z1_01121 1035839.AFNK01000044_gene987 5.1e-09 67.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1MUIU@1224,1RPZZ@1236,COG4644@1,COG4644@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01122 1263831.F543_22730 2.6e-137 494.6 Gammaproteobacteria ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase and inactivated derivatives Z1_01123 529507.PMI3010 2.1e-29 135.2 Proteus uspB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009636,GO:0010033,GO:0016020,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0045471,GO:0046677,GO:0050896,GO:0071944,GO:0097305,GO:1901700 ko:K06144 ko00000,ko02000 9.B.4.1.1 Bacteria 1RDHD@1224,1S3P8@1236,291H9@1,2ZP3V@2,3Z2SU@583 NA|NA|NA S Universal stress protein B (UspB) Z1_01124 34506.g1577 4.2e-74 283.9 Bilateria Metazoa 2D1YB@1,2SJS6@2759,3AEF8@33154,3BYKD@33208,3DFGK@33213 NA|NA|NA S Universal stress protein family Z1_01125 529507.PMI3008 1.4e-253 881.7 Proteus gdhA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004353,GO:0004354,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006537,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016639,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.4.1.4 ko:K00262 ko00220,ko00250,ko00910,ko01100,map00220,map00250,map00910,map01100 R00248 RC00006,RC02799 ko00000,ko00001,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_2481,iECSP_1301.ECSP_2329,iECs_1301.ECs2467,iG2583_1286.G2583_2207,iPC815.YPO3971,iSDY_1059.SDY_1514,iYL1228.KPN_01210,iZ_1308.Z2793 Bacteria 1MUMF@1224,1RPUZ@1236,3Z243@583,COG0334@1,COG0334@2 NA|NA|NA C Psort location Cytoplasmic, score Z1_01126 34506.g1575 8.2e-134 483.0 Bilateria Metazoa 39N8C@33154,3CPTA@33208,3E5YA@33213,COG1028@1,KOG0725@2759 NA|NA|NA Q Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase Z1_01127 529507.PMI3006 1.4e-136 492.3 Proteus rsmJ GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008990,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036308,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.242 ko:K15984 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MX8Z@1224,1RMIB@1236,3Z2DR@583,COG0742@1,COG0742@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the guanosine in position 1516 of 16S rRNA Z1_01128 34506.g1573 0.0 1379.0 Rhabditida Nematoda 1KUDP@119089,38SFI@33154,3B98M@33208,3CT8Z@33213,40CJ3@6231,415QS@6236,COG0339@1,KOG2089@2759 NA|NA|NA O Peptidase family M3 Z1_01130 34506.g1572 2.5e-22 110.9 Eukaryota Eukaryota 2SVRC@2759,COG3943@1 NA|NA|NA S Virulence protein RhuM family Z1_01131 529507.PMI3003 8.8e-53 212.6 Gammaproteobacteria ko:K21572 ko00000,ko02000 8.A.46.1,8.A.46.3 Bacteria 1P4P4@1224,1STVU@1236,COG1395@1,COG1395@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_01132 529507.PMI3002 1.8e-105 388.7 Proteus ko:K21964 ko00000,ko02044 Bacteria 1QN1K@1224,1TKE7@1236,2AYBA@1,31QDY@2,3Z3EZ@583 NA|NA|NA S Fimbrillin MatB Z1_01133 529507.PMI3001 2.7e-123 448.0 Proteus matC ko:K21965 ko00000,ko02044 Bacteria 1PB5I@1224,1S46S@1236,3Z3F4@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Part of the ecpRABCDE operon, which encodes the E.coli common pilus (ECP). ECP is found in both commensal and pathogenic strains and plays a dual role in early-stage biofilm development and host cell recognition (By similarity) Z1_01134 521000.PROVRETT_08327 0.0 1461.0 Providencia ko:K21966 ko00000,ko02044 Bacteria 1R2PY@1224,1RMJX@1236,3Z8SZ@586,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Psort location OuterMembrane, score Z1_01135 529507.PMI2998 0.0 1094.0 Proteus ko:K21967 ko00000,ko02044 Bacteria 1R4XB@1224,1RNFY@1236,28J32@1,2Z8ZC@2,3Z3C0@583 NA|NA|NA S Part of the ecpRABCDE operon, which encodes the E.coli common pilus (ECP). ECP is found in both commensal and pathogenic strains and plays a dual role in early-stage biofilm development and host cell recognition. Tip pilus adhesin, which is required for assembly of EcpA into fibers (By similarity) Z1_01136 529507.PMI2997 1.2e-120 439.1 Proteus ko:K21968 ko00000,ko02044 Bacteria 1R9G7@1224,1RSAU@1236,3Z3FV@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Part of the ecpRABCDE operon, which encodes the E.coli common pilus (ECP). ECP is found in both commensal and pathogenic strains and plays a dual role in early-stage biofilm development and host cell recognition (By similarity) Z1_01137 529507.PMI2996 6.3e-160 570.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RDUJ@1224,1S4GE@1236,2E01R@1,30K18@2 NA|NA|NA Z1_01138 529507.PMI2995 2.8e-44 184.1 Proteus Bacteria 1N9M1@1224,1SDDP@1236,3Z3IU@583,COG4104@1,COG4104@2 NA|NA|NA S PAAR motif Z1_01139 529507.PMI2994 1.1e-146 526.2 Proteus Bacteria 1NSQ3@1224,1SMKA@1236,2DUX5@1,33STX@2,3Z3JV@583 NA|NA|NA S No significant database matches Z1_01140 529507.PMI2993 0.0 1840.9 Proteus Bacteria 1PDSI@1224,1RWM4@1236,29W5D@1,30HQD@2,3Z3JI@583 NA|NA|NA Z1_01141 529507.PMI2992 6.3e-240 836.3 Proteus Bacteria 1QGMT@1224,1TE2R@1236,29W5E@1,30HQE@2,3Z3JC@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4123) Z1_01142 34506.g835 0.0 1459.5 Bilateria Metazoa 2SCM5@2759,3AQ84@33154,3C1XD@33208,3DK37@33213,COG3501@1 NA|NA|NA S Phage late control gene D protein (GPD) Z1_01143 34506.g834 7.3e-97 359.8 Bilateria Metazoa 2D3VZ@1,2SSZ2@2759,3ATER@33154,3C4SU@33208,3DK5A@33213 NA|NA|NA S Type VI secretion system effector, Hcp Z1_01144 34506.g833 7.1e-64 249.6 Bilateria Metazoa 2D2M2@1,2SN90@2759,3AK3I@33154,3BZPV@33208,3DGB9@33213 NA|NA|NA S HNH nucleases Z1_01145 529507.PMI2986 4.8e-83 313.9 Proteus yaiL GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09912 ko00000 iECW_1372.ECW_m0432,iWFL_1372.ECW_m0432 Bacteria 1N15V@1224,1S5V0@1236,3Z2WN@583,COG3122@1,COG3122@2 NA|NA|NA S Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2058) Z1_01146 529507.PMI2985 3.4e-134 484.2 Proteus rluA 5.4.99.28,5.4.99.29 ko:K06177 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1QDTQ@1224,1RM82@1236,3Z2BP@583,COG0564@1,COG0564@2 NA|NA|NA J RNA pseudouridylate synthase Z1_01147 529507.PMI2984 2.5e-83 314.7 Proteus csp ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1MXHP@1224,1RRP0@1236,3Z2I2@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K 'Cold-shock' DNA-binding domain Z1_01148 529507.PMI2983 4.9e-131 473.8 Proteus glvR ko:K15835,ko:K19337 ko00000,ko03000 Bacteria 1P0V9@1224,1RRV6@1236,3Z1JN@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain, rpiR family Z1_01149 529507.PMI2982 1.8e-284 984.6 Proteus malX 2.7.1.193,2.7.1.199,2.7.1.201,2.7.1.208,2.7.1.211 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02778,ko:K02779,ko:K02790,ko:K02791,ko:K02802,ko:K02803,ko:K02804,ko:K02809,ko:K02810,ko:K02818,ko:K02819 ko00010,ko00500,ko00520,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02060,map05111 M00265,M00266,M00267,M00269,M00270,M00271 R00811,R02738,R02780,R04111,R05199 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.1.15,4.A.1.1.2,4.A.1.1.3,4.A.1.1.5,4.A.1.1.7,4.A.1.2.1,4.A.1.2.10,4.A.1.2.11,4.A.1.2.12,4.A.1.2.13,4.A.1.2.2,4.A.1.2.4,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6,4.A.1.2.8,4.A.1.2.9 Bacteria 1MU2P@1224,1RNF4@1236,3Z141@583,COG1263@1,COG1263@2,COG1264@1,COG1264@2 NA|NA|NA G phosphotransferase system, EIIB Z1_01150 529507.PMI2981 5.7e-258 896.3 Proteus 4.3.2.2,5.5.1.2 ko:K01756,ko:K01857 ko00230,ko00250,ko00362,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01220,map00230,map00250,map00362,map01100,map01110,map01120,map01130,map01220 M00048,M00049 R01083,R03307,R04559 RC00379,RC00444,RC00445,RC00902 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MXNN@1224,1RS00@1236,3Z1JX@583,COG0015@1,COG0015@2 NA|NA|NA F 3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase Z1_01151 529507.PMI2980 2.1e-241 841.3 Proteus ko:K03308 ko00000 2.A.22.4,2.A.22.5 Bacteria 1MUZJ@1224,1RPCT@1236,3Z1X8@583,COG0733@1,COG0733@2 NA|NA|NA S Sodium:neurotransmitter symporter family Z1_01152 529507.PMI2979 0.0 1478.4 Proteus fdhF 1.17.1.10,1.17.1.9,1.17.99.7 ko:K00123,ko:K05299,ko:K22015 ko00630,ko00680,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00630,map00680,map00720,map01100,map01120,map01200 M00377 R00134,R00519 RC02796 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iHN637.CLJU_c06990 Bacteria 1QTZB@1224,1T1JA@1236,3Z392@583,COG3383@1,COG3383@2 NA|NA|NA C Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain Z1_01153 529507.PMI2978 8.2e-128 463.0 Proteus nanE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006040,GO:0006050,GO:0006051,GO:0006053,GO:0006054,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0019262,GO:0019752,GO:0042737,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046346,GO:0046348,GO:0046395,GO:0047465,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901575 2.7.1.60,5.1.3.9 ko:K01788,ko:K13967 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R02087,R02705 RC00002,RC00017,RC00290 ko00000,ko00001,ko01000 iB21_1397.B21_03034,iECBD_1354.ECBD_0524,iECB_1328.ECB_03083,iECD_1391.ECD_03083,iEcHS_1320.EcHS_A3411,iEcolC_1368.EcolC_0483,iSFV_1184.SFV_3248,iSF_1195.SF3259,iSFxv_1172.SFxv_3571,iS_1188.S3476,iUTI89_1310.UTI89_C3653,ic_1306.c3977 Bacteria 1PRVW@1224,1RS59@1236,3Z2SN@583,COG3010@1,COG3010@2 NA|NA|NA G Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase Z1_01154 529507.PMI2977 1.3e-159 568.9 Proteus nanK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0006040,GO:0006054,GO:0006082,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009384,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0019200,GO:0019262,GO:0019752,GO:0033554,GO:0042737,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046348,GO:0046395,GO:0046835,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901575 2.7.1.2,2.7.1.60,5.1.3.9 ko:K00845,ko:K00885,ko:K13967 ko00010,ko00052,ko00500,ko00520,ko00521,ko00524,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00052,map00500,map00520,map00521,map00524,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00001,M00549 R00299,R01600,R01786,R02087,R02705 RC00002,RC00017,RC00290 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_3494,iECO26_1355.ECO26_4321,iECSF_1327.ECSF_3047,iECs_1301.ECs4095,iSFV_1184.SFV_3247,iSFxv_1172.SFxv_3570,iZ_1308.Z4580 Bacteria 1Q78E@1224,1RRA2@1236,3Z29J@583,COG1940@1,COG1940@2 NA|NA|NA GK ROK family Z1_01155 529507.PMI2976 3e-268 930.6 Proteus nanT ko:K03307 ko00000 2.A.21 Bacteria 1R4VK@1224,1RQFS@1236,3Z1TY@583,COG0591@1,COG0591@2 NA|NA|NA E Sodium:solute symporter family Z1_01156 529507.PMI2975 1.1e-83 315.8 Proteus yhcH GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 ko:K19334 ko00000,ko02048 Bacteria 1RCDU@1224,1S4CF@1236,3Z2RZ@583,COG2731@1,COG2731@2 NA|NA|NA G Domain of unknown function (DUF386) Z1_01157 529507.PMI2974 6.7e-159 566.6 Proteus rpiR GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K15835,ko:K19337 ko00000,ko03000 Bacteria 1NUQ1@1224,1RNUZ@1236,3Z1ZD@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain, rpiR family Z1_01158 529507.PMI2973 1e-167 595.9 Proteus nanA 4.1.3.3,4.3.3.7 ko:K01639,ko:K01714 ko00261,ko00300,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00261,map00300,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R01811,R10147 RC00159,RC00600,RC03062,RC03063 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R53X@1224,1RRVA@1236,3Z2HH@583,COG0329@1,COG0329@2 NA|NA|NA EM Dihydrodipicolinate synthetase family Z1_01159 529507.PMI2972 6.7e-122 443.4 Proteus Bacteria 1QCM6@1224,1T8CH@1236,2ACXY@1,312JJ@2,3Z2MS@583 NA|NA|NA Z1_01160 529507.PMI2971 0.0 1315.8 Proteus Bacteria 1MV2W@1224,1RQS2@1236,3Z3BG@583,COG1835@1,COG1835@2 NA|NA|NA I Acyltransferase family Z1_01161 529507.PMI2970 8.7e-125 453.0 Proteus sapB ko:K07507 ko00000,ko02000 9.B.20 Bacteria 1MURJ@1224,1S0FM@1236,3Z1KK@583,COG1285@1,COG1285@2 NA|NA|NA S MgtC family Z1_01162 529507.PMI2969 7.1e-223 779.6 Proteus ko:K03301,ko:K08218,ko:K11537 ko01501,map01501 M00628 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.1.10.2,2.A.1.25,2.A.12 Bacteria 1MWI9@1224,1RMU5@1236,3Z193@583,COG2211@1,COG2211@2 NA|NA|NA G Nucleoside H+ symporter Z1_01163 529507.PMI2968 2.2e-164 584.7 Proteus 3.1.4.55 ko:K06167 ko00440,map00440 R10205 RC00296 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1NNVZ@1224,1T7JW@1236,3Z1IY@583,COG1235@1,COG1235@2 NA|NA|NA S Beta-lactamase superfamily domain Z1_01164 529507.PMI2967 0.0 1458.0 Proteus ko:K02027,ko:K02529 M00207 ko00000,ko00002,ko02000,ko03000 3.A.1.1 Bacteria 1P8CC@1224,1S0CU@1236,3Z2GS@583,COG1609@1,COG1609@2,COG1653@1,COG1653@2 NA|NA|NA K Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_01165 529507.PMI2966 1.8e-164 585.1 Proteus ko:K07308 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1RDNF@1224,1S5JZ@1236,3Z1G8@583,COG3302@1,COG3302@2 NA|NA|NA S DMSO reductase anchor subunit (DmsC) Z1_01166 529507.PMI2965 1.2e-125 455.7 Proteus ko:K07307 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1MU1B@1224,1SYHX@1236,3Z1CV@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_01167 529507.PMI2964 0.0 1631.3 Proteus dmsA 1.8.5.3 ko:K07306 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1NR6J@1224,1RMVE@1236,3Z2H4@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C anaerobic DMSO reductase chain A precursor K00369 Z1_01168 529507.PMI2963 9e-144 516.2 Proteus Bacteria 1P1FH@1224,1RS0Z@1236,3Z12E@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K AraC-like ligand binding domain Z1_01169 529507.PMI2962 4.2e-262 910.2 Proteus smvA ko:K08167 M00713,M00714 ko00000,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.1.3 Bacteria 1MWXZ@1224,1RY5H@1236,3Z15W@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator superfamily Z1_01170 529507.PMI2961 3.1e-98 364.4 Proteus Bacteria 1N6TK@1224,1S2VH@1236,3Z27P@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, tetR family Z1_01171 34506.g998 4.9e-134 483.8 Eukaryota Eukaryota COG1131@1,KOG0059@2759 NA|NA|NA V ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances Z1_01172 529507.PMI2959 7.3e-170 603.2 Proteus fatC ko:K02015 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1NM9D@1224,1RPAH@1236,3Z171@583,COG4605@1,COG4605@2 NA|NA|NA P FecCD transport family Z1_01173 529507.PMI2958 1.9e-146 525.4 Proteus feuB ko:K02015 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MVSV@1224,1RQCK@1236,3Z1JB@583,COG4606@1,COG4606@2 NA|NA|NA P FecCD transport family Z1_01174 529507.PMI2957 2.2e-176 624.8 Proteus fatB ko:K02016 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1R54Y@1224,1RZ1I@1236,3Z1YP@583,COG4607@1,COG4607@2 NA|NA|NA P Periplasmic binding protein Z1_01175 529507.PMI2956 7.6e-52 209.5 Proteus chbB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009401,GO:0015144,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034219,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0090563,GO:0090566,GO:1901264,GO:1902815 2.7.1.196,2.7.1.205 ko:K02760 ko00500,ko02060,map00500,map02060 M00275 R11170,R11172 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.3.2 iSbBS512_1146.SbBS512_E1982 Bacteria 1RITP@1224,1S632@1236,3Z2PD@583,COG1440@1,COG1440@2 NA|NA|NA G PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit Z1_01176 529507.PMI2955 5.9e-247 859.8 Proteus celB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008150,GO:0016020,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944,GO:1901264,GO:1902815 ko:K02761 ko00500,ko02060,map00500,map02060 M00275 R11170,R11172 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 4.A.3.2 iECABU_c1320.ECABU_c19930 Bacteria 1PF2A@1224,1SYHD@1236,3Z1FY@583,COG1455@1,COG1455@2 NA|NA|NA G The phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system (PTS), a major carbohydrate active - transport system, catalyzes the phosphorylation of incoming sugar substrates concomitant with their translocation across the cell membrane Z1_01177 529507.PMI2954 7.3e-53 213.0 Proteus celC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009401,GO:0009987,GO:0015144,GO:0016043,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0022607,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034219,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051259,GO:0051260,GO:0055085,GO:0065003,GO:0071702,GO:0071840,GO:0090563,GO:0090566,GO:1901264,GO:1902815 2.7.1.196,2.7.1.205 ko:K02759 ko00500,ko02060,map00500,map02060 M00275 R11170,R11172 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.3.2 iECUMN_1333.ECUMN_2025 Bacteria 1RI0T@1224,1S75F@1236,3Z2U9@583,COG1447@1,COG1447@2 NA|NA|NA G PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit Z1_01178 529507.PMI2953 2.7e-157 561.2 Proteus chbR GO:0001047,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0044212,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 2.1.1.63,3.1.31.1,3.2.2.21 ko:K01174,ko:K03490,ko:K10778,ko:K13529,ko:K15051 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000,ko03400 Bacteria 1MXV1@1224,1RQRD@1236,3Z1HE@583,COG1917@1,COG1917@2,COG2169@1,COG2169@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_01179 34506.g1000 6.7e-259 899.4 Bilateria Metazoa 2D1J6@1,2SIAT@2759,3AI7M@33154,3BYUX@33208,3DFVJ@33213 NA|NA|NA S Phosphotransferase system, EIIC Z1_01180 529507.PMI2951 7.6e-143 513.1 Proteus chbG 2.7.1.196,2.7.1.205,3.5.1.105 ko:K02759,ko:K03478 ko00500,ko02060,map00500,map02060 M00275 R11170,R11172 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.3.2 Bacteria 1MX3P@1224,1RRC4@1236,3Z1DX@583,COG3394@1,COG3394@2 NA|NA|NA F Involved in the degradation of chitin. ChbG is essential for growth on the acetylated chitooligosaccharides chitobiose and chitotriose but is dispensable for growth on cellobiose and chitosan dimer, the deacetylated form of chitobiose. Deacetylation of chitobiose-6-P and chitotriose-6-P is necessary for both the activation of the chb promoter by the regulatory protein ChbR and the hydrolysis of phosphorylated beta-glucosides by the phospho- beta-glucosidase ChbF. Catalyzes the removal of only one acetyl group from chitobiose-6-P to yield monoacetylchitobiose-6-P, the inducer of ChbR and the substrate of ChbF Z1_01181 529507.PMI2950 1.1e-98 365.9 Proteus ko:K16078 ko00000,ko02000 1.B.6.2.2 Bacteria 1RH8M@1224,1S67J@1236,3Z2M7@583,COG3637@1,COG3637@2 NA|NA|NA M Enterobacterial Ail/Lom protein Z1_01182 529507.PMI2949 5.7e-105 387.1 Proteus mtsE ko:K11089 ko05322,map05322 ko00000,ko00001 Bacteria 1PBVT@1224,1RSKK@1236,3Z1HH@583,COG2304@1,COG2304@2 NA|NA|NA S von willebrand factor, type A Z1_01183 529507.PMI2948 6.1e-148 530.0 Proteus ubiE_1 Bacteria 1MXP4@1224,1RRP4@1236,3Z29P@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA Q Methyl-transferase Z1_01184 529507.PMI2947 2.7e-304 1050.4 Proteus nikA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006935,GO:0008150,GO:0009605,GO:0016151,GO:0020037,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046906,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050896,GO:0050919,GO:0051540,GO:0097159,GO:1901363 ko:K15584 ko02010,map02010 M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 iSFV_1184.SFV_3479 Bacteria 1P1HT@1224,1RQ7Z@1236,3Z2CU@583,COG0747@1,COG0747@2 NA|NA|NA E Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_01185 529507.PMI2946 2.7e-166 591.3 Proteus nikB GO:0000041,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015099,GO:0015318,GO:0015675,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016151,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035444,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046873,GO:0046914,GO:0046915,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K15585 ko02010,map02010 M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 iG2583_1286.G2583_4198 Bacteria 1MU8Z@1224,1RP7R@1236,3Z2DA@583,COG0601@1,COG0601@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01186 529507.PMI2945 1.3e-159 568.9 Proteus ko:K02034,ko:K12370,ko:K15582,ko:K15586 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1NNQQ@1224,1RNGP@1236,3Z1BJ@583,COG1173@1,COG1173@2 NA|NA|NA P N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C Z1_01187 529507.PMI2944 1.3e-140 505.8 Proteus oppD 3.6.3.24 ko:K02031,ko:K02032,ko:K12371,ko:K15583,ko:K15587 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1R47H@1224,1RY2U@1236,3Z1UK@583,COG0444@1,COG0444@2 NA|NA|NA EP ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_01188 529507.PMI2943 3.7e-134 484.2 Proteus 3.6.3.24 ko:K10823,ko:K10824,ko:K12372 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1MUGS@1224,1S00H@1236,3Z222@583,COG4608@1,COG4608@2 NA|NA|NA E ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_01189 529507.PMI2942 1.1e-69 269.2 Proteus Bacteria 1NZ1Z@1224,1SQ53@1236,2F7FD@1,33ZW5@2,3Z3EF@583 NA|NA|NA Z1_01190 529507.PMI2941 9.1e-308 1062.0 Proteus Bacteria 1MY11@1224,1RP3F@1236,3Z26D@583,COG1069@1,COG1069@2 NA|NA|NA C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain Z1_01191 529507.PMI2940 0.0 1080.1 Proteus 5.3.1.25,5.3.1.3 ko:K01818 ko00051,ko01120,map00051,map01120 R03163 RC00434 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1NTJI@1224,1RY1B@1236,3Z181@583,COG2407@1,COG2407@2 NA|NA|NA G Converts the aldose L-fucose into the corresponding ketose L-fuculose Z1_01192 529507.PMI2939 6.3e-176 623.2 Proteus 4.1.3.3,4.3.3.7 ko:K01639,ko:K01714 ko00261,ko00300,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00261,map00300,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R01811,R10147 RC00159,RC00600,RC03062,RC03063 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVWH@1224,1RP7A@1236,3Z1AI@583,COG0329@1,COG0329@2 NA|NA|NA EM Dihydrodipicolinate synthetase family Z1_01193 529507.PMI2938 2.5e-213 747.7 Proteus 3.2.1.40 ko:K05989 ko00000,ko01000 Bacteria 1Q1EG@1224,1RRF0@1236,3Z1GD@583,COG4409@1,COG4409@2,COG4692@1,COG4692@2 NA|NA|NA G BNR repeat-like domain Z1_01194 529507.PMI2937 1.2e-180 639.0 Proteus Bacteria 1P88K@1224,1SYHY@1236,3Z24G@583,COG3181@1,COG3181@2 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter family receptor Z1_01195 529507.PMI2936 1.1e-75 289.3 Proteus Bacteria 1RKQ9@1224,1S77B@1236,2AY2W@1,31Q4P@2,3Z19N@583 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter TctB family Z1_01196 529507.PMI2935 3.2e-270 937.2 Proteus ko:K07793 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.80.1 Bacteria 1MUKR@1224,1RMQB@1236,3Z0YU@583,COG3333@1,COG3333@2 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter TctA family Z1_01197 529507.PMI2934 2.7e-188 664.5 Proteus fruR 3.2.1.26 ko:K01193,ko:K02529,ko:K03435 ko00052,ko00500,ko01100,map00052,map00500,map01100 R00801,R00802,R02410,R03635,R03921,R06088 RC00028,RC00077 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000 GH32 Bacteria 1MXQ1@1224,1RPK9@1236,3Z1Q6@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K helix_turn _helix lactose operon repressor Z1_01198 529507.PMI2933 2.8e-113 414.5 Proteus Bacteria 1REIV@1224,1S4UW@1236,2C03A@1,2Z86B@2,3Z25U@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4291) Z1_01199 34506.g6764 3.5e-171 607.4 Eukaryota MTHFR1 GO:0003674,GO:0003824,GO:0004489,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006730,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114 1.5.1.20,3.6.4.12 ko:K00297,ko:K10901 ko00670,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,ko01523,ko03440,ko03460,map00670,map00720,map01100,map01120,map01200,map01523,map03440,map03460 M00295,M00377,M00414 R01224,R07168 RC00081 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Eukaryota COG0685@1,KOG0564@2759 NA|NA|NA E methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) activity Z1_01200 529507.PMI2931 1.9e-64 251.5 Proteus yeaO Bacteria 1MZ7H@1224,1S9PQ@1236,3Z2ZM@583,COG3189@1,COG3189@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF488 Z1_01201 529507.PMI2930 2.7e-293 1013.8 Proteus glpD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004368,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006072,GO:0006091,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009056,GO:0009331,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016901,GO:0019637,GO:0022900,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046168,GO:0046434,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0052590,GO:0052646,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0071949,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575,GO:1902494,GO:1990204 1.1.5.3 ko:K00111 ko00564,ko01110,map00564,map01110 R00848 RC00029 ko00000,ko00001,ko01000 iSSON_1240.SSON_3663 Bacteria 1MUMY@1224,1RMGP@1236,3Z25P@583,COG0578@1,COG0578@2 NA|NA|NA C C-terminal domain of alpha-glycerophosphate oxidase Z1_01202 529507.PMI2929 1.3e-139 502.3 Proteus glpR ko:K02444 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUJG@1224,1RPS0@1236,3Z1EB@583,COG1349@1,COG1349@2 NA|NA|NA K DeoR C terminal sensor domain Z1_01203 529507.PMI2928 2.9e-156 557.8 Proteus glpG GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004252,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006355,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044238,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02441 ko00000 Bacteria 1MYPM@1224,1RN1K@1236,3Z0WR@583,COG0705@1,COG0705@2 NA|NA|NA S Rhomboid-type serine protease that catalyzes intramembrane proteolysis Z1_01204 529507.PMI2927 1.8e-56 224.9 Proteus glpE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004792,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0044424,GO:0044464 2.8.1.1 ko:K02439,ko:K07390 ko00920,ko01110,ko01120,map00920,map01110,map01120 R01931 ko00000,ko00001,ko01000,ko03029,ko03110 iECSF_1327.ECSF_3244 Bacteria 1MZPW@1224,1S94C@1236,3Z2P4@583,COG0607@1,COG0607@2 NA|NA|NA H Catalyzes, although with low efficiency, the sulfur transfer reaction from thiosulfate to cyanide Z1_01205 529507.PMI2926 4.7e-105 387.1 Proteus nfuA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006950,GO:0006979,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010106,GO:0010467,GO:0015976,GO:0016043,GO:0016226,GO:0019538,GO:0019725,GO:0022607,GO:0030003,GO:0031163,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0042592,GO:0042594,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046916,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051604,GO:0051716,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097428,GO:0098771,GO:1901564 ko:K07400,ko:K13628,ko:K19168 ko00000,ko02048,ko03016 Bacteria 1MU8Y@1224,1RN7J@1236,3Z1S7@583,COG0316@1,COG0316@2,COG0694@1,COG0694@2 NA|NA|NA C Involved in iron-sulfur cluster biogenesis. Binds a 4Fe- 4S cluster, can transfer this cluster to apoproteins, and thereby intervenes in the maturation of Fe S proteins. Could also act as a scaffold chaperone for damaged Fe S proteins Z1_01206 529507.PMI2925 7.1e-132 476.5 Proteus comF GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0015976,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 Bacteria 1RHAV@1224,1S64Q@1236,3Z2CX@583,COG1040@1,COG1040@2 NA|NA|NA S Competence protein Z1_01207 529507.PMI2924 2.1e-148 531.6 Proteus bioH 2.1.1.197,3.1.1.85 ko:K02169,ko:K02170 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00572 R09543,R09725 RC00003,RC00460,RC00461 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1N2R9@1224,1T1K8@1236,3Z0YH@583,COG2267@1,COG2267@2 NA|NA|NA F The physiological role of BioH is to remove the methyl group introduced by BioC when the pimeloyl moiety is complete. It allows to synthesize pimeloyl-ACP via the fatty acid synthetic pathway through the hydrolysis of the ester bonds of pimeloyl-ACP esters Z1_01208 529507.PMI2923 9.1e-80 302.8 Proteus osmC Bacteria 1QUE7@1224,1S84Z@1236,3Z3F0@583,COG1765@1,COG1765@2 NA|NA|NA O OsmC-like protein Z1_01209 529507.PMI2922 2.1e-35 154.5 Proteus feoC ko:K07490 ko00000,ko02000 Bacteria 1N73I@1224,1SDB1@1236,2E630@1,330S2@2,3Z320@583 NA|NA|NA K May function as a transcriptional regulator that controls feoABC expression Z1_01210 34506.g6762 0.0 1507.3 Bilateria Metazoa 2D1K3@1,2SIE2@2759,3AIXS@33154,3BXFK@33208,3DE1W@33213 NA|NA|NA S Ferrous iron transport protein B C terminus Z1_01211 529507.PMI2920 2.7e-35 154.1 Proteus feoA GO:0000041,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006826,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015684,GO:0030001,GO:0033554,GO:0034220,GO:0034755,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0070627,GO:0070838,GO:0072511,GO:0097286,GO:0098655,GO:0098657,GO:0098659,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098707,GO:0098711,GO:0098739,GO:0099587,GO:1903874 ko:K04758 ko00000,ko02000 Bacteria 1QF6U@1224,1TCA2@1236,3Z325@583,COG1918@1,COG1918@2 NA|NA|NA P ferrous iron import across plasma membrane Z1_01212 529507.PMI2919 7.8e-290 1002.3 Proteus Bacteria 1NX5N@1224,1S01X@1236,3Z1FJ@583,COG3779@1,COG3779@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4026) Z1_01213 529507.PMI2918 1.1e-76 292.7 Proteus yihI GO:0003674,GO:0005096,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008047,GO:0008150,GO:0030234,GO:0030695,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043547,GO:0044087,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051336,GO:0051345,GO:0060589,GO:0065007,GO:0065009,GO:0090069,GO:0090071,GO:0098772 ko:K09894 ko00000 Bacteria 1N8HM@1224,1SDUG@1236,3Z2YB@583,COG3078@1,COG3078@2 NA|NA|NA S A GTPase-activating protein (GAP) that modifies Der EngA GTPase function. May play a role in ribosome biogenesis Z1_01214 529507.PMI2917 9.7e-296 1021.9 Proteus Bacteria 1QA8B@1224,1RZ93@1236,3Z2AN@583,COG1807@1,COG1807@2 NA|NA|NA M Psort location CytoplasmicMembrane, score 10.00 Z1_01215 529507.PMI2916 7.9e-102 376.3 Proteus 2.3.1.128 ko:K03790 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1RKKE@1224,1S47R@1236,3Z0VU@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_01216 529507.PMI2915 5.7e-234 816.6 Proteus yicO ko:K06901 ko00000,ko02000 2.A.1.40 Bacteria 1MUV0@1224,1RMBE@1236,3Z20X@583,COG2252@1,COG2252@2 NA|NA|NA S Permease family Z1_01217 529507.PMI2914 0.0 1404.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1MX2K@1224,1RYHV@1236,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U COG3210 Large exoproteins involved in heme utilization or adhesion Z1_01218 529507.PMI2913 6.8e-65 253.1 Gammaproteobacteria acpS 2.7.8.7,4.2.1.136 ko:K00997,ko:K17758 ko00770,map00770 R01625 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iHN637.CLJU_RS01470 Bacteria 1N9WH@1224,1SQFT@1236,COG0736@1,COG0736@2 NA|NA|NA I Transfers the 4'-phosphopantetheine moiety from coenzyme A to a Ser of Z1_01219 529507.PMI2912 4.3e-130 470.7 Proteus Bacteria 1MU6X@1224,1RMBB@1236,3Z1GK@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_01220 529507.PMI2911 4.4e-103 380.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NWZD@1224,1SP9D@1236,COG0764@1,COG0764@2 NA|NA|NA I FabA-like domain Z1_01221 529507.PMI2910 7e-50 203.0 Gammaproteobacteria ko:K02078 ko00000,ko00001 Bacteria 1NXQU@1224,1SRZM@1236,COG0236@1,COG0236@2 NA|NA|NA IQ acyl carrier protein Z1_01222 529507.PMI2909 2e-224 784.6 Gammaproteobacteria gcvT 2.1.2.10 ko:K00605,ko:K11053 ko00260,ko00630,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,map00260,map00630,map00670,map01100,map01110,map01130,map01200 M00532 R01221,R02300,R04125 RC00022,RC00069,RC00183,RC02834 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1PG7W@1224,1SJRT@1236,COG0404@1,COG0404@2 NA|NA|NA E Glycine cleavage T-protein C-terminal barrel domain Z1_01223 529507.PMI2908 0.0 1699.5 Proteus Bacteria 1MU1X@1224,1RMDE@1236,3Z14J@583,COG0304@1,COG0304@2 NA|NA|NA I Catalyzes the condensation reaction of fatty acid synthesis by the addition to an acyl acceptor of two carbons from malonyl-ACP Z1_01224 529507.PMI2907 1.1e-228 798.9 Gammaproteobacteria 2.3.1.179 ko:K09458 ko00061,ko00780,ko01100,ko01212,map00061,map00780,map01100,map01212 M00083,M00572 R04355,R04726,R04952,R04957,R04960,R04963,R04968,R07762,R10115,R10119 RC00039,RC02728,RC02729,RC02888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Bacteria 1NT4S@1224,1SKQ0@1236,COG0304@1,COG0304@2 NA|NA|NA IQ Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain Z1_01225 529507.PMI2906 3.6e-196 690.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NSEZ@1224,1SJU5@1236,2CIEE@1,33PEE@2 NA|NA|NA Z1_01226 529507.PMI2905 3.4e-129 467.6 Bacteria ybbA ko:K02003,ko:K02004 M00258 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria COG1136@1,COG1136@2 NA|NA|NA V lipoprotein transporter activity Z1_01227 529507.PMI2904 1.3e-114 419.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1NIEG@1224,1SP91@1236,2EPVK@1,33HG3@2 NA|NA|NA Z1_01228 529507.PMI2903 1.7e-227 795.0 Proteobacteria ko:K02003,ko:K02004,ko:K09808,ko:K11636 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00255,M00258,M00315 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1,3.A.1.125,3.A.1.134.6 Bacteria 1R4Q2@1224,COG4591@1,COG4591@2 NA|NA|NA M ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component Z1_01229 529507.PMI2902 1.2e-177 629.0 Proteus fabD 2.3.1.39 ko:K00645,ko:K15327,ko:K15329,ko:K15355,ko:K15469 ko00061,ko00333,ko01100,ko01130,ko01212,map00061,map00333,map01100,map01130,map01212 M00082 R01626,R11671 RC00004,RC00039,RC02727 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko01008 Bacteria 1MV6N@1224,1RNH3@1236,3Z13H@583,COG0331@1,COG0331@2 NA|NA|NA I Acyl transferase domain Z1_01230 1141662.OOA_08777 4.8e-60 238.4 Gammaproteobacteria ycdU GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1R77S@1224,1S0M0@1236,28KHX@1,2ZA3B@2 NA|NA|NA Z1_01231 529507.PMI2900 2e-132 478.4 Proteus glnP ko:K02029,ko:K10002 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00230,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 Bacteria 1PT12@1224,1RRQK@1236,3Z1CE@583,COG0765@1,COG0765@2 NA|NA|NA P (ABC) transporter Z1_01232 529507.PMI2899 2.8e-134 484.6 Proteus gltJ ko:K02029,ko:K10003,ko:K10040 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00228,M00230,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 Bacteria 1P47I@1224,1RR4Q@1236,3Z1T6@583,COG0765@1,COG0765@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01233 529507.PMI2898 3.7e-151 540.8 Proteus fliY_2 ko:K02030 M00236 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1.3 Bacteria 1MVT6@1224,1RMG5@1236,3Z1HM@583,COG0834@1,COG0834@2 NA|NA|NA ET Bacterial periplasmic substrate-binding proteins Z1_01234 529507.PMI2897 4.3e-135 487.3 Proteus phoU GO:0000287,GO:0001558,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006873,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009268,GO:0009405,GO:0009408,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009892,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010468,GO:0010563,GO:0010605,GO:0010629,GO:0010966,GO:0016020,GO:0016036,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019725,GO:0019897,GO:0019898,GO:0022898,GO:0030002,GO:0030145,GO:0030320,GO:0030643,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032409,GO:0032410,GO:0032412,GO:0032413,GO:0032879,GO:0033554,GO:0034605,GO:0034762,GO:0034763,GO:0034765,GO:0034766,GO:0040008,GO:0042221,GO:0042592,GO:0042594,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043269,GO:0043271,GO:0044070,GO:0044092,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045936,GO:0046677,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046983,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051051,GO:0051128,GO:0051174,GO:0051704,GO:0051716,GO:0055062,GO:0055081,GO:0055082,GO:0055083,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009,GO:0070887,GO:0071214,GO:0071236,GO:0071467,GO:0071496,GO:0071944,GO:0072501,GO:0072502,GO:0072505,GO:0072506,GO:0098771,GO:0104004,GO:1903792,GO:1903795,GO:1903796,GO:1903959,GO:1903960,GO:2000185,GO:2000186 ko:K02039 ko00000 Bacteria 1MUMI@1224,1RMW5@1236,3Z1DT@583,COG0704@1,COG0704@2 NA|NA|NA P Part of the phosphate (Pho) regulon, which plays a key role in phosphate homeostasis. PhoU is essential for the repression of the Pho regulon at high phosphate conditions Z1_01235 529507.PMI2896 1.8e-144 518.5 Proteus pstB GO:0000166,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005315,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006817,GO:0006820,GO:0008144,GO:0008150,GO:0010921,GO:0015291,GO:0015318,GO:0015698,GO:0016020,GO:0017076,GO:0019220,GO:0019222,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031323,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034220,GO:0035303,GO:0035435,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051336,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:1901265,GO:1901363 3.6.3.27 ko:K02036 ko02010,map02010 M00222 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.7 Bacteria 1MU16@1224,1RNUF@1236,3Z23B@583,COG1117@1,COG1117@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex PstSACB involved in phosphate import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_01236 34506.g5145 3.3e-161 574.3 Bilateria Metazoa 2ECCN@1,2SI8V@2759,3AGPK@33154,3BZF7@33208,3DEB6@33213 NA|NA|NA S Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01237 529507.PMI2894 5.4e-170 603.6 Proteus pstC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006817,GO:0006820,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010921,GO:0015698,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019220,GO:0019222,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0034220,GO:0035303,GO:0035435,GO:0040007,GO:0044110,GO:0044116,GO:0044117,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051336,GO:0051704,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661 ko:K02037,ko:K02038 ko02010,map02010 M00222 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.7 ic_1306.c4652 Bacteria 1MVKP@1224,1RQXJ@1236,3Z1CR@583,COG0573@1,COG0573@2 NA|NA|NA P probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane Z1_01238 529507.PMI2893 4.1e-192 677.2 Proteus pstS ko:K02040 ko02010,ko02020,ko05152,map02010,map02020,map05152 M00222 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.7 Bacteria 1MUAZ@1224,1RN5Q@1236,3Z1SR@583,COG0226@1,COG0226@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex PstSACB involved in phosphate import Z1_01239 529507.PMI2892 2.1e-252 877.9 Proteus Bacteria 1MUAK@1224,1RPP2@1236,3Z11F@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T His Kinase A (phosphoacceptor) domain Z1_01240 34506.g1331 2.2e-131 474.9 Rhabditida Nematoda 1M6P0@119089,3AH77@33154,3BZ0U@33208,3DF7I@33213,40P6Z@6231,4153N@6236,COG5641@1,KOG1601@2759 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_01241 529507.PMI2890 4.5e-85 320.5 Proteus greB GO:0006139,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006354,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010604,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031437,GO:0031439,GO:0032774,GO:0032784,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903311,GO:1903313,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K04760 ko00000,ko03021 Bacteria 1RAP0@1224,1S40Q@1236,3Z2D5@583,COG0782@1,COG0782@2 NA|NA|NA K Necessary for efficient RNA polymerase transcription elongation past template-encoded arresting sites. The arresting sites in DNA have the property of trapping a certain fraction of elongating RNA polymerases that pass through, resulting in locked ternary complexes. Cleavage of the nascent transcript by cleavage factors such as GreA or GreB allows the resumption of elongation from the new 3'terminus. GreB releases sequences of up to 9 nucleotides in length Z1_01242 529507.PMI2889 0.0 1483.8 Proteus yhgF GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896 ko:K06959 ko00000 Bacteria 1MUA7@1224,1RMNH@1236,3Z1GB@583,COG2183@1,COG2183@2 NA|NA|NA K Likely ribonuclease with RNase H fold. Z1_01243 529507.PMI2888 7.4e-118 429.9 Proteus csgG Bacteria 1NDU8@1224,1RPPY@1236,3Z189@583,COG1462@1,COG1462@2 NA|NA|NA M Curli production assembly/transport component CsgG Z1_01244 529507.PMI2887 5.9e-58 229.9 Proteus Z012_10670 Bacteria 1N7DV@1224,1S7AS@1236,3Z2XV@583,COG4259@1,COG4259@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4810) Z1_01245 529507.PMI2886 1.8e-113 415.2 Proteus VY92_06375 Bacteria 1R3WM@1224,1RSP7@1236,3Z242@583,COG4380@1,COG4380@2 NA|NA|NA M Putative bacterial lipoprotein (DUF799) Z1_01246 34506.g1433 5.5e-269 932.9 Bilateria Metazoa 2QRH0@2759,3AJ5F@33154,3BZCK@33208,3DEQ8@33213,COG0635@1 NA|NA|NA H HemN C-terminal domain Z1_01247 529507.PMI2884 5.5e-272 943.0 Proteus glnG GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0043565,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K07712 ko02020,map02020 M00497 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1MU0N@1224,1RMCK@1236,3Z29K@583,COG2204@1,COG2204@2 NA|NA|NA T Bacterial regulatory protein, Fis family Z1_01248 529507.PMI2883 1e-190 672.5 Proteus glnL GO:0000155,GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0004721,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016311,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019222,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0035556,GO:0036211,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044464,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 2.7.13.3 ko:K07708,ko:K07710 ko02020,map02020 M00497,M00500 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1MVN6@1224,1RN15@1236,3Z149@583,COG3852@1,COG3852@2 NA|NA|NA T Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific Z1_01249 34506.g1431 1.4e-275 954.9 Bilateria Metazoa 39EXA@33154,3BAVA@33208,3CZQ0@33213,COG0174@1,KOG0683@2759 NA|NA|NA E lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain Z1_01250 529507.PMI2881 0.0 1194.5 Proteus typA GO:0000027,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006996,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0034622,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071826,GO:0071840 ko:K06207 ko00000 Bacteria 1MV5Q@1224,1RMJB@1236,3Z25F@583,COG1217@1,COG1217@2 NA|NA|NA T Elongation factor G C-terminus Z1_01252 34506.g6326 1.1e-87 329.7 Eukaryota 5.4.99.21 ko:K06182 ko00000,ko01000,ko03009 Eukaryota 2S02U@2759,COG1187@1 NA|NA|NA J RNA pseudouridylate synthase Z1_01253 1166016.W5S_0554 5.1e-08 64.3 Pectobacterium Bacteria 1MSKC@122277,1QFF9@1224,1TCPE@1236,2BGYW@1,32AZ0@2 NA|NA|NA Z1_01254 529507.PMI2876 7e-47 193.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1NAFS@1224,1SCGR@1236,COG3620@1,COG3620@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_01255 529507.PMI2875 1.3e-113 415.6 Proteus yihX GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008877,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0030145,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050308 3.1.3.10 ko:K20866 ko00010,ko01120,map00010,map01120 R00947 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1PGNF@1224,1RRDC@1236,3Z2GA@583,COG1011@1,COG1011@2 NA|NA|NA S Haloacid dehalogenase-like hydrolase Z1_01256 529507.PMI2874 9.2e-77 292.7 Proteus dtd GO:0002161,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006450,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051499,GO:0051500,GO:0052689,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0090304,GO:0106026,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 ko:K07560 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1RGTV@1224,1S61I@1236,3Z2HF@583,COG1490@1,COG1490@2 NA|NA|NA J rejects L-amino acids rather than detecting D-amino acids in the active site. By recycling D-aminoacyl-tRNA to D-amino acids and free tRNA molecules, this enzyme counteracts the toxicity associated with the formation of D-aminoacyl-tRNA entities in vivo and helps enforce protein L-homochirality Z1_01257 529507.PMI2873 3.1e-175 620.9 Proteus yiiD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043543,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564 ko:K06323 ko00000 Bacteria 1R407@1224,1RPJ2@1236,3Z2FJ@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Putative thioesterase (yiiD_Cterm) Z1_01258 529507.PMI2872 5.1e-159 567.0 Proteus rluF GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022613,GO:0031118,GO:0031119,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.19,5.4.99.21,5.4.99.22 ko:K06178,ko:K06182,ko:K06183 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MXQE@1224,1RMC7@1236,3Z2BN@583,COG1187@1,COG1187@2 NA|NA|NA J S4 RNA-binding domain Z1_01259 529507.PMI2871 1.5e-36 158.3 Proteus Bacteria 1QCT0@1224,1T8JX@1236,2ADBV@1,3131A@2,3Z327@583 NA|NA|NA Z1_01260 529507.PMI2870 0.0 1092.0 Proteus yicH GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K07289 ko00000 Bacteria 1MU7Y@1224,1RN96@1236,3Z38S@583,COG2982@1,COG2982@2 NA|NA|NA M AsmA Family Z1_01261 34506.g6327 5.8e-250 869.8 Bilateria Metazoa 2QQD4@2759,39J71@33154,3BXTN@33208,3DFB3@33213,COG2233@1 NA|NA|NA F Permease family Z1_01262 34506.g6328 1.7e-213 748.4 Eukaryota Eukaryota 2SZFV@2759,COG0786@1 NA|NA|NA E Sodium/glutamate symporter Z1_01263 529507.PMI2866 0.0 1356.7 Proteus recG GO:0003674,GO:0003678,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009314,GO:0009379,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010501,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0033202,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048476,GO:0050896,GO:0051276,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0140097,GO:0140098,GO:1901360,GO:1902494 3.6.4.12 ko:K03655 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MWN2@1224,1RMMQ@1236,3Z1WX@583,COG1200@1,COG1200@2 NA|NA|NA L Critical role in recombination and DNA repair. Helps process Holliday junction intermediates to mature products by catalyzing branch migration. Has a DNA unwinding activity characteristic of a DNA helicase with a 3'- to 5'- polarity. Unwinds branched duplex DNA (Y-DNA) Z1_01264 529507.PMI2865 9.7e-132 476.1 Proteus trmH GO:0001510,GO:0002128,GO:0002938,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009020,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016423,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0106050,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.1.1.185,2.1.1.34 ko:K00556,ko:K03214,ko:K03218,ko:K03437,ko:K15333 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016,ko03036 Bacteria 1MWBE@1224,1RMPR@1236,3Z2CM@583,COG0566@1,COG0566@2 NA|NA|NA J Catalyzes the 2'-O methylation of guanosine at position 18 in tRNA Z1_01265 529507.PMI2864 0.0 1400.2 Proteus spoT GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008728,GO:0008893,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009150,GO:0009259,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0015949,GO:0015969,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016778,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016794,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030312,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0033865,GO:0033875,GO:0034032,GO:0034035,GO:0034641,GO:0042278,GO:0042578,GO:0042594,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046128,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:1901068,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901657 2.7.6.5,3.1.7.2 ko:K00951,ko:K01139 ko00230,map00230 R00336,R00429 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 iECNA114_1301.ECNA114_3794,iECOK1_1307.ECOK1_4092,iECP_1309.ECP_3748,iECS88_1305.ECS88_4065,iECSF_1327.ECSF_3486,iLF82_1304.LF82_2165,iNRG857_1313.NRG857_18145,iUMN146_1321.UM146_18405,iUTI89_1310.UTI89_C4195,ic_1306.c4475 Bacteria 1MU44@1224,1RN3H@1236,3Z1FI@583,COG0317@1,COG0317@2 NA|NA|NA KT In eubacteria ppGpp (guanosine 3'-diphosphate 5-' diphosphate) is a mediator of the stringent response that coordinates a variety of cellular activities in response to changes in nutritional abundance Z1_01266 529507.PMI2863 1.2e-37 162.2 Proteus rpoZ GO:0003674,GO:0003824,GO:0003899,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030312,GO:0030880,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034062,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0040007,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097659,GO:0097747,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.6 ko:K03060 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020 M00183 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400 Bacteria 1N6TX@1224,1SCSR@1236,3Z2WR@583,COG1758@1,COG1758@2 NA|NA|NA K Promotes RNA polymerase assembly. Latches the N- and C- terminal regions of the beta' subunit thereby facilitating its interaction with the beta and alpha subunits Z1_01267 529507.PMI2862 1.1e-112 412.5 Proteus gmk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004385,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046037,GO:0046128,GO:0046483,GO:0046710,GO:0046940,GO:0050145,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901135,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576,GO:1901657 2.7.4.8,4.1.1.23 ko:K00942,ko:K01591 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00050,M00051 R00332,R00965,R02090 RC00002,RC00409 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2813,iIT341.HP0321,iPC815.YPO0040,iSBO_1134.SBO_3729,iSFV_1184.SFV_3881,iSFxv_1172.SFxv_4016,iUTI89_1310.UTI89_C4193 Bacteria 1MW92@1224,1RN09@1236,3Z1XP@583,COG0194@1,COG0194@2 NA|NA|NA F Essential for recycling GMP and indirectly, cGMP Z1_01268 529507.PMI2861 4.1e-107 394.0 Proteus yicG GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1R9H8@1224,1S00T@1236,3Z2E0@583,COG2860@1,COG2860@2 NA|NA|NA S UPF0126 domain Z1_01269 529507.PMI2860 3e-253 880.6 Proteus yidR GO:0005975,GO:0005996,GO:0006063,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016054,GO:0019586,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046365,GO:0046395,GO:0046397,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 Bacteria 1MWDT@1224,1RMFV@1236,3Z18J@583,COG0823@1,COG0823@2 NA|NA|NA U Protein of unknown function (DUF3748) Z1_01270 529507.PMI2859 1.1e-164 585.9 Bacteria Bacteria COG2374@1,COG2374@2 NA|NA|NA Z1_01272 529507.PMI2857 6.3e-51 206.5 Gammaproteobacteria ko:K07726 ko00000,ko03000 Bacteria 1N05Y@1224,1SCTY@1236,COG2944@1,COG2944@2 NA|NA|NA K helix-turn-helix Z1_01273 529507.PMI2856 3.9e-63 247.3 Bacteria Bacteria COG4737@1,COG4737@2 NA|NA|NA G Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system Z1_01274 529507.PMI2855 0.0 1335.1 Proteus glyS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004820,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006426,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046983,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.14 ko:K01879,ko:K14164 ko00970,map00970 M00360 R03654 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iAPECO1_1312.APECO1_2891,iE2348C_1286.E2348C_3810,iECABU_c1320.ECABU_c40010,iECED1_1282.ECED1_4242,iECH74115_1262.ECH74115_4934,iECNA114_1301.ECNA114_3710,iECOK1_1307.ECOK1_4005,iECP_1309.ECP_3661,iECS88_1305.ECS88_3976,iECSF_1327.ECSF_3393,iECSP_1301.ECSP_4554,iECs_1301.ECs4442,iG2583_1286.G2583_4300,iJN678.glyS,iUMN146_1321.UM146_17960,iUTI89_1310.UTI89_C4099,ic_1306.c4378 Bacteria 1MV2F@1224,1RNR3@1236,3Z2B4@583,COG0751@1,COG0751@2 NA|NA|NA J Glycyl-tRNA synthetase beta subunit Z1_01275 529507.PMI2854 3e-178 630.9 Proteus glyQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004820,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0016874,GO:0016875,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046983,GO:0140098,GO:0140101 6.1.1.14 ko:K01878,ko:K14164 ko00970,map00970 M00360 R03654 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iAF1260.b3560,iAF987.Gmet_2942,iJO1366.b3560,iPC815.YPO4072,iY75_1357.Y75_RS19360 Bacteria 1MVCJ@1224,1RMYI@1236,3Z2C9@583,COG0752@1,COG0752@2 NA|NA|NA J Glycyl-tRNA synthetase alpha subunit Z1_01276 529507.PMI2853 2.6e-111 407.9 Proteus tag 3.2.2.20 ko:K01246 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1R9X5@1224,1S25K@1236,3Z2XY@583,COG2818@1,COG2818@2 NA|NA|NA L DNA-3-methyladenine glycosylase I (3-methyladenine-DNA glycosylase I, constitutive) (TAG I) (DNA-3-methyladenine glycosidase I) K01246 Z1_01277 34506.g1459 4.7e-246 856.7 Bilateria Metazoa 3ABAU@33154,3BTWX@33208,3DENP@33213,COG1167@1,KOG0634@2759 NA|NA|NA E Aminotransferase class I and II Z1_01278 529507.PMI2851 7.3e-300 1035.8 Proteus yidE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03281,ko:K07085 ko00000 2.A.49,2.A.81 Bacteria 1MUVM@1224,1RQY2@1236,3Z14R@583,COG0569@1,COG0569@2,COG2985@1,COG2985@2 NA|NA|NA U Predicted Permease Membrane Region Z1_01279 529507.PMI2850 1.8e-53 214.9 Proteus yidQ GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1MZ8R@1224,1S9TX@1236,3Z2Z8@583,COG5645@1,COG5645@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1375) Z1_01280 529507.PMI2849 4.7e-48 196.8 Proteus Bacteria 1QCS6@1224,1T8IR@1236,2BI4E@1,32C9I@2,3Z2ZR@583 NA|NA|NA S Family of unknown function (DUF5339) Z1_01282 529507.PMI2848 0.0 1100.9 Proteus ko:K07326,ko:K11017 ko03070,ko05133,map03070,map05133 ko00000,ko00001,ko02042,ko02044 1.B.20 Bacteria 1MXF6@1224,1RQJB@1236,3Z36E@583,COG2831@1,COG2831@2 NA|NA|NA U POTRA domain Z1_01283 529507.PMI2847 0.0 1098.2 Proteus dppA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006810,GO:0006857,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015833,GO:0020037,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033218,GO:0042277,GO:0042597,GO:0042886,GO:0042938,GO:0044464,GO:0046906,GO:0048037,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061077,GO:0071702,GO:0071705,GO:0097159,GO:1901363 ko:K02035,ko:K12368 ko02010,ko02024,ko02030,map02010,map02024,map02030 M00239,M00324 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 iSSON_1240.SSON_3846 Bacteria 1MUZH@1224,1RNES@1236,3Z1IN@583,COG0747@1,COG0747@2 NA|NA|NA E Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_01284 529507.PMI2846 1.2e-183 649.0 Proteus dppB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02033,ko:K12369 ko02010,ko02024,map02010,map02024 M00239,M00324 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 iECUMN_1333.ECUMN_4053 Bacteria 1MU8Z@1224,1RNJ1@1236,3Z1Q8@583,COG0601@1,COG0601@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01285 529507.PMI2845 6e-155 553.5 Proteus dppC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02034,ko:K12370,ko:K15582,ko:K15586 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iAF1260.b3542,iAPECO1_1312.APECO1_2906,iB21_1397.B21_03344,iBWG_1329.BWG_3231,iE2348C_1286.E2348C_3790,iEC042_1314.EC042_3848,iEC55989_1330.EC55989_3993,iECABU_c1320.ECABU_c39840,iECBD_1354.ECBD_0194,iECB_1328.ECB_03393,iECDH10B_1368.ECDH10B_3721,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3422,iECD_1391.ECD_03393,iECED1_1282.ECED1_4221,iECH74115_1262.ECH74115_4910,iECIAI1_1343.ECIAI1_3700,iECIAI39_1322.ECIAI39_4051,iECNA114_1301.ECNA114_3693,iECO103_1326.ECO103_4274,iECO111_1330.ECO111_4358,iECO26_1355.ECO26_4636,iECOK1_1307.ECOK1_3988,iECP_1309.ECP_3643,iECS88_1305.ECS88_3962,iECSE_1348.ECSE_3815,iECSF_1327.ECSF_3376,iECSP_1301.ECSP_4533,iECUMN_1333.ECUMN_4052,iECW_1372.ECW_m3808,iECs_1301.ECs4422,iEKO11_1354.EKO11_0191,iETEC_1333.ETEC_3787,iEcDH1_1363.EcDH1_0170,iEcE24377_1341.EcE24377A_4034,iEcHS_1320.EcHS_A3741,iEcSMS35_1347.EcSMS35_3861,iEcolC_1368.EcolC_0173,iG2583_1286.G2583_4279,iJO1366.b3542,iLF82_1304.LF82_0517,iNRG857_1313.NRG857_17605,iUMN146_1321.UM146_17880,iUMNK88_1353.UMNK88_4323,iUTI89_1310.UTI89_C4080,iWFL_1372.ECW_m3808,iY75_1357.Y75_RS19465,iZ_1308.Z4959,ic_1306.c4357 Bacteria 1MUG0@1224,1RN08@1236,3Z1YD@583,COG1173@1,COG1173@2 NA|NA|NA P N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C Z1_01286 529507.PMI2844 5.9e-180 636.7 Proteus dppD GO:0000166,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0015232,GO:0015886,GO:0016020,GO:0017076,GO:0022857,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051184,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901678 3.6.3.24 ko:K02031,ko:K02032,ko:K12371,ko:K15583,ko:K15587 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iYL1228.KPN_03896 Bacteria 1R4KB@1224,1SMBI@1236,3Z1C9@583,COG0444@1,COG0444@2 NA|NA|NA P Belongs to the ABC transporter superfamily Z1_01287 529507.PMI2843 3.4e-183 647.5 Proteus dppF GO:0000166,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0015232,GO:0015886,GO:0017076,GO:0022857,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051184,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901678 3.6.3.24 ko:K02032,ko:K10823,ko:K10824,ko:K12372 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iEC042_1314.EC042_3846,iECABU_c1320.ECABU_c39820,iECED1_1282.ECED1_4219,iPC815.YPO3999,iSF_1195.SF3575,iSFxv_1172.SFxv_3897,iS_1188.S4195,ic_1306.c4355 Bacteria 1NU4K@1224,1SKPD@1236,3Z1NI@583,COG4608@1,COG4608@2 NA|NA|NA P Belongs to the ABC transporter superfamily Z1_01288 529507.PMI2842 2.2e-307 1060.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1NES9@1224,1SCG3@1236,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U haemagglutination activity domain Z1_01289 529507.PMI2841 4e-122 444.1 Proteus 2.7.7.7 ko:K02342 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1NU7E@1224,1T1VR@1236,3Z1MD@583,COG5000@1,COG5000@2 NA|NA|NA T Gammaproteobacterial periplasmic sensor domain Z1_01290 34506.g870 3e-284 983.8 Bilateria Metazoa 3AGT2@33154,3BYEH@33208,3DF89@33213,COG1025@1,KOG0959@2759 NA|NA|NA O Peptidase M16 inactive domain Z1_01291 529507.PMI2839 3.3e-29 133.7 Proteus dmpI 5.3.2.6 ko:K01821 ko00362,ko00621,ko00622,ko01100,ko01120,ko01220,map00362,map00621,map00622,map01100,map01120,map01220 M00569 R03966,R05389 RC01040,RC01355 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1N6WW@1224,1SC97@1236,3Z304@583,COG1942@1,COG1942@2 NA|NA|NA G Tautomerase enzyme Z1_01292 529507.PMI2838 2.6e-186 657.9 Proteus yhjD GO:0003674,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015221,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033036,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:1901264,GO:1901505 ko:K07058 ko00000 Bacteria 1N04V@1224,1RNIB@1236,3Z218@583,COG1295@1,COG1295@2 NA|NA|NA S Virulence factor BrkB Z1_01293 529507.PMI2837 1.9e-36 158.7 Proteus Bacteria 1NAAB@1224,1SE1J@1236,3Z2UR@583,COG1422@1,COG1422@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1090) Z1_01294 529507.PMI2836 6.4e-159 566.6 Proteus rlmJ GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008988,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015976,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016433,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036307,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.266 ko:K07115 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MWGA@1224,1RNI1@1236,3Z1YF@583,COG2961@1,COG2961@2 NA|NA|NA H Specifically methylates the adenine in position 2030 of 23S rRNA Z1_01295 529507.PMI2835 1.6e-260 904.8 Proteus gor GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004362,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015036,GO:0015037,GO:0015038,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071949,GO:0097159,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901265,GO:1901363,GO:1990748 1.8.1.7 ko:K00383 ko00480,ko04918,map00480,map04918 R00094,R00115 RC00011 ko00000,ko00001,ko01000 iZ_1308.Z4900 Bacteria 1MU2Z@1224,1RMC0@1236,3Z2GK@583,COG1249@1,COG1249@2 NA|NA|NA C Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase Z1_01297 529507.PMI2834 1.4e-270 938.3 Proteus 1.5.3.1 ko:K00303 ko00260,ko01100,map00260,map01100 R00610 RC00060,RC00557 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU7M@1224,1RP7W@1236,3Z2G1@583,COG0665@1,COG0665@2 NA|NA|NA E NAD(P)-binding Rossmann-like domain Z1_01298 529507.PMI2833 3.8e-87 327.4 Proteus tdcF Bacteria 1RD3E@1224,1S3IP@1236,3Z1QU@583,COG0251@1,COG0251@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease L-PSP Z1_01299 529507.PMI2832 4.6e-91 340.5 Proteus mobB GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005525,GO:0017076,GO:0019001,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 2.10.1.1,2.7.7.77 ko:K02379,ko:K03750,ko:K03752,ko:K03753,ko:K13818 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R09735,R11581 RC03462 ko00000,ko00001,ko01000 iB21_1397.B21_03691,iBWG_1329.BWG_3527,iECBD_1354.ECBD_4174,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3728,iEcDH1_1363.EcDH1_4130,iJO1366.b3856,iSbBS512_1146.SbBS512_E4328,iY75_1357.Y75_RS17805 Bacteria 1RD3Q@1224,1S72P@1236,3Z2XS@583,COG1763@1,COG1763@2 NA|NA|NA H Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein B Z1_01300 529507.PMI2831 2.2e-105 388.3 Proteus mobA GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0055086,GO:0061603,GO:0070568,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902757,GO:1902758 2.10.1.1,2.7.7.77 ko:K03750,ko:K03752,ko:K13818 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R09735,R11581 RC03462 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2604,iEcHS_1320.EcHS_A4080,iEcolC_1368.EcolC_4158,iLF82_1304.LF82_1370,iNRG857_1313.NRG857_19230,iSBO_1134.SBO_3869,iSbBS512_1146.SbBS512_E4329,iUMNK88_1353.UMNK88_4686,ic_1306.c4801 Bacteria 1RH3M@1224,1S74N@1236,3Z31A@583,COG0746@1,COG0746@2 NA|NA|NA H Transfers a GMP moiety from GTP to Mo-molybdopterin (Mo- MPT) cofactor (Moco or molybdenum cofactor) to form Mo- molybdopterin guanine dinucleotide (Mo-MGD) cofactor Z1_01301 529507.PMI2830 2.8e-44 184.1 Proteus yihD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09896 ko00000 Bacteria 1N026@1224,1S93G@1236,3Z2X0@583,COG3084@1,COG3084@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1040) Z1_01302 529507.PMI2829 3.3e-191 674.1 Proteus srkA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 Bacteria 1MU2Q@1224,1RNHI@1236,3Z1GQ@583,COG2334@1,COG2334@2 NA|NA|NA F A protein kinase that phosphorylates Ser and Thr residues. Probably acts to suppress the effects of stress linked to accumulation of reactive oxygen species. Probably involved in the extracytoplasmic stress response Z1_01303 529507.PMI2828 9.6e-112 409.5 Proteus dsbA GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042221,GO:0042597,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071236,GO:0140096 ko:K03673 ko01503,map01503 M00728 ko00000,ko00001,ko00002,ko03110 iEcSMS35_1347.EcSMS35_4241 Bacteria 1RGWH@1224,1S5WA@1236,3Z28W@583,COG1651@1,COG1651@2 NA|NA|NA O DSBA-like thioredoxin domain Z1_01304 529507.PMI2827 3.2e-68 264.2 Gammaproteobacteria ko:K15383 ko00000,ko02000 9.A.58.2 Bacteria 1N17C@1224,1SB5P@1236,COG4095@1,COG4095@2 NA|NA|NA S Sugar efflux transporter for intercellular exchange Z1_01305 529507.PMI2826 0.0 1825.4 Proteus polA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003887,GO:0004518,GO:0004527,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0008409,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030312,GO:0033554,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0040007,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071897,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 2.7.7.7 ko:K01146,ko:K02335 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03410,ko03420,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03410,map03420,map03440 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MU31@1224,1RNBG@1236,3Z120@583,COG0258@1,COG0258@2,COG0749@1,COG0749@2 NA|NA|NA L In addition to polymerase activity, this DNA polymerase exhibits 5'-3' exonuclease activity Z1_01306 529507.PMI2825 4.3e-89 334.0 Proteus def GO:0003674,GO:0003824,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008463,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0018193,GO:0018206,GO:0019538,GO:0031365,GO:0036211,GO:0042586,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043686,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0071704,GO:1901564 3.5.1.88 ko:K01462 ko00000,ko01000 Bacteria 1RA2P@1224,1S247@1236,3Z1UY@583,COG0242@1,COG0242@2 NA|NA|NA J Removes the formyl group from the N-terminal Met of newly synthesized proteins. Requires at least a dipeptide for an efficient rate of reaction. N-terminal L-methionine is a prerequisite for activity but the enzyme has broad specificity at other positions Z1_01307 529507.PMI2824 6.7e-113 413.3 Proteus engB GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0017076,GO:0019001,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03978 ko00000,ko03036 Bacteria 1MY3Z@1224,1RNJP@1236,3Z2NZ@583,COG0218@1,COG0218@2 NA|NA|NA D Necessary for normal cell division and for the maintenance of normal septation Z1_01308 529507.PMI2823 4.5e-100 370.5 Proteus ppiA GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0036211,GO:0042597,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044464,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 5.2.1.8 ko:K03767,ko:K03768 ko01503,ko04217,map01503,map04217 ko00000,ko00001,ko01000,ko03110,ko04147 Bacteria 1R9ZQ@1224,1RP9U@1236,3Z2SS@583,COG0652@1,COG0652@2 NA|NA|NA M PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides Z1_01309 529507.PMI2822 4.3e-106 390.6 Proteus pabA GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005950,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006575,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009108,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0046820,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 2.6.1.85,4.1.3.27 ko:K01658,ko:K01664 ko00400,ko00405,ko00790,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,ko02025,map00400,map00405,map00790,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024,map02025 M00023 R00985,R00986,R01716 RC00010,RC01418,RC02148,RC02414 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_3095,iEC042_1314.EC042_3623,iECABU_c1320.ECABU_c37840,iECED1_1282.ECED1_4024,iECNA114_1301.ECNA114_3463,iECOK1_1307.ECOK1_3780,iECP_1309.ECP_3451,iECS88_1305.ECS88_3751,iECSF_1327.ECSF_3187,iLF82_1304.LF82_1586,iNRG857_1313.NRG857_16660,iUMN146_1321.UM146_16880,iUTI89_1310.UTI89_C3863,ic_1306.c4135 Bacteria 1MV5Y@1224,1RMQW@1236,3Z104@583,COG0512@1,COG0512@2 NA|NA|NA EH Peptidase C26 Z1_01310 529507.PMI2821 2e-230 804.7 Proteus argD GO:0003674,GO:0003824,GO:0003992,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006553,GO:0006591,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009016,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009084,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0033359,GO:0036094,GO:0042450,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046451,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.6.1.11,2.6.1.17 ko:K00821 ko00220,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00016,M00028,M00845 R02283,R04475 RC00006,RC00062 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iSFV_1184.SFV_3365,iSF_1195.SF3378,iSFxv_1172.SFxv_3689,iSSON_1240.SSON_3490,iS_1188.S4385 Bacteria 1MV3C@1224,1RMV1@1236,3Z0Y0@583,COG4992@1,COG4992@2 NA|NA|NA H acetylornithine Z1_01311 471881.PROPEN_01539 1.2e-114 419.1 Proteus crp GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007584,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009605,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016070,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019001,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0030551,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031670,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035438,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045013,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045990,GO:0046483,GO:0046983,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0061984,GO:0061985,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071496,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K10914 ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02024,map02025,map02026,map05111 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1MXID@1224,1RMIZ@1236,3Z15S@583,COG0664@1,COG0664@2 NA|NA|NA K Cyclic nucleotide-binding domain Z1_01312 529507.PMI2819 3.9e-69 267.3 Proteus yhfA ko:K07397 ko00000 Bacteria 1RCZW@1224,1S3XF@1236,3Z2JG@583,COG1765@1,COG1765@2 NA|NA|NA O OsmC-like protein Z1_01313 529507.PMI2818 4.9e-162 577.0 Proteus prkB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004849,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006222,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008655,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009173,GO:0009174,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009224,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019206,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042455,GO:0043094,GO:0043097,GO:0043174,GO:0043771,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046035,GO:0046049,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.7.1.19 ko:K00855 ko00710,ko01100,ko01120,ko01200,map00710,map01100,map01120,map01200 M00165,M00166 R01523 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MWN9@1224,1RMS7@1236,3Z17B@583,COG3954@1,COG3954@2 NA|NA|NA C Phosphoribulokinase / Uridine kinase family Z1_01314 529507.PMI2817 2.4e-33 147.5 Proteus yheU ko:K07019,ko:K09898 ko00000 Bacteria 1N6TM@1224,1SCDE@1236,3Z2XX@583,COG3089@1,COG3089@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0270) Z1_01315 529507.PMI2816 8.7e-192 676.0 Proteus yheT GO:0003674,GO:0003824,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0050526,GO:0052689,GO:0071704 ko:K07019 ko00000 Bacteria 1MWV1@1224,1RN39@1236,3Z19D@583,COG0429@1,COG0429@2 NA|NA|NA S Serine aminopeptidase, S33 Z1_01316 529507.PMI2815 3.7e-100 370.9 Proteus Bacteria 1R551@1224,1RRVX@1236,3Z2FX@583,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA E LysE type translocator Z1_01317 529507.PMI2814 3.2e-150 537.7 Proteus murR GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K15835,ko:K19337 ko00000,ko03000 Bacteria 1ND5W@1224,1RNCI@1236,3Z15Q@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain, rpiR family Z1_01318 529507.PMI2813 6.4e-282 976.1 Proteus aer GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006935,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009453,GO:0009454,GO:0009605,GO:0009987,GO:0016020,GO:0023052,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0042802,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0050918,GO:0051716,GO:0052128,GO:0052131,GO:0065007,GO:0071944 ko:K03406,ko:K03776 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z2AE@583,COG0840@1,COG0840@2,COG3829@1,COG3829@2 NA|NA|NA T PAS fold Z1_01319 529507.PMI2812 4.1e-86 323.9 Proteus ko:K06887,ko:K11903 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1NU11@1224,1SN57@1236,3Z3FU@583,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S VI_effect_Hcp1 type VI secretion system effector, Hcp1 family protein Z1_01321 529507.PMI2810 9.6e-132 476.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RJ25@1224,1S78K@1236,2BRN9@1,32KMV@2 NA|NA|NA Z1_01322 529507.PMI2809 1e-248 865.9 Proteus tar ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z38A@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT chemotaxis, protein Z1_01323 529507.PMI2808 9.6e-223 779.6 Proteus tar ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z203@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT Methyl-accepting chemotaxis-like domains (chemotaxis sensory transducer). Z1_01324 34506.g954 0.0 1233.4 Rhabditida Nematoda 1KY0B@119089,38FBM@33154,3B9H1@33208,3CS1F@33213,40C9D@6231,40SDX@6236,COG0488@1,KOG0062@2759 NA|NA|NA EJ ABC transporter Z1_01325 529507.PMI2806 2.1e-105 388.3 Proteus kefG ko:K03923,ko:K11748 ko00000,ko02000 2.A.37.1.2 Bacteria 1MXFT@1224,1RMVS@1236,3Z31X@583,COG2249@1,COG2249@2 NA|NA|NA S Flavodoxin-like fold Z1_01326 529507.PMI2805 0.0 1145.6 Proteus kefB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015318,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K03455,ko:K11747 ko00000,ko02000 2.A.37,2.A.37.1.2 iB21_1397.B21_03153,iEC55989_1330.EC55989_3754,iECBD_1354.ECBD_0398,iECB_1328.ECB_03201,iECD_1391.ECD_03201,iECO26_1355.ECO26_4439,iECSE_1348.ECSE_3612,iECW_1372.ECW_m3606,iEKO11_1354.EKO11_0394,iEcHS_1320.EcHS_A3547,iSFV_1184.SFV_3356,iSSON_1240.SSON_3481,iWFL_1372.ECW_m3606,iYL1228.KPN_03736 Bacteria 1MV34@1224,1RNVR@1236,3Z1BT@583,COG0475@1,COG0475@2,COG1226@1,COG1226@2 NA|NA|NA P Pore-forming subunit of a potassium efflux system that confers protection against electrophiles. Catalyzes K( ) H( ) antiport Z1_01327 529507.PMI2804 1.6e-31 141.4 Proteus yheV ko:K07070 ko00000 Bacteria 1N6RJ@1224,1SC9Y@1236,3Z2ZJ@583,COG3529@1,COG3529@2 NA|NA|NA S Probable metal-binding protein (DUF2387) Z1_01328 529507.PMI2803 3.5e-93 347.8 Proteus slyD GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006464,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016151,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0022417,GO:0031647,GO:0035821,GO:0036211,GO:0042026,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043963,GO:0044003,GO:0044068,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044501,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050821,GO:0050896,GO:0050897,GO:0051082,GO:0051604,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051817,GO:0052027,GO:0052250,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 5.2.1.8 ko:K03774,ko:K03775 ko00000,ko01000,ko03110 Bacteria 1RD35@1224,1S3QR@1236,3Z1T9@583,COG1047@1,COG1047@2 NA|NA|NA G FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Z1_01329 529507.PMI2802 6e-29 132.9 Proteus slyX ko:K03745 ko00000 Bacteria 1NGFM@1224,1SGAM@1236,3Z324@583,COG2900@1,COG2900@2 NA|NA|NA S SlyX Z1_01330 529507.PMI2801 6.5e-131 473.4 Proteus fkpA GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0008150,GO:0009987,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042026,GO:0042597,GO:0044464 5.2.1.8 ko:K03772 ko00000,ko01000,ko03110 Bacteria 1RDA1@1224,1RRKU@1236,3Z2KH@583,COG0545@1,COG0545@2 NA|NA|NA M Domain amino terminal to FKBP-type peptidyl-prolyl isomerase Z1_01331 529507.PMI2800 6.5e-154 550.1 Proteus Bacteria 1N5ZD@1224,1RRU6@1236,3Z34E@583,COG0697@1,COG0697@2 NA|NA|NA EG COG0697 Permeases of the drug metabolite transporter (DMT) superfamily Z1_01332 529507.PMI2799 2.4e-127 461.5 Proteus yheO GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1MU5K@1224,1RPDQ@1236,3Z1HS@583,COG2964@1,COG2964@2 NA|NA|NA S YheO-like PAS domain Z1_01333 529507.PMI2798 7.7e-67 259.6 Proteus tusD GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0003674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0019417,GO:0032991,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901360,GO:1902494,GO:1990228,GO:1990234 ko:K07235 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1N021@1224,1S99J@1236,3Z2RD@583,COG1553@1,COG1553@2 NA|NA|NA J Part of a sulfur-relay system required for 2-thiolation of 5-methylaminomethyl-2-thiouridine (mnm(5)s(2)U) at tRNA wobble positions. Accepts sulfur from TusA and transfers it in turn to TusE Z1_01334 529507.PMI2797 2.1e-58 231.5 Proteus tusC GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0032991,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1902494,GO:1990228,GO:1990234 ko:K07236 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko03016 Bacteria 1N8RV@1224,1SD0S@1236,3Z2PS@583,COG2923@1,COG2923@2 NA|NA|NA P DsrE/DsrF-like family Z1_01335 529507.PMI2796 1.6e-45 188.3 Proteus tusB GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0032991,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1902494,GO:1990228,GO:1990234 ko:K07237 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko03016 Bacteria 1NGF3@1224,1SGPI@1236,3Z2XC@583,COG2168@1,COG2168@2 NA|NA|NA J Part of a sulfur-relay system required for 2-thiolation of 5-methylaminomethyl-2-thiouridine (mnm(5)s(2)U) at tRNA wobble positions Z1_01336 406818.XBJ1_4065 5.8e-64 250.0 Gammaproteobacteria rpsL GO:0000372,GO:0000375,GO:0000376,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008380,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010628,GO:0015935,GO:0016070,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031325,GO:0032991,GO:0033120,GO:0034336,GO:0034337,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043484,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990145,GO:1990904 ko:K02950 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RCWY@1224,1S3WB@1236,COG0048@1,COG0048@2 NA|NA|NA J Interacts with and stabilizes bases of the 16S rRNA that are involved in tRNA selection in the A site and with the mRNA backbone. Located at the interface of the 30S and 50S subunits, it traverses the body of the 30S subunit contacting proteins on the other side and probably holding the rRNA structure together. The combined cluster of proteins S8, S12 and S17 appears to hold together the shoulder and platform of the 30S subunit Z1_01337 471881.PROPEN_01577 2.1e-79 301.6 Proteus rpsG GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02992 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MXC8@1224,1RN77@1236,3Z20Y@583,COG0049@1,COG0049@2 NA|NA|NA J One of the primary rRNA binding proteins, it binds directly to 16S rRNA where it nucleates assembly of the head domain of the 30S subunit. Is located at the subunit interface close to the decoding center, probably blocks exit of the E-site tRNA Z1_01338 529507.PMI2793 0.0 1387.9 Proteus fusA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003746,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02355 ko00000,ko03012,ko03029 Bacteria 1MUCV@1224,1RNSZ@1236,3Z20N@583,COG0480@1,COG0480@2 NA|NA|NA J Catalyzes the GTP-dependent ribosomal translocation step during translation elongation. During this step, the ribosome changes from the pre-translocational (PRE) to the post- translocational (POST) state as the newly formed A-site-bound peptidyl-tRNA and P-site-bound deacylated tRNA move to the P and E sites, respectively. Catalyzes the coordinated movement of the two tRNA molecules, the mRNA and conformational changes in the ribosome Z1_01339 529507.PMI3251 3.6e-224 783.9 Proteus tuf GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02358 ko00000,ko03012,ko03029,ko04147 Bacteria 1MVC0@1224,1RMYX@1236,3Z0W8@583,COG0050@1,COG0050@2 NA|NA|NA J This protein promotes the GTP-dependent binding of aminoacyl-tRNA to the A-site of ribosomes during protein biosynthesis Z1_01340 529507.PMI2791 2.8e-58 231.1 Proteus secE GO:0002790,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006605,GO:0006612,GO:0006613,GO:0006614,GO:0006616,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008320,GO:0008565,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031522,GO:0032940,GO:0032978,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0042886,GO:0042887,GO:0043952,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045047,GO:0045184,GO:0046903,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0061024,GO:0065002,GO:0070727,GO:0070972,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072594,GO:0072599,GO:0072657,GO:0090150,GO:1904680 ko:K03073 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.2 Bacteria 1RDI9@1224,1S3PA@1236,3Z2S5@583,COG0690@1,COG0690@2 NA|NA|NA U Essential subunit of the Sec protein translocation channel SecYEG. Clamps together the 2 halves of SecY. May contact the channel plug during translocation Z1_01341 529507.PMI2790 2.4e-98 364.8 Proteus nusG GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006353,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016020,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043244,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K02601,ko:K05785 ko00000,ko03000,ko03009,ko03021 Bacteria 1MU14@1224,1RMW0@1236,3Z1EY@583,COG0250@1,COG0250@2 NA|NA|NA K Participates in transcription elongation, termination and antitermination. In the absence of Rho, increases the rate of transcription elongation by the RNA polymerase (RNAP), probably by partially suppressing pausing. In the presence of Rho, modulates most Rho-dependent termination events by interacting with the RNAP to render the complex more susceptible to the termination activity of Rho. May be required to overcome a kinetic limitation of Rho to function at certain terminators. Also involved in ribosomal RNA transcriptional antitermination Z1_01342 529507.PMI2789 2.1e-70 271.6 Proteus rplK GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010467,GO:0015934,GO:0015968,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022411,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032984,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0042594,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02867 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RA2M@1224,1S22R@1236,3Z2HY@583,COG0080@1,COG0080@2 NA|NA|NA J Forms part of the ribosomal stalk which helps the ribosome interact with GTP-bound translation factors Z1_01343 529507.PMI2788 2.7e-118 431.4 Proteus rplA GO:0000027,GO:0000470,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045947,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02863 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MUE6@1224,1RMDW@1236,3Z2WY@583,COG0081@1,COG0081@2 NA|NA|NA J Binds directly to 23S rRNA. The L1 stalk is quite mobile in the ribosome, and is involved in E site tRNA release Z1_01344 529507.PMI2787 5.9e-80 303.5 Proteus rplJ GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016020,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030312,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02864,ko:K02935 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RAN5@1224,1S286@1236,3Z1ST@583,COG0244@1,COG0244@2 NA|NA|NA J Forms part of the ribosomal stalk, playing a central role in the interaction of the ribosome with GTP-bound translation factors Z1_01345 529507.PMI2786 9.4e-51 206.1 Proteus rplL GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046983,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02935 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RGU4@1224,1S5V7@1236,3Z34X@583,COG0222@1,COG0222@2 NA|NA|NA J Forms part of the ribosomal stalk which helps the ribosome interact with GTP-bound translation factors. Is thus essential for accurate translation Z1_01346 529507.PMI2785 0.0 2632.4 Proteus rpoB GO:0000428,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003899,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030880,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034062,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:0097747,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.6 ko:K03043,ko:K13797 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020 M00183 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400 Bacteria 1MUC4@1224,1RMK0@1236,3Z0WY@583,COG0085@1,COG0085@2 NA|NA|NA K DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates Z1_01347 529507.PMI2784 0.0 2736.1 Proteus rpoC GO:0000428,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003899,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030880,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034062,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:0097747,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.6 ko:K03046,ko:K13797 ko00230,ko00240,ko01100,ko03020,map00230,map00240,map01100,map03020 M00183 R00435,R00441,R00442,R00443 RC02795 br01611,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03021,ko03400 Bacteria 1MU3M@1224,1RPYH@1236,3Z2FM@583,COG0086@1,COG0086@2 NA|NA|NA K DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates Z1_01348 529507.PMI2783 2.8e-163 581.3 Proteus Bacteria 1MUSP@1224,1RNUW@1236,3Z1CN@583,COG5464@1,COG5464@2 NA|NA|NA S Putative transposase, YhgA-like Z1_01349 529507.PMI2782 4.6e-221 773.5 Proteus thiH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033554,GO:0034641,GO:0036355,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051716,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.1.99.19 ko:K03150 ko00730,ko01100,map00730,map01100 R10246 RC01434,RC03095 ko00000,ko00001,ko01000 iPC815.YPO3743,iSF_1195.SF4062,iSFxv_1172.SFxv_4429,iS_1188.S3673 Bacteria 1MXK0@1224,1RNTV@1236,3Z1YS@583,COG0502@1,COG0502@2 NA|NA|NA C Biotin and Thiamin Synthesis associated domain Z1_01350 529507.PMI2781 1.7e-137 495.4 Proteus thiG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009987,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.8.1.10 ko:K03149 ko00730,ko01100,map00730,map01100 R10247 RC03096,RC03097,RC03461 ko00000,ko00001,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c45060,iECO26_1355.ECO26_5099,ic_1306.c4947 Bacteria 1N0N5@1224,1RMPD@1236,3Z1MZ@583,COG2022@1,COG2022@2 NA|NA|NA H Catalyzes the rearrangement of 1-deoxy-D-xylulose 5- phosphate (DXP) to produce the thiazole phosphate moiety of thiamine. Sulfur is provided by the thiocarboxylate moiety of the carrier protein ThiS. In vitro, sulfur can be provided by H(2)S Z1_01351 529507.PMI2780 4e-27 126.7 Proteus thiS 2.8.1.10 ko:K03149,ko:K03154 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R10247 RC03096,RC03097,RC03461 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b4407,iBWG_1329.BWG_3651,iECDH10B_1368.ECDH10B_4180,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3851,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_4003,iEcDH1_1363.EcDH1_4003,iEcolC_1368.EcolC_4034,iJO1366.b4407,iJR904.b4407,iUMNK88_1353.UMNK88_4832,iY75_1357.Y75_RS17090 Bacteria 1N6ZF@1224,1SCFT@1236,3Z348@583,COG2104@1,COG2104@2 NA|NA|NA H ThiS family Z1_01352 529507.PMI2779 9.4e-138 496.1 Proteus thiF GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008144,GO:0008270,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 2.7.7.73,2.7.7.80 ko:K03148,ko:K21029 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07459 RC00043 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2482,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3852,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_4002,iECIAI39_1322.ECIAI39_4382,iEcDH1_1363.EcDH1_4002 Bacteria 1MW7H@1224,1RPJ3@1236,3Z24Y@583,COG0476@1,COG0476@2 NA|NA|NA H ThiF family Z1_01353 529507.PMI2778 8.7e-116 422.9 Proteus thiE GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004789,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.3,2.7.1.49,2.7.4.7 ko:K00788,ko:K14153 ko00730,ko01100,map00730,map01100 M00127 R03223,R03471,R04509,R10712 RC00002,RC00017,RC00224,RC03255,RC03397 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_4300,iSSON_1240.SSON_4166 Bacteria 1RDSU@1224,1SYGR@1236,3Z16G@583,COG0352@1,COG0352@2 NA|NA|NA H Condenses 4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate (THZ-P) and 2-methyl-4-amino-5-hydroxymethyl pyrimidine pyrophosphate (HMP-PP) to form thiamine monophosphate (TMP) Z1_01354 34506.g1670 0.0 1324.3 Rhabditida Nematoda 1M6M8@119089,2QRQ4@2759,38I15@33154,3BNVW@33208,3DDJ8@33213,40P5A@6231,4151A@6236,COG0422@1 NA|NA|NA H Radical SAM ThiC family Z1_01355 529507.PMI2776 9.8e-126 456.1 Proteus Bacteria 1RA1A@1224,1S21J@1236,3Z3B4@583,COG0560@1,COG0560@2 NA|NA|NA E haloacid dehalogenase-like hydrolase Z1_01356 529507.PMI2775 9.8e-154 549.3 Proteus nudC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004551,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0030145,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035529,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 1.3.7.1,3.6.1.22 ko:K03426,ko:K20449 ko00760,ko01100,ko01120,ko04146,map00760,map01100,map01120,map04146 R00103,R03004,R03164,R11104 RC00002,RC02422 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b3996,iB21_1397.B21_03826,iBWG_1329.BWG_3656,iEC55989_1330.EC55989_4481,iECBD_1354.ECBD_4036,iECB_1328.ECB_03873,iECDH10B_1368.ECDH10B_4185,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3856,iECD_1391.ECD_03873,iECIAI1_1343.ECIAI1_4211,iECO103_1326.ECO103_4745,iECO111_1330.ECO111_4813,iECO26_1355.ECO26_5105,iECSE_1348.ECSE_4284,iECW_1372.ECW_m4355,iEKO11_1354.EKO11_4325,iETEC_1333.ETEC_4256,iEcDH1_1363.EcDH1_3998,iEcE24377_1341.EcE24377A_4539,iEcHS_1320.EcHS_A4230,iEcolC_1368.EcolC_4029,iJO1366.b3996,iPC815.YPO3736,iSSON_1240.SSON_4169,iUMNK88_1353.UMNK88_4837,iWFL_1372.ECW_m4355,iY75_1357.Y75_RS17065,iYL1228.KPN_04378 Bacteria 1QGCX@1224,1RP0Y@1236,3Z1B1@583,COG2816@1,COG2816@2 NA|NA|NA L NADH pyrophosphatase zinc ribbon domain Z1_01357 529507.PMI2774 2.1e-207 728.0 Proteus hemE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004853,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006780,GO:0006782,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0018130,GO:0019353,GO:0019438,GO:0019752,GO:0033013,GO:0033014,GO:0033526,GO:0034641,GO:0042168,GO:0042440,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046501,GO:0046502,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 4.1.1.37 ko:K01599 ko00860,ko01100,ko01110,map00860,map01100,map01110 M00121 R03197,R04972 RC00872 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO3734,iSBO_1134.SBO_4018 Bacteria 1MUG1@1224,1RMDH@1236,3Z197@583,COG0407@1,COG0407@2 NA|NA|NA H Uroporphyrinogen decarboxylase Z1_01358 529507.PMI2773 1.4e-122 445.7 Proteus nfi GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016888,GO:0016893,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043737,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 3.1.21.7 ko:K05982 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MWRN@1224,1RRYH@1236,3Z12D@583,COG1515@1,COG1515@2 NA|NA|NA L DNA repair enzyme involved in the repair of deaminated bases. Selectively cleaves double-stranded DNA at the second phosphodiester bond 3' to a deoxyinosine leaving behind the intact lesion on the nicked DNA Z1_01359 529507.PMI2772 4.4e-106 390.6 Proteus yjaG GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09891 ko00000 Bacteria 1MWSN@1224,1RQDG@1236,3Z14H@583,COG3068@1,COG3068@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF416) Z1_01360 471881.PROPEN_02602 3.3e-40 170.6 Proteus hupA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006323,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009295,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010556,GO:0016043,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043590,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051276,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:1990104,GO:1990178,GO:2001141 ko:K03530,ko:K05787 ko00000,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MZ5B@1224,1S8VH@1236,3Z2WW@583,COG0776@1,COG0776@2 NA|NA|NA L Histone-like DNA-binding protein which is capable of wrapping DNA to stabilize it, and thus to prevent its denaturation under extreme environmental conditions Z1_01361 529507.PMI2770 1.3e-128 465.7 Proteus yjaH Bacteria 1QFI0@1224,1RPY5@1236,28HWS@1,2Z82N@2,3Z28Q@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1481) Z1_01362 529507.PMI2769 2.2e-243 847.8 Proteus purD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004637,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046390,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.4.13 ko:K01945 ko00230,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map01100,map01110,map01130 M00048 R04144 RC00090,RC00166 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_3417,iECSF_1327.ECSF_3859,iJN746.PP_4823,iPC815.YPO3729 Bacteria 1MUAH@1224,1RNS4@1236,3Z133@583,COG0151@1,COG0151@2 NA|NA|NA F Phosphoribosylglycinamide synthetase, C domain Z1_01363 529507.PMI2768 1.1e-300 1038.5 Proteus purH GO:0003674,GO:0003824,GO:0004643,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.2.3,3.5.4.10 ko:K00602 ko00230,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,ko01523,map00230,map00670,map01100,map01110,map01130,map01523 M00048 R01127,R04560 RC00026,RC00263,RC00456 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iEcHS_1320.EcHS_A4240,iPC815.YPO3728 Bacteria 1MUDQ@1224,1RMWS@1236,3Z1H0@583,COG0138@1,COG0138@2 NA|NA|NA F AICARFT/IMPCHase bienzyme Z1_01369 529507.PMI2767 3.5e-102 377.5 Proteus idi GO:0003674,GO:0003824,GO:0004452,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009240,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016863,GO:0019637,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046490,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 4.1.1.33,5.3.3.2 ko:K01597,ko:K01823 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00095,M00096,M00364,M00365,M00366,M00367 R01121,R01123 RC00453,RC00455 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R9YJ@1224,1S6ZT@1236,3Z2YQ@583,COG1443@1,COG1443@2 NA|NA|NA I Catalyzes the 1,3-allylic rearrangement of the homoallylic substrate isopentenyl (IPP) to its highly electrophilic allylic isomer, dimethylallyl diphosphate (DMAPP) Z1_01370 34506.g1470 2.5e-203 714.5 Opisthokonta GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005975,GO:0006066,GO:0006071,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008888,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019400,GO:0019405,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019563,GO:0019564,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019751,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034308,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042180,GO:0042866,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044262,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046164,GO:0046174,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0055114,GO:0061613,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901616 Opisthokonta 2QUB4@2759,38G0G@33154,COG0371@1 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_01371 529507.PMI2765 4.2e-180 637.1 Proteus metAS GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006555,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008652,GO:0008899,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009086,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016748,GO:0016750,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.3.1.46 ko:K00651 ko00270,ko00920,ko01100,ko01110,ko01230,map00270,map00920,map01100,map01110,map01230 M00017 R01777 RC00004,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_4539,iSBO_1134.SBO_4033,iSbBS512_1146.SbBS512_E4507 Bacteria 1MV64@1224,1RM7T@1236,3Z17A@583,COG1897@1,COG1897@2 NA|NA|NA E Transfers a succinyl group from succinyl-CoA to L- homoserine, forming succinyl-L-homoserine Z1_01372 529507.PMI2764 4.4e-310 1069.7 Proteus aceB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004474,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006097,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046487,GO:0046912,GO:0071704 2.3.3.9 ko:K01638 ko00620,ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,ko01200,map00620,map00630,map01100,map01110,map01120,map01200 M00012 R00472 RC00004,RC00308,RC02747 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_4499,iLF82_1304.LF82_0013,iNRG857_1313.NRG857_20010 Bacteria 1MVEV@1224,1RPVI@1236,3Z1HQ@583,COG2225@1,COG2225@2 NA|NA|NA H Malate synthase Z1_01373 529507.PMI2763 2.1e-249 867.8 Proteus aceA GO:0001101,GO:0001666,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004451,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006097,GO:0006102,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009268,GO:0009405,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010034,GO:0010447,GO:0016020,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0019752,GO:0019899,GO:0032787,GO:0033554,GO:0033993,GO:0035375,GO:0036293,GO:0036294,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043207,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046421,GO:0046487,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0052173,GO:0052200,GO:0052564,GO:0052572,GO:0070482,GO:0070542,GO:0070887,GO:0071453,GO:0071456,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072350,GO:0075136,GO:0075141,GO:1901700 4.1.3.1 ko:K01637 ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,ko01200,map00630,map01100,map01110,map01120,map01200 M00012 R00479 RC00311,RC00313 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 e_coli_core.b4015,iAF1260.b4015,iB21_1397.B21_03847,iBWG_1329.BWG_3671,iE2348C_1286.E2348C_4318,iEC042_1314.EC042_4377,iEC55989_1330.EC55989_4500,iECABU_c1320.ECABU_c45310,iECBD_1354.ECBD_4022,iECB_1328.ECB_03887,iECDH10B_1368.ECDH10B_4204,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3871,iECD_1391.ECD_03887,iECED1_1282.ECED1_4722,iECIAI1_1343.ECIAI1_4235,iECIAI39_1322.ECIAI39_4401,iECNA114_1301.ECNA114_4164,iECO103_1326.ECO103_4759,iECO111_1330.ECO111_4827,iECO26_1355.ECO26_5119,iECP_1309.ECP_4225,iECSE_1348.ECSE_4300,iECSF_1327.ECSF_3865,iECUMN_1333.ECUMN_4541,iECW_1372.ECW_m4374,iEKO11_1354.EKO11_4310,iETEC_1333.ETEC_4270,iEcDH1_1363.EcDH1_3982,iEcE24377_1341.EcE24377A_4557,iEcHS_1320.EcHS_A4249,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4469,iEcolC_1368.EcolC_4015,iJN746.PP_4116,iJO1366.b4015,iJR904.b4015,iLF82_1304.LF82_0012,iNRG857_1313.NRG857_20015,iSDY_1059.SDY_4328,iUMNK88_1353.UMNK88_4859,iWFL_1372.ECW_m4374,iY75_1357.Y75_RS20880 Bacteria 1MWIF@1224,1RQAK@1236,3Z2D0@583,COG2224@1,COG2224@2 NA|NA|NA C isocitrate lyase Z1_01374 34506.g1467 0.0 1153.7 Bilateria Metazoa 2S4PR@2759,39ZYX@33154,3BPWJ@33208,3D6Y8@33213,COG4579@1 NA|NA|NA T Isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase (AceK) Z1_01375 529507.PMI2761 2.6e-112 411.4 Proteus eda GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008675,GO:0008700,GO:0008948,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0016832,GO:0016833,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0106009 4.1.2.14,4.1.3.42 ko:K01625 ko00030,ko00630,ko01100,ko01120,ko01200,map00030,map00630,map01100,map01120,map01200 M00008,M00061,M00308,M00631 R00470,R05605 RC00307,RC00308,RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECOK1_1307.ECOK1_1968,iYL1228.KPN_02365 Bacteria 1MUVJ@1224,1RPDF@1236,3Z26Z@583,COG0800@1,COG0800@2 NA|NA|NA G KDPG and KHG aldolase Z1_01376 529507.PMI2760 0.0 1223.0 Proteus edd GO:0003674,GO:0003824,GO:0004456,GO:0005975,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019520,GO:0019521,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046176,GO:0046177,GO:0046395,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 4.2.1.12 ko:K01690 ko00030,ko01100,ko01120,ko01200,map00030,map01100,map01120,map01200 M00008 R02036 RC00543 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEcolC_1368.EcolC_1781,iJN746.PP_1010,iPC815.YPO2533,iYL1228.KPN_02366 Bacteria 1MU3T@1224,1RMNA@1236,3Z2DP@583,COG0129@1,COG0129@2 NA|NA|NA EG Belongs to the IlvD Edd family Z1_01377 529507.PMI2759 2.8e-151 541.2 Proteus iclR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K13641 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUNW@1224,1RY9N@1236,3Z1A6@583,COG1414@1,COG1414@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix isocitrate lyase regulation Z1_01378 529507.PMI2758 0.0 2429.1 Proteus metH GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006520,GO:0006555,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008172,GO:0008213,GO:0008270,GO:0008276,GO:0008652,GO:0008705,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009086,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019538,GO:0019752,GO:0019842,GO:0031419,GO:0032259,GO:0034641,GO:0035999,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042084,GO:0042558,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046872,GO:0046906,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050667,GO:0051186,GO:0071704,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.1.1.13 ko:K00548 ko00270,ko00450,ko00670,ko01100,ko01110,ko01230,map00270,map00450,map00670,map01100,map01110,map01230 M00017 R00946,R09365 RC00035,RC00113,RC01241 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO103_1326.ECO103_4764,iECUMN_1333.ECUMN_4545 Bacteria 1MV6G@1224,1RMYD@1236,3Z1VH@583,COG0646@1,COG0646@2,COG1410@1,COG1410@2 NA|NA|NA H B12 binding domain Z1_01379 529507.PMI2757 6.2e-105 386.7 Proteus Bacteria 1RIAT@1224,1S8KY@1236,2BG2K@1,329YV@2,3Z1I0@583 NA|NA|NA Z1_01381 34506.g801 4.7e-244 850.1 Opisthokonta HOM3 GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004072,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006531,GO:0006553,GO:0006555,GO:0006566,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009085,GO:0009086,GO:0009088,GO:0009089,GO:0009090,GO:0009092,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019202,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.7.2.4 ko:K00928 ko00260,ko00261,ko00270,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00260,map00261,map00270,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00016,M00017,M00018,M00033,M00525,M00526,M00527 R00480 RC00002,RC00043 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Opisthokonta 38QNZ@33154,COG0527@1,KOG0456@2759 NA|NA|NA E lysine biosynthetic process via diaminopimelate Z1_01382 529507.PMI2754 0.0 1115.9 Proteus pgi GO:0003674,GO:0003824,GO:0004347,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034599,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042221,GO:0042802,GO:0042866,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051716,GO:0055086,GO:0070887,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 5.3.1.9 ko:K01810 ko00010,ko00030,ko00500,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00030,map00500,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00001,M00004,M00114 R02739,R02740,R03321 RC00376,RC00563 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iEcSMS35_1347.EcSMS35_4486 Bacteria 1MUFP@1224,1RNIT@1236,3Z23M@583,COG0166@1,COG0166@2 NA|NA|NA F Phosphoglucose isomerase Z1_01383 529507.PMI2753 2.1e-96 358.2 Proteus ubiC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008813,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.1.3.40 ko:K03181 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R01302 RC00491,RC02148 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iZ_1308.Z5638 Bacteria 1N8BF@1224,1S6A0@1236,3Z2M1@583,COG3161@1,COG3161@2 NA|NA|NA H Removes the pyruvyl group from chorismate, with concomitant aromatization of the ring, to provide 4- hydroxybenzoate (4HB) for the ubiquinone pathway Z1_01384 529507.PMI2752 1.3e-151 542.3 Proteus ubiA GO:0002094,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004659,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008412,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016765,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 2.5.1.39 ko:K03179 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R05000,R05615 RC00209,RC02895 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01006 iZ_1308.Z5639 Bacteria 1MV4Q@1224,1RMZ1@1236,3Z1NS@583,COG0382@1,COG0382@2 NA|NA|NA H Catalyzes the prenylation of para-hydroxybenzoate (PHB) with an all-trans polyprenyl group. Mediates the second step in the final reaction sequence of ubiquinone-8 (UQ-8) biosynthesis, which is the condensation of the polyisoprenoid side chain with PHB, generating the first membrane-bound Q intermediate 3- octaprenyl-4-hydroxybenzoate Z1_01385 529507.PMI2751 0.0 1625.1 Proteus plsB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004366,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006644,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0019752,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.15 ko:K00631 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R09380 RC00004,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iECs_1301.ECs5024,iG2583_1286.G2583_4866 Bacteria 1MWZ6@1224,1RM7K@1236,3Z1IU@583,COG2937@1,COG2937@2 NA|NA|NA I Belongs to the GPAT DAPAT family Z1_01386 529507.PMI2750 2e-56 224.9 Proteus dgkA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004143,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006654,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019637,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046473,GO:0046474,GO:0046486,GO:0050896,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901576 2.7.1.107 ko:K00901 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,ko04070,ko04072,ko05231,map00561,map00564,map01100,map01110,map04070,map04072,map05231 R02240 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MZ3Q@1224,1S92I@1236,3Z2RV@583,COG0818@1,COG0818@2 NA|NA|NA M Recycling of diacylglycerol produced during the turnover of membrane phospholipid Z1_01387 529507.PMI2749 1.3e-108 399.1 Proteus lexA GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006282,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031668,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071496,GO:0071704,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001020,GO:2001141 3.4.21.88 ko:K01356 M00729 ko00000,ko00002,ko01000,ko01002,ko03400 Bacteria 1MW80@1224,1RMXF@1236,3Z2T6@583,COG1974@1,COG1974@2 NA|NA|NA K Represses a number of genes involved in the response to DNA damage (SOS response), including recA and lexA. Binds to the 16 bp palindromic sequence 5'-CTGTATATATATACAG-3'. In the presence of single-stranded DNA, RecA interacts with LexA causing an autocatalytic cleavage which disrupts the DNA-binding part of LexA, leading to derepression of the SOS regulon and eventually DNA repair Z1_01388 529507.PMI2748 1.3e-96 359.0 Proteus zur GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010043,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016020,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046983,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02076,ko:K03711,ko:K09823 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1MZIW@1224,1S5ZI@1236,3Z1UT@583,COG0735@1,COG0735@2 NA|NA|NA P Ferric uptake regulator family Z1_01389 529507.PMI2747 7.1e-92 343.2 Proteus ssb GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0030234,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RCWT@1224,1S3WP@1236,3Z2FV@583,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L Plays an important role in DNA replication, recombination and repair. Binds to ssDNA and to an array of partner proteins to recruit them to their sites of action during DNA metabolism Z1_01390 529507.PMI2746 0.0 1882.8 Proteus uvrA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009380,GO:0009381,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1902494,GO:1905347,GO:1905348,GO:1990391 ko:K03701 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MW0W@1224,1RMS9@1236,3Z1D4@583,COG0178@1,COG0178@2 NA|NA|NA L The UvrABC repair system catalyzes the recognition and processing of DNA lesions. UvrA is an ATPase and a DNA-binding protein. A damage recognition complex composed of 2 UvrA and 2 UvrB subunits scans DNA for abnormalities. When the presence of a lesion has been verified by UvrB, the UvrA molecules dissociate Z1_01391 529507.PMI2745 3.3e-242 844.0 Proteus yhaO GO:0000096,GO:0000098,GO:0001101,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009093,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016054,GO:0019752,GO:0032329,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042940,GO:0042942,GO:0043200,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044273,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044464,GO:0046395,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071944,GO:1901367,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901698,GO:1901700 ko:K03834,ko:K03835,ko:K03837 ko00000,ko02000 2.A.42.1.1,2.A.42.1.2,2.A.42.2.1 Bacteria 1N3PB@1224,1RQXP@1236,3Z281@583,COG0814@1,COG0814@2 NA|NA|NA E Serine transporter Z1_01392 529507.PMI2744 1.6e-241 841.6 Proteus yhaM GO:0000096,GO:0000098,GO:0001101,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009093,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019448,GO:0019450,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042221,GO:0043200,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044273,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0046439,GO:0050896,GO:0071704,GO:0080146,GO:1901367,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901698,GO:1901700 Bacteria 1MW81@1224,1RP1R@1236,3Z1QT@583,COG3681@1,COG3681@2 NA|NA|NA S Serine dehydratase alpha chain Z1_01393 529507.PMI2743 1.8e-231 808.1 Proteus tyrB 2.6.1.1,2.6.1.57 ko:K00813,ko:K00832 ko00220,ko00250,ko00270,ko00330,ko00350,ko00360,ko00400,ko00401,ko00950,ko00960,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map00250,map00270,map00330,map00350,map00360,map00400,map00401,map00950,map00960,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00024,M00025,M00034,M00040 R00355,R00694,R00734,R00896,R01731,R02433,R02619,R05052,R07396,R10845 RC00006,RC00036 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iJN746.PP_3590 Bacteria 1MUT0@1224,1RN02@1236,3Z1PE@583,COG1448@1,COG1448@2 NA|NA|NA H Aminotransferase class I and II Z1_01394 529507.PMI2742 3.7e-207 727.2 Proteus alr GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006523,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008784,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009078,GO:0009079,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016855,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0030203,GO:0030632,GO:0034645,GO:0036094,GO:0036361,GO:0040007,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046144,GO:0046145,GO:0046394,GO:0046416,GO:0046436,GO:0046437,GO:0047661,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 5.1.1.1 ko:K01775 ko00473,ko01100,ko01502,map00473,map01100,map01502 R00401 RC00285 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iPC815.YPO0321,iSBO_1134.SBO_4064,iSbBS512_1146.SbBS512_E4542,iYL1228.KPN_04440 Bacteria 1MV0Q@1224,1RM8U@1236,3Z1CZ@583,COG0787@1,COG0787@2 NA|NA|NA M Catalyzes the interconversion of L-alanine and D- alanine. May also act on other amino acids Z1_01395 34506.g975 1.2e-255 888.6 Bilateria Metazoa 2QRXQ@2759,3AEMZ@33154,3BYTN@33208,3DDYT@33213,COG0305@1 NA|NA|NA L DnaB-like helicase C terminal domain Z1_01396 34506.g974 2.6e-180 637.9 Bilateria Metazoa 38TSA@33154,3CPTD@33208,3E5YC@33213,COG0604@1,KOG1197@2759 NA|NA|NA C Zinc-binding dehydrogenase Z1_01397 34506.g973 8.8e-203 712.6 Rhabditida Nematoda 1M6H8@119089,3A195@33154,3BXBK@33208,3DENH@33213,40P1H@6231,414VM@6236,COG0042@1,KOG2335@2759 NA|NA|NA J Dihydrouridine synthase (Dus) Z1_01398 529507.PMI2738 9.4e-247 859.0 Proteus ko:K14645 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1RCQW@1224,1SYHT@1236,3Z0WX@583,COG1404@1,COG1404@2 NA|NA|NA O Subtilase family Z1_01399 34506.g1673 1.7e-207 728.4 Bilateria Metazoa 3A1ZY@33154,3BQCR@33208,3DENK@33213,COG1132@1,KOG0055@2759 NA|NA|NA Q ABC transporter Z1_01400 529507.PMI2736 1.2e-152 545.8 Proteus potB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015417,GO:0015595,GO:0015606,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0015848,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902047,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903711,GO:1904949,GO:1990351 ko:K11071 ko02010,map02010 M00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.11.1 iE2348C_1286.E2348C_1266,iECUMN_1333.ECUMN_1368,iSBO_1134.SBO_1916 Bacteria 1MVGM@1224,1RNNZ@1236,3Z12A@583,COG1176@1,COG1176@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01401 529507.PMI2735 3e-131 474.6 Proteus potC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015417,GO:0015595,GO:0015606,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0015848,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902047,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903711,GO:1904949,GO:1990351 ko:K11070 ko02010,map02010 M00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.11.1 iSBO_1134.SBO_1939 Bacteria 1MVC5@1224,1RQB7@1236,3Z16I@583,COG1177@1,COG1177@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01402 529507.PMI2734 2.4e-200 704.5 Proteus potD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0015848,GO:0019808,GO:0019809,GO:0019810,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0070405,GO:0071702,GO:0071705 ko:K11069,ko:K11070 ko02010,map02010 M00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.11.1 iSbBS512_1146.SbBS512_E2202 Bacteria 1MUYW@1224,1RM7W@1236,3Z1DQ@583,COG0687@1,COG0687@2 NA|NA|NA P Required for the activity of the bacterial periplasmic transport system of putrescine Z1_01403 529507.PMI2733 1.8e-50 204.9 Proteus ko:K20391 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1QD0M@1224,1T8V9@1236,3Z3H5@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_01404 529507.PMI2732 9.2e-203 712.6 Proteus yadC GO:0005575,GO:0005623,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007155,GO:0008150,GO:0009289,GO:0009987,GO:0022610,GO:0031589,GO:0033554,GO:0042221,GO:0042710,GO:0042995,GO:0043708,GO:0043709,GO:0044010,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051716,GO:0090605,GO:0090609 ko:K07350 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1PQ61@1224,1RRYQ@1236,3Z2HZ@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01405 529507.PMI2731 3.4e-86 324.3 Proteus Bacteria 1N3AG@1224,1SBD7@1236,3Z2UY@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01406 529507.PMI2730 0.0 1687.2 Proteus ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z2BI@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_01407 529507.PMI2729 8.5e-122 443.0 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1NUM1@1224,1SNHI@1236,3Z1R8@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_01408 529507.PMI2728 6.4e-91 340.1 Proteus fimA ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1N9JK@1224,1SFC2@1236,3Z18I@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01409 529507.PMI2727 1.1e-167 595.9 Proteus yddG GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005302,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015173,GO:0015179,GO:0015192,GO:0015196,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015801,GO:0015807,GO:0015823,GO:0015827,GO:0015828,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 iBWG_1329.BWG_1294,iE2348C_1286.E2348C_1607,iECDH10B_1368.ECDH10B_1604,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1416,iECS88_1305.ECS88_1565,iEcDH1_1363.EcDH1_2175,iJO1366.b1473,iNRG857_1313.NRG857_07295,iSSON_1240.SSON_1651,iUMN146_1321.UM146_09675 Bacteria 1MVGC@1224,1RMXB@1236,3Z100@583,COG0697@1,COG0697@2 NA|NA|NA EG EamA-like transporter family Z1_01410 34506.g1678 2e-241 841.3 Rhabditida Nematoda 1KUK3@119089,38CST@33154,3BFVK@33208,3CXAE@33213,40APF@6231,4173N@6236,COG0626@1,KOG0053@2759 NA|NA|NA E Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme Z1_01411 529507.PMI2725 3.4e-106 391.0 Proteus mtrR Bacteria 1RETE@1224,1SCWK@1236,3Z23Y@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, tetR family Z1_01412 529507.PMI2724 2.5e-158 564.7 Proteus yqeI Bacteria 1R4TZ@1224,1RMU6@1236,3Z11H@583,COG3710@1,COG3710@2 NA|NA|NA K transcriptional Z1_01413 529507.PMI2723 2.7e-91 341.3 Proteus Bacteria 1PB0U@1224,1RZBG@1236,28H7J@1,2Z7JS@2,3Z227@583 NA|NA|NA S FidL-like putative membrane protein Z1_01414 1141663.OOC_04787 6.7e-41 172.9 Providencia pduA_4 ko:K04027 ko00000 Bacteria 1RH1U@1224,1TKPI@1236,3ZA5A@586,COG4577@1,COG4577@2 NA|NA|NA CQ BMC domain Z1_01415 529507.PMI2721 1.4e-41 175.3 Proteus pduA_3 ko:K04027 ko00000 Bacteria 1RHAF@1224,1S6C8@1236,3Z2WH@583,COG4577@1,COG4577@2 NA|NA|NA CQ BMC domain Z1_01416 529507.PMI2720 2e-40 171.4 Proteus pduA ko:K04027 ko00000 Bacteria 1RH1U@1224,1S5Y6@1236,3Z2VJ@583,COG4577@1,COG4577@2 NA|NA|NA CQ BMC domain Z1_01417 529507.PMI2719 3.3e-308 1063.5 Proteus eutE Bacteria 1QUBI@1224,1RMMC@1236,3Z0YR@583,COG1012@1,COG1012@2 NA|NA|NA C Acetaldehyde dehydrogenase Z1_01418 529507.PMI2718 3.5e-39 167.2 Proteus ccmL ko:K04028 ko00000 Bacteria 1MZDC@1224,1S6K4@1236,3Z2VG@583,COG4576@1,COG4576@2 NA|NA|NA CQ Ethanolamine utilisation protein EutN/carboxysome Z1_01419 34506.g1681 1.2e-213 748.8 Rhabditida Nematoda 1M0QT@119089,3A518@33154,3BS5B@33208,3DDFN@33213,40R1M@6231,4173X@6236,COG1012@1,COG1454@1,KOG2450@2759,KOG3857@2759 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_01420 529507.PMI2716 0.0 2272.3 Proteus cutC 4.3.99.4 ko:K20038 ko00000,ko01000 Bacteria 1MWBF@1224,1RMEK@1236,3Z17P@583,COG1882@1,COG1882@2 NA|NA|NA C Glycine radical enzyme that catalyzes the cleavage of a C-N bond in choline, producing trimethylamine (TMA) and acetaldehyde Z1_01421 529507.PMI2715 3.8e-184 650.6 Proteus cutD GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006576,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009308,GO:0009310,GO:0009987,GO:0016491,GO:0019695,GO:0034641,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042402,GO:0042426,GO:0043364,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044248,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070283,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K20037 ko00000,ko01000 Bacteria 1R400@1224,1T0C2@1236,3Z2AD@583,COG1180@1,COG1180@2 NA|NA|NA C Catalyzes activation of the choline trimethylamine-lyase CutC under anaerobic conditions by generation of an organic free radical on a glycine residue, via an homolytic cleavage of S- adenosyl-L-methionine (SAM) Z1_01422 529507.PMI2714 2.5e-78 298.1 Proteus Bacteria 1RIUW@1224,1S7IT@1236,3Z3EK@583,COG4577@1,COG4577@2 NA|NA|NA CQ BMC Z1_01423 529507.PMI2713 7.4e-115 419.9 Proteus pduL 2.3.1.8 ko:K15024 ko00430,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00430,map00620,map00640,map00720,map01100,map01120,map01200 M00579 R00230,R00921 RC00004,RC02746,RC02816 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R5F0@1224,1RYQF@1236,3Z11X@583,COG4869@1,COG4869@2 NA|NA|NA Q Involved in 1,2-propanediol (1,2-PD) degradation by catalyzing the conversion of propanoyl-CoA to propanoyl-phosphate Z1_01424 529507.PMI2712 1.1e-127 462.6 Proteus Bacteria 1P4IF@1224,1RR64@1236,2DBHR@1,2Z9CI@2,3Z300@583 NA|NA|NA Z1_01425 471881.PROPEN_00399 3.8e-64 250.8 Proteus emrE ko:K03297 ko00000,ko02000 2.A.7.1 Bacteria 1QE8M@1224,1S35H@1236,3Z2KZ@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA U Small Multidrug Resistance protein Z1_01426 529507.PMI2710 1.5e-52 211.8 Proteus emrE ko:K03297 ko00000,ko02000 2.A.7.1 Bacteria 1RHK8@1224,1S74T@1236,3Z2XG@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Small Multidrug Resistance protein Z1_01427 529507.PMI2709 4e-169 600.9 Gammaproteobacteria yopH ko:K04055 ko00000,ko02044 3.A.6.1 Bacteria 1REUH@1224,1S7QR@1236,COG5599@1,COG5599@2 NA|NA|NA T Phosphatase Z1_01428 529507.PMI2708 0.0 1902.5 Proteus bepE_1 ko:K18138,ko:K18307 ko01501,ko01503,ko02024,map01501,map01503,map02024 M00644,M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.6.2,2.A.6.2.20,2.A.6.2.32 Bacteria 1MU48@1224,1RMBN@1236,3Z28V@583,COG0841@1,COG0841@2 NA|NA|NA V Psort location CytoplasmicMembrane, score Z1_01429 529507.PMI2707 2e-197 694.9 Proteus mdtA_1 ko:K03585,ko:K18306 ko01501,ko01503,ko02024,map01501,map01503,map02024 M00644,M00646,M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000,ko03036 2.A.6.2,2.A.6.2.20,2.A.6.2.32,8.A.1,8.A.1.6 Bacteria 1MUFW@1224,1RQJ9@1236,3Z2M5@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Belongs to the membrane fusion protein (MFP) (TC 8.A.1) family Z1_01430 529507.PMI2706 5.6e-71 273.5 Proteus ko:K15977,ko:K18305 M00644 ko00000,ko00002,ko02000 Bacteria 1N0DQ@1224,1S6IE@1236,3Z2YR@583,COG2259@1,COG2259@2 NA|NA|NA S DoxX Z1_01431 529507.PMI2705 1.6e-79 302.0 Proteus soxR GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540 ko:K13639 ko00000,ko03000 Bacteria 1RH2U@1224,1S6M0@1236,3Z2AB@583,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, mercury resistance Z1_01432 529507.PMI2704 9.4e-74 282.7 Proteus Bacteria 1QCS4@1224,1T8IN@1236,2AQ5A@1,31FAP@2,3Z2ZN@583 NA|NA|NA Z1_01433 529507.PMI2703 6.5e-125 453.4 Proteus Bacteria 1QCSF@1224,1T8J8@1236,29DWP@1,300UJ@2,3Z30P@583 NA|NA|NA Z1_01434 529507.PMI2702 3e-96 357.8 Proteus Bacteria 1NMJ9@1224,1SID0@1236,2C8QR@1,33NW6@2,3Z2U4@583 NA|NA|NA S Bacterial type III secretion apparatus protein (OrgA_MxiK) Z1_01435 529507.PMI2701 9.2e-125 453.0 Proteus ko:K03222,ko:K22505 ko03070,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.3 Bacteria 1RA14@1224,1S32N@1236,3Z0Z3@583,COG4669@1,COG4669@2 NA|NA|NA U Secretory protein of YscJ/FliF family Z1_01436 529507.PMI2700 5.7e-40 169.9 Proteus Bacteria 1QG77@1224,1TDK6@1236,2AT26@1,31II5@2,3Z33T@583 NA|NA|NA Z1_01437 529507.PMI2699 4.6e-36 156.8 Proteus prgI ko:K03221 ko03070,map03070 M00332,M00542 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.6.1 Bacteria 1N72M@1224,1SD40@1236,2BWZD@1,32ZZJ@2,3Z30Q@583 NA|NA|NA S Type III secretion needle MxiH, YscF, SsaG, EprI, PscF, EscF Z1_01438 529507.PMI2698 1.1e-200 705.7 Proteus Bacteria 1P725@1224,1SWE4@1236,292HW@1,2ZQ21@2,3Z38R@583 NA|NA|NA Z1_01439 529507.PMI2697 3.5e-140 504.2 Proteus invF Bacteria 1MZDB@1224,1T0MC@1236,3Z2N0@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_01440 529507.PMI2696 0.0 1107.0 Proteus ysaC ko:K22504 Bacteria 1MV6H@1224,1RPIX@1236,3Z0UP@583,COG1450@1,COG1450@2 NA|NA|NA NU Type III secretion outer membrane pore, YscC HrcC family Z1_01441 529507.PMI2695 1.6e-194 685.3 Proteus ysaW ko:K04058,ko:K22511 ko03070,map03070 M00332 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1R94S@1224,1S78G@1236,28KVC@1,2ZABZ@2,3Z39Y@583 NA|NA|NA S type III secretion regulator YopN LcrE InvE MxiC Z1_01442 529507.PMI2694 0.0 1300.0 Proteus invA ko:K03230 ko03070,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.3 Bacteria 1R346@1224,1T62Z@1236,3Z2ES@583,COG4789@1,COG4789@2 NA|NA|NA U Psort location CytoplasmicMembrane, score Z1_01443 529507.PMI2693 3.5e-70 270.8 Proteus invB ko:K22512 Bacteria 1NFBS@1224,1SG5M@1236,2E8WA@1,3336H@2,3Z30N@583 NA|NA|NA S Invasion protein B family Z1_01444 529507.PMI2692 1.8e-237 828.2 Proteus invC 3.6.3.14 ko:K03224,ko:K22506 ko03070,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.3 Bacteria 1MUH6@1224,1RM9W@1236,3Z17Z@583,COG1157@1,COG1157@2 NA|NA|NA NU Type III Z1_01445 529507.PMI2691 1e-70 272.7 Proteus Bacteria 1QJ6C@1224,1TH3X@1236,2AVIR@1,31MBC@2,3Z2TQ@583 NA|NA|NA Z1_01446 529507.PMI2690 3.5e-203 714.1 Proteus Bacteria 1QCTR@1224,1T8KR@1236,2B3UG@1,31WIA@2,3Z33K@583 NA|NA|NA Z1_01447 529507.PMI2689 2.3e-170 604.7 Proteus spaO ko:K02416,ko:K03225 ko02030,ko02040,ko03070,map02030,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.6.1 Bacteria 1NHT9@1224,1SHK8@1236,3Z2PJ@583,COG1886@1,COG1886@2 NA|NA|NA NU Type III flagellar switch regulator (C-ring) FliN C-term Z1_01448 529507.PMI2688 1.3e-111 409.1 Proteus ko:K22507 Bacteria 1R6K5@1224,1RQMY@1236,3Z3A6@583,COG4790@1,COG4790@2 NA|NA|NA U FliP family Z1_01449 529507.PMI2687 2.4e-34 151.0 Proteus rhcS ko:K02420,ko:K03227,ko:K22508 ko02040,ko03070,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1N6RK@1224,1SCHY@1236,3Z30I@583,COG4794@1,COG4794@2 NA|NA|NA U Bacterial export proteins, family 3 Z1_01450 529507.PMI2686 3.9e-131 474.2 Proteus epaR ko:K02421,ko:K03228,ko:K22509 ko02040,ko03070,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1RJHJ@1224,1S7BU@1236,3Z12Q@583,COG4791@1,COG4791@2 NA|NA|NA U type III secretion apparatus protein SpaR YscT HrcT Z1_01451 529507.PMI2685 1.1e-187 662.5 Proteus flhB ko:K02401,ko:K03229,ko:K04061,ko:K22510 ko02040,ko03070,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1NC6M@1224,1RRI9@1236,3Z2ME@583,COG1377@1,COG1377@2 NA|NA|NA NU FlhB HrpN YscU SpaS Family Z1_01452 529507.PMI2684 2.3e-90 338.2 Proteus Bacteria 1RGWG@1224,1S64E@1236,3Z2WD@583,COG0457@1,COG0457@2 NA|NA|NA S Tetratricopeptide repeat Z1_01453 529507.PMI2683 0.0 1238.4 Proteus ko:K13285 ko05100,ko05131,ko05132,map05100,map05131,map05132 ko00000,ko00001,ko02000 1.C.36.3 Bacteria 1QRG2@1224,1TDGK@1236,2B19P@1,31TQ6@2,3Z2WA@583 NA|NA|NA S Secretion system effector C (SseC) like family Z1_01454 529507.PMI2682 5.8e-104 384.0 Proteus Bacteria 1NH99@1224,1SIDR@1236,2ESF2@1,33JZR@2,3Z2U8@583 NA|NA|NA Z1_01455 529507.PMI2681 5.2e-195 686.8 Proteus ko:K13287 ko05100,ko05131,ko05132,map05100,map05131,map05132 ko00000,ko00001,ko02000 1.C.36.3 Bacteria 1QIZT@1224,1TGWN@1236,2AY8J@1,31QAV@2,3Z33Q@583 NA|NA|NA S Invasion plasmid antigen IpaD Z1_01456 529507.PMI2680 0.0 1330.9 Proteus prrA ko:K02014 ko00000,ko02000 1.B.14 Bacteria 1MXY7@1224,1RSFW@1236,3Z1I7@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA M TonB dependent receptor Z1_01457 529507.PMI2679 4.7e-162 577.0 Proteus nadC 2.4.2.19 ko:K00767,ko:K03813 ko00760,ko01100,map00760,map01100 M00115 R03348 RC02877 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MW0C@1224,1RMBU@1236,3Z1PG@583,COG0157@1,COG0157@2 NA|NA|NA H Belongs to the NadC ModD family Z1_01458 34506.g6319 1.2e-154 552.4 Eukaryota Eukaryota 2D6R6@1,2T2QT@2759 NA|NA|NA S Mycolic acid cyclopropane synthetase Z1_01459 529507.PMI2677 1.9e-144 518.5 Proteus 3.6.3.34 ko:K02013,ko:K09817 ko02010,map02010 M00240,M00242 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.14,3.A.1.15.3,3.A.1.15.5 Bacteria 1MUNG@1224,1S4UC@1236,3Z2HX@583,COG1120@1,COG1120@2 NA|NA|NA P ABC transporter Z1_01460 529507.PMI2676 1.8e-168 598.6 Proteus ko:K02015 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MV9W@1224,1RMDF@1236,3Z25D@583,COG0609@1,COG0609@2 NA|NA|NA P ABC 3 transport family Z1_01461 529507.PMI2675 8.3e-185 652.9 Proteus ko:K02016,ko:K02049 ko02010,map02010 M00188,M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14,3.A.1.16,3.A.1.17 Bacteria 1NVK4@1224,1RSK8@1236,3Z2AZ@583,COG0614@1,COG0614@2 NA|NA|NA P Periplasmic binding protein Z1_01462 529507.PMI2674 2e-183 648.3 Proteus gntR GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0033554,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K06145 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUEP@1224,1RQKH@1236,3Z0V2@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K Periplasmic binding protein domain Z1_01463 529507.PMI2673 8.3e-99 366.3 Proteus gntK 2.7.1.12 ko:K00851 ko00030,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00030,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 R01737 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RHD0@1224,1RP41@1236,3Z2R6@583,COG3265@1,COG3265@2 NA|NA|NA F Gluconokinase Z1_01464 529507.PMI2672 2e-239 834.7 Proteus gntU GO:0003674,GO:0005215,GO:0005402,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008643,GO:0015075,GO:0015144,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015318,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034219,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098655 ko:K03299,ko:K06156 ko00000,ko02000 2.A.8,2.A.8.1.8 iAF1260.b4476,iB21_1397.B21_03240,iBWG_1329.BWG_3127,iEC55989_1330.EC55989_3845,iECB_1328.ECB_03287,iECDH10B_1368.ECDH10B_3609,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3313,iECD_1391.ECD_03287,iECH74115_1262.ECH74115_4752,iECIAI1_1343.ECIAI1_3581,iECIAI39_1322.ECIAI39_3918,iECO26_1355.ECO26_4525,iECSE_1348.ECSE_3704,iECSP_1301.ECSP_4391,iECUMN_1333.ECUMN_3899,iECs_1301.ECs4285,iEKO11_1354.EKO11_0306,iETEC_1333.ETEC_3684,iEcDH1_1363.EcDH1_0279,iEcE24377_1341.EcE24377A_3914,iEcHS_1320.EcHS_A3635,iEcSMS35_1347.EcSMS35_3719,iEcolC_1368.EcolC_0277,iG2583_1286.G2583_4138,iJO1366.b4476,iSDY_1059.SDY_3587,iUMNK88_1353.UMNK88_4205,iY75_1357.Y75_RS20045,iYL1228.KPN_03800,iZ_1308.Z4804 Bacteria 1MUFG@1224,1RNGE@1236,3Z1X7@583,COG2610@1,COG2610@2 NA|NA|NA EG GntP family permease Z1_01465 529507.PMI2671 4e-170 604.0 Proteus Bacteria 1R5W9@1224,1RZUT@1236,3Z2NK@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT methyl-accepting chemotaxis protein Z1_01467 529507.PMI2670 6.8e-234 816.2 Proteus Z012_00180 3.1.1.5 ko:K10804 ko01040,map01040 ko00000,ko00001,ko01000,ko01004 Bacteria 1MXSG@1224,1RQZT@1236,3Z1KW@583,COG2755@1,COG2755@2 NA|NA|NA E GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family Z1_01468 529507.PMI2669 5.9e-227 793.1 Proteus Z012_00175 ko:K09795 ko00000 Bacteria 1R4X7@1224,1RY84@1236,3Z1TZ@583,COG2845@1,COG2845@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF459) Z1_01469 529507.PMI2668 1.7e-268 931.4 Proteus algI ko:K19294 ko00000 Bacteria 1MUXN@1224,1RQ1A@1236,3Z1QH@583,COG1696@1,COG1696@2 NA|NA|NA M membrane protein involved in D-alanine export Z1_01470 529507.PMI2667 1.6e-143 515.4 Proteus bax ko:K03796 ko00000 GH73 Bacteria 1RD3U@1224,1S3RA@1236,3Z19M@583,COG2992@1,COG2992@2 NA|NA|NA S Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase Z1_01471 529507.PMI2666 4.5e-224 783.5 Proteus Bacteria 1MVTN@1224,1RM97@1236,2DBFB@1,2Z8XA@2,3Z10F@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4056) Z1_01472 529507.PMI2665 6.9e-225 786.2 Proteus Bacteria 1QUE3@1224,1T1VJ@1236,3Z2D7@583,COG4775@1,COG4775@2 NA|NA|NA M Surface antigen Z1_01473 585.DR95_2256 4.8e-150 537.3 Proteus Bacteria 1NC6U@1224,1RSEY@1236,28IAE@1,2Z8D0@2,3Z1Z1@583 NA|NA|NA Z1_01474 529507.PMI2663 4.7e-79 300.4 Proteus recX GO:0003674,GO:0006282,GO:0008150,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030234,GO:0031323,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051171,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0080090,GO:0080134,GO:0080135,GO:0098772,GO:2001020 ko:K03565 ko00000,ko03400 Bacteria 1N6P6@1224,1SCMF@1236,3Z2J5@583,COG2137@1,COG2137@2 NA|NA|NA S Modulates RecA activity Z1_01475 529507.PMI2662 6.5e-113 413.3 Proteus ko:K03933 ko00000 AA10,CBM73 Bacteria 1MXNR@1224,1RQZB@1236,3Z14B@583,COG3397@1,COG3397@2 NA|NA|NA S Lytic polysaccharide mono-oxygenase, cellulose-degrading Z1_01476 529507.PMI2661 9.3e-113 412.9 Proteus tal GO:0003674,GO:0003824,GO:0004801,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0016740,GO:0016744,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016832,GO:0044424,GO:0044464,GO:0097023 2.2.1.2 ko:K00616,ko:K08313,ko:K08314 ko00030,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00004,M00007 R01827 RC00439,RC00604 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iB21_1397.B21_03781,iEC042_1314.EC042_0914,iECBD_1354.ECBD_4077,iECB_1328.ECB_03832,iECD_1391.ECD_03832,iECH74115_1262.ECH74115_5407,iECSP_1301.ECSP_5016,iECs_1301.ECs4875,iEcHS_1320.EcHS_A4181,iG2583_1286.G2583_4758,iSBO_1134.SBO_0715,iSF_1195.SF0775,iSFxv_1172.SFxv_0845,iS_1188.S0818,iZ_1308.Z5501 Bacteria 1MWQ8@1224,1RNWN@1236,3Z1SU@583,COG0176@1,COG0176@2 NA|NA|NA H Transaldolase is important for the balance of metabolites in the pentose-phosphate pathway Z1_01477 529507.PMI2660 3.7e-69 267.3 Proteus caiF ko:K08277 ko00000,ko03000 Bacteria 1RJ32@1224,1S6GM@1236,2BXKV@1,32FV2@2,3Z2P0@583 NA|NA|NA K CaiF/GrlA transcriptional regulator Z1_01478 529507.PMI2659 1.1e-104 386.0 Proteus caiE GO:0003674,GO:0003824,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008735,GO:0009437,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0034641,GO:0044237,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564 ko:K02617,ko:K08279 ko00000 Bacteria 1MVUI@1224,1RYPQ@1236,3Z1XY@583,COG0663@1,COG0663@2 NA|NA|NA S Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) Z1_01479 529507.PMI2658 4.6e-143 513.8 Proteus caiD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004300,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006579,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008809,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009437,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016856,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0034440,GO:0034641,GO:0042219,GO:0042413,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044270,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 4.2.1.149 ko:K08299 R10675 RC01095 ko00000,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1945,iEC042_1314.EC042_0038,iECABU_c1320.ECABU_c00410,iECB_1328.ECB_00040,iECD_1391.ECD_00040,iECO103_1326.ECO103_0038,iECP_1309.ECP_0036,iETEC_1333.ETEC_0036,iNRG857_1313.NRG857_00190,iUMN146_1321.UM146_22960,ic_1306.c0045 Bacteria 1MWZC@1224,1RR3Z@1236,3Z2AT@583,COG1024@1,COG1024@2 NA|NA|NA I Catalyzes the reversible dehydration of L-carnitinyl-CoA to crotonobetainyl-CoA Z1_01480 529507.PMI2657 5.6e-310 1069.3 Proteus caiC GO:0003674,GO:0003824,GO:0016405,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016879,GO:0016881,GO:0051108,GO:0051109 6.2.1.48 ko:K02182 ko00000,ko01000 iECSE_1348.ECSE_0038,iNRG857_1313.NRG857_00195 Bacteria 1MU6G@1224,1RMQ4@1236,3Z1QC@583,COG0318@1,COG0318@2 NA|NA|NA IQ Could catalyze the transfer of CoA to carnitine, generating the initial carnitinyl-CoA needed for the CaiB reaction cycle Z1_01481 529507.PMI2656 3.9e-242 843.6 Proteus caiB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006579,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008735,GO:0009056,GO:0009437,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0034641,GO:0042219,GO:0042413,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 2.8.3.21 ko:K08298 R10643,R10644 RC00014,RC00131 ko00000,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_0038,iECIAI1_1343.ECIAI1_0040,iECO103_1326.ECO103_0040,iECO111_1330.ECO111_0039,iECO26_1355.ECO26_0039,iEcHS_1320.EcHS_A0042,iSF_1195.SF0035,iSFxv_1172.SFxv_0036,iS_1188.S0037 Bacteria 1MU2K@1224,1RNB5@1236,3Z1T0@583,COG1804@1,COG1804@2 NA|NA|NA H Catalyzes the reversible transfer of the CoA moiety from gamma-butyrobetainyl-CoA to L-carnitine to generate L-carnitinyl- CoA and gamma-butyrobetaine. Is also able to catalyze the reversible transfer of the CoA moiety from gamma-butyrobetainyl- CoA or L-carnitinyl-CoA to crotonobetaine to generate crotonobetainyl-CoA Z1_01482 529507.PMI2655 1.4e-220 771.9 Proteus caiA 1.3.8.13 ko:K08297 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUDR@1224,1RMMJ@1236,3Z0UZ@583,COG1960@1,COG1960@2 NA|NA|NA I Catalyzes the reduction of crotonobetainyl-CoA to gamma- butyrobetainyl-CoA Z1_01483 529507.PMI2654 1.7e-295 1021.1 Proteus caiT GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015226,GO:0015651,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015838,GO:0015879,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072349,GO:0072488,GO:0098655,GO:1902603 ko:K05245 ko00000,ko02000 2.A.15.2 iB21_1397.B21_00043,iECBD_1354.ECBD_3575,iECB_1328.ECB_00044,iECD_1391.ECD_00044,iSF_1195.SF0037,iSFxv_1172.SFxv_0038,iS_1188.S0039 Bacteria 1MV0K@1224,1RP3E@1236,3Z19E@583,COG1292@1,COG1292@2 NA|NA|NA M Catalyzes the exchange of L-carnitine for gamma- butyrobetaine and related betaines Z1_01484 529507.PMI2653 3.2e-133 481.1 Proteus fixA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006091,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006579,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009056,GO:0009437,GO:0009987,GO:0016491,GO:0022900,GO:0034641,GO:0042219,GO:0042413,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K03521 ko00000 Bacteria 1MVH6@1224,1RN6F@1236,3Z2A6@583,COG2086@1,COG2086@2 NA|NA|NA C Required for anaerobic carnitine reduction. May bring reductant to CaiA Z1_01485 529507.PMI2652 2.6e-169 601.3 Proteus fixB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006579,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009437,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016491,GO:0019395,GO:0019752,GO:0022900,GO:0030258,GO:0032787,GO:0033539,GO:0034440,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042219,GO:0042413,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044270,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:0097159,GO:0097164,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 1.3.8.1 ko:K00248,ko:K03522 ko00071,ko00280,ko00650,ko01100,ko01110,ko01120,ko01200,ko01212,map00071,map00280,map00650,map01100,map01110,map01120,map01200,map01212 R01175,R01178,R02661,R03172,R04751 RC00052,RC00068,RC00076,RC00120,RC00148 ko00000,ko00001,ko01000,ko04147 Bacteria 1MUFI@1224,1RMK7@1236,3Z1P6@583,COG2025@1,COG2025@2 NA|NA|NA C Required for anaerobic carnitine reduction. May bring reductant to CaiA Z1_01486 34506.g1365 1.6e-241 841.6 Bilateria Metazoa 3AFIM@33154,3BZ3Z@33208,3DD9W@33213,COG2440@1,KOG2415@2759 NA|NA|NA C FAD dependent oxidoreductase Z1_01487 529507.PMI2650 2.2e-50 204.5 Proteus fixX ko:K03855 ko00000 Bacteria 1RHTX@1224,1S6EF@1236,3Z2ZK@583,COG2440@1,COG2440@2 NA|NA|NA C ferredoxin-like protein Z1_01488 529507.PMI2649 4e-248 863.6 Proteus ygcS ko:K08368 ko00000,ko02000 2.A.1 Bacteria 1MVKJ@1224,1T1VM@1236,3Z154@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Sugar (and other) transporter Z1_01489 529507.PMI2648 0.0 3149.8 Gammaproteobacteria ko:K03924 ko00000,ko01000 Bacteria 1NSN5@1224,1RPNN@1236,COG0714@1,COG0714@2,COG1196@1,COG1196@2 NA|NA|NA M ATPase involved in DNA repair Z1_01490 529507.PMI2647 3.4e-297 1027.3 Gammaproteobacteria yqiK ko:K07192 ko04910,map04910 ko00000,ko00001,ko03036,ko04131,ko04147 Bacteria 1P50K@1224,1RRHJ@1236,COG2268@1,COG2268@2 NA|NA|NA S protein conserved in bacteria Z1_01491 529507.PMI2646 2.2e-108 398.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1R38Q@1224,1T64T@1236,28NN2@1,2ZBNH@2 NA|NA|NA Z1_01492 529507.PMI2645 1.2e-100 372.5 Gammaproteobacteria lemA ko:K03744 ko00000 Bacteria 1MVH0@1224,1S2M8@1236,COG1704@1,COG1704@2 NA|NA|NA S LemA protein Z1_01493 529507.PMI2644 1.6e-192 678.7 Gammaproteobacteria ko:K06872 ko00000 Bacteria 1PB41@1224,1SAWX@1236,COG1512@1,COG1512@2 NA|NA|NA S TPM domain Z1_01495 529507.PMI2548 1.7e-99 368.6 Proteus yjdC GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1903506,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 Bacteria 1RAPB@1224,1RPSA@1236,3Z121@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_01496 529507.PMI2547 9.8e-231 805.8 Proteus dcuA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005310,GO:0005342,GO:0005469,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006855,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015138,GO:0015141,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015318,GO:0015556,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015741,GO:0015744,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071422,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K07791,ko:K07792 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.13.1 iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3996,iEcDH1_1363.EcDH1_3854 Bacteria 1MVHH@1224,1RPTE@1236,3Z27F@583,COG2704@1,COG2704@2 NA|NA|NA S Responsible for the transport of C4-dicarboxylates from the periplasm across the inner membrane Z1_01497 529507.PMI2546 3.6e-271 940.3 Proteus aspA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006531,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008797,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010628,GO:0010755,GO:0010756,GO:0010954,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016840,GO:0016841,GO:0019222,GO:0019752,GO:0030162,GO:0031323,GO:0031325,GO:0032268,GO:0032270,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045862,GO:0046394,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070613,GO:0071704,GO:0080090,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1903317,GO:1903319 4.3.1.1 ko:K01744 ko00250,ko01100,map00250,map01100 R00490 RC00316,RC02799 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_2250,iECs_1301.ECs5120,iG2583_1286.G2583_4966,iSBO_1134.SBO_4317,iSDY_1059.SDY_4444,iSF_1195.SF4293,iSFxv_1172.SFxv_4682,iSSON_1240.SSON_4322,iS_1188.S4560,iUTI89_1310.UTI89_C4736,iYL1228.KPN_04529,iZ_1308.Z5744,ic_1306.c5222 Bacteria 1R9JY@1224,1RP5Z@1236,3Z1GE@583,COG1027@1,COG1027@2 NA|NA|NA E Lyase Z1_01498 529507.PMI2545 1.1e-78 299.3 Proteus fxsA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07113 ko00000 Bacteria 1MZJJ@1224,1S8XU@1236,3Z1DR@583,COG3030@1,COG3030@2 NA|NA|NA S FxsA cytoplasmic membrane protein Z1_01499 529507.PMI2544 5.3e-44 183.3 Proteus groS GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006950,GO:0006986,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010033,GO:0016032,GO:0016465,GO:0019058,GO:0019068,GO:0032991,GO:0035966,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051087,GO:0051704,GO:0061077,GO:0101031,GO:1990220 ko:K04078 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1MZ2X@1224,1S8YR@1236,3Z2TR@583,COG0234@1,COG0234@2 NA|NA|NA O Binds to Cpn60 in the presence of Mg-ATP and suppresses the ATPase activity of the latter Z1_01500 529507.PMI2543 1.2e-289 1001.9 Proteus groL GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006950,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009405,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009986,GO:0009987,GO:0010646,GO:0010647,GO:0016032,GO:0016462,GO:0016465,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018995,GO:0019058,GO:0019068,GO:0020003,GO:0023051,GO:0023056,GO:0030430,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033643,GO:0033646,GO:0033655,GO:0035639,GO:0035821,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043230,GO:0043656,GO:0043657,GO:0043900,GO:0043903,GO:0044183,GO:0044215,GO:0044216,GO:0044217,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044421,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046872,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048583,GO:0048584,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051704,GO:0051817,GO:0052047,GO:0052212,GO:0061077,GO:0065007,GO:0065010,GO:0097159,GO:0097367,GO:0101031,GO:1901222,GO:1901224,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902531,GO:1902533,GO:1990220,GO:2000535 ko:K04077 ko03018,ko04212,ko04940,ko05134,ko05152,map03018,map04212,map04940,map05134,map05152 ko00000,ko00001,ko03019,ko03029,ko03110,ko04147 Bacteria 1MURR@1224,1RMTB@1236,3Z26K@583,COG0459@1,COG0459@2 NA|NA|NA O Prevents misfolding and promotes the refolding and proper assembly of unfolded polypeptides generated under stress conditions Z1_01501 529507.PMI3034 2.6e-73 281.2 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01502 529507.PMI3506 2.6e-222 777.7 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01503 529507.PMI2541 7.1e-40 169.9 Proteus yjeI GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1RJBQ@1224,1S6CT@1236,2AGMU@1,316V4@2,3Z2S0@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4156) Z1_01504 529507.PMI2540 1.2e-112 412.5 Gammaproteobacteria ylbE Bacteria 1R63N@1224,1RQER@1236,COG0702@1,COG0702@2 NA|NA|NA GM Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases Z1_01505 529507.PMI2539 7.4e-95 353.2 Proteus Bacteria 1QCU4@1224,1T8M8@1236,3Z34C@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01506 529507.PMI2538 1.1e-124 452.6 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1MY9H@1224,1S862@1236,3Z31U@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_01507 529507.PMI2537 3.1e-104 384.4 Proteus Bacteria 1QD1U@1224,1T8WN@1236,29GSS@1,303QJ@2,3Z3J5@583 NA|NA|NA Z1_01508 529507.PMI2536 1.5e-92 345.5 Proteus Bacteria 1QD2A@1224,1T8X9@1236,3Z3JW@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01509 529507.PMI2535 8.4e-128 463.0 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1N416@1224,1TB1C@1236,3Z3HM@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain Z1_01510 529507.PMI2534 2.2e-148 531.6 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1PWW9@1224,1TB1B@1236,3Z3H9@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain Z1_01511 529507.PMI2533 0.0 1644.8 Proteus fimD_3 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z35M@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Psort location OuterMembrane, score Z1_01512 529507.PMI1923 1.5e-27 129.8 Proteus Bacteria 1QN1P@1224,1TKEG@1236,2AYBJ@1,31QE8@2,3Z3E0@583 NA|NA|NA Z1_01513 529507.PMI2531 5.2e-195 686.8 Proteus kamA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016869,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540 5.4.3.2 ko:K01843,ko:K19810 ko00310,map00310 R00461 RC00303 ko00000,ko00001,ko01000,ko03012 iECH74115_1262.ECH74115_5662,iECIAI39_1322.ECIAI39_4611,iS_1188.S4569 Bacteria 1MUPJ@1224,1RM84@1236,3Z28E@583,COG1509@1,COG1509@2 NA|NA|NA C lysine 2,3-aminomutase Z1_01514 529507.PMI2530 1.3e-102 379.0 Proteus efp GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003746,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006417,GO:0006448,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045900,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072344,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001124,GO:2001125 ko:K02356 ko00000,ko03012 Bacteria 1MW2J@1224,1RPW7@1236,3Z1Q5@583,COG0231@1,COG0231@2 NA|NA|NA J Involved in peptide bond synthesis. Alleviates ribosome stalling that occurs when 3 or more consecutive Pro residues or the sequence PPG is present in a protein, possibly by augmenting the peptidyl transferase activity of the ribosome. Modification of Lys-34 is required for alleviation Z1_01515 529507.PMI2529 1.8e-86 325.1 Proteus rpiB 5.3.1.6 ko:K01808 ko00030,ko00051,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map00051,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00004,M00007,M00165,M00167 R01056,R09030 RC00376,RC00434 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1QNAM@1224,1TKU6@1236,3Z109@583,COG0698@1,COG0698@2 NA|NA|NA G Sugar-phosphate isomerase, RpiB LacA LacB family Z1_01516 34506.g4718 2e-117 428.3 Bilateria Metazoa 2S2GP@2759,3A3GM@33154,3BRHU@33208,3D8FW@33213,COG1142@1 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_01517 529507.PMI2527 0.0 1273.8 Proteus hyfB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K12137 ko00000,ko01000 iEKO11_1354.EKO11_1252 Bacteria 1MXRW@1224,1RM9Q@1236,3Z0XT@583,COG0651@1,COG0651@2 NA|NA|NA CP Proton-conducting membrane transporter Z1_01518 529507.PMI2526 3e-157 561.2 Proteus hyfC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0033554,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071944 ko:K12138,ko:K12139 ko00000,ko01000 iUMNK88_1353.UMNK88_3079 Bacteria 1MXV5@1224,1RPCY@1236,3Z14C@583,COG0650@1,COG0650@2 NA|NA|NA C NADH dehydrogenase Z1_01519 34506.g4720 1.2e-253 882.1 Rhabditida GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005740,GO:0005743,GO:0005746,GO:0005747,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006120,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019866,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0031090,GO:0031966,GO:0031967,GO:0031975,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042773,GO:0042775,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044455,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0050136,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070469,GO:0071704,GO:0072521,GO:0098796,GO:0098798,GO:0098800,GO:0098803,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K03883 ko00190,ko01100,ko04714,ko04723,ko05012,map00190,map01100,map04714,map04723,map05012 M00142 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03029 3.D.1.6 Nematoda 1KZ0N@119089,38F5W@33154,3BEVW@33208,3CTS4@33213,40G51@6231,415UN@6236,COG1007@1,KOG4668@2759 NA|NA|NA C Proton-conducting membrane transporter Z1_01520 529507.PMI2524 3.6e-109 401.0 Proteus hyfE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K12140 ko00000,ko01000 Bacteria 1NAT8@1224,1RRYF@1236,3Z1ZS@583,COG4237@1,COG4237@2 NA|NA|NA C NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L Z1_01521 529507.PMI2523 1.7e-282 978.0 Proteus hyfF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0033554,GO:0044425,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071944 ko:K12141 ko00000,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_2625,iZ_1308.Z3746 Bacteria 1MVBA@1224,1RPB3@1236,3Z1QR@583,COG0651@1,COG0651@2 NA|NA|NA CP NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus Z1_01522 529507.PMI2522 0.0 1169.8 Proteus hyfG ko:K12142,ko:K15830 ko00000,ko01000 iEcE24377_1341.EcE24377A_2769 Bacteria 1QUBF@1224,1RSJ4@1236,3Z20T@583,COG3261@1,COG3261@2,COG3262@1,COG3262@2 NA|NA|NA C Nickel-dependent hydrogenase Z1_01523 529507.PMI2521 2.9e-91 341.3 Proteus hyfH ko:K12143,ko:K15831 ko00000 Bacteria 1R9YT@1224,1RQB1@1236,3Z16S@583,COG1143@1,COG1143@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_01524 34506.g4722 2.5e-149 534.6 Bilateria Metazoa 3AGXZ@33154,3BYMF@33208,3DFS0@33213,COG0377@1,KOG1687@2759 NA|NA|NA C NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit Z1_01525 529507.PMI2519 1.5e-73 282.0 Proteus hyfJ ko:K12145,ko:K15834 ko00000,ko01000 iECSP_1301.ECSP_3429 Bacteria 1RHQ7@1224,1S6TA@1236,2DBX5@1,2ZBMB@2,3Z2JJ@583 NA|NA|NA C Formate hydrogenlyase maturation protein HycH Z1_01526 529507.PMI2518 2.9e-90 337.8 Proteus hycI GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0010467,GO:0016485,GO:0016787,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0051604,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.23.51 ko:K00442,ko:K03605,ko:K08315 ko00680,ko01100,ko01120,map00680,map01100,map01120 R03025 RC02628 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1R3V7@1224,1S0IE@1236,3Z2EK@583,COG0680@1,COG0680@2 NA|NA|NA C Hydrogenase maturation protease Z1_01527 529507.PMI2517 4.7e-193 680.2 Proteus yibD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008194,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0015020,GO:0016020,GO:0016036,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0042594,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496 ko:K19354 ko00000,ko01000,ko01003,ko01005 GT2 Bacteria 1N72Z@1224,1RRQJ@1236,3Z1AV@583,COG1216@1,COG1216@2 NA|NA|NA S Glycosyltransferase like family 2 Z1_01528 529507.PMI2516 0.0 1081.6 Proteus appA_2 ko:K02035 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1QPZA@1224,1RNFW@1236,3Z252@583,COG0747@1,COG0747@2 NA|NA|NA E Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_01529 529507.PMI2515 4e-181 640.6 Proteus dppB ko:K02033 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1NCNE@1224,1RS3T@1236,3Z1CM@583,COG0601@1,COG0601@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01530 529507.PMI2514 1.1e-150 539.3 Proteus dppC ko:K02031,ko:K02034,ko:K12370,ko:K15582,ko:K15586 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1MUW2@1224,1RRZP@1236,3Z1AA@583,COG1173@1,COG1173@2 NA|NA|NA P ABC transporter (permease) Z1_01531 529507.PMI2513 2.5e-152 544.7 Proteus oppD ko:K02031,ko:K02032,ko:K15583 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00439 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1QBR5@1224,1RSXI@1236,3Z1H1@583,COG1123@1,COG1123@2 NA|NA|NA P ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_01532 529507.PMI2512 1.5e-112 412.1 Proteus dppF 3.6.3.30 ko:K02032,ko:K10826 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1RHR2@1224,1S2PZ@1236,3Z275@583,COG1124@1,COG1124@2 NA|NA|NA EP ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_01533 529507.PMI2511 0.0 1663.7 Proteus CP_1076 3.2.1.21 ko:K05349,ko:K21449 ko00460,ko00500,ko00940,ko01100,ko01110,map00460,map00500,map00940,map01100,map01110 R00026,R02558,R02887,R02985,R03527,R04949,R04998,R10035,R10039,R10040 RC00049,RC00059,RC00171,RC00262,RC00397,RC00451,RC00714,RC00746,RC01248 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 1.B.40.2 GH3 Bacteria 1R9G5@1224,1SAJ6@1236,3Z0XJ@583,COG3064@1,COG3064@2,COG3468@1,COG3468@2,COG5563@1,COG5563@2 NA|NA|NA MU Autotransporter beta-domain Z1_01534 529507.PMI2510 8.6e-151 539.7 Proteus yjjW 1.97.1.4 ko:K04069 R04710 ko00000,ko01000 Bacteria 1QIC8@1224,1RRCB@1236,3Z2KP@583,COG1180@1,COG1180@2 NA|NA|NA O radical SAM domain protein Z1_01535 529507.PMI2509 5.7e-299 1032.7 Proteus yjjI GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0044237,GO:0045333,GO:0055114 Bacteria 1N1EN@1224,1RP1S@1236,3Z24C@583,COG1328@1,COG1328@2 NA|NA|NA F Protein of unknown function (DUF3029) Z1_01536 529507.PMI2508 1.4e-119 435.6 Proteus smp 2.4.1.15,2.4.1.347,2.7.13.3,6.3.1.20 ko:K00697,ko:K03800,ko:K07186,ko:K20973 ko00500,ko00785,ko01100,ko02020,ko02025,map00500,map00785,map01100,map02020,map02025 M00820 R02737,R07770,R07771,R11143 RC00005,RC00043,RC00049,RC00070,RC00090,RC00992,RC02748,RC02896 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko01003,ko02022 GT20 Bacteria 1MUT6@1224,1RNHZ@1236,3Z24Q@583,COG3726@1,COG3726@2 NA|NA|NA S Bacterial virulence factor haemolysin Z1_01537 529507.PMI2507 9e-181 639.4 Proteus serB GO:0000287,GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004647,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006544,GO:0006545,GO:0006563,GO:0006564,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0017144,GO:0019752,GO:0042133,GO:0042136,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046872,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 3.1.3.3 ko:K01079 ko00260,ko00680,ko01100,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00680,map01100,map01120,map01130,map01200,map01230 M00020 R00582 RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01009 iE2348C_1286.E2348C_4686,iEC042_1314.EC042_4885,iECO26_1355.ECO26_5594,iECSF_1327.ECSF_4321,iECUMN_1333.ECUMN_5012,iETEC_1333.ETEC_4743,iPC815.YPO0442,iUMNK88_1353.UMNK88_5307 Bacteria 1MWA3@1224,1RNJE@1236,3Z14D@583,COG0560@1,COG0560@2 NA|NA|NA E phosphoserine phosphatase Z1_01538 529507.PMI2506 2e-258 897.9 Proteus radA GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363 ko:K04485 ko00000,ko03400 Bacteria 1MUJQ@1224,1RN2E@1236,3Z1SP@583,COG1066@1,COG1066@2 NA|NA|NA L DNA-dependent ATPase involved in processing of recombination intermediates, plays a role in repairing DNA breaks. Stimulates the branch migration of RecA-mediated strand transfer reactions, allowing the 3' invading strand to extend heteroduplex DNA faster. Binds ssDNA in the presence of ADP but not other nucleotides, has ATPase activity that is stimulated by ssDNA and various branched DNA structures, but inhibited by SSB. Does not have RecA's homology-searching function Z1_01539 529507.PMI2505 2.1e-243 847.8 Proteus nadR GO:0000166,GO:0000287,GO:0000309,GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009268,GO:0009435,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010446,GO:0016043,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019674,GO:0022607,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043565,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0051716,GO:0055086,GO:0065003,GO:0070566,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990837 2.7.1.22,2.7.7.1,2.7.7.3 ko:K00954,ko:K06211 ko00760,ko00770,ko01100,map00760,map00770,map01100 M00120 R00137,R02324,R03005,R03035 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03000 iECSE_1348.ECSE_4665,iYL1228.KPN_04845 Bacteria 1MUSI@1224,1RPHP@1236,3Z1V9@583,COG0669@1,COG0669@2,COG3172@1,COG3172@2 NA|NA|NA H AAA domain Z1_01540 529507.PMI2504 3.8e-207 727.2 Proteus bscC 3.4.21.105 ko:K02200,ko:K04018,ko:K19225,ko:K20543,ko:K21007 ko02025,map02025 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko02000 1.B.55.3 Bacteria 1R483@1224,1RZHR@1236,3Z1QP@583,COG1434@1,COG1434@2,COG4235@1,COG4235@2 NA|NA|NA O DUF218 domain Z1_01541 529507.PMI2503 3.9e-303 1046.6 Proteus fes ko:K07214 ko00000 Bacteria 1MXJN@1224,1RPMW@1236,3Z229@583,COG2382@1,COG2382@2 NA|NA|NA P esterase Z1_01542 529507.PMI2500 2.4e-267 927.5 Proteus phoA GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004035,GO:0004721,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016491,GO:0016695,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019538,GO:0030288,GO:0030313,GO:0030613,GO:0031975,GO:0033748,GO:0036211,GO:0042578,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055114,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.1.3.1,3.1.3.39 ko:K01077,ko:K04342 ko00521,ko00730,ko00790,ko01100,ko01130,ko02020,map00521,map00730,map00790,map01100,map01130,map02020 M00126 R02135,R02228,R04620 RC00017,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko00537,ko01000,ko04147 iECO111_1330.ECO111_0413,iECO26_1355.ECO26_0416 Bacteria 1MXI2@1224,1RNG8@1236,3Z1N8@583,COG1785@1,COG1785@2 NA|NA|NA P alkaline phosphatase precursor (APASE) K01077 Z1_01543 529507.PMI2499 1e-285 988.8 Proteus yjbB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005315,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006817,GO:0006820,GO:0008150,GO:0015291,GO:0015318,GO:0015698,GO:0016020,GO:0022804,GO:0022857,GO:0034220,GO:0035435,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661 ko:K03324 ko00000,ko02000 2.A.58.2 Bacteria 1MUDE@1224,1RNMM@1236,3Z1DY@583,COG1283@1,COG1283@2 NA|NA|NA P Na+/Pi-cotransporter Z1_01544 529507.PMI2498 6.6e-101 373.2 Proteus Bacteria 1QUE5@1224,1T1VN@1236,3Z1P4@583,COG1247@1,COG1247@2 NA|NA|NA M Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_01545 529507.PMI2497 9.5e-37 159.1 Proteus Bacteria 1QG6X@1224,1TDJU@1236,2AT1X@1,31IHW@2,3Z33G@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1435) Z1_01548 529507.PMI2496 1.3e-190 672.2 Proteus rsmC GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008990,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0052914,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.172 ko:K00564 R07234 RC00003 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MXE9@1224,1RQCH@1236,3Z1RQ@583,COG2813@1,COG2813@2 NA|NA|NA J Ribosomal RNA small subunit methyltransferase C Z1_01549 529507.PMI2495 1.1e-74 285.8 Proteus holD GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0050896 2.7.7.7 ko:K02344 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1RH2F@1224,1S634@1236,3Z33A@583,COG3050@1,COG3050@2 NA|NA|NA L DNA polymerase III is a complex, multichain enzyme responsible for most of the replicative synthesis in bacteria. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity. The exact function of the psi subunit is Z1_01550 529507.PMI2494 2.4e-80 304.7 Proteus rimI GO:0003674,GO:0003824,GO:0004596,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006474,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008999,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0017189,GO:0018193,GO:0018194,GO:0019538,GO:0031365,GO:0034212,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043543,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564 2.3.1.128,2.3.1.234 ko:K01409,ko:K03789,ko:K14742 R10648 RC00070,RC00416 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1RIE6@1224,1S9G0@1236,3Z2XM@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K of ribosomal protein S18 Z1_01551 529507.PMI2493 5.5e-172 610.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1PNER@1224,1RSE3@1236,COG2253@1,COG2253@2 NA|NA|NA S Nucleotidyl transferase AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_01552 529507.PMI2492 3e-93 347.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1RAHV@1224,1S2H6@1236,COG5340@1,COG5340@2 NA|NA|NA K Psort location Cytoplasmic, score Z1_01553 1208321.D104_12210 1.4e-29 134.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1P0DM@1224,1SRZH@1236,COG3311@1,COG3311@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_01554 754477.Q7C_560 3e-237 827.4 Thiotrichales Bacteria 1MU23@1224,1RNE0@1236,46144@72273,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_01555 529507.PMI2489 2.5e-40 171.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1NDXN@1224,1SE75@1236,2EEGS@1,338AJ@2 NA|NA|NA Z1_01556 1208321.D104_12195 1.8e-181 641.7 Oceanospirillales ko:K18481,ko:K18640 M00670 ko00000,ko00002,ko02000,ko04812 3.A.1.27.4,3.A.1.27.5 Bacteria 1P7BK@1224,1RRN2@1236,1XNSW@135619,COG0443@1,COG0443@2 NA|NA|NA O PRTRC system protein D Z1_01557 754477.Q7C_556 2.2e-78 298.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1R9NF@1224,1RS5G@1236,28NAH@1,2ZBE9@2 NA|NA|NA Z1_01558 1127673.GLIP_3236 7.1e-217 759.6 Alteromonadaceae umuC GO:0000731,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003824,GO:0003887,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006301,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009355,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019985,GO:0031224,GO:0031668,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042575,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0061695,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071897,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02346,ko:K03502 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUUH@1224,1RMT1@1236,46609@72275,COG0389@1,COG0389@2 NA|NA|NA L COG0389 Nucleotidyltransferase DNA polymerase involved in DNA repair Z1_01559 1127673.GLIP_3237 1.6e-108 398.7 Alteromonadaceae Bacteria 1MUIU@1224,1TABY@1236,46A9T@72275,COG4644@1,COG4644@2 NA|NA|NA L Tn3 transposase DDE domain Z1_01560 1051646.VITU9109_01087 0.0 1981.5 Vibrionales Bacteria 1MUIU@1224,1RPHA@1236,1XW2C@135623,COG4644@1,COG4644@2 NA|NA|NA L Tn3 transposase DDE domain Z1_01561 1123279.ATUS01000005_gene3192 4e-289 1000.0 unclassified Gammaproteobacteria Bacteria 1J81D@118884,1MUMJ@1224,1RSDY@1236,COG0399@1,COG0399@2 NA|NA|NA M Putative transposase Z1_01562 1263831.F543_22840 1.7e-134 485.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1MU0S@1224,1RYES@1236,COG3843@1,COG3843@2 NA|NA|NA U Type IV secretory pathway VirD2 Z1_01563 1263831.F543_22850 2.5e-212 744.6 Gammaproteobacteria ydhC ko:K07552,ko:K18552 br01600,ko00000,ko01504,ko02000 2.A.1.2,2.A.1.2.3 Bacteria 1QU36@1224,1T24P@1236,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA EGP TIGRFAM Drug resistance transporter Bcr CflA subfamily Z1_01564 1123279.ATUS01000005_gene3192 9e-74 283.1 unclassified Gammaproteobacteria Bacteria 1J81D@118884,1MUMJ@1224,1RSDY@1236,COG0399@1,COG0399@2 NA|NA|NA M Putative transposase Z1_01565 1035839.AFNK01000027_gene1328 1.2e-157 562.4 Pasteurellales strB 2.7.1.72 ko:K04343 M00766 R02225 RC00002,RC00078 br01600,ko00000,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MW4R@1224,1S2D2@1236,1Y9I1@135625,COG3570@1,COG3570@2 NA|NA|NA V Aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase Z1_01566 178901.AmDm5_1379 4.1e-155 553.9 Alphaproteobacteria ymdC 2.7.1.87,2.7.1.95 ko:K00897,ko:K10673,ko:K19299 M00766 br01600,ko00000,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MXWC@1224,2U6V8@28211,COG3231@1,COG3231@2 NA|NA|NA J Phosphotransferase enzyme family Z1_01567 1051646.VITU9109_06924 2.8e-143 514.6 Vibrionales folP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004156,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.15 ko:K00796,ko:K18824 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R03066,R03067 RC00121,RC00842 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 Bacteria 1MUIR@1224,1RM8G@1236,1XTE1@135623,COG0294@1,COG0294@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of para-aminobenzoate (pABA) with 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin diphosphate (DHPt-PP) to form 7,8-dihydropteroate (H2Pte), the immediate precursor of folate derivatives Z1_01568 1328313.DS2_19176 1.4e-25 122.1 Alteromonadaceae ko:K07483,ko:K07497 ko00000 Bacteria 1N1HQ@1224,1SBAR@1236,46DK1@72275,COG2963@1,COG2963@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01569 357804.Ping_3668 3.4e-93 348.2 Psychromonadaceae ko:K07497 ko00000 Bacteria 1MVXQ@1224,1RR4F@1236,2QIDP@267894,COG2801@1,COG2801@2 NA|NA|NA L PFAM Integrase, catalytic region Z1_01570 55601.VANGNB10_cI0119 6.4e-161 573.5 Vibrionales ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1QUFG@1224,1T1X3@1236,1XTE2@135623,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_01571 1127673.GLIP_2322 1.5e-77 295.4 Alteromonadaceae umuD ko:K03503 ko00000,ko01000,ko01002,ko03400 Bacteria 1MZFA@1224,1S5X5@1236,46B0E@72275,COG1974@1,COG1974@2 NA|NA|NA KT COG1974 SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidases) Z1_01572 1208321.D104_09920 1.7e-170 605.1 Oceanospirillales polC 2.7.7.7,3.6.4.12 ko:K02342,ko:K03657,ko:K03763 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03420,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03420,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1QUV6@1224,1RZ2H@1236,1XMX9@135619,COG2176@1,COG2176@2 NA|NA|NA L Exonuclease Z1_01573 754477.Q7C_552 9.4e-49 199.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RF7D@1224,1S5P7@1236,2A4U8@1,30TFS@2 NA|NA|NA Z1_01574 675813.VIB_000107 7.5e-156 556.6 Vibrionales 2.7.7.7 ko:K02342 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MX81@1224,1RMSD@1236,1XWF5@135623,COG2378@1,COG2378@2 NA|NA|NA K WYL domain Z1_01575 1123053.AUDG01000009_gene3814 2.6e-258 897.9 Chromatiales mod 2.1.1.72 ko:K07316 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1MX9M@1224,1RNHM@1236,1X08R@135613,COG2189@1,COG2189@2 NA|NA|NA L DNA methylase Z1_01576 232346.JHQL01000004_gene1673 0.0 1125.2 Oceanospirillales 3.1.21.5 ko:K01156 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1MX92@1224,1RYDV@1236,1XJVR@135619,COG1061@1,COG1061@2 NA|NA|NA L Type III restriction enzyme, res subunit Z1_01577 1123053.AUDG01000086_gene2061 0.0 2492.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NTG4@1224,1SJJY@1236,28IR4@1,2Z8QP@2 NA|NA|NA Z1_01578 1123053.AUDG01000086_gene2062 0.0 1469.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1NQQ2@1224,1SK3N@1236,28KJ3@1,2ZA48@2 NA|NA|NA Z1_01579 83406.HDN1F_11630 2.3e-178 631.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1Q97I@1224,1S0BW@1236,COG1637@1,COG1637@2 NA|NA|NA L nuclease of the RecB family Z1_01580 1208321.D104_09960 0.0 1313.9 Oceanospirillales ko:K03698,ko:K12070 ko00000,ko01000,ko02044,ko03019 3.A.7.11.1 Bacteria 1MUZY@1224,1RQUZ@1236,1XMWG@135619,COG3481@1,COG3481@2 NA|NA|NA S Putative helicase Z1_01581 754477.Q7C_543 0.0 1206.4 Thiotrichales traD ko:K12071 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1QUPX@1224,1T20D@1236,460C7@72273,COG0433@1,COG0433@2 NA|NA|NA S TraM recognition site of TraD and TraG Z1_01582 754477.Q7C_542 6.6e-104 383.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1R46E@1224,1S15F@1236,28M1U@1,2ZAGH@2 NA|NA|NA Z1_01583 754477.Q7C_541 4e-113 414.1 Gammaproteobacteria VP1577 ko:K12071 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1R98T@1224,1RYTG@1236,COG0433@1,COG0433@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4400) Z1_01584 391600.ABRU01000043_gene2625 6.8e-12 77.8 Alphaproteobacteria Bacteria 1RJRB@1224,2BG1R@1,2U9FJ@28211,329XY@2 NA|NA|NA Z1_01585 1232683.ADIMK_3995 4.5e-112 411.4 Alteromonadaceae Bacteria 1NEHF@1224,1RMJ3@1236,466Z2@72275,COG1396@1,COG1396@2,COG2856@1,COG2856@2 NA|NA|NA K IrrE N-terminal-like domain Z1_01586 1127673.GLIP_2342 1.3e-47 195.3 Gammaproteobacteria ko:K12068 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1RM71@1224,1S7CJ@1236,2B95I@1,322GJ@2 NA|NA|NA S TIGRFAM type IV conjugative transfer system protein TraL Z1_01587 529507.PMI2469 6.9e-110 403.3 Gammaproteobacteria traE ko:K12067 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1R6QY@1224,1S08I@1236,2A75G@1,30W1B@2 NA|NA|NA S type IV conjugative transfer system protein TraE Z1_01588 754477.Q7C_536 4.4e-158 563.9 Gammaproteobacteria ko:K12066 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1QEK5@1224,1S05N@1236,28HGW@1,2Z7SN@2 NA|NA|NA S PFAM TraK protein Z1_01589 529507.PMI2467 8.7e-200 703.0 Gammaproteobacteria traB ko:K12065,ko:K15051 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1QUPW@1224,1T20C@1236,COG2433@1,COG2433@2 NA|NA|NA S PFAM Bacterial conjugation TrbI-like protein Z1_01590 1127673.GLIP_2346 2.6e-103 381.3 Gammaproteobacteria traV ko:K12064 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1N10S@1224,1RR6T@1236,28M4U@1,2ZAIP@2 NA|NA|NA S PFAM Type IV conjugative transfer system Z1_01591 1127673.GLIP_2347 4e-60 237.3 Gammaproteobacteria ko:K12069 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1RB9K@1224,1S22N@1236,28PQH@1,2ZCCI@2 NA|NA|NA Z1_01592 1208321.D104_10490 6.3e-159 566.6 Oceanospirillales Bacteria 1MY3Y@1224,1S00U@1236,1XKQ8@135619,COG5340@1,COG5340@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator, AbiEi antitoxin N-terminal domain Z1_01593 1127673.GLIP_2349 6e-174 616.7 Gammaproteobacteria ko:K09144 ko00000 Bacteria 1MWST@1224,1RMAN@1236,COG2253@1,COG2253@2 NA|NA|NA S Nucleotidyl transferase AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_01594 1208321.D104_04230 1.3e-125 455.7 Oceanospirillales 5.3.4.1 ko:K03981,ko:K12228 ko00000,ko01000,ko02044,ko03110 3.A.7.10.1,3.A.7.11.1 Bacteria 1R9PI@1224,1S0AT@1236,1XPB7@135619,COG1651@1,COG1651@2 NA|NA|NA M Required for disulfide bond formation in some periplasmic proteins. Acts by transferring its disulfide bond to other proteins and is reduced in the process Z1_01595 529507.PMI2461 0.0 1593.6 Gammaproteobacteria traG ko:K12063 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MUEN@1224,1RMMX@1236,COG3451@1,COG3451@2 NA|NA|NA U type-IV secretion system protein TraC Z1_01596 1127673.GLIP_2354 2.5e-53 214.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1RG7N@1224,1S5DV@1236,29QYA@1,30BZ5@2 NA|NA|NA Z1_01597 1208321.D104_04215 1e-90 339.3 Gammaproteobacteria ko:K12062 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1R0SV@1224,1T4PF@1236,COG4959@1,COG4959@2 NA|NA|NA OU PFAM Peptidase S26 Z1_01598 1127673.GLIP_2356 3.9e-204 717.2 Gammaproteobacteria traW ko:K12061 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1R41Q@1224,1S1KA@1236,28KEF@1,2ZA0P@2 NA|NA|NA S PFAM Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein Z1_01599 529507.PMI2457 6.3e-201 706.4 Gammaproteobacteria traU ko:K12060 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MXUA@1224,1RS8F@1236,28HGF@1,2Z7SA@2 NA|NA|NA S PFAM TraU Z1_01600 1208321.D104_04200 0.0 2418.7 Oceanospirillales traN ko:K12058 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MW96@1224,1RYPT@1236,1XJGJ@135619,28KC1@1,2Z9Z1@2 NA|NA|NA S Type-1V conjugative transfer system mating pair stabilisation Z1_01601 1116375.VEJY3_11800 2.5e-256 891.0 Proteobacteria Bacteria 1R3B2@1224,2Z924@2,arCOG14100@1 NA|NA|NA S SIR2-like domain Z1_01602 1116375.VEJY3_11805 0.0 1303.5 Vibrionales ko:K06915 ko00000 Bacteria 1MUSH@1224,1RXZ7@1236,1XVA9@135623,COG0433@1,COG0433@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function DUF87 Z1_01603 529507.PMI2452 6.5e-112 410.2 Proteus 3.1.21.1 ko:K01150 ko00000,ko01000 Bacteria 1MXQM@1224,1RPX9@1236,3Z1UP@583,COG2356@1,COG2356@2 NA|NA|NA L Endonuclease I Z1_01604 1196835.A458_06580 7.7e-101 373.6 Gammaproteobacteria tnpA1 Bacteria 1N2KA@1224,1RMXC@1236,COG3464@1,COG3464@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01605 1005395.CSV86_21508 3.5e-91 340.9 Pseudomonas putida group lspA 3.4.23.36 ko:K03101 ko03060,map03060 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1RGV9@1224,1RY7Q@1236,1YWWT@136845,COG0597@1,COG0597@2 NA|NA|NA MU This protein specifically catalyzes the removal of signal peptides from prolipoproteins Z1_01606 653733.Selin_0007 1.1e-156 559.3 Bacteria Bacteria COG1230@1,COG1230@2 NA|NA|NA P cation diffusion facilitator family transporter Z1_01607 1122212.AULO01000011_gene442 8.3e-72 276.2 Oceanospirillales cadR Bacteria 1MZ3P@1224,1S8VE@1236,1XJ9D@135619,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_01608 573.JG24_02650 4.5e-45 186.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1QRWK@1224,1SU8F@1236,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L viral genome integration into host DNA Z1_01609 573.JG24_02625 1.7e-213 748.4 Gammaproteobacteria tetA ko:K08151,ko:K08153 M00668,M00717 ko00000,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.1.2.38,2.A.1.2.39,2.A.1.2.4,2.A.1.2.41,2.A.1.2.68,2.A.1.2.75,2.A.1.2.8 Bacteria 1MVSH@1224,1RYB9@1236,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator Superfamily Z1_01610 573.JG24_02630 2.8e-117 427.9 Gammaproteobacteria tetR ko:K18476 M00668 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1REPQ@1224,1S426@1236,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Tetracycline repressor protein TetR Z1_01611 1166130.H650_00265 2.6e-137 494.6 Enterobacter ko:K18320 ko00000 Bacteria 1MWZ2@1224,1RRC2@1236,3X3BR@547,COG3316@1,COG3316@2 NA|NA|NA L Transposase IS66 family Z1_01612 1134474.O59_002520 7.8e-153 546.6 Cellvibrio ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1FI9T@10,1MVAN@1224,1RMSS@1236,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Phage integrase, N-terminal SAM-like domain Z1_01613 573.JG24_01715 4.1e-59 234.6 Gammaproteobacteria folA 1.1.1.262,1.5.1.3 ko:K00097,ko:K00287,ko:K18589,ko:K18590 ko00670,ko00750,ko00790,ko01100,ko01523,map00670,map00750,map00790,map01100,map01523 M00124,M00126,M00840 R00936,R00937,R00939,R00940,R02235,R02236,R05681,R05837,R07406,R11765 RC00089,RC00109,RC00110,RC00158,RC00675,RC01475 br01600,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504 iJN746.PP_5132 Bacteria 1RH0P@1224,1S3TW@1236,COG0262@1,COG0262@2 NA|NA|NA H Dihydrofolate reductase Z1_01614 1246995.AFR_22075 2.8e-70 272.7 Bacteria ko:K06880 ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria COG2312@1,COG2312@2 NA|NA|NA S response to antibiotic Z1_01615 795666.MW7_1134 2.2e-142 511.5 Burkholderiaceae aadA4 2.7.7.47 ko:K00984 ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1K7D6@119060,1QVMI@1224,2VPQJ@28216,COG1708@1,COG1708@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4111) Z1_01616 1121360.AUAQ01000016_gene1143 1.4e-250 871.7 Bacteria tnpA1 Bacteria COG3464@1,COG3464@2 NA|NA|NA Z1_01617 1177154.Y5S_00388 1.2e-91 342.4 Oceanospirillales lspA 3.4.23.36 ko:K03101 ko03060,map03060 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1RGV9@1224,1RY7Q@1236,1XJMC@135619,COG0597@1,COG0597@2 NA|NA|NA MU This protein specifically catalyzes the removal of signal peptides from prolipoproteins Z1_01618 653733.Selin_0007 3.1e-156 557.8 Bacteria Bacteria COG1230@1,COG1230@2 NA|NA|NA P cation diffusion facilitator family transporter Z1_01619 1122212.AULO01000011_gene442 6.3e-72 276.6 Oceanospirillales cadR Bacteria 1MZ3P@1224,1S8VE@1236,1XJ9D@135619,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_01620 529507.PMI2451 4.8e-100 370.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1R9U7@1224,1RZCM@1236,2C7BN@1,2ZB8G@2 NA|NA|NA Z1_01621 1208321.D104_04180 1.1e-50 205.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1RFJ7@1224,1S4UY@1236,2965H@1,2ZTFQ@2 NA|NA|NA Z1_01622 529507.PMI2449 1.8e-74 285.0 Gammaproteobacteria ssb ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RAX7@1224,1S36S@1236,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L DNA-binding protein Z1_01623 1208321.D104_04170 2.9e-156 557.8 Oceanospirillales Bacteria 1NA66@1224,1S212@1236,1XP13@135619,28IQ7@1,2Z8PY@2 NA|NA|NA S RecT family Z1_01624 529507.PMI2447 2.6e-12 77.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1NFAY@1224,1SF4Z@1236,2ECXT@1,336UY@2 NA|NA|NA Z1_01625 1208321.D104_04160 1.9e-194 684.9 Oceanospirillales 3.1.12.1 ko:K07464 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1QXFN@1224,1RR25@1236,1XNVH@135619,COG5377@1,COG5377@2 NA|NA|NA L YqaJ-like viral recombinase domain Z1_01626 1208321.D104_04155 7.5e-180 636.3 Oceanospirillales cobS 6.6.1.2 ko:K09882 ko00860,ko01100,map00860,map01100 R05227 RC02000 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MXIW@1224,1RN7C@1236,1XIXW@135619,COG0714@1,COG0714@2 NA|NA|NA S AAA domain (dynein-related subfamily) Z1_01627 529507.PMI2444 1.1e-141 509.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1R4PZ@1224,1S1QM@1236,2EIAT@1,2Z8F3@2 NA|NA|NA Z1_01628 754477.Q7C_512 7.9e-182 642.9 Gammaproteobacteria 5.3.1.8,5.3.1.9 ko:K15916 ko00010,ko00030,ko00051,ko00500,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00030,map00051,map00500,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00001,M00004,M00114 R01819,R02739,R02740,R03321 RC00376,RC00563 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R6H8@1224,1RYJ6@1236,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Protein of unknown function (DUF3150) Z1_01629 1208321.D104_04140 3.2e-77 294.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1R55S@1224,1RP9T@1236,28IKU@1,2Z8MF@2 NA|NA|NA Z1_01630 1208321.D104_04135 9.2e-287 992.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1QXFP@1224,1T3AQ@1236,COG2304@1,COG2304@2 NA|NA|NA S von willebrand factor, type A Z1_01631 1208321.D104_04130 2.5e-86 324.7 Oceanospirillales radC ko:K03630 ko00000 Bacteria 1MXZ5@1224,1RPZ8@1236,1XP7B@135619,COG2003@1,COG2003@2 NA|NA|NA E RadC-like JAB domain Z1_01632 1208321.D104_04125 1e-59 235.7 Oceanospirillales Bacteria 1RFEB@1224,1S3SR@1236,1XQBV@135619,29U8W@1,30FIX@2 NA|NA|NA Z1_01633 1208321.D104_04120 3.4e-213 747.3 Oceanospirillales Bacteria 1MW9E@1224,1RXXG@1236,1XK9H@135619,COG4643@1,COG4643@2 NA|NA|NA S Zinc-binding domain of primase-helicase Z1_01634 1208321.D104_04110 5.7e-129 466.8 Oceanospirillales Bacteria 1R8JI@1224,1S1I2@1236,1XQ27@135619,28MXA@1,2ZB4D@2 NA|NA|NA Z1_01635 1208321.D104_04105 1.3e-179 635.6 Oceanospirillales traF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004791,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0016671,GO:0019725,GO:0033554,GO:0034599,GO:0042221,GO:0042592,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045454,GO:0047134,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1990748 ko:K03671,ko:K12057 ko04621,ko05418,map04621,map05418 ko00000,ko00001,ko02044,ko03110 3.A.7.11.1 Bacteria 1MXG2@1224,1S08D@1236,1XP4H@135619,COG0526@1,COG0526@2 NA|NA|NA CO F plasmid transfer operon protein Z1_01636 1208321.D104_04100 9e-251 872.5 Oceanospirillales ko:K12072 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MWD0@1224,1RSK4@1236,1XJUS@135619,28MTB@1,2ZB1J@2 NA|NA|NA S Conjugative relaxosome accessory transposon protein Z1_01637 2340.JV46_07670 0.0 2246.9 Gammaproteobacteria ko:K12056 ko00000,ko02044 3.A.7.11.1 Bacteria 1MXCR@1224,1RPZR@1236,COG4678@1,COG4678@2 NA|NA|NA G PFAM TraG-like protein, N-terminal region Z1_01638 529507.PMI2430 2.3e-72 278.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RABV@1224,1S293@1236,28PC8@1,2ZC4P@2 NA|NA|NA Z1_01639 1127673.GLIP_0776 9.1e-95 352.8 Gammaproteobacteria ko:K02402 ko02020,ko02024,ko02026,ko02040,map02020,map02024,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1R5IB@1224,1RZAZ@1236,2CFTS@1,2ZBG4@2 NA|NA|NA N Flagellar transcriptional activator (FlhC) Z1_01640 1208321.D104_04080 1e-47 195.7 Gammaproteobacteria ko:K02403 ko02020,ko02024,ko02026,ko02040,map02020,map02024,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1REX5@1224,1S47P@1236,29YDW@1,30K8E@2 NA|NA|NA K Flagellar transcriptional activator (FlhD) Z1_01641 1127673.GLIP_0778 1e-96 359.4 Alteromonadaceae Bacteria 1RDXX@1224,1SDJ6@1236,46BTE@72275,COG0741@1,COG0741@2 NA|NA|NA M lytic transglycosylase Z1_01642 1127673.GLIP_0779 1.5e-123 448.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1R8Z1@1224,1S0YB@1236,28NX5@1,2ZBUW@2 NA|NA|NA Z1_01643 1127673.GLIP_0780 1.2e-163 582.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1R8UW@1224,1S15M@1236,2DJ9J@1,30546@2 NA|NA|NA Z1_01644 1127673.GLIP_0781 1.5e-39 168.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1MYCK@1224,1S63A@1236,COG4197@1,COG4197@2 NA|NA|NA S Putative antitoxin of bacterial toxin-antitoxin system, YdaS/YdaT Z1_01645 1208321.D104_04055 1.3e-119 435.6 Oceanospirillales Bacteria 1RHIM@1224,1SYH0@1236,1XKUA@135619,COG1974@1,COG1974@2 NA|NA|NA KT Peptidase S24-like Z1_01646 529507.PMI2422 3.3e-310 1070.1 Proteus prfC GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003747,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008079,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016150,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019003,GO:0019538,GO:0022411,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0032984,GO:0034641,GO:0034645,GO:0036094,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02837 ko00000,ko03012 Bacteria 1MU7X@1224,1RMFT@1236,3Z1YM@583,COG4108@1,COG4108@2 NA|NA|NA J Increases the formation of ribosomal termination complexes and stimulates activities of RF-1 and RF-2. It binds guanine nucleotides and has strong preference for UGA stop codons. It may interact directly with the ribosome. The stimulation of RF- 1 and RF-2 is significantly reduced by GTP and GDP, but not by GMP Z1_01647 529507.PMI2421 1.1e-51 209.1 Proteus osmY GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009987,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464,GO:0050896,GO:0061077 ko:K04065 ko00000 Bacteria 1QG7F@1224,1TDKF@1236,3Z33Y@583,COG2823@1,COG2823@2 NA|NA|NA S BON domain Z1_01648 529507.PMI2420 6.3e-204 716.5 Proteus yjjU GO:0003674,GO:0003824,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016787,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1PV7M@1224,1RRPR@1236,3Z1QY@583,COG4667@1,COG4667@2 NA|NA|NA S esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily Z1_01649 529507.PMI2419 1.4e-147 528.9 Proteus yjjV ko:K03424 ko00000,ko01000 Bacteria 1MW5C@1224,1RP5T@1236,3Z2SX@583,COG0084@1,COG0084@2 NA|NA|NA L TatD related DNase Z1_01650 529507.PMI2418 8.5e-227 792.7 Proteus nupX ko:K03317 ko00000 2.A.41 Bacteria 1MXXX@1224,1RMBX@1236,3Z2A7@583,COG1972@1,COG1972@2 NA|NA|NA P Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus Z1_01651 529507.PMI2416 3e-139 501.1 Proteus deoC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004139,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009166,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016052,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016832,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576 4.1.2.4 ko:K01619 ko00030,map00030 R01066 RC00436,RC00437 ko00000,ko00001,ko01000 iEcSMS35_1347.EcSMS35_4930,iPC815.YPO0436 Bacteria 1N8AG@1224,1RPTS@1236,3Z24U@583,COG0274@1,COG0274@2 NA|NA|NA F Catalyzes a reversible aldol reaction between acetaldehyde and D-glyceraldehyde 3-phosphate to generate 2-deoxy- D-ribose 5-phosphate Z1_01652 529507.PMI2415 4.8e-246 856.7 Proteus deoA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004645,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009032,GO:0009116,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0016763,GO:0033554,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901657 2.4.2.2,2.4.2.4 ko:K00756,ko:K00758 ko00240,ko00983,ko01100,ko05219,map00240,map00983,map01100,map05219 R01570,R01876,R02296,R02484,R08222,R08230 RC00063 ko00000,ko00001,ko01000 iB21_1397.B21_04224,iEC042_1314.EC042_4879,iECBD_1354.ECBD_3638,iECB_1328.ECB_04258,iECD_1391.ECD_04258,iECH74115_1262.ECH74115_5897,iECIAI1_1343.ECIAI1_4605,iECIAI39_1322.ECIAI39_4914,iECSE_1348.ECSE_4657,iECSP_1301.ECSP_5465,iECUMN_1333.ECUMN_5006,iECW_1372.ECW_m4744,iEKO11_1354.EKO11_3932,iETEC_1333.ETEC_4738,iEcE24377_1341.EcE24377A_4981,iEcSMS35_1347.EcSMS35_4931,iEcolC_1368.EcolC_3674,iG2583_1286.G2583_5242,iSSON_1240.SSON_4533,iSbBS512_1146.SbBS512_E4929,iUMNK88_1353.UMNK88_5301,iWFL_1372.ECW_m4744,iYL1228.KPN_04838,iZ_1308.Z5984,ic_1306.c5466 Bacteria 1MV3H@1224,1RPTG@1236,3Z1IK@583,COG0213@1,COG0213@2 NA|NA|NA F The enzymes which catalyze the reversible phosphorolysis of pyrimidine nucleosides are involved in the degradation of these compounds and in their utilization as carbon and energy sources, or in the rescue of pyrimidine bases for nucleotide synthesis Z1_01653 529507.PMI2414 3.9e-242 843.6 Proteus deoB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008973,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009166,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576 5.4.2.7 ko:K01839 ko00030,ko00230,map00030,map00230 R01057,R02749 RC00408 ko00000,ko00001,ko01000 iLF82_1304.LF82_0465,iNRG857_1313.NRG857_22165 Bacteria 1MVN8@1224,1RQ6W@1236,3Z0WF@583,COG1015@1,COG1015@2 NA|NA|NA F Phosphotransfer between the C1 and C5 carbon atoms of pentose Z1_01654 529507.PMI2413 2e-129 468.4 Proteus deoD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004731,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360 2.4.2.1,2.4.2.28 ko:K00772,ko:K03784 ko00230,ko00240,ko00270,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00270,map00760,map01100,map01110 M00034 R01402,R01561,R01863,R01969,R02147,R02294,R02295,R02297,R02484,R02557,R02748,R08368,R10244 RC00033,RC00063,RC00122,RC02819 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO0440 Bacteria 1MUW6@1224,1RMMA@1236,3Z1M8@583,COG0813@1,COG0813@2 NA|NA|NA F Phosphorylase superfamily Z1_01655 529507.PMI2412 2.2e-23 114.4 Proteus citN ko:K03300 ko00000 2.A.11 Bacteria 1N25B@1224,1RR4W@1236,3Z3DX@583,COG2851@1,COG2851@2 NA|NA|NA C Citrate transporter Z1_01656 529507.PMI2412 5.3e-198 696.8 Proteus citN ko:K03300 ko00000 2.A.11 Bacteria 1N25B@1224,1RR4W@1236,3Z3DX@583,COG2851@1,COG2851@2 NA|NA|NA C Citrate transporter Z1_01657 529507.PMI2411 0.0 1190.6 Proteus Bacteria 1Q8I8@1224,1RRHR@1236,3Z12S@583,COG0076@1,COG0076@2 NA|NA|NA H Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain Z1_01659 529507.PMI2410 2.4e-43 181.0 Proteus ybiI ko:K06204 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko03000,ko03009,ko03021 Bacteria 1MZIB@1224,1S8SP@1236,3Z31V@583,COG1734@1,COG1734@2 NA|NA|NA T Prokaryotic dksA/traR C4-type zinc finger Z1_01660 529507.PMI2409 1.2e-266 925.2 Proteus pyk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004743,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0040007,GO:0042866,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 2.7.1.40 ko:K00873 ko00010,ko00230,ko00620,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04922,ko04930,ko05165,ko05203,ko05230,map00010,map00230,map00620,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04922,map04930,map05165,map05203,map05230 M00001,M00002,M00049,M00050 R00200,R00430,R01138,R01858,R02320 RC00002,RC00015 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 Bacteria 1MU21@1224,1RYKM@1236,3Z22V@583,COG0469@1,COG0469@2 NA|NA|NA G Belongs to the pyruvate kinase family Z1_01661 34506.g1738 5.6e-250 869.8 Bilateria Metazoa 39HZP@33154,3C2WV@33208,3DIYH@33213,COG0477@1,KOG2533@2759 NA|NA|NA EGP transmembrane transport Z1_01662 529507.PMI2407 8.1e-238 829.3 Proteus pgtC ko:K02012,ko:K08478 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00190 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.10 Bacteria 1MWWI@1224,1RRWU@1236,3Z1V0@583,COG1840@1,COG1840@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_01663 529507.PMI2406 0.0 1476.5 Proteus pgtB 2.7.13.3 ko:K02482,ko:K03406,ko:K07653,ko:K08475,ko:K10125 ko02020,ko02030,map02020,map02030 M00460,M00503,M00504 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022,ko02035 Bacteria 1RCM9@1224,1RQIN@1236,3Z0W1@583,COG4191@1,COG4191@2,COG4192@1,COG4192@2 NA|NA|NA T Signal transduction histidine kinase Z1_01664 34506.g901 5.8e-37 159.8 Bilateria Metazoa 2D36K@1,2SQE2@2759,39EXM@33154,3CIUI@33208,3DHCH@33213 NA|NA|NA T Bacterial regulatory protein, Fis family Z1_01665 34506.g901 4.1e-161 573.9 Bilateria Metazoa 2D36K@1,2SQE2@2759,39EXM@33154,3CIUI@33208,3DHCH@33213 NA|NA|NA T Bacterial regulatory protein, Fis family Z1_01666 529507.PMI2404 1.1e-262 912.1 Proteus dhaM GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006476,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016787,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019213,GO:0019538,GO:0033554,GO:0033558,GO:0034983,GO:0035601,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0047324,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0098732,GO:0140096,GO:1901564 2.7.1.121,2.7.1.202,2.7.3.9 ko:K02768,ko:K02784,ko:K05881,ko:K08483,ko:K08485,ko:K11183,ko:K11189 ko00051,ko00561,ko01100,ko01120,ko02060,map00051,map00561,map01100,map01120,map02060 M00273 R01012,R03232 RC00015,RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.2.1,8.A.7,8.A.8.1.1 iECs_1301.ECs1703,iSF_1195.SF1201,iS_1188.S1285,iUTI89_1310.UTI89_C1391,iZ_1308.Z1969 Bacteria 1MUT8@1224,1RRCZ@1236,3Z1KF@583,COG1080@1,COG1080@2,COG1925@1,COG1925@2,COG3412@1,COG3412@2 NA|NA|NA G PTS system fructose IIA component Z1_01667 34506.g899 5.5e-115 420.2 Rhabditida Nematoda 1M25K@119089,39I44@33154,3CMXD@33208,3E3JK@33213,40IV9@6231,416UM@6236,COG2376@1,KOG2426@2759 NA|NA|NA G Dak2 Z1_01668 529507.PMI2402 1.1e-203 715.7 Proteus dhaK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006066,GO:0006071,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019400,GO:0019637,GO:0019751,GO:0033554,GO:0034308,GO:0042180,GO:0042182,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0047324,GO:0050896,GO:0051716,GO:0061610,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901575,GO:1901615 2.7.1.121,2.7.1.28,2.7.1.29,4.6.1.15 ko:K00863,ko:K05878 ko00051,ko00561,ko00680,ko01100,ko01120,ko01200,ko04622,map00051,map00561,map00680,map01100,map01120,map01200,map04622 M00344 R01011,R01012,R01059 RC00002,RC00015,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEcHS_1320.EcHS_A1304,iUMNK88_1353.UMNK88_1515,iYL1228.KPN_03495 Bacteria 1MVSR@1224,1RNRQ@1236,3Z2IG@583,COG2376@1,COG2376@2 NA|NA|NA G dihydroxyacetone kinase Z1_01669 529507.PMI2401 1.3e-41 175.3 Proteus Bacteria 1N52V@1224,1S9ZP@1236,2BGNY@1,32AMN@2,3Z323@583 NA|NA|NA S Ogr/Delta-like zinc finger Z1_01670 529507.PMI2400 2e-43 181.4 Proteus Bacteria 1N2ZU@1224,1SAR3@1236,2CH69@1,32UHU@2,3Z34Z@583 NA|NA|NA S Phage holin family 2 Z1_01671 529507.PMI2399 1.9e-217 761.5 Proteus tetA ko:K08151,ko:K08153 M00668,M00717 ko00000,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.1.2.38,2.A.1.2.39,2.A.1.2.4,2.A.1.2.41,2.A.1.2.68,2.A.1.2.75,2.A.1.2.8 Bacteria 1MVSH@1224,1RYB9@1236,3Z1ID@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Sugar (and other) transporter Z1_01672 529507.PMI2398 1.4e-110 405.6 Proteus tetR ko:K18476 M00668 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1REPQ@1224,1S426@1236,3Z3CK@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Tetracyclin repressor, C-terminal all-alpha domain Z1_01673 529507.PMI2397 2.6e-177 627.9 Proteus nadK 2.7.1.23 ko:K00858 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R00104 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1NBI3@1224,1RZ58@1236,3Z1RR@583,COG0061@1,COG0061@2 NA|NA|NA G Involved in the regulation of the intracellular balance of NAD and NADP, and is a key enzyme in the biosynthesis of NADP. Catalyzes specifically the phosphorylation on 2'-hydroxyl of the adenosine moiety of NAD to yield NADP Z1_01674 529507.PMI2396 1.3e-158 565.8 Proteus Bacteria 1PEW9@1224,1RR2U@1236,3Z1M9@583,COG0330@1,COG0330@2 NA|NA|NA O SPFH Band 7 PHB domain protein Z1_01675 529507.PMI2395 2.6e-133 481.5 Proteus 3.6.1.55 ko:K03574 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1QTT4@1224,1RQ35@1236,3Z0WI@583,COG1051@1,COG1051@2 NA|NA|NA F NUDIX domain Z1_01676 529507.PMI2394 8.6e-69 266.2 Proteus ko:K03832 ko00000,ko02000 2.C.1.1 Bacteria 1PDSK@1224,1TE1W@1236,3Z3IQ@583,COG0810@1,COG0810@2 NA|NA|NA M Gram-negative bacterial TonB protein C-terminal Z1_01677 529507.PMI2393 2.5e-72 278.1 Proteus terW Bacteria 1RHCH@1224,1S77D@1236,2AVMP@1,31MEH@2,3Z2JZ@583 NA|NA|NA Z1_01678 529507.PMI2392 6.6e-181 639.8 Proteus 4.1.3.34 ko:K01644 ko02020,map02020 R00362 RC00067,RC01118 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1PX34@1224,1RR7R@1236,3Z10A@583,COG2301@1,COG2301@2 NA|NA|NA C C-C_Bond_Lyase of the TIM-Barrel fold Z1_01679 529507.PMI2391 4.1e-203 713.8 Proteus stiP GO:0000902,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008234,GO:0009653,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016485,GO:0016540,GO:0016787,GO:0019538,GO:0032502,GO:0032989,GO:0043170,GO:0044238,GO:0048856,GO:0048869,GO:0051604,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071840,GO:0140096,GO:1901564 ko:K07590 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1NNDE@1224,1RMBP@1236,3Z156@583,COG1358@1,COG1358@2 NA|NA|NA J PELOTA RNA binding domain Z1_01680 529507.PMI2390 1.5e-146 525.4 Proteus 3.1.3.12 ko:K01087 ko00500,ko01100,map00500,map01100 R02778 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N9QG@1224,1RMVG@1236,3Z22Q@583,COG0561@1,COG0561@2 NA|NA|NA S phosphatase activity Z1_01681 529507.PMI2389 1.4e-217 761.9 Proteus apt 2.4.2.10,2.4.2.7 ko:K00759,ko:K00762 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00051 R00190,R01229,R01870,R04378 RC00063,RC00611 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 Bacteria 1MWNI@1224,1RN87@1236,3Z1QV@583,COG0503@1,COG0503@2 NA|NA|NA F TRSP domain C terminus to PRTase_2 Z1_01682 529507.PMI2388 1.3e-107 395.6 Proteus terZ ko:K05791 ko00000 Bacteria 1R8MN@1224,1S0KB@1236,3Z1VF@583,COG2310@1,COG2310@2 NA|NA|NA T TerD domain Z1_01683 529507.PMI2387 6.8e-212 743.0 Proteus terA 5.1.1.3 ko:K01776,ko:K05792 ko00471,ko01100,map00471,map01100 R00260 RC00302 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 Bacteria 1PD8T@1224,1RPW3@1236,3Z28K@583,COG2310@1,COG2310@2,COG4110@1,COG4110@2 NA|NA|NA T TerD domain Z1_01684 529507.PMI2386 3.6e-76 290.8 Proteus terB ko:K05793,ko:K05795 ko00000 Bacteria 1RD4Q@1224,1S635@1236,3Z2UM@583,COG3793@1,COG3793@2 NA|NA|NA P Tellurite resistance protein TerB Z1_01685 529507.PMI2385 4.5e-183 647.1 Proteus terC ko:K05794 ko00000 Bacteria 1MUNR@1224,1RP9Y@1236,3Z0UT@583,COG0861@1,COG0861@2 NA|NA|NA P Integral membrane protein TerC family Z1_01686 529507.PMI2384 3.8e-102 377.5 Proteus terD ko:K05795 ko00000 Bacteria 1N1IX@1224,1RN9E@1236,3Z21B@583,COG2310@1,COG2310@2 NA|NA|NA T TerD domain Z1_01687 34506.g1478 2.2e-102 378.3 Bilateria Metazoa 2EC6P@1,2SI44@2759,3AGYN@33154,3BZ26@33208,3DDNC@33213 NA|NA|NA S TerD domain Z1_01688 529507.PMI2382 8.9e-127 459.5 Proteus cicA 2.3.1.51,3.1.3.27,3.1.3.3 ko:K00655,ko:K01079,ko:K18697 ko00260,ko00561,ko00564,ko00680,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00561,map00564,map00680,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00020,M00089 R00582,R02029,R02241,R09381 RC00004,RC00017,RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko01009 Bacteria 1MXGP@1224,1RQNV@1236,3Z2P7@583,COG0560@1,COG0560@2 NA|NA|NA E haloacid dehalogenase-like hydrolase Z1_01689 529507.PMI2381 1.5e-249 868.6 Proteus tar ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1NU02@1224,1SKRM@1236,3Z3CS@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT Methyl-accepting chemotaxis-like domains (chemotaxis sensory transducer). Z1_01690 529507.PMI2380 2.3e-220 771.5 Proteus tar ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1NU02@1224,1SKRM@1236,3Z38C@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT Methyl-accepting chemotaxis-like domains (chemotaxis sensory transducer). Z1_01691 529507.PMI2379 2.1e-163 581.6 Gammaproteobacteria oxyR_3 Bacteria 1N4P5@1224,1RSQH@1236,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_01692 529507.PMI2378 0.0 1531.5 Gammaproteobacteria cbbbC Bacteria 1MU6B@1224,1RNXW@1236,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Belongs to the prokaryotic molybdopterin-containing oxidoreductase family Z1_01693 34506.g1473 1.4e-256 891.7 Bilateria Metazoa 2S2RW@2759,3A3X3@33154,3BRZA@33208,3DF2P@33213,COG1271@1 NA|NA|NA C Cytochrome bd terminal oxidase subunit I Z1_01694 529507.PMI2376 1.7e-187 661.8 Proteus cioB 1.10.3.14 ko:K00426 ko00190,ko01100,ko02020,map00190,map01100,map02020 M00153 R11325 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.3 Bacteria 1MURP@1224,1RN0N@1236,3Z285@583,COG1294@1,COG1294@2 NA|NA|NA C Cytochrome bd terminal oxidase subunit II Z1_01695 529507.PMI2375 1.4e-23 114.8 Proteobacteria Bacteria 1NGXN@1224,2DR70@1,33AGH@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2474) Z1_01696 529507.PMI2374 2.5e-172 611.3 Gammaproteobacteria ko:K08994 ko00000,ko02000 1.A.46.2 Bacteria 1MX91@1224,1S0QU@1236,COG3781@1,COG3781@2 NA|NA|NA S Membrane Z1_01700 529507.PMI2372 0.0 1127.9 Proteus rpoD GO:0000988,GO:0000990,GO:0003674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0016987,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2000142,GO:2001141 ko:K03086 ko00000,ko03021 Bacteria 1MVNJ@1224,1RMQI@1236,3Z111@583,COG0568@1,COG0568@2 NA|NA|NA K Sigma factors are initiation factors that promote the attachment of RNA polymerase to specific initiation sites and are then released. This sigma factor is the primary sigma factor during exponential growth Z1_01701 529507.PMI2371 0.0 1169.8 Proteus dnaG GO:0003674,GO:0003824,GO:0003896,GO:0003899,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006269,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034062,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097747,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K02316 ko03030,map03030 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032 Bacteria 1MUHC@1224,1RMGA@1236,3Z1QQ@583,COG0358@1,COG0358@2 NA|NA|NA L RNA polymerase that catalyzes the synthesis of short RNA molecules used as primers for DNA polymerase during DNA replication Z1_01702 1005994.GTGU_04164 6e-29 132.9 Gammaproteobacteria rpsU GO:0000028,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02970 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MZCC@1224,1S8QZ@1236,COG0828@1,COG0828@2 NA|NA|NA J Belongs to the bacterial ribosomal protein bS21 family Z1_01703 529507.PMI2369 5.3e-192 676.8 Proteus tsaD GO:0000287,GO:0000408,GO:0002949,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006508,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016787,GO:0019538,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070011,GO:0070525,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140030,GO:0140032,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901564 2.3.1.234 ko:K01409,ko:K03070 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 R10648 RC00070,RC00416 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02044,ko03016 3.A.5.1,3.A.5.10,3.A.5.2,3.A.5.4 Bacteria 1MU6S@1224,1RN8M@1236,3Z1PN@583,COG0533@1,COG0533@2 NA|NA|NA J Required for the formation of a threonylcarbamoyl group on adenosine at position 37 (t(6)A37) in tRNAs that read codons beginning with adenine. Is involved in the transfer of the threonylcarbamoyl moiety of threonylcarbamoyl-AMP (TC-AMP) to the N6 group of A37, together with TsaE and TsaB. TsaD likely plays a direct catalytic role in this reaction Z1_01704 529507.PMI2368 1.9e-277 961.1 Gammaproteobacteria aroH GO:0003674,GO:0003824,GO:0003849,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009423,GO:0009507,GO:0009536,GO:0009611,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019438,GO:0019752,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0050896,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.54 ko:K01626 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024 M00022 R01826 RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iIT341.HP0134 Bacteria 1MUWF@1224,1RRMM@1236,COG3200@1,COG3200@2 NA|NA|NA E phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase Z1_01705 529507.PMI2367 1.3e-69 268.9 Bacteria Bacteria COG1917@1,COG1917@2 NA|NA|NA L Cupin 2, conserved barrel domain protein Z1_01706 529507.PMI2366 1.6e-96 358.6 Gammaproteobacteria pheA 4.2.1.51 ko:K04518 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00024 R00691,R01373 RC00360 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MYWM@1224,1SHZR@1236,COG0077@1,COG0077@2 NA|NA|NA E Prephenate dehydratase Z1_01707 529507.PMI2365 1.6e-123 448.7 Bacteria Bacteria COG0684@1,COG0684@2 NA|NA|NA H ribonuclease inhibitor activity Z1_01708 529507.PMI2364 1e-116 426.0 Proteus plsY GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 2.3.1.15 ko:K08591 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R09380 RC00004,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Bacteria 1RD4Z@1224,1RN1J@1236,3Z235@583,COG0344@1,COG0344@2 NA|NA|NA I Catalyzes the transfer of an acyl group from acyl- phosphate (acyl-PO(4)) to glycerol-3-phosphate (G3P) to form lysophosphatidic acid (LPA). This enzyme utilizes acyl-phosphate as fatty acyl donor, but not acyl-CoA or acyl-ACP Z1_01709 529507.PMI2363 1.2e-55 222.2 Proteus folB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004150,GO:0005488,GO:0005515,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016832,GO:0042802 1.13.11.81,4.1.2.25,5.1.99.8 ko:K01633 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00840 R03504,R11037,R11073 RC00721,RC00943,RC01479,RC03333,RC03334 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2955,iECSE_1348.ECSE_3338,iPC815.YPO0648,iSBO_1134.SBO_2914,iSDY_1059.SDY_3241,iSFxv_1172.SFxv_3403,iUTI89_1310.UTI89_C3494,iYL1228.KPN_03462,ic_1306.c3808 Bacteria 1MZ8Z@1224,1S9B2@1236,3Z2NY@583,COG1539@1,COG1539@2 NA|NA|NA H Catalyzes the conversion of 7,8-dihydroneopterin to 6- hydroxymethyl-7,8-dihydropterin Z1_01710 529507.PMI2362 2.5e-236 824.3 Proteus cca GO:0001680,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004652,GO:0004810,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016437,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0031123,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042245,GO:0042780,GO:0043170,GO:0043628,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0070566,GO:0070567,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1990817 2.7.7.19,2.7.7.72 ko:K00970,ko:K00974 ko03013,ko03018,map03013,map03018 R09382,R09383,R09384,R09386 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1MU2X@1224,1RPFJ@1236,3Z260@583,COG0617@1,COG0617@2 NA|NA|NA J Catalyzes the addition and repair of the essential 3'- terminal CCA sequence in tRNAs without using a nucleic acid template. Adds these three nucleotides in the order of C, C, and A to the tRNA nucleotide-73, using CTP and ATP as substrates and producing inorganic pyrophosphate. Also shows phosphatase, 2'- nucleotidase and 2',3'-cyclic phosphodiesterase activities. These phosphohydrolase activities are probably involved in the repair of the tRNA 3'-CCA terminus degraded by intracellular RNases Z1_01711 529507.PMI2361 3.2e-109 401.4 Proteus ygiM GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07184 ko00000 Bacteria 1MX7M@1224,1RS74@1236,3Z2K2@583,COG3103@1,COG4991@2 NA|NA|NA T sh3 domain protein Z1_01712 529507.PMI2360 7.2e-172 609.8 Proteus ygiF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0043167,GO:0043169,GO:0046872,GO:0050355 3.6.1.25 ko:K18446 ko00000,ko01000 Bacteria 1MY43@1224,1RMP4@1236,3Z2IF@583,COG3025@1,COG3025@2 NA|NA|NA S CYTH domain Z1_01713 529507.PMI2359 0.0 1845.9 Proteus glnE GO:0000166,GO:0000287,GO:0000820,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006521,GO:0006541,GO:0006542,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008882,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0010565,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0017076,GO:0019222,GO:0019752,GO:0030554,GO:0031323,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0033238,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046872,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0062012,GO:0065007,GO:0070566,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.7.7.42,2.7.7.89 ko:K00982 ko00000,ko01000 Bacteria 1MU4I@1224,1RP9N@1236,3Z13P@583,COG1391@1,COG1391@2 NA|NA|NA H Involved in the regulation of glutamine synthetase GlnA, a key enzyme in the process to assimilate ammonia. When cellular nitrogen levels are high, the C-terminal adenylyl transferase (AT) inactivates GlnA by covalent transfer of an adenylyl group from ATP to specific tyrosine residue of GlnA, thus reducing its activity. Conversely, when nitrogen levels are low, the N-terminal adenylyl removase (AR) activates GlnA by removing the adenylyl group by phosphorolysis, increasing its activity. The regulatory region of GlnE binds the signal transduction protein PII (GlnB) which indicates the nitrogen status of the cell Z1_01714 529507.PMI2358 9.5e-264 915.6 Proteus hldE GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0012501,GO:0016051,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0019200,GO:0033692,GO:0033785,GO:0033786,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0046835,GO:0070566,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 2.7.1.167,2.7.7.70 ko:K03272,ko:K21344 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00064 R05644,R05646 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iECH74115_1262.ECH74115_4363,iECSP_1301.ECSP_4025,iECs_1301.ECs3935,iPC815.YPO0654,iZ_1308.Z4405 Bacteria 1MV3Z@1224,1RMAJ@1236,3Z19Y@583,COG0615@1,COG0615@2,COG2870@1,COG2870@2 NA|NA|NA F Catalyzes the ADP transfer from ATP to D-glycero-beta-D- manno-heptose 1-phosphate, yielding ADP-D-glycero-beta-D-manno- heptose Z1_01715 529507.PMI2354 1.6e-38 165.2 Proteus yqiC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09806 ko00000 Bacteria 1N7AH@1224,1SCH1@1236,3Z2YG@583,COG2960@1,COG2960@2 NA|NA|NA S Membrane fusogenic activity Z1_01716 529507.PMI2353 1.5e-115 422.2 Proteus ribB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003933,GO:0003935,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008686,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0016829,GO:0016830,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019238,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042726,GO:0042727,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.5.4.25,4.1.99.12 ko:K02858,ko:K14652 ko00740,ko00790,ko01100,ko01110,map00740,map00790,map01100,map01110 M00125,M00840 R00425,R07281 RC00293,RC01792,RC01815,RC02504 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU8P@1224,1RQ49@1236,3Z10Y@583,COG0108@1,COG0108@2 NA|NA|NA H Catalyzes the conversion of D-ribulose 5-phosphate to formate and 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate Z1_01717 529507.PMI2352 5.4e-152 543.5 Proteus ygiD GO:0003674,GO:0003824,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0046566,GO:0051213,GO:0055114 1.13.11.8 ko:K04100,ko:K15777 ko00362,ko00624,ko00627,ko00965,ko01120,map00362,map00624,map00627,map00965,map01120 R01632,R03550,R04280,R08836,R09565 RC00233,RC00387,RC00535,RC02567,RC02694 br01602,ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MXJZ@1224,1RR5P@1236,3Z1N5@583,COG3384@1,COG3384@2 NA|NA|NA C Catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase Z1_01718 529507.PMI2351 3.9e-231 807.0 Proteus ygiC 3.5.1.78,6.3.1.8 ko:K01460 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R01917,R01918 RC00090,RC00096 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW6V@1224,1RQAP@1236,3Z19F@583,COG0754@1,COG0754@2 NA|NA|NA E Glutathionylspermidine synthase preATP-grasp Z1_01719 529507.PMI2350 1e-128 466.1 Proteus ygiB GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MXGU@1224,1RPEV@1236,3Z2G0@583,COG5463@1,COG5463@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1190) Z1_01720 34506.g1707 2e-234 818.1 Bilateria Metazoa 2EAZN@1,2SH5M@2759,3AFAX@33154,3BWT2@33208,3DEYP@33213 NA|NA|NA S Outer membrane efflux protein Z1_01721 529507.PMI2348 8.5e-116 422.9 Proteus nudF GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0019144,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0047631,GO:0050896 3.6.1.13 ko:K01515 ko00230,map00230 R01054 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iECP_1309.ECP_3126 Bacteria 1RDMW@1224,1RPZV@1236,3Z2MG@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L NUDIX domain Z1_01722 529507.PMI2347 3.5e-165 587.4 Proteus cpdA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004112,GO:0004114,GO:0004115,GO:0005488,GO:0005506,GO:0008081,GO:0008150,GO:0008198,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016787,GO:0016788,GO:0042545,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0045229,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071840 2.1.2.2,3.1.4.53 ko:K03651,ko:K11175 ko00230,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,ko02025,map00230,map00670,map01100,map01110,map01130,map02025 M00048 R00191,R04325,R04326 RC00026,RC00197,RC00296,RC01128 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MWKX@1224,1RPA7@1236,3Z10X@583,COG1409@1,COG1409@2 NA|NA|NA F Hydrolyzes cAMP to 5'-AMP. Plays an important regulatory role in modulating the intracellular concentration of cAMP, thereby influencing cAMP-dependent processes Z1_01723 529507.PMI2346 1.5e-109 402.1 Proteus yqiA GO:0003674,GO:0003824,GO:0016787,GO:0016788 ko:K07000 ko00000 Bacteria 1MVJF@1224,1S5WF@1236,3Z1T1@583,COG3150@1,COG3150@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0227) Z1_01724 529507.PMI2345 0.0 1258.0 Proteus parE GO:0000819,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003918,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006276,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007062,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009295,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016853,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022402,GO:0030541,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051276,GO:0061505,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0098813,GO:0140097,GO:1901360 5.99.1.3 ko:K02470,ko:K02622 ko00000,ko01000,ko02048,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MVH1@1224,1RMCI@1236,3Z1D6@583,COG0187@1,COG0187@2 NA|NA|NA L topoisomerase IV subunit B K02622 Z1_01725 529507.PMI2344 0.0 1926.8 Proteus parC GO:0000819,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006276,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007062,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009330,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019897,GO:0019898,GO:0022402,GO:0030541,GO:0032991,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051276,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:0098813,GO:1901360,GO:1901363 5.99.1.3 ko:K02469,ko:K02621 ko00000,ko01000,ko02048,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MURI@1224,1RMTC@1236,3Z1EH@583,COG0188@1,COG0188@2 NA|NA|NA L Belongs to the type II topoisomerase GyrA ParC subunit family Z1_01726 529507.PMI2343 3.2e-138 497.7 Proteus plsC GO:0003674,GO:0003824,GO:0003841,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016411,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0042171,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046474,GO:0046486,GO:0071617,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.51,3.1.3.3 ko:K00655,ko:K07003,ko:K15781 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R02241,R09381 RC00004,RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Bacteria 1MY51@1224,1RQYC@1236,3Z2B2@583,COG0204@1,COG0204@2 NA|NA|NA I 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (1-AGP acyltransferase) (1-AGPAT) (lysophosphatidic acid acyltransferase) (LPAAT) K00655 Z1_01727 34506.g748 1.8e-278 964.5 Bilateria Metazoa 2QR4X@2759,38BK4@33154,3BRDN@33208,3DDDQ@33213,COG2132@1 NA|NA|NA Q Multicopper oxidase Z1_01728 529507.PMI2341 0.0 2176.4 Proteus ko:K12685,ko:K19231 ko00000,ko01000,ko02000,ko02044 1.B.12,1.B.12.5.1,1.B.12.5.3 Bacteria 1MVY7@1224,1RRCM@1236,3Z184@583,COG1404@1,COG1404@2,COG4625@1,COG4625@2 NA|NA|NA O Autotransporter beta-domain Z1_01729 529507.PMI2340 1.9e-212 745.0 Proteus Bacteria 1QCN1@1224,1T8DK@1236,2AQ2N@1,31F7T@2,3Z2PY@583 NA|NA|NA Z1_01730 529507.PMI2337 2.3e-89 334.7 Proteus folA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004146,GO:0005488,GO:0005542,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0019842,GO:0031406,GO:0033218,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051870,GO:0051871,GO:0055114,GO:0070401,GO:0070402,GO:0072341,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363 1.5.1.3 ko:K00287 ko00670,ko00790,ko01100,ko01523,map00670,map00790,map01100,map01523 M00126,M00840 R00936,R00937,R00939,R00940,R02235,R02236,R11765 RC00109,RC00110,RC00158 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECBD_1354.ECBD_3567,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0047,iECNA114_1301.ECNA114_0036,iEcDH1_1363.EcDH1_3551,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0050,iG2583_1286.G2583_0050,iNRG857_1313.NRG857_00250,iUMN146_1321.UM146_23020 Bacteria 1RH0P@1224,1S5VH@1236,3Z29Q@583,COG0262@1,COG0262@2 NA|NA|NA H Key enzyme in folate metabolism. Catalyzes an essential reaction for de novo glycine and purine synthesis, and for DNA precursor synthesis Z1_01731 529507.PMI2336 2.2e-164 584.7 Proteus apaH GO:0003674,GO:0003824,GO:0004551,GO:0004721,GO:0006139,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008138,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008796,GO:0008803,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0015949,GO:0016311,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016817,GO:0016818,GO:0019538,GO:0034641,GO:0036211,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0046483,GO:0050896,GO:0055086,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901564 3.6.1.41 ko:K01525 ko00230,map00230 R00125 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_0052,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0053,iSDY_1059.SDY_0074 Bacteria 1MV10@1224,1RPUJ@1236,3Z1P5@583,COG0639@1,COG0639@2 NA|NA|NA T Hydrolyzes diadenosine 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate to yield ADP Z1_01732 529507.PMI2335 5.9e-64 250.0 Proteus apaG ko:K06195 ko00000 Bacteria 1MZ2Z@1224,1S8SE@1236,3Z2TG@583,COG2967@1,COG2967@2 NA|NA|NA P ApaG domain Z1_01733 529507.PMI2334 5.8e-149 533.5 Proteus ksgA GO:0000028,GO:0000154,GO:0000179,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016433,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070475,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360,GO:1901363 2.1.1.182 ko:K02528 R10716 RC00003,RC03257 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MVNU@1224,1RMHW@1236,3Z1CK@583,COG0030@1,COG0030@2 NA|NA|NA J Specifically dimethylates two adjacent adenosines (A1518 and A1519) in the loop of a conserved hairpin near the 3'-end of 16S rRNA in the 30S particle. May play a critical role in biogenesis of 30S subunits Z1_01734 529507.PMI2333 1.8e-192 678.3 Proteus pdxA GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006081,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008614,GO:0008615,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042802,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046184,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050570,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051287,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 1.1.1.262,1.1.1.408,1.1.1.409 ko:K00097,ko:K22024 ko00750,ko01100,map00750,map01100 M00124 R05681,R05837,R07406 RC00089,RC00675,RC01475 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO111_1330.ECO111_0056 Bacteria 1MX5W@1224,1RNZV@1236,3Z200@583,COG1995@1,COG1995@2 NA|NA|NA H Catalyzes the NAD(P)-dependent oxidation of 4- (phosphohydroxy)-L-threonine (HTP) into 2-amino-3-oxo-4- (phosphohydroxy)butyric acid which spontaneously decarboxylates to form 3-amino-2-oxopropyl phosphate (AHAP) Z1_01735 34506.g792 4.4e-239 833.6 Rhabditida Nematoda 1M74V@119089,395UW@33154,3CA8X@33208,3DRDW@33213,40PMS@6231,415QT@6236,COG0476@1,KOG2017@2759 NA|NA|NA O SurA N-terminal domain Z1_01736 529507.PMI2331 0.0 1611.7 Proteus lptD GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0042221,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045229,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0071702,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901264 ko:K04744 ko00000,ko02000 1.B.42.1 iG2583_1286.G2583_0058 Bacteria 1MUJC@1224,1RQEX@1236,3Z23R@583,COG1452@1,COG1452@2 NA|NA|NA M Together with LptE, is involved in the assembly of lipopolysaccharide (LPS) at the surface of the outer membrane Z1_01737 529507.PMI2330 1.8e-147 528.5 Proteus djlA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0051087,GO:0071944 ko:K05801 ko00000,ko03110 Bacteria 1N270@1224,1RP0P@1236,3Z16F@583,COG1076@1,COG1076@2 NA|NA|NA O Regulatory DnaK co-chaperone. Direct interaction between DnaK and DjlA is needed for the induction of the wcaABCDE operon, involved in the synthesis of a colanic acid polysaccharide capsule, possibly through activation of the RcsB RcsC phosphotransfer signaling pathway. The colanic acid capsule may help the bacterium survive conditions outside the host Z1_01738 529507.PMI2329 4.4e-123 447.2 Proteus rluA GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022613,GO:0031118,GO:0031119,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.28,5.4.99.29 ko:K06177 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MVJ5@1224,1RN4N@1236,3Z2F8@583,COG0564@1,COG0564@2 NA|NA|NA J Responsible for synthesis of pseudouridine from uracil Z1_01739 529507.PMI2328 0.0 1911.0 Proteus rapA GO:0000166,GO:0001000,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003824,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019899,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043175,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097659,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03580 ko00000,ko01000,ko03021 Bacteria 1MX6H@1224,1RNRZ@1236,3Z15V@583,COG0553@1,COG0553@2 NA|NA|NA K Transcription regulator that activates transcription by stimulating RNA polymerase (RNAP) recycling in case of stress conditions such as supercoiled DNA or high salt concentrations. Probably acts by releasing the RNAP, when it is trapped or immobilized on tightly supercoiled DNA. Does not activate transcription on linear DNA. Probably not involved in DNA repair Z1_01740 529507.PMI2327 0.0 1608.2 Proteus polB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003887,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008408,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0018130,GO:0019438,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045004,GO:0045005,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 2.7.7.7 ko:K02336 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVY9@1224,1RMQ1@1236,3Z1W0@583,COG0417@1,COG0417@2 NA|NA|NA L DNA polymerase family B Z1_01741 529507.PMI2326 6.1e-105 386.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1RCZE@1224,1S52X@1236,COG1569@1,COG1569@2 NA|NA|NA S PIN domain Z1_01742 529507.PMI2325 1.5e-74 285.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1R8IB@1224,1S5VF@1236,COG3311@1,COG3311@2 NA|NA|NA K Excisionase Z1_01743 529507.PMI2324 3.6e-123 447.6 Proteus thiQ GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008144,GO:0008150,GO:0015234,GO:0015238,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015888,GO:0015893,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035461,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043492,GO:0045117,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071934,GO:0072348,GO:0072531,GO:0090482,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901474,GO:1901682 ko:K02062 ko02010,map02010 M00191 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.19 iAF1260.b0066,iEC55989_1330.EC55989_0064,iECABU_c1320.ECABU_c00740,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0065,iECO103_1326.ECO103_0067,iECO111_1330.ECO111_0068,iECO26_1355.ECO26_0068,iECSE_1348.ECSE_0066,iETEC_1333.ETEC_0065,iEcDH1_1363.EcDH1_3533,iJO1366.b0066,iJR904.b0066,iUMNK88_1353.UMNK88_64,iY75_1357.Y75_RS00335,ic_1306.c0082 Bacteria 1MV78@1224,1RQH3@1236,3Z16X@583,COG3840@1,COG3840@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex ThiBPQ involved in thiamine import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_01744 529507.PMI2323 3.8e-282 976.9 Proteus thiP GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015234,GO:0015238,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0035461,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0045117,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071934,GO:0071944,GO:0072348,GO:0072531,GO:0090482,GO:1901474,GO:1901682 ko:K02063 ko02010,map02010 M00191 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.19 iAPECO1_1312.APECO1_1915,iECIAI1_1343.ECIAI1_0067,iECO103_1326.ECO103_0068,iECO111_1330.ECO111_0069,iECO26_1355.ECO26_0069,iECOK1_1307.ECOK1_0068,iECS88_1305.ECS88_0072,iECSE_1348.ECSE_0067,iECUMN_1333.ECUMN_0068,iPC815.YPO0521,iSF_1195.SF0062,iSFxv_1172.SFxv_0064,iS_1188.S0064,iUMN146_1321.UM146_23130,iUTI89_1310.UTI89_C0075 Bacteria 1MWCF@1224,1RNHK@1236,3Z293@583,COG1178@1,COG1178@2 NA|NA|NA P with TbpA and ThiQ functions in transport of thiamine and thiamine pyrophosphate into the cell Z1_01745 529507.PMI2322 5.6e-194 683.3 Proteus tbpA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008144,GO:0008150,GO:0015888,GO:0015893,GO:0019842,GO:0030288,GO:0030313,GO:0030975,GO:0030976,GO:0031975,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044464,GO:0045117,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0072348,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901681 ko:K02064 ko02010,map02010 M00191 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.19 iAPECO1_1312.APECO1_1914,iSFxv_1172.SFxv_0065,iUTI89_1310.UTI89_C0076 Bacteria 1MUBB@1224,1RMQ9@1236,3Z1XN@583,COG4143@1,COG4143@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_01746 529507.PMI2321 5.9e-102 376.7 Proteus nudH GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019439,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031329,GO:0031331,GO:0033554,GO:0034353,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043487,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0050779,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K08311 ko03018,map03018 R10816 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000,ko03019 Bacteria 1RDGJ@1224,1S3PQ@1236,3Z2II@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L Accelerates the degradation of transcripts by removing pyrophosphate from the 5'-end of triphosphorylated RNA, leading to a more labile monophosphorylated state that can stimulate subsequent ribonuclease cleavage Z1_01747 529507.PMI2320 0.0 1437.6 Proteus ptsP GO:0003674,GO:0003824,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008965,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016775,GO:0019538,GO:0036211,GO:0042221,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0050896,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901698 2.7.3.9 ko:K08483,ko:K08484 ko02060,map02060 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 8.A.7 Bacteria 1QTTV@1224,1T1H2@1236,3Z264@583,COG3605@1,COG3605@2 NA|NA|NA T phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase Z1_01748 529507.PMI2319 1.8e-172 611.7 Proteus lgt GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008961,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009249,GO:0009898,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0018065,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034645,GO:0036211,GO:0040007,GO:0042157,GO:0042158,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051604,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098562,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.199 ko:K03438,ko:K13292 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MVE3@1224,1RMVK@1236,3Z16P@583,COG0682@1,COG0682@2 NA|NA|NA M Transfers the N-acyl diglyceride group on what will become the N-terminal cysteine of membrane lipoproteins Z1_01749 34506.g1004 3.1e-169 600.9 Rhabditida Nematoda 1KV1Q@119089,38B8T@33154,3BBAM@33208,3CTT4@33213,40AQY@6231,410JA@6236,COG0207@1,KOG0673@2759 NA|NA|NA F Thymidylate synthase Z1_01750 529507.PMI2317 1.3e-93 349.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1RAHV@1224,1S2H6@1236,COG5340@1,COG5340@2 NA|NA|NA K Psort location Cytoplasmic, score Z1_01751 529507.PMI2316 8.3e-176 622.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1PNER@1224,1RSE3@1236,COG2253@1,COG2253@2 NA|NA|NA S Nucleotidyl transferase AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_01752 529507.PMI2315 3.7e-79 300.8 Proteus ppdA ko:K02679,ko:K08084,ko:K08085 ko00000,ko02044 3.A.15.2 Bacteria 1N8EX@1224,1S81J@1236,3Z314@583,COG4970@1,COG4970@2 NA|NA|NA NU Prokaryotic N-terminal methylation motif Z1_01753 529507.PMI2314 4.9e-119 433.7 Proteus ppdB ko:K02459,ko:K02672,ko:K02680 ko03070,ko05111,map03070,map05111 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.15 Bacteria 1RHSZ@1224,1S374@1236,3Z2SD@583,COG4795@1,COG4795@2 NA|NA|NA U prepilin peptidase dependent protein Z1_01754 529507.PMI2313 1.9e-80 305.1 Proteus Bacteria 1QE58@1224,1SHCV@1236,2AG11@1,31654@2,3Z312@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2509) Z1_01755 529507.PMI2312 1.8e-44 184.9 Proteus Bacteria 1QG8R@1224,1TDMT@1236,2AT3P@1,31IJR@2,3Z34P@583 NA|NA|NA Z1_01756 529507.PMI2311 0.0 2273.0 Proteus recC GO:0000724,GO:0000725,GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008854,GO:0009314,GO:0009338,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0016895,GO:0017111,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044355,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0099046,GO:0140097,GO:1901360,GO:1902494 3.1.11.5 ko:K03583 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MWTI@1224,1RNT0@1236,3Z13W@583,COG1330@1,COG1330@2 NA|NA|NA L A helicase nuclease that prepares dsDNA breaks (DSB) for recombinational DNA repair. Binds to DSBs and unwinds DNA via a highly rapid and processive ATP-dependent bidirectional helicase activity. Unwinds dsDNA until it encounters a Chi (crossover hotspot instigator) sequence from the 3' direction. Cuts ssDNA a few nucleotides 3' to the Chi site. The properties and activities of the enzyme are changed at Chi. The Chi-altered holoenzyme produces a long 3'-ssDNA overhang and facilitates RecA-binding to the ssDNA for homologous DNA recombination and repair. Holoenzyme degrades any linearized DNA that is unable to undergo homologous recombination. In the holoenzyme this subunit recognizes the wild- type Chi sequence, and when added to isolated RecB increases its ATP-dependent helicase processivity Z1_01757 529507.PMI2310 0.0 1845.5 Proteus ptrA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0008270,GO:0016787,GO:0019538,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.24.55,3.4.24.56 ko:K01407,ko:K01408 ko05010,map05010 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1QTVC@1224,1T1IG@1236,3Z1SQ@583,COG1025@1,COG1025@2 NA|NA|NA O Peptidase M16 inactive domain Z1_01758 529507.PMI2309 0.0 2419.0 Proteus recB GO:0000166,GO:0000724,GO:0000725,GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006952,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008854,GO:0009314,GO:0009338,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015616,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0016895,GO:0017076,GO:0017111,GO:0030554,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044355,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0097367,GO:0099046,GO:0140097,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1902494 3.1.11.5,3.6.4.12 ko:K03582,ko:K16898 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUTF@1224,1RPC6@1236,3Z1UV@583,COG1074@1,COG1074@2 NA|NA|NA L A helicase nuclease that prepares dsDNA breaks (DSB) for recombinational DNA repair. Binds to DSBs and unwinds DNA via a highly rapid and processive ATP-dependent bidirectional helicase activity. Unwinds dsDNA until it encounters a Chi (crossover hotspot instigator) sequence from the 3' direction. Cuts ssDNA a few nucleotides 3' to the Chi site. The properties and activities of the enzyme are changed at Chi. The Chi-altered holoenzyme produces a long 3'-ssDNA overhang and facilitates RecA-binding to the ssDNA for homologous DNA recombination and repair. Holoenzyme degrades any linearized DNA that is unable to undergo homologous recombination. In the holoenzyme this subunit contributes ATPase, 3'-5' helicase, exonuclease activity and loads RecA onto ssDNA Z1_01759 529507.PMI2308 0.0 1224.2 Proteus recD GO:0000166,GO:0000724,GO:0000725,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004386,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008094,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008854,GO:0009338,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0016895,GO:0017076,GO:0017111,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043142,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140097,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1902494 3.1.11.5 ko:K03581 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MW43@1224,1RPA0@1236,3Z2CZ@583,COG0507@1,COG0507@2 NA|NA|NA L A helicase nuclease that prepares dsDNA breaks (DSB) for recombinational DNA repair. Binds to DSBs and unwinds DNA via a highly rapid and processive ATP-dependent bidirectional helicase activity. Unwinds dsDNA until it encounters a Chi (crossover hotspot instigator) sequence from the 3' direction. Cuts ssDNA a few nucleotides 3' to the Chi site. The properties and activities of the enzyme are changed at Chi. The Chi-altered holoenzyme produces a long 3'-ssDNA overhang and facilitates RecA-binding to the ssDNA for homologous DNA recombination and repair. Holoenzyme degrades any linearized DNA that is unable to undergo homologous recombination. In the holoenzyme this subunit has ssDNA-dependent ATPase and 5'-3' helicase activity. When added to pre-assembled RecBC greatly stimulates nuclease activity and augments holoenzyme processivity. Negatively regulates the RecA-loading ability of RecBCD Z1_01760 529507.PMI2307 3.6e-249 867.1 Proteus argA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003991,GO:0004042,GO:0004358,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006526,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016597,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019752,GO:0031406,GO:0034618,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.3.1.1,2.7.2.8 ko:K00619,ko:K00930,ko:K14682 ko00220,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00028 R00259,R02649 RC00002,RC00004,RC00043,RC00064 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_2830,iLF82_1304.LF82_0116,iNRG857_1313.NRG857_13920,iYL1228.KPN_03226 Bacteria 1MUUP@1224,1RMV5@1236,3Z1NY@583,COG0548@1,COG0548@2,COG1246@1,COG1246@2 NA|NA|NA E Belongs to the acetyltransferase family. ArgA subfamily Z1_01761 529507.PMI2306 1.9e-231 808.1 Proteus amiC GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0007049,GO:0008150,GO:0008745,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032505,GO:0042597,GO:0043093,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061783 3.5.1.28 ko:K01448 ko01503,map01503 M00727 R04112 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01011,ko03036 iPC815.YPO1023,iSDY_1059.SDY_3034,iYL1228.KPN_03225 Bacteria 1MUQK@1224,1RMP1@1236,3Z0Z9@583,COG0860@1,COG0860@2 NA|NA|NA M N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase Z1_01765 529507.PMI2305 2.5e-208 731.1 Proteus mltA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004553,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008933,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016787,GO:0016798,GO:0019867,GO:0030203,GO:0030288,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043170,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044462,GO:0044464,GO:0061783,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K08304 ko00000,ko01000,ko01011 GH102 iECABU_c1320.ECABU_c30840 Bacteria 1MXD4@1224,1RP7K@1236,3Z1XH@583,COG2821@1,COG2821@2 NA|NA|NA M Murein-degrading enzyme. May play a role in recycling of muropeptides during cell elongation and or cell division Z1_01766 529507.PMI2304 3.6e-154 550.8 Proteus ygdL GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0030955,GO:0031402,GO:0031420,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0046872,GO:0061503,GO:0061504,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.7.7.73,2.7.7.80 ko:K03148,ko:K21029,ko:K22132 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07459 RC00043 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MWXR@1224,1RMT3@1236,3Z1KN@583,COG1179@1,COG1179@2 NA|NA|NA H ThiF family Z1_01767 529507.PMI2303 3.5e-76 290.8 Proteus csdE GO:0003674,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0061504,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901360 2.8.1.7,4.4.1.16 ko:K02426,ko:K07125,ko:K11717 ko00450,ko01100,map00450,map01100 R03599,R11528 RC00961,RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1REQB@1224,1S44J@1236,3Z2T5@583,COG2166@1,COG2166@2 NA|NA|NA S cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE Z1_01768 529507.PMI2302 2.1e-227 794.7 Proteus csdA GO:0000096,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564 2.8.1.7,4.4.1.16 ko:K01766,ko:K11717 ko00450,ko01100,map00450,map01100 R03599,R11528 RC00961,RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b2810,iAPECO1_1312.APECO1_3722,iB21_1397.B21_02622,iBWG_1329.BWG_2548,iEC55989_1330.EC55989_3089,iECBD_1354.ECBD_0912,iECB_1328.ECB_02661,iECDH10B_1368.ECDH10B_2980,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2720,iECD_1391.ECD_02661,iECS88_1305.ECS88_3079,iETEC_1333.ETEC_3000,iEcDH1_1363.EcDH1_0878,iEcolC_1368.EcolC_0902,iJO1366.b2810,iPC815.YPO1028,iUMNK88_1353.UMNK88_3495,iY75_1357.Y75_RS14620 Bacteria 1MUPD@1224,1RNIY@1236,3Z2FT@583,COG0520@1,COG0520@2 NA|NA|NA E Aminotransferase class-V Z1_01769 529507.PMI2301 1.3e-168 599.0 Proteus gcvA GO:0001130,GO:0001131,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03566 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1MWY0@1224,1RP7Q@1236,3Z1AY@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_01770 529507.PMI2300 6e-67 260.0 Proteus ygdD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MZX3@1224,1SCNB@1236,3Z2QF@583,COG2363@1,COG2363@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF423) Z1_01771 34506.g1656 1.4e-214 751.9 Eukaryota Eukaryota 2S28J@2759,COG2933@1 NA|NA|NA J rRNA processing Z1_01772 529507.PMI2298 4.5e-140 503.8 Proteus xni GO:0000287,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003887,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004527,GO:0004536,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006271,GO:0006273,GO:0006281,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008409,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016888,GO:0016893,GO:0017108,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0022616,GO:0030955,GO:0031420,GO:0033554,GO:0033567,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034655,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0048256,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901576 2.7.7.7 ko:K01146,ko:K02335 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03410,ko03420,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03410,map03420,map03440 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MX9Y@1224,1RQZE@1236,3Z1N1@583,COG0258@1,COG0258@2 NA|NA|NA L Has flap endonuclease activity. During DNA replication, flap endonucleases cleave the 5'-overhanging flap structure that is generated by displacement synthesis when DNA polymerase encounters the 5'-end of a downstream Okazaki fragment Z1_01773 34506.g1657 2.3e-259 901.0 Bilateria Metazoa 2EFBA@1,2SKIR@2759,3AGHU@33154,3BY3S@33208,3DFG0@33213 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4478) Z1_01774 34506.g1658 2.7e-165 587.8 Bilateria Metazoa 2EB83@1,2SHCD@2759,3AG5A@33154,3BZGW@33208,3DEW7@33213 NA|NA|NA S Nitrile reductase, 7-cyano-7-deazaguanine-reductase N-term Z1_01775 529507.PMI2295 8.2e-99 366.3 Proteus syd GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009898,GO:0016020,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031234,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098562 ko:K15723 ko00000 Bacteria 1RAB3@1224,1S2N3@1236,28Q4G@1,2ZCMR@2,3Z18X@583 NA|NA|NA S Interacts with the SecY protein in vivo. May bind preferentially to an uncomplexed state of SecY, thus functioning either as a chelating agent for excess SecY in the cell or as a regulatory factor that negatively controls the translocase function Z1_01776 529507.PMI2294 4.3e-55 220.3 Proteus yqcC GO:0008150,GO:0009987,GO:0042710,GO:0044010,GO:0044764,GO:0051704 3.5.1.28,5.1.3.13,5.4.99.26 ko:K01790,ko:K03806,ko:K06175 ko00521,ko00523,ko01130,map00521,map00523,map01130 M00793 R06514 RC01531 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01011,ko03016 Bacteria 1N7AG@1224,1SCXJ@1236,3Z2XD@583,COG3098@1,COG3098@2 NA|NA|NA S tRNA pseudouridine synthase C Z1_01777 529507.PMI2293 2.7e-151 541.2 Proteus truC GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016853,GO:0016866,GO:0031119,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.26 ko:K06175 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1N8GW@1224,1RMZ7@1236,3Z1KU@583,COG0564@1,COG0564@2 NA|NA|NA J RNA pseudouridylate synthase Z1_01778 529507.PMI2292 2.1e-266 924.5 Proteus ptsG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0008645,GO:0009401,GO:0015144,GO:0015749,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034219,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0090563,GO:0090564,GO:1904659 2.7.1.193,2.7.1.199,2.7.1.201,2.7.1.208,2.7.1.211 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02778,ko:K02779,ko:K02790,ko:K02791,ko:K02802,ko:K02803,ko:K02804,ko:K02809,ko:K02810,ko:K02818,ko:K02819,ko:K20116,ko:K20117,ko:K20118 ko00010,ko00500,ko00520,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02060,map05111 M00265,M00266,M00267,M00269,M00270,M00271,M00809 R00811,R02738,R02780,R04111,R05199 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.1.13,4.A.1.1.14,4.A.1.1.15,4.A.1.1.2,4.A.1.1.3,4.A.1.1.5,4.A.1.1.7,4.A.1.1.9,4.A.1.2.1,4.A.1.2.10,4.A.1.2.11,4.A.1.2.12,4.A.1.2.13,4.A.1.2.2,4.A.1.2.4,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6,4.A.1.2.8,4.A.1.2.9 Bacteria 1MY1V@1224,1RMYZ@1236,3Z288@583,COG1263@1,COG1263@2,COG1264@1,COG1264@2 NA|NA|NA G phosphotransferase system, EIIB Z1_01779 529507.PMI2291 3.3e-251 874.0 Proteus Bacteria 1QD1S@1224,1T8WK@1236,29EEI@1,301CF@2,3Z3J3@583 NA|NA|NA Z1_01780 529507.PMI2290 4.5e-79 300.4 Proteus yqcA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0010181,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0048037,GO:0050662,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K06205 ko00000 Bacteria 1N27T@1224,1S906@1236,3Z2KG@583,COG0716@1,COG0716@2 NA|NA|NA C Flavodoxin Z1_01781 529507.PMI2289 4.9e-66 256.9 Proteus yaeH Bacteria 1RD2V@1224,1S3XU@1236,28NXJ@1,2ZBV4@2,3Z2KJ@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3461) Z1_01782 34506.g1225 2.8e-135 488.0 Bilateria Metazoa 2ED8Z@1,2SIYD@2759,3AGB5@33154,3BXBT@33208,3DEPE@33213 NA|NA|NA S Tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase N-terminal Z1_01783 529507.PMI2287 0.0 1755.0 Proteus glnD GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006464,GO:0006520,GO:0006541,GO:0006542,GO:0006807,GO:0006808,GO:0007154,GO:0007584,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008773,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009084,GO:0009605,GO:0009719,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018175,GO:0018177,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0031670,GO:0036211,GO:0042221,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044283,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046394,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070569,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071496,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090293,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901698,GO:1901699,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 2.7.7.59 ko:K00990 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV54@1224,1RN5T@1236,3Z2H0@583,COG2844@1,COG2844@2 NA|NA|NA O Modifies, by uridylylation and deuridylylation, the PII regulatory proteins (GlnB and homologs), in response to the nitrogen status of the cell that GlnD senses through the glutamine level. Under low glutamine levels, catalyzes the conversion of the PII proteins and UTP to PII-UMP and PPi, while under higher glutamine levels, GlnD hydrolyzes PII-UMP to PII and UMP (deuridylylation). Thus, controls uridylylation state and activity of the PII proteins, and plays an important role in the regulation of nitrogen Z1_01784 529507.PMI2286 2.1e-151 541.6 Proteus map GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008233,GO:0008235,GO:0008237,GO:0008238,GO:0009987,GO:0016787,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070006,GO:0070011,GO:0070084,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.11.18 ko:K01265 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU99@1224,1RMHN@1236,3Z1CT@583,COG0024@1,COG0024@2 NA|NA|NA J Methionine aminopeptidase Z1_01785 529507.PMI2285 1.7e-131 475.3 Proteus rpsB GO:0000028,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030312,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02967 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1MU33@1224,1RN0Z@1236,3Z23W@583,COG0052@1,COG0052@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein S2 Z1_01786 529507.PMI2284 1.4e-150 538.9 Proteus tsf GO:0001871,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003746,GO:0005085,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009986,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0019899,GO:0030246,GO:0030247,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051020,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2001065 ko:K02357 ko00000,ko03012,ko03029 Bacteria 1MUS2@1224,1RPBJ@1236,3Z1DK@583,COG0264@1,COG0264@2 NA|NA|NA J Associates with the EF-Tu.GDP complex and induces the exchange of GDP to GTP. It remains bound to the aminoacyl-tRNA.EF- Tu.GTP complex up to the GTP hydrolysis stage on the ribosome Z1_01787 529507.PMI2283 3.7e-131 474.2 Proteus pyrH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009041,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009165,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019637,GO:0033862,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046940,GO:0050145,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.4.22 ko:K09903 ko00240,ko01100,map00240,map01100 R00158 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV3N@1224,1RMHX@1236,3Z1I3@583,COG0528@1,COG0528@2 NA|NA|NA F Catalyzes the reversible phosphorylation of UMP to UDP Z1_01788 529507.PMI2282 4.9e-91 340.5 Proteus frr GO:0002181,GO:0002184,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008079,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022411,GO:0030312,GO:0032984,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043021,GO:0043023,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02838 ko00000,ko03012 Bacteria 1N66T@1224,1RN75@1236,3Z1Q2@583,COG0233@1,COG0233@2 NA|NA|NA J Responsible for the release of ribosomes from messenger RNA at the termination of protein biosynthesis. May increase the efficiency of translation by recycling ribosomes from one round of translation to another Z1_01789 529507.PMI2281 2e-219 768.1 Proteus dxr GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006721,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009240,GO:0009987,GO:0016114,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019288,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019752,GO:0030145,GO:0030604,GO:0032787,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0046490,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0050897,GO:0051483,GO:0051484,GO:0055114,GO:0070402,GO:0071704,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901576 1.1.1.267 ko:K00099 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R05688 RC01452 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1814,iECOK1_1307.ECOK1_0174,iECS88_1305.ECS88_0183,iHN637.CLJU_RS06420,iNJ661.Rv2870c,iUMN146_1321.UM146_23670,iUTI89_1310.UTI89_C0188 Bacteria 1MU4G@1224,1RNNW@1236,3Z2D9@583,COG0743@1,COG0743@2 NA|NA|NA I Catalyzes the NADP-dependent rearrangement and reduction of 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP) to 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP) Z1_01790 529507.PMI2280 6.6e-139 500.0 Proteus uppS GO:0000270,GO:0000287,GO:0002094,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004659,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006066,GO:0006629,GO:0006720,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008834,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016093,GO:0016094,GO:0016740,GO:0016765,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043164,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046165,GO:0046872,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 2.5.1.31 ko:K00806 ko00900,ko01110,map00900,map01110 R06447 RC00279,RC02839 ko00000,ko00001,ko01000,ko01006 iECBD_1354.ECBD_3445,iECOK1_1307.ECOK1_0175,iECSE_1348.ECSE_0173,iECW_1372.ECW_m0170,iEKO11_1354.EKO11_3744,iEcDH1_1363.EcDH1_3429,iEcE24377_1341.EcE24377A_0178,iEcHS_1320.EcHS_A0176,iNRG857_1313.NRG857_00890,iSFV_1184.SFV_0157,iUMN146_1321.UM146_23675,iUMNK88_1353.UMNK88_178,iWFL_1372.ECW_m0170,iY75_1357.Y75_RS00880 Bacteria 1MVP1@1224,1RMVX@1236,3Z1P3@583,COG0020@1,COG0020@2 NA|NA|NA H Catalyzes the sequential condensation of isopentenyl diphosphate (IPP) with (2E,6E)-farnesyl diphosphate (E,E-FPP) to yield (2Z,6Z,10Z,14Z,18Z,22Z,26Z,30Z,34E,38E)-undecaprenyl diphosphate (di-trans,octa-cis-UPP). UPP is the precursor of glycosyl carrier lipid in the biosynthesis of bacterial cell wall polysaccharide components such as peptidoglycan and lipopolysaccharide Z1_01791 529507.PMI2279 6.8e-156 556.6 Proteus cdsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004605,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006655,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016024,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046341,GO:0046471,GO:0046474,GO:0046483,GO:0046486,GO:0055086,GO:0070567,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.7.41 ko:K00981 ko00564,ko01100,ko01110,ko04070,map00564,map01100,map01110,map04070 M00093 R01799 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_1596,iSDY_1059.SDY_0191 Bacteria 1MWSV@1224,1RQ6M@1236,3Z0UK@583,COG0575@1,COG0575@2 NA|NA|NA I Cytidylyltransferase family Z1_01792 529507.PMI2278 9.3e-253 879.0 Proteus rseP GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006355,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0043170,GO:0043856,GO:0044238,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045152,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0140096,GO:0140110,GO:1901564,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 3.4.21.107 ko:K04771,ko:K11749 ko01503,ko02020,ko02024,ko04112,map01503,map02020,map02024,map04112 M00728 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1MU91@1224,1RMIX@1236,3Z106@583,COG0750@1,COG0750@2 NA|NA|NA M Peptidase family M50 Z1_01793 585.DR95_2494 0.0 1563.1 Proteus bamA GO:0005575,GO:0005623,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045229,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0061024,GO:0070727,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0098552,GO:0098796,GO:1990063 ko:K07277 ko00000,ko02000,ko03029 1.B.33 Bacteria 1MU0D@1224,1RMAP@1236,3Z10D@583,COG4775@1,COG4775@2 NA|NA|NA M Part of the outer membrane protein assembly complex, which is involved in assembly and insertion of beta-barrel proteins into the outer membrane. Constitutes, with BamD, the core component of the assembly machinery Z1_01794 529507.PMI2276 5.9e-80 303.5 Proteus skp GO:0001530,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006807,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009279,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019867,GO:0022417,GO:0022607,GO:0030288,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031647,GO:0031975,GO:0032978,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042597,GO:0042802,GO:0043163,GO:0043165,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044238,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045229,GO:0050821,GO:0051082,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051604,GO:0051641,GO:0061024,GO:0061077,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070727,GO:0071704,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0097367,GO:1901564 ko:K06142 ko00000 Bacteria 1RD8X@1224,1RQIE@1236,3Z30X@583,COG2825@1,COG2825@2 NA|NA|NA M Outer membrane protein (OmpH-like) Z1_01795 529507.PMI2275 2.7e-159 568.2 Proteus lpxD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.191 ko:K02536 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R04550 RC00039,RC00166 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 ic_1306.c0216 Bacteria 1MUX6@1224,1RNYI@1236,3Z26X@583,COG1044@1,COG1044@2 NA|NA|NA M Catalyzes the N-acylation of UDP-3-O- (hydroxytetradecanoyl)glucosamine using 3-hydroxytetradecanoyl-ACP as the acyl donor. Is involved in the biosynthesis of lipid A, a phosphorylated glycolipid that anchors the lipopolysaccharide to the outer membrane of the cell Z1_01796 529507.PMI2274 5.4e-80 303.5 Proteus fabZ GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008693,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019171,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0047451,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 4.2.1.59 ko:K02372 ko00061,ko00780,ko01100,ko01212,map00061,map00780,map01100,map01212 M00083,M00572 R04428,R04535,R04537,R04544,R04568,R04954,R04965,R07764,R10117,R10121 RC00831,RC01095 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iJN746.PP_1602 Bacteria 1RH2T@1224,1S63E@1236,3Z0ZR@583,COG0764@1,COG0764@2 NA|NA|NA I Involved in unsaturated fatty acids biosynthesis. Catalyzes the dehydration of short chain beta-hydroxyacyl-ACPs and long chain saturated and unsaturated beta-hydroxyacyl-ACPs Z1_01797 529507.PMI2273 2.2e-116 425.2 Proteus lpxA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008780,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.129 ko:K00677 ko00540,ko01100,ko01503,map00540,map01100,map01503 M00060 R04567 RC00039,RC00055 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iIT341.HP1375,iPC815.YPO1056 Bacteria 1MUHQ@1224,1RPHB@1236,3Z101@583,COG1043@1,COG1043@2 NA|NA|NA M Involved in the biosynthesis of lipid A, a phosphorylated glycolipid that anchors the lipopolysaccharide to the outer membrane of the cell Z1_01798 529507.PMI2272 5.4e-217 760.0 Proteus lpxB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005543,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008194,GO:0008289,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008915,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0019637,GO:0019897,GO:0019898,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.4.1.182 ko:K00748 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R04606 RC00005,RC00059 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 GT19 iE2348C_1286.E2348C_0187,iEcolC_1368.EcolC_3478,iIT341.HP0867 Bacteria 1MVBI@1224,1RNS1@1236,3Z0Y8@583,COG0763@1,COG0763@2 NA|NA|NA M Condensation of UDP-2,3-diacylglucosamine and 2,3- diacylglucosamine-1-phosphate to form lipid A disaccharide, a precursor of lipid A, a phosphorylated glycolipid that anchors the lipopolysaccharide to the outer membrane of the cell Z1_01799 529507.PMI2271 3.4e-106 391.0 Proteus rnhB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004523,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006271,GO:0006273,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016891,GO:0016893,GO:0019439,GO:0022616,GO:0032299,GO:0032991,GO:0033554,GO:0033567,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034655,GO:0043137,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575,GO:1901576 3.1.26.4 ko:K03470 ko03030,map03030 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032 Bacteria 1RA65@1224,1RQ4B@1236,3Z21Y@583,COG0164@1,COG0164@2 NA|NA|NA L Endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA- DNA hybrids Z1_01800 529507.PMI2270 0.0 2319.3 Proteus dnaE GO:0003674,GO:0003824,GO:0003887,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032991,GO:0034061,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042575,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044776,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02337 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MUIF@1224,1RP0K@1236,3Z1YI@583,COG0587@1,COG0587@2 NA|NA|NA L Bacterial DNA polymerase III alpha subunit Z1_01801 529507.PMI2269 4.1e-178 630.6 Proteus accA GO:0001676,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009317,GO:0009329,GO:0009987,GO:0016053,GO:0019752,GO:0032787,GO:0032991,GO:0042759,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.1.3.15,6.4.1.2 ko:K01962,ko:K01963 ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00376 R00742,R04386 RC00040,RC00253,RC00367 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b0185,iBWG_1329.BWG_0177,iEC55989_1330.EC55989_0179,iECDH10B_1368.ECDH10B_0165,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0178,iECED1_1282.ECED1_0191,iECH74115_1262.ECH74115_0195,iECIAI1_1343.ECIAI1_0185,iECNA114_1301.ECNA114_0175,iECO111_1330.ECO111_0186,iECO26_1355.ECO26_0187,iECP_1309.ECP_0193,iECSE_1348.ECSE_0184,iECSF_1327.ECSF_0200,iECSP_1301.ECSP_0184,iECW_1372.ECW_m0181,iECs_1301.ECs0187,iEKO11_1354.EKO11_3733,iEcDH1_1363.EcDH1_3418,iEcE24377_1341.EcE24377A_0189,iEcHS_1320.EcHS_A0187,iG2583_1286.G2583_0188,iJN746.PP_1607,iJO1366.b0185,iJR904.b0185,iLF82_1304.LF82_0008,iNRG857_1313.NRG857_00945,iSDY_1059.SDY_0201,iSFV_1184.SFV_0168,iSF_1195.SF0175,iSFxv_1172.SFxv_0185,iS_1188.S0178,iUMNK88_1353.UMNK88_190,iWFL_1372.ECW_m0181,iY75_1357.Y75_RS00935,iZ_1308.Z0197 Bacteria 1MURN@1224,1RNN8@1236,3Z1C1@583,COG0825@1,COG0825@2 NA|NA|NA I Component of the acetyl coenzyme A carboxylase (ACC) complex. First, biotin carboxylase catalyzes the carboxylation of biotin on its carrier protein (BCCP) and then the CO(2) group is transferred by the carboxyltransferase to acetyl-CoA to form malonyl-CoA Z1_01802 529507.PMI2268 8.7e-136 489.6 Proteus Bacteria 1R413@1224,1S3TR@1236,3Z0XV@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_01803 529507.PMI2267 2.2e-254 884.4 Proteus tilS GO:0002097,GO:0002101,GO:0002136,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016879,GO:0032267,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 6.3.4.19 ko:K04075,ko:K14058 R09597 RC02633,RC02634 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MU85@1224,1RN14@1236,3Z113@583,COG0037@1,COG0037@2 NA|NA|NA J Ligates lysine onto the cytidine present at position 34 of the AUA codon-specific tRNA(Ile) that contains the anticodon CAU, in an ATP-dependent manner. Cytidine is converted to lysidine, thus changing the amino acid specificity of the tRNA from methionine to isoleucine Z1_01804 529507.PMI2266 2.6e-42 177.6 Proteus rof GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0043244,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K19000 ko00000,ko03021 Bacteria 1MZYG@1224,1S8Y7@1236,3Z2X5@583,COG4568@1,COG4568@2 NA|NA|NA K Modulator of Rho-dependent transcription termination (ROF) Z1_01805 529507.PMI2265 3.3e-126 457.6 Proteus cutF GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009279,GO:0010810,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030155,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042802,GO:0044462,GO:0044464,GO:0050789,GO:0065007,GO:0071944 ko:K06079 ko01503,map01503 ko00000,ko00001 Bacteria 1NZ8R@1224,1S0ZA@1236,3Z1R1@583,COG3015@1,COG3015@2 NA|NA|NA MP NlpE C-terminal OB domain Z1_01806 34506.g992 0.0 1134.8 Rhabditida Nematoda 1M0RE@119089,38HAU@33154,3BD03@33208,3DEGC@33213,40R2C@6231,4174A@6236,COG0442@1,KOG2324@2759 NA|NA|NA J Aminoacyl-tRNA editing domain Z1_01807 529507.PMI2263 1.5e-132 478.8 Proteus yaeB GO:0000049,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016426,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0089715,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901363 Bacteria 1MUF0@1224,1RPCX@1236,3Z2PX@583,COG1720@1,COG1720@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family UPF0066 Z1_01808 529507.PMI2262 2.5e-68 264.6 Proteus rcsF ko:K06080 ko02020,map02020 ko00000,ko00001 Bacteria 1RIKW@1224,1S6DZ@1236,2B4JI@1,31XBN@2,3Z2IM@583 NA|NA|NA M Essential component of the Rcs signaling system, which controls transcription of numerous genes. Plays a role in signal transduction from the cell surface to the histidine kinase RcsC. May detect outer membrane defects Z1_01809 529507.PMI2261 1.4e-147 528.9 Proteus metQ GO:0000101,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0015711,GO:0015821,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031225,GO:0031226,GO:0031975,GO:0032991,GO:0042597,GO:0042940,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046658,GO:0046942,GO:0048473,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055052,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072348,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K02072,ko:K02073 ko02010,map02010 M00238 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.24 ic_1306.c0238 Bacteria 1MUVY@1224,1RS3R@1236,3Z16E@583,COG1464@1,COG1464@2 NA|NA|NA M Belongs to the nlpA lipoprotein family Z1_01810 529507.PMI2260 1e-100 372.9 Proteus metI GO:0000099,GO:0000101,GO:0003333,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015179,GO:0015191,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015711,GO:0015807,GO:0015821,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042940,GO:0043190,GO:0043492,GO:0043865,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0048473,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055052,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072348,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901682,GO:1902475,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903825,GO:1904949,GO:1905039,GO:1990351 ko:K02072 ko02010,map02010 M00238 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.24 iPC815.YPO1072 Bacteria 1MW8E@1224,1RPKY@1236,3Z3A5@583,COG2011@1,COG2011@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_01811 529507.PMI2259 9.5e-189 666.0 Proteus metN GO:0000099,GO:0000101,GO:0000166,GO:0003333,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015179,GO:0015191,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015711,GO:0015807,GO:0015821,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034220,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042940,GO:0042943,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043190,GO:0043492,GO:0043865,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0048473,GO:0048474,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055052,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072348,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901682,GO:1902475,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903825,GO:1904949,GO:1905039,GO:1990351 ko:K02071 ko02010,map02010 M00238 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.24 iAF1260.b0199,iBWG_1329.BWG_0192,iECDH10B_1368.ECDH10B_0180,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0193,iECP_1309.ECP_0209,iEcDH1_1363.EcDH1_3403,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0211,iJO1366.b0199,iJR904.b0199,iUMNK88_1353.UMNK88_205,iY75_1357.Y75_RS01010 Bacteria 1QTTK@1224,1RMQD@1236,3Z254@583,COG1135@1,COG1135@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex MetNIQ involved in methionine import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_01812 529507.PMI2258 1.2e-105 389.0 Proteus gmhB GO:0000271,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008610,GO:0008653,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0033692,GO:0034200,GO:0034637,GO:0034645,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046401,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 3.1.3.15,3.1.3.82,3.1.3.83,4.2.1.19,6.3.2.10 ko:K01089,ko:K01929,ko:K03273 ko00300,ko00340,ko00540,ko00550,ko01100,ko01110,ko01230,ko01502,map00300,map00340,map00540,map00550,map01100,map01110,map01230,map01502 M00026,M00064 R03013,R03457,R04573,R04617,R05647,R09771 RC00017,RC00064,RC00141,RC00932 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko01011 iB21_1397.B21_00198,iEC55989_1330.EC55989_0198,iECBD_1354.ECBD_3418,iECB_1328.ECB_00199,iECD_1391.ECD_00199,iECIAI1_1343.ECIAI1_0202,iECO103_1326.ECO103_0200,iECSE_1348.ECSE_0202,iETEC_1333.ETEC_0196,iEcHS_1320.EcHS_A0204,iEcolC_1368.EcolC_3459 Bacteria 1RDGR@1224,1S3UD@1236,3Z13V@583,COG0241@1,COG0241@2 NA|NA|NA E Polynucleotide kinase 3 phosphatase Z1_01818 529507.PMI2257 2.9e-145 521.2 Proteus yafD Bacteria 1MVPP@1224,1RMBH@1236,3Z1BY@583,COG3021@1,COG3021@2 NA|NA|NA L Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family Z1_01819 529507.PMI2256 1e-231 808.9 Proteus 1.8.5.4 ko:K17218 ko00920,map00920 R10152 RC03155 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N5MC@1224,1RQS1@1236,3Z1A3@583,COG0446@1,COG0446@2 NA|NA|NA S oxidoreductase Z1_01820 529507.PMI2255 1.8e-63 248.4 Proteus Bacteria 1NBU2@1224,1SE49@1236,3Z2SC@583,COG2427@1,COG2427@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1641) Z1_01821 34506.g1403 1e-226 792.3 Rhabditida Nematoda 1M81K@119089,3A170@33154,3BQFC@33208,3DDE1@33213,40R1A@6231,4173P@6236,COG0626@1,KOG0053@2759 NA|NA|NA E Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme Z1_01822 34506.g1402 6.8e-251 872.8 Rhabditida Nematoda 1M0MW@119089,3AFP9@33154,3BZ1H@33208,3DF1R@33213,40QY5@6231,41723@6236,COG0531@1,KOG1286@2759 NA|NA|NA E Amino acid permease Z1_01823 529507.PMI2252 1.8e-127 461.8 Proteus queE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 1.97.1.4,4.3.99.3 ko:K04068,ko:K10026 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R04710,R10002 RC02989 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUJ2@1224,1RNQZ@1236,3Z2M8@583,COG0602@1,COG0602@2 NA|NA|NA H Catalyzes the complex heterocyclic radical-mediated conversion of 6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin (CPH4) to 7- carboxy-7-deazaguanine (CDG), a step common to the biosynthetic pathways of all 7-deazapurine-containing compounds Z1_01824 529507.PMI2251 1e-65 255.8 Proteus queD 4.1.2.50,4.2.3.12 ko:K01737 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00842,M00843 R04286,R09959 RC01117,RC02846,RC02847 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03016 Bacteria 1RI4P@1224,1S3T6@1236,3Z2RX@583,COG0720@1,COG0720@2 NA|NA|NA H 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase Z1_01825 529507.PMI2250 0.0 1184.5 Proteus cysJ GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004783,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009337,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0032553,GO:0032991,GO:0036094,GO:0042602,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050661,GO:0050662,GO:0055114,GO:0070401,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 1.8.1.2 ko:K00380 ko00920,ko01100,ko01120,map00920,map01100,map01120 M00176 R00858 RC00065 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO26_1355.ECO26_3835,iECSE_1348.ECSE_3020,iECW_1372.ECW_m2972,iEKO11_1354.EKO11_1004,iEcE24377_1341.EcE24377A_3066,iEcolC_1368.EcolC_0948,iWFL_1372.ECW_m2972,iYO844.BSU33440 Bacteria 1QUAH@1224,1T1RJ@1236,3Z1U4@583,COG0369@1,COG0369@2 NA|NA|NA H Component of the sulfite reductase complex that catalyzes the 6-electron reduction of sulfite to sulfide. This is one of several activities required for the biosynthesis of L- cysteine from sulfate. The flavoprotein component catalyzes the electron flow from NADPH - FAD - FMN to the hemoprotein component Z1_01826 529507.PMI2249 0.0 1162.9 Proteus cysI GO:0003674,GO:0003824,GO:0004783,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009337,GO:0009987,GO:0016002,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0016673,GO:0019419,GO:0020037,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050311,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0097159,GO:1901363 1.7.7.1,1.8.1.2,1.8.7.1 ko:K00366,ko:K00381,ko:K00392 ko00910,ko00920,ko01100,ko01120,map00910,map00920,map01100,map01120 M00176,M00531 R00790,R00858,R00859,R03600 RC00065,RC00176 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_3037,iECH74115_1262.ECH74115_4017,iECIAI1_1343.ECIAI1_2867,iECNA114_1301.ECNA114_2794,iECO103_1326.ECO103_3307,iECSE_1348.ECSE_3019,iECSF_1327.ECSF_2552,iECSP_1301.ECSP_3712,iECUMN_1333.ECUMN_3091,iECW_1372.ECW_m2971,iECs_1301.ECs3618,iEKO11_1354.EKO11_1005,iEcE24377_1341.EcE24377A_3065,iSFV_1184.SFV_2742,iSbBS512_1146.SbBS512_E3112,iWFL_1372.ECW_m2971,iZ_1308.Z4073 Bacteria 1MVVB@1224,1RMFH@1236,3Z1E8@583,COG0155@1,COG0155@2 NA|NA|NA H Component of the sulfite reductase complex that catalyzes the 6-electron reduction of sulfite to sulfide. This is one of several activities required for the biosynthesis of L- cysteine from sulfate Z1_01827 529507.PMI2248 7.3e-135 486.5 Proteus cysH GO:0000103,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004604,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0019379,GO:0019419,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044464,GO:0055114 1.8.4.10,1.8.4.8 ko:K00390 ko00920,ko01100,ko01120,map00920,map01100,map01120 M00176 R02021 RC00007,RC02862 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_3025,iECABU_c1320.ECABU_c30290,iECNA114_1301.ECNA114_2793,iECO103_1326.ECO103_3306,iECP_1309.ECP_2736,iECSF_1327.ECSF_2551,iETEC_1333.ETEC_2955,iLF82_1304.LF82_0415,iNRG857_1313.NRG857_13505,iSDY_1059.SDY_2964,ic_1306.c3321 Bacteria 1MXUR@1224,1RNC5@1236,3Z1IA@583,COG0175@1,COG0175@2 NA|NA|NA EH Belongs to the PAPS reductase family. CysH subfamily Z1_01828 529507.PMI2247 1e-265 922.2 Proteus cysG 1.3.1.76,2.1.1.107,2.1.1.131,3.7.1.12,4.2.1.75,4.99.1.3,4.99.1.4 ko:K02302,ko:K02303,ko:K02304,ko:K03795,ko:K13541,ko:K13542 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R02864,R03165,R03194,R03947,R05180,R05807,R05809,R07772 RC00003,RC00871,RC01012,RC01034,RC01293,RC01545,RC01861,RC02097,RC03471 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_3999 Bacteria 1MUI0@1224,1RM9V@1236,3Z0ZU@583,COG0007@1,COG0007@2,COG1648@1,COG1648@2 NA|NA|NA H Multifunctional enzyme that catalyzes the SAM-dependent methylations of uroporphyrinogen III at position C-2 and C-7 to form precorrin-2 via precorrin-1. Then it catalyzes the NAD- dependent ring dehydrogenation of precorrin-2 to yield sirohydrochlorin. Finally, it catalyzes the ferrochelation of sirohydrochlorin to yield siroheme Z1_01829 529507.PMI2246 7.6e-174 616.3 Proteus cysD GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004779,GO:0004781,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0019344,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0050896,GO:0070566,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.8.4.10,1.8.4.8,2.7.7.4 ko:K00390,ko:K00957 ko00230,ko00261,ko00450,ko00920,ko01100,ko01120,ko01130,map00230,map00261,map00450,map00920,map01100,map01120,map01130 M00176,M00596 R00529,R02021,R04929 RC00007,RC02809,RC02862,RC02889 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_1303,iUMNK88_1353.UMNK88_3428,iYL1228.KPN_03114 Bacteria 1MUCZ@1224,1RNAD@1236,3Z19R@583,COG0175@1,COG0175@2 NA|NA|NA H Phosphoadenosine phosphosulfate reductase family Z1_01830 529507.PMI2245 1.9e-272 944.5 Proteus cysN GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0004779,GO:0004781,GO:0005488,GO:0005525,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0070566,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 2.7.1.25,2.7.7.4 ko:K00955,ko:K00956 ko00230,ko00261,ko00450,ko00920,ko01100,ko01120,ko01130,map00230,map00261,map00450,map00920,map01100,map01120,map01130 M00176,M00596 R00509,R00529,R04928,R04929 RC00002,RC00078,RC02809,RC02889 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO103_1326.ECO103_3293 Bacteria 1MUD9@1224,1RME4@1236,3Z2ED@583,COG2895@1,COG2895@2 NA|NA|NA H Belongs to the TRAFAC class translation factor GTPase superfamily. Classic translation factor GTPase family. CysN NodQ subfamily Z1_01831 529507.PMI2244 2.8e-111 407.9 Proteus cysC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004020,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0042802,GO:0044237 2.7.1.25 ko:K00860 ko00230,ko00920,ko01100,ko01120,map00230,map00920,map01100,map01120 M00176 R00509,R04928 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2750,iB21_1397.B21_02565,iBWG_1329.BWG_2486,iEC042_1314.EC042_2944,iEC55989_1330.EC55989_3023,iECBD_1354.ECBD_0974,iECB_1328.ECB_02600,iECDH10B_1368.ECDH10B_2918,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2660,iECD_1391.ECD_02600,iECH74115_1262.ECH74115_4002,iECIAI1_1343.ECIAI1_2852,iECO111_1330.ECO111_3474,iECO26_1355.ECO26_3819,iECSE_1348.ECSE_3002,iECSP_1301.ECSP_3698,iECUMN_1333.ECUMN_3074,iECW_1372.ECW_m2956,iECs_1301.ECs3604,iEKO11_1354.EKO11_1019,iEcDH1_1363.EcDH1_0938,iEcE24377_1341.EcE24377A_3051,iEcHS_1320.EcHS_A2888,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2876,iG2583_1286.G2583_3398,iJO1366.b2750,iJR904.b2750,iSBO_1134.SBO_2770,iSDY_1059.SDY_2949,iSFV_1184.SFV_2748,iSSON_1240.SSON_2898,iUMNK88_1353.UMNK88_3426,iWFL_1372.ECW_m2956,iY75_1357.Y75_RS14315,iZ_1308.Z4058 Bacteria 1MX0D@1224,1RNWT@1236,3Z2US@583,COG0529@1,COG0529@2 NA|NA|NA H Adenylylsulphate kinase Z1_01832 529507.PMI2243 4.1e-50 203.8 Proteus ftsB GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0030428,GO:0032153,GO:0032505,GO:0042802,GO:0043093,GO:0044464,GO:0051301,GO:0071944 ko:K05589 ko00000,ko03036 Bacteria 1N7AA@1224,1SD8H@1236,3Z2RB@583,COG2919@1,COG2919@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein. May link together the upstream cell division proteins, which are predominantly cytoplasmic, with the downstream cell division proteins, which are predominantly periplasmic Z1_01833 529507.PMI2242 1.4e-138 498.8 Proteus ispD GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006629,GO:0006720,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050518,GO:0070567,GO:0071704,GO:1901576 2.7.7.60 ko:K00991 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R05633 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2747,iBWG_1329.BWG_2483,iEC55989_1330.EC55989_3019,iECDH10B_1368.ECDH10B_2915,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2657,iECIAI1_1343.ECIAI1_2848,iECO103_1326.ECO103_3289,iECO111_1330.ECO111_3471,iECO26_1355.ECO26_3816,iECSE_1348.ECSE_2999,iECW_1372.ECW_m2953,iEKO11_1354.EKO11_1022,iEcDH1_1363.EcDH1_0941,iEcE24377_1341.EcE24377A_3048,iEcHS_1320.EcHS_A2885,iEcolC_1368.EcolC_0965,iJO1366.b2747,iJR904.b2747,iPC815.YPO3361,iSBO_1134.SBO_2773,iSDY_1059.SDY_2946,iSSON_1240.SSON_2895,iSbBS512_1146.SbBS512_E3127,iUMNK88_1353.UMNK88_3422,iWFL_1372.ECW_m2953,iY75_1357.Y75_RS14300 Bacteria 1MY3B@1224,1S21S@1236,3Z26H@583,COG1211@1,COG1211@2 NA|NA|NA I Catalyzes the formation of 4-diphosphocytidyl-2-C- methyl-D-erythritol from CTP and 2-C-methyl-D-erythritol 4- phosphate (MEP) Z1_01834 529507.PMI2241 1.2e-85 322.4 Proteus ispF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008685,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016849,GO:0030145,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 2.1.1.228,2.7.7.60,4.6.1.12 ko:K00554,ko:K00991,ko:K01770,ko:K12506 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R00597,R05633,R05637 RC00002,RC00003,RC00334,RC01440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03016 iPC815.YPO3360 Bacteria 1MVHA@1224,1S3RQ@1236,3Z2AI@583,COG0245@1,COG0245@2 NA|NA|NA F Involved in the biosynthesis of isopentenyl diphosphate (IPP) and dimethylallyl diphosphate (DMAPP), two major building blocks of isoprenoid compounds. Catalyzes the conversion of 4- diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol 2-phosphate (CDP-ME2P) to 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate (ME-CPP) with a corresponding release of cytidine 5-monophosphate (CMP) Z1_01835 34506.g914 1.7e-201 708.4 Rhabditida Nematoda 1M0PN@119089,3AGEM@33154,3BYIC@33208,3DE3P@33213,40R0A@6231,41736@6236,COG0585@1,KOG2339@2759 NA|NA|NA S tRNA pseudouridine synthase D (TruD) Z1_01836 529507.PMI2239 5.3e-144 516.9 Proteus surE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004309,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006244,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008252,GO:0008253,GO:0008254,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009125,GO:0009129,GO:0009131,GO:0009158,GO:0009161,GO:0009164,GO:0009166,GO:0009173,GO:0009175,GO:0009218,GO:0009222,GO:0009259,GO:0009261,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030145,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0034656,GO:0042454,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046049,GO:0046050,GO:0046131,GO:0046133,GO:0046135,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901658 3.1.3.5 ko:K03787 ko00230,ko00240,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00760,map01100,map01110 R00183,R00511,R00963,R01126,R01227,R01569,R01664,R01968,R02088,R02102,R02323,R02719,R03346 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iSFxv_1172.SFxv_3035 Bacteria 1MVHE@1224,1RN36@1236,3Z0YG@583,COG0496@1,COG0496@2 NA|NA|NA F Nucleotidase with a broad substrate specificity as it can dephosphorylate various ribo- and deoxyribonucleoside 5'- monophosphates and ribonucleoside 3'-monophosphates with highest affinity to 3'-AMP. Also hydrolyzes polyphosphate (exopolyphosphatase activity) with the preference for short-chain- length substrates (P20-25). Might be involved in the regulation of dNTP and NTP pools, and in the turnover of 3'-mononucleotides produced by numerous intracellular RNases (T1, T2, and F) during the degradation of various RNAs Z1_01837 529507.PMI2238 1.3e-113 415.6 Proteus pcm GO:0003674,GO:0003824,GO:0004719,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008757,GO:0009987,GO:0010340,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019538,GO:0030091,GO:0032259,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051998,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 2.1.1.77 ko:K00573 ko00000,ko01000 Bacteria 1MXQC@1224,1RMHZ@1236,3Z22R@583,COG2518@1,COG2518@2 NA|NA|NA J Catalyzes the methyl esterification of L-isoaspartyl residues in peptides and proteins that result from spontaneous decomposition of normal L-aspartyl and L-asparaginyl residues. It plays a role in the repair and or degradation of damaged proteins Z1_01838 529507.PMI2237 3.8e-191 674.1 Proteus nlpD GO:0000920,GO:0001896,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0008219,GO:0009279,GO:0009987,GO:0012501,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032153,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043085,GO:0044093,GO:0044462,GO:0044464,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051301,GO:0051336,GO:0051345,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944 ko:K06194,ko:K12943 ko00000 1.A.34.1.2 Bacteria 1RD24@1224,1RR11@1236,3Z1WC@583,COG1388@1,COG1388@2,COG4942@1,COG4942@2 NA|NA|NA DM Lysin motif Z1_01839 529507.PMI2236 1.9e-178 631.7 Proteus rpoS GO:0000988,GO:0000990,GO:0001000,GO:0001121,GO:0001123,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0016987,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019899,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043175,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2000142,GO:2001141 ko:K03087 ko02026,ko05111,map02026,map05111 ko00000,ko00001,ko03021 Bacteria 1MUDI@1224,1RN8V@1236,3Z2AJ@583,COG0568@1,COG0568@2 NA|NA|NA K Sigma-70 region 3 Z1_01840 529507.PMI2235 0.0 1664.0 Proteus mutS GO:0000018,GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003684,GO:0003690,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008094,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008301,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030554,GO:0030983,GO:0031323,GO:0032136,GO:0032300,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043531,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1990391 ko:K03555 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko03400 iECW_1372.ECW_m2935,iWFL_1372.ECW_m2935 Bacteria 1MUGX@1224,1RNW3@1236,3Z13D@583,COG0249@1,COG0249@2 NA|NA|NA L DNA mismatch repair protein Z1_01841 529507.PMI2228 7.8e-76 289.7 Proteus yjaB ko:K03827 ko00000,ko01000 Bacteria 1RI35@1224,1S66W@1236,3Z33P@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_01842 529507.PMI2227 1.4e-158 565.5 Proteus licT ko:K02538,ko:K03488 ko00000,ko03000 Bacteria 1NHN8@1224,1RR9W@1236,3Z3FG@583,COG3711@1,COG3711@2 NA|NA|NA K CAT RNA binding domain Z1_01843 34506.g6322 0.0 1199.5 Bilateria Metazoa 2D1BI@1,2SHH9@2759,3AFVJ@33154,3BXUU@33208,3DDH2@33213 NA|NA|NA S Phosphotransferase system, EIIC Z1_01844 529507.PMI2225 5.1e-161 573.5 Gammaproteobacteria 3.1.3.97,3.1.4.57 ko:K07053,ko:K20859 ko00440,map00440 R00188,R10972,R10973,R11188 RC00078,RC00296 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1NT3A@1224,1SJZ3@1236,COG0613@1,COG0613@2 NA|NA|NA S DNA polymerase alpha chain like domain Z1_01845 529507.PMI2224 7.5e-49 199.5 Proteus Bacteria 1QGN4@1224,1TE36@1236,3Z3JQ@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix Z1_01846 529507.PMI2223 6.8e-93 346.7 Gammaproteobacteria GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1RC0B@1224,1S1FT@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbria a protein Z1_01847 529507.PMI2222 9.7e-103 379.4 Bacteria GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_01848 34506.g6324 0.0 1661.7 Bilateria Metazoa 2SPXB@2759,3AMFZ@33154,3C0TV@33208,3DGRK@33213,COG3188@1 NA|NA|NA NU PapC C-terminal domain Z1_01849 529507.PMI2220 2.4e-130 471.5 Proteus papD ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1PWWA@1224,1TB1D@1236,3Z3EA@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_01851 529507.PMI2218 5.3e-101 373.6 Gammaproteobacteria ko:K12523 ko00000,ko02044 Bacteria 1NY87@1224,1SQK5@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01852 529507.PMI2217 3.8e-96 357.5 Gammaproteobacteria ko:K12521 ko00000,ko02044 Bacteria 1P0ZY@1224,1SS4A@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Residues 11 to 176 of 176 are 92.81 pct identical to residues 1 to 167 of 167 from SwissProt.40 sp P42187 PRSF_ECOLI MINOR FIMBRIAL PROTEIN PRSF PRECURSOR Z1_01854 529507.PMI2215 2.3e-178 631.3 Proteus yfeX ko:K07223 ko00000 Bacteria 1MWDD@1224,1RMWG@1236,3Z0ZI@583,COG2837@1,COG2837@2 NA|NA|NA C Dyp-type peroxidase family Z1_01855 529507.PMI2214 5.3e-87 327.0 Proteus ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1N294@1224,1S7GA@1236,3Z2I7@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01856 529507.PMI2213 2.7e-120 438.0 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1RAD9@1224,1S2TB@1236,3Z2SI@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain Z1_01857 529507.PMI2212 0.0 1642.5 Proteus ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z1TS@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU PapC C-terminal domain Z1_01858 529507.PMI2211 9.6e-89 332.8 Proteus ko:K07349 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1NCUV@1224,1SDP0@1236,3Z34T@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01859 529507.PMI2210 5e-87 327.0 Proteus sthD Bacteria 1N3N9@1224,1TKHR@1236,3Z31Q@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01860 529507.PMI2209 5.3e-44 183.3 Proteus Bacteria 1QCTF@1224,1SST4@1236,3Z331@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_01861 529507.PMI2208 3.6e-153 547.7 Proteus ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1R5WQ@1224,1S031@1236,3Z28U@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_01862 529507.PMI2207 2.7e-51 207.6 Proteus Bacteria 1P32S@1224,1T8KA@1236,3Z32V@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_01863 529507.PMI2206 1.2e-269 935.3 Proteus yflS_1 ko:K03319,ko:K14445 ko00000,ko02000 2.A.47,2.A.47.1 Bacteria 1MUSA@1224,1RMF3@1236,3Z15I@583,COG0471@1,COG0471@2 NA|NA|NA P Sodium:sulfate symporter transmembrane region Z1_01864 529507.PMI2205 9.9e-166 589.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1MXDQ@1224,1RPBS@1236,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_01865 529507.PMI2204 1.2e-168 599.0 Gammaproteobacteria yhhW_1 ko:K06911 ko00000 Bacteria 1MWIP@1224,1RNVM@1236,COG1741@1,COG1741@2 NA|NA|NA S Belongs to the pirin family Z1_01866 529507.PMI2203 2.3e-119 434.9 Proteus Bacteria 1MWFQ@1224,1RMHF@1236,3Z32M@583,COG1335@1,COG1335@2 NA|NA|NA Q COG1335 Amidases related to nicotinamidase Z1_01867 529507.PMI2202 1.8e-309 1067.8 Proteus sucD GO:0001539,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009361,GO:0009987,GO:0032991,GO:0040011,GO:0042709,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045239,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588,GO:1902494 6.2.1.5 ko:K01902,ko:K02381 ko00020,ko00640,ko00660,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00640,map00660,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00173,M00374,M00620 R00405,R02404 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MWWN@1224,1RME7@1236,3Z1TU@583,COG0074@1,COG0074@2 NA|NA|NA C Membrane protein FdrA Z1_01868 529507.PMI2201 8.5e-240 835.9 Proteus sucD 6.2.1.5 ko:K01902,ko:K02381 ko00020,ko00640,ko00660,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00640,map00660,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00173,M00374,M00620 R00405,R02404 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MX67@1224,1RQEG@1236,3Z114@583,COG0074@1,COG0074@2 NA|NA|NA C Protein of unknown function (DUF1116) Z1_01869 529507.PMI2200 1.1e-155 555.8 Proteus ylbF Bacteria 1N0UA@1224,1S1HZ@1236,2DBVD@1,2ZBAJ@2,3Z0Y6@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2877) Z1_01870 529507.PMI2199 1.1e-164 585.9 Proteus arcC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006527,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008804,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009064,GO:0009065,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0019546,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 2.7.2.2 ko:K00926 ko00220,ko00230,ko00910,ko01100,ko01120,ko01200,map00220,map00230,map00910,map01100,map01120,map01200 R00150,R01395 RC00002,RC00043,RC02803,RC02804 ko00000,ko00001,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_0454,iECED1_1282.ECED1_0540,iECUMN_1333.ECUMN_0561,iEcE24377_1341.EcE24377A_0559,iG2583_1286.G2583_0641,iJN746.PP_0999 Bacteria 1MWXC@1224,1RP78@1236,3Z2D3@583,COG0549@1,COG0549@2 NA|NA|NA E Belongs to the carbamate kinase family Z1_01871 529507.PMI2198 3.4e-233 813.9 Proteus Bacteria 1MVPS@1224,1RSJ3@1236,3Z1XZ@583,COG2271@1,COG2271@2 NA|NA|NA G Vacuole effluxer Atg22 like Z1_01872 529507.PMI2197 2.4e-175 621.3 Proteus allS GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0043565,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K10972 ko00000,ko03000 Bacteria 1P293@1224,1RNA3@1236,3Z1QE@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_01873 529507.PMI2196 2.9e-140 504.6 Proteus ko:K07052 ko00000 Bacteria 1P0IE@1224,1RS9M@1236,3Z2TA@583,COG1266@1,COG1266@2 NA|NA|NA S CAAX protease self-immunity Z1_01874 34506.g1730 1.9e-172 611.7 Eukaryota 2.7.7.41 ko:K00981 ko00564,ko01100,ko01110,ko04070,map00564,map01100,map01110,map04070 M00093 R01799 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Eukaryota COG0575@1,KOG1440@2759 NA|NA|NA I phosphatidate cytidylyltransferase activity Z1_01875 529507.PMI2194 7.5e-126 456.4 Proteus plsC 2.3.1.51 ko:K00655 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R02241,R09381 RC00004,RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Bacteria 1RA8V@1224,1RSDQ@1236,3Z2TU@583,COG0204@1,COG0204@2 NA|NA|NA I Phosphate acyltransferases Z1_01876 529507.PMI2193 1.6e-117 428.7 Proteus pgsAb 2.7.8.5 ko:K00995 ko00564,ko01100,map00564,map01100 R01801 RC00002,RC00017,RC02795 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RHFC@1224,1S6C6@1236,3Z17N@583,COG0558@1,COG0558@2 NA|NA|NA I CDP-alcohol phosphatidyltransferase Z1_01877 529507.PMI2192 9.2e-110 402.9 Proteus fixJ Bacteria 1RM3R@1224,1S6NV@1236,3Z18M@583,COG4566@1,COG4566@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_01878 34506.g1731 1.8e-189 668.3 Bilateria Metazoa 2CZ0F@1,2S7KS@2759,3AAU2@33154,3BZ3K@33208,3DEW1@33213 NA|NA|NA S helix_turn _helix lactose operon repressor Z1_01879 34506.g1732 1.2e-298 1031.6 Bilateria Metazoa 39SNE@33154,3BAKV@33208,3D1Z1@33213,COG1621@1,KOG0228@2759 NA|NA|NA G Glycosyl hydrolases family 32 Z1_01880 529507.PMI2189 4.6e-174 617.1 Proteus scrK 2.7.1.4 ko:K00847 ko00051,ko00500,ko00520,ko01100,map00051,map00500,map00520,map01100 R00760,R00867,R03920 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MX38@1224,1RRWT@1236,3Z2MZ@583,COG0524@1,COG0524@2 NA|NA|NA H pfkB family carbohydrate kinase Z1_01881 529507.PMI2188 4.5e-164 583.9 Proteus rarD ko:K05786 ko00000,ko02000 2.A.7.7 Bacteria 1N1D7@1224,1RYQH@1236,3Z1V8@583,COG2962@1,COG2962@2 NA|NA|NA S EamA-like transporter family Z1_01882 529507.PMI2187 1.4e-223 781.9 Proteus purT GO:0003674,GO:0003824,GO:0004644,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008776,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0016772,GO:0016774,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.2.2 ko:K08289 ko00230,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00670,map01100,map01110,map01130 M00048 R04325,R04326 RC00026,RC00197,RC01128 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iNJ661.Rv0389,iSDY_1059.SDY_1135 Bacteria 1N3KA@1224,1RNTW@1236,3Z0ZZ@583,COG0027@1,COG0027@2 NA|NA|NA F Involved in the de novo purine biosynthesis. Catalyzes the transfer of formate to 5-phospho-ribosyl-glycinamide (GAR), producing 5-phospho-ribosyl-N-formylglycinamide (FGAR). Formate is provided by PurU via hydrolysis of 10-formyl-tetrahydrofolate Z1_01883 529507.PMI2185 0.0 1237.2 Proteus htpG GO:0000302,GO:0000303,GO:0000305,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006457,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010035,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0030312,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034614,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071450,GO:0071451,GO:0071944,GO:1901700,GO:1901701 ko:K04079 ko04141,ko04151,ko04217,ko04612,ko04621,ko04626,ko04657,ko04659,ko04914,ko04915,ko05200,ko05215,ko05418,map04141,map04151,map04217,map04612,map04621,map04626,map04657,map04659,map04914,map04915,map05200,map05215,map05418 ko00000,ko00001,ko01009,ko03029,ko03051,ko03110,ko04131,ko04147 Bacteria 1MUUE@1224,1RNWD@1236,3Z1BE@583,COG0326@1,COG0326@2 NA|NA|NA O chaperone HSP90, heat shock protein C 62.5 K04079 Z1_01884 529507.PMI2184 2.5e-115 421.4 Proteus adk GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004017,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006172,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009133,GO:0009135,GO:0009136,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009180,GO:0009185,GO:0009188,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015949,GO:0015950,GO:0015951,GO:0016070,GO:0016208,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046940,GO:0050145,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090304,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.4.3 ko:K00939 ko00230,ko00730,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00730,map01100,map01110,map01130 M00049 R00127,R01547,R11319 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iECH74115_1262.ECH74115_0566,iEKO11_1354.EKO11_3373,iG2583_1286.G2583_0586 Bacteria 1MXCZ@1224,1RMT6@1236,3Z22A@583,COG0563@1,COG0563@2 NA|NA|NA F Catalyzes the reversible transfer of the terminal phosphate group between ATP and AMP. Plays an important role in cellular energy homeostasis and in adenine nucleotide metabolism Z1_01885 34506.g105 6.1e-190 669.8 Chromadorea Nematoda 1KZB3@119089,38BPY@33154,3BH4Z@33208,3CTKI@33213,40GDH@6231,COG0276@1,KOG1321@2759 NA|NA|NA H Ferrochelatase Z1_01886 529507.PMI2182 2.8e-202 711.1 Proteus fepE GO:0000041,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006826,GO:0008150,GO:0015343,GO:0015620,GO:0015682,GO:0015685,GO:0015688,GO:0015711,GO:0015850,GO:0015891,GO:0016020,GO:0022857,GO:0030001,GO:0042930,GO:0044464,GO:0044718,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051184,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0072512,GO:1901678 ko:K05789,ko:K05790 ko00000,ko01005 Bacteria 1N0EC@1224,1RR0I@1236,3Z24R@583,COG3765@1,COG3765@2 NA|NA|NA M ferric enterobactin Z1_01887 529507.PMI2181 3.7e-254 883.6 Proteus gsk GO:0003674,GO:0003824,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008906,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0044237 2.7.1.20,2.7.1.73,2.7.1.92 ko:K00856,ko:K00892,ko:K03338 ko00230,ko00562,ko01100,ko01120,map00230,map00562,map01100,map01120 R00185,R01131,R01228,R05661 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iSDY_1059.SDY_0442 Bacteria 1MUUC@1224,1RMN2@1236,3Z0VV@583,COG0524@1,COG0524@2 NA|NA|NA H pfkB family carbohydrate kinase Z1_01888 529507.PMI2180 1.7e-302 1044.6 Proteus ybaL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03455 ko00000 2.A.37 Bacteria 1MV34@1224,1RMM7@1236,3Z24A@583,COG1226@1,COG1226@2,COG4651@1,COG4651@2 NA|NA|NA P TrkA-N domain Z1_01889 529507.PMI3034 6.9e-74 283.1 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01890 529507.PMI3382 4.3e-225 786.9 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_01891 529507.PMI2177 0.0 1138.6 Proteus ushA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008252,GO:0008253,GO:0008768,GO:0009225,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016817,GO:0016818,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0034641,GO:0042578,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901360 3.1.3.5,3.6.1.45 ko:K01081,ko:K11751 ko00230,ko00240,ko00760,ko01100,ko01110,map00230,map00240,map00760,map01100,map01110 R00183,R00511,R00963,R01126,R01227,R01569,R01664,R01968,R02088,R02102,R02323,R02719,R03346 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_0493,iECIAI1_1343.ECIAI1_0483,iECO103_1326.ECO103_0456,iECSE_1348.ECSE_0505 Bacteria 1MX03@1224,1RPX3@1236,3Z2FC@583,COG0737@1,COG0737@2 NA|NA|NA F protein UshA precursor includes UDP-sugar hydrolase (UDP-sugar diphosphatase) (UDP-sugar pyrophosphatase) Z1_01892 529507.PMI2176 2.7e-82 311.2 Proteus ybaK GO:0002161,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006450,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043906,GO:0043907,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0052689,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0090304,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 ko:K03976,ko:K19055 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1RGX5@1224,1S6S0@1236,3Z2UZ@583,COG2606@1,COG2606@2 NA|NA|NA S Aminoacyl-tRNA editing domain Z1_01893 529507.PMI2175 7.5e-149 533.1 Proteus ybaP ko:K09973 ko00000 Bacteria 1MVCW@1224,1RRI8@1236,3Z33F@583,COG3735@1,COG3735@2 NA|NA|NA S TraB family Z1_01894 529507.PMI2174 3.2e-225 787.7 Proteus ko:K12342 ko03070,map03070 ko00000,ko00001,ko02044 1.B.40.1.3,1.B.40.1.4 Bacteria 1N0C9@1224,1S9JE@1236,3Z32R@583,COG5295@1,COG5295@2 NA|NA|NA UW YadA-like membrane anchor domain Z1_01895 529507.PMI2173 0.0 1865.5 Proteus copA GO:0000041,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006825,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010272,GO:0010273,GO:0015075,GO:0015080,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035434,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046688,GO:0046873,GO:0046915,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0060003,GO:0061687,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071280,GO:0071292,GO:0071944,GO:0090662,GO:0097501,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098754,GO:0099131,GO:1902601,GO:1990169 3.6.3.54 ko:K17686 ko01524,ko04016,map01524,map04016 R00086 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 3.A.3.5 iEC55989_1330.EC55989_0497,iECIAI1_1343.ECIAI1_0487,iECO103_1326.ECO103_0460,iECSE_1348.ECSE_0509,iECW_1372.ECW_m0557,iEKO11_1354.EKO11_3363,iWFL_1372.ECW_m0557 Bacteria 1MU08@1224,1RN2C@1236,3Z1YX@583,COG2217@1,COG2217@2 NA|NA|NA P E1-E2 ATPase Z1_01896 529507.PMI2172 2.4e-71 274.6 Proteus cueR GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001199,GO:0001204,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005515,GO:0005575,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K13638,ko:K19591 M00769 ko00000,ko00002,ko01504,ko03000 Bacteria 1RGX6@1224,1S8ZG@1236,3Z3ES@583,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, mercury resistance Z1_01897 529507.PMI2171 1.2e-88 332.4 Proteus ybbJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07340 ko00000 Bacteria 1N241@1224,1S5W4@1236,3Z2MF@583,COG1585@1,COG1585@2 NA|NA|NA OU NfeD-like C-terminal, partner-binding Z1_01898 529507.PMI2170 9.5e-124 449.9 Proteus qmcA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MUM8@1224,1RNW8@1236,3Z21V@583,COG0330@1,COG0330@2 NA|NA|NA O C-terminal region of band_7 Z1_01899 34506.g824 1.4e-140 505.8 Bilateria Metazoa 3A8EZ@33154,3BVDM@33208,3DBM3@33213,COG0526@1,KOG0910@2759 NA|NA|NA O Tetratricopeptide repeat Z1_01900 529507.PMI2168 5.4e-144 516.9 Proteus ybbO GO:0003674,GO:0003824,GO:0004033,GO:0008106,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0055114 Bacteria 1RGKZ@1224,1T1HV@1236,3Z1BZ@583,COG0300@1,COG0300@2 NA|NA|NA S KR domain Z1_01901 34506.g825 1.9e-106 391.7 Bilateria Metazoa 2EIU8@1,2SP5U@2759,3AM9K@33154,3C0CM@33208,3DGNI@33213 NA|NA|NA S GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family Z1_01902 529507.PMI2166 2.4e-119 434.9 Proteus ybbA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0008144,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K02003 M00258 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MXG9@1224,1RMG1@1236,3Z1JK@583,COG4181@1,COG4181@2 NA|NA|NA Q ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_01903 529507.PMI2165 0.0 1554.3 Proteus ybbP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02004 M00258 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MU9R@1224,1RM8Y@1236,3Z2GC@583,COG3127@1,COG3127@2 NA|NA|NA Q FtsX-like permease family Z1_01904 529507.PMI2164 7.4e-186 656.4 Proteus ynaI GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0042802,GO:0044464,GO:0071944 ko:K16052 ko00000,ko02000 1.A.23.4 Bacteria 1MXD2@1224,1RNUB@1236,3Z1KD@583,COG0668@1,COG0668@2 NA|NA|NA M mechanosensitive ion channel Z1_01905 529507.PMI2163 3.6e-230 803.9 Proteus Bacteria 1NS7T@1224,1RYZ8@1236,3Z1UN@583,COG2807@1,COG2807@2 NA|NA|NA P Major Facilitator Superfamily Z1_01906 529507.PMI2162 1e-206 725.7 Proteus purK GO:0003674,GO:0003824,GO:0004638,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.4.18 ko:K01589 ko00230,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map01100,map01110,map01130 M00048 R07404 RC01927 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU70@1224,1RQEI@1236,3Z29H@583,COG0026@1,COG0026@2 NA|NA|NA F Involved in the de novo purine biosynthesis. Catalyzes the transfer of formate to 5-phospho-ribosyl-glycinamide (GAR), producing 5-phospho-ribosyl-N-formylglycinamide (FGAR). Formate is provided by PurU via hydrolysis of 10-formyl-tetrahydrofolate Z1_01907 529507.PMI2161 7.3e-89 333.2 Proteus purE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004638,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0016853,GO:0016866,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034023,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 5.4.99.18 ko:K01588 ko00230,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map01100,map01110,map01130 M00048 R07405 RC01947 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iETEC_1333.ETEC_0575,iJN746.PP_5336,iPC815.YPO3076,iUTI89_1310.UTI89_C0551 Bacteria 1RCWJ@1224,1S3VN@1236,3Z349@583,COG0041@1,COG0041@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of N5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide (N5-CAIR) to 4-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (CAIR) Z1_01908 529507.PMI2160 5.3e-138 496.9 Proteus lpxH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008758,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0019637,GO:0019897,GO:0019898,GO:0030145,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 3.6.1.54 ko:K03269 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R04549 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iE2348C_1286.E2348C_0457 Bacteria 1N3U7@1224,1RP1X@1236,3Z2RH@583,COG2908@1,COG2908@2 NA|NA|NA S Hydrolyzes the pyrophosphate bond of UDP-2,3- diacylglucosamine to yield 2,3-diacylglucosamine 1-phosphate (lipid X) and UMP by catalyzing the attack of water at the alpha-P atom. Involved in the biosynthesis of lipid A, a phosphorylated glycolipid that anchors the lipopolysaccharide to the outer membrane of the cell Z1_01909 529507.PMI2159 7.4e-91 339.7 Proteus ppiB GO:0000413,GO:0003674,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 2.7.11.1,5.2.1.8 ko:K03767,ko:K03768,ko:K08884 ko01503,ko04217,map01503,map04217 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko03110,ko04147 Bacteria 1R9ZQ@1224,1S222@1236,3Z25S@583,COG0652@1,COG0652@2 NA|NA|NA O PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides Z1_01910 34506.g1714 1.1e-272 945.3 Rhabditida Nematoda 1M7SQ@119089,38GUV@33154,3B9DM@33208,3CWTZ@33213,40QVV@6231,415B6@6236,COG0215@1,KOG2007@2759 NA|NA|NA J DALR_2 Z1_01911 529507.PMI2157 6.8e-178 629.8 Proteus fruK GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006000,GO:0006001,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008443,GO:0008662,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019200,GO:0019318,GO:0019320,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0046835,GO:0071704,GO:1901575 2.7.1.11,2.7.1.56 ko:K00882,ko:K16370 ko00010,ko00030,ko00051,ko00052,ko00680,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00030,map00051,map00052,map00680,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00001,M00345 R00756,R02071,R03236,R03237,R03238,R03239,R04779 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2168,iAPECO1_1312.APECO1_4386,iB21_1397.B21_02056,iEC042_1314.EC042_2401,iEC55989_1330.EC55989_2421,iECABU_c1320.ECABU_c24990,iECBD_1354.ECBD_1490,iECB_1328.ECB_02097,iECDH10B_1368.ECDH10B_2325,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2104,iECD_1391.ECD_02097,iECED1_1282.ECED1_2616,iECH74115_1262.ECH74115_3304,iECIAI1_1343.ECIAI1_2248,iECIAI39_1322.ECIAI39_2308,iECNA114_1301.ECNA114_2259,iECO103_1326.ECO103_2643,iECO111_1330.ECO111_2886,iECO26_1355.ECO26_3080,iECOK1_1307.ECOK1_2400,iECP_1309.ECP_2208,iECS88_1305.ECS88_2316,iECSE_1348.ECSE_2436,iECSF_1327.ECSF_2049,iECSP_1301.ECSP_3046,iECUMN_1333.ECUMN_2504,iECW_1372.ECW_m2369,iECs_1301.ECs3060,iEKO11_1354.EKO11_1586,iETEC_1333.ETEC_2303,iEcDH1_1363.EcDH1_1490,iEcHS_1320.EcHS_A2305,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2315,iEcolC_1368.EcolC_1480,iG2583_1286.G2583_2711,iJO1366.b2168,iJR904.b2168,iLF82_1304.LF82_0744,iNRG857_1313.NRG857_11005,iPC815.YPO1299,iSBO_1134.SBO_2156,iSDY_1059.SDY_2316,iSFV_1184.SFV_2243,iSF_1195.SF2253,iSFxv_1172.SFxv_2486,iS_1188.S2382,iUMN146_1321.UM146_05955,iUMNK88_1353.UMNK88_2713,iUTI89_1310.UTI89_C2443,iWFL_1372.ECW_m2369,iY75_1357.Y75_RS11345,iZ_1308.Z3426,ic_1306.c2703 Bacteria 1MVNW@1224,1RP6K@1236,3Z3B8@583,COG1105@1,COG1105@2 NA|NA|NA H belongs to the carbohydrate kinase PfkB family Z1_01913 529507.PMI2156 2e-32 144.4 Proteus yaaA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K14761 ko00000,ko03009 Bacteria 1N7NW@1224,1SCJU@1236,3Z30H@583,COG2501@1,COG2501@2 NA|NA|NA S S4 domain Z1_01914 529507.PMI2155 2.8e-165 587.8 Proteus folD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004477,GO:0004486,GO:0004488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0019238,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042558,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901564 1.5.1.5,3.5.4.9 ko:K01491 ko00670,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00670,map00720,map01100,map01120,map01200 M00140,M00377 R01220,R01655 RC00202,RC00578 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSDY_1059.SDY_0281 Bacteria 1MWU4@1224,1RNSW@1236,3Z1J9@583,COG0190@1,COG0190@2 NA|NA|NA F Catalyzes the oxidation of 5,10- methylenetetrahydrofolate to 5,10-methenyltetrahydrofolate and then the hydrolysis of 5,10-methenyltetrahydrofolate to 10- formyltetrahydrofolate Z1_01916 34506.g3162 1.3e-191 675.6 Eukaryota Eukaryota 2D6RD@1,2T2RB@2759 NA|NA|NA S Phage integrase family Z1_01917 471874.PROSTU_04474 2.4e-21 107.5 Providencia Bacteria 1NKJQ@1224,1SJHF@1236,2EJD7@1,33D48@2,3ZAC7@586 NA|NA|NA Z1_01918 585.DR95_337 6e-111 406.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1R553@1224,1RZ8I@1236,COG4725@1,COG4725@2 NA|NA|NA KT Belongs to the MT-A70-like family Z1_01919 471874.PROSTU_04472 3.8e-19 100.9 Providencia Bacteria 1NJJX@1224,1SGWY@1236,2DSIH@1,33G9Z@2,3ZADP@586 NA|NA|NA S Psort location Cytoplasmic, score 8.96 Z1_01920 406818.XBJ1_1165 1.8e-20 104.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1P7IJ@1224,1SWFZ@1236,291HQ@1,2ZP49@2 NA|NA|NA Z1_01921 585.DR95_507 1.4e-13 81.3 Proteus Bacteria 1NKYJ@1224,1SU7W@1236,28U47@1,2ZGA7@2,3Z3K1@583 NA|NA|NA Z1_01928 529507.PMI2747 2.2e-72 278.5 Proteus ssb GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0030234,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RCWT@1224,1S3WP@1236,3Z2FV@583,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L Plays an important role in DNA replication, recombination and repair. Binds to ssDNA and to an array of partner proteins to recruit them to their sites of action during DNA metabolism Z1_01929 28152.DJ57_2593 3.9e-56 224.6 Proteobacteria Bacteria 1N3WF@1224,2CJW6@1,32SAX@2 NA|NA|NA Z1_01930 28152.DJ57_2592 3.2e-115 421.4 Gammaproteobacteria recB 3.1.11.5,3.6.4.12 ko:K03582,ko:K16898 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1QUUZ@1224,1T21W@1236,COG1074@1,COG1074@2 NA|NA|NA L PDDEXK-like domain of unknown function (DUF3799) Z1_01932 529507.PMI0470 6.9e-27 126.3 Proteus Bacteria 1QGK4@1224,1TE0E@1236,29W3X@1,30HNQ@2,3Z3GT@583 NA|NA|NA Z1_01934 633.DJ40_4110 9.8e-08 62.0 Yersinia Bacteria 1PBQH@1224,1STFZ@1236,28V3X@1,2ZH7A@2,41HRA@629 NA|NA|NA Z1_01938 529507.PMI0474 3.3e-27 127.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1P5KR@1224,1SUDA@1236,299J6@1,2ZWMP@2 NA|NA|NA Z1_01943 1141663.OOC_13779 2.4e-69 268.9 Providencia MA20_34720 3.4.21.88 ko:K01356 M00729 ko00000,ko00002,ko01000,ko01002,ko03400 Bacteria 1QER3@1224,1TC3X@1236,3ZAB3@586,COG2932@1,COG2932@2 NA|NA|NA K Peptidase S24-like Z1_01944 1344012.ATMI01000052_gene1957 2.4e-10 70.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1NGKU@1224,1SI28@1236,2EN86@1,33FVZ@2 NA|NA|NA S Cro Z1_01945 529507.PMI0481 4e-12 77.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1NAX8@1224,1SD0Y@1236,2EEGI@1,338AC@2 NA|NA|NA Z1_01947 716541.ECL_01305 6.6e-108 397.5 Enterobacter Bacteria 1PR7F@1224,1RUV3@1236,3X42S@547,COG0640@1,COG0640@2 NA|NA|NA L Bacteriophage replication protein O Z1_01948 925984.E5AGF0_9CAUD 1.6e-154 552.7 Myoviridae Viruses 4QAWG@10239,4QI76@10662,4QPII@28883,4QV6X@35237 NA|NA|NA S DNA helicase activity Z1_01951 585.DR95_365 2.7e-32 144.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1P53X@1224,1SV49@1236,28YY5@1,2ZKR4@2 NA|NA|NA Z1_01954 585.DR95_367 3.5e-44 183.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1NXUI@1224,1SPTI@1236,2F68Y@1,33YSR@2 NA|NA|NA S Restriction alleviation protein Lar Z1_01955 471874.PROSTU_04431 6.1e-76 290.0 Providencia Bacteria 1QJAF@1224,1TKHH@1236,29XIR@1,30J9P@2,3ZACB@586 NA|NA|NA S NinB protein Z1_01957 1147139.A0A0A6Z5B6_9CAUD 2.6e-20 104.0 Podoviridae Viruses 4QAZF@10239,4QNEM@10744,4QPH6@28883,4QUTY@35237 NA|NA|NA S Protein of unknwon function (DUF3310) Z1_01958 585.DR95_371 1.3e-119 435.6 Gammaproteobacteria pphA 3.1.3.16 ko:K07313 ko00000,ko01000 Bacteria 1N106@1224,1S9QJ@1236,COG0639@1,COG0639@2 NA|NA|NA T Serine Threonine protein Z1_01961 529507.PMI0485 7.8e-40 169.5 Gammaproteobacteria ybcO Bacteria 1N2ZM@1224,1S9DB@1236,2D7I9@1,32TP3@2 NA|NA|NA S phage protein Z1_01962 406818.XBJ1_1196 2.9e-44 184.5 Gammaproteobacteria rusA GO:0000217,GO:0000400,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008821,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016889,GO:0016894,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363 3.1.22.4 ko:K01160 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1N92D@1224,1S738@1236,COG4570@1,COG4570@2 NA|NA|NA L Endonuclease that resolves Holliday junction intermediates made during homologous genetic recombination and DNA repair. Exhibits sequence and structure-selective cleavage of four-way DNA junctions, where it introduces symmetrical nicks in two strands of the same polarity at the 5' side of dinucleotides. Corrects the defects in genetic recombination and DNA repair associated with inactivation of ruvAB or ruvC Z1_01964 521000.PROVRETT_06000 4e-76 290.8 Providencia Bacteria 1REEZ@1224,1S4WI@1236,28KJX@1,2ZA4V@2,3Z9S9@586 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1133) Z1_01966 585.DR95_377 8.4e-53 212.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1N2MJ@1224,1S9ZI@1236,2E2ZM@1,32WXG@2 NA|NA|NA S LydA holin phage, holin superfamily III Z1_01967 585.DR95_378 1.2e-65 255.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1MZGP@1224,1SE04@1236,2DNV9@1,32ZB3@2 NA|NA|NA Z1_01968 471874.PROSTU_01893 2.1e-37 161.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1N72G@1224,1SC9P@1236,2DQJ7@1,3377H@2 NA|NA|NA Z1_01970 529507.PMI0493 1.2e-103 382.5 Proteus Bacteria 1N0VX@1224,1SACX@1236,3Z3JR@583,COG3617@1,COG3617@2 NA|NA|NA K BRO family, N-terminal domain Z1_01971 529507.PMI0494 2.1e-31 141.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1NMTR@1224,1SGAN@1236,2EH9C@1,33B17@2 NA|NA|NA Z1_01973 520999.PROVALCAL_02582 3.3e-20 103.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NIGF@1224,1SGNM@1236,2EUNU@1,33N4P@2 NA|NA|NA Z1_01974 471874.PROSTU_01900 1.6e-65 255.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1N3JB@1224,1SBAK@1236,2CXUI@1,32T2N@2 NA|NA|NA S DNA-packaging protein gp3 Z1_01975 471874.PROSTU_01901 3.5e-222 777.3 Providencia ko:K06909 ko00000 Bacteria 1R66A@1224,1RQFD@1236,3Z9G2@586,COG1783@1,COG1783@2 NA|NA|NA S Phage terminase, large subunit, PBSX family Z1_01976 1147140.H6WRT0_9CAUD 1.1e-157 563.1 Viruses Viruses 4QC8M@10239 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1073) Z1_01977 82995.CR62_24300 1.1e-103 383.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1MY2T@1224,1RR6M@1236,COG2369@1,COG2369@2 NA|NA|NA S Phage Mu protein F like protein Z1_01978 1073754.G0ZND7_9VIRU 2.5e-151 542.0 Viruses Viruses 4QBXF@10239 NA|NA|NA Z1_01979 82995.CR62_24310 1.2e-44 186.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1RCQU@1224,1S3CK@1236,28R0E@1,2ZDF4@2 NA|NA|NA Z1_01980 1073754.G0ZND9_9VIRU 7.5e-144 516.9 Viruses Viruses 4QGIT@10239 NA|NA|NA Z1_01981 1073754.G0ZNE0_9VIRU 2.5e-09 67.4 Viruses Viruses 4QGHP@10239 NA|NA|NA Z1_01982 1168549.I6S619_9CAUD 2.6e-54 218.0 Siphoviridae Viruses 4QEE4@10239,4QN4V@10699,4QPNF@28883,4QZFB@35237 NA|NA|NA Z1_01983 585.DR95_389 2e-23 115.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RK0M@1224,1S7SB@1236,2DMD2@1,32NPC@2 NA|NA|NA Z1_01984 571.MC52_18255 7.8e-45 186.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1RH4Q@1224,1S6AQ@1236,2DM4J@1,31PM5@2 NA|NA|NA Z1_01985 471874.PROSTU_01911 4.4e-32 144.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RGRP@1224,1S44C@1236,2A38R@1,30RQI@2 NA|NA|NA Z1_01986 585.DR95_392 3.5e-132 477.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1QI2T@1224,1RQ6J@1236,COG5492@1,COG5492@2 NA|NA|NA N domain, Protein Z1_01987 585.DR95_393 7.6e-118 429.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1R2EK@1224,1S1PE@1236,2DBJZ@1,2Z9PF@2 NA|NA|NA Z1_01988 1005994.GTGU_00279 2.2e-17 95.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1P9KC@1224,1SUB7@1236,28SX0@1,2ZF6H@2 NA|NA|NA Z1_01989 82995.CR62_24370 7.8e-09 67.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1P7WS@1224,1ST6Y@1236,29AWM@1,2ZXVS@2 NA|NA|NA Z1_01990 585.DR95_406 1.5e-275 956.1 Gammaproteobacteria GO:0006884,GO:0008150,GO:0008361,GO:0009987,GO:0009992,GO:0016043,GO:0019725,GO:0030104,GO:0032535,GO:0042592,GO:0048878,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0090066 ko:K05802 ko00000,ko02000 1.A.23.1.1 Bacteria 1MX2R@1224,1SYI1@1236,COG3096@1,COG3096@2,COG5281@1,COG5281@2 NA|NA|NA D tape measure protein Z1_01991 640513.Entas_2666 7.2e-59 233.4 Enterobacter Bacteria 1RKER@1224,1S7CB@1236,2AXDP@1,31PD1@2,3X3ZG@547 NA|NA|NA Z1_01992 1005994.GTGU_00316 8.7e-49 199.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1RB9E@1224,1S3CZ@1236,28NWF@1,2ZBUB@2 NA|NA|NA Z1_01993 640513.Entas_2664 5e-42 177.2 Enterobacter Bacteria 1MYEI@1224,1S8J6@1236,3X40E@547,COG0791@1,COG0791@2 NA|NA|NA M NlpC/P60 family Z1_01994 82995.CR62_24395 2.4e-262 911.8 Gammaproteobacteria imd 3.2.1.94 ko:K20847 ko00000,ko01000 GH27 Bacteria 1R80U@1224,1RQNU@1236,COG4733@1,COG4733@2 NA|NA|NA S cellulase activity Z1_01995 716541.ECL_03181 9.7e-51 208.4 Bacteria GO:0000272,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0010383,GO:0010391,GO:0010410,GO:0016052,GO:0016787,GO:0016788,GO:0017144,GO:0042737,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0045491,GO:0045493,GO:0046555,GO:0052689,GO:0071554,GO:0071704,GO:1901575,GO:2000884 Bacteria COG2755@1,COG2755@2 NA|NA|NA E lipolytic protein G-D-S-L family Z1_01996 90371.CY43_03070 1.7e-83 317.0 Salmonella Bacteria 1RJCC@1224,1S7U9@1236,2A87T@1,328SX@2,3ZMTE@590 NA|NA|NA Z1_01997 1141663.OOC_15319 2.2e-149 535.0 Providencia yfdH GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K20534 ko00000,ko01000,ko01005,ko02000 4.D.2.1.9 GT2 Bacteria 1MWE5@1224,1RPCE@1236,3Z8H9@586,COG0463@1,COG0463@2 NA|NA|NA M Catalyzes the transfer of 4-deoxy-4-formamido-L- arabinose from UDP to undecaprenyl phosphate. The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_01998 529507.PMI2154 7.8e-126 456.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_01999 529507.PMI2153 4e-56 223.8 Proteus arsR GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0043170,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0046685,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03892,ko:K21903 ko00000,ko03000 Bacteria 1MZT1@1224,1SAI5@1236,3Z2TS@583,COG0640@1,COG0640@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Arsenical Resistance Operon Repressor Z1_02000 529507.PMI2152 2.5e-231 807.7 Proteus arsB ko:K03893 ko00000,ko02000 2.A.45.1,3.A.4.1 Bacteria 1MUX4@1224,1RMAV@1236,3Z2FZ@583,COG1055@1,COG1055@2 NA|NA|NA P Involved in arsenical resistance. Thought to form the channel of an arsenite pump Z1_02001 529507.PMI2151 8.5e-162 576.2 Proteus yddE 5.3.3.17 ko:K06998 ko00405,ko01130,ko02024,map00405,map01130,map02024 M00835 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUAS@1224,1S0T9@1236,3Z0W5@583,COG0384@1,COG0384@2 NA|NA|NA S Phenazine biosynthesis-like protein Z1_02002 529507.PMI2149 1.4e-270 938.3 Proteus 1.5.3.1 ko:K00303 ko00260,ko01100,map00260,map01100 R00610 RC00060,RC00557 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU7M@1224,1RP7W@1236,3Z3AX@583,COG0665@1,COG0665@2 NA|NA|NA E FAD dependent oxidoreductase Z1_02003 529507.PMI2148 2.3e-107 394.8 Proteus thiJ 2.7.11.1,3.5.1.124 ko:K03152,ko:K05520,ko:K12132 ko00000,ko01000,ko01001,ko01002 Bacteria 1P4JD@1224,1RZ4J@1236,3Z1Z3@583,COG0693@1,COG0693@2 NA|NA|NA S DJ-1/PfpI family Z1_02004 529507.PMI2147 3.1e-113 414.5 Proteus eda GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 2.7.1.45,4.1.2.14,4.1.3.42 ko:K00874,ko:K01625 ko00030,ko00630,ko01100,ko01120,ko01200,map00030,map00630,map01100,map01120,map01200 M00008,M00061,M00308,M00631 R00470,R01541,R05605 RC00002,RC00017,RC00307,RC00308,RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUVJ@1224,1RPDF@1236,3Z1V6@583,COG0800@1,COG0800@2 NA|NA|NA G KDPG and KHG aldolase Z1_02005 529507.PMI2146 1.6e-190 671.8 Proteus kdgK 2.7.1.45 ko:K00874 ko00030,ko01100,ko01120,ko01200,map00030,map01100,map01120,map01200 M00061,M00308,M00631 R01541 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVG2@1224,1RNH5@1236,3Z11S@583,COG0524@1,COG0524@2 NA|NA|NA G pfkB family carbohydrate kinase Z1_02006 529507.PMI2145 1.1e-161 575.9 Proteus gatY 4.1.2.40 ko:K08302 ko00052,ko01100,map00052,map01100 R01069 RC00438,RC00439 ko00000,ko00001,ko01000 iPC815.YPO0844 Bacteria 1MURX@1224,1RQUC@1236,3Z236@583,COG0191@1,COG0191@2 NA|NA|NA H Class II aldolase, tagatose bisphosphate family Z1_02007 529507.PMI2144 1.3e-292 1011.5 Proteus YPO0843 Bacteria 1MWVR@1224,1RNTP@1236,3Z1V7@583,COG4289@1,COG4289@2 NA|NA|NA S protein conserved in bacteria Z1_02008 529507.PMI2143 0.0 1109.4 Proteus ydeN ko:K01138 ko00000,ko01000 Bacteria 1MV92@1224,1RPM3@1236,3Z22Z@583,COG3119@1,COG3119@2 NA|NA|NA P Sulfatase Z1_02009 529507.PMI2142 7e-247 859.4 Proteus Z012_03470 ko:K06871 ko00000 Bacteria 1MX3M@1224,1RN4R@1236,3Z0UY@583,COG0641@1,COG0641@2 NA|NA|NA C radical SAM domain protein Z1_02010 529507.PMI2141 2.6e-138 498.0 Proteus agaR ko:K02081 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUJT@1224,1SZXU@1236,3Z1TH@583,COG1349@1,COG1349@2 NA|NA|NA K DeoR C terminal sensor domain Z1_02011 34506.g1488 2e-249 867.8 Eukaryota Eukaryota 2EC94@1,2SI5X@2759 NA|NA|NA S Tagatose 6 phosphate kinase Z1_02012 529507.PMI2139 1.5e-222 778.5 Proteus agaS GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006040,GO:0006044,GO:0006046,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008448,GO:0008643,GO:0009056,GO:0009401,GO:0015144,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019213,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034219,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046348,GO:0051119,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901071,GO:1901072,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901575 ko:K02082 ko00000,ko01000 Bacteria 1NICK@1224,1RRU0@1236,3Z12P@583,COG2222@1,COG2222@2 NA|NA|NA M isomerase Z1_02013 529507.PMI2138 4.5e-88 330.5 Proteus agaV 2.7.1.191 ko:K02745,ko:K02794 ko00051,ko00052,ko00520,ko01100,ko02060,map00051,map00052,map00520,map01100,map02060 M00276,M00277 R02630,R08366 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.6.1,4.A.6.1.4 Bacteria 1R4ES@1224,1RQ2P@1236,3Z2WM@583,COG3444@1,COG3444@2 NA|NA|NA G PTS system sorbose subfamily IIB component Z1_02014 529507.PMI2137 1.4e-123 449.1 Proteus agaC ko:K02746 ko00052,ko02060,map00052,map02060 M00277 R08366 RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 4.A.6.1.4 Bacteria 1NBYA@1224,1RQ1Z@1236,3Z18A@583,COG3715@1,COG3715@2 NA|NA|NA G PTS system sorbose-specific iic component Z1_02015 529507.PMI2136 3.8e-162 577.4 Proteus agaD ko:K02747,ko:K02796 ko00051,ko00052,ko00520,ko01100,ko02060,map00051,map00052,map00520,map01100,map02060 M00276,M00277 R02630,R08366 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 4.A.6.1,4.A.6.1.4 Bacteria 1N45J@1224,1RSNE@1236,3Z1VP@583,COG3716@1,COG3716@2 NA|NA|NA G PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component Z1_02016 529507.PMI2135 1e-72 279.3 Proteus agaF ko:K02744 ko00052,ko02060,map00052,map02060 M00277,M00287 R08366,R08367 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.6.1.4,4.A.6.1.5 Bacteria 1QN6S@1224,1S5MC@1236,3Z2JX@583,COG2893@1,COG2893@2 NA|NA|NA G PTS system fructose IIA component Z1_02017 529507.PMI2134 2.1e-224 784.6 Proteus Z012_03490 3.5.1.25 ko:K02079 ko00052,map00052 R05168 RC00166,RC00300 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW8Y@1224,1RMRV@1236,3Z1TR@583,COG1820@1,COG1820@2 NA|NA|NA G Belongs to the metallo-dependent hydrolases superfamily. NagA family Z1_02018 529507.PMI2133 3.9e-161 573.9 Proteus kduI GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006063,GO:0006064,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008697,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016054,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0019585,GO:0019586,GO:0019698,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042802,GO:0042839,GO:0042840,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046365,GO:0046395,GO:0046396,GO:0046397,GO:0046872,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 5.3.1.17 ko:K01815 ko00040,map00040 R04383 RC00541 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU9D@1224,1RPDB@1236,3Z185@583,COG3717@1,COG3717@2 NA|NA|NA G Catalyzes the isomerization of 5-dehydro-4-deoxy-D- glucuronate to 3-deoxy-D-glycero-2,5-hexodiulosonate Z1_02019 529507.PMI2132 7.5e-135 486.5 Proteus Bacteria 1MWB6@1224,1RMZB@1236,3Z25Q@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_02020 529507.PMI2131 2.5e-208 731.1 Proteus yteR Bacteria 1NSJK@1224,1T1DP@1236,3Z2AK@583,COG4225@1,COG4225@2 NA|NA|NA S Glycosyl Hydrolase Family 88 Z1_02021 529507.PMI2128 0.0 2016.1 Proteus ChABCII 4.2.2.20,4.2.2.21 ko:K08961 ko00000,ko01000 Bacteria 1PYRU@1224,1RXQJ@1236,28IHV@1,2Z8J1@2,3Z15M@583 NA|NA|NA H Broad-specificity glycosaminoglycan lyase Z1_02022 529507.PMI2127 0.0 2066.6 Proteus Z012_00015 4.2.2.20,4.2.2.21 ko:K08961 ko00000,ko01000 Bacteria 1PYRU@1224,1RXQJ@1236,28IHV@1,2Z8J1@2,3Z13N@583 NA|NA|NA H Chondroitin sulfate ABC lyase Z1_02023 529507.PMI2126 0.0 1427.5 Proteus Z012_00010 Bacteria 1R49X@1224,1S0J6@1236,3Z0VR@583,COG4625@1,COG4625@2 NA|NA|NA S Autotransporter beta-domain Z1_02024 529507.PMI2125 6.9e-172 609.8 Proteus Z012_07760 Bacteria 1RF4F@1224,1S54Q@1236,29VHR@1,30GZR@2,3Z0XG@583 NA|NA|NA S OMPG-porin 1 family Z1_02025 529507.PMI2124 0.0 1086.2 Proteus Z012_03425 3.1.6.14 ko:K01137,ko:K01138 ko00531,ko01100,ko04142,map00531,map01100,map04142 M00078,M00079 R07808,R07819 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MV0B@1224,1RMSX@1236,3Z14W@583,COG3119@1,COG3119@2 NA|NA|NA P Sulfatase Z1_02027 529507.PMI2123 2.4e-86 324.7 Proteus iucB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009237,GO:0009712,GO:0009987,GO:0016289,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0018958,GO:0019184,GO:0019290,GO:0019540,GO:0019748,GO:0034641,GO:0040007,GO:0043043,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044550,GO:0047617,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615 1.17.1.8,2.3.1.102,2.3.1.128,2.3.1.82,6.3.2.38 ko:K00215,ko:K00663,ko:K03789,ko:K03790,ko:K03894,ko:K03896,ko:K06140,ko:K18816,ko:K21992 ko00261,ko00300,ko00310,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00261,map00300,map00310,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R03168,R04198,R04199,R10090 RC00004,RC00064,RC00090,RC00478,RC00865 br01600,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01504,ko03000,ko03009 iNJ661.Rv1347c Bacteria 1QUE8@1224,1T1VT@1236,3Z2QZ@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J COG1670 acetyltransferases, including N-acetylases of ribosomal proteins Z1_02028 529507.PMI2122 3.9e-115 421.0 Proteus Bacteria 1QCQY@1224,1T8H3@1236,3Z2WE@583,COG5295@1,COG5295@2 NA|NA|NA UW Head domain of trimeric autotransporter adhesin Z1_02029 529507.PMI2121 2.8e-151 541.2 Proteus Z012_10240 Bacteria 1MW2B@1224,1RNDZ@1236,3Z0WE@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_02030 585.DR95_2853 2.2e-09 67.8 Proteus Bacteria 1QGNF@1224,1TE3J@1236,2BTA0@1,32NFH@2,3Z3JZ@583 NA|NA|NA Z1_02031 529507.PMI2120 3.4e-100 370.9 Proteus yceJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K12262 ko00000 Bacteria 1MZ7X@1224,1S3RF@1236,3Z2IE@583,COG3038@1,COG3038@2 NA|NA|NA C Prokaryotic cytochrome b561 Z1_02032 529507.PMI2119 1.4e-104 385.6 Proteus yceI Bacteria 1R9XD@1224,1S24R@1236,3Z3DN@583,COG2353@1,COG2353@2 NA|NA|NA S YceI-like domain Z1_02033 34506.g4888 2.4e-203 714.5 Opisthokonta Opisthokonta 2CSBN@1,2RB69@2759,3AQXZ@33154 NA|NA|NA S Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family Z1_02034 529507.PMI2117 3e-207 727.6 Proteus kch GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015318,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022607,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0055085,GO:0065003,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071840,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K10716 ko00000,ko02000 1.A.1.1,1.A.1.13,1.A.1.17,1.A.1.24,1.A.1.25,1.A.1.6 iEC042_1314.EC042_1304,iECUMN_1333.ECUMN_1549 Bacteria 1R3QQ@1224,1RPFS@1236,3Z1SH@583,COG1226@1,COG1226@2 NA|NA|NA P Potassium channel Z1_02035 529507.PMI2116 7.4e-163 579.7 Proteus tehB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008757,GO:0016740,GO:0016741,GO:0032259,GO:0044424,GO:0044464 2.1.1.265 ko:K03647,ko:K16868 ko00000,ko01000 Bacteria 1QUE9@1224,1T1VU@1236,3Z1VE@583,COG2227@1,COG2227@2,COG3615@1,COG3615@2 NA|NA|NA HP Tellurite resistance protein TehB Z1_02036 529507.PMI2115 3e-246 857.4 Proteus clcA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006821,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015299,GO:0015318,GO:0015672,GO:0015698,GO:0015706,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031404,GO:0034220,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1902600 ko:K03281 ko00000 2.A.49 iAF1260.b0155,iB21_1397.B21_00153,iBWG_1329.BWG_0148,iE2348C_1286.E2348C_0162,iEC042_1314.EC042_0155,iEC55989_1330.EC55989_0149,iECBD_1354.ECBD_3463,iECDH10B_1368.ECDH10B_0135,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0149,iECD_1391.ECD_00154,iECIAI1_1343.ECIAI1_0153,iECO103_1326.ECO103_0155,iECSE_1348.ECSE_0156,iECUMN_1333.ECUMN_0152,iECW_1372.ECW_m0152,iEKO11_1354.EKO11_3761,iETEC_1333.ETEC_0151,iEcDH1_1363.EcDH1_3447,iEcE24377_1341.EcE24377A_0160,iEcolC_1368.EcolC_3504,iJO1366.b0155,iSSON_1240.SSON_0167,iUMNK88_1353.UMNK88_159,iWFL_1372.ECW_m0152,iY75_1357.Y75_RS00790,iZ_1308.Z0166 Bacteria 1MV4K@1224,1RQJW@1236,3Z1PX@583,COG0038@1,COG0038@2 NA|NA|NA P Voltage gated chloride channel Z1_02037 529507.PMI2114 2.2e-252 877.9 Proteus alsT ko:K03310 ko00000 2.A.25 Bacteria 1MUI3@1224,1RMNF@1236,3Z1JC@583,COG1115@1,COG1115@2 NA|NA|NA E Sodium:alanine symporter family Z1_02038 529507.PMI2113 4.4e-280 969.9 Proteus aldA 1.2.1.3 ko:K00128 ko00010,ko00053,ko00071,ko00280,ko00310,ko00330,ko00340,ko00380,ko00410,ko00561,ko00620,ko00625,ko00903,ko00981,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,map00010,map00053,map00071,map00280,map00310,map00330,map00340,map00380,map00410,map00561,map00620,map00625,map00903,map00981,map01100,map01110,map01120,map01130 M00135 R00264,R00631,R00710,R00904,R01752,R01986,R02549,R02678,R02940,R02957,R03283,R03869,R04065,R04506,R04903,R05050,R05237,R05238,R05286,R06366,R08146 RC00047,RC00071,RC00080,RC00186,RC00218,RC00242,RC00816,RC01500 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU1V@1224,1RMBQ@1236,3Z1R3@583,COG1012@1,COG1012@2 NA|NA|NA C Aldehyde dehydrogenase family Z1_02039 529507.PMI2112 0.0 1109.4 Proteus hcp GO:0000302,GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004601,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010035,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016661,GO:0016684,GO:0017144,GO:0034641,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042542,GO:0042737,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0046209,GO:0046210,GO:0046677,GO:0050418,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0072593,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901700,GO:1990748,GO:2001057 1.7.99.1 ko:K05601 ko00910,map00910 R00143 RC02797 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N88B@1224,1RP1I@1236,3Z2CA@583,COG0369@1,COG1151@2 NA|NA|NA C Catalyzes the reduction of hydroxylamine to form NH(3) and H(2)O Z1_02040 529507.PMI2111 1.9e-194 684.9 Proteus hcr GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016651,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0055114,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363 ko:K11933 ko00000,ko01000 Bacteria 1MY2Q@1224,1RR5A@1236,3Z1MK@583,COG1018@1,COG1018@2 NA|NA|NA C Oxidoreductase FAD-binding domain Z1_02041 529507.PMI2110 1.2e-52 212.2 Proteus Bacteria 1NFS0@1224,1SFVA@1236,2CBN4@1,337IC@2,3Z2VI@583 NA|NA|NA Z1_02042 529507.PMI2109 2.3e-190 671.4 Proteus mgtE 3.6.1.1 ko:K04767,ko:K06213,ko:K15986 ko00190,map00190 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 1.A.26.1 Bacteria 1MW24@1224,1RYH1@1236,3Z26I@583,COG2239@1,COG2239@2 NA|NA|NA P Acts as a magnesium transporter Z1_02043 529507.PMI2108 4.9e-72 276.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1NDA2@1224,1SEEN@1236,2EDK2@1,337FV@2 NA|NA|NA S Toxin YafO, type II toxin-antitoxin system Z1_02044 529507.PMI2107 9.3e-101 372.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1NTJQ@1224,1SMA9@1236,2EWRW@1,33Q3K@2 NA|NA|NA Z1_02045 529507.PMI2105 4.1e-92 344.0 Proteus sprT ko:K02742 ko00000 Bacteria 1RJW4@1224,1S70F@1236,3Z2N5@583,COG3091@1,COG3091@2 NA|NA|NA S SprT-like zinc ribbon domain Z1_02046 529507.PMI2104 2.9e-51 207.6 Proteus bigR Bacteria 1N72Q@1224,1SCH5@1236,3Z2WU@583,COG0640@1,COG0640@2 NA|NA|NA K HxlR-like helix-turn-helix Z1_02047 529507.PMI2103 8.5e-75 286.2 Proteus ko:K07112 ko00000 Bacteria 1MZ3A@1224,1S95T@1236,3Z2J0@583,COG2391@1,COG2391@2 NA|NA|NA S transporter component Z1_02048 529507.PMI2102 1.9e-71 275.0 Proteus ko:K07112 ko00000 Bacteria 1MZC0@1224,1S8UB@1236,3Z2WC@583,COG2391@1,COG2391@2 NA|NA|NA S Transporter Component Z1_02049 529507.PMI2101 0.0 2161.0 Gammaproteobacteria bcsC ko:K07272,ko:K13486,ko:K20543,ko:K21007 ko02020,ko02025,map02020,map02025 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko01005,ko02000 1.B.55.3 Bacteria 1MVB8@1224,1RPSN@1236,COG0457@1,COG0457@2,COG3071@1,COG3071@2,COG4775@1,COG4775@2,COG5010@1,COG5010@2 NA|NA|NA M Cellulose synthase Z1_02050 529507.PMI2100 0.0 1520.0 Proteus bcsB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K20541 ko00000,ko02000 4.D.3.1.6 Bacteria 1MWF8@1224,1RPJ6@1236,3Z3A7@583,COG1215@1,COG1215@2 NA|NA|NA M Bacterial cellulose synthase subunit Z1_02051 529507.PMI2099 0.0 1739.9 Proteus bcsA GO:0000271,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006073,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009250,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0030243,GO:0030244,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044042,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044464,GO:0051273,GO:0051274,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090540,GO:1901576 2.4.1.12 ko:K00694 ko00500,ko01100,ko02026,map00500,map01100,map02026 R02889 RC00005 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko02000 4.D.3.1.2,4.D.3.1.5,4.D.3.1.6 GT2 Bacteria 1MWF8@1224,1RPJ6@1236,3Z3D0@583,COG1215@1,COG1215@2 NA|NA|NA M Cellulose synthase Z1_02052 529507.PMI2098 2.9e-139 501.1 Proteus parA ko:K03496 ko00000,ko03036,ko04812 Bacteria 1MXFI@1224,1RYAG@1236,3Z37S@583,COG1192@1,COG1192@2 NA|NA|NA D Cellulose biosynthesis protein BcsQ Z1_02053 529507.PMI2097 5.5e-26 122.9 Proteus Bacteria 1QNTF@1224,1TMF1@1236,2AZ33@1,31R9D@2,3Z3JG@583 NA|NA|NA S Cellulose biosynthesis protein BcsR Z1_02054 529507.PMI2096 0.0 1093.2 Proteus kbaA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0016020,GO:0022603,GO:0042173,GO:0043937,GO:0043938,GO:0044464,GO:0045595,GO:0045597,GO:0045881,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051094,GO:0065007,GO:0071944 2.7.8.42,2.7.8.43 ko:K03760,ko:K06349,ko:K12975,ko:K19353 ko00540,ko01503,map00540,map01503 M00722,M00723 R11204,R11205,R11555,R11556,R11557 RC00002,RC00017,RC00428 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1MWJY@1224,1RN4T@1236,3Z3A1@583,COG2194@1,COG2194@2 NA|NA|NA S Cellulose biosynthesis protein BcsG Z1_02055 529507.PMI2095 6.8e-212 743.0 Proteus metK GO:0000096,GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004478,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006555,GO:0006556,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009069,GO:0009108,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0017076,GO:0017144,GO:0019752,GO:0030554,GO:0030955,GO:0031420,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0033353,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042278,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046128,GO:0046439,GO:0046483,GO:0046498,GO:0046500,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901657 2.5.1.6 ko:K00789 ko00270,ko01100,ko01110,ko01230,map00270,map01100,map01110,map01230 M00034,M00035,M00368,M00609 R00177,R04771 RC00021,RC01211 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_4967,iYL1228.KPN_03375 Bacteria 1MUFQ@1224,1RNV6@1236,3Z2E2@583,COG0192@1,COG0192@2 NA|NA|NA H Catalyzes the formation of S-adenosylmethionine (AdoMet) from methionine and ATP. The overall synthetic reaction is composed of two sequential steps, AdoMet formation and the subsequent tripolyphosphate hydrolysis which occurs prior to release of AdoMet from the enzyme Z1_02056 529507.PMI2094 0.0 1285.4 Proteus speA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006525,GO:0006527,GO:0006576,GO:0006595,GO:0006596,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008792,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009064,GO:0009065,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009445,GO:0009446,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042401,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606 4.1.1.19 ko:K01585 ko00330,ko01100,map00330,map01100 M00133 R00566 RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_3590,iE2348C_1286.E2348C_3191,iEC55989_1330.EC55989_3231,iECABU_c1320.ECABU_c32250,iECED1_1282.ECED1_3401,iECIAI1_1343.ECIAI1_3071,iECIAI39_1322.ECIAI39_3358,iECO103_1326.ECO103_3518,iECO26_1355.ECO26_4037,iECOK1_1307.ECOK1_3327,iECP_1309.ECP_2933,iECS88_1305.ECS88_3221,iECSE_1348.ECSE_3207,iECSF_1327.ECSF_2737,iECSP_1301.ECSP_3909,iECUMN_1333.ECUMN_3290,iECW_1372.ECW_m3198,iECs_1301.ECs3814,iEKO11_1354.EKO11_0788,iEcE24377_1341.EcE24377A_3281,iEcHS_1320.EcHS_A3096,iEcolC_1368.EcolC_0773,iG2583_1286.G2583_3597,iIT341.HP0422,iLF82_1304.LF82_2157,iNRG857_1313.NRG857_14440,iPC815.YPO0929,iSBO_1134.SBO_3051,iSDY_1059.SDY_3134,iSSON_1240.SSON_3092,iSbBS512_1146.SbBS512_E3371,iWFL_1372.ECW_m3198,iZ_1308.Z4283 Bacteria 1MU80@1224,1RP2J@1236,3Z16U@583,COG1166@1,COG1166@2 NA|NA|NA H biosynthetic arginine decarboxylase Z1_02057 529507.PMI2093 3.6e-179 634.0 Proteus speB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006576,GO:0006595,GO:0006596,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008783,GO:0009058,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009445,GO:0009446,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016813,GO:0030145,GO:0034641,GO:0042401,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.5.3.11 ko:K01480,ko:K12541 ko00330,ko01100,ko02010,map00330,map01100,map02010 M00133,M00330 R01157 RC00024,RC00329 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000,ko02044 3.A.1.109.3,3.A.1.109.4 iB21_1397.B21_02730,iECB_1328.ECB_02767,iECD_1391.ECD_02767,iSbBS512_1146.SbBS512_E3370 Bacteria 1MVFH@1224,1RMH5@1236,3Z1D3@583,COG0010@1,COG0010@2 NA|NA|NA F Catalyzes the formation of putrescine from agmatine Z1_02058 529507.PMI2092 4e-139 500.7 Proteus Bacteria 1MVQW@1224,1RNY1@1236,3Z35E@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_02059 529507.PMI2090 3.5e-55 220.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1N1JW@1224,1S97N@1236,COG3636@1,COG3636@2 NA|NA|NA K addiction module antidote protein Z1_02060 529507.PMI2089 1.3e-125 455.7 Proteus mutH GO:0000018,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009036,GO:0009987,GO:0015666,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016888,GO:0016893,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0032300,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043765,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1990391 ko:K03573 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MVYX@1224,1RQVV@1236,3Z21F@583,COG3066@1,COG3066@2 NA|NA|NA L Sequence-specific endonuclease that cleaves unmethylated GATC sequences. It is involved in DNA mismatch repair Z1_02061 34506.g680 0.0 1164.4 Bilateria Metazoa 2F7PI@1,2T8SZ@2759,3AHV8@33154,3BX1I@33208,3DDYA@33213 NA|NA|NA S Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_02062 529507.PMI2087 3.8e-113 414.1 Proteus leuD GO:0003674,GO:0003824,GO:0003861,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006551,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009098,GO:0009316,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016866,GO:0019752,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 4.2.1.33,4.2.1.35 ko:K01704 ko00290,ko00660,ko01100,ko01110,ko01210,ko01230,map00290,map00660,map01100,map01110,map01210,map01230 M00432,M00535 R03896,R03898,R03968,R04001,R10170 RC00976,RC00977,RC01041,RC01046,RC03072 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVXB@1224,1RNMK@1236,3Z1FH@583,COG0066@1,COG0066@2 NA|NA|NA E Catalyzes the isomerization between 2-isopropylmalate and 3-isopropylmalate, via the formation of 2-isopropylmaleate Z1_02063 34506.g678 1.1e-267 928.7 Bilateria Metazoa 39N7J@33154,3BN86@33208,3DDPN@33213,COG0065@1,KOG0454@2759 NA|NA|NA E Aconitase family (aconitate hydratase) Z1_02064 529507.PMI2085 1.9e-208 731.5 Proteus leuB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003862,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006551,GO:0006807,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009098,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019752,GO:0030145,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0033554,GO:0034198,GO:0042594,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0071496,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1990928 1.1.1.85 ko:K00052 ko00290,ko00660,ko01100,ko01110,ko01210,ko01230,map00290,map00660,map01100,map01110,map01210,map01230 M00432,M00535 R00994,R04426,R10052 RC00084,RC00417,RC03036 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECs_1301.ECs0077,iYL1228.KPN_00079,iZ_1308.Z0082 Bacteria 1MUH4@1224,1RMZQ@1236,3Z1S0@583,COG0473@1,COG0473@2 NA|NA|NA H Catalyzes the oxidation of 3-carboxy-2-hydroxy-4- methylpentanoate (3-isopropylmalate) to 3-carboxy-4-methyl-2- oxopentanoate. The product decarboxylates to 4-methyl-2 oxopentanoate Z1_02065 529507.PMI2084 3.1e-292 1010.4 Proteus leuA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003852,GO:0003985,GO:0003988,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006551,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009098,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016407,GO:0016408,GO:0016453,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046912,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.3.3.13 ko:K01649 ko00290,ko00620,ko01100,ko01110,ko01210,ko01230,map00290,map00620,map01100,map01110,map01210,map01230 M00432 R01213 RC00004,RC00470,RC02754 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSFV_1184.SFV_0066 Bacteria 1MUNQ@1224,1RMWE@1236,3Z29V@583,COG0119@1,COG0119@2 NA|NA|NA H Catalyzes the condensation of the acetyl group of acetyl-CoA with 3-methyl-2-oxobutanoate (2-oxoisovalerate) to form 3-carboxy-3-hydroxy-4-methylpentanoate (2-isopropylmalate) Z1_02066 529507.PMI2082 8.4e-176 622.9 Proteus leuO GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032991,GO:0032993,GO:0043565,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K05798 ko00000,ko03000 iECW_1372.ECW_m0076,iWFL_1372.ECW_m0076 Bacteria 1MX24@1224,1RQP0@1236,3Z15B@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_02067 529507.PMI2081 0.0 1191.8 Proteus fadD 6.2.1.3 ko:K01897 ko00061,ko00071,ko01100,ko01212,ko02024,ko03320,ko04146,ko04216,ko04714,ko04920,map00061,map00071,map01100,map01212,map02024,map03320,map04146,map04216,map04714,map04920 M00086 R01280 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko04147 4.C.1.1 Bacteria 1MU4D@1224,1RPNE@1236,3Z228@583,COG1022@1,COG1022@2 NA|NA|NA I AMP-binding enzyme Z1_02068 529507.PMI2080 4.3e-186 657.1 Proteus fruR GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042866,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051252,GO:0055086,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0080090,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 3.2.1.26 ko:K01193,ko:K02529,ko:K03435 ko00052,ko00500,ko01100,map00052,map00500,map01100 R00801,R00802,R02410,R03635,R03921,R06088 RC00028,RC00077 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000 GH32 Bacteria 1MXQ1@1224,1RNR1@1236,3Z1HW@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K helix_turn _helix lactose operon repressor Z1_02069 529507.PMI2079 8.7e-78 296.2 Proteus mraZ GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031333,GO:0043254,GO:0043565,GO:0044087,GO:0044212,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000142,GO:2000143,GO:2001141 ko:K03925 ko00000 Bacteria 1RHCG@1224,1S63F@1236,3Z1ER@583,COG2001@1,COG2001@2 NA|NA|NA K Negatively regulates its own expression and that of the subsequent genes in the proximal part of the division and cell wall (dcw) gene cluster. Acts by binding directly to DNA. May also regulate the expression of genes outside the dcw cluster Z1_02070 529507.PMI2078 1.5e-172 612.1 Proteus rsmH GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016434,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070475,GO:0071424,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.199 ko:K03438 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MUT4@1224,1RM7M@1236,3Z1EI@583,COG0275@1,COG0275@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the N4 position of cytidine in position 1402 (C1402) of 16S rRNA Z1_02071 529507.PMI2077 5.3e-50 203.4 Proteus ftsL GO:0000003,GO:0000910,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0032505,GO:0043093,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0071944 ko:K03586 ko00000,ko03036 Bacteria 1N9MH@1224,1SC7P@1236,3Z2W9@583,COG3116@1,COG3116@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein. May link together the upstream cell division proteins, which are predominantly cytoplasmic, with the downstream cell division proteins, which are predominantly periplasmic Z1_02072 529507.PMI2076 0.0 1159.8 Proteus ftsI GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008658,GO:0008955,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031406,GO:0032153,GO:0033218,GO:0033293,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051301,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901681 3.4.16.4 ko:K03587,ko:K08384,ko:K08724,ko:K12552,ko:K12556 ko00550,ko01100,ko01501,map00550,map01100,map01501 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011,ko03036 iSSON_1240.SSON_0092 Bacteria 1MUNY@1224,1RNGW@1236,3Z37Y@583,COG0768@1,COG0768@2 NA|NA|NA M Catalyzes cross-linking of the peptidoglycan cell wall at the division septum Z1_02073 529507.PMI2075 1.6e-285 988.0 Proteus murE GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008765,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.4.16.4,6.3.2.10,6.3.2.13 ko:K01928,ko:K03587,ko:K15792 ko00300,ko00550,ko01501,map00300,map00550,map01501 R02788,R04617 RC00064,RC00090,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011,ko03036 iECO103_1326.ECO103_0087,iECO111_1330.ECO111_0088,iECW_1372.ECW_m0084,iEKO11_1354.EKO11_3829,iWFL_1372.ECW_m0084,ic_1306.c0103 Bacteria 1MU6P@1224,1RMD6@1236,3Z1J8@583,COG0769@1,COG0769@2 NA|NA|NA M Catalyzes the addition of meso-diaminopimelic acid to the nucleotide precursor UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate (UMAG) in the biosynthesis of bacterial cell-wall peptidoglycan Z1_02074 529507.PMI2074 3.5e-255 887.1 Proteus murF GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008766,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0047480,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.10 ko:K01929 ko00300,ko00550,ko01100,ko01502,map00300,map00550,map01100,map01502 R04573,R04617 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iB21_1397.B21_00086,iEC042_1314.EC042_0087,iEC55989_1330.EC55989_0082,iECBD_1354.ECBD_3531,iECB_1328.ECB_00087,iECD_1391.ECD_00087,iECIAI1_1343.ECIAI1_0085,iECO103_1326.ECO103_0088,iECO111_1330.ECO111_0089,iECO26_1355.ECO26_0089,iECSE_1348.ECSE_0088,iECW_1372.ECW_m0085,iEKO11_1354.EKO11_3828,iEcE24377_1341.EcE24377A_0088,iEcHS_1320.EcHS_A0092,iEcolC_1368.EcolC_3571,iSBO_1134.SBO_0074,iSSON_1240.SSON_0094,iSbBS512_1146.SbBS512_E0079,iUMNK88_1353.UMNK88_86,iWFL_1372.ECW_m0085,iYL1228.KPN_00090 Bacteria 1QTSF@1224,1RMGD@1236,3Z1NB@583,COG0770@1,COG0770@2 NA|NA|NA M Involved in cell wall formation. Catalyzes the final step in the synthesis of UDP-N-acetylmuramoyl-pentapeptide, the precursor of murein Z1_02075 529507.PMI2073 1.1e-200 705.7 Proteus mraY GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008963,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0030203,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042546,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044464,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.8.13 ko:K01000 ko00550,ko01100,ko01502,map00550,map01100,map01502 R05629,R05630 RC00002,RC02753 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 9.B.146 iAF987.Gmet_0409,iEC042_1314.EC042_0088,iECABU_c1320.ECABU_c00920,iECED1_1282.ECED1_0088,iECH74115_1262.ECH74115_0095,iECSP_1301.ECSP_0090,iECs_1301.ECs0091,iG2583_1286.G2583_0091,iSDY_1059.SDY_0117,iZ_1308.Z0097,ic_1306.c0105 Bacteria 1MUTK@1224,1RNIG@1236,3Z17U@583,COG0472@1,COG0472@2 NA|NA|NA M First step of the lipid cycle reactions in the biosynthesis of the cell wall peptidoglycan Z1_02076 529507.PMI2072 5.7e-247 859.8 Proteus murD GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008764,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.9 ko:K01925 ko00471,ko00550,ko01100,map00471,map00550,map01100 R02783 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iAPECO1_1312.APECO1_1898,iECNA114_1301.ECNA114_0081,iECOK1_1307.ECOK1_0089,iECP_1309.ECP_0090,iECS88_1305.ECS88_0091,iECSF_1327.ECSF_0098,iLF82_1304.LF82_1418,iNRG857_1313.NRG857_00450,iUMN146_1321.UM146_23225,iUTI89_1310.UTI89_C0097 Bacteria 1MVYD@1224,1RP25@1236,3Z0VA@583,COG0771@1,COG0771@2 NA|NA|NA M Cell wall formation. Catalyzes the addition of glutamate to the nucleotide precursor UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine (UMA) Z1_02077 529507.PMI2071 2e-214 751.5 Proteus ftsW GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008360,GO:0009987,GO:0015647,GO:0015648,GO:0015835,GO:0015836,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022857,GO:0022884,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0040007,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051301,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:1901264,GO:1901505 2.4.1.227 ko:K02563,ko:K03588 ko00550,ko01100,ko01502,ko04112,map00550,map01100,map01502,map04112 R05032,R05662 RC00005,RC00049 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011,ko02000,ko03036 2.A.103.1 GT28 Bacteria 1MVDB@1224,1RMIV@1236,3Z2G7@583,COG0772@1,COG0772@2 NA|NA|NA D Belongs to the SEDS family Z1_02078 34506.g1435 2.7e-202 711.1 Bilateria Metazoa 2QT0H@2759,3A78W@33154,3BTA2@33208,3DE59@33213,COG0707@1 NA|NA|NA M Glycosyltransferase family 28 N-terminal domain Z1_02079 529507.PMI2069 6.9e-278 962.6 Proteus murC GO:0000166,GO:0000270,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008763,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0017076,GO:0030203,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034645,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0046872,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.45,6.3.2.8 ko:K01924,ko:K02558 ko00471,ko00550,ko01100,map00471,map00550,map01100 R03193 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iECP_1309.ECP_0093,iJN678.murC Bacteria 1MV68@1224,1RN88@1236,3Z11W@583,COG0773@1,COG0773@2 NA|NA|NA M Belongs to the MurCDEF family Z1_02080 529507.PMI2068 1e-54 219.2 Proteus Bacteria 1QCRN@1224,1T8I1@1236,2AD8U@1,312XV@2,3Z2YK@583 NA|NA|NA Z1_02081 529507.PMI2067 3.3e-149 534.3 Proteus ftsQ GO:0000003,GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0022607,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0032505,GO:0032506,GO:0042802,GO:0043093,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061640,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090529,GO:1902410,GO:1903047 6.3.2.4 ko:K01921,ko:K03589 ko00473,ko00550,ko01100,ko01502,ko04112,map00473,map00550,map01100,map01502,map04112 R01150 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011,ko03036 Bacteria 1N0T7@1224,1S9FJ@1236,3Z1JE@583,COG1589@1,COG1589@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein. May link together the upstream cell division proteins, which are predominantly cytoplasmic, with the downstream cell division proteins, which are predominantly periplasmic. May control correct divisome assembly Z1_02082 529507.PMI2066 7.9e-238 829.3 Proteus ftsA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009898,GO:0009987,GO:0016020,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032153,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03590 ko04112,map04112 ko00000,ko00001,ko03036,ko04812 Bacteria 1MUSR@1224,1RMXY@1236,3Z1PS@583,COG0849@1,COG0849@2 NA|NA|NA D Cell division protein that is involved in the assembly of the Z ring. May serve as a membrane anchor for the Z ring Z1_02083 529507.PMI2065 5.1e-207 726.9 Proteus ftsZ GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0022607,GO:0032153,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034622,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051258,GO:0051301,GO:0065003,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03531 ko04112,map04112 ko00000,ko00001,ko02048,ko03036,ko04812 Bacteria 1MV2X@1224,1RPZS@1236,3Z11I@583,COG0206@1,COG0206@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein that forms a contractile ring structure (Z ring) at the future cell division site. The regulation of the ring assembly controls the timing and the location of cell division. One of the functions of the FtsZ ring is to recruit other cell division proteins to the septum to produce a new cell wall between the dividing cells. Binds GTP and shows GTPase activity Z1_02084 529507.PMI2064 4.2e-172 610.5 Proteus lpxC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008759,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019213,GO:0019637,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 3.5.1.108,4.2.1.59 ko:K02535,ko:K16363 ko00061,ko00540,ko01100,ko01212,map00061,map00540,map01100,map01212 M00060,M00083 R04428,R04535,R04537,R04544,R04568,R04587,R04954,R04965 RC00166,RC00300,RC00831,RC01095 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko01005 iECS88_1305.ECS88_0100 Bacteria 1MV6T@1224,1RQ72@1236,3Z12W@583,COG0774@1,COG0774@2 NA|NA|NA F Catalyzes the hydrolysis of UDP-3-O-myristoyl-N- acetylglucosamine to form UDP-3-O-myristoylglucosamine and acetate, the committed step in lipid A biosynthesis Z1_02085 529507.PMI2063 1.8e-71 275.4 Proteus Z012_02020 Bacteria 1RC6A@1224,1S648@1236,3Z2JY@583,COG4701@1,COG4701@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF721) Z1_02086 529507.PMI2062 3.2e-92 344.4 Proteus secM GO:0003674,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006417,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0034248,GO:0042597,GO:0044464,GO:0045182,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051246,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:2000112 ko:K13301 ko03060,ko03070,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1RC3K@1224,1S7VM@1236,2ATX7@1,31JGK@2,3Z1K9@583 NA|NA|NA S Regulates secA expression by translational coupling of the secM secA operon. Translational pausing at a specific Pro residue 5 residues before the end of the protein may allow disruption of a mRNA repressor helix that normally suppresses secA translation initiation Z1_02087 529507.PMI2061 0.0 1755.7 Proteus secA GO:0000166,GO:0002790,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006457,GO:0006605,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008320,GO:0008565,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015440,GO:0015450,GO:0015462,GO:0015627,GO:0015628,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022884,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031522,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032940,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033220,GO:0034613,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042802,GO:0042886,GO:0042887,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043492,GO:0043952,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046903,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0055085,GO:0061077,GO:0065002,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098776,GO:1901265,GO:1901363,GO:1904680 ko:K03070 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.10,3.A.5.2,3.A.5.4 Bacteria 1MUJZ@1224,1RM9M@1236,3Z1QD@583,COG0653@1,COG0653@2 NA|NA|NA U Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the SecYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving both as a receptor for the preprotein-SecB complex and as an ATP-driven molecular motor driving the stepwise translocation of polypeptide chains across the membrane Z1_02088 529507.PMI2057 0.0 2951.8 Proteus shlA ko:K11016,ko:K15125 ko03070,ko05133,map03070,map05133 ko00000,ko00001,ko00536,ko02042,ko02044 Bacteria 1MX2K@1224,1RYHV@1236,3Z1G3@583,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U Haemagluttinin repeat Z1_02089 529507.PMI2056 0.0 1108.6 Proteus shlB ko:K11017 ko03070,map03070 ko00000,ko00001,ko02042,ko02044 1.B.20 Bacteria 1R5EE@1224,1RS6Z@1236,3Z2EI@583,COG2831@1,COG2831@2 NA|NA|NA U POTRA domain Z1_02090 529507.PMI2055 3.1e-71 274.2 Proteus mutT GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008413,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017110,GO:0030145,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035539,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044715,GO:0044716,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0047429,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 3.6.1.55,3.6.1.65 ko:K03574,ko:K08320 ko00000,ko01000,ko03400 iE2348C_1286.E2348C_0104,iSDY_1059.SDY_0129 Bacteria 1RCZM@1224,1RS3S@1236,3Z2YT@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L NUDIX domain Z1_02091 529507.PMI2054 3.3e-35 153.7 Proteus yacG GO:0003674,GO:0004857,GO:0005488,GO:0008150,GO:0008270,GO:0008657,GO:0010911,GO:0030234,GO:0032780,GO:0042030,GO:0043086,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043462,GO:0044092,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050790,GO:0051336,GO:0051346,GO:0060589,GO:0060590,GO:0065007,GO:0065009,GO:0072586,GO:0098772,GO:2000371,GO:2000372 2.7.1.24 ko:K00859,ko:K09862 ko00770,ko01100,map00770,map01100 M00120 R00130 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1NGJ8@1224,1SC7M@1236,3Z335@583,COG3024@1,COG3024@2 NA|NA|NA S Inhibits all the catalytic activities of DNA gyrase by preventing its interaction with DNA. Acts by binding directly to the C-terminal domain of GyrB, which probably disrupts DNA binding by the gyrase Z1_02092 529507.PMI2053 2.9e-139 501.1 Proteus zapD GO:0000003,GO:0000910,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0032153,GO:0032505,GO:0042802,GO:0043093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051301 ko:K18778 ko00000,ko03036 Bacteria 1MW69@1224,1RNPD@1236,3Z0VM@583,COG4582@1,COG4582@2 NA|NA|NA D Cell division factor that enhances FtsZ-ring assembly. Directly interacts with FtsZ and promotes bundling of FtsZ protofilaments, with a reduction in FtsZ GTPase activity Z1_02093 529507.PMI2052 2.7e-106 391.3 Proteus coaE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004140,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015936,GO:0015937,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046390,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.1.24 ko:K00859 ko00770,ko01100,map00770,map01100 M00120 R00130 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_0104 Bacteria 1RCXT@1224,1S3NR@1236,3Z1VJ@583,COG0237@1,COG0237@2 NA|NA|NA H Catalyzes the phosphorylation of the 3'-hydroxyl group of dephosphocoenzyme A to form coenzyme A Z1_02094 529507.PMI2051 2e-222 778.1 Proteus hofC GO:0002790,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015628,GO:0015833,GO:0016020,GO:0032940,GO:0033036,GO:0042886,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046903,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071806,GO:0071944,GO:0098776 ko:K02505,ko:K02653 ko00000,ko02035,ko02044 3.A.15.2 Bacteria 1MV4U@1224,1RNV0@1236,3Z2N4@583,COG1459@1,COG1459@2 NA|NA|NA NU Type II secretion system (T2SS), protein F Z1_02095 529507.PMI2050 6.3e-207 726.5 Proteus hofB ko:K02454,ko:K02504,ko:K02652 ko03070,ko05111,map03070,map05111 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.15,3.A.15.2 Bacteria 1MU7V@1224,1RMBS@1236,3Z26Q@583,COG2804@1,COG2804@2 NA|NA|NA NU Type II/IV secretion system protein Z1_02096 529507.PMI2049 7.1e-77 293.1 Proteus ppdD GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K02650,ko:K02682 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.15.2 Bacteria 1N7EQ@1224,1SCES@1236,3Z2SP@583,COG4969@1,COG4969@2 NA|NA|NA NU Prokaryotic N-terminal methylation motif Z1_02097 529507.PMI2048 3.1e-106 391.0 Proteus ampD GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008745,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0009254,GO:0009392,GO:0016020,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019867,GO:0030203,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0046872,GO:0046914,GO:0061783,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.5.1.28 ko:K03806,ko:K11066 ko00000,ko01000,ko01011 Bacteria 1RDHU@1224,1S3PG@1236,3Z144@583,COG3023@1,COG3023@2 NA|NA|NA V Ami_2 Z1_02098 34506.g81 1.1e-139 502.7 Bilateria Metazoa 2E70Y@1,2SDNY@2759,3AFG7@33154,3BX4B@33208,3DFDF@33213 NA|NA|NA S FCD domain Z1_02099 529507.PMI2046 0.0 1794.2 Proteus aceE GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004738,GO:0005488,GO:0005515,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016903,GO:0019842,GO:0030976,GO:0036094,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0046872,GO:0046983,GO:0048037,GO:0050662,GO:0055114,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901681 1.2.4.1 ko:K00163 ko00010,ko00020,ko00620,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00020,map00620,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00307 R00014,R00209,R01699,R03270 RC00004,RC00027,RC00627,RC02742,RC02744,RC02882 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 e_coli_core.b0114,iAF1260.b0114,iBWG_1329.BWG_0107,iE2348C_1286.E2348C_0117,iEC55989_1330.EC55989_0107,iECDH10B_1368.ECDH10B_0094,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0108,iECH74115_1262.ECH74115_0121,iECIAI1_1343.ECIAI1_0112,iECNA114_1301.ECNA114_0106,iECO103_1326.ECO103_0114,iECO111_1330.ECO111_0115,iECO26_1355.ECO26_0116,iECSE_1348.ECSE_0114,iECSF_1327.ECSF_0127,iECSP_1301.ECSP_0115,iECUMN_1333.ECUMN_0111,iECW_1372.ECW_m0111,iECs_1301.ECs0118,iEKO11_1354.EKO11_3802,iETEC_1333.ETEC_0110,iEcDH1_1363.EcDH1_3488,iEcE24377_1341.EcE24377A_0116,iEcHS_1320.EcHS_A0118,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0124,iEcolC_1368.EcolC_3545,iG2583_1286.G2583_0118,iJN746.PP_0339,iJO1366.b0114,iJR904.b0114,iUMNK88_1353.UMNK88_112,iWFL_1372.ECW_m0111,iY75_1357.Y75_RS00580,iZ_1308.Z0124 Bacteria 1MV21@1224,1RN6K@1236,3Z1Z6@583,COG2609@1,COG2609@2 NA|NA|NA C pyruvate dehydrogenase E1 component Z1_02100 529507.PMI2045 0.0 1079.7 Proteus aceF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004742,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006084,GO:0006085,GO:0006086,GO:0006090,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016407,GO:0016417,GO:0016418,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0030523,GO:0031405,GO:0031406,GO:0032787,GO:0032991,GO:0033293,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035383,GO:0035384,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045254,GO:0046390,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071616,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901681,GO:1902494,GO:1990204 2.3.1.12 ko:K00627 ko00010,ko00020,ko00620,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00020,map00620,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00307 R00209,R02569 RC00004,RC02742,RC02857 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iETEC_1333.ETEC_0111,iSSON_1240.SSON_0123,iYL1228.KPN_00119 Bacteria 1MU7K@1224,1RNPT@1236,3Z131@583,COG0508@1,COG0508@2 NA|NA|NA C acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex Z1_02101 529507.PMI2044 6.8e-270 936.0 Proteus lpdA GO:0000166,GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004148,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006084,GO:0006085,GO:0006086,GO:0006090,GO:0006103,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006464,GO:0006520,GO:0006544,GO:0006546,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015036,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0017144,GO:0018130,GO:0018335,GO:0019362,GO:0019438,GO:0019464,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032787,GO:0032991,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035383,GO:0035384,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042737,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043543,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045239,GO:0045240,GO:0045250,GO:0045252,GO:0045254,GO:0046390,GO:0046395,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0055114,GO:0061732,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0071616,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0090407,GO:0097159,GO:0106077,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1902494,GO:1990204,GO:1990234 1.8.1.4 ko:K00382 ko00010,ko00020,ko00260,ko00280,ko00620,ko00630,ko00640,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00020,map00260,map00280,map00620,map00630,map00640,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00036,M00307,M00532 R00209,R01221,R01698,R03815,R07618,R08549 RC00004,RC00022,RC00583,RC02742,RC02833,RC02834 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iAPECO1_1312.APECO1_1869,iEcolC_1368.EcolC_3543,iPC815.YPO3417,iSFV_1184.SFV_0107,iUMN146_1321.UM146_23385 Bacteria 1MU2U@1224,1RMFF@1236,3Z1X6@583,COG1249@1,COG1249@2 NA|NA|NA C COG1249 Pyruvate 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component, and related enzymes Z1_02102 529507.PMI2043 0.0 6471.0 Gammaproteobacteria rtxA GO:0000166,GO:0000287,GO:0000822,GO:0001897,GO:0001906,GO:0001907,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004177,GO:0004197,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008154,GO:0008233,GO:0008234,GO:0008238,GO:0008239,GO:0009056,GO:0009405,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016485,GO:0016540,GO:0016787,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0017076,GO:0018149,GO:0018153,GO:0018193,GO:0018199,GO:0018205,GO:0018262,GO:0018995,GO:0019538,GO:0019835,GO:0019836,GO:0020002,GO:0022411,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030042,GO:0030554,GO:0031640,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032984,GO:0033643,GO:0033644,GO:0034641,GO:0035639,GO:0035821,GO:0036094,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043178,GO:0043412,GO:0043603,GO:0043624,GO:0043657,GO:0043933,GO:0044003,GO:0044004,GO:0044179,GO:0044215,GO:0044216,GO:0044217,GO:0044218,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044279,GO:0044364,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044764,GO:0046872,GO:0051261,GO:0051604,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051715,GO:0051801,GO:0051817,GO:0051818,GO:0051883,GO:0052331,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097435,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K05802,ko:K06889,ko:K07052,ko:K10953,ko:K20276 ko02024,ko05110,map02024,map05110 ko00000,ko00001,ko02000,ko02042 1.A.23.1.1 Bacteria 1P2XP@1224,1RZK2@1236,COG1073@1,COG1073@2,COG2931@1,COG2931@2,COG4717@1,COG4717@2 NA|NA|NA MQ Peptidase C80 family Z1_02103 529507.PMI2043 4.6e-48 197.6 Gammaproteobacteria rtxA GO:0000166,GO:0000287,GO:0000822,GO:0001897,GO:0001906,GO:0001907,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004177,GO:0004197,GO:0005488,GO:0005509,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005576,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008154,GO:0008233,GO:0008234,GO:0008238,GO:0008239,GO:0009056,GO:0009405,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016485,GO:0016540,GO:0016787,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0017076,GO:0018149,GO:0018153,GO:0018193,GO:0018199,GO:0018205,GO:0018262,GO:0018995,GO:0019538,GO:0019835,GO:0019836,GO:0020002,GO:0022411,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030042,GO:0030554,GO:0031640,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032984,GO:0033643,GO:0033644,GO:0034641,GO:0035639,GO:0035821,GO:0036094,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043178,GO:0043412,GO:0043603,GO:0043624,GO:0043657,GO:0043933,GO:0044003,GO:0044004,GO:0044179,GO:0044215,GO:0044216,GO:0044217,GO:0044218,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044279,GO:0044364,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044764,GO:0046872,GO:0051261,GO:0051604,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051715,GO:0051801,GO:0051817,GO:0051818,GO:0051883,GO:0052331,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097435,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K05802,ko:K06889,ko:K07052,ko:K10953,ko:K20276 ko02024,ko05110,map02024,map05110 ko00000,ko00001,ko02000,ko02042 1.A.23.1.1 Bacteria 1P2XP@1224,1RZK2@1236,COG1073@1,COG1073@2,COG2931@1,COG2931@2,COG4717@1,COG4717@2 NA|NA|NA MQ Peptidase C80 family Z1_02104 1448139.AI20_12385 1.4e-10 71.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RJMK@1224,1S5VI@1236,2ARHU@1,31GU7@2 NA|NA|NA Z1_02105 529507.PMI2040 0.0 1725.3 Proteus acnB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003730,GO:0003824,GO:0003994,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006097,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006417,GO:0006629,GO:0006631,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009060,GO:0009062,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010608,GO:0015980,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0019222,GO:0019541,GO:0019543,GO:0019626,GO:0019629,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032268,GO:0032787,GO:0034248,GO:0042737,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046395,GO:0046459,GO:0046487,GO:0047456,GO:0048037,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051246,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072329,GO:0072350,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901575,GO:2000112 4.2.1.3,4.2.1.99 ko:K01682 ko00020,ko00630,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,map00020,map00630,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230 M00009,M00010,M00012,M00173 R01324,R01325,R01900,R04425 RC00497,RC00498,RC00618,RC01153 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI1_1343.ECIAI1_0116,iPC815.YPO3415 Bacteria 1MVCR@1224,1RNMC@1236,3Z10B@583,COG1049@1,COG1049@2 NA|NA|NA C aconitate hydratase 2 (citrate hydro-lyase 2) (aconitase 2) K01682 Z1_02106 529507.PMI2039 2e-64 251.5 Proteus yacL ko:K09910 ko00000 Bacteria 1RH38@1224,1S6EG@1236,3Z2R1@583,COG3112@1,COG3112@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0231) Z1_02107 529507.PMI2038 3.7e-138 497.7 Proteus mscS GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006884,GO:0008150,GO:0008361,GO:0008381,GO:0009987,GO:0009992,GO:0015267,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0019725,GO:0022607,GO:0022803,GO:0022836,GO:0022857,GO:0030104,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032535,GO:0034220,GO:0042592,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048878,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051259,GO:0051260,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090066 ko:K03442 ko00000,ko02000 1.A.23.2 Bacteria 1N596@1224,1RQZP@1236,3Z1UJ@583,COG0668@1,COG0668@2 NA|NA|NA M Conserved TM helix Z1_02108 529507.PMI2037 4.8e-111 407.1 Proteus argO GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015174,GO:0015181,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015809,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902023,GO:1903825,GO:1903826,GO:1905039,GO:1990822 ko:K06895 ko00000,ko02000 2.A.75.1 iPC815.YPO0918 Bacteria 1RD6B@1224,1RR03@1236,3Z2G6@583,COG1279@1,COG1279@2 NA|NA|NA U Involved in the export of arginine. Important to control the intracellular level of arginine and the correct balance between arginine and lysine Z1_02109 529507.PMI2036 8.1e-126 456.4 Proteus yggE GO:0000302,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034605,GO:0034614,GO:0042221,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071575,GO:0071944,GO:0098552,GO:1901700,GO:1901701 ko:K09807 ko00000 Bacteria 1RH7T@1224,1RP7T@1236,3Z1CS@583,COG2968@1,COG2968@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF541) Z1_02110 155515.JP36_09010 6.2e-11 74.3 Pasteurellales Bacteria 1QI5G@1224,1TFZ5@1236,1YAHK@135625,2AUN7@1,31KB2@2 NA|NA|NA Z1_02112 34506.g762 6.1e-168 596.7 Bilateria Metazoa 2D1K9@1,2SIEG@2759,3AFUP@33154,3BZA9@33208,3DERH@33213 NA|NA|NA S Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02113 529507.PMI2032 1.5e-115 422.2 Proteus rpiA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004751,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006014,GO:0006081,GO:0006098,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009052,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0019321,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019693,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051156,GO:0051186,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072524,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564 5.3.1.6 ko:K01807 ko00030,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00004,M00007,M00165,M00167,M00580 R01056 RC00434 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVGR@1224,1RNF8@1236,3Z2KK@583,COG0120@1,COG0120@2 NA|NA|NA G Catalyzes the reversible conversion of ribose-5- phosphate to ribulose 5-phosphate Z1_02114 34506.g764 3.1e-234 817.4 Rhabditida Nematoda 1M6E7@119089,38GJA@33154,3BY76@33208,3DE4J@33213,40NYR@6231,414RC@6236,COG0111@1,KOG0068@2759 NA|NA|NA E D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain Z1_02115 529507.PMI2030 0.0 1347.0 Proteus hlyB ko:K11004,ko:K12530,ko:K12531 ko02010,ko02020,ko03070,ko05133,map02010,map02020,map03070,map05133 M00325,M00326,M00575 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02044 3.A.1.109,3.A.1.109.1,3.A.1.109.2 Bacteria 1R2T0@1224,1SBE1@1236,3Z18C@583,COG2274@1,COG2274@2 NA|NA|NA V Psort location CytoplasmicMembrane, score Z1_02116 529507.PMI2029 2.1e-244 851.3 Proteus hlyD ko:K02022,ko:K11003,ko:K12532 ko02020,ko03070,ko05133,map02020,map03070,map05133 M00325,M00326,M00575 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02044 8.A.1,8.A.1.3.1,8.A.1.3.2 Bacteria 1MUI8@1224,1RNK4@1236,3Z1UX@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M HlyD membrane-fusion protein of T1SS Z1_02117 529507.PMI2028 0.0 1250.7 Proteus apxIB_2 ko:K11004,ko:K12530,ko:K12531 ko02010,ko02020,ko03070,ko05133,map02010,map02020,map03070,map05133 M00325,M00326,M00575 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02044 3.A.1.109,3.A.1.109.1,3.A.1.109.2 Bacteria 1R2T0@1224,1SBE1@1236,3Z135@583,COG2274@1,COG2274@2 NA|NA|NA V ABC transporter transmembrane region Z1_02118 529507.PMI2027 3.5e-114 417.5 Proteus fthC GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0030272,GO:0034641,GO:0035999,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.3.2 ko:K01934 ko00670,ko01100,map00670,map01100 R02301 RC00183 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MZG0@1224,1S612@1236,3Z321@583,COG0212@1,COG0212@2 NA|NA|NA H 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family Z1_02119 529507.PMI2026 1.2e-52 212.2 Proteus zapA GO:0000003,GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0000921,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0019954,GO:0022402,GO:0022414,GO:0022607,GO:0030428,GO:0031106,GO:0032153,GO:0032185,GO:0032505,GO:0032506,GO:0034622,GO:0042802,GO:0043093,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061640,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071840,GO:0090529,GO:1902410,GO:1903047 ko:K09888 ko00000,ko03036 Bacteria 1N6YN@1224,1SX2R@1236,3Z31S@583,COG3027@1,COG3027@2 NA|NA|NA D Activator of cell division through the inhibition of FtsZ GTPase activity, therefore promoting FtsZ assembly into bundles of protofilaments necessary for the formation of the division Z ring. It is recruited early at mid-cell but it is not essential for cell division Z1_02120 529507.PMI2025 2.2e-105 388.3 Proteus ygfB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09895 ko00000 Bacteria 1N7W0@1224,1SCPW@1236,3Z2U6@583,COG3079@1,COG3079@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0149) Z1_02121 529507.PMI2024 2.4e-253 880.9 Proteus pepP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008235,GO:0008237,GO:0008238,GO:0016787,GO:0019538,GO:0030145,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.11.9 ko:K01262 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUZS@1224,1RN0W@1236,3Z10M@583,COG0006@1,COG0006@2 NA|NA|NA E Xaa-Pro aminopeptidase (X-Pro aminopeptidase) (aminopeptidase P II) (APP-II) (aminoacylproline aminopeptidase) K01262 Z1_02122 529507.PMI2023 1.3e-223 781.9 Proteus ubiH GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008681,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016705,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 ko:K03184,ko:K03185,ko:K18800 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R04987,R04989,R06146,R08768,R08773,R08775 RC00046,RC01254,RC02670 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iB21_1397.B21_02702,iECBD_1354.ECBD_0830,iECB_1328.ECB_02739,iECD_1391.ECD_02739,iEcHS_1320.EcHS_A3066 Bacteria 1MU6I@1224,1RMS3@1236,3Z27J@583,COG0654@1,COG0654@2 NA|NA|NA C hydroxylase Z1_02123 529507.PMI2022 5.4e-239 833.2 Proteus visC GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016491,GO:0019168,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 ko:K03184,ko:K03185,ko:K18800 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R04987,R04989,R06146,R08768,R08773,R08775 RC00046,RC01254,RC02670 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU6I@1224,1RND5@1236,3Z2GX@583,COG0654@1,COG0654@2 NA|NA|NA C Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH UbiF VisC COQ6 family Z1_02124 529507.PMI2021 2.5e-208 731.1 Proteus gcvT GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004047,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006544,GO:0006546,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016740,GO:0016741,GO:0017144,GO:0019464,GO:0019752,GO:0032259,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042737,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 2.1.2.10 ko:K00605 ko00260,ko00630,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,map00260,map00630,map00670,map01100,map01110,map01130,map01200 M00532 R01221,R02300,R04125 RC00022,RC00069,RC00183,RC02834 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSFV_1184.SFV_2953 Bacteria 1MV96@1224,1RN2A@1236,3Z10I@583,COG0404@1,COG0404@2 NA|NA|NA H The glycine cleavage system catalyzes the degradation of glycine Z1_02125 529507.PMI2020 1e-66 259.2 Proteus gcvH GO:0001505,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006544,GO:0006546,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009987,GO:0016054,GO:0017144,GO:0019464,GO:0019752,GO:0031405,GO:0031406,GO:0033293,GO:0036094,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042737,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0048037,GO:0050662,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901681 ko:K02437 ko00260,ko00630,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,map00260,map00630,map01100,map01110,map01130,map01200 M00532 R01221 RC00022,RC02834 ko00000,ko00001,ko00002 iE2348C_1286.E2348C_3156,iPC815.YPO0906 Bacteria 1RGV7@1224,1S656@1236,3Z2R9@583,COG0509@1,COG0509@2 NA|NA|NA E The glycine cleavage system catalyzes the degradation of glycine. The H protein shuttles the methylamine group of glycine from the P protein to the T protein Z1_02126 529507.PMI2019 0.0 1905.2 Proteus gcvP GO:0003674,GO:0003824,GO:0004375,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016642,GO:0030312,GO:0040007,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 1.4.4.2 ko:K00281,ko:K00282 ko00260,ko00630,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,map00260,map00630,map01100,map01110,map01130,map01200 M00532 R01221,R03425 RC00022,RC00929,RC02834,RC02880 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_3318 Bacteria 1MUDP@1224,1RND3@1236,3Z17V@583,COG0403@1,COG0403@2,COG1003@1,COG1003@2 NA|NA|NA E The glycine cleavage system catalyzes the degradation of glycine. The P protein binds the alpha-amino group of glycine through its pyridoxal phosphate cofactor Z1_02127 529507.PMI2018 1e-110 406.0 Proteus maf ko:K07023 ko00000 Bacteria 1MXEZ@1224,1RRQQ@1236,3Z1A0@583,COG1896@1,COG1896@2 NA|NA|NA S HD domain Z1_02128 529507.PMI2017 3e-184 651.0 Proteus ygfZ GO:0003674,GO:0005488,GO:0005542,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0019842,GO:0022607,GO:0031163,GO:0031406,GO:0033218,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051186,GO:0071840,GO:0072341,GO:0097159,GO:1901363 ko:K06980,ko:K22073 ko00000,ko01000,ko03016,ko03029 Bacteria 1N852@1224,1RPWB@1236,3Z1W5@583,COG0354@1,COG0354@2 NA|NA|NA J Folate-binding protein involved in regulating the level of ATP-DnaA and in the modification of some tRNAs. It is probably a key factor in regulatory networks that act via tRNA modification, such as initiation of chromosomal replication Z1_02129 529507.PMI2016 8.9e-49 199.1 Proteus sdhE GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006105,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016043,GO:0016999,GO:0017013,GO:0017144,GO:0018065,GO:0018293,GO:0019538,GO:0019752,GO:0022607,GO:0034552,GO:0034622,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0045333,GO:0055114,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072350,GO:1901564 1.3.5.1,1.3.5.4 ko:K00240,ko:K09159 ko00020,ko00190,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00190,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00149,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02048 Bacteria 1N7P4@1224,1SCKB@1236,3Z2VA@583,COG2938@1,COG2938@2 NA|NA|NA S Flavinator of succinate dehydrogenase Z1_02130 529507.PMI2014 1.4e-74 285.4 Proteus ygfX GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016999,GO:0017000,GO:0017144,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032091,GO:0043393,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051098,GO:0051100,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944 ko:K19168 ko00000,ko02048 Bacteria 1RDS7@1224,1S3W7@1236,295KK@1,2ZSY3@2,3Z32G@583 NA|NA|NA S Membrane-bound toxin component of toxin-antitoxin system Z1_02131 529507.PMI2013 7.8e-99 366.3 Proteus fldB GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0010181,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0048037,GO:0050662,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03839,ko:K03840 ko00000 iEcSMS35_1347.EcSMS35_3028,iJN678.isiB,iYL1228.KPN_03323 Bacteria 1QRBW@1224,1RMED@1236,3Z2WV@583,COG0716@1,COG0716@2 NA|NA|NA C Flavodoxin Z1_02132 529507.PMI2012 1.7e-173 615.1 Proteus xerD GO:0000150,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006276,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008907,GO:0009009,GO:0009037,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015074,GO:0032991,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048476,GO:0050896,GO:0071139,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 ko:K04763 ko00000,ko03036 Bacteria 1MVNF@1224,1RPI8@1236,3Z143@583,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA D Phage integrase, N-terminal SAM-like domain Z1_02133 529507.PMI2011 2.6e-129 468.0 Proteus dsbC GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464,GO:0055114,GO:0140096 5.3.4.1 ko:K03981 ko00000,ko01000,ko02044,ko03110 3.A.7.11.1 iE2348C_1286.E2348C_3146,iEC042_1314.EC042_3104,iEcSMS35_1347.EcSMS35_3026,iPC815.YPO0891,iSFV_1184.SFV_2941,iSF_1195.SF2879,iSFxv_1172.SFxv_3158,iS_1188.S3078 Bacteria 1RD39@1224,1S3U8@1236,3Z2JI@583,COG1651@1,COG1651@2 NA|NA|NA O Required for disulfide bond formation in some periplasmic proteins. Acts by transferring its disulfide bond to other proteins and is reduced in the process Z1_02134 529507.PMI2010 0.0 1136.3 Proteus recJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008297,GO:0008409,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035312,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0045145,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 ko:K07462 ko03410,ko03430,ko03440,map03410,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MU1M@1224,1RMF4@1236,3Z2DD@583,COG0608@1,COG0608@2 NA|NA|NA L DHH family Z1_02135 529507.PMI2009 3.3e-175 620.9 Proteus prfB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003747,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008079,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016149,GO:0019538,GO:0022411,GO:0032984,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02836 ko00000,ko03012 Bacteria 1MUAW@1224,1RP9Z@1236,3Z0YI@583,COG1186@1,COG1186@2 NA|NA|NA J Peptide chain release factor 2 directs the termination of translation in response to the peptide chain termination codons UGA and UAA Z1_02136 529507.PMI2008 7.4e-291 1005.7 Proteus lysS GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006430,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009405,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0017076,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019752,GO:0030312,GO:0030322,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042221,GO:0042391,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046471,GO:0046483,GO:0046486,GO:0046677,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051704,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.6 ko:K04567 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03658 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iAF1260.b4129,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_3989,iECW_1372.ECW_m4490,iEcDH1_1363.EcDH1_3862,iJN678.lysS,iJO1366.b4129,iWFL_1372.ECW_m4490 Bacteria 1MX1V@1224,1RMJN@1236,3Z1KE@583,COG1190@1,COG1190@2 NA|NA|NA J Belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family Z1_02138 637910.ROD_29271 1.1e-46 192.6 Citrobacter Bacteria 1RJBQ@1224,1S7X9@1236,2AGMU@1,316V4@2,3WZIR@544 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4156) Z1_02139 220341.16501620 1.3e-43 183.0 Salmonella ko:K07804,ko:K11934 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 1.B.6.2.1 Bacteria 1N7TP@1224,1SEKP@1236,3ZN7R@590,COG3637@1,COG3637@2 NA|NA|NA M Enterobacterial Ail/Lom protein Z1_02140 90371.CY43_02050 1.5e-43 182.6 Salmonella Bacteria 1NZ00@1224,1SPWQ@1236,2FARZ@1,342ZD@2,3ZMU9@590 NA|NA|NA Z1_02141 90371.CY43_02045 1.1e-66 260.0 Salmonella ko:K10921 ko05111,map05111 ko00000,ko00001 Bacteria 1NE64@1224,1SE5B@1236,3ZN1H@590,COG3710@1,COG3710@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_02142 90371.CY43_02035 7.9e-40 170.2 Salmonella Bacteria 1NW0G@1224,1SP7Y@1236,2FARZ@1,33XM9@2,3ZNBP@590 NA|NA|NA Z1_02143 637910.ROD_29341 4.3e-66 258.1 Gammaproteobacteria ko:K10921 ko05111,map05111 ko00000,ko00001 Bacteria 1RIF0@1224,1SEEZ@1236,COG3710@1,COG3710@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C-terminal domain protein Z1_02144 220341.16501614 1.1e-63 249.6 Salmonella ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1RIDE@1224,1S3ZF@1236,3ZN5F@590,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Type-1 fimbrial protein, A Z1_02145 220341.16501613 1.1e-88 333.2 Salmonella stbB ko:K07346,ko:K15540 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1MX76@1224,1S08K@1236,3ZM7R@590,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_02146 90371.CY43_02015 0.0 1199.1 Salmonella stbC ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3ZMS2@590,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU PapC C-terminal domain Z1_02147 220341.16501611 7.5e-170 603.6 Salmonella stbD Bacteria 1PAZ3@1224,1RRDN@1236,3ZMSW@590,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02148 90371.CY43_02005 3.1e-69 268.5 Salmonella fimB ko:K07346 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1RHGU@1224,1S4PK@1236,3ZN4A@590,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_02149 529507.PMI1968 8.4e-28 129.0 Proteus Bacteria 1QG5U@1224,1TDIQ@1236,2AT0Y@1,31IGW@2,3Z328@583 NA|NA|NA Z1_02150 529507.PMI1967 1.8e-30 137.9 Proteus Bacteria 1QCT2@1224,1T8JZ@1236,2AT0Y@1,300VV@2,3Z329@583 NA|NA|NA S Sigma-S stabilisation anti-adaptor protein Z1_02151 529507.PMI1966 4.7e-102 377.1 Proteus azr ko:K19784 ko00000 Bacteria 1RAFI@1224,1SWYZ@1236,3Z2EP@583,COG0431@1,COG0431@2 NA|NA|NA S NADPH-dependent FMN reductase Z1_02152 529507.PMI1965 1.7e-70 271.9 Proteus Bacteria 1N61F@1224,1SB26@1236,2E1KJ@1,32WY1@2,3Z2V5@583 NA|NA|NA Z1_02153 529507.PMI1964 1.8e-305 1055.0 Proteus 5.2.1.8 ko:K01802 ko00000,ko01000 Bacteria 1RIVM@1224,1S77S@1236,3Z1RI@583,COG0545@1,COG0545@2,COG1511@1,COG1511@2 NA|NA|NA M peptidylprolyl isomerase Z1_02154 529507.PMI1963 1.1e-155 555.8 Proteus Bacteria 1RJWM@1224,1S8IE@1236,2APS1@1,31EVW@2,3Z1BD@583 NA|NA|NA S Antiactivator protein ExsD Z1_02155 529507.PMI1962 9.1e-158 562.8 Proteus exsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006355,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009438,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019172,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019243,GO:0019249,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032787,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046185,GO:0046394,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051596,GO:0060255,GO:0061727,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0080090,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K20968 ko02025,map02025 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1R6WN@1224,1RRR4@1236,3Z0YD@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K COG2207 AraC-type DNA-binding domain-containing proteins Z1_02156 529507.PMI1961 2.3e-87 328.2 Proteus Bacteria 1MZG6@1224,1S826@1236,3Z1JG@583,COG1664@1,COG1664@2 NA|NA|NA M Polymer-forming cytoskeletal Z1_02157 529507.PMI1960 3e-104 384.4 Proteus 1.1.1.25,2.3.1.128,4.2.1.10 ko:K03790,ko:K13832 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02413,R03084 RC00206,RC00848 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009 Bacteria 1RCX2@1224,1S42B@1236,3Z1G1@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02158 529507.PMI1959 2.5e-61 241.1 Proteus ygbA Bacteria 1N8FZ@1224,1S42H@1236,2E4R1@1,32ZJK@2,3Z2UE@583 NA|NA|NA S Nitrous oxide-stimulated promoter Z1_02159 529507.PMI1958 2.2e-38 164.5 Proteus ko:K12149 ko00000,ko03400 Bacteria 1N4F6@1224,1SA0U@1236,2C6FZ@1,32S0J@2,3Z2ZH@583 NA|NA|NA S DinI-like family Z1_02160 529507.PMI1957 1.7e-37 161.4 Proteus yecH Bacteria 1N09N@1224,1SA8V@1236,2E9BS@1,333JI@2,3Z2ZY@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2492) Z1_02161 529507.PMI1956 1.1e-30 138.7 Proteus ydcH ko:K09794 ko00000 Bacteria 1N760@1224,1SD65@1236,3Z311@583,COG2841@1,COG2841@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF465) Z1_02162 529507.PMI1955 1.7e-84 318.5 Proteus eco GO:0003674,GO:0004857,GO:0004866,GO:0004867,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009892,GO:0010466,GO:0010605,GO:0010951,GO:0019222,GO:0019538,GO:0030162,GO:0030234,GO:0030288,GO:0030313,GO:0030414,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031975,GO:0032268,GO:0032269,GO:0042597,GO:0043086,GO:0043170,GO:0044092,GO:0044238,GO:0044464,GO:0045861,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051336,GO:0051346,GO:0052547,GO:0052548,GO:0060255,GO:0061134,GO:0061135,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0080090,GO:0098772,GO:1901564 ko:K08276 ko00000 Bacteria 1MZEN@1224,1S6Y9@1236,3Z231@583,COG4574@1,COG4574@2 NA|NA|NA M Ecotin Z1_02163 34506.g5061 2e-71 275.0 Bilateria Metazoa 2D4UE@1,2SWBQ@2759,3AS0R@33154,3C3SZ@33208,3DJGY@33213 NA|NA|NA S Universal stress protein family Z1_02164 34506.g5062 5.3e-156 557.0 Metazoa Metazoa 39UQ6@33154,3BV26@33208,COG0053@1,KOG1485@2759 NA|NA|NA P Dimerisation domain of Zinc Transporter Z1_02165 529507.PMI1952 1.5e-175 622.1 Proteus ghrB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008873,GO:0008875,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016618,GO:0019520,GO:0019522,GO:0019752,GO:0030267,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046176,GO:0046181,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 1.1.1.215,1.1.1.26,1.1.1.43,1.1.1.79,1.1.1.81 ko:K00015,ko:K00032,ko:K00090 ko00030,ko00260,ko00480,ko00620,ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,map00030,map00260,map00480,map00620,map00630,map01100,map01110,map01120 R00465,R00717,R01388,R01392,R01739,R02032,R02034 RC00001,RC00031,RC00042,RC00084 ko00000,ko00001,ko01000 iSFV_1184.SFV_3534 Bacteria 1MU2D@1224,1RMGZ@1236,3Z1NR@583,COG1052@1,COG1052@2 NA|NA|NA C D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain Z1_02166 529507.PMI1951 1.2e-196 692.2 Proteus galE GO:0000166,GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003978,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005996,GO:0006012,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009242,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016052,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0019318,GO:0019320,GO:0019388,GO:0033499,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0046377,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051287,GO:0070403,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901575,GO:1901576 5.1.3.2 ko:K01784 ko00052,ko00520,ko01100,map00052,map00520,map01100 M00361,M00362,M00632 R00291,R02984 RC00289 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO1139,iSF_1195.SF0545,iSFxv_1172.SFxv_0601,iS_1188.S0553,iYL1228.KPN_00773 Bacteria 1MUHI@1224,1RMTU@1236,3Z1DM@583,COG1087@1,COG1087@2 NA|NA|NA M Male sterility protein Z1_02167 34506.g5065 2.8e-212 744.2 Rhabditida 2.7.7.12 ko:K00965 ko00052,ko00520,ko01100,ko04917,map00052,map00520,map01100,map04917 M00362,M00554,M00632 R00955 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Nematoda 1KZ0D@119089,38ED2@33154,3BH2V@33208,3CVV7@33213,40G82@6231,40T80@6236,COG1085@1,KOG2958@2759 NA|NA|NA C Galactose-1-phosphate uridyl transferase, C-terminal domain Z1_02168 34506.g5066 1.9e-217 761.5 Rhabditida Nematoda 1M0N5@119089,38HFX@33154,3BGCU@33208,3CWGJ@33213,40QYF@6231,4172A@6236,COG0153@1,KOG0631@2759 NA|NA|NA G Galactokinase galactose-binding signature Z1_02169 529507.PMI1948 1.8e-206 724.9 Proteus galM GO:0003674,GO:0003824,GO:0004034,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006012,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0016052,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016857,GO:0019318,GO:0019320,GO:0019388,GO:0033499,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046365,GO:0071704,GO:1901575 2.7.1.6,5.1.3.3 ko:K00849,ko:K01785 ko00010,ko00052,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,map00010,map00052,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130 M00554,M00632 R01092,R01602,R10619 RC00002,RC00078,RC00563 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iECH74115_1262.ECH74115_0859,iECSP_1301.ECSP_0809,iECs_1301.ECs0784,iZ_1308.Z0926 Bacteria 1MVMN@1224,1RNZN@1236,3Z1C4@583,COG2017@1,COG2017@2 NA|NA|NA G Aldose 1-epimerase Z1_02170 529507.PMI1947 3.4e-183 647.5 Proteus galR ko:K02529 ko00000,ko03000 Bacteria 1MU1G@1224,1RMSP@1236,3Z1E9@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K Periplasmic binding protein-like domain Z1_02171 34506.g5069 3.7e-296 1023.5 Rhabditida ko:K14388 ko00000,ko02000 2.A.21.5.3,2.A.21.5.4,2.A.21.5.5 Nematoda 1KZ8V@119089,38EY4@33154,3BAZ5@33208,3CW54@33213,40G9T@6231,40Y98@6236,COG0591@1,KOG2349@2759 NA|NA|NA P Sodium:solute symporter family Z1_02172 34506.g5070 0.0 1368.2 Eukaryota Eukaryota 2D3Z3@1,2STAE@2759 NA|NA|NA S TonB dependent receptor Z1_02173 529507.PMI1944 1.7e-159 568.5 Proteus ko:K07017 ko00000 Bacteria 1RB1X@1224,1RY80@1236,3Z2V7@583,COG2819@1,COG2819@2 NA|NA|NA S Putative esterase Z1_02174 529507.PMI1943 1e-202 712.6 Proteus ko:K02532 ko00000,ko02000 2.A.1.5 Bacteria 1QUEB@1224,1T1VW@1236,3Z169@583,COG0738@1,COG0738@2 NA|NA|NA G Major facilitator superfamily Z1_02175 529507.PMI1942 9.1e-113 412.9 Proteus yijF ko:K09974 ko00000 Bacteria 1RE1M@1224,1S44B@1236,3Z1II@583,COG3738@1,COG3738@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1287) Z1_02177 529507.PMI1941 7.6e-63 246.1 Proteus ykgJ ko:K06940 ko00000 Bacteria 1N027@1224,1S949@1236,3Z2R2@583,COG0727@1,COG0727@2 NA|NA|NA S Putative zinc- or iron-chelating domain Z1_02179 529507.PMI1940 7.8e-48 196.1 Proteus ko:K09922 ko00000 Bacteria 1RHBQ@1224,1S7UR@1236,3Z2XI@583,COG3169@1,COG3169@2 NA|NA|NA S Putative member of DMT superfamily (DUF486) Z1_02180 529507.PMI1939 6.2e-67 260.0 Proteus Bacteria 1QD0Y@1224,1T8VI@1236,3Z3HH@583,COG3755@1,COG3755@2 NA|NA|NA N Lysozyme inhibitor LprI Z1_02181 529507.PMI1938 1.2e-129 469.2 Proteus lutC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K00782 ko00000 iECO111_1330.ECO111_0342,iECO26_1355.ECO26_0342 Bacteria 1N67T@1224,1RNC6@1236,3Z1C3@583,COG1556@1,COG1556@2 NA|NA|NA S LUD domain Z1_02182 34506.g979 1e-278 965.3 Bilateria Metazoa 2RZC4@2759,3A2CY@33154,3BR27@33208,3DEEB@33213,COG1139@1 NA|NA|NA C LUD domain Z1_02183 529507.PMI1936 1.9e-132 478.4 Proteus lutA ko:K18928 ko00000 Bacteria 1MWTK@1224,1RMVZ@1236,3Z1IC@583,COG0247@1,COG0247@2 NA|NA|NA C Cysteine-rich domain Z1_02184 34506.g980 4.4e-267 926.8 Bilateria Metazoa 2RZJX@2759,3A39U@33154,3BZSX@33208,3DG6U@33213,COG1620@1 NA|NA|NA C L-lactate permease Z1_02185 1217648.F933_01752 1.3e-112 413.3 Moraxellaceae ydhP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K19577 ko00000,ko02000 2.A.1.2.65 Bacteria 1MU9G@1224,1RM9G@1236,3NIRP@468,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator Superfamily Z1_02186 7425.NV19202-PA 1.5e-111 408.7 Insecta Arthropoda 2RXUH@2759,3A0GS@33154,3BRJV@33208,3D8ZF@33213,3SR30@50557,422C8@6656,COG2249@1 NA|NA|NA S Flavodoxin-like fold Z1_02187 529507.PMI1933 5.2e-104 383.6 Proteus 5.4.2.11 ko:K01834 ko00010,ko00260,ko00680,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04922,ko05230,map00010,map00260,map00680,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04922,map05230 M00001,M00002,M00003 R01518 RC00536 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 Bacteria 1QUEC@1224,1T1VX@1236,3Z2XK@583,COG0406@1,COG0406@2 NA|NA|NA G alpha-ribazole phosphatase activity Z1_02188 529507.PMI1932 8.8e-154 549.7 Proteus ko:K07088 ko00000 Bacteria 1R71W@1224,1RSP2@1236,3Z3FD@583,COG0679@1,COG0679@2 NA|NA|NA S Membrane transport protein Z1_02189 34506.g1382 1.5e-291 1008.1 Rhabditida Nematoda 1M6EI@119089,2QSC8@2759,395NM@33154,3CA5Z@33208,3DRAV@33213,40NZ2@6231,414RR@6236,COG0579@1 NA|NA|NA S Malate:quinone oxidoreductase (Mqo) Z1_02190 529507.PMI1930 9.5e-73 279.3 Proteus dddQ Bacteria 1PZRW@1224,1TEKD@1236,3Z3EU@583,COG1917@1,COG1917@2 NA|NA|NA S Cupin 2, conserved barrel domain protein Z1_02191 529507.PMI1929 1.2e-120 439.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_02192 529507.PMI1927 2.1e-41 174.5 Proteus Bacteria 1P96W@1224,1T8VR@1236,2DEBF@1,2ZM92@2,3Z3HU@583 NA|NA|NA Z1_02193 529507.PMI1925 0.0 1451.8 Bacteria CP_0471 ko:K07126 ko00000 Bacteria COG0790@1,COG0790@2 NA|NA|NA S beta-lactamase activity Z1_02194 529507.PMI1924 1.7e-128 465.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_02195 529507.PMI1923 9.3e-214 749.2 Proteus Bacteria 1QN1P@1224,1TKEG@1236,2AYBJ@1,31QE8@2,3Z3E0@583 NA|NA|NA Z1_02196 529507.PMI1922 1.9e-124 451.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_02197 911008.GLAD_00135 9.3e-197 693.0 Gammaproteobacteria ko:K00375 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUJE@1224,1RXYA@1236,COG1167@1,COG1167@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulators containing a DNA-binding HTH domain and an aminotransferase domain (MocR family) and their eukaryotic orthologs Z1_02198 1006000.GKAS_04225 1.6e-136 492.3 Gammaproteobacteria ydeK Bacteria 1MVHN@1224,1RM9P@1236,COG0697@1,COG0697@2 NA|NA|NA EG transporter Z1_02199 471881.PROPEN_04529 4.9e-72 277.3 Proteus ko:K07076 ko00000 Bacteria 1RID1@1224,1S9KW@1236,3Z3K0@583,COG1708@1,COG1708@2 NA|NA|NA S Nucleotidyltransferase domain Z1_02201 1141662.OOA_01952 2e-129 468.4 Providencia ko:K07043 ko00000 Bacteria 1PG2I@1224,1SXM9@1236,3ZACI@586,COG1451@1,COG1451@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function DUF45 Z1_02202 1141662.OOA_01957 0.0 1942.9 Providencia hsdR 3.1.21.3 ko:K01153 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1MU96@1224,1RP2Q@1236,3Z9CP@586,COG0610@1,COG0610@2 NA|NA|NA V Subunit R is required for both nuclease and ATPase activities, but not for modification Z1_02203 493475.GARC_3342 6e-296 1023.1 Alteromonadaceae Bacteria 1NRBC@1224,1RQZ6@1236,4696J@72275,COG1479@1,COG1479@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function DUF262 Z1_02204 493475.GARC_3341 1.8e-225 788.5 Alteromonadaceae Bacteria 1QEUZ@1224,1RQZ7@1236,46A36@72275,COG1479@1,COG1479@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function DUF262 Z1_02205 1123252.ATZF01000001_gene1188 1.5e-93 350.1 Bacilli hsdS 3.1.21.3 ko:K01154 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1V78B@1239,4IQSF@91061,COG0732@1,COG0732@2 NA|NA|NA V Type I restriction modification DNA specificity domain Z1_02206 1141662.OOA_01977 0.0 1510.4 Providencia hsdM 2.1.1.72 ko:K03427 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1MW3A@1224,1RMRA@1236,3Z8XQ@586,COG0286@1,COG0286@2 NA|NA|NA V COG0286 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit Z1_02207 1524467.IV04_09830 2.4e-203 714.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1N2N0@1224,1S9GP@1236,2CZMG@1,32T6N@2 NA|NA|NA Z1_02208 1410619.SRDD_14940 4.3e-61 240.7 Serratia 3.6.1.13 ko:K01515 ko00230,map00230 R01054 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1QU7P@1224,1S7BC@1236,403R4@613,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L Belongs to the Nudix hydrolase family Z1_02209 61647.LG71_22365 4.6e-51 207.2 Gammaproteobacteria ko:K07028 ko00000 Bacteria 1RHF4@1224,1S3QW@1236,COG0645@1,COG0645@2 NA|NA|NA S AAA domain Z1_02211 529507.PMI1906 5.4e-86 323.6 Proteus smpB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070930,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564 ko:K03664 ko00000 Bacteria 1RDFP@1224,1S3PT@1236,3Z1VR@583,COG0691@1,COG0691@2 NA|NA|NA J Required for rescue of stalled ribosomes mediated by trans-translation. Binds to transfer-messenger RNA (tmRNA), required for stable association of tmRNA with ribosomes. tmRNA and SmpB together mimic tRNA shape, replacing the anticodon stem-loop with SmpB. tmRNA is encoded by the ssrA gene Z1_02212 529507.PMI1905 2.7e-76 291.2 Proteus ratA GO:0003674,GO:0005488,GO:0006417,GO:0006446,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0017148,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0034248,GO:0034249,GO:0043021,GO:0043023,GO:0044877,GO:0045947,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:2000112,GO:2000113 ko:K18588 ko00000 Bacteria 1RGUH@1224,1S61C@1236,3Z0WK@583,COG2867@1,COG2867@2 NA|NA|NA I Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport Z1_02213 529507.PMI1904 1.1e-44 185.7 Proteus rnfH ko:K03154,ko:K09801 ko04122,map04122 ko00000,ko00001 Bacteria 1MZCH@1224,1SCHG@1236,3Z2TP@583,COG2914@1,COG2914@2 NA|NA|NA S RnfH family Ubiquitin Z1_02214 529507.PMI1903 2e-61 241.5 Proteus bamE GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0030674,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045203,GO:0045229,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0060090,GO:0061024,GO:0070727,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0098552,GO:0098796,GO:1990063 ko:K06186 ko00000,ko02000 1.B.33.1 Bacteria 1N6YW@1224,1SCTT@1236,3Z2PU@583,COG2913@1,COG2913@2 NA|NA|NA M Part of the outer membrane protein assembly complex, which is involved in assembly and insertion of beta-barrel proteins into the outer membrane Z1_02215 529507.PMI1902 1.6e-270 938.3 Proteus recN GO:0000724,GO:0000725,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009295,GO:0009314,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043590,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 ko:K03631 ko00000,ko03400 Bacteria 1MUNP@1224,1RNPZ@1236,3Z178@583,COG0497@1,COG0497@2 NA|NA|NA L repair protein Z1_02216 529507.PMI1901 3.8e-170 604.0 Proteus nadK GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003951,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006741,GO:0006753,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006769,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008976,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009820,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016776,GO:0017076,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019637,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051287,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.1.23 ko:K00858 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R00104 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko01000 iEcSMS35_1347.EcSMS35_2767,iHN637.CLJU_RS05480,iLJ478.TM1733,iSB619.SA_RS04895 Bacteria 1MUBC@1224,1RP84@1236,3Z10J@583,COG0061@1,COG0061@2 NA|NA|NA H Involved in the regulation of the intracellular balance of NAD and NADP, and is a key enzyme in the biosynthesis of NADP. Catalyzes specifically the phosphorylation on 2'-hydroxyl of the adenosine moiety of NAD to yield NADP Z1_02217 529507.PMI1900 1.4e-99 369.0 Proteus grpE GO:0000166,GO:0000774,GO:0001871,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006950,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009267,GO:0009408,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009986,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016043,GO:0017076,GO:0019904,GO:0022607,GO:0030234,GO:0030246,GO:0030247,GO:0030312,GO:0030554,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032991,GO:0033554,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042594,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046983,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051716,GO:0060589,GO:0060590,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901265,GO:1901363,GO:2001065 ko:K03687 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1RH8T@1224,1S5W5@1236,3Z29E@583,COG0576@1,COG0576@2 NA|NA|NA O Participates actively in the response to hyperosmotic and heat shock by preventing the aggregation of stress-denatured proteins, in association with DnaK and GrpE. It is the nucleotide exchange factor for DnaK and may function as a thermosensor. Unfolded proteins bind initially to DnaJ Z1_02218 529507.PMI1899 1.2e-131 475.7 Proteus ung GO:0003674,GO:0003824,GO:0004844,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006285,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016798,GO:0016799,GO:0019104,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097506,GO:0097510,GO:0140097,GO:1901360 3.2.2.27 ko:K03648 ko03410,ko05340,map03410,map05340 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MV80@1224,1RPDH@1236,3Z1TI@583,COG0692@1,COG0692@2 NA|NA|NA L Excises uracil residues from the DNA which can arise as a result of misincorporation of dUMP residues by DNA polymerase or due to deamination of cytosine Z1_02219 529507.PMI1898 2.2e-66 258.1 Proteus grcA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006566,GO:0006567,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008861,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009066,GO:0009068,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016407,GO:0016408,GO:0016453,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 1.14.13.236 ko:K06866,ko:K15763,ko:K22361 ko00623,ko00625,ko01100,ko01120,ko01220,map00623,map00625,map01100,map01120,map01220 M00538 R02550,R03562,R05444,R05666,R11901 RC00269,RC00490,RC01383 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSF_1195.SF2641,iSFxv_1172.SFxv_2898,iS_1188.S2814 Bacteria 1RDRB@1224,1S45G@1236,3Z2MT@583,COG3445@1,COG3445@2 NA|NA|NA S Acts as a radical domain for damaged PFL and possibly other radical proteins Z1_02220 529507.PMI1897 1.7e-241 841.6 Proteus srmB GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003724,GO:0003725,GO:0003727,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008104,GO:0008143,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009987,GO:0010501,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033592,GO:0034622,GO:0034641,GO:0035770,GO:0036464,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043186,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045495,GO:0046483,GO:0051179,GO:0060293,GO:0065003,GO:0070035,GO:0070717,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097617,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901363,GO:1990904 3.6.4.13 ko:K05590,ko:K11927 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009,ko03019 Bacteria 1MU49@1224,1RMWA@1236,3Z1QF@583,COG0513@1,COG0513@2 NA|NA|NA F Belongs to the DEAD box helicase family Z1_02221 529507.PMI1896 6.4e-142 510.0 Proteus yfiC GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016426,GO:0016430,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.1.1.223,2.1.1.72 ko:K00571,ko:K15460 ko00000,ko01000,ko02048,ko03016 Bacteria 1PC8R@1224,1RM8S@1236,3Z230@583,COG4123@1,COG4123@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the adenine in position 37 of tRNA(1)(Val) (anticodon cmo5UAC) Z1_02222 529507.PMI1894 2.7e-100 371.3 Proteus rpoE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009628,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03088 ko00000,ko03021 Bacteria 1MX7T@1224,1RN64@1236,3Z220@583,COG1595@1,COG1595@2 NA|NA|NA K Belongs to the sigma-70 factor family. ECF subfamily Z1_02223 529507.PMI1893 1.4e-108 399.1 Proteus rseA GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010556,GO:0016989,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2001141 ko:K03597 ko00000,ko03021 Bacteria 1R4U0@1224,1RN98@1236,3Z1ZK@583,COG3073@1,COG3073@2 NA|NA|NA T An anti-sigma factor for extracytoplasmic function (ECF) sigma factor sigma-E (RpoE). ECF sigma factors are held in an inactive form by an anti-sigma factor until released by regulated intramembrane proteolysis (RIP). RIP occurs when an extracytoplasmic signal triggers a concerted proteolytic cascade to transmit information and elicit cellular responses. The membrane-spanning regulatory substrate protein is first cut periplasmically (site-1 protease, S1P, DegS), then within the membrane itself (site-2 protease, S2P, RseP), while cytoplasmic proteases finish degrading the anti-sigma factor, liberating sigma-E Z1_02224 529507.PMI1892 2.3e-181 641.3 Proteus rseB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044464,GO:0045152 ko:K03598 ko00000,ko03021 Bacteria 1MUQ8@1224,1RNF3@1236,3Z12B@583,COG3026@1,COG3026@2 NA|NA|NA T MucB/RseB C-terminal domain Z1_02225 529507.PMI1891 4.5e-82 310.5 Proteus rseC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0016020,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K03803 ko00000,ko03021 Bacteria 1N6QS@1224,1SCTM@1236,3Z2J8@583,COG3086@1,COG3086@2 NA|NA|NA T Positive regulator of sigma(E), RseC/MucC Z1_02226 529507.PMI1890 0.0 1176.4 Proteus lepA GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003746,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009268,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019538,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034641,GO:0034645,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043021,GO:0043023,GO:0043024,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0050896,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K03596 ko05134,map05134 ko00000,ko00001 Bacteria 1MVZA@1224,1RPFB@1236,3Z2H7@583,COG0481@1,COG0481@2 NA|NA|NA J Required for accurate and efficient protein synthesis under certain stress conditions. May act as a fidelity factor of the translation reaction, by catalyzing a one-codon backward translocation of tRNAs on improperly translocated ribosomes. Back- translocation proceeds from a post-translocation (POST) complex to a pre-translocation (PRE) complex, thus giving elongation factor G a second chance to translocate the tRNAs correctly. Binds to ribosomes in a GTP-dependent manner Z1_02227 529507.PMI1889 1.6e-185 655.2 Proteus lepB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004252,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006465,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015643,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016485,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051604,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 3.4.21.89 ko:K03100 ko02024,ko03060,map02024,map03060 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MXUF@1224,1RMHI@1236,3Z2GT@583,COG0681@1,COG0681@2 NA|NA|NA U Belongs to the peptidase S26 family Z1_02228 529507.PMI1888 8.6e-122 443.0 Proteus rnc GO:0000287,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003725,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004525,GO:0004540,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016072,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016891,GO:0016893,GO:0019899,GO:0022613,GO:0032296,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0097159,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901363 3.1.26.3 ko:K03685 ko03008,ko05205,map03008,map05205 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009,ko03019,ko03036 Bacteria 1MUQ6@1224,1RN0C@1236,3Z1ZY@583,COG0571@1,COG0571@2 NA|NA|NA J Digests double-stranded RNA. Involved in the processing of primary rRNA transcript to yield the immediate precursors to the large and small rRNAs (23S and 16S). Processes some mRNAs, and tRNAs when they are encoded in the rRNA operon. Processes pre- crRNA and tracrRNA of type II CRISPR loci if present in the organism Z1_02229 529507.PMI1887 5.1e-170 603.6 Proteus era GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009898,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016310,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0019538,GO:0019843,GO:0019897,GO:0019898,GO:0022613,GO:0031234,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046777,GO:0070181,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564 ko:K03595 ko00000,ko03009,ko03029 Bacteria 1MUKT@1224,1RN3A@1236,3Z283@583,COG1159@1,COG1159@2 NA|NA|NA S An essential GTPase that binds both GDP and GTP, with rapid nucleotide exchange. Plays a role in 16S rRNA processing and 30S ribosomal subunit biogenesis and possibly also in cell cycle regulation and energy metabolism Z1_02230 529507.PMI1886 4.8e-134 483.8 Proteus recO GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0050896 2.6.99.2 ko:K03474,ko:K03584 ko00750,ko01100,ko03440,map00750,map01100,map03440 M00124 R05838 RC01476 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 Bacteria 1RHIC@1224,1RN8Y@1236,3Z15H@583,COG1381@1,COG1381@2 NA|NA|NA L Involved in DNA repair and RecF pathway recombination Z1_02231 529507.PMI1885 4.4e-132 477.2 Proteus pdxJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008614,GO:0008615,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016769,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033856,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042802,GO:0042816,GO:0042819,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 2.6.99.2 ko:K03474 ko00750,ko01100,map00750,map01100 M00124 R05838 RC01476 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2564,iAF987.Gmet_1885,iB21_1397.B21_02422,iBWG_1329.BWG_2328,iEC55989_1330.EC55989_2852,iECBD_1354.ECBD_1117,iECB_1328.ECB_02458,iECDH10B_1368.ECDH10B_2732,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2491,iECD_1391.ECD_02458,iECH74115_1262.ECH74115_3800,iECIAI1_1343.ECIAI1_2675,iECO103_1326.ECO103_3142,iECO111_1330.ECO111_3290,iECO26_1355.ECO26_3611,iECSE_1348.ECSE_2852,iECSP_1301.ECSP_3509,iECW_1372.ECW_m2792,iECs_1301.ECs3430,iEKO11_1354.EKO11_1169,iEcDH1_1363.EcDH1_1104,iEcE24377_1341.EcE24377A_2850,iEcHS_1320.EcHS_A2719,iEcolC_1368.EcolC_1113,iG2583_1286.G2583_3145,iJO1366.b2564,iJR904.b2564,iWFL_1372.ECW_m2792,iY75_1357.Y75_RS13390 Bacteria 1MU9W@1224,1RMS5@1236,3Z2HD@583,COG0854@1,COG0854@2 NA|NA|NA H Catalyzes the complicated ring closure reaction between the two acyclic compounds 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP) and 3-amino-2-oxopropyl phosphate (1-amino-acetone-3-phosphate or AAP) to form pyridoxine 5'-phosphate (PNP) and inorganic phosphate Z1_02232 529507.PMI1884 3.6e-61 240.7 Proteus acpS GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008897,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0018070,GO:0018193,GO:0018209,GO:0018215,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032787,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901564,GO:1901576 2.7.8.7,3.2.1.52 ko:K00997,ko:K01207 ko00520,ko00531,ko00770,ko01100,ko01501,map00520,map00531,map00770,map01100,map01501 M00628 R00022,R01625,R05963,R07809,R07810,R10831 RC00002,RC00049 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MZBF@1224,1S98P@1236,3Z2QH@583,COG0736@1,COG0736@2 NA|NA|NA I Transfers the 4'-phosphopantetheine moiety from coenzyme A to a Ser of acyl-carrier-protein Z1_02233 529507.PMI1883 1.1e-38 165.2 Proteus yfhL ko:K03522,ko:K05337 ko00000,ko04147 Bacteria 1MZ6H@1224,1S8ZV@1236,3Z2YE@583,COG1145@1,COG1145@2 NA|NA|NA C Ferredoxin Z1_02234 529507.PMI1882 5.9e-94 350.1 Proteus tadA GO:0002097,GO:0002100,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004000,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006382,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008251,GO:0008270,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016553,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0019239,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0052717,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 3.4.17.13,3.5.4.1,3.5.4.3,3.5.4.33,3.8.1.5 ko:K01297,ko:K01485,ko:K01487,ko:K01563,ko:K11991 ko00230,ko00240,ko00330,ko00361,ko00625,ko01100,ko01120,map00230,map00240,map00330,map00361,map00625,map01100,map01120 R00974,R01411,R01676,R02922,R05284,R05367,R05368,R05369,R05370,R07669,R07670,R10223 RC00074,RC00204,RC00477,RC00514,RC00809,RC01317,RC01340,RC01341,RC02013 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko01011,ko03016 Bacteria 1RGU0@1224,1S60Z@1236,3Z0YV@583,COG0590@1,COG0590@2 NA|NA|NA F Catalyzes the deamination of adenosine to inosine at the wobble position 34 of tRNA(Arg2) Z1_02235 529507.PMI1881 5e-96 357.1 Proteus yfcP GO:0005575,GO:0005623,GO:0007155,GO:0008150,GO:0009289,GO:0022610,GO:0042995,GO:0044464 Bacteria 1RBB7@1224,1S25Q@1236,3Z2R5@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02236 529507.PMI1880 1.5e-205 721.8 Proteus pmfE GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 Bacteria 1R5VI@1224,1S00I@1236,3Z28Y@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02237 529507.PMI1879 1.6e-140 505.4 Proteus pmfD ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1MY06@1224,1RR9H@1236,3Z190@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_02238 529507.PMI1878 0.0 1672.1 Proteus pmfC Bacteria 1P744@1224,1RN8Z@1236,3Z0WS@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_02239 529507.PMI1877 5.8e-92 343.6 Proteus pmfA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345,ko:K12517 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1R85Z@1224,1S0XY@1236,3Z1XX@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02240 529507.PMI1876 9.1e-278 962.2 Proteus mltF GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008933,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0019867,GO:0030203,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0043170,GO:0044462,GO:0044464,GO:0061783,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K18691 ko00000,ko01000,ko01011 iBWG_1329.BWG_2322,iEC042_1314.EC042_2762,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2485,iECNA114_1301.ECNA114_2631,iECP_1309.ECP_2560,iECSF_1327.ECSF_2397,iECW_1372.ECW_m2786,iEKO11_1354.EKO11_1175,iEcDH1_1363.EcDH1_1110,iEcHS_1320.EcHS_A2711,iEcolC_1368.EcolC_1119,iG2583_1286.G2583_3089,iJO1366.b2558,iSFxv_1172.SFxv_2861,iUMN146_1321.UM146_03930,iUMNK88_1353.UMNK88_3212,iUTI89_1310.UTI89_C2878,iWFL_1372.ECW_m2786,iY75_1357.Y75_RS13345 Bacteria 1MWDS@1224,1RM8W@1236,3Z0ZM@583,COG4623@1,COG4623@2 NA|NA|NA M Murein-degrading enzyme that degrades murein glycan strands and insoluble, high-molecular weight murein sacculi, with the concomitant formation of a 1,6-anhydromuramoyl product. Lytic transglycosylases (LTs) play an integral role in the metabolism of the peptidoglycan (PG) sacculus. Their lytic action creates space within the PG sacculus to allow for its expansion as well as for the insertion of various structures such as secretion systems and flagella Z1_02241 529507.PMI1875 0.0 2607.0 Proteus purL GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004642,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006188,GO:0006189,GO:0006520,GO:0006541,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016884,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046040,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 6.3.5.3 ko:K01952 ko00230,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map01100,map01110,map01130 M00048 R04463 RC00010,RC01160 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_3792,iECO111_1330.ECO111_3283,iECSP_1301.ECSP_3501,iECs_1301.ECs3423,iG2583_1286.G2583_3088,iJN746.PP_1037,ic_1306.c3080 Bacteria 1MYN4@1224,1RMRN@1236,3Z1EV@583,COG0046@1,COG0046@2,COG0047@1,COG0047@2 NA|NA|NA F Phosphoribosylformylglycinamidine synthase involved in the purines biosynthetic pathway. Catalyzes the ATP-dependent conversion of formylglycinamide ribonucleotide (FGAR) and glutamine to yield formylglycinamidine ribonucleotide (FGAM) and glutamate Z1_02242 529507.PMI1874 7.4e-264 916.0 Proteus Bacteria 1N58A@1224,1RP34@1236,3Z1GC@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T His Kinase A (phosphoacceptor) domain Z1_02243 529507.PMI1873 6.5e-158 563.5 Proteus yfhG ko:K02487,ko:K18138 ko01501,ko01503,ko02020,map01501,map01503,map02020 M00507,M00647,M00699,M00718 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000,ko02022,ko02035 2.A.6.2 Bacteria 1RDX1@1224,1S4CU@1236,3Z1TC@583,COG3170@1,COG3170@2 NA|NA|NA NU YfhG lipoprotein Z1_02244 529507.PMI1872 3.4e-247 860.5 Proteus yfhA GO:0000156,GO:0000160,GO:0000976,GO:0000984,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001150,GO:0001151,GO:0001158,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0023052,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035326,GO:0035556,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060089,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K07715 ko02020,ko02024,map02020,map02024 M00502 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1MU0N@1224,1RMCK@1236,3Z18N@583,COG2204@1,COG2204@2 NA|NA|NA T Sigma-54 interaction domain Z1_02245 529507.PMI1871 9.8e-310 1068.5 Proteus nadE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008795,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009435,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016880,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019674,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.1.5,6.3.5.1 ko:K01916,ko:K01950 ko00760,ko01100,map00760,map01100 M00115 R00189,R00257 RC00010,RC00100 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU9U@1224,1RNKA@1236,3Z0W3@583,COG0171@1,COG0171@2,COG0388@1,COG0388@2 NA|NA|NA H Catalyzes the ATP-dependent amidation of deamido-NAD to form NAD. Uses L-glutamine as a nitrogen source Z1_02246 529507.PMI1870 1e-54 219.2 Proteus glnB GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006808,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010565,GO:0017076,GO:0019216,GO:0019217,GO:0019222,GO:0030234,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042304,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046890,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0062012,GO:0065007,GO:0065009,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098772,GO:1901265,GO:1901363 ko:K04751,ko:K04752 ko02020,map02020 ko00000,ko00001 Bacteria 1RGWK@1224,1S67I@1236,3Z2PG@583,COG0347@1,COG0347@2 NA|NA|NA K Nitrogen regulatory protein P-II Z1_02247 529507.PMI1869 9e-113 412.9 Proteus Bacteria 1RK11@1224,1S49N@1236,2E047@1,32VSV@2,3Z0YE@583 NA|NA|NA Z1_02248 529507.PMI1868 7e-228 796.2 Proteus hmp GO:0000166,GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004155,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0008941,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0016667,GO:0016671,GO:0016705,GO:0016708,GO:0017144,GO:0019725,GO:0020037,GO:0030003,GO:0031406,GO:0032843,GO:0033293,GO:0033554,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042133,GO:0042135,GO:0042592,GO:0042737,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046209,GO:0046210,GO:0046906,GO:0046916,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051213,GO:0051409,GO:0051716,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071500,GO:0071949,GO:0072593,GO:0097159,GO:0098771,GO:1901265,GO:1901363,GO:2001057 1.14.12.17 ko:K05916 ko05132,map05132 ko00000,ko00001,ko01000 iECP_1309.ECP_2554 Bacteria 1MV41@1224,1RMPJ@1236,3Z20F@583,COG1017@1,COG1017@2,COG1018@1,COG1018@2 NA|NA|NA C Is involved in NO detoxification in an aerobic process, termed nitric oxide dioxygenase (NOD) reaction that utilizes O(2) and NAD(P)H to convert NO to nitrate, which protects the bacterium from various noxious nitrogen compounds. Therefore, plays a central role in the inducible response to nitrosative stress Z1_02249 34506.g851 3.4e-241 840.5 Rhabditida Nematoda 1KUI5@119089,38EKT@33154,3BAU2@33208,3CT2W@33213,40BIJ@6231,40SNW@6236,COG0112@1,KOG2467@2759 NA|NA|NA E Interconversion of serine and glycine Z1_02250 529507.PMI1866 1.4e-215 755.4 Proteus hcaT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 1.5.1.2 ko:K00286,ko:K05820,ko:K08161 ko00330,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00330,map01100,map01110,map01130,map01230 M00015 R01248,R01251,R03291,R03293 RC00054,RC00083 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 2.A.1.2.20,2.A.1.27 iECIAI39_1322.ECIAI39_2737,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2688,iSFV_1184.SFV_2584,iSF_1195.SF2583,iS_1188.S2755 Bacteria 1MVZI@1224,1RPBT@1236,3Z1H7@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP MFS_1 like family Z1_02251 529507.PMI1865 2.8e-243 847.4 Gammaproteobacteria 3.4.11.9 ko:K01262 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1N9PS@1224,1RNW2@1236,COG0006@1,COG0006@2 NA|NA|NA E Metallopeptidase family M24 Z1_02252 529507.PMI1864 6.5e-114 416.8 Gammaproteobacteria ybiH Bacteria 1RGJW@1224,1S43B@1236,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Domain of unknown function (DUF1956) Z1_02253 529507.PMI1863 2.6e-146 524.6 Proteus suhB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006020,GO:0006066,GO:0006793,GO:0006796,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008934,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019637,GO:0019751,GO:0023052,GO:0031403,GO:0031420,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043647,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046164,GO:0046174,GO:0046434,GO:0046838,GO:0046855,GO:0046872,GO:0047954,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0052745,GO:0052834,GO:0065007,GO:0071545,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901615,GO:1901616 3.1.3.25 ko:K01092 ko00521,ko00562,ko01100,ko04070,map00521,map00562,map01100,map04070 M00131 R01185,R01186,R01187 RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_2538,iPC815.YPO2899 Bacteria 1MUQT@1224,1RNME@1236,3Z1WI@583,COG0483@1,COG0483@2 NA|NA|NA G Inositol monophosphatase family Z1_02254 529507.PMI1862 4.7e-134 483.8 Proteus trmJ GO:0001510,GO:0002128,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016300,GO:0016427,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0052665,GO:0052666,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.1.1.200,3.5.1.19,6.1.1.16 ko:K01883,ko:K02533,ko:K08281,ko:K15396 ko00760,ko00970,ko01100,map00760,map00970,map01100 M00359,M00360 R01268,R03650 RC00055,RC00100,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 Bacteria 1N47Y@1224,1RPD3@1236,3Z1AN@583,COG0565@1,COG0565@2 NA|NA|NA J Catalyzes the formation of 2'O-methylated cytidine (Cm32) or 2'O-methylated uridine (Um32) at position 32 in tRNA Z1_02255 529507.PMI1861 7.9e-85 319.7 Proteus iscR GO:0003674,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 2.8.1.7 ko:K04487,ko:K13643 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07460,R11528,R11529 RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000,ko02048,ko03000,ko03016,ko03029 Bacteria 1RDA4@1224,1S3RW@1236,3Z0UI@583,COG1959@1,COG1959@2 NA|NA|NA K Regulates the transcription of several operons and genes involved in the biogenesis of Fe-S clusters and Fe-S-containing proteins Z1_02256 529507.PMI1860 5.5e-228 796.6 Proteus iscS GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004123,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0009000,GO:0009058,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016226,GO:0016740,GO:0016769,GO:0016782,GO:0016783,GO:0016829,GO:0016846,GO:0018130,GO:0018131,GO:0019842,GO:0022607,GO:0030170,GO:0031071,GO:0031119,GO:0031163,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046484,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0070279,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901360,GO:1901363 2.8.1.7 ko:K04487 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07460,R11528,R11529 RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000,ko02048,ko03016,ko03029 iPC815.YPO2896,iYL1228.KPN_02862 Bacteria 1MU1C@1224,1RNCD@1236,3Z2FQ@583,COG1104@1,COG1104@2 NA|NA|NA E Master enzyme that delivers sulfur to a number of partners involved in Fe-S cluster assembly, tRNA modification or cofactor biosynthesis. Catalyzes the removal of elemental sulfur atoms from cysteine to produce alanine. Functions as a sulfur delivery protein for Fe-S cluster synthesis onto IscU, an Fe-S scaffold assembly protein, as well as other S acceptor proteins Z1_02257 529507.PMI1859 9.9e-67 259.2 Proteus iscU GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016226,GO:0016740,GO:0016782,GO:0019538,GO:0019725,GO:0022607,GO:0030003,GO:0031163,GO:0036455,GO:0042592,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046916,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051604,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097428,GO:0098771,GO:1901564 ko:K04488 ko00000 iAPECO1_1312.APECO1_3996,iB21_1397.B21_02385,iBWG_1329.BWG_2293,iE2348C_1286.E2348C_2812,iEC042_1314.EC042_2733,iEC55989_1330.EC55989_2814,iECABU_c1320.ECABU_c28350,iECBD_1354.ECBD_1155,iECB_1328.ECB_02421,iECDH10B_1368.ECDH10B_2696,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2456,iECD_1391.ECD_02421,iECED1_1282.ECED1_2960,iECH74115_1262.ECH74115_3761,iECIAI1_1343.ECIAI1_2581,iECIAI39_1322.ECIAI39_2730,iECNA114_1301.ECNA114_2608,iECO103_1326.ECO103_3046,iECO111_1330.ECO111_3253,iECO26_1355.ECO26_3576,iECOK1_1307.ECOK1_2878,iECP_1309.ECP_2534,iECS88_1305.ECS88_2705,iECSE_1348.ECSE_2815,iECSF_1327.ECSF_2373,iECSP_1301.ECSP_3473,iECUMN_1333.ECUMN_2849,iECW_1372.ECW_m2755,iECs_1301.ECs3395,iEKO11_1354.EKO11_1204,iETEC_1333.ETEC_2686,iEcDH1_1363.EcDH1_1139,iEcE24377_1341.EcE24377A_2814,iEcHS_1320.EcHS_A2680,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2682,iEcolC_1368.EcolC_1148,iG2583_1286.G2583_3059,iJO1366.b2529,iSDY_1059.SDY_2725,iSFV_1184.SFV_2577,iSF_1195.SF2576,iSFxv_1172.SFxv_2832,iSSON_1240.SSON_2611,iS_1188.S2748,iUMN146_1321.UM146_04055,iUMNK88_1353.UMNK88_3182,iUTI89_1310.UTI89_C2851,iWFL_1372.ECW_m2755,iY75_1357.Y75_RS13200,iZ_1308.Z3796,ic_1306.c3055 Bacteria 1RD5K@1224,1S3P1@1236,3Z2K6@583,COG0822@1,COG0822@2 NA|NA|NA C A scaffold on which IscS assembles Fe-S clusters. It is likely that Fe-S cluster coordination is flexible as the role of this complex is to build and then hand off Fe-S clusters Z1_02258 529507.PMI1858 1.1e-53 215.7 Proteus iscA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016226,GO:0016530,GO:0019538,GO:0022607,GO:0031163,GO:0034986,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0051604,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097428,GO:0140104,GO:1901564 ko:K05997,ko:K13628 ko00000,ko03016 iAPECO1_1312.APECO1_3997,iB21_1397.B21_02384,iBWG_1329.BWG_2292,iE2348C_1286.E2348C_2811,iEC042_1314.EC042_2732,iEC55989_1330.EC55989_2813,iECABU_c1320.ECABU_c28340,iECBD_1354.ECBD_1156,iECB_1328.ECB_02420,iECDH10B_1368.ECDH10B_2695,iECD_1391.ECD_02420,iECED1_1282.ECED1_2959,iECIAI1_1343.ECIAI1_2580,iECIAI39_1322.ECIAI39_2729,iECNA114_1301.ECNA114_2607,iECO103_1326.ECO103_3045,iECO111_1330.ECO111_3252,iECO26_1355.ECO26_3575,iECOK1_1307.ECOK1_2877,iECP_1309.ECP_2533,iECS88_1305.ECS88_2704,iECSE_1348.ECSE_2814,iECSF_1327.ECSF_2372,iECSP_1301.ECSP_3472,iECUMN_1333.ECUMN_2848,iECW_1372.ECW_m2754,iECs_1301.ECs3394,iEKO11_1354.EKO11_1205,iETEC_1333.ETEC_2685,iEcDH1_1363.EcDH1_1140,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2681,iEcolC_1368.EcolC_1149,iG2583_1286.G2583_3058,iJO1366.b2528,iLF82_1304.LF82_1120,iNRG857_1313.NRG857_12580,iSBO_1134.SBO_2552,iSDY_1059.SDY_2724,iSF_1195.SF2575,iSSON_1240.SSON_2610,iS_1188.S2747,iUMN146_1321.UM146_04060,iUMNK88_1353.UMNK88_3181,iWFL_1372.ECW_m2754,iY75_1357.Y75_RS13195,iZ_1308.Z3795,ic_1306.c3053 Bacteria 1RH6T@1224,1S5XD@1236,3Z2QS@583,COG0316@1,COG0316@2 NA|NA|NA C iron-sulfur cluster assembly protein Z1_02259 529507.PMI1857 2.7e-91 341.3 Proteus hscB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0032991,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0051604,GO:0071704,GO:0097428,GO:1901564,GO:1902494,GO:1990230,GO:1990234 ko:K04082,ko:K05801 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1RHZX@1224,1S9YH@1236,3Z2WJ@583,COG1076@1,COG1076@2 NA|NA|NA O Co-chaperone involved in the maturation of iron-sulfur cluster-containing proteins. Seems to help targeting proteins to be folded toward HscA Z1_02260 529507.PMI1856 0.0 1174.5 Proteus hscA GO:0000166,GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006986,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010467,GO:0010556,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0016989,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022607,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034620,GO:0035639,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036094,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043531,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044183,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051087,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051604,GO:0051716,GO:0060255,GO:0061077,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070417,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097428,GO:0140110,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902494,GO:1903506,GO:1990230,GO:1990234,GO:2001141 ko:K04043,ko:K04044 ko03018,ko04212,ko05152,map03018,map04212,map05152 ko00000,ko00001,ko03019,ko03029,ko03110,ko04147 1.A.33,1.A.33.1 Bacteria 1MVQI@1224,1RN74@1236,3Z15F@583,COG0443@1,COG0443@2 NA|NA|NA O Chaperone involved in the maturation of iron-sulfur cluster-containing proteins. Has a low intrinsic ATPase activity which is markedly stimulated by HscB. Involved in the maturation of IscU Z1_02261 529507.PMI1855 1.6e-57 228.4 Proteus fdx ko:K04755 ko00000 Bacteria 1RHDC@1224,1S5XW@1236,3Z2T9@583,COG0633@1,COG0633@2 NA|NA|NA C 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain Z1_02262 529507.PMI1854 1.2e-31 141.7 Proteus iscX GO:0003674,GO:0004857,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0022607,GO:0030234,GO:0031163,GO:0043086,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044085,GO:0044092,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050790,GO:0051186,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071840,GO:0098772 Bacteria 1N7C1@1224,1SC9F@1236,3Z30T@583,COG2975@1,COG2975@2 NA|NA|NA S Iron-sulphur cluster assembly Z1_02263 529507.PMI1853 6.9e-245 852.8 Proteus pepB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016787,GO:0019538,GO:0034641,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.4.11.1,3.4.11.23 ko:K01255,ko:K07751 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R00899,R04951 RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 iAF1260.b2523,iBWG_1329.BWG_2287,iECDH10B_1368.ECDH10B_2690,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2450,iEcDH1_1363.EcDH1_1145,iJO1366.b2523,iY75_1357.Y75_RS13170 Bacteria 1MUIN@1224,1RNFI@1236,3Z1QN@583,COG0260@1,COG0260@2 NA|NA|NA E Probably plays an important role in intracellular peptide degradation Z1_02264 529507.PMI1852 2.1e-73 281.6 Proteus sseB Bacteria 1R4DR@1224,1RRDT@1236,28I6Y@1,2Z89T@2,3Z31B@583 NA|NA|NA S SseB protein C-terminal domain Z1_02265 529507.PMI1851 0.0 3346.2 Proteus yfhM GO:0003674,GO:0004857,GO:0004866,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009892,GO:0009897,GO:0009986,GO:0010466,GO:0010605,GO:0010951,GO:0016020,GO:0019222,GO:0030162,GO:0030234,GO:0030414,GO:0031224,GO:0031225,GO:0031226,GO:0031233,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031362,GO:0032268,GO:0032269,GO:0043086,GO:0044092,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045861,GO:0046658,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051336,GO:0051346,GO:0052547,GO:0052548,GO:0060255,GO:0061134,GO:0061135,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098552,GO:0098772 ko:K06894 ko00000 Bacteria 1MV7J@1224,1RNRY@1236,3Z21P@583,COG2373@1,COG2373@2 NA|NA|NA S Large extracellular alpha-helical protein Z1_02266 529507.PMI1850 0.0 1556.2 Proteus pbpC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008658,GO:0008955,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0031224,GO:0031406,GO:0033218,GO:0033293,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044425,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051302,GO:0051781,GO:0065007,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901681 2.4.1.129 ko:K05367 ko00550,map00550 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003,ko01011 GT51 iE2348C_1286.E2348C_2802,iECO111_1330.ECO111_3243,iSF_1195.SF2565 Bacteria 1MUA9@1224,1RMBV@1236,3Z0WQ@583,COG4953@1,COG4953@2 NA|NA|NA M penicillin-binding protein 1C Z1_02267 529507.PMI1849 2.4e-74 284.6 Proteus ndk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004550,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006165,GO:0006220,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009132,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0019205,GO:0019637,GO:0034641,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046939,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072527,GO:1901360,GO:1901564 2.7.4.6 ko:K00940 ko00230,ko00240,ko00983,ko01100,ko01110,ko01130,ko04016,map00230,map00240,map00983,map01100,map01110,map01130,map04016 M00049,M00050,M00052,M00053 R00124,R00139,R00156,R00330,R00570,R00722,R01137,R01857,R02093,R02326,R02331,R03530,R11894,R11895 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131 Bacteria 1R9ZA@1224,1S1Z3@1236,3Z1GI@583,COG0105@1,COG0105@2 NA|NA|NA F Major role in the synthesis of nucleoside triphosphates other than ATP. The ATP gamma phosphate is transferred to the NDP beta phosphate via a ping-pong mechanism, using a phosphorylated active-site intermediate Z1_02268 529507.PMI1848 2e-222 778.1 Proteus rlmN GO:0000049,GO:0000154,GO:0001510,GO:0002935,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008169,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016426,GO:0016433,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0030488,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0070040,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140101,GO:0140102,GO:1901360,GO:1901363 2.1.1.192 ko:K06941 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MUYK@1224,1RMUI@1236,3Z2CW@583,COG0820@1,COG0820@2 NA|NA|NA J Specifically methylates position 2 of adenine 2503 in 23S rRNA and position 2 of adenine 37 in tRNAs Z1_02269 529507.PMI1847 1.1e-74 285.8 Proteus sscB ko:K02656,ko:K20543 ko00000,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.55.3 Bacteria 1QCNJ@1224,1T8E3@1236,3Z2QP@583,COG3063@1,COG3063@2 NA|NA|NA NU Type IV pilus biogenesis stability protein PilW Z1_02270 529507.PMI1846 3.2e-162 577.8 Proteus rodZ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008150,GO:0008360,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022603,GO:0022604,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944 ko:K15539 ko00000 Bacteria 1N240@1224,1RQMV@1236,3Z1YG@583,COG1426@1,COG1426@2 NA|NA|NA S Cytoskeletal protein that is involved in cell-shape control through regulation of the length of the long axis Z1_02271 529507.PMI1845 2.1e-205 721.5 Proteus ispG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006720,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009055,GO:0009058,GO:0009240,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016725,GO:0019288,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019752,GO:0022900,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046429,GO:0046490,GO:0046872,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0052592,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901576 1.17.7.1,1.17.7.3 ko:K03526 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R08689,R10859 RC01486 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2515,iAPECO1_1312.APECO1_4009,iB21_1397.B21_02369,iBWG_1329.BWG_2279,iE2348C_1286.E2348C_2798,iEC55989_1330.EC55989_2800,iECABU_c1320.ECABU_c28200,iECBD_1354.ECBD_1171,iECB_1328.ECB_02407,iECDH10B_1368.ECDH10B_2681,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2442,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_1153,iECD_1391.ECD_02407,iECED1_1282.ECED1_2946,iECH74115_1262.ECH74115_3740,iECIAI39_1322.ECIAI39_2716,iECNA114_1301.ECNA114_2593,iECO103_1326.ECO103_3032,iECO111_1330.ECO111_3239,iECO26_1355.ECO26_3562,iECOK1_1307.ECOK1_2863,iECP_1309.ECP_2520,iECS88_1305.ECS88_2691,iECSE_1348.ECSE_2801,iECSF_1327.ECSF_2359,iECSP_1301.ECSP_3455,iECW_1372.ECW_m2740,iECs_1301.ECs3377,iEKO11_1354.EKO11_1218,iETEC_1333.ETEC_2672,iEcDH1_1363.EcDH1_1153,iEcE24377_1341.EcE24377A_2799,iEcolC_1368.EcolC_1162,iHN637.CLJU_RS06430,iIT341.HP0625,iJN678.gcpE,iJO1366.b2515,iJR904.b2515,iLF82_1304.LF82_1130,iNRG857_1313.NRG857_12515,iUMN146_1321.UM146_04130,iUMNK88_1353.UMNK88_3165,iUTI89_1310.UTI89_C2836,iWFL_1372.ECW_m2740,iY75_1357.Y75_RS13130,iYL1228.KPN_02845,iZ_1308.Z3778,ic_1306.c3037 Bacteria 1MUAX@1224,1RMXZ@1236,3Z2A8@583,COG0821@1,COG0821@2 NA|NA|NA I Converts 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate (ME-2,4cPP) into 1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate Z1_02272 529507.PMI1844 3.6e-246 857.1 Proteus hisS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004821,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006427,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0030312,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0040007,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.21 ko:K01892 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03655 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iE2348C_1286.E2348C_2797,iECNA114_1301.ECNA114_2592,iECSF_1327.ECSF_2358 Bacteria 1MV2K@1224,1RPHI@1236,3Z159@583,COG0124@1,COG0124@2 NA|NA|NA J Histidyl-tRNA synthetase Z1_02273 529507.PMI1843 6.4e-108 396.7 Proteus yfgM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071575,GO:0071944,GO:0098552 Bacteria 1N117@1224,1S95P@1236,3Z103@583,COG2976@1,COG2976@2 NA|NA|NA S Tetratricopeptide repeat-like domain Z1_02274 529507.PMI1842 1.8e-199 701.8 Proteus bamB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042802,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045229,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0055114,GO:0061024,GO:0070727,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0098552,GO:0098796,GO:1990063 ko:K17713 ko00000,ko02000 1.B.33.1 Bacteria 1MXIJ@1224,1RN4V@1236,3Z1WS@583,COG1520@1,COG1520@2 NA|NA|NA M Part of the outer membrane protein assembly complex, which is involved in assembly and insertion of beta-barrel proteins into the outer membrane Z1_02275 529507.PMI1841 1.2e-256 892.1 Proteus der GO:0000027,GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006996,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0032794,GO:0034622,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043023,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071826,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097216,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03977 ko00000,ko03009 Bacteria 1MU9S@1224,1RMSF@1236,3Z1J5@583,COG1160@1,COG1160@2 NA|NA|NA S GTPase that plays an essential role in the late steps of ribosome biogenesis Z1_02276 529507.PMI1840 1.7e-65 255.0 Proteus Bacteria 1QG79@1224,1TDK8@1236,2CBVY@1,301F2@2,3Z33U@583 NA|NA|NA Z1_02277 34506.g858 2.8e-184 651.0 Bilateria 1.3.3.3 ko:K00228 ko00860,ko01100,ko01110,map00860,map01100,map01110 M00121 R03220 RC00884 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Metazoa 38BVF@33154,3BDJW@33208,3CV5T@33213,COG0408@1,KOG1518@2759 NA|NA|NA H coproporphyrinogen oxidase activity Z1_02278 34506.g859 3.2e-77 294.3 Bilateria Metazoa 2EK8E@1,2SQ6W@2759,3AM3N@33154,3C0U3@33208,3DGMH@33213 NA|NA|NA S Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02279 529507.PMI1837 2.5e-109 401.4 Proteus yfeY Bacteria 1RB4E@1224,1RRU9@1236,28PEC@1,2ZC5Z@2,3Z2VW@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1131) Z1_02280 529507.PMI1836 1.2e-166 592.4 Proteus yfeX GO:0003674,GO:0003824,GO:0004601,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016684,GO:0020037,GO:0042221,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070887,GO:0097159,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901363,GO:1990748 ko:K07223 ko00000 Bacteria 1MWDD@1224,1RMZJ@1236,3Z1YH@583,COG2837@1,COG2837@2 NA|NA|NA P Dyp-type peroxidase family Z1_02281 34506.g860 1.2e-194 685.6 Eukaryota ko:K02048 ko00920,ko02010,map00920,map02010 M00185 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.6.1,3.A.1.6.3 Eukaryota 2RZHC@2759,COG1613@1 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_02282 529507.PMI1834 5.5e-147 526.9 Proteus cysT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008272,GO:0015698,GO:0016020,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071944,GO:0072348 ko:K02018,ko:K02046 ko00920,ko02010,map00920,map02010 M00185,M00189 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.6.1,3.A.1.6.3,3.A.1.8 iAPECO1_1312.APECO1_4122,iE2348C_1286.E2348C_2609,iECNA114_1301.ECNA114_2500,iECOK1_1307.ECOK1_2740,iECP_1309.ECP_2447,iECS88_1305.ECS88_2613,iECSF_1327.ECSF_2287,iLF82_1304.LF82_0425,iNRG857_1313.NRG857_12150,iSDY_1059.SDY_2620,iUMN146_1321.UM146_04505,iUTI89_1310.UTI89_C2757,iYL1228.KPN_02772 Bacteria 1QTTU@1224,1RS0W@1236,3Z1JF@583,COG0555@1,COG0555@2 NA|NA|NA P Sulfate ABC transporter, permease protein CysT Z1_02283 529507.PMI1833 2e-152 545.0 Proteus cysW GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02046,ko:K02047 ko00920,ko02010,map00920,map02010 M00185 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.6.1,3.A.1.6.3 iJN678.cysW,iPC815.YPO3013 Bacteria 1MV8X@1224,1RNZK@1236,3Z0YB@583,COG4208@1,COG4208@2 NA|NA|NA P sulfate ABC transporter, permease protein CysW Z1_02284 529507.PMI1832 6.2e-207 726.5 Proteus cysA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008272,GO:0008509,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015116,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015419,GO:0015698,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034220,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043225,GO:0043492,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0072348,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:0099133,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901682,GO:1902358 3.6.3.25,3.6.3.29 ko:K02017,ko:K02045,ko:K10112 ko00920,ko02010,map00920,map02010 M00185,M00189,M00194,M00196,M00197,M00200,M00201,M00206,M00207,M00491,M00602,M00605,M00606 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.1,3.A.1.6.1,3.A.1.6.3,3.A.1.8 iE2348C_1286.E2348C_2607,iSSON_1240.SSON_2511 Bacteria 1QTTT@1224,1RN1B@1236,3Z1TD@583,COG1118@1,COG1118@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex CysAWTP involved in sulfate thiosulfate import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_02285 529507.PMI1831 1.6e-160 572.0 Proteus cysM GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004124,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006535,GO:0006563,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019344,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0080146,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.5.1.47 ko:K01738,ko:K12339 ko00270,ko00920,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00270,map00920,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00021 R00897,R03132,R03601,R04859 RC00020,RC02814,RC02821,RC02876 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_2444 Bacteria 1MUBE@1224,1RN6J@1236,3Z26Y@583,COG0031@1,COG0031@2 NA|NA|NA E Pyridoxal-phosphate dependent enzyme Z1_02286 529507.PMI1830 7.4e-86 323.2 Proteus crr GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006109,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008643,GO:0009401,GO:0009892,GO:0009898,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0019222,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031234,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045912,GO:0048519,GO:0050789,GO:0051179,GO:0051234,GO:0065007,GO:0071702,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098552,GO:0098562 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02777 ko00010,ko00500,ko00520,ko02026,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02026,map02060,map05111 M00265,M00266,M00268,M00270,M00271,M00272,M00303,M00806 R02738,R02780,R04111,R04394,R05132,R08559 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.2.11,4.A.1.2.2,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6 e_coli_core.b2417,iAF1260.b2417,iAPECO1_1312.APECO1_4128,iB21_1397.B21_02278,iBWG_1329.BWG_2179,iE2348C_1286.E2348C_2603,iEC042_1314.EC042_2626,iEC55989_1330.EC55989_2707,iECABU_c1320.ECABU_c27380,iECBD_1354.ECBD_1264,iECB_1328.ECB_02317,iECDH10B_1368.ECDH10B_2582,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2351,iECD_1391.ECD_02317,iECED1_1282.ECED1_2861,iECH74115_1262.ECH74115_3648,iECIAI1_1343.ECIAI1_2475,iECIAI39_1322.ECIAI39_2563,iECNA114_1301.ECNA114_2494,iECO103_1326.ECO103_2936,iECO111_1330.ECO111_3147,iECO26_1355.ECO26_3470,iECOK1_1307.ECOK1_2734,iECS88_1305.ECS88_2607,iECSE_1348.ECSE_2708,iECSF_1327.ECSF_2281,iECSP_1301.ECSP_3365,iECUMN_1333.ECUMN_2739,iECW_1372.ECW_m2646,iEKO11_1354.EKO11_1311,iETEC_1333.ETEC_2530,iEcDH1_1363.EcDH1_1244,iEcE24377_1341.EcE24377A_2704,iEcHS_1320.EcHS_A2552,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2572,iEcolC_1368.EcolC_1261,iG2583_1286.G2583_2949,iJO1366.b2417,iJR904.b2417,iLF82_1304.LF82_0357,iNRG857_1313.NRG857_12120,iSFV_1184.SFV_2469,iSF_1195.SF2472,iSFxv_1172.SFxv_2721,iSSON_1240.SSON_2506,iS_1188.S2618,iUMN146_1321.UM146_04535,iUMNK88_1353.UMNK88_3019,iUTI89_1310.UTI89_C2751,iWFL_1372.ECW_m2646,iY75_1357.Y75_RS12665,ic_1306.c2952 Bacteria 1MWIQ@1224,1RNE3@1236,3Z28P@583,COG2190@1,COG2190@2 NA|NA|NA G phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 1 Z1_02287 529507.PMI1829 0.0 1086.6 Proteus ptsI GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008643,GO:0008965,GO:0009401,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016775,GO:0019197,GO:0032991,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702 2.7.1.121,2.7.3.9 ko:K05881,ko:K08483 ko00561,ko02060,map00561,map02060 R01012 RC00015,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 8.A.7 iB21_1397.B21_02277,iE2348C_1286.E2348C_2602,iEC042_1314.EC042_2625,iECBD_1354.ECBD_1265,iECB_1328.ECB_02316,iECD_1391.ECD_02316,iECH74115_1262.ECH74115_3647,iECIAI1_1343.ECIAI1_2474,iECIAI39_1322.ECIAI39_2562,iECO103_1326.ECO103_2935,iECO111_1330.ECO111_3146,iECO26_1355.ECO26_3469,iECP_1309.ECP_2440,iECSE_1348.ECSE_2707,iECSP_1301.ECSP_3364,iECUMN_1333.ECUMN_2738,iECW_1372.ECW_m2645,iECs_1301.ECs3288,iEKO11_1354.EKO11_1312,iEcE24377_1341.EcE24377A_2703,iEcHS_1320.EcHS_A2551,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2571,iEcolC_1368.EcolC_1262,iLF82_1304.LF82_1770,iNRG857_1313.NRG857_12115,iSBO_1134.SBO_2440,iSDY_1059.SDY_2613,iSFV_1184.SFV_2468,iSF_1195.SF2471,iSFxv_1172.SFxv_2720,iSSON_1240.SSON_2505,iS_1188.S2617,iUMNK88_1353.UMNK88_3018,iWFL_1372.ECW_m2645,iZ_1308.Z3682 Bacteria 1MUT8@1224,1RN6R@1236,3Z20I@583,COG1080@1,COG1080@2 NA|NA|NA G General (non sugar-specific) component of the phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system (sugar PTS). This major carbohydrate active-transport system catalyzes the phosphorylation of incoming sugar substrates concomitantly with their translocation across the cell membrane. Enzyme I transfers the phosphoryl group from phosphoenolpyruvate (PEP) to the phosphoryl carrier protein (HPr) Z1_02288 529507.PMI1828 3.2e-37 160.6 Proteus ptsH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005981,GO:0006109,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006810,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008643,GO:0008965,GO:0008982,GO:0009401,GO:0009893,GO:0009894,GO:0009896,GO:0009987,GO:0010604,GO:0010675,GO:0010676,GO:0010906,GO:0010907,GO:0015144,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0019197,GO:0019222,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030234,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031329,GO:0031331,GO:0032881,GO:0032991,GO:0034219,GO:0043085,GO:0043467,GO:0043470,GO:0043471,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045819,GO:0045913,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0060255,GO:0062012,GO:0062013,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070873,GO:0070875,GO:0071702,GO:0080090,GO:0098772 2.7.1.121 ko:K02784,ko:K05881,ko:K08485,ko:K11189 ko00561,ko02060,map00561,map02060 R01012 RC00015,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 4.A.2.1,8.A.8.1.1 e_coli_core.b2415,iAF1260.b2415,iB21_1397.B21_02276,iBWG_1329.BWG_2177,iE2348C_1286.E2348C_2601,iEC042_1314.EC042_2624,iEC55989_1330.EC55989_2705,iECABU_c1320.ECABU_c27360,iECBD_1354.ECBD_1266,iECB_1328.ECB_02315,iECDH10B_1368.ECDH10B_2580,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2349,iECDH1ME8569_1439.EcDH1_1246,iECD_1391.ECD_02315,iECED1_1282.ECED1_2859,iECH74115_1262.ECH74115_3646,iECIAI1_1343.ECIAI1_2473,iECIAI39_1322.ECIAI39_2561,iECNA114_1301.ECNA114_2492,iECO103_1326.ECO103_2934,iECO111_1330.ECO111_3145,iECO26_1355.ECO26_3468,iECOK1_1307.ECOK1_2732,iECP_1309.ECP_2439,iECS88_1305.ECS88_2605,iECSE_1348.ECSE_2706,iECSF_1327.ECSF_2279,iECSP_1301.ECSP_3363,iECUMN_1333.ECUMN_2737,iECW_1372.ECW_m2644,iECs_1301.ECs3287,iEKO11_1354.EKO11_1313,iETEC_1333.ETEC_2528,iEcDH1_1363.EcDH1_1246,iEcE24377_1341.EcE24377A_2702,iEcHS_1320.EcHS_A2550,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2570,iEcolC_1368.EcolC_1263,iG2583_1286.G2583_2947,iJO1366.b2415,iJR904.b2415,iLF82_1304.LF82_1769,iNRG857_1313.NRG857_12110,iPC815.YPO2993,iSBO_1134.SBO_2439,iSDY_1059.SDY_2612,iSFV_1184.SFV_2467,iSF_1195.SF2470,iSFxv_1172.SFxv_2719,iSSON_1240.SSON_2504,iS_1188.S2616,iSbBS512_1146.SbBS512_E2765,iUMN146_1321.UM146_04545,iUMNK88_1353.UMNK88_3017,iUTI89_1310.UTI89_C2749,iWFL_1372.ECW_m2644,iY75_1357.Y75_RS12655,iZ_1308.Z3681,ic_1306.c2950 Bacteria 1N0CV@1224,1S9R2@1236,3Z2X6@583,COG1925@1,COG1925@2 NA|NA|NA G PTS HPr component phosphorylation site Z1_02289 529507.PMI1827 3.6e-174 617.5 Proteus cysK GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004124,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006535,GO:0006563,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009333,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019344,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0080146,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494,GO:1990234 2.5.1.47 ko:K01738 ko00270,ko00920,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00270,map00920,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00021 R00897,R03601,R04859 RC00020,RC02814,RC02821 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2414,iAPECO1_1312.APECO1_4131,iB21_1397.B21_02275,iBWG_1329.BWG_2176,iE2348C_1286.E2348C_2600,iEC042_1314.EC042_2623,iEC55989_1330.EC55989_2704,iECABU_c1320.ECABU_c27350,iECBD_1354.ECBD_1267,iECB_1328.ECB_02314,iECDH10B_1368.ECDH10B_2579,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2348,iECD_1391.ECD_02314,iECED1_1282.ECED1_2858,iECH74115_1262.ECH74115_3645,iECIAI1_1343.ECIAI1_2472,iECNA114_1301.ECNA114_2491,iECO103_1326.ECO103_2933,iECO111_1330.ECO111_3144,iECO26_1355.ECO26_3467,iECOK1_1307.ECOK1_2731,iECP_1309.ECP_2438,iECS88_1305.ECS88_2604,iECSE_1348.ECSE_2705,iECSF_1327.ECSF_2278,iECSP_1301.ECSP_3362,iECUMN_1333.ECUMN_2736,iECW_1372.ECW_m2643,iECs_1301.ECs3286,iEKO11_1354.EKO11_1314,iETEC_1333.ETEC_2527,iEcDH1_1363.EcDH1_1247,iEcHS_1320.EcHS_A2549,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2569,iEcolC_1368.EcolC_1264,iG2583_1286.G2583_2946,iJO1366.b2414,iJR904.b2414,iLF82_1304.LF82_0418,iNRG857_1313.NRG857_12105,iSSON_1240.SSON_2503,iSbBS512_1146.SbBS512_E2766,iUMN146_1321.UM146_04550,iUMNK88_1353.UMNK88_3016,iUTI89_1310.UTI89_C2747,iWFL_1372.ECW_m2643,iY75_1357.Y75_RS12650,iZ_1308.Z3680 Bacteria 1MUBE@1224,1RN6J@1236,3Z11M@583,COG0031@1,COG0031@2 NA|NA|NA E Belongs to the cysteine synthase cystathionine beta- synthase family Z1_02290 529507.PMI1826 3.4e-143 514.2 Proteus cysZ GO:0000096,GO:0000097,GO:0000103,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008271,GO:0008272,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008512,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009675,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015103,GO:0015116,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015296,GO:0015318,GO:0015672,GO:0015698,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016053,GO:0019344,GO:0019752,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046394,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072348,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:0098662,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901682,GO:1902358,GO:1902600 ko:K06203 ko00000 iJR904.b2413,iYL1228.KPN_02760 Bacteria 1MVFT@1224,1RMQT@1236,3Z1W3@583,COG2981@1,COG2981@2 NA|NA|NA P High affinity, high specificity proton-dependent sulfate transporter, which mediates sulfate uptake. Provides the sulfur source for the cysteine synthesis pathway Z1_02291 529507.PMI1824 1.4e-187 662.1 Proteus zipA GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022402,GO:0022607,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0032506,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051301,GO:0061640,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090529,GO:1902410,GO:1903047 ko:K03528 ko00000,ko03036 Bacteria 1MVHR@1224,1RMDB@1236,3Z2B5@583,COG3115@1,COG3115@2 NA|NA|NA D Essential cell division protein that stabilizes the FtsZ protofilaments by cross-linking them and that serves as a cytoplasmic membrane anchor for the Z ring. Also required for the recruitment to the septal ring of downstream cell division proteins Z1_02292 529507.PMI1823 0.0 1322.4 Proteus ligA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003909,GO:0003911,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006266,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006288,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016886,GO:0033554,GO:0034641,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051103,GO:0051287,GO:0051716,GO:0070403,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 6.5.1.2 ko:K01972 ko03030,ko03410,ko03420,ko03430,map03030,map03410,map03420,map03430 R00382 RC00005 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032,ko03400 iEC55989_1330.EC55989_2701,iECABU_c1320.ECABU_c27320,iECIAI1_1343.ECIAI1_2469,iECO103_1326.ECO103_2930,iECO111_1330.ECO111_3141,iECO26_1355.ECO26_3464,iECSE_1348.ECSE_2702,iECW_1372.ECW_m2640,iEKO11_1354.EKO11_1317,iEcE24377_1341.EcE24377A_2698,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2566,iWFL_1372.ECW_m2640,iYL1228.KPN_02758,ic_1306.c2945 Bacteria 1MV3R@1224,1RPAV@1236,3Z1Y6@583,COG0272@1,COG0272@2 NA|NA|NA L DNA ligase that catalyzes the formation of phosphodiester linkages between 5'-phosphoryl and 3'-hydroxyl groups in double-stranded DNA using NAD as a coenzyme and as the energy source for the reaction. It is essential for DNA replication and repair of damaged DNA Z1_02293 529507.PMI1822 1.3e-205 722.2 Proteus nupC ko:K03317,ko:K11535 ko00000,ko02000 2.A.41,2.A.41.1 Bacteria 1MXXX@1224,1RMBX@1236,3Z1WM@583,COG1972@1,COG1972@2 NA|NA|NA P Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus Z1_02294 529507.PMI1821 8.3e-34 149.1 Proteus ypeB 2.7.7.7 ko:K02342,ko:K09954,ko:K10857 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1N7GT@1224,1SCBX@1236,3Z2Z2@583,COG3530@1,COG3530@2 NA|NA|NA S Putative quorum-sensing-regulated virulence factor Z1_02295 529507.PMI1820 1.3e-73 282.3 Proteus papX3 Bacteria 1RM70@1224,1S83P@1236,3Z2QJ@583,COG1846@1,COG1846@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein Z1_02296 529507.PMI1819 2.8e-134 484.6 Proteus Bacteria 1R413@1224,1S3TR@1236,3Z0Y7@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_02299 529507.PMI1818 3.8e-281 973.4 Proteus gltX GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004818,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006424,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.17,6.1.1.24 ko:K01885,ko:K09698 ko00860,ko00970,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map00970,map01100,map01110,map01120 M00121,M00359,M00360 R03651,R05578 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko02048,ko03016 iEC042_1314.EC042_2616,iIT341.HP0476 Bacteria 1MUCR@1224,1RN3R@1236,3Z12M@583,COG0008@1,COG0008@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of glutamate to tRNA(Glu) in a two-step reaction glutamate is first activated by ATP to form Glu-AMP and then transferred to the acceptor end of tRNA(Glu) Z1_02307 529507.PMI1817 8.6e-50 202.6 Proteus Bacteria 1NCEG@1224,1SE2E@1236,3Z2V3@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_02308 529507.PMI1816 9e-144 516.2 Proteus phsC ko:K03620,ko:K08354 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10149 RC02823 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.5 Bacteria 1R4HB@1224,1RSIU@1236,3Z362@583,COG4117@1,COG4117@2 NA|NA|NA C Prokaryotic cytochrome b561 Z1_02309 471881.PROPEN_01849 2.4e-109 401.4 Proteus phsB ko:K08353,ko:K08358 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10149,R10150 RC02823,RC03109 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.10,5.A.3.5 Bacteria 1MU5T@1224,1RZ7M@1236,3Z3C8@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_02310 529507.PMI1814 0.0 1405.2 Proteus psrA 1.8.5.5 ko:K08352 ko00920,ko01120,map00920,map01120 R10149 RC02823 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 5.A.3.5 Bacteria 1P01N@1224,1SYHR@1236,3Z145@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Hydrogen sulfide production membrane anchoring protein K08352 Z1_02311 529507.PMI1813 3.6e-143 514.2 Proteus ko:K07090 ko00000 Bacteria 1RARR@1224,1SWX9@1236,3Z1FU@583,COG0730@1,COG0730@2 NA|NA|NA S Sulfite exporter TauE/SafE Z1_02313 529507.PMI1812 2e-126 458.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_02314 529507.PMI1811 2.1e-142 511.5 Proteus vacJ GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015711,GO:0015748,GO:0015914,GO:0016043,GO:0033036,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0071702,GO:0071840,GO:0120009,GO:0120010 ko:K04754 ko00000 Bacteria 1MVX0@1224,1RNPS@1236,3Z20R@583,COG2853@1,COG2853@2 NA|NA|NA M MlaA lipoprotein Z1_02315 529507.PMI1810 9.1e-256 889.0 Proteus fadL GO:0003674,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005324,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006869,GO:0008028,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0009279,GO:0010876,GO:0015075,GO:0015245,GO:0015267,GO:0015288,GO:0015318,GO:0015483,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015849,GO:0015908,GO:0015909,GO:0016020,GO:0019867,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022834,GO:0022836,GO:0022857,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0034220,GO:0044462,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K06076 ko00000,ko02000 1.B.9 iECs_1301.ECs3227,iG2583_1286.G2583_2880,iZ_1308.Z3608 Bacteria 1MUU4@1224,1RQZJ@1236,3Z20D@583,COG2067@1,COG2067@2 NA|NA|NA I Outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX) Z1_02316 529507.PMI1809 4.2e-49 200.3 Proteus yfcZ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N0DI@1224,1S91T@1236,3Z2W4@583,COG3691@1,COG3691@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF406) Z1_02317 529507.PMI1808 1.8e-237 828.2 Proteus fadI GO:0003674,GO:0003824,GO:0003857,GO:0003988,GO:0004300,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016408,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0033542,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 2.3.1.16 ko:K00632 ko00071,ko00280,ko00281,ko00362,ko00592,ko00642,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01212,map00071,map00280,map00281,map00362,map00592,map00642,map01100,map01110,map01120,map01130,map01212 M00087,M00113 R00829,R00927,R01177,R03778,R03858,R03991,R04546,R04742,R04747,R05506,R05586,R07891,R07895,R07899,R08091,R08095 RC00004,RC00326,RC00405,RC01702,RC02728,RC02898,RC02955 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO103_1326.ECO103_2806,iEcHS_1320.EcHS_A2493 Bacteria 1MU5G@1224,1RNGU@1236,3Z20E@583,COG0183@1,COG0183@2 NA|NA|NA I Catalyzes the final step of fatty acid oxidation in which acetyl-CoA is released and the CoA ester of a fatty acid two carbons shorter is formed Z1_02318 529507.PMI1807 0.0 1413.3 Proteus fadJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0003857,GO:0004300,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008692,GO:0009056,GO:0009062,GO:0009987,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016856,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0032787,GO:0034440,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:1901575 1.1.1.35,4.2.1.17,5.1.2.3,5.3.3.8 ko:K01782,ko:K01825 ko00071,ko00280,ko00281,ko00310,ko00362,ko00380,ko00410,ko00640,ko00650,ko00903,ko00930,ko01040,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00071,map00280,map00281,map00310,map00362,map00380,map00410,map00640,map00650,map00903,map00930,map01040,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00032,M00087 R01975,R03026,R03045,R03276,R04137,R04170,R04203,R04204,R04224,R04737,R04738,R04739,R04740,R04741,R04744,R04745,R04746,R04748,R04749,R04756,R05066,R05305,R06411,R06412,R06941,R06942,R07935,R07951,R08093,R08094 RC00029,RC00099,RC00117,RC00241,RC00525,RC00831,RC00834,RC00896,RC01078,RC01086,RC01095,RC01098,RC01103,RC01217,RC02115 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c26730,iETEC_1333.ETEC_2476,iEcE24377_1341.EcE24377A_2637,ic_1306.c2886 Bacteria 1MU9P@1224,1RMZ8@1236,3Z118@583,COG1024@1,COG1024@2,COG1250@1,COG1250@2 NA|NA|NA I Catalyzes the formation of a hydroxyacyl-CoA by addition of water on enoyl-CoA. Also exhibits 3-hydroxyacyl-CoA epimerase and 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase activities Z1_02319 529507.PMI1806 2.3e-84 318.2 Proteus sixA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564 ko:K08296 ko00000,ko01000 Bacteria 1NAAE@1224,1SD0B@1236,3Z2JW@583,COG2062@1,COG2062@2 NA|NA|NA T Phosphoglycerate mutase family Z1_02320 529507.PMI1805 3e-101 374.4 Proteus yfcN Bacteria 1MVS6@1224,1RPXD@1236,3Z2IK@583,COG2840@1,COG2840@2 NA|NA|NA S Small MutS-related domain Z1_02321 529507.PMI1804 3.7e-99 367.5 Proteus dps ko:K04047 ko00000,ko03036 Bacteria 1RAC5@1224,1SWQP@1236,3Z3BZ@583,COG0783@1,COG0783@2 NA|NA|NA P Ferritin-like domain Z1_02322 529507.PMI1803 4e-178 630.6 Proteus prmB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006304,GO:0006305,GO:0006306,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008757,GO:0009007,GO:0009008,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018364,GO:0019538,GO:0032259,GO:0032775,GO:0034641,GO:0036009,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044728,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140096,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901564 2.1.1.297,2.1.1.298 ko:K02493,ko:K07320 R10806 RC00003,RC03279 ko00000,ko01000,ko03009,ko03012 Bacteria 1MX8Q@1224,1RPHQ@1236,3Z2QY@583,COG2890@1,COG2890@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the 50S ribosomal protein L3 on a specific glutamine residue Z1_02323 529507.PMI1802 3.1e-206 724.2 Proteus aroC GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004107,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009423,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016838,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032553,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0048037,GO:0050662,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.2.3.5 ko:K01736 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R01714 RC00586 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_2469,iEC55989_1330.EC55989_2573,iECO103_1326.ECO103_2794,iECO111_1330.ECO111_3077,iECO26_1355.ECO26_3317,iECSE_1348.ECSE_2638,iECW_1372.ECW_m2518,iEKO11_1354.EKO11_1436,iIT341.HP0663,iSSON_1240.SSON_2387,iUMNK88_1353.UMNK88_2882,iWFL_1372.ECW_m2518 Bacteria 1MU98@1224,1RMQS@1236,3Z27U@583,COG0082@1,COG0082@2 NA|NA|NA E Catalyzes the anti-1,4-elimination of the C-3 phosphate and the C-6 proR hydrogen from 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate (EPSP) to yield chorismate, which is the branch point compound that serves as the starting substrate for the three terminal pathways of aromatic amino acid biosynthesis. This reaction introduces a second double bond into the aromatic ring system Z1_02324 529507.PMI1801 2.8e-140 504.6 Proteus yfcA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0016020,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K07090,ko:K11312 ko00000 Bacteria 1MXNM@1224,1RRH4@1236,3Z263@583,COG0730@1,COG0730@2 NA|NA|NA S Sulfite exporter TauE/SafE Z1_02325 529507.PMI1800 4.4e-108 397.1 Proteus yfcM GO:0003674,GO:0003824,GO:0004497,GO:0005488,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016705,GO:0016709,GO:0017185,GO:0018126,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043687,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0046872,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072580,GO:1901260,GO:1901564 ko:K09906 ko00000,ko01000,ko03012 Bacteria 1MWTG@1224,1RNHD@1236,3Z2NG@583,COG3101@1,COG3101@2 NA|NA|NA S Elongation factor P hydroxylase Z1_02326 529507.PMI1799 2e-42 177.9 Proteus yfcL GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N0DT@1224,1S9BA@1236,2CJ8F@1,32SAV@2,3Z2WI@583 NA|NA|NA S YfcL protein Z1_02327 529507.PMI1798 1.6e-171 608.6 Proteus Bacteria 1R8ST@1224,1S0CB@1236,28KMG@1,2ZA5X@2,3Z1EN@583 NA|NA|NA Z1_02328 529507.PMI1797 2e-100 371.7 Proteus Bacteria 1MZIE@1224,1S95R@1236,3Z2NP@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02329 529507.PMI1796 0.0 1390.9 Proteus mnmC GO:0000166,GO:0001510,GO:0002097,GO:0002098,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004808,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016491,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071949,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 2.1.1.61,2.1.1.72,2.4.2.29,4.2.1.151 ko:K00773,ko:K07319,ko:K11782,ko:K15461 ko00130,ko01110,map00130,map01110 R00601,R03789,R08702,R10209,R10666 RC00003,RC00053,RC00060,RC00063,RC01483,RC03232 ko00000,ko00001,ko01000,ko02048,ko03016 Bacteria 1MZW5@1224,1RMTE@1236,3Z2BE@583,COG0665@1,COG0665@2,COG4121@1,COG4121@2 NA|NA|NA H Catalyzes the last two steps in the biosynthesis of 5- methylaminomethyl-2-thiouridine (mnm(5)s(2)U) at the wobble position (U34) in tRNA. Catalyzes the FAD-dependent demodification of cmnm(5)s(2)U34 to nm(5)s(2)U34, followed by the transfer of a methyl group from S-adenosyl-L-methionine to nm(5)s(2)U34, to form mnm(5)s(2)U34 Z1_02330 529507.PMI1795 4.3e-225 786.9 Proteus fabB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004312,GO:0004315,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 2.3.1.41 ko:K00647 ko00061,ko00780,ko01100,ko01212,map00061,map00780,map01100,map01212 M00083,M00572 R04355,R04726,R04952,R04957,R04960,R04963,R04968,R07762,R10115,R10119 RC00039,RC02728,RC02729,RC02888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iAF1260.b2323,iAPECO1_1312.APECO1_4241,iB21_1397.B21_02208,iBWG_1329.BWG_2097,iE2348C_1286.E2348C_2463,iEC042_1314.EC042_2564,iEC55989_1330.EC55989_2567,iECABU_c1320.ECABU_c26560,iECBD_1354.ECBD_1336,iECB_1328.ECB_02248,iECDH10B_1368.ECDH10B_2485,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2261,iECD_1391.ECD_02248,iECED1_1282.ECED1_2787,iECIAI1_1343.ECIAI1_2400,iECIAI39_1322.ECIAI39_2472,iECNA114_1301.ECNA114_2414,iECO103_1326.ECO103_2787,iECO111_1330.ECO111_3071,iECO26_1355.ECO26_3311,iECOK1_1307.ECOK1_2605,iECP_1309.ECP_2362,iECS88_1305.ECS88_2471,iECSE_1348.ECSE_2632,iECSF_1327.ECSF_2200,iECUMN_1333.ECUMN_2663,iECW_1372.ECW_m2512,iEKO11_1354.EKO11_1442,iETEC_1333.ETEC_2459,iEcDH1_1363.EcDH1_1333,iEcHS_1320.EcHS_A2474,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2480,iEcolC_1368.EcolC_1329,iJO1366.b2323,iJR904.b2323,iLF82_1304.LF82_0605,iNRG857_1313.NRG857_11765,iSBO_1134.SBO_2360,iUMN146_1321.UM146_05195,iUTI89_1310.UTI89_C2608,iWFL_1372.ECW_m2512,iY75_1357.Y75_RS12180,ic_1306.c2869 Bacteria 1MU1X@1224,1RMDE@1236,3Z2A3@583,COG0304@1,COG0304@2 NA|NA|NA H Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain Z1_02331 529507.PMI1794 8.5e-165 586.3 Proteus yyaM Bacteria 1MWSU@1224,1RSF8@1236,3Z1US@583,COG0697@1,COG0697@2 NA|NA|NA EG EamA-like transporter family Z1_02332 529507.PMI1793 4e-147 527.3 Proteus ripA_1 Bacteria 1NETZ@1224,1RRXN@1236,3Z2VR@583,COG0662@1,COG0662@2,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_02333 529507.PMI1792 5.4e-214 750.0 Proteus pdxB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008614,GO:0008615,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0033711,GO:0034641,GO:0036001,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051287,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 1.1.1.290 ko:K03473 ko00750,ko01100,map00750,map01100 M00124 R04210 RC00084 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iZ_1308.Z3582 Bacteria 1N5TD@1224,1RMFW@1236,3Z1F5@583,COG0111@1,COG0111@2 NA|NA|NA H Catalyzes the oxidation of erythronate-4-phosphate to 3- hydroxy-2-oxo-4-phosphonooxybutanoate Z1_02334 529507.PMI1790 1.4e-184 652.1 Proteus asd GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004073,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006549,GO:0006553,GO:0006555,GO:0006566,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009085,GO:0009086,GO:0009088,GO:0009089,GO:0009097,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.2.1.11 ko:K00133 ko00260,ko00261,ko00270,ko00300,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00260,map00261,map00270,map00300,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00016,M00017,M00018,M00033,M00525,M00526,M00527 R02291 RC00684 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUHG@1224,1RNB6@1236,3Z22Y@583,COG0136@1,COG0136@2 NA|NA|NA E Semialdehyde dehydrogenase, NAD binding domain Z1_02335 34506.g689 5.2e-164 583.6 Rhabditida Nematoda 1M6GC@119089,38FPW@33154,3BRJ9@33208,3DDR0@33213,40P0R@6231,414U6@6236,COG0101@1,COG0111@1,COG0136@1,COG0304@1,KOG0068@2759,KOG1394@2759,KOG4393@2759,KOG4777@2759 NA|NA|NA AEIJ Domain of unknown function (DUF3410) Z1_02336 529507.PMI1788 1.8e-122 445.3 Proteus dedA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03975 ko00000 Bacteria 1MX4M@1224,1RPB1@1236,3Z1C2@583,COG0586@1,COG0586@2 NA|NA|NA S SNARE associated Golgi protein Z1_02337 529507.PMI1787 2.8e-174 617.8 Proteus accD GO:0001676,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003824,GO:0003989,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006417,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009317,GO:0009329,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0016053,GO:0016421,GO:0016874,GO:0016885,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032787,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0042759,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234,GO:2000112,GO:2000113 2.1.3.15,6.4.1.2 ko:K01963 ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00376 R00742,R04386 RC00040,RC00253,RC00367 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN678.accD,iPC815.YPO2768,iUTI89_1310.UTI89_C2601 Bacteria 1MW8G@1224,1RNDS@1236,3Z0YC@583,COG0777@1,COG0777@2 NA|NA|NA F Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta Z1_02338 529507.PMI1786 1.1e-247 862.1 Proteus folC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004326,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006761,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008841,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046452,GO:0046483,GO:0046900,GO:0046901,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.12,6.3.2.17 ko:K11754 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841 R00942,R02237,R04241 RC00064,RC00090,RC00162 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_2475,iJN746.PP_1997,iSDY_1059.SDY_2514 Bacteria 1MVCH@1224,1RMB0@1236,3Z2AQ@583,COG0285@1,COG0285@2 NA|NA|NA H Functions in two distinct reactions of the de novo folate biosynthetic pathway. Catalyzes the addition of a glutamate residue to dihydropteroate (7,8-dihydropteroate or H2Pte) to form dihydrofolate (7,8-dihydrofolate monoglutamate or H2Pte-Glu). Also catalyzes successive additions of L-glutamate to tetrahydrofolate or 10-formyltetrahydrofolate or 5,10-methylenetetrahydrofolate, leading to folylpolyglutamate derivatives Z1_02339 529507.PMI1785 3.8e-87 327.8 Proteus dedD GO:0000910,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0007049,GO:0008150,GO:0009987,GO:0022402,GO:0030428,GO:0032153,GO:0032506,GO:0042834,GO:0044464,GO:0051301,GO:0097367 ko:K02453,ko:K03642,ko:K03749 ko03070,ko05111,map03070,map05111 M00331 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.15 Bacteria 1MXHQ@1224,1RRKM@1236,3Z22W@583,COG3147@1,COG3147@2 NA|NA|NA D Sporulation related domain Z1_02340 529507.PMI1784 1.3e-82 312.4 Proteus cvpA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009403,GO:0009404,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019748,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044464,GO:0044550,GO:0071944 ko:K03558 ko00000 Bacteria 1NF4G@1224,1RQ58@1236,3Z2U1@583,COG1286@1,COG1286@2 NA|NA|NA S Colicin V production protein Z1_02341 529507.PMI1783 1.7e-290 1004.6 Proteus purF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004044,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006520,GO:0006541,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 2.4.2.14 ko:K00764 ko00230,ko00250,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00250,map01100,map01110,map01130 M00048 R01072 RC00010,RC02724,RC02752 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002 iAF1260.b2312,iB21_1397.B21_02197,iBWG_1329.BWG_2086,iECBD_1354.ECBD_1347,iECB_1328.ECB_02237,iECDH10B_1368.ECDH10B_2474,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2250,iECD_1391.ECD_02237,iECIAI1_1343.ECIAI1_2389,iECO103_1326.ECO103_2776,iECO111_1330.ECO111_3060,iECO26_1355.ECO26_3300,iECW_1372.ECW_m2501,iEKO11_1354.EKO11_1453,iETEC_1333.ETEC_2448,iEcDH1_1363.EcDH1_1344,iEcE24377_1341.EcE24377A_2606,iEcolC_1368.EcolC_1340,iJO1366.b2312,iJR904.b2312,iSF_1195.SF2388,iSFxv_1172.SFxv_2633,iSSON_1240.SSON_2370,iS_1188.S2523,iSbBS512_1146.SbBS512_E2690,iUMNK88_1353.UMNK88_2863,iWFL_1372.ECW_m2501,iY75_1357.Y75_RS12125 Bacteria 1MU0V@1224,1RMYA@1236,3Z1MH@583,COG0034@1,COG0034@2 NA|NA|NA F glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase Z1_02342 529507.PMI1782 1.1e-101 375.9 Proteus ubiX GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 2.5.1.129 ko:K03186 ko00130,ko00627,ko00940,ko01100,ko01110,ko01120,ko01220,map00130,map00627,map00940,map01100,map01110,map01120,map01220 M00117 R01238,R02952,R03367,R04985,R04986,R11225 RC00391,RC00814,RC03392 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2311,iAPECO1_1312.APECO1_4253,iB21_1397.B21_02196,iBWG_1329.BWG_2085,iE2348C_1286.E2348C_2451,iEC55989_1330.EC55989_2555,iECBD_1354.ECBD_1348,iECB_1328.ECB_02236,iECDH10B_1368.ECDH10B_2473,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2249,iECD_1391.ECD_02236,iECED1_1282.ECED1_2775,iECH74115_1262.ECH74115_3451,iECIAI39_1322.ECIAI39_2460,iECNA114_1301.ECNA114_2401,iECO103_1326.ECO103_2775,iECOK1_1307.ECOK1_2544,iECP_1309.ECP_2350,iECS88_1305.ECS88_2458,iECSE_1348.ECSE_2620,iECSF_1327.ECSF_2187,iECSP_1301.ECSP_3186,iECs_1301.ECs3195,iETEC_1333.ETEC_2447,iEcDH1_1363.EcDH1_1345,iEcE24377_1341.EcE24377A_2605,iEcHS_1320.EcHS_A2462,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2467,iG2583_1286.G2583_2848,iJO1366.b2311,iJR904.b2311,iLF82_1304.LF82_2354,iNRG857_1313.NRG857_11705,iSDY_1059.SDY_2510,iUMN146_1321.UM146_05255,iUMNK88_1353.UMNK88_2862,iUTI89_1310.UTI89_C2595,iY75_1357.Y75_RS12120,iZ_1308.Z3573 Bacteria 1RA0P@1224,1RPN1@1236,3Z29S@583,COG0163@1,COG0163@2 NA|NA|NA H Flavin prenyltransferase that catalyzes the synthesis of the prenylated FMN cofactor (prenyl-FMN) for 4-hydroxy-3- polyprenylbenzoic acid decarboxylase UbiD. The prenyltransferase is metal-independent and links a dimethylallyl moiety from dimethylallyl monophosphate (DMAP) to the flavin N5 and C6 atoms of FMN Z1_02343 529507.PMI1781 3.2e-156 557.8 Proteus yfcH ko:K07071 ko00000 Bacteria 1MUB4@1224,1RN6A@1236,3Z0YN@583,COG1090@1,COG1090@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1731) Z1_02344 529507.PMI1780 2.8e-116 424.5 Proteus yfcG GO:0003674,GO:0003824,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015036,GO:0016491,GO:0016667,GO:0050896,GO:0055114 ko:K11209 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUN3@1224,1RMF7@1236,3Z2V2@583,COG0625@1,COG0625@2 NA|NA|NA O Belongs to the GST superfamily Z1_02345 529507.PMI1779 9.6e-100 369.4 Proteus yfcD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.7.6.2,5.3.3.2 ko:K00949,ko:K01823 ko00730,ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00730,map00900,map01100,map01110,map01130 M00095,M00096,M00364,M00365,M00366,M00367 R00619,R01123 RC00002,RC00017,RC00455 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_0565 Bacteria 1P8AM@1224,1RQA3@1236,3Z2KU@583,COG1443@1,COG1443@2 NA|NA|NA I NUDIX domain Z1_02346 529507.PMI1778 7.1e-192 676.4 Proteus gntR ko:K06145 ko00000,ko03000 Bacteria 1MUEP@1224,1RR6G@1236,3Z277@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K helix_turn _helix lactose operon repressor Z1_02347 34506.g5149 9.3e-77 292.7 Bilateria Metazoa 2D153@1,2SGR1@2759,3ABVE@33154,3C584@33208,3DJ5T@33213 NA|NA|NA S Phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 Z1_02348 529507.PMI1776 1.3e-42 178.7 Proteus ulaB 2.7.1.194 ko:K02822 ko00053,ko01100,ko01120,ko02060,map00053,map01100,map01120,map02060 M00283,M00550 R07671 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.7.1 Bacteria 1RHFW@1224,1S6Y5@1236,3Z33C@583,COG3414@1,COG3414@2 NA|NA|NA G Phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component Z1_02349 34506.g5150 1.8e-226 791.6 Bilateria Metazoa 2EEDN@1,2SJU4@2759,3AIQ5@33154,3BWY5@33208,3DE42@33213 NA|NA|NA S PTS system sugar-specific permease component Z1_02350 529507.PMI1774 7.9e-227 792.7 Proteus alr GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008784,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016855,GO:0030203,GO:0034645,GO:0036361,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0047661,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 5.1.1.1,6.3.2.10 ko:K01775,ko:K01929 ko00300,ko00473,ko00550,ko01100,ko01502,map00300,map00473,map00550,map01100,map01502 R00401,R04573,R04617 RC00064,RC00141,RC00285 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 Bacteria 1NXDA@1224,1RU2U@1236,3Z2AX@583,COG0787@1,COG0787@2 NA|NA|NA M Catalyzes the interconversion of L-alanine and D- alanine. May also act on other amino acids Z1_02351 529507.PMI1773 0.0 1632.5 Gammaproteobacteria gcd GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004344,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008876,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016901,GO:0019842,GO:0031224,GO:0031406,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043177,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046872,GO:0048037,GO:0048038,GO:0048039,GO:0055114,GO:0070968,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363 1.1.5.2 ko:K00117 ko00030,ko01100,ko01110,ko01130,map00030,map01100,map01110,map01130 R06620 RC00066 ko00000,ko00001,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_0117,iECIAI1_1343.ECIAI1_0122,iECW_1372.ECW_m0121,iEKO11_1354.EKO11_3792,iWFL_1372.ECW_m0121 Bacteria 1MUQX@1224,1RN5D@1236,COG4993@1,COG4993@2 NA|NA|NA G Dehydrogenase Z1_02352 529507.PMI1772 0.0 1385.5 Proteus pta GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006083,GO:0006084,GO:0006085,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006520,GO:0006566,GO:0006567,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008959,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009066,GO:0009068,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016053,GO:0016054,GO:0016407,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016999,GO:0017000,GO:0017001,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019413,GO:0019427,GO:0019438,GO:0019541,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033865,GO:0033866,GO:0033875,GO:0034030,GO:0034032,GO:0034033,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035383,GO:0035384,GO:0042737,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045733,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046395,GO:0046459,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070689,GO:0071616,GO:0071704,GO:0072329,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606 1.1.1.40,2.3.1.8 ko:K00029,ko:K13788 ko00430,ko00620,ko00640,ko00680,ko00710,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00430,map00620,map00640,map00680,map00710,map00720,map01100,map01120,map01200 M00169,M00172,M00357,M00579 R00216,R00230,R00921 RC00004,RC00105,RC02746,RC02816 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iG2583_1286.G2583_2834,iYL1228.KPN_02688 Bacteria 1QTS5@1224,1RMJS@1236,3Z1RM@583,COG0280@1,COG0280@2,COG0857@1,COG0857@2 NA|NA|NA C phosphate acetyltransferase Z1_02353 529507.PMI1771 4.6e-227 793.5 Proteus ackA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006083,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008610,GO:0008776,GO:0009058,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016774,GO:0016999,GO:0017000,GO:0017144,GO:0019413,GO:0019541,GO:0019542,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042710,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044010,GO:0044011,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046394,GO:0046459,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051790,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090605,GO:0090609,GO:1901576 2.7.2.1 ko:K00925 ko00430,ko00620,ko00640,ko00680,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00430,map00620,map00640,map00680,map00720,map01100,map01120,map01200 M00357,M00579 R00315,R01353 RC00002,RC00043 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSDY_1059.SDY_2492,iYL1228.KPN_02687 Bacteria 1MW61@1224,1RMKB@1236,3Z1QW@583,COG0282@1,COG0282@2 NA|NA|NA F Catalyzes the formation of acetyl phosphate from acetate and ATP. Can also catalyze the reverse reaction Z1_02354 529507.PMI1770 8.1e-84 316.2 Proteus yfbV GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0010639,GO:0016020,GO:0033043,GO:0033044,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0065007,GO:0071944,GO:2001251 ko:K09899 ko00000 Bacteria 1N172@1224,1S2QC@1236,3Z2KM@583,COG3092@1,COG3092@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF412 Z1_02355 529507.PMI1769 5.3e-89 333.6 Proteus yfbU GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716 ko:K09161 ko00000 Bacteria 1QWV8@1224,1RME1@1236,3Z1F7@583,COG3013@1,COG3013@2 NA|NA|NA S YfbU domain Z1_02356 529507.PMI1768 3.1e-124 451.1 Proteus yfbT GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0030145,GO:0042578,GO:0043136,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050084,GO:0050286,GO:0050308,GO:0050897 3.1.3.23 ko:K19270 ko00000,ko01000 Bacteria 1MX3R@1224,1RPX2@1236,3Z1AJ@583,COG0637@1,COG0637@2 NA|NA|NA S Haloacid dehalogenase-like hydrolase Z1_02357 529507.PMI1767 0.0 1122.5 Proteus yfbS GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03281,ko:K03319,ko:K07085,ko:K14445 ko00000,ko02000 2.A.47,2.A.47.1,2.A.49,2.A.81 Bacteria 1MU0K@1224,1RMI1@1236,3Z1SV@583,COG0471@1,COG0471@2,COG0569@1,COG0569@2 NA|NA|NA P Tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctM component Z1_02358 529507.PMI1766 1.2e-103 382.5 Proteus yfbR GO:0002953,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006226,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008655,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009157,GO:0009162,GO:0009165,GO:0009176,GO:0009177,GO:0009219,GO:0009221,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0010139,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0032262,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043094,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043173,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046078,GO:0046385,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050897,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.1.3.89 ko:K08722 ko00240,ko01100,map00240,map01100 R01569,R01664,R01968,R02088,R02102,R10776 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iB21_1397.B21_02176,iEC55989_1330.EC55989_2535,iECBD_1354.ECBD_1368,iECB_1328.ECB_02216,iECD_1391.ECD_02216,iECH74115_1262.ECH74115_3430,iECIAI1_1343.ECIAI1_2365,iECIAI39_1322.ECIAI39_2438,iECO111_1330.ECO111_3039,iECO26_1355.ECO26_3279,iECSE_1348.ECSE_2548,iECSP_1301.ECSP_3165,iECUMN_1333.ECUMN_2630,iECs_1301.ECs3175,iEcHS_1320.EcHS_A2440,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2446,iEcolC_1368.EcolC_1361,iG2583_1286.G2583_2828,iSFV_1184.SFV_2358,iSF_1195.SF2367,iSFxv_1172.SFxv_2612,iS_1188.S2502,iYL1228.KPN_02681,iZ_1308.Z3552 Bacteria 1MVGJ@1224,1RSED@1236,3Z1F8@583,COG1896@1,COG1896@2 NA|NA|NA S Catalyzes the strictly specific dephosphorylation of 2'- deoxyribonucleoside 5'-monophosphates Z1_02359 529507.PMI1765 4.6e-235 820.1 Proteus alaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004021,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006523,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009078,GO:0009079,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0019272,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0030632,GO:0032787,GO:0033554,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042221,GO:0042851,GO:0042852,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0046144,GO:0046145,GO:0046394,GO:0046416,GO:0046436,GO:0046437,GO:0046677,GO:0047635,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070279,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.6.1.2,2.6.1.66 ko:K00814,ko:K14260 ko00220,ko00250,ko00290,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,map00220,map00250,map00290,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230 M00171 R00258,R01215 RC00006,RC00008,RC00036 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iNJ661.Rv0337c Bacteria 1MW0Z@1224,1RN5B@1236,3Z1KT@583,COG0436@1,COG0436@2 NA|NA|NA H Aminotransferase class I and II Z1_02360 529507.PMI1764 3.8e-165 587.4 Proteus lrhA GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 Bacteria 1PR6U@1224,1RQ7J@1236,3Z1MA@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02361 529507.PMI1762 4e-75 287.3 Proteus nuoA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0050136,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00330 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 e_coli_core.b2288,iAF1260.b2288,iAPECO1_1312.APECO1_4277,iB21_1397.B21_02173,iBWG_1329.BWG_2062,iE2348C_1286.E2348C_2428,iEC042_1314.EC042_2529,iEC55989_1330.EC55989_2532,iECABU_c1320.ECABU_c26200,iECBD_1354.ECBD_1373,iECB_1328.ECB_02213,iECDH10B_1368.ECDH10B_2450,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2225,iECD_1391.ECD_02213,iECED1_1282.ECED1_2752,iECH74115_1262.ECH74115_3427,iECIAI1_1343.ECIAI1_2362,iECIAI39_1322.ECIAI39_2435,iECO103_1326.ECO103_2752,iECO26_1355.ECO26_3276,iECOK1_1307.ECOK1_2521,iECP_1309.ECP_2327,iECS88_1305.ECS88_2435,iECSE_1348.ECSE_2545,iECSP_1301.ECSP_3162,iECUMN_1333.ECUMN_2627,iECW_1372.ECW_m2476,iECs_1301.ECs3172,iEKO11_1354.EKO11_1479,iETEC_1333.ETEC_2423,iEcDH1_1363.EcDH1_1369,iEcE24377_1341.EcE24377A_2581,iEcHS_1320.EcHS_A2437,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2442,iEcolC_1368.EcolC_1364,iG2583_1286.G2583_2825,iJN746.PP_4119,iJO1366.b2288,iJR904.b2288,iLF82_1304.LF82_1539,iNRG857_1313.NRG857_11585,iSBO_1134.SBO_2321,iSDY_1059.SDY_2484,iSFV_1184.SFV_2355,iSF_1195.SF2364,iSFxv_1172.SFxv_2608,iSSON_1240.SSON_2345,iS_1188.S2499,iSbBS512_1146.SbBS512_E2664,iUMN146_1321.UM146_05375,iUTI89_1310.UTI89_C2568,iWFL_1372.ECW_m2476,iY75_1357.Y75_RS11995,ic_1306.c2829 Bacteria 1RGUT@1224,1S644@1236,3Z31I@583,COG0838@1,COG0838@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02362 471881.PROPEN_01765 4.2e-129 467.2 Proteus nuoB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006120,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019693,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0032991,GO:0034220,GO:0034641,GO:0042773,GO:0042775,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050136,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1902600,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00331,ko:K13380 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iYL1228.KPN_02677 Bacteria 1MUI2@1224,1RP4R@1236,3Z20C@583,COG0377@1,COG0377@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02363 529507.PMI1760 0.0 1231.5 Proteus nuoC GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006120,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019693,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042773,GO:0042775,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0050136,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00332,ko:K00333,ko:K13378,ko:K13380 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iECDH10B_1368.ECDH10B_2448,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2223,iETEC_1333.ETEC_2421,iEcDH1_1363.EcDH1_1371,iPC815.YPO2553,iUMNK88_1353.UMNK88_2836 Bacteria 1MVIN@1224,1RM98@1236,3Z1AG@583,COG0649@1,COG0649@2,COG0852@1,COG0852@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02364 529507.PMI1759 6.7e-101 373.2 Proteus nuoE GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0048037,GO:0050136,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00334 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iYL1228.KPN_02675 Bacteria 1MWS2@1224,1RN4C@1236,3Z28H@583,COG1905@1,COG1905@2 NA|NA|NA C Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin Z1_02365 529507.PMI1758 2.9e-270 937.2 Proteus nuoF GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0010181,GO:0015980,GO:0016020,GO:0030964,GO:0032553,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051287,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00335 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 Bacteria 1MV8F@1224,1RMUD@1236,3Z1WD@583,COG1894@1,COG1894@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain Z1_02366 529507.PMI1757 0.0 1839.3 Proteus nuoG GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006120,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019693,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042773,GO:0042775,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050136,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00336 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iECs_1301.ECs3167,iG2583_1286.G2583_2820,iZ_1308.Z3542 Bacteria 1P8MN@1224,1RMUH@1236,3Z20J@583,COG1034@1,COG1034@2 NA|NA|NA C NADH dehydrogenase Z1_02367 529507.PMI1756 2.4e-178 631.3 Proteus nuoH GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0050136,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00337 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 Bacteria 1MU2R@1224,1RQE9@1236,3Z2FA@583,COG1005@1,COG1005@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient. This subunit may bind ubiquinone Z1_02368 529507.PMI1755 1.3e-93 349.0 Proteus nuoI GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0030964,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00338 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 e_coli_core.b2281,iAF1260.b2281,iAPECO1_1312.APECO1_4284,iB21_1397.B21_02166,iBWG_1329.BWG_2055,iE2348C_1286.E2348C_2421,iEC042_1314.EC042_2522,iEC55989_1330.EC55989_2525,iECABU_c1320.ECABU_c26130,iECBD_1354.ECBD_1380,iECB_1328.ECB_02206,iECDH10B_1368.ECDH10B_2443,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2218,iECD_1391.ECD_02206,iECED1_1282.ECED1_2745,iECH74115_1262.ECH74115_3420,iECIAI1_1343.ECIAI1_2355,iECIAI39_1322.ECIAI39_2428,iECNA114_1301.ECNA114_2371,iECO103_1326.ECO103_2745,iECO111_1330.ECO111_3029,iECO26_1355.ECO26_3269,iECOK1_1307.ECOK1_2514,iECP_1309.ECP_2320,iECS88_1305.ECS88_2428,iECSE_1348.ECSE_2538,iECSF_1327.ECSF_2158,iECSP_1301.ECSP_3155,iECUMN_1333.ECUMN_2620,iECW_1372.ECW_m2469,iECs_1301.ECs3165,iEKO11_1354.EKO11_1486,iETEC_1333.ETEC_2416,iEcDH1_1363.EcDH1_1376,iEcE24377_1341.EcE24377A_2574,iEcHS_1320.EcHS_A2430,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2435,iEcolC_1368.EcolC_1371,iG2583_1286.G2583_2818,iJO1366.b2281,iJR904.b2281,iLF82_1304.LF82_1546,iNRG857_1313.NRG857_11550,iPC815.YPO2548,iSBO_1134.SBO_2314,iSFV_1184.SFV_2348,iSF_1195.SF2357,iSFxv_1172.SFxv_2601,iS_1188.S2492,iSbBS512_1146.SbBS512_E2657,iUMN146_1321.UM146_05410,iUMNK88_1353.UMNK88_2831,iUTI89_1310.UTI89_C2561,iWFL_1372.ECW_m2469,iY75_1357.Y75_RS11960,iZ_1308.Z3540,ic_1306.c2822 Bacteria 1MV90@1224,1RN32@1236,3Z1KJ@583,COG1143@1,COG1143@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02369 529507.PMI1754 7.8e-86 323.2 Proteus nuoJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0050136,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00339 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 e_coli_core.b2280,iAF1260.b2280,iAPECO1_1312.APECO1_4285,iB21_1397.B21_02165,iBWG_1329.BWG_2054,iE2348C_1286.E2348C_2420,iEC042_1314.EC042_2521,iEC55989_1330.EC55989_2524,iECABU_c1320.ECABU_c26120,iECBD_1354.ECBD_1381,iECB_1328.ECB_02205,iECDH10B_1368.ECDH10B_2442,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2217,iECD_1391.ECD_02205,iECED1_1282.ECED1_2744,iECH74115_1262.ECH74115_3419,iECIAI1_1343.ECIAI1_2354,iECIAI39_1322.ECIAI39_2427,iECNA114_1301.ECNA114_2370,iECO103_1326.ECO103_2744,iECO111_1330.ECO111_3028,iECO26_1355.ECO26_3268,iECOK1_1307.ECOK1_2513,iECP_1309.ECP_2319,iECS88_1305.ECS88_2427,iECSE_1348.ECSE_2537,iECSF_1327.ECSF_2157,iECSP_1301.ECSP_3154,iECUMN_1333.ECUMN_2619,iECW_1372.ECW_m2468,iECs_1301.ECs3164,iEKO11_1354.EKO11_1487,iETEC_1333.ETEC_2415,iEcDH1_1363.EcDH1_1377,iEcE24377_1341.EcE24377A_2573,iEcHS_1320.EcHS_A2429,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2434,iEcolC_1368.EcolC_1372,iJO1366.b2280,iJR904.b2280,iLF82_1304.LF82_1547,iNRG857_1313.NRG857_11545,iSBO_1134.SBO_2313,iSDY_1059.SDY_2476,iSFV_1184.SFV_2347,iSF_1195.SF2356,iSFxv_1172.SFxv_2600,iSSON_1240.SSON_2337,iS_1188.S2491,iSbBS512_1146.SbBS512_E2656,iUMN146_1321.UM146_05415,iUMNK88_1353.UMNK88_2830,iUTI89_1310.UTI89_C2560,iWFL_1372.ECW_m2468,iY75_1357.Y75_RS11955,iZ_1308.Z3539,ic_1306.c2821 Bacteria 1MWJV@1224,1S65T@1236,3Z10C@583,COG0839@1,COG0839@2 NA|NA|NA C NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 Z1_02370 529507.PMI1753 6.2e-32 143.3 Proteus nuoK GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0050136,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00340 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iIT341.HP1270 Bacteria 1RH0S@1224,1S6FN@1236,3Z3FI@583,COG0713@1,COG0713@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02371 529507.PMI1752 0.0 1187.6 Proteus nuoL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0015672,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1902600,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00341 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 e_coli_core.b2278,iAF1260.b2278,iBWG_1329.BWG_2052,iECDH10B_1368.ECDH10B_2440,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2215,iEcDH1_1363.EcDH1_1379,iJN746.PP_4129,iJO1366.b2278,iJR904.b2278,iY75_1357.Y75_RS11945 Bacteria 1MW2M@1224,1RNKN@1236,3Z0VP@583,COG1009@1,COG1009@2 NA|NA|NA CP NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus Z1_02372 529507.PMI1751 2e-283 981.1 Proteus nuoM GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0048037,GO:0048038,GO:0048039,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1902600,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00342 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iSDY_1059.SDY_2473 Bacteria 1MV7V@1224,1RNI4@1236,3Z0WZ@583,COG1008@1,COG1008@2 NA|NA|NA C Proton-conducting membrane transporter Z1_02373 529507.PMI1750 4.1e-262 910.2 Proteus nuoN GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0006119,GO:0006120,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015672,GO:0015980,GO:0015988,GO:0015990,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016310,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0017144,GO:0019637,GO:0019693,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0034641,GO:0042773,GO:0042775,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045271,GO:0045272,GO:0045333,GO:0046034,GO:0046483,GO:0050136,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902494,GO:1902600,GO:1990204 1.6.5.3 ko:K00343 ko00190,ko01100,map00190,map01100 M00144 R11945 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.1 iEC042_1314.EC042_2517,iSbBS512_1146.SbBS512_E2652 Bacteria 1MV56@1224,1RPJB@1236,3Z13S@583,COG1007@1,COG1007@2 NA|NA|NA C NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cytoplasmic membrane), and thus conserves the redox energy in a proton gradient Z1_02374 529507.PMI1748 2.9e-174 617.8 Proteus Bacteria 1QGKA@1224,1TE0Q@1236,2ATDF@1,31IWP@2,3Z34B@583 NA|NA|NA Z1_02375 529507.PMI1747 5.3e-223 780.0 Proteus xaxA Bacteria 1R67T@1224,1RRVR@1236,28K4G@1,2Z9TD@2,3Z0WG@583 NA|NA|NA Z1_02376 529507.PMI1746 3.4e-255 887.1 Proteus menF GO:0000162,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004049,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005950,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008909,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0016853,GO:0016866,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0050486,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901661,GO:1901663,GO:1902494 5.4.4.2 ko:K02361,ko:K02552 ko00130,ko01053,ko01100,ko01110,ko01130,map00130,map01053,map01100,map01110,map01130 M00116 R01717 RC00588 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c26010,iECIAI39_1322.ECIAI39_2413,iSF_1195.SF2344,iS_1188.S2478,ic_1306.c2809 Bacteria 1MVB7@1224,1RNSR@1236,3Z1Y1@583,COG1169@1,COG1169@2 NA|NA|NA HQ Isochorismate synthase Z1_02377 34506.g1498 0.0 1156.4 Bilateria Metazoa 3AEP7@33154,3BXH1@33208,3DETT@33213,COG0147@1,KOG1223@2759 NA|NA|NA E Middle domain of thiamine pyrophosphate Z1_02378 529507.PMI1744 1.7e-150 538.5 Proteus menH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016829,GO:0016835,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0070205,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.2.99.20 ko:K08680 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R08166 RC02148,RC02475 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_4298,iEC55989_1330.EC55989_2511,iECO103_1326.ECO103_2730,iECOK1_1307.ECOK1_2500,iECS88_1305.ECS88_2414,iETEC_1333.ETEC_2398,iEcE24377_1341.EcE24377A_2559,iSBO_1134.SBO_2300,iUMN146_1321.UM146_05480,iUTI89_1310.UTI89_C2547 Bacteria 1R3WK@1224,1RQHH@1236,3Z1BX@583,COG0596@1,COG0596@2 NA|NA|NA H Catalyzes a proton abstraction reaction that results in 2,5-elimination of pyruvate from 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6- hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate (SEPHCHC) and the formation of 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate (SHCHC) Z1_02379 529507.PMI1743 9.3e-166 589.3 Proteus menB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008935,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0042180,GO:0042181,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071890,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.1.3.36 ko:K01661 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R07263 RC01923 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN678.menB,iYL1228.KPN_02660 Bacteria 1QTZ2@1224,1T1TZ@1236,3Z2AM@583,COG0447@1,COG0447@2 NA|NA|NA H Converts o-succinylbenzoyl-CoA (OSB-CoA) to 1,4- dihydroxy-2-naphthoyl-CoA (DHNA-CoA) Z1_02380 529507.PMI1742 4.6e-185 653.7 Proteus menC GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.2.1.113 ko:K02549 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R04031 RC01053 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_2406,iSbBS512_1146.SbBS512_E2640 Bacteria 1MV33@1224,1RRC0@1236,3Z29N@583,COG1441@1,COG1441@2 NA|NA|NA H 4-(2'-carboxyphenyl)-4-oxybutyric acid synthase Z1_02381 529507.PMI1741 1.5e-280 971.5 Proteus menE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006732,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008756,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016405,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016878,GO:0022607,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 4.2.1.113,6.2.1.26 ko:K01911,ko:K02549 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R04030,R04031 RC00004,RC00014,RC01053 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_2354,iECSF_1327.ECSF_2141,iEcE24377_1341.EcE24377A_2556,iEcHS_1320.EcHS_A2406,iJN678.menE,iLF82_1304.LF82_1314,iNRG857_1313.NRG857_11465 Bacteria 1MW0Y@1224,1RN35@1236,3Z2CQ@583,COG0318@1,COG0318@2 NA|NA|NA IQ AMP-binding enzyme C-terminal domain Z1_02382 34506.g1494 4.9e-292 1009.6 Rhabditida 1.11.1.6 ko:K03781 ko00380,ko00630,ko01110,ko01130,ko01200,ko04011,ko04016,ko04068,ko04146,ko04211,ko04212,ko04213,ko05014,map00380,map00630,map01110,map01130,map01200,map04011,map04016,map04068,map04146,map04211,map04212,map04213,map05014 M00532 R00009,R00602,R02670 RC00034,RC00767,RC02141,RC02755 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Nematoda 1M6ND@119089,38BMC@33154,3BFAV@33208,3CSMT@33213,40FGD@6231,4152V@6236,COG0753@1,KOG0047@2759 NA|NA|NA P Catalase Z1_02383 529507.PMI1739 1.4e-95 355.5 Proteus yfaZ GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RDW5@1224,1S3Q0@1236,29PXB@1,30AVP@2,3Z2FK@583 NA|NA|NA S YfaZ precursor Z1_02384 529507.PMI1738 3.3e-209 734.2 Proteus tyrP GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015711,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03834,ko:K03835,ko:K03837 ko00000,ko02000 2.A.42.1.1,2.A.42.1.2,2.A.42.2.1 iECUMN_1333.ECUMN_2202 Bacteria 1N35H@1224,1RNNC@1236,3Z1MG@583,COG0814@1,COG0814@2 NA|NA|NA E Transmembrane amino acid transporter protein Z1_02386 529507.PMI1737 8.7e-34 149.1 Proteus ygdi3 Bacteria 1MZYU@1224,1S9HJ@1236,2E9MC@1,32U4J@2,3Z31T@583 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF903) Z1_02387 529507.PMI1736 4.8e-47 193.4 Proteus yfaE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046858 1.17.1.1 ko:K00523,ko:K04755,ko:K08952,ko:K08953,ko:K08954,ko:K11107 ko00520,map00520 R03391,R03392 RC00230 ko00000,ko00001,ko00194,ko01000 Bacteria 1QU91@1224,1T1VI@1236,3Z31H@583,COG0633@1,COG0633@2 NA|NA|NA C 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain Z1_02388 529507.PMI1735 1.1e-214 752.3 Proteus nrdB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005971,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009987,GO:0015949,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990204 1.17.4.1 ko:K00526 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00053 R02017,R02018,R02019,R02024 RC00613 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iAPECO1_1312.APECO1_4325 Bacteria 1MWUS@1224,1RMJC@1236,3Z11J@583,COG0208@1,COG0208@2 NA|NA|NA C Ribonucleotide reductase, small chain Z1_02389 529507.PMI1734 0.0 1527.7 Proteus nrdA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004748,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005971,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016491,GO:0016725,GO:0016728,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0055086,GO:0055114,GO:0061731,GO:0071704,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990204 1.17.4.1 ko:K00525 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00053 R02017,R02018,R02019,R02024 RC00613 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iSDY_1059.SDY_2428 Bacteria 1MUJ8@1224,1RMPV@1236,3Z132@583,COG0209@1,COG0209@2 NA|NA|NA F Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides Z1_02390 529507.PMI1733 1.5e-140 505.4 Proteus ubiG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005543,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008289,GO:0008689,GO:0008757,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0032259,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042538,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043431,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0061542,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901611,GO:1901661,GO:1901663 2.1.1.222,2.1.1.64 ko:K00568 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R04988,R05614,R08769,R08781 RC00003,RC00392,RC01895 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_2376 Bacteria 1MU89@1224,1RMV7@1236,3Z1PP@583,COG2227@1,COG2227@2 NA|NA|NA H O-methyltransferase that catalyzes the 2 O-methylation steps in the ubiquinone biosynthetic pathway Z1_02391 529507.PMI1732 0.0 1683.7 Proteus gyrA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003918,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016853,GO:0016887,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034335,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051276,GO:0061505,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 5.99.1.3 ko:K02469,ko:K02621 ko00000,ko01000,ko02048,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MUGG@1224,1RN03@1236,3Z1PR@583,COG0188@1,COG0188@2 NA|NA|NA L A type II topoisomerase that negatively supercoils closed circular double-stranded (ds) DNA in an ATP-dependent manner to modulate DNA topology and maintain chromosomes in an underwound state. Negative supercoiling favors strand separation, and DNA replication, transcription, recombination and repair, all of which involve strand separation. Also able to catalyze the interconversion of other topological isomers of dsDNA rings, including catenanes and knotted rings. Type II topoisomerases break and join 2 DNA strands simultaneously in an ATP-dependent manner Z1_02392 529507.PMI1731 0.0 1767.7 Proteus rcsC GO:0000155,GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019538,GO:0023014,GO:0023052,GO:0033554,GO:0035556,GO:0036211,GO:0042710,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044010,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046777,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071214,GO:0071470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0104004,GO:0140096,GO:1901564 2.7.13.3 ko:K07677 ko02020,ko02026,map02020,map02026 M00474 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1NRP8@1224,1RQCU@1236,3Z27W@583,COG0642@1,COG0784@1,COG0784@2,COG2205@2 NA|NA|NA T Component of the Rcs signaling system, which controls transcription of numerous genes. RcsC functions as a membrane- associated protein kinase that phosphorylates RcsD in response to environmental signals. The phosphoryl group is then transferred to the response regulator RcsB Z1_02393 529507.PMI1730 1.1e-113 416.0 Proteus rcsB GO:0001121,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001140,GO:0001141,GO:0001216,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031344,GO:0031346,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0042710,GO:0043170,GO:0044010,GO:0044011,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044764,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046677,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051703,GO:0051704,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090605,GO:0090609,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02282,ko:K07687,ko:K07689,ko:K20264 ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02024,map02025,map02026,map05111 M00474,M00475,M00818 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko02035,ko02044 Bacteria 1MW84@1224,1RNK3@1236,3Z22J@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K Component of the Rcs signaling system, which controls transcription of numerous genes. RcsB is the response regulator that binds to regulatory DNA regions Z1_02394 529507.PMI1729 0.0 1757.7 Proteus rcsD GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009927,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019538,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0035556,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 2.7.13.3,4.6.1.1 ko:K01768,ko:K07676,ko:K07687,ko:K10715,ko:K20976 ko00230,ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko04113,ko04213,map00230,map02020,map02024,map02025,map02026,map04113,map04213 M00474,M00517,M00695,M00820 R00089,R00434 RC00295 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022 Bacteria 1MXQG@1224,1RQ18@1236,3Z22S@583,COG0642@1,COG2198@1,COG2198@2,COG2205@2 NA|NA|NA T Hpt domain Z1_02399 529507.PMI1728 1.1e-184 652.5 Gammaproteobacteria trpS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004830,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006436,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.2 ko:K01867 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03664 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 Bacteria 1MV4T@1224,1RNDC@1236,COG0180@1,COG0180@2 NA|NA|NA J Tryptophanyl-tRNA synthetase Z1_02400 529507.PMI1727 9.3e-138 496.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1N4SP@1224,1SYN0@1236,COG2932@1,COG2932@2 NA|NA|NA K Peptidase S24-like Z1_02401 529507.PMI1726 3.6e-151 540.8 Proteus Bacteria 1QHJU@1224,1RQCY@1236,3Z2ZW@583,COG0484@1,COG0484@2 NA|NA|NA O Antitermination protein Z1_02402 529507.PMI1725 1.5e-49 201.8 Proteus Bacteria 1NBKN@1224,1TGWF@1236,2DNF2@1,32X6F@2,3Z3GB@583 NA|NA|NA S Phage holin family (Lysis protein S) Z1_02403 529507.PMI1724 1e-69 269.2 Proteus Bacteria 1MZGP@1224,1SE04@1236,2DNV9@1,32ZB3@2,3Z3E5@583 NA|NA|NA Z1_02404 529507.PMI1723 3.7e-73 280.8 Proteus ko:K14744 ko00000,ko01000 Bacteria 1NEGN@1224,1T9VD@1236,2DI8V@1,302DI@2,3Z3FF@583 NA|NA|NA S Bacteriophage Rz lysis protein Z1_02405 529507.PMI1722 1.7e-90 338.6 Proteus Bacteria 1RB5D@1224,1S1YJ@1236,28R47@1,2ZDIJ@2,3Z2XE@583 NA|NA|NA Z1_02406 529507.PMI1721 6e-277 959.5 Proteus Bacteria 1NMKD@1224,1RRMK@1236,28JKG@1,2Z9DB@2,3Z14Y@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3383) Z1_02407 529507.PMI1720 2.8e-76 291.2 Proteus Bacteria 1RC53@1224,1S36I@1236,28NU3@1,2ZBSH@2,3Z2J2@583 NA|NA|NA Z1_02408 529507.PMI1719 9.6e-77 292.7 Proteus Bacteria 1REJE@1224,1S5I5@1236,29JHH@1,306EX@2,3Z2M6@583 NA|NA|NA Z1_02409 529507.PMI1718 0.0 1416.7 Proteus Bacteria 1R958@1224,1S014@1236,3Z1ZH@583,COG1511@1,COG1511@2 NA|NA|NA S domain protein Z1_02410 529507.PMI1717 2e-80 305.1 Proteus Bacteria 1RDNT@1224,1S5S3@1236,29EI3@1,301G1@2,3Z2RT@583 NA|NA|NA Z1_02411 529507.PMI1716 3.2e-55 220.7 Proteus Bacteria 1N2QN@1224,1SBBZ@1236,2DNJ5@1,32XS8@2,3Z30R@583 NA|NA|NA Z1_02412 529507.PMI1715 1.4e-147 528.9 Gammaproteobacteria Z012_02080 Bacteria 1QHHN@1224,1T040@1236,2DC0H@1,2ZC7P@2 NA|NA|NA Z1_02413 529507.PMI1714 3.5e-123 447.6 Proteus Bacteria 1R3UH@1224,1S0V2@1236,3Z25T@583,COG4540@1,COG4540@2 NA|NA|NA S Baseplate assembly protein Z1_02414 529507.PMI1713 2.8e-60 237.7 Proteus Bacteria 1N5C2@1224,1SAMW@1236,2CFTG@1,32T5H@2,3Z2Y3@583 NA|NA|NA S Psort location Cytoplasmic, score 8.96 Z1_02415 529507.PMI1712 1.7e-221 775.0 Proteus Bacteria 1R01H@1224,1T05C@1236,3Z1R2@583,COG3299@1,COG3299@2 NA|NA|NA S Baseplate J-like protein Z1_02416 529507.PMI1711 1e-124 452.6 Proteus Bacteria 1R95M@1224,1RYW3@1236,2DBG8@1,2Z92V@2,3Z1QJ@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2612) Z1_02417 529507.PMI1710 2.4e-115 422.5 Proteus Bacteria 1MY9C@1224,1S7II@1236,3Z1H3@583,COG4675@1,COG4675@2,COG5301@1,COG5301@2 NA|NA|NA S tail collar domain protein Z1_02419 521000.PROVRETT_07457 7.3e-22 109.8 Providencia Bacteria 1RM2P@1224,1S7Q5@1236,3Z9E1@586,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase, GNAT family Z1_02420 529507.PMI1708 2.5e-100 371.3 Proteus Bacteria 1RHYI@1224,1S40A@1236,3Z1CI@583,COG3803@1,COG3803@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF924) Z1_02421 529507.PMI1707 7.5e-138 496.5 Proteus dmsC ko:K07308 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1MZXS@1224,1S1T5@1236,3Z1MJ@583,COG3302@1,COG3302@2 NA|NA|NA S DMSO reductase anchor subunit (DmsC) Z1_02422 529507.PMI1706 3.2e-123 447.6 Proteus dmsB ko:K07307 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1MU5T@1224,1RPIC@1236,3Z2DF@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C Dimethylsulfoxide reductase, chain B Z1_02423 529507.PMI1705 0.0 1662.1 Proteus dmsA 1.8.5.3 ko:K07306 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1NR6J@1224,1RMVE@1236,3Z115@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Belongs to the prokaryotic molybdopterin-containing oxidoreductase family Z1_02424 529507.PMI1704 1.1e-220 772.3 Proteus ybdG GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008381,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015267,GO:0016020,GO:0022803,GO:0022836,GO:0022857,GO:0033554,GO:0042802,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0071214,GO:0071470,GO:0071944,GO:0104004 ko:K16053 ko00000,ko02000 1.A.23.4.5 Bacteria 1MVX9@1224,1RNBM@1236,3Z17Q@583,COG0668@1,COG0668@2 NA|NA|NA M Mechanosensitive ion channel Z1_02425 529507.PMI1702 2.5e-90 338.2 Proteus hdeD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009268,GO:0009628,GO:0016020,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K21908 ko00000 9.B.36.1.1 Bacteria 1RFV7@1224,1S4XK@1236,3Z2I4@583,COG3247@1,COG3247@2 NA|NA|NA S Short repeat of unknown function (DUF308) Z1_02426 529507.PMI1701 2.8e-154 551.2 Proteus dat GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016054,GO:0016740,GO:0016769,GO:0019478,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046395,GO:0046416,GO:0046437,GO:0047810,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901607 2.6.1.21 ko:K00824 ko00310,ko00330,ko00360,ko00472,ko00473,ko01100,map00310,map00330,map00360,map00472,map00473,map01100 R01148,R01582,R02459,R02851,R02924,R05053 RC00006,RC00008,RC00025 ko00000,ko00001,ko01000,ko01007 Bacteria 1MVAT@1224,1RPU0@1236,3Z23X@583,COG0115@1,COG0115@2 NA|NA|NA EH Amino-transferase class IV Z1_02427 529507.PMI1700 6.4e-99 366.7 Proteus sinR Bacteria 1MXWB@1224,1RMDC@1236,3Z3A3@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_02428 529507.PMI1699 3.5e-112 411.0 Proteus azlC Bacteria 1PD8G@1224,1RQBT@1236,3Z38I@583,COG1296@1,COG1296@2 NA|NA|NA E AzlC protein Z1_02429 529507.PMI1698 8e-49 199.5 Proteus Bacteria 1N290@1224,1S6JZ@1236,2DMQN@1,32T1U@2,3Z3HT@583 NA|NA|NA S Branched-chain amino acid transport protein (AzlD) Z1_02430 529507.PMI1697 2.1e-263 914.4 Proteus Bacteria 1N1Z2@1224,1RPG9@1236,3Z10E@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T Histidine kinase Z1_02431 529507.PMI1696 2.3e-119 434.9 Proteus Bacteria 1R7R1@1224,1S1P3@1236,3Z2SA@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K swarming motility regulation protein RssB Z1_02432 529507.PMI1695 2.1e-41 174.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1N7HM@1224,1SD12@1236,2BW28@1,33184@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2798) Z1_02433 529507.PMI1694 1.4e-211 741.9 Proteus namA 1.6.99.1 ko:K00354 R00282 RC00001 ko00000,ko01000 Bacteria 1MVE0@1224,1RMII@1236,3Z2A4@583,COG1902@1,COG1902@2 NA|NA|NA C NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family Z1_02434 529507.PMI1693 1.5e-123 448.7 Proteus cat 2.3.1.28 ko:K00638,ko:K18234 br01600,ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1MUCJ@1224,1RPPT@1236,3Z24M@583,COG0110@1,COG0110@2 NA|NA|NA S Hexapeptide repeat of succinyl-transferase Z1_02435 529507.PMI1692 1.7e-48 198.4 Proteus Bacteria 1QG6Q@1224,1TDJK@1236,2AT1Q@1,31IHP@2,3Z337@583 NA|NA|NA Z1_02436 529507.PMI1691 3.9e-72 277.3 Proteus 3.1.2.20 ko:K01073 ko00000,ko01000 Bacteria 1RHNU@1224,1S5XC@1236,3Z2IJ@583,COG1607@1,COG1607@2 NA|NA|NA I Thioesterase superfamily Z1_02437 529507.PMI1690 1.6e-57 228.4 Proteus Bacteria 1R9X4@1224,1RZ0R@1236,3Z2XP@583,COG0384@1,COG0384@2 NA|NA|NA S Phenazine biosynthesis-like protein Z1_02438 529507.PMI1690 4.1e-81 307.4 Proteus Bacteria 1R9X4@1224,1RZ0R@1236,3Z2XP@583,COG0384@1,COG0384@2 NA|NA|NA S Phenazine biosynthesis-like protein Z1_02439 529507.PMI1688 5.9e-288 996.1 Proteus dtpT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03305 ko00000 2.A.17 Bacteria 1MW6W@1224,1RM8P@1236,3Z2EQ@583,COG3104@1,COG3104@2 NA|NA|NA P POT family Z1_02440 529507.PMI1687 2.1e-219 768.1 Proteus mdtG GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015893,GO:0042221,GO:0042493,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085 ko:K05820,ko:K08161 ko00000,ko02000 2.A.1.2.20,2.A.1.27 Bacteria 1MUBP@1224,1RNXS@1236,3Z2FN@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP MFS_1 like family Z1_02441 529507.PMI1686 1.3e-184 652.1 Proteus lpxL GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016740,GO:0019637,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.241,2.3.1.242,2.3.1.243 ko:K02517,ko:K02560,ko:K12974 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R05075,R05146,R10906 RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iSF_1195.SF1061,iS_1188.S1138,iYL1228.KPN_01068 Bacteria 1MVNI@1224,1RMZ5@1236,3Z27B@583,COG1560@1,COG1560@2 NA|NA|NA M Catalyzes the transfer of laurate from lauroyl-acyl carrier protein (ACP) to Kdo(2)-lipid IV(A) to form Kdo(2)- (lauroyl)-lipid IV(A) Z1_02442 529507.PMI1685 1e-54 219.2 Proteus ttrR ko:K13041 ko02020,map02020 M00514 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1N6WR@1224,1S0TV@1236,3Z2FY@583,COG4566@1,COG4566@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_02443 529507.PMI1685 2.2e-41 174.5 Proteus ttrR ko:K13041 ko02020,map02020 M00514 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1N6WR@1224,1S0TV@1236,3Z2FY@583,COG4566@1,COG4566@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_02444 529507.PMI1684 0.0 1143.3 Proteus ttrS 2.7.13.3 ko:K02044,ko:K13040 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00223,M00514 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02000,ko02022 3.A.1.9 Bacteria 1RCM9@1224,1RNNF@1236,3Z0Y1@583,COG3221@1,COG3221@2,COG4191@1,COG4191@2 NA|NA|NA T ABC transporter, phosphonate, periplasmic substrate-binding protein Z1_02445 529507.PMI1683 6.6e-144 516.5 Proteus ttrB ko:K08358 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10150 RC03109 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.10 Bacteria 1MU1B@1224,1RPUU@1236,3Z2E6@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S dicluster domain Z1_02446 529507.PMI1682 1.5e-194 685.3 Proteus ttrC ko:K08359 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10150 RC03109 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.10 Bacteria 1QU9J@1224,1T1VQ@1236,3Z0XR@583,COG3301@1,COG3301@2 NA|NA|NA P Polysulphide reductase, NrfD Z1_02447 529507.PMI1681 0.0 2079.7 Proteus ttrA ko:K08357 ko00920,ko01120,ko02020,map00920,map01120,map02020 R10150 RC03109 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.10 Bacteria 1P01N@1224,1RQK9@1236,3Z1E1@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Belongs to the prokaryotic molybdopterin-containing oxidoreductase family Z1_02448 529507.PMI1680 1.7e-113 415.2 Proteus rcsA Bacteria 1RJKE@1224,1S60U@1236,3Z1TN@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, luxR family Z1_02449 529507.PMI1679 1.9e-42 177.9 Proteus bssS GO:0008150,GO:0043900,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065007,GO:1900190 ko:K12148 ko00000,ko02048 Bacteria 1MZNE@1224,1S8Z0@1236,2CFXH@1,32S2R@2,3Z32S@583 NA|NA|NA S BssS protein family Z1_02450 529507.PMI1678 5.3e-203 713.4 Proteus pyrC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004151,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016812,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019856,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.5.2.3 ko:K01465 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00051 R01993 RC00632 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSBO_1134.SBO_2002,iYL1228.KPN_01074 Bacteria 1MUYP@1224,1RNEN@1236,3Z108@583,COG0418@1,COG0418@2 NA|NA|NA F dihydroorotase Z1_02455 529507.PMI1677 1.2e-88 332.4 Proteus ylaC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RIZ1@1224,1S7K3@1236,2CEAX@1,328KF@2,3Z2BD@583 NA|NA|NA S Inner membrane protein YlaC Z1_02456 529507.PMI1676 3.3e-32 143.7 Proteus cspA GO:0006355,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1N6Q5@1224,1SCA7@1236,3Z3H8@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K 'Cold-shock' DNA-binding domain Z1_02457 529507.PMI1675 4.4e-31 139.8 Proteus dsrB Bacteria 1N7NE@1224,1SD23@1236,2E52Z@1,32ZW5@2,3Z340@583 NA|NA|NA S Dextransucrase DSRB Z1_02459 529507.PMI1674 1.8e-122 445.3 Proteus mgtC GO:0008150,GO:0009405,GO:0044419,GO:0051704 ko:K07507 ko00000,ko02000 9.B.20 iJN678.mgtC Bacteria 1MURJ@1224,1RQUD@1236,3Z21R@583,COG1285@1,COG1285@2 NA|NA|NA S MgtC family Z1_02460 529507.PMI1672 3.6e-55 220.7 Proteus flhD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K02403 ko02020,ko02024,ko02026,ko02040,map02020,map02024,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1N25K@1224,1S6JK@1236,2AX91@1,31P80@2,3Z2U2@583 NA|NA|NA K Functions in complex with FlhC as a master transcriptional regulator that regulates transcription of several flagellar and non-flagellar operons by binding to their promoter region. Activates expression of class 2 flagellar genes, including fliA, which is a flagellum-specific sigma factor that turns on the class 3 genes. Also regulates genes whose products function in a variety of physiological pathways Z1_02461 529507.PMI1671 1.4e-104 385.6 Proteus flhC GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051302,GO:0051782,GO:0065007,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K02402 ko02020,ko02024,ko02026,ko02040,map02020,map02024,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1N7I6@1224,1RNUP@1236,2DBG4@1,2Z927@2,3Z2FH@583 NA|NA|NA K Functions in complex with FlhD as a master transcriptional regulator that regulates transcription of several flagellar and non-flagellar operons by binding to their promoter region. Activates expression of class 2 flagellar genes, including fliA, which is a flagellum-specific sigma factor that turns on the class 3 genes. Also regulates genes whose products function in a variety of physiological pathways Z1_02462 529507.PMI1670 5.8e-155 553.5 Proteus motA GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009425,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071944,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588,GO:0120100,GO:0120101 ko:K02556 ko02020,ko02030,ko02040,map02020,map02030,map02040 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035 1.A.30.1 Bacteria 1MXK3@1224,1RNTF@1236,3Z17I@583,COG1291@1,COG1291@2 NA|NA|NA N MotA/TolQ/ExbB proton channel family Z1_02463 529507.PMI1669 4.8e-188 663.7 Proteus motB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0009288,GO:0009425,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0071944,GO:0120100,GO:0120101 ko:K02557 ko02030,ko02040,map02030,map02040 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035 1.A.30.1 Bacteria 1MW1Y@1224,1RPQ9@1236,3Z1XS@583,COG1360@1,COG1360@2 NA|NA|NA N Membrane MotB of proton-channel complex MotA/MotB Z1_02464 529507.PMI1668 0.0 1385.5 Proteus cheA GO:0000160,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004673,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006935,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009605,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010562,GO:0010604,GO:0010605,GO:0016020,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016775,GO:0018106,GO:0018193,GO:0018202,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019904,GO:0023014,GO:0023052,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031399,GO:0031400,GO:0031401,GO:0032101,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032270,GO:0032879,GO:0032991,GO:0035303,GO:0035304,GO:0035306,GO:0035307,GO:0035556,GO:0036211,GO:0040011,GO:0040012,GO:0042221,GO:0042330,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045937,GO:0046777,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0050920,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051248,GO:0051270,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098561,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901873,GO:1901875,GO:1902021,GO:2000145 2.7.13.3 ko:K02487,ko:K03407,ko:K06596 ko02020,ko02025,ko02030,map02020,map02025,map02030 M00506,M00507 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko02022,ko02035 Bacteria 1MUAG@1224,1RMS6@1236,3Z14V@583,COG0643@1,COG0643@2,COG2198@1,COG2198@2 NA|NA|NA H Two component signalling adaptor domain Z1_02465 529507.PMI1667 6.8e-84 316.6 Proteus cheW GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006935,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010604,GO:0016020,GO:0019222,GO:0019904,GO:0023052,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031399,GO:0031401,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032991,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098561,GO:1901873,GO:1901875 ko:K03408 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1RD1W@1224,1S26J@1236,3Z1D7@583,COG0835@1,COG0835@2 NA|NA|NA NT Two component signalling adaptor domain Z1_02466 529507.PMI1666 1.8e-261 908.3 Proteus tsr GO:0001101,GO:0001932,GO:0003674,GO:0004888,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006928,GO:0006935,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007172,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009593,GO:0009605,GO:0009719,GO:0009966,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010646,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019901,GO:0022607,GO:0023051,GO:0023052,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031399,GO:0032101,GO:0032110,GO:0032268,GO:0032879,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0034622,GO:0038023,GO:0040011,GO:0040012,GO:0042221,GO:0042325,GO:0042330,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043113,GO:0043200,GO:0043424,GO:0043549,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045859,GO:0046983,GO:0048583,GO:0048870,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050896,GO:0050920,GO:0051171,GO:0051174,GO:0051179,GO:0051246,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051270,GO:0051338,GO:0051606,GO:0051641,GO:0051668,GO:0051674,GO:0051716,GO:0060089,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070727,GO:0070887,GO:0071229,GO:0071230,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0080090,GO:0098561,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902021,GO:2000145 ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z217@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT Methyl-accepting chemotaxis-like domains (chemotaxis sensory transducer). Z1_02467 529507.PMI1665 9.6e-252 875.9 Proteus tap GO:0003674,GO:0004888,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006935,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009987,GO:0016020,GO:0023052,GO:0038023,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007,GO:0071944 ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z1FP@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT chemotaxis, protein Z1_02468 529507.PMI1664 5.3e-172 610.1 Proteus cheR GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006807,GO:0006935,GO:0008022,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008757,GO:0008983,GO:0009605,GO:0009987,GO:0010340,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016741,GO:0019538,GO:0032259,GO:0032991,GO:0036211,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051998,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098561,GO:0140096,GO:1901564 2.1.1.80 ko:K00575 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko01000,ko02035 Bacteria 1MU6W@1224,1RMFK@1236,3Z2JM@583,COG1352@1,COG1352@2 NA|NA|NA H chemotaxis protein methyltransferase Z1_02469 529507.PMI1663 6.7e-190 669.8 Proteus cheB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006482,GO:0006807,GO:0006935,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008214,GO:0008984,GO:0009605,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016787,GO:0016788,GO:0018277,GO:0019538,GO:0019899,GO:0036211,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051723,GO:0052689,GO:0070988,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564,GO:1990827 3.1.1.61,3.5.1.44 ko:K03412 ko02020,ko02030,map02020,map02030 M00506 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02022,ko02035 Bacteria 1MWCN@1224,1RN67@1236,3Z1JT@583,COG2201@1,COG2201@2 NA|NA|NA NT catalyzes the demethylation of specific methylglutamate residues introduced into the chemoreceptors (methyl-accepting chemotaxis proteins) by CheR Z1_02470 529507.PMI1662 3.9e-63 247.3 Proteus Bacteria 1RDNP@1224,1S47I@1236,3Z2MJ@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA T cheY-homologous receiver domain Z1_02471 529507.PMI1661 9.2e-113 412.9 Proteus cheZ GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004721,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006928,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019538,GO:0032991,GO:0036211,GO:0040011,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071704,GO:0071944,GO:0071973,GO:0071975,GO:0071977,GO:0097588,GO:0098561,GO:0140096,GO:1901564 ko:K03414 ko02030,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1NIV6@1224,1RNG2@1236,3Z20U@583,COG3143@1,COG3143@2 NA|NA|NA NT Plays an important role in bacterial chemotaxis signal transduction pathway by accelerating the dephosphorylation of phosphorylated CheY (CheY-P) Z1_02472 529507.PMI1660 1e-207 729.2 Proteus flhB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02401,ko:K02556,ko:K03229,ko:K04061,ko:K13820,ko:K22510 ko02020,ko02030,ko02040,ko03070,map02020,map02030,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko02035,ko02044 1.A.30.1,3.A.6.1,3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1MUWI@1224,1RMHA@1236,3Z246@583,COG1377@1,COG1377@2 NA|NA|NA N Required for formation of the rod structure in the basal body of the flagellar apparatus. Together with FliI and FliH, may constitute the export apparatus of flagellin Z1_02473 529507.PMI1659 0.0 1302.7 Proteus flhA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006996,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0044085,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0070925,GO:0071840,GO:0071944 ko:K02400 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1MUF3@1224,1RMSM@1236,3Z126@583,COG1298@1,COG1298@2 NA|NA|NA N flagellar biosynthesis protein FlhA Z1_02474 529507.PMI1658 3.3e-204 717.6 Proteus Bacteria 1QCZN@1224,1T8TY@1236,3Z3F7@583,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U haemagglutination activity domain Z1_02475 529507.PMI1657 1.3e-75 288.9 Proteus flgN ko:K02399 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MZUY@1224,1SAU2@1236,3Z2JN@583,COG3418@1,COG3418@2 NA|NA|NA NOU FlgN protein Z1_02476 529507.PMI1656 3.1e-44 184.1 Proteus flgM ko:K02398 ko02020,ko02025,ko02026,ko02040,map02020,map02025,map02026,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MZI7@1224,1S8UX@1236,3Z2YP@583,COG2747@1,COG2747@2 NA|NA|NA N Anti-sigma-28 factor, FlgM Z1_02477 529507.PMI1655 5.5e-118 430.3 Proteus flgA GO:0001539,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009987,GO:0040011,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588 ko:K02279,ko:K02386 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1NY6E@1224,1RMY1@1236,3Z22D@583,COG1261@1,COG1261@2 NA|NA|NA N Involved in the assembly process of the P-ring formation. It may associate with FlgF on the rod constituting a structure essential for the P-ring assembly or may act as a modulator protein for the P-ring assembly Z1_02478 529507.PMI1654 1.6e-70 271.9 Proteus flgB GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009424,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02387 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MZ8P@1224,1S9DS@1236,3Z2JK@583,COG1815@1,COG1815@2 NA|NA|NA N Structural component of flagellum, the bacterial motility apparatus. Part of the rod structure of flagellar basal body Z1_02479 529507.PMI1653 9.4e-68 262.7 Proteus flgC ko:K02388 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1RHI3@1224,1S653@1236,3Z2MH@583,COG1558@1,COG1558@2 NA|NA|NA N Flagellar basal body rod FlgEFG protein C-terminal Z1_02480 529507.PMI1652 4.1e-131 474.2 Proteus flgD GO:0001539,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009424,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02389,ko:K02390 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MXCG@1224,1RPZI@1236,3Z3BD@583,COG1843@1,COG1843@2 NA|NA|NA N Required for flagellar hook formation. May act as a scaffolding protein Z1_02481 34506.g841 9.7e-225 785.8 Bilateria Metazoa 2D19X@1,2SHAI@2759,3AHZ5@33154,3BZGH@33208,3DE0Y@33213 NA|NA|NA S Flagellar basal body protein FlaE Z1_02482 529507.PMI1650 4.7e-137 493.8 Proteus flgF GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009424,GO:0009425,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02391 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1NZWQ@1224,1RNVX@1236,3Z2DV@583,COG4787@1,COG4787@2 NA|NA|NA N flagellar basal body Z1_02483 529507.PMI1649 1.2e-140 505.8 Proteus flgG GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009288,GO:0009424,GO:0009425,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044462,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071944,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02392 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MVMA@1224,1RMJ2@1236,3Z1E7@583,COG4786@1,COG4786@2 NA|NA|NA N Belongs to the flagella basal body rod proteins family Z1_02484 529507.PMI1648 2.2e-134 485.0 Proteus flgH ko:K02393 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1RDEY@1224,1S3XK@1236,3Z2A5@583,COG2063@1,COG2063@2 NA|NA|NA N Assembles around the rod to form the L-ring and probably protects the motor basal body from shearing forces during rotation Z1_02485 34506.g844 1.2e-192 679.1 Bilateria Metazoa 2EF73@1,2SKF9@2759,3AHY6@33154,3BYNC@33208,3DDMQ@33213 NA|NA|NA T Flagellar P-ring protein Z1_02486 529507.PMI1646 7.7e-180 636.3 Proteus flgJ GO:0001539,GO:0003674,GO:0005198,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009987,GO:0040011,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588 3.5.1.28 ko:K01448,ko:K02395 ko01503,map01503 M00727 R04112 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01011,ko02035,ko03036 Bacteria 1MX2W@1224,1RPGY@1236,3Z1N4@583,COG1705@1,COG1705@2,COG3951@1,COG3951@2 NA|NA|NA MNOU Flagellar rod assembly protein muramidase FlgJ Z1_02487 529507.PMI1645 6.3e-304 1049.3 Proteus flgK GO:0006996,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0044085,GO:0044780,GO:0044781,GO:0070925,GO:0071840 ko:K02396 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MV2M@1224,1RMEA@1236,3Z1GF@583,COG1256@1,COG1256@2 NA|NA|NA N flagellar hook-associated protein Z1_02488 529507.PMI1644 4.5e-169 600.5 Proteus flgL ko:K02397 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1PJUJ@1224,1RPNR@1236,3Z1U6@583,COG1344@1,COG1344@2 NA|NA|NA N Bacterial flagellin N-terminal helical region Z1_02490 529507.PMI1642 1.5e-133 482.3 Proteus fliR ko:K02421 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2 Bacteria 1NIF4@1224,1RMYW@1236,3Z1BR@583,COG1684@1,COG1684@2 NA|NA|NA N Role in flagellar biosynthesis Z1_02491 529507.PMI1641 3.3e-37 160.6 Proteus fliQ ko:K02420 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2 Bacteria 1N73W@1224,1SCBG@1236,3Z2V4@583,COG1987@1,COG1987@2 NA|NA|NA N Role in flagellar biosynthesis Z1_02492 529507.PMI1640 3.4e-135 487.6 Proteus fliP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02419,ko:K03226 ko02040,ko03070,map02040,map03070 M00332,M00542,M00660 ko00000,ko00001,ko00002,ko02035,ko02044 3.A.6.1,3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1MVBU@1224,1RMYH@1236,3Z1UD@583,COG1338@1,COG1338@2 NA|NA|NA N Plays a role in the flagellum-specific transport system Z1_02493 529507.PMI1639 3.1e-72 277.7 Proteus fliO ko:K02418 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2 Bacteria 1QFXY@1224,1TD9A@1236,3Z2IW@583,COG3190@1,COG3190@2 NA|NA|NA N Flagellar biosynthesis protein, FliO Z1_02494 529507.PMI1638 5.2e-66 256.9 Proteus fliN ko:K02417 ko02030,ko02040,map02030,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1RGWT@1224,1S5YE@1236,3Z2N1@583,COG1886@1,COG1886@2 NA|NA|NA N FliN is one of three proteins (FliG, FliN, FliM) that form the rotor-mounted switch complex (C ring), located at the base of the basal body. This complex interacts with the CheY and CheZ chemotaxis proteins, in addition to contacting components of the motor that determine the direction of flagellar rotation Z1_02495 529507.PMI1637 1.8e-192 678.3 Proteus fliM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006935,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009425,GO:0009605,GO:0016020,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0050896,GO:0050918,GO:0071944 ko:K02416 ko02030,ko02040,map02030,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MX01@1224,1RQ8M@1236,3Z1I1@583,COG1868@1,COG1868@2 NA|NA|NA N FliM is one of three proteins (FliG, FliN, FliM) that forms the rotor-mounted switch complex (C ring), located at the base of the basal body. This complex interacts with the CheY and CheZ chemotaxis proteins, in addition to contacting components of the motor that determine the direction of flagellar rotation Z1_02496 529507.PMI1636 3e-76 291.2 Proteus fliL GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009425,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02415 ko00000,ko02035 Bacteria 1RARK@1224,1S2F1@1236,3Z2AV@583,COG1580@1,COG1580@2 NA|NA|NA N Controls the rotational direction of flagella during chemotaxis Z1_02497 529507.PMI1635 6.5e-249 866.3 Proteus fliK GO:0001539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009424,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588 ko:K02414 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1N7XT@1224,1SCA6@1236,3Z2DQ@583,COG3144@1,COG3144@2 NA|NA|NA N Flagellar hook-length control protein FliK Z1_02498 529507.PMI1634 1.6e-71 275.4 Proteus fliJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02413 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1RHFM@1224,1S76M@1236,3Z2EB@583,COG2882@1,COG2882@2 NA|NA|NA N Flagellar protein that affects chemotactic events Z1_02499 529507.PMI1633 6.6e-254 882.9 Proteus fliI GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0042802 3.6.3.14 ko:K02412 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko01000,ko02035,ko02044 3.A.6.2,3.A.6.3 Bacteria 1MUH6@1224,1RM9W@1236,3Z1FZ@583,COG1157@1,COG1157@2 NA|NA|NA NU ATP synthase alpha/beta family, nucleotide-binding domain Z1_02500 529507.PMI1632 4e-117 427.6 Proteus fliH GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K02411 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 3.A.6.2 Bacteria 1NMQE@1224,1RR8H@1236,3Z130@583,COG1317@1,COG1317@2 NA|NA|NA N Flagellar assembly protein FliH Z1_02501 529507.PMI1631 1.6e-177 628.6 Proteus fliG GO:0001539,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006928,GO:0006996,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009425,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0040011,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044461,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0046982,GO:0046983,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0070925,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02410 ko02030,ko02040,map02030,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MV9X@1224,1RM9B@1236,3Z1VM@583,COG1536@1,COG1536@2 NA|NA|NA N FliG is one of three proteins (FliG, FliN, FliM) that forms the rotor-mounted switch complex (C ring), located at the base of the basal body. This complex interacts with the CheY and CheZ chemotaxis proteins, in addition to contacting components of the motor that determine the direction of flagellar rotation Z1_02502 34506.g852 2.4e-311 1074.3 Bilateria Metazoa 2SIX2@2759,3AFCC@33154,3BYH3@33208,3DETF@33213,COG1766@1 NA|NA|NA NU Flagellar M-ring protein C-terminal Z1_02503 529507.PMI1629 2.7e-46 191.0 Proteus fliE ko:K02408 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1N6RZ@1224,1SD52@1236,3Z2ZB@583,COG1677@1,COG1677@2 NA|NA|NA N Flagellar hook-basal body complex protein FliE Z1_02504 529507.PMI1924 2.5e-50 205.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1NX5M@1224,1SQM7@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU fimbrial subunit Z1_02505 529507.PMI1626 6e-35 152.9 Proteus Bacteria 1N9B0@1224,1SCHJ@1236,2E32V@1,32Y33@2,3Z3I1@583 NA|NA|NA Z1_02506 529507.PMI1625 7.5e-42 176.0 Proteus Bacteria 1P4D1@1224,1SVUQ@1236,2CJ7J@1,2ZTUK@2,3Z2ZS@583 NA|NA|NA Z1_02507 529507.PMI1624 1.1e-225 788.9 Proteus Bacteria 1PSXZ@1224,1S14V@1236,28MJX@1,2ZAWA@2,3Z2BK@583 NA|NA|NA Z1_02508 529507.PMI1623 1.4e-54 218.8 Proteus fliT GO:0001539,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009987,GO:0040011,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588 ko:K02423 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1NC88@1224,1SCME@1236,2DNZ7@1,32ZV7@2,3Z2PZ@583 NA|NA|NA N Flagellar protein FliT Z1_02509 529507.PMI1622 4.3e-65 253.8 Proteus fliS GO:0001539,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009987,GO:0040011,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0097588 ko:K02422 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MZ3G@1224,1S8TQ@1236,3Z2RK@583,COG1516@1,COG1516@2 NA|NA|NA N Flagellar protein FliS Z1_02510 529507.PMI1621 1.2e-253 882.1 Proteus fliD GO:0001539,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005623,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009288,GO:0009987,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K02407 ko02040,map02040 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MUVP@1224,1RS2S@1236,3Z0W6@583,COG1345@1,COG1345@2 NA|NA|NA N Required for morphogenesis and for the elongation of the flagellar filament by facilitating polymerization of the flagellin monomers at the tip of growing filament. Forms a capping structure, which prevents flagellin subunits (transported through the central channel of the flagellum) from leaking out without polymerization at the distal end Z1_02511 529507.PMI1620 1.9e-158 565.5 Proteus fliC GO:0005575,GO:0005576,GO:0005623,GO:0009288,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044464 ko:K02406 ko02020,ko02040,ko04621,ko04626,ko05132,ko05134,map02020,map02040,map04621,map04626,map05132,map05134 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MV1N@1224,1RN0Y@1236,3Z1TP@583,COG1344@1,COG1344@2 NA|NA|NA N Flagellin is the subunit protein which polymerizes to form the filaments of bacterial flagella Z1_02512 529507.PMI1619 1.7e-135 489.2 Proteus fliC GO:0005575,GO:0005576,GO:0005623,GO:0009288,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0044464 ko:K02406 ko02020,ko02040,ko04621,ko04626,ko05132,ko05134,map02020,map02040,map04621,map04626,map05132,map05134 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MV1N@1224,1RN0Y@1236,3Z1TP@583,COG1344@1,COG1344@2 NA|NA|NA N Flagellin is the subunit protein which polymerizes to form the filaments of bacterial flagella Z1_02513 529507.PMI1618 7.7e-129 466.5 Proteus fliA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K02405 ko02020,ko02025,ko02026,ko02040,ko05111,map02020,map02025,map02026,map02040,map05111 ko00000,ko00001,ko02035,ko03021 Bacteria 1MWEU@1224,1RMKJ@1236,3Z1AS@583,COG1191@1,COG1191@2 NA|NA|NA K Sigma factors are initiation factors that promote the attachment of RNA polymerase to specific initiation sites and are then released. This sigma factor controls the expression of flagella-related genes Z1_02514 529507.PMI1617 5.7e-97 360.1 Proteus fliZ GO:0000988,GO:0000989,GO:0001047,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010556,GO:0016989,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032879,GO:0040012,GO:0044212,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051270,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902021,GO:1903506,GO:2000145,GO:2001141 ko:K02425 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko02035 iB21_1397.fliZ,iECD_1391.fliZ Bacteria 1P3KM@1224,1RRB7@1236,2DBMG@1,2Z9YQ@2,3Z27X@583 NA|NA|NA N Phage integrase, N-terminal SAM-like domain Z1_02515 529507.PMI1616 0.0 2589.3 Proteus putA GO:0000166,GO:0000976,GO:0000984,GO:0000986,GO:0000987,GO:0001017,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001141,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003824,GO:0003842,GO:0004657,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006560,GO:0006562,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009064,GO:0009065,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009898,GO:0009987,GO:0010133,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016020,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043565,GO:0043648,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046395,GO:0046483,GO:0046700,GO:0048037,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0055114,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0098552,GO:0098562,GO:0140110,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 1.2.1.88,1.3.8.7,1.5.5.2 ko:K00249,ko:K00294,ko:K13821 ko00071,ko00250,ko00280,ko00330,ko00410,ko00640,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01212,ko03320,map00071,map00250,map00280,map00330,map00410,map00640,map01100,map01110,map01130,map01200,map01212,map03320 M00013,M00036,M00087 R00245,R00707,R00708,R00924,R01175,R01253,R01279,R02661,R03172,R03777,R03857,R03990,R04095,R04432,R04444,R04445,R04751,R04754,R05051 RC00052,RC00068,RC00076,RC00080,RC00083,RC00095,RC00148,RC00216,RC00242,RC00246,RC00255 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03000 iPC815.YPO1851,iSbBS512_1146.SbBS512_E2304 Bacteria 1MV93@1224,1RN48@1236,3Z1V3@583,COG0506@1,COG0506@2,COG3905@1,COG3905@2,COG4230@1,COG4230@2 NA|NA|NA C Oxidizes proline to glutamate for use as a carbon and nitrogen source Z1_02516 529507.PMI1615 6.6e-276 956.1 Proteus putP ko:K11928 ko00000,ko02000 2.A.21.2 Bacteria 1MUBI@1224,1RMXU@1236,3Z28I@583,COG0591@1,COG0591@2 NA|NA|NA E Belongs to the sodium solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family Z1_02517 1166016.W5S_1835 3.5e-15 89.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1P4B6@1224,1STHE@1236,2CIJX@1,2ZG5B@2 NA|NA|NA Z1_02518 406818.XBJ1_0982 3.2e-133 481.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1N45B@1224,1RNDM@1236,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_02519 521000.PROVRETT_05757 2e-103 382.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1MXWN@1224,1SK1I@1236,COG1672@1,COG1672@2 NA|NA|NA S PFAM Archaeal ATPase Z1_02522 529507.PMI1614 2.2e-257 894.4 Proteus cycA GO:0001761,GO:0001762,GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005326,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006836,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015180,GO:0015187,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015808,GO:0015816,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0022858,GO:0022889,GO:0032328,GO:0032329,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042891,GO:0042895,GO:0042940,GO:0042941,GO:0042942,GO:0042943,GO:0042944,GO:0042945,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03293,ko:K11737 ko00000,ko02000 2.A.3.1,2.A.3.1.7 iECO111_1330.ECO111_5093,iECO26_1355.ECO26_5376,iEcHS_1320.EcHS_A4458,iSbBS512_1146.SbBS512_E4749,iYL1228.KPN_04601 Bacteria 1MUPS@1224,1RPFT@1236,3Z22C@583,COG1113@1,COG1113@2 NA|NA|NA E Amino acid permease Z1_02523 529507.PMI1613 2.1e-73 281.6 Proteus uspF ko:K11932,ko:K14061 ko00000 Bacteria 1RI97@1224,1S5Z1@1236,3Z2Y5@583,COG0589@1,COG0589@2 NA|NA|NA T Universal stress protein Z1_02524 529507.PMI1612 7.3e-152 543.1 Proteus 2.5.1.105 ko:K06897 ko00790,map00790 R10339 RC00121 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1NK2I@1224,1RSGM@1236,3Z11D@583,COG1237@1,COG1237@2 NA|NA|NA S Metallo-beta-lactamase superfamily Z1_02525 529507.PMI1611 3.5e-76 290.8 Proteus uspF ko:K11932,ko:K14061 ko00000 Bacteria 1QFXV@1224,1TD97@1236,3Z2IT@583,COG0589@1,COG0589@2 NA|NA|NA T Universal stress protein family Z1_02526 529507.PMI1610 9.3e-63 246.1 Proteus psiE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K13256 ko00000 Bacteria 1RD8R@1224,1S4FE@1236,3Z2PM@583,COG3223@1,COG3223@2 NA|NA|NA S Phosphate-starvation-inducible E Z1_02527 529507.PMI1609 5e-153 547.0 Proteus rrmA GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008270,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008989,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0052912,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.187 ko:K00563 R07233 RC00003 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MXDY@1224,1RMU7@1236,3Z0UU@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA H Methyltransferase domain Z1_02528 529507.PMI1608 2.2e-102 378.3 Proteus mntP GO:0000041,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005384,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006828,GO:0008150,GO:0008324,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010042,GO:0015075,GO:0015318,GO:0016020,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0034220,GO:0042221,GO:0044464,GO:0046873,GO:0046915,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071421,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 Bacteria 1NWBY@1224,1RR6R@1236,3Z1W9@583,COG1971@1,COG1971@2 NA|NA|NA P Probably functions as a manganese efflux pump Z1_02529 529507.PMI1607 3.7e-257 893.6 Proteus sdaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003941,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006563,GO:0006565,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016840,GO:0016841,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 4.3.1.17 ko:K01752 ko00260,ko00270,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00270,map01100,map01110,map01130,map01200,map01230 R00220,R00590 RC00331,RC02600 ko00000,ko00001,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_2106 Bacteria 1MUZN@1224,1RMJZ@1236,3Z1JI@583,COG1760@1,COG1760@2 NA|NA|NA E Serine dehydratase beta chain Z1_02530 529507.PMI1606 9e-101 372.9 Proteus nudL GO:0003674,GO:0003824,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818 Bacteria 1RD2C@1224,1SA4Q@1236,3Z24P@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L NUDIX domain Z1_02531 529507.PMI1605 8.9e-270 935.6 Proteus pabB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0046820,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.6.1.85 ko:K01665,ko:K13950 ko00790,map00790 R01716 RC00010,RC01418 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_1977 Bacteria 1MVBJ@1224,1RMSE@1236,3Z1EJ@583,COG0147@1,COG0147@2 NA|NA|NA EH synthase component I Z1_02532 529507.PMI1604 2.9e-24 117.1 Proteus yoaH ko:K09917 ko00000 Bacteria 1N89H@1224,1SCHP@1236,3Z336@583,COG3140@1,COG3140@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0181) Z1_02533 529507.PMI1603 2.1e-67 261.5 Proteus yebF Bacteria 1RIMG@1224,1S6EJ@1236,2DM3Z@1,31MN2@2,3Z2PP@583 NA|NA|NA S YebF-like protein Z1_02534 529507.PMI1602 7.1e-33 146.0 Proteus holE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0009360,GO:0032991,GO:0042575,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044776,GO:0061695,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02345 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MZTI@1224,1S8YF@1236,2CFYS@1,32S2T@2,3Z307@583 NA|NA|NA L DNA polymerase III, theta subunit Z1_02535 529507.PMI1601 8.5e-268 929.1 Proteus yaaJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03310 ko00000 2.A.25 iEcE24377_1341.EcE24377A_0007 Bacteria 1MUI3@1224,1RMNF@1236,3Z2D4@583,COG1115@1,COG1115@2 NA|NA|NA E Sodium:alanine symporter family Z1_02536 529507.PMI1600 7.8e-168 596.3 Proteus amiD 3.5.1.28 ko:K03806,ko:K11066 ko00000,ko01000,ko01011 Bacteria 1RDHU@1224,1RMDN@1236,3Z1EF@583,COG3023@1,COG3023@2 NA|NA|NA V Ami_2 Z1_02537 529507.PMI1599 5e-246 856.7 Proteus brnQ GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005304,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015188,GO:0015190,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015658,GO:0015711,GO:0015803,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015818,GO:0015820,GO:0015829,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903785,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03311 ko00000 2.A.26 Bacteria 1MVIF@1224,1RR3P@1236,3Z198@583,COG1114@1,COG1114@2 NA|NA|NA U Component of the transport system for branched-chain amino acids Z1_02538 529507.PMI1598 2.3e-150 538.1 Proteus yidA GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050308 Bacteria 1MXIH@1224,1RQH8@1236,3Z1WE@583,COG0561@1,COG0561@2 NA|NA|NA S Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase Z1_02539 529507.PMI1597 1.8e-68 265.0 Proteus marA ko:K13632 ko01503,map01503 M00647,M00746 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko03000 Bacteria 1RDFH@1224,1S45A@1236,3Z2HV@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix proteins, AraC family Z1_02540 529507.PMI1596 7e-256 889.4 Proteus pheP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03293,ko:K11732,ko:K11734 ko00000,ko02000 2.A.3.1,2.A.3.1.1,2.A.3.1.3 iAPECO1_1312.APECO1_1472,iECW_1372.ECW_m0628,iEcolC_1368.EcolC_3070,iUTI89_1310.UTI89_C0576,iWFL_1372.ECW_m0628 Bacteria 1MUPS@1224,1RNK0@1236,3Z0VI@583,COG1113@1,COG1113@2 NA|NA|NA E Amino acid permease Z1_02541 529507.PMI1595 2.1e-114 418.3 Proteus pagP GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005975,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008374,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009279,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016409,GO:0016416,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044462,GO:0044464,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.251 ko:K12973 ko01503,ko05133,map01503,map05133 M00724 R11223 RC00037,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iEC042_1314.EC042_0658,iECO111_1330.ECO111_0653,iECSE_1348.ECSE_0690,iEcolC_1368.EcolC_3022 Bacteria 1Q75P@1224,1RPCR@1236,2C256@1,2Z7SY@2,3Z1HZ@583 NA|NA|NA M Transfers a palmitate residue from the sn-1 position of a phospholipid to the N-linked hydroxymyristate on the proximal unit of lipid A or its precursors Z1_02542 471881.PROPEN_00346 1.1e-94 352.8 Proteus Bacteria 1QCU8@1224,1T8ME@1236,2CJ77@1,31WMU@2,3Z34M@583 NA|NA|NA Z1_02543 529507.PMI1593 3.1e-147 527.7 Proteus thiD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006772,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008902,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009228,GO:0009229,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0042357,GO:0042364,GO:0042723,GO:0042724,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.1.49,2.7.4.7 ko:K00941 ko00730,ko01100,map00730,map01100 M00127 R03471,R04509 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iG2583_1286.G2583_2635 Bacteria 1MU9J@1224,1RNFP@1236,3Z20S@583,COG0351@1,COG0351@2 NA|NA|NA H Phosphomethylpyrimidine kinase Z1_02544 529507.PMI1592 2.8e-196 691.0 Proteus fbaB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004332,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016832,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 4.1.2.13 ko:K11645 ko00010,ko00030,ko00051,ko00680,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00030,map00051,map00680,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00001,M00003 R01068,R01070,R01829,R02568 RC00438,RC00439,RC00603,RC00604 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iETEC_1333.ETEC_2236,iSBO_1134.SBO_0918,iUMNK88_1353.UMNK88_2640 Bacteria 1MW9N@1224,1RQHJ@1236,3Z1QS@583,COG1830@1,COG1830@2 NA|NA|NA G DeoC/LacD family aldolase Z1_02545 529507.PMI1591 4e-167 594.0 Proteus yegS GO:0001727,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004143,GO:0006629,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0030258,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0046834,GO:0071704 2.7.1.107 ko:K07029 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 R02240 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MY37@1224,1RMX9@1236,3Z2CG@583,COG1597@1,COG1597@2 NA|NA|NA F Lipid kinase Z1_02546 529507.PMI1590 1.6e-268 931.4 Proteus yegQ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K08303 ko05120,map05120 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUQG@1224,1RNPY@1236,3Z10T@583,COG0826@1,COG0826@2 NA|NA|NA O Peptidase family U32 Z1_02547 529507.PMI1589 9.8e-129 466.1 Proteus Bacteria 1MVCB@1224,1RMD0@1236,3Z18F@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_02548 529507.PMI1588 1.2e-255 888.6 Proteus Bacteria 1N17V@1224,1RNI8@1236,3Z2EA@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T His Kinase A (phosphoacceptor) domain Z1_02549 529507.PMI1587 0.0 1912.5 Proteus mdtC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006855,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015299,GO:0015307,GO:0015318,GO:0015672,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046618,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1902600 ko:K03296,ko:K07788,ko:K07789 ko02020,map02020 M00648 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.6.2 Bacteria 1MU48@1224,1RMBN@1236,3Z1CC@583,COG0841@1,COG0841@2 NA|NA|NA V AcrB/AcrD/AcrF family Z1_02550 529507.PMI1586 0.0 1928.7 Proteus mdtB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03296,ko:K07788,ko:K07789 ko02020,map02020 M00648 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.6.2 Bacteria 1MU48@1224,1RMBN@1236,3Z0Y9@583,COG0841@1,COG0841@2 NA|NA|NA P Belongs to the resistance-nodulation-cell division (RND) (TC 2.A.6) family Z1_02551 529507.PMI1585 2.6e-201 708.0 Proteus mdtA GO:0008150,GO:0008219,GO:0009987,GO:0012501 ko:K07799 ko02020,map02020 M00648 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 8.A.1 Bacteria 1MW65@1224,1RQ67@1236,3Z1XB@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion Z1_02552 529507.PMI1584 6.6e-243 846.3 Proteus dtpA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006855,GO:0006857,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015318,GO:0015333,GO:0015672,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0035442,GO:0035443,GO:0035672,GO:0035673,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042887,GO:0042891,GO:0042895,GO:0042937,GO:0042938,GO:0042939,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071916,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1902600,GO:1904680 ko:K03305 ko00000 2.A.17 iB21_1397.B21_01594,iBWG_1329.BWG_1449,iEC042_1314.EC042_1803,iECBD_1354.ECBD_2009,iECB_1328.ECB_01604,iECDH10B_1368.ECDH10B_1768,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1578,iECD_1391.ECD_01604,iECUMN_1333.ECUMN_1925,iETEC_1333.ETEC_1669,iEcDH1_1363.EcDH1_2006,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1565,iEcolC_1368.EcolC_1995,iJO1366.b1634,iUMNK88_1353.UMNK88_2094,iY75_1357.Y75_RS08570 Bacteria 1MW6W@1224,1RM8P@1236,3Z2CD@583,COG3104@1,COG3104@2 NA|NA|NA U POT family Z1_02553 529507.PMI1583 1.5e-104 385.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1QXQV@1224,1SNU5@1236,2ASQB@1,31I58@2 NA|NA|NA Z1_02554 529507.PMI1581 1.9e-253 881.3 Proteus proP ko:K03762 ko00000,ko02000 2.A.1.6.4 Bacteria 1MU46@1224,1RMJI@1236,3Z1HA@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator superfamily Z1_02555 585.DR95_459 2.3e-07 61.2 Proteus Bacteria 1QGM7@1224,1TE21@1236,2ATE7@1,31IXK@2,3Z3IT@583 NA|NA|NA Z1_02556 529507.PMI1580 6.5e-268 929.5 Proteus mgtE ko:K06213 ko00000,ko02000 1.A.26.1 Bacteria 1MW24@1224,1RNE4@1236,3Z167@583,COG2239@1,COG2239@2 NA|NA|NA P Acts as a magnesium transporter Z1_02557 529507.PMI1579 7.5e-291 1005.7 Proteus ppx GO:0003674,GO:0003824,GO:0004309,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006082,GO:0006793,GO:0006797,GO:0006798,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0071704,GO:1901575 3.6.1.11,3.6.1.40 ko:K01524 ko00230,map00230 R03409 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_2643 Bacteria 1MV35@1224,1RN3V@1236,3Z2HM@583,COG0248@1,COG0248@2 NA|NA|NA FP Ppx/GppA phosphatase family Z1_02558 34506.g669 0.0 1374.0 Bilateria Metazoa 2QUEZ@2759,3A4PM@33154,3BWR3@33208,3DDC9@33213,COG0855@1 NA|NA|NA P Polyphosphate kinase middle domain Z1_02559 529507.PMI1577 6.1e-108 396.7 Proteus speG GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004145,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006576,GO:0006595,GO:0006598,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009308,GO:0009310,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0022607,GO:0034641,GO:0042402,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044106,GO:0044237,GO:0046872,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 2.3.1.57 ko:K00657 ko00330,ko01100,ko04216,map00330,map01100,map04216 M00135 R01154 RC00004,RC00096 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b1584,iB21_1397.B21_01543,iBWG_1329.BWG_1398,iECBD_1354.ECBD_2062,iECB_1328.ECB_01553,iECDH10B_1368.ECDH10B_1717,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1527,iECD_1391.ECD_01553,iECH74115_1262.ECH74115_2293,iECIAI1_1343.ECIAI1_1634,iECO103_1326.ECO103_1723,iECO111_1330.ECO111_2051,iECSE_1348.ECSE_1705,iECSP_1301.ECSP_2148,iECW_1372.ECW_m1749,iECs_1301.ECs2290,iEKO11_1354.EKO11_2194,iETEC_1333.ETEC_1618,iEcDH1_1363.EcDH1_2059,iEcE24377_1341.EcE24377A_1791,iEcHS_1320.EcHS_A1657,iEcolC_1368.EcolC_2046,iG2583_1286.G2583_1978,iJO1366.b1584,iJR904.b1584,iWFL_1372.ECW_m1749,iY75_1357.Y75_RS08305,iZ_1308.Z2571 Bacteria 1PDMH@1224,1RPZ4@1236,3Z1WW@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02560 529507.PMI1576 2.5e-115 421.4 Proteus purN GO:0003674,GO:0003824,GO:0004644,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0033554,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716 2.1.2.2 ko:K11175 ko00230,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00670,map01100,map01110,map01130 M00048 R04325,R04326 RC00026,RC00197,RC01128 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b2500,iBWG_1329.BWG_2264,iECDH10B_1368.ECDH10B_2666,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2426,iEcDH1_1363.EcDH1_1169,iJO1366.b2500,iJR904.b2500,iY75_1357.Y75_RS13050 Bacteria 1MWN1@1224,1RMHS@1236,3Z1RJ@583,COG0299@1,COG0299@2 NA|NA|NA F Catalyzes the transfer of a formyl group from 10- formyltetrahydrofolate to 5-phospho-ribosyl-glycinamide (GAR), producing 5-phospho-ribosyl-N-formylglycinamide (FGAR) and tetrahydrofolate Z1_02561 529507.PMI1575 1.6e-199 701.8 Proteus purM GO:0003674,GO:0003824,GO:0004641,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.3.1,6.3.4.13 ko:K01933,ko:K11788 ko00230,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map01100,map01110,map01130 M00048 R04144,R04208 RC00090,RC00166,RC01100 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_1844,iECSF_1327.ECSF_2340 Bacteria 1MURG@1224,1RNZZ@1236,3Z2ER@583,COG0150@1,COG0150@2 NA|NA|NA F AIR synthase related protein, N-terminal domain Z1_02562 529507.PMI1574 4.3e-112 410.6 Proteus upp GO:0003674,GO:0003824,GO:0004845,GO:0004849,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006222,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008655,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009173,GO:0009174,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0016772,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019206,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042455,GO:0042802,GO:0043094,GO:0043097,GO:0043174,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046049,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.4.2.9 ko:K00761 ko00240,ko01100,map00240,map01100 R00966 RC00063 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b2498,iAPECO1_1312.APECO1_4071,iB21_1397.B21_02352,iBWG_1329.BWG_2262,iE2348C_1286.E2348C_2723,iEC042_1314.EC042_2699,iEC55989_1330.EC55989_2783,iECABU_c1320.ECABU_c27980,iECBD_1354.ECBD_1190,iECB_1328.ECB_02390,iECDH10B_1368.ECDH10B_2664,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2424,iECD_1391.ECD_02390,iECED1_1282.ECED1_2921,iECH74115_1262.ECH74115_3720,iECIAI1_1343.ECIAI1_2550,iECIAI39_1322.ECIAI39_2639,iECNA114_1301.ECNA114_2571,iECO103_1326.ECO103_3015,iECO111_1330.ECO111_3222,iECO26_1355.ECO26_3545,iECOK1_1307.ECOK1_2794,iECP_1309.ECP_2500,iECS88_1305.ECS88_2669,iECSE_1348.ECSE_2784,iECSF_1327.ECSF_2339,iECSP_1301.ECSP_3437,iECUMN_1333.ECUMN_2811,iECW_1372.ECW_m2721,iEKO11_1354.EKO11_1236,iETEC_1333.ETEC_2603,iEcDH1_1363.EcDH1_1171,iEcE24377_1341.EcE24377A_2781,iEcHS_1320.EcHS_A2633,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2645,iEcolC_1368.EcolC_1178,iG2583_1286.G2583_3021,iJN746.PP_0746,iJO1366.b2498,iJR904.b2498,iLF82_1304.LF82_2383,iNRG857_1313.NRG857_12410,iSFV_1184.SFV_2543,iSF_1195.SF2542,iS_1188.S2691,iSbBS512_1146.SbBS512_E2872,iUMN146_1321.UM146_04235,iUMNK88_1353.UMNK88_3094,iWFL_1372.ECW_m2721,iY75_1357.Y75_RS13040,ic_1306.c3015 Bacteria 1MV4N@1224,1RPBG@1236,3Z1EZ@583,COG0035@1,COG0035@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of uracil and 5-phospho-alpha- D-ribose 1-diphosphate (PRPP) to UMP and diphosphate Z1_02563 529507.PMI1573 2.9e-227 794.3 Proteus uraA ko:K02824,ko:K16345 ko00000,ko02000 2.A.40.1.1,2.A.40.1.2,2.A.40.4.2 Bacteria 1MUN9@1224,1RRK5@1236,3Z1BA@583,COG2233@1,COG2233@2 NA|NA|NA F Permease family Z1_02564 529507.PMI1572 1.3e-218 765.4 Proteus ybdG ko:K16053 ko00000,ko02000 1.A.23.4.5 Bacteria 1MVX9@1224,1RNBM@1236,3Z1B3@583,COG0668@1,COG0668@2 NA|NA|NA M Mechanosensitive ion channel Z1_02565 529507.PMI1571 7.2e-138 496.5 Proteus hda GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006270,GO:0006275,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008156,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0016020,GO:0017076,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030174,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032297,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043531,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051171,GO:0051172,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090329,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576,GO:2000104,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02313,ko:K10763 ko02020,ko04112,map02020,map04112 ko00000,ko00001,ko03032,ko03036 Bacteria 1MVW6@1224,1RPJP@1236,3Z12I@583,COG0593@1,COG0593@2 NA|NA|NA L protein DnaA with DNA polymerase subunit beta sliding clamp (dnaN). Stimulates hydrolysis of ATP-DnaA to ADP-DnaA, rendering DnaA inactive for Z1_02566 529507.PMI1570 3.2e-223 780.8 Proteus nupG ko:K03289,ko:K03301,ko:K08218,ko:K11537 ko01501,map01501 M00628 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 2.A.1.10.1,2.A.1.10.2,2.A.1.25,2.A.12 Bacteria 1MWI9@1224,1RMU5@1236,3Z2DC@583,COG2211@1,COG2211@2 NA|NA|NA G Nucleoside H+ symporter Z1_02567 529507.PMI1569 4.9e-60 236.9 Proteus arsC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 1.20.4.1 ko:K00537 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZ4Z@1224,1S8XH@1236,3Z31Y@583,COG1393@1,COG1393@2 NA|NA|NA C ArsC family Z1_02568 529507.PMI1568 3.4e-272 943.7 Proteus bepA GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016787,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0019538,GO:0022607,GO:0030163,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043163,GO:0043165,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044464,GO:0045229,GO:0046872,GO:0051603,GO:0061024,GO:0061077,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071709,GO:0071840,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 Bacteria 1MVFV@1224,1RP5S@1236,3Z24S@583,COG4783@1,COG4783@2 NA|NA|NA M Functions as both a chaperone and a metalloprotease. Maintains the integrity of the outer membrane by promoting either the assembly or the elimination of outer membrane proteins, depending on their folding state Z1_02569 529507.PMI1567 2.1e-186 658.3 Proteus perM GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K03548 ko00000,ko02000 2.A.86.1 Bacteria 1MW0B@1224,1RPVP@1236,3Z1XT@583,COG0628@1,COG0628@2 NA|NA|NA S AI-2E family transporter Z1_02570 529507.PMI1566 6.8e-86 323.2 Proteus bcp GO:0003674,GO:0003824,GO:0004601,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008379,GO:0009636,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0016684,GO:0032843,GO:0042221,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0051920,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071944,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1990748 1.11.1.15 ko:K03564 ko00000,ko01000 iPC815.YPO3064 Bacteria 1RD4R@1224,1RQ7F@1236,3Z38P@583,COG1225@1,COG1225@2 NA|NA|NA O SCO1/SenC Z1_02571 529507.PMI1565 5.8e-100 370.2 Proteus gcvR GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K03567 ko02026,map02026 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1R7W7@1224,1RSDP@1236,3Z3B9@583,COG2716@1,COG2716@2 NA|NA|NA E ACT domain Z1_02572 34506.g1461 1.3e-165 589.0 Rhabditida Nematoda 1M88P@119089,2QWNS@2759,399HY@33154,3BGNT@33208,3CUM9@33213,40QQT@6231,416WM@6236,COG0329@1 NA|NA|NA E Dihydrodipicolinate synthetase family Z1_02573 529507.PMI1563 2.3e-190 671.4 Proteus bamC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009986,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032991,GO:0042802,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045229,GO:0061024,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098796,GO:1990063 ko:K07287 ko00000,ko02000 1.B.33.1 Bacteria 1MUUK@1224,1RN2X@1236,3Z2C6@583,COG3317@1,COG3317@2 NA|NA|NA M Part of the outer membrane protein assembly complex, which is involved in assembly and insertion of beta-barrel proteins into the outer membrane Z1_02574 34506.g1462 2.1e-131 474.9 Rhabditida Nematoda 1M7SV@119089,399JT@33154,3BX02@33208,3DFXZ@33213,40QVZ@6231,41713@6236,COG0152@1,KOG2835@2759 NA|NA|NA F SAICAR synthetase Z1_02575 529507.PMI1561 8.2e-165 586.3 Proteus ypfJ GO:0005575,GO:0005576 ko:K07054 ko00000 Bacteria 1MU4U@1224,1RMF8@1236,3Z2E9@583,COG2321@1,COG2321@2 NA|NA|NA S Putative neutral zinc metallopeptidase Z1_02576 529507.PMI1560 6e-71 273.5 Proteus yeaL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RA7I@1224,1S2D6@1236,3Z2NI@583,COG2707@1,COG2707@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF441) Z1_02577 529507.PMI1559 0.0 1380.2 Proteus tmcA GO:0000049,GO:0000154,GO:0002097,GO:0002101,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0022613,GO:0030490,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0051391,GO:0051392,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1904812,GO:1990882,GO:1990883,GO:1990884 2.3.1.193,2.3.1.57 ko:K00657,ko:K06957 ko00330,ko01100,ko04216,map00330,map01100,map04216 M00135 R01154 RC00004,RC00096 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03016 Bacteria 1NBA4@1224,1RPAM@1236,3Z1N3@583,COG1444@1,COG1444@2 NA|NA|NA J Catalyzes the formation of N(4)-acetylcytidine (ac(4)C) at the wobble position of tRNA(Met), by using acetyl-CoA as an acetyl donor and ATP (or GTP) Z1_02578 585.DR95_484 3.9e-27 126.7 Gammaproteobacteria ypfN Bacteria 1N76H@1224,1SCQS@1236,2C6G7@1,32YJI@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0370) Z1_02579 529507.PMI1558 3e-60 237.7 Proteus ybaN GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K09790 ko00000 Bacteria 1N7BI@1224,1SCJZ@1236,3Z2R8@583,COG2832@1,COG2832@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF454) Z1_02580 34506.g1236 1.9e-225 788.1 Eukaryota Eukaryota 2CZY8@1,2SC3Z@2759 NA|NA|NA S Putative transposase DNA-binding domain Z1_02581 529507.PMI1557 3.3e-126 457.6 Proteus vanY Bacteria 1N2IC@1224,1S0DU@1236,3Z265@583,COG1876@1,COG1876@2 NA|NA|NA E D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase Z1_02582 529507.PMI1556 7.6e-216 756.1 Proteus dapE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008652,GO:0009014,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019752,GO:0032153,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046451,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050897,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 3.5.1.18 ko:K01439 ko00300,ko01100,ko01120,ko01230,map00300,map01100,map01120,map01230 M00016 R02734 RC00064,RC00090 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_2485,iIT341.HP0212 Bacteria 1MW6G@1224,1RMNQ@1236,3Z1CD@583,COG0624@1,COG0624@2 NA|NA|NA E Catalyzes the hydrolysis of N-succinyl-L,L- diaminopimelic acid (SDAP), forming succinate and LL-2,6- diaminoheptanedioate (DAP), an intermediate involved in the bacterial biosynthesis of lysine and meso-diaminopimelic acid, an essential component of bacterial cell walls Z1_02583 529507.PMI1555 4e-65 253.8 Proteus yffB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 1.20.4.1 ko:K00537,ko:K16509 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZ6S@1224,1S8TR@1236,3Z31E@583,COG1393@1,COG1393@2 NA|NA|NA P ArsC family Z1_02584 529507.PMI1554 7.2e-100 369.8 Proteus Bacteria 1N030@1224,1SBC1@1236,2DADI@1,32TV7@2,3Z1RH@583 NA|NA|NA Z1_02585 529507.PMI1553 8.4e-108 396.4 Proteus narP ko:K02479,ko:K07685 ko02020,map02020 M00472 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022 Bacteria 1Q7GF@1224,1RWWU@1236,3Z2UN@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K Response regulator receiver domain Z1_02586 529507.PMI1552 0.0 1470.3 Proteus maeB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004470,GO:0004473,GO:0005488,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016615,GO:0016616,GO:0030145,GO:0043167,GO:0043169,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055114 1.1.1.38,1.1.1.40,2.3.1.8 ko:K00027,ko:K00029,ko:K00625,ko:K13788 ko00430,ko00620,ko00640,ko00680,ko00710,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,ko02020,map00430,map00620,map00640,map00680,map00710,map00720,map01100,map01120,map01200,map02020 M00169,M00172,M00357,M00579 R00214,R00216,R00230,R00921 RC00004,RC00105,RC02746,RC02816 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_1637 Bacteria 1MU0A@1224,1RN5F@1236,3Z1NM@583,COG0280@1,COG0280@2,COG0281@1,COG0281@2 NA|NA|NA C Malic enzyme, NAD binding domain Z1_02587 529507.PMI1551 1.9e-158 565.1 Proteus cjrA Bacteria 1R5UH@1224,1RQXM@1236,3Z1MN@583,COG3016@1,COG3016@2 NA|NA|NA S Haem-binding uptake, Tiki superfamily, ChaN Z1_02588 529507.PMI1550 2.4e-139 501.5 Proteus tonB ko:K03832 ko00000,ko02000 2.C.1.1 Bacteria 1PBUA@1224,1SWIW@1236,3Z313@583,COG0810@1,COG0810@2 NA|NA|NA M Interacts with outer membrane receptor proteins that carry out high-affinity binding and energy dependent uptake into the periplasmic space of specific substrates. It could act to transduce energy from the cytoplasmic membrane to specific energy- requiring processes in the outer membrane, resulting in the release into the periplasm of ligands bound by these outer membrane proteins Z1_02589 34506.g774 0.0 1432.5 Chromadorea Nematoda 1KUTY@119089,38DGX@33154,3BADV@33208,3CXQ9@33213,40BBE@6231,COG1505@1,KOG2237@2759 NA|NA|NA O Prolyl oligopeptidase, N-terminal beta-propeller domain Z1_02590 529507.PMI1548 0.0 1484.9 Proteus hasR ko:K16087,ko:K16152 ko00000,ko02000 1.B.14.2,1.B.14.7.1 Bacteria 1QUEJ@1224,1T1W2@1236,3Z1RA@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA M TonB dependent receptor Z1_02591 529507.PMI1547 5.3e-251 873.2 Proteus xseA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008855,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009318,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0019439,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575,GO:1902494 3.1.11.6 ko:K03601 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUA4@1224,1RNAZ@1236,3Z1HN@583,COG1570@1,COG1570@2 NA|NA|NA L Bidirectionally degrades single-stranded DNA into large acid-insoluble oligonucleotides, which are then degraded further into small acid-soluble oligonucleotides Z1_02592 529507.PMI1546 2.5e-267 927.5 Proteus guaB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003938,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006183,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042451,GO:0042455,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046039,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046390,GO:0046483,GO:0050896,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901070,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 1.1.1.205 ko:K00088 ko00230,ko00983,ko01100,ko01110,map00230,map00983,map01100,map01110 M00050 R01130,R08240 RC00143,RC02207 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iAPECO1_1312.APECO1_4018,iECABU_c1320.ECABU_c28100,iECP_1309.ECP_2510,iECSF_1327.ECSF_2349,iUTI89_1310.UTI89_C2826,ic_1306.c3027 Bacteria 1MUJM@1224,1RMT8@1236,3Z2EE@583,COG0516@1,COG0516@2,COG0517@1,COG0517@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of inosine 5'-phosphate (IMP) to xanthosine 5'-phosphate (XMP), the first committed and rate- limiting step in the de novo synthesis of guanine nucleotides, and therefore plays an important role in the regulation of cell growth Z1_02593 529507.PMI1545 2e-310 1070.8 Proteus guaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003921,GO:0003922,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006177,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016884,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0030312,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0040007,GO:0042278,GO:0042451,GO:0042455,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046037,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901070,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 6.3.5.2 ko:K01951 ko00230,ko00983,ko01100,map00230,map00983,map01100 M00050 R01230,R01231,R08244 RC00010,RC00204 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01002 iJN746.PP_1032,iLJ478.TM1820,iSF_1195.SF2553,iSFxv_1172.SFxv_2808,iS_1188.S2725,iYL1228.KPN_02833 Bacteria 1MU2A@1224,1RP81@1236,3Z29Y@583,COG0518@1,COG0518@2,COG0519@1,COG0519@2 NA|NA|NA F Catalyzes the synthesis of GMP from XMP Z1_02594 585.DR95_500 1.3e-52 212.2 Gammaproteobacteria Z012_11675 Bacteria 1MU23@1224,1RMJ1@1236,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_02595 529507.PMI0894 8.6e-41 172.9 Proteus rlmD 2.1.1.190,2.1.1.191 ko:K03215,ko:K06969,ko:K14292 ko03013,map03013 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 Bacteria 1RDWK@1224,1S3U5@1236,3Z2GJ@583,COG1092@1,COG1092@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the guanine in position 2445 (m2G2445) and the guanine in position 2069 (m7G2069) of 23S rRNA Z1_02597 351348.Maqu_1716 1.1e-17 95.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1N1CS@1224,1SA5M@1236,2E16U@1,32VIU@2 NA|NA|NA S Toxin of toxin-antitoxin type 1 system Z1_02598 1183438.GKIL_1471 8.5e-94 351.3 Bacteria Bacteria 28JMM@1,2Z9E4@2 NA|NA|NA Z1_02599 40215.BBOS01000042_gene78 3.1e-20 104.4 Moraxellaceae Bacteria 1NPQ3@1224,1SIME@1236,2EMBU@1,33F0T@2,3NPG0@468 NA|NA|NA Z1_02601 1440052.EAKF1_ch3508c 6.8e-293 1012.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1R0M4@1224,1SD74@1236,COG0457@1,COG0457@2 NA|NA|NA S Tetratricopeptide repeat Z1_02605 198628.Dda3937_04395 6.1e-96 357.1 Dickeya Bacteria 1NIUK@1224,1SIR0@1236,2ESYY@1,2JEPD@204037,33KH6@2 NA|NA|NA Z1_02606 198628.Dda3937_02585 1.1e-119 436.0 Dickeya 2.7.7.77 ko:K03752,ko:K04095 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R11581 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036 Bacteria 1RDPS@1224,1SH29@1236,2JER5@204037,COG2184@1,COG2184@2 NA|NA|NA D Fic/DOC family Z1_02607 529507.PMI1544 6.1e-148 530.0 Proteus ycgL ko:K07074 ko00000 Bacteria 1MYFT@1224,1RY9F@1236,3Z18E@583,COG3541@1,COG3541@2 NA|NA|NA S Predicted nucleotidyltransferase Z1_02608 529507.PMI1543 7.6e-202 709.5 Proteus ko:K07074 ko00000 Bacteria 1R522@1224,1RZG7@1236,3Z0UJ@583,COG3541@1,COG3541@2 NA|NA|NA S Predicted nucleotidyltransferase Z1_02609 529507.PMI1542 3.5e-35 153.7 Proteus Bacteria 1NK95@1224,1SHQF@1236,2ERAD@1,33IW2@2,3Z2Z1@583 NA|NA|NA Z1_02610 529507.PMI1541 4.2e-52 210.3 Proteus cutA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0016043,GO:0022607,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046688,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051260,GO:0065003,GO:0071840 4.2.3.1 ko:K01733,ko:K03926 ko00260,ko00750,ko01100,ko01110,ko01120,ko01230,map00260,map00750,map01100,map01110,map01120,map01230 M00018 R01466,R05086 RC00017,RC00526 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1N6TN@1224,1SCFM@1236,3Z2X9@583,COG1324@1,COG1324@2 NA|NA|NA P CutA1 divalent ion tolerance protein Z1_02611 529507.PMI1540 1.1e-178 632.5 Proteus yjhU GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K05346 ko00000,ko03000 Bacteria 1R558@1224,1S0CH@1236,3Z1RW@583,COG2390@1,COG2390@2 NA|NA|NA K Putative sugar-binding domain Z1_02612 529507.PMI1539 2e-135 488.4 Proteus modA2 GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0030288,GO:0030313,GO:0030973,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044464 ko:K02020 ko02010,map02010 M00189 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.8 Bacteria 1QD9D@1224,1RZMX@1236,3Z1BV@583,COG0725@1,COG0725@2 NA|NA|NA P Bacterial extracellular solute-binding protein Z1_02613 529507.PMI1538 1.3e-129 469.2 Proteus modB1 GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02018 ko02010,map02010 M00189 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.8 Bacteria 1QTTU@1224,1RYCU@1236,3Z3BP@583,COG0555@1,COG0555@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_02614 529507.PMI1537 4.8e-111 407.1 Proteus 3.6.3.29,3.6.3.30 ko:K02010,ko:K02017,ko:K11076 ko02010,map02010 M00189,M00190,M00300 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.10,3.A.1.11.2,3.A.1.8 Bacteria 1RANP@1224,1S20N@1236,3Z1QB@583,COG3842@1,COG3842@2 NA|NA|NA P ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_02615 529507.PMI1536 6e-131 473.4 Proteus cI Bacteria 1PIRG@1224,1S499@1236,3Z2XQ@583,COG1396@1,COG1396@2,COG2932@1,COG2932@2 NA|NA|NA K Peptidase S24-like Z1_02616 529507.PMI1535 5.3e-40 169.9 Proteus Bacteria 1NBYJ@1224,1SHIS@1236,2E3FU@1,32YEN@2,3Z303@583 NA|NA|NA Z1_02617 529507.PMI1534 9.8e-65 252.7 Proteus Bacteria 1PVBT@1224,1T968@1236,2AFAT@1,315A6@2,3Z3GW@583 NA|NA|NA M Domain of unknown function (DUF4878) Z1_02618 529507.PMI1533 5.6e-86 323.6 Proteus Bacteria 1N5MP@1224,1S9QS@1236,3Z3AT@583,COG3863@1,COG3863@2 NA|NA|NA S Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family Z1_02619 529507.PMI1532 6.4e-145 520.0 Proteus Bacteria 1MW9A@1224,1RMMZ@1236,3Z1NU@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase Z1_02620 529507.PMI1531 7.3e-140 503.1 Proteus Bacteria 1R50H@1224,1RYG2@1236,3Z2M2@583,COG4639@1,COG4639@2 NA|NA|NA S RNA ligase Z1_02621 529507.PMI1530 2.4e-217 761.1 Proteus Bacteria 1MZH5@1224,1RZX8@1236,3Z1CJ@583,COG4639@1,COG4639@2 NA|NA|NA S AAA domain Z1_02622 529507.PMI1529 2.3e-84 318.2 Proteus Bacteria 1N2RA@1224,1SANQ@1236,2DZM1@1,32VDI@2,3Z31N@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4822) Z1_02623 529507.PMI1528 2.7e-219 767.7 Proteus rbsK 2.7.1.15,2.7.1.4 ko:K00847,ko:K00852,ko:K02444 ko00030,ko00051,ko00500,ko00520,ko01100,map00030,map00051,map00500,map00520,map01100 R00760,R00867,R01051,R02750,R03920 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000 Bacteria 1R52G@1224,1RN4W@1236,3Z1MC@583,COG0524@1,COG0524@2,COG1349@1,COG1349@2 NA|NA|NA H Catalyzes the phosphorylation of ribose at O-5 in a reaction requiring ATP and magnesium. The resulting D-ribose-5- phosphate can then be used either for sythesis of nucleotides, histidine, and tryptophan, or as a component of the pentose phosphate pathway Z1_02624 529507.PMI1527 4e-141 507.3 Proteus Bacteria 1R8IM@1224,1SZPK@1236,3Z166@583,COG5426@1,COG5426@2 NA|NA|NA S Putative glutamine amidotransferase Z1_02625 529507.PMI1526 2.7e-169 601.3 Proteus ko:K09936 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.7.21 Bacteria 1MX2Z@1224,1S14I@1236,3Z23S@583,COG3238@1,COG3238@2 NA|NA|NA S Putative inner membrane exporter, YdcZ Z1_02626 529507.PMI1525 1.5e-197 695.3 Proteus pteR ko:K07048 ko00000 Bacteria 1NPYS@1224,1RRE8@1236,3Z0VJ@583,COG1735@1,COG1735@2 NA|NA|NA C Phosphotriesterase family Z1_02627 529507.PMI1524 4.6e-177 627.1 Proteus glpX 2.2.1.1,3.1.3.11,3.1.3.37 ko:K00615,ko:K02446,ko:K11532 ko00010,ko00030,ko00051,ko00680,ko00710,ko01051,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00030,map00051,map00680,map00710,map01051,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00003,M00004,M00007,M00165,M00167 R00762,R01067,R01641,R01830,R01845,R04780,R06590 RC00017,RC00032,RC00226,RC00571,RC01560 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUB1@1224,1RR0E@1236,3Z0ZF@583,COG1494@1,COG1494@2 NA|NA|NA G Bacterial fructose-1,6-bisphosphatase, glpX-encoded Z1_02628 529507.PMI1523 5.5e-112 410.2 Gammaproteobacteria ydgI ko:K15976 ko00000,ko01000 Bacteria 1RBZQ@1224,1S328@1236,COG0778@1,COG0778@2 NA|NA|NA C Nitroreductase Z1_02629 529507.PMI1522 3e-111 407.9 Proteus uvrY GO:0000156,GO:0000160,GO:0003674,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0023052,GO:0035556,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007 ko:K02282,ko:K07687,ko:K07689,ko:K20264 ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02024,map02025,map02026,map05111 M00474,M00475,M00818 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko02035,ko02044 Bacteria 1MWGM@1224,1RQ1J@1236,3Z13U@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_02630 529507.PMI1521 6e-91 340.1 Proteus uvrC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009380,GO:0009381,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016787,GO:0016788,GO:0030312,GO:0031668,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0040007,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1902494,GO:1905347,GO:1905348,GO:1990391 ko:K03703 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MV38@1224,1RNGV@1236,3Z1PF@583,COG0322@1,COG0322@2 NA|NA|NA L The UvrABC repair system catalyzes the recognition and processing of DNA lesions. UvrC both incises the 5' and 3' sides of the lesion. The N-terminal half is responsible for the 3' incision and the C-terminal half is responsible for the 5' incision Z1_02631 529507.PMI1524 2e-22 111.3 Proteus glpX 2.2.1.1,3.1.3.11,3.1.3.37 ko:K00615,ko:K02446,ko:K11532 ko00010,ko00030,ko00051,ko00680,ko00710,ko01051,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00010,map00030,map00051,map00680,map00710,map01051,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00003,M00004,M00007,M00165,M00167 R00762,R01067,R01641,R01830,R01845,R04780,R06590 RC00017,RC00032,RC00226,RC00571,RC01560 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUB1@1224,1RR0E@1236,3Z0ZF@583,COG1494@1,COG1494@2 NA|NA|NA G Bacterial fructose-1,6-bisphosphatase, glpX-encoded Z1_02632 529507.PMI1523 5.5e-112 410.2 Gammaproteobacteria ydgI ko:K15976 ko00000,ko01000 Bacteria 1RBZQ@1224,1S328@1236,COG0778@1,COG0778@2 NA|NA|NA C Nitroreductase Z1_02633 529507.PMI1522 3e-111 407.9 Proteus uvrY GO:0000156,GO:0000160,GO:0003674,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0023052,GO:0035556,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060089,GO:0065007 ko:K02282,ko:K07687,ko:K07689,ko:K20264 ko02020,ko02024,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02024,map02025,map02026,map05111 M00474,M00475,M00818 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko02035,ko02044 Bacteria 1MWGM@1224,1RQ1J@1236,3Z13U@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, Lux Regulon Z1_02634 529507.PMI1521 0.0 1193.7 Proteus uvrC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009380,GO:0009381,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016787,GO:0016788,GO:0030312,GO:0031668,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0040007,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1902494,GO:1905347,GO:1905348,GO:1990391 ko:K03703 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MV38@1224,1RNGV@1236,3Z1PF@583,COG0322@1,COG0322@2 NA|NA|NA L The UvrABC repair system catalyzes the recognition and processing of DNA lesions. UvrC both incises the 5' and 3' sides of the lesion. The N-terminal half is responsible for the 3' incision and the C-terminal half is responsible for the 5' incision Z1_02635 529507.PMI1520 9.1e-98 362.8 Proteus pgsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008444,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0017169,GO:0019637,GO:0031224,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044425,GO:0044464,GO:0045017,GO:0046474,GO:0046486,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901576 2.7.8.41,2.7.8.5 ko:K00995,ko:K08744 ko00564,ko01100,map00564,map01100 R01801,R02030 RC00002,RC00017,RC02795 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b1912,iAPECO1_1312.APECO1_954,iB21_1397.B21_01866,iBWG_1329.BWG_1721,iE2348C_1286.E2348C_2030,iEC042_1314.EC042_2073,iEC55989_1330.EC55989_2132,iECABU_c1320.ECABU_c21710,iECBD_1354.ECBD_1731,iECB_1328.ECB_01877,iECDH10B_1368.ECDH10B_2053,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1852,iECD_1391.ECD_01877,iECED1_1282.ECED1_2177,iECH74115_1262.ECH74115_2684,iECIAI1_1343.ECIAI1_1996,iECIAI39_1322.ECIAI39_1143,iECNA114_1301.ECNA114_2003,iECO103_1326.ECO103_2168,iECO111_1330.ECO111_2492,iECO26_1355.ECO26_2804,iECOK1_1307.ECOK1_2029,iECP_1309.ECP_1852,iECS88_1305.ECS88_1966,iECSF_1327.ECSF_1764,iECSP_1301.ECSP_2516,iECUMN_1333.ECUMN_2204,iECs_1301.ECs2650,iETEC_1333.ETEC_2020,iEcDH1_1363.EcDH1_1734,iEcE24377_1341.EcE24377A_2145,iEcHS_1320.EcHS_A2010,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1271,iEcolC_1368.EcolC_1727,iG2583_1286.G2583_2363,iJO1366.b1912,iJR904.b1912,iLF82_1304.LF82_1635,iNRG857_1313.NRG857_09550,iSDY_1059.SDY_1106,iSSON_1240.SSON_1206,iSbBS512_1146.SbBS512_E1039,iUMN146_1321.UM146_07620,iUMNK88_1353.UMNK88_2386,iUTI89_1310.UTI89_C2113,iY75_1357.Y75_RS10025,iYL1228.KPN_02410,iZ_1308.Z3000,ic_1306.c2325 Bacteria 1RCZ7@1224,1S465@1236,3Z1HJ@583,COG0558@1,COG0558@2 NA|NA|NA I Belongs to the CDP-alcohol phosphatidyltransferase class-I family Z1_02641 529507.PMI1519 4.9e-122 443.7 Gammaproteobacteria MA20_06510 2.7.4.1 ko:K00937,ko:K06925 ko00190,ko03018,map00190,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016,ko03019 Bacteria 1R4QA@1224,1RQ73@1236,COG3683@1,COG3683@2 NA|NA|NA S transport system periplasmic component Z1_02642 529507.PMI1518 5.3e-152 543.9 Gammaproteobacteria yohM ko:K08970 ko00000,ko02000 2.A.52.2 Bacteria 1MWIW@1224,1RQ9T@1236,COG2215@1,COG2215@2 NA|NA|NA P Belongs to the NiCoT transporter (TC 2.A.52) family Z1_02643 529507.PMI1517 9.8e-59 232.6 Proteus Bacteria 1N0KY@1224,1SCNI@1236,3Z3FZ@583,COG3544@1,COG3544@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF305) Z1_02644 529507.PMI1516 2.5e-69 268.1 Proteus Bacteria 1QG56@1224,1TDI0@1236,2AT03@1,31IFX@2,3Z302@583 NA|NA|NA Z1_02645 529507.PMI1515 6.3e-216 756.5 Proteus sotB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03445,ko:K08159 ko00000,ko02000 2.A.1.2.15,2.A.1.2.18,2.A.1.2.26 iEcSMS35_1347.EcSMS35_1642,iSF_1195.SF1566 Bacteria 1MU9G@1224,1RPHV@1236,3Z1H9@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA P Major Facilitator Superfamily Z1_02646 529507.PMI1514 4.7e-49 200.3 Proteus emrE ko:K03297 ko00000,ko02000 2.A.7.1 Bacteria 1MZ54@1224,1S8SG@1236,3Z2W2@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Small Multidrug Resistance protein Z1_02647 529507.PMI1513 1e-50 205.7 Proteus ydbJ ko:K09712,ko:K14475 ko05143,map05143 ko00000,ko00001 Bacteria 1NJGR@1224,1SXZJ@1236,3Z2Z9@583,COG3042@1,COG3042@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF333) Z1_02648 529507.PMI1512 4.2e-92 344.0 Proteus dsbB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006091,GO:0006457,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016491,GO:0016667,GO:0022900,GO:0044237,GO:0050896,GO:0055114 ko:K03611 ko00000,ko03110 5.A.2.1 iAF1260.b1185,iB21_1397.B21_01170,iBWG_1329.BWG_1010,iEC042_1314.EC042_1234,iEC55989_1330.EC55989_1280,iECBD_1354.ECBD_2437,iECB_1328.ECB_01160,iECDH10B_1368.ECDH10B_1238,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1124,iECD_1391.ECD_01160,iECED1_1282.ECED1_1327,iECIAI1_1343.ECIAI1_1202,iECO103_1326.ECO103_1287,iECSP_1301.ECSP_1582,iECUMN_1333.ECUMN_1474,iECs_1301.ECs1680,iETEC_1333.ETEC_1289,iEcDH1_1363.EcDH1_2463,iEcHS_1320.EcHS_A1288,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1964,iEcolC_1368.EcolC_2440,iG2583_1286.G2583_1446,iJO1366.b1185,iSDY_1059.SDY_1222,iY75_1357.Y75_RS06185 Bacteria 1RIJE@1224,1S6WD@1236,3Z2TB@583,COG1495@1,COG1495@2 NA|NA|NA C disulfide bond formation protein B Z1_02649 529507.PMI1511 1.3e-266 925.2 Proteus nhaB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005451,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0006873,GO:0006885,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010226,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015081,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015298,GO:0015299,GO:0015318,GO:0015385,GO:0015491,GO:0015672,GO:0016020,GO:0019725,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030641,GO:0034220,GO:0035725,GO:0042221,GO:0042592,GO:0044464,GO:0045851,GO:0046873,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051452,GO:0051453,GO:0055067,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098771,GO:0099516,GO:1902600 ko:K03314 ko00000,ko02000 2.A.34.1 iECP_1309.ECP_1229,iLF82_1304.LF82_1485,iNRG857_1313.NRG857_06055,iUTI89_1310.UTI89_C1372 Bacteria 1MV0F@1224,1RPE3@1236,3Z14S@583,COG3067@1,COG3067@2 NA|NA|NA P ) H( ) antiporter that extrudes sodium in exchange for external protons Z1_02650 529507.PMI1510 6.7e-133 479.9 Proteus fadR GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006629,GO:0006631,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010563,GO:0010565,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019216,GO:0019217,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019395,GO:0019752,GO:0030258,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032787,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034440,GO:0042304,GO:0043436,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045723,GO:0045833,GO:0045834,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045923,GO:0045934,GO:0045935,GO:0045936,GO:0046889,GO:0046890,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051055,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0055114,GO:0060255,GO:0062012,GO:0062013,GO:0065007,GO:0071071,GO:0071072,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1903725,GO:1903726,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03603,ko:K05799,ko:K22104 ko00000,ko03000 Bacteria 1MW7M@1224,1RMRE@1236,3Z38J@583,COG2186@1,COG2186@2 NA|NA|NA K Multifunctional regulator of fatty acid metabolism Z1_02651 529507.PMI1509 2.9e-251 874.0 Proteus dadA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006524,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008718,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009078,GO:0009080,GO:0009324,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016638,GO:0019478,GO:0019480,GO:0019752,GO:0032991,GO:0042851,GO:0042853,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046144,GO:0046395,GO:0046416,GO:0046436,GO:0055114,GO:0055130,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606,GO:1902494,GO:1990204 1.4.5.1 ko:K00285 ko00360,map00360 R01374,R09493 RC00006,RC00025 ko00000,ko00001,ko01000 iSBO_1134.SBO_1883,iSFV_1184.SFV_1196,iSF_1195.SF1178,iSFxv_1172.SFxv_1352,iS_1188.S1266,iUMNK88_1353.UMNK88_1502,iYL1228.KPN_02309 Bacteria 1MVIZ@1224,1RQ50@1236,3Z3AP@583,COG0665@1,COG0665@2 NA|NA|NA E FAD dependent oxidoreductase Z1_02652 529507.PMI1508 2.3e-212 744.6 Proteus alr GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006523,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008784,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009078,GO:0009079,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016853,GO:0016854,GO:0016855,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0030203,GO:0030632,GO:0034645,GO:0036094,GO:0036361,GO:0040007,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046144,GO:0046145,GO:0046394,GO:0046416,GO:0046436,GO:0046437,GO:0047661,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 5.1.1.1 ko:K01775 ko00473,ko01100,ko01502,map00473,map01100,map01502 R00401 RC00285 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iEC55989_1330.EC55989_1285,iECIAI39_1322.ECIAI39_1880,iECO103_1326.ECO103_1292,iECO26_1355.ECO26_1703,iECSE_1348.ECSE_1238,iECUMN_1333.ECUMN_1479,iECW_1372.ECW_m1275,iEKO11_1354.EKO11_2666,iEcE24377_1341.EcE24377A_1335,iWFL_1372.ECW_m1275,iYL1228.KPN_02308 Bacteria 1MV0Q@1224,1RM8U@1236,3Z3D1@583,COG0787@1,COG0787@2 NA|NA|NA M Catalyzes the interconversion of L-alanine and D- alanine. May also act on other amino acids Z1_02653 529507.PMI1507 0.0 1471.1 Proteus hypF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016743,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046944,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564 ko:K04656 ko00000 iAF987.Gmet_0119 Bacteria 1MVP8@1224,1RP08@1236,3Z1NQ@583,COG0068@1,COG0068@2 NA|NA|NA O Along with HypE, it catalyzes the synthesis of the CN ligands of the active site iron of NiFe -hydrogenases using carbamoylphosphate as a substrate. It functions as a carbamoyl transferase using carbamoylphosphate as a substrate and transferring the carboxamido moiety in an ATP-dependent reaction to the thiolate of the C-terminal cysteine of HypE yielding a protein-S-carboxamide Z1_02654 529507.PMI1506 3e-144 517.7 Proteus mipA GO:0000270,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030203,GO:0030312,GO:0030313,GO:0030674,GO:0031975,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044462,GO:0044464,GO:0060090,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K07274 ko00000,ko02000 9.B.99.1 Bacteria 1MWQN@1224,1RQTM@1236,3Z1E6@583,COG3713@1,COG3713@2 NA|NA|NA M MltA-interacting protein MipA Z1_02655 529507.PMI1505 7.6e-171 606.3 Proteus yeaD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716 4.2.1.9,5.1.3.15 ko:K01687,ko:K01792 ko00010,ko00290,ko00770,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01210,ko01230,map00010,map00290,map00770,map01100,map01110,map01120,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R01209,R02739,R04441,R05070 RC00468,RC00563,RC01714 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1Q7VN@1224,1RQK0@1236,3Z269@583,COG0676@1,COG0676@2 NA|NA|NA G Aldose 1-epimerase Z1_02656 34506.g1183 5.5e-186 656.8 Rhabditida Nematoda 1KUTI@119089,38DPH@33154,3BA6Z@33208,3CRFX@33213,40FCJ@6231,40Y6E@6236,COG0057@1,KOG0657@2759 NA|NA|NA F Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Z1_02657 529507.PMI1503 2.3e-83 314.7 Proteus msrB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0019538,GO:0030091,GO:0033743,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901564 1.8.4.12 ko:K07305 ko00000,ko01000 iAF1260.b1778,iB21_1397.B21_01735,iBWG_1329.BWG_1591,iE2348C_1286.E2348C_1905,iEC042_1314.EC042_1944,iEC55989_1330.EC55989_1947,iECBD_1354.ECBD_1866,iECB_1328.ECB_01747,iECDH10B_1368.ECDH10B_1916,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1722,iECD_1391.ECD_01747,iECH74115_1262.ECH74115_2502,iECIAI39_1322.ECIAI39_1275,iECNA114_1301.ECNA114_1824,iECO103_1326.ECO103_1964,iECP_1309.ECP_1726,iECSE_1348.ECSE_1949,iECSF_1327.ECSF_1639,iECSP_1301.ECSP_2350,iECUMN_1333.ECUMN_2067,iECW_1372.ECW_m1947,iECs_1301.ECs2487,iEKO11_1354.EKO11_1997,iETEC_1333.ETEC_1810,iEcDH1_1363.EcDH1_1864,iEcE24377_1341.EcE24377A_2002,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1413,iG2583_1286.G2583_2225,iJO1366.b1778,iLF82_1304.LF82_1402,iNRG857_1313.NRG857_08905,iPC815.YPO2158,iSSON_1240.SSON_1385,iWFL_1372.ECW_m1947,iY75_1357.Y75_RS09320,iYL1228.KPN_01198,iZ_1308.Z2817 Bacteria 1RGWC@1224,1S5WI@1236,3Z2S2@583,COG0229@1,COG0229@2 NA|NA|NA C SelR domain Z1_02658 529507.PMI1502 6.4e-47 193.0 Proteus yeaC ko:K09916 ko00000 Bacteria 1N6T3@1224,1SCFV@1236,3Z2UG@583,COG3139@1,COG3139@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1315) Z1_02659 529507.PMI1501 8.1e-122 443.0 Proteus pncA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006769,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008936,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009820,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019365,GO:0019438,GO:0019637,GO:0030145,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043094,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043173,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.11.1,3.5.1.19 ko:K08281,ko:K12132 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R01268 RC00100 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001 iE2348C_1286.E2348C_1895,iECs_1301.ECs2475,iZ_1308.Z2802 Bacteria 1MUGW@1224,1RZBF@1236,3Z112@583,COG1335@1,COG1335@2 NA|NA|NA Q Isochorismatase family Z1_02660 34506.g1044 1.1e-194 685.6 Rhabditida Nematoda 1KYKM@119089,38D57@33154,3BFKQ@33208,3CR8B@33213,40B89@6231,410NS@6236,COG0252@1,KOG0503@2759 NA|NA|NA E Asparaginase, N-terminal Z1_02661 529507.PMI1499 0.0 1203.7 Proteus sppA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006465,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016485,GO:0016787,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051604,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 ko:K04773,ko:K04774 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUXE@1224,1RNYW@1236,3Z1PA@583,COG0616@1,COG0616@2 NA|NA|NA OU signal peptide peptidase Z1_02662 529507.PMI1498 8.8e-101 372.9 Proteus ydjA GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0010181,GO:0032553,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 Bacteria 1PKUV@1224,1RNQG@1236,3Z1PK@583,COG0778@1,COG0778@2 NA|NA|NA C Nitroreductase family Z1_02663 529507.PMI1497 3.3e-197 694.1 Proteus selD GO:0000287,GO:0001887,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004756,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016070,GO:0016259,GO:0016260,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016781,GO:0019752,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0070329,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.7.9.3 ko:K01008 ko00450,ko01100,map00450,map01100 R03595 RC00002,RC02878 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 iPC815.YPO2164,iSFV_1184.SFV_1453,iSF_1195.SF1459,iSFxv_1172.SFxv_1645,iS_1188.S1574 Bacteria 1MWFG@1224,1RQ5Q@1236,3Z17Y@583,COG0709@1,COG0709@2 NA|NA|NA H Selenide, water dikinase Z1_02664 529507.PMI1496 0.0 1311.6 Proteus topB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003917,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007049,GO:0007059,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016853,GO:0022402,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0051304,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 5.99.1.2 ko:K03169 ko00000,ko01000,ko03032 Bacteria 1MUFZ@1224,1RN4X@1236,3Z2CY@583,COG0550@1,COG0550@2 NA|NA|NA L Releases the supercoiling and torsional tension of DNA, which is introduced during the DNA replication and transcription, by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. Introduces a single-strand break via transesterification at a target site in duplex DNA. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand. The free DNA strand then undergoes passage around the unbroken strand, thus removing DNA supercoils. Finally, in the religation step, the DNA 3'-OH attacks the covalent intermediate to expel the active-site tyrosine and restore the DNA phosphodiester backbone Z1_02665 529507.PMI1495 4.4e-157 560.5 Proteus xthA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008853,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016895,GO:0033554,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 3.1.11.2 ko:K01142 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVII@1224,1RN4H@1236,3Z11C@583,COG0708@1,COG0708@2 NA|NA|NA L exodeoxyribonuclease III Z1_02666 529507.PMI1494 2.8e-162 577.8 Proteus rlsA Bacteria 1NWHI@1224,1RP8S@1236,3Z2ZZ@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_02668 529507.PMI1493 1.4e-161 575.5 Proteus purU GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006760,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008864,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009256,GO:0009257,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.7.72,3.5.1.10 ko:K00974,ko:K01433 ko00630,ko00670,ko03013,map00630,map00670,map03013 R00944,R09382,R09383,R09384,R09386 RC00026,RC00078,RC00111 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 iSDY_1059.SDY_1284 Bacteria 1MVCF@1224,1RN6Q@1236,3Z1JV@583,COG0788@1,COG0788@2 NA|NA|NA F formyltetrahydrofolate deformylase Z1_02669 529507.PMI1492 5.1e-92 343.6 Proteus ychJ ko:K09858 ko00000 Bacteria 1PSXP@1224,1SX7F@1236,3Z3F8@583,COG3012@1,COG3012@2 NA|NA|NA S SEC-C motif Z1_02670 529507.PMI1491 1.6e-196 691.8 Proteus ycf29 ko:K02485,ko:K03413,ko:K07684 ko02020,ko02030,map02020,map02030 M00471,M00506 ko00000,ko00001,ko00002,ko02022,ko02035 Bacteria 1QUER@1224,1RWMA@1236,3Z16B@583,COG2197@1,COG2197@2 NA|NA|NA T cheY-homologous receiver domain Z1_02671 34506.g942 1.2e-168 599.0 Bilateria Metazoa 3AGWJ@33154,3BZG0@33208,3DF0R@33213,COG1208@1,KOG1322@2759 NA|NA|NA JM Nucleotidyl transferase Z1_02672 529507.PMI1489 1.4e-192 678.7 Proteus capI 5.1.3.6 ko:K08679 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R01385 RC00289 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU7J@1224,1RPTA@1236,3Z0XF@583,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA M Polysaccharide biosynthesis protein Z1_02673 529507.PMI1488 6.3e-56 223.4 Proteus hns GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003681,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032991,GO:0032993,GO:0042802,GO:0043565,GO:0043900,GO:0043901,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1900190,GO:1900191,GO:1900231,GO:1900232,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03746 ko00000,ko03036,ko03400 Bacteria 1R9YM@1224,1S24H@1236,3Z2P9@583,COG2916@1,COG2916@2 NA|NA|NA K Domain in histone-like proteins of HNS family Z1_02674 529507.PMI1487 1.6e-108 398.7 Proteus tdk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004797,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009120,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009157,GO:0009162,GO:0009165,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0018130,GO:0019136,GO:0019205,GO:0019206,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046104,GO:0046125,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0090304,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576,GO:1901657 2.7.1.21 ko:K00857 ko00240,ko00983,ko01100,map00240,map00983,map01100 R01567,R02099,R08233 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b1238,iBWG_1329.BWG_1065,iECDH10B_1368.ECDH10B_1298,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1176,iEcDH1_1363.EcDH1_2411,iJO1366.b1238,iJR904.b1238,iPC815.YPO2176,iY75_1357.Y75_RS06470 Bacteria 1NJR4@1224,1RPCK@1236,3Z204@583,COG1435@1,COG1435@2 NA|NA|NA F Thymidine kinase Z1_02675 529507.PMI1486 0.0 1736.9 Proteus adhE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004022,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006066,GO:0006067,GO:0006115,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008774,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016620,GO:0016903,GO:0016999,GO:0017000,GO:0017144,GO:0034308,GO:0034309,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046165,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 1.1.1.1,1.2.1.10 ko:K04072 ko00010,ko00071,ko00350,ko00620,ko00625,ko00626,ko00650,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01220,map00010,map00071,map00350,map00620,map00625,map00626,map00650,map01100,map01110,map01120,map01130,map01220 R00228,R00623,R00754,R01172,R04880,R05233,R05234,R06917,R06927 RC00004,RC00050,RC00088,RC00099,RC00116,RC00184,RC00649,RC01195 ko00000,ko00001,ko01000 iEcE24377_1341.EcE24377A_1389,iYL1228.KPN_02199 Bacteria 1MVPH@1224,1RNBH@1236,3Z12N@583,COG1012@1,COG1012@2,COG1454@1,COG1454@2 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_02676 529507.PMI1485 2.3e-108 398.3 Proteus ychE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K05595 ko00000,ko02000 2.A.95.1 Bacteria 1MX5T@1224,1RPZ3@1236,3Z2CS@583,COG2095@1,COG2095@2 NA|NA|NA U MarC family integral membrane protein Z1_02677 529507.PMI1484 7.6e-129 466.5 Proteus gsiA_3 ko:K02032 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1MUGH@1224,1RR8V@1236,3Z1UG@583,COG1124@1,COG1124@2 NA|NA|NA EP AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_02678 529507.PMI1483 6.1e-154 550.1 Proteus oppD 3.6.3.24 ko:K02031,ko:K02032,ko:K12371,ko:K15583,ko:K15587 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1NTNP@1224,1RPAS@1236,3Z2HC@583,COG0444@1,COG0444@2 NA|NA|NA EP ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_02679 529507.PMI1482 3.2e-147 527.7 Proteus yddQ ko:K02034,ko:K12370,ko:K15582,ko:K15586 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1MW3R@1224,1RMMR@1236,3Z1ZJ@583,COG1173@1,COG1173@2 NA|NA|NA P N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C Z1_02680 529507.PMI1481 3.5e-183 647.5 Proteus ddpB ko:K02033 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1MU8Z@1224,1RNAW@1236,3Z16R@583,COG0601@1,COG0601@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_02681 529507.PMI1480 4.6e-296 1023.1 Proteus ddpA ko:K02035 ko02024,map02024 M00239 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5 Bacteria 1MWR7@1224,1RQV4@1236,3Z18Q@583,COG0747@1,COG0747@2 NA|NA|NA E Extracellular solute-binding protein, family 5 Z1_02682 529507.PMI1479 0.0 1714.9 Proteus nirB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008942,GO:0009061,GO:0009344,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016491,GO:0016661,GO:0020037,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046857,GO:0046906,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050661,GO:0050662,GO:0051536,GO:0051540,GO:0055114,GO:0097159,GO:0098809,GO:1901265,GO:1901363 1.7.1.15 ko:K00362 ko00910,ko01120,map00910,map01120 M00530 R00787 RC00176 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_3849 Bacteria 1MW58@1224,1RNGY@1236,3Z3B0@583,COG1251@1,COG1251@2 NA|NA|NA C BFD-like [2Fe-2S] binding domain Z1_02683 529507.PMI1478 8.9e-56 222.6 Proteus nirD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008942,GO:0009061,GO:0009344,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016491,GO:0016661,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046857,GO:0055114,GO:0098809 1.7.1.15 ko:K00362,ko:K00363,ko:K05710 ko00360,ko00910,ko01120,ko01220,map00360,map00910,map01120,map01220 M00530,M00545 R00787,R06782,R06783 RC00098,RC00176 br01602,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_3772 Bacteria 1MZBY@1224,1S9F1@1236,3Z3FJ@583,COG2146@1,COG2146@2 NA|NA|NA P Rieske-like [2Fe-2S] domain Z1_02684 529507.PMI1477 5.2e-259 899.8 Proteus cysG GO:0003674,GO:0003824,GO:0004851,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006783,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008169,GO:0008757,GO:0009058,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018130,GO:0019354,GO:0019438,GO:0032259,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0042168,GO:0042440,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0046148,GO:0046156,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.3.1.76,2.1.1.107,2.1.1.131,3.7.1.12,4.2.1.75,4.99.1.3,4.99.1.4 ko:K02302,ko:K02303,ko:K02304,ko:K03795,ko:K13541,ko:K13542 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R02864,R03165,R03194,R03947,R05180,R05807,R05809,R07772 RC00003,RC00871,RC01012,RC01034,RC01293,RC01545,RC01861,RC02097,RC03471 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI1_1343.ECIAI1_3507,iECSE_1348.ECSE_3630,iEcE24377_1341.EcE24377A_3838,iJN746.PP_3999,iPC815.YPO0158 Bacteria 1MUI0@1224,1RM9V@1236,3Z38W@583,COG0007@1,COG0007@2,COG1648@1,COG1648@2 NA|NA|NA H Multifunctional enzyme that catalyzes the SAM-dependent methylations of uroporphyrinogen III at position C-2 and C-7 to form precorrin-2 via precorrin-1. Then it catalyzes the NAD- dependent ring dehydrogenation of precorrin-2 to yield sirohydrochlorin. Finally, it catalyzes the ferrochelation of sirohydrochlorin to yield siroheme Z1_02685 529507.PMI1476 0.0 1107.4 Proteus oppA2 ko:K02035,ko:K15580 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00439 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1P91R@1224,1RN57@1236,3Z17K@583,COG4166@1,COG4166@2 NA|NA|NA E Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_02686 529507.PMI1475 0.0 1110.1 Proteus oppA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006810,GO:0006857,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015833,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033218,GO:0042277,GO:0042597,GO:0042886,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061077,GO:0071702,GO:0071705,GO:1900750 ko:K02035,ko:K15580 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00439 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iECABU_c1320.ECABU_c15240,iECNA114_1301.ECNA114_1414,iECSF_1327.ECSF_1224,iNRG857_1313.NRG857_06385 Bacteria 1P91R@1224,1RN57@1236,3Z27R@583,COG4166@1,COG4166@2 NA|NA|NA E ABC transporter substrate-binding protein Z1_02687 529507.PMI1474 3e-162 577.8 Proteus oppB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008150,GO:0016020,GO:0022857,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K02033,ko:K15581 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00439 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1MU8Z@1224,1RNJ1@1236,3Z26G@583,COG0601@1,COG0601@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_02688 529507.PMI1473 4.8e-160 570.5 Proteus oppC ko:K02034,ko:K12370,ko:K15582,ko:K15586 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 Bacteria 1MU26@1224,1RND6@1236,3Z2DZ@583,COG1173@1,COG1173@2 NA|NA|NA P N-terminal TM domain of oligopeptide transport permease C Z1_02689 529507.PMI1472 1.4e-181 642.1 Proteus oppD GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008144,GO:0016020,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044464,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 3.6.3.24 ko:K02031,ko:K02032,ko:K02034,ko:K12371,ko:K15583,ko:K15587 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iECED1_1282.ECED1_1398,iLF82_1304.LF82_1573,iSBO_1134.SBO_1821 Bacteria 1R4KB@1224,1SMBI@1236,3Z2E1@583,COG0444@1,COG0444@2 NA|NA|NA P ABC transporter Z1_02690 529507.PMI1471 9.9e-191 672.5 Proteus oppF GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008144,GO:0016020,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044464,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 3.6.3.24 ko:K02032,ko:K10823,ko:K10824,ko:K12372 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00324,M00439,M00440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iAPECO1_1312.APECO1_362,iECOK1_1307.ECOK1_1402,iECS88_1305.ECS88_1315,iUMN146_1321.UM146_10835,iUTI89_1310.UTI89_C1445 Bacteria 1NU4K@1224,1SKPD@1236,3Z208@583,COG4608@1,COG4608@2 NA|NA|NA P ABC transporter ATP-binding Z1_02691 529507.PMI1470 6.6e-34 149.4 Proteus Bacteria 1QSY8@1224,1RWKB@1236,3Z3J8@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Cro/C1-type HTH DNA-binding domain Z1_02692 529507.PMI1469 3.6e-94 350.9 Proteus ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1QI7Y@1224,1S07V@1236,3Z37W@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02693 529507.PMI1468 4.2e-95 354.0 Proteus fimI ko:K07351 ko00000,ko02035 Bacteria 1Q00V@1224,1TBYR@1236,3Z3GP@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02694 529507.PMI1467 3.5e-123 447.6 Proteus sfmC ko:K07346,ko:K07353,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1R3T9@1224,1RS56@1236,3Z358@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_02695 529507.PMI1466 0.0 1729.9 Proteus elfC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005539,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008201,GO:0009279,GO:0009297,GO:0009987,GO:0015267,GO:0015288,GO:0015473,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022857,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043711,GO:0044085,GO:0044462,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097367,GO:1901681 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z3BU@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_02696 529507.PMI1465 8.3e-182 642.9 Proteus ko:K07350 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1QEC9@1224,1RV1S@1236,3Z3EJ@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02697 529507.PMI1464 1.4e-98 365.5 Proteus Bacteria 1Q00W@1224,1TBYS@1236,3Z39B@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02698 529507.PMI1463 1.7e-210 738.4 Proteus pat 2.6.1.9 ko:K00817 ko00340,ko00350,ko00360,ko00400,ko00401,ko00960,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00340,map00350,map00360,map00400,map00401,map00960,map01100,map01110,map01130,map01230 M00026 R00694,R00734,R03243 RC00006,RC00888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 Bacteria 1MW7I@1224,1RZAD@1236,3Z13G@583,COG0079@1,COG0079@2 NA|NA|NA M aminotransferase Z1_02699 529507.PMI1462 0.0 1312.7 Proteus betT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033554,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071944 ko:K02168 ko00000,ko02000 2.A.15.1.3,2.A.15.1.4 iAF1260.b0314,iB21_1397.B21_00273,iEC042_1314.EC042_0347,iEC55989_1330.EC55989_0316,iECBD_1354.ECBD_3344,iECB_1328.ECB_00270,iECDH10B_1368.ECDH10B_0301,iECD_1391.ECD_00270,iECH74115_1262.ECH74115_0376,iECIAI1_1343.ECIAI1_0311,iECO103_1326.ECO103_0291,iECO111_1330.ECO111_0348,iECO26_1355.ECO26_0348,iECSE_1348.ECSE_0335,iECSP_1301.ECSP_0369,iECUMN_1333.ECUMN_0352,iECW_1372.ECW_m0388,iECs_1301.ECs0360,iEKO11_1354.EKO11_3531,iEcDH1_1363.EcDH1_3292,iEcE24377_1341.EcE24377A_0331,iEcHS_1320.EcHS_A0373,iEcolC_1368.EcolC_3309,iG2583_1286.G2583_0418,iJO1366.b0314,iJR904.b0314,iUMNK88_1353.UMNK88_361,iWFL_1372.ECW_m0388,iY75_1357.Y75_RS01625,iZ_1308.Z0401 Bacteria 1MV0K@1224,1RP3E@1236,3Z2BA@583,COG1292@1,COG1292@2 NA|NA|NA M Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family Z1_02700 529507.PMI1461 6.9e-107 393.3 Proteus betI GO:0000976,GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02167 ko00000,ko03000 Bacteria 1MX72@1224,1RZBH@1236,3Z22I@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K HTH-type transcriptional regulator BetI Z1_02701 529507.PMI1460 2.5e-283 980.7 Proteus betB GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004029,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006578,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008802,GO:0009058,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0019285,GO:0019695,GO:0022607,GO:0031455,GO:0031456,GO:0034641,GO:0042133,GO:0042398,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0055114,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.2.1.8 ko:K00130 ko00260,ko01100,map00260,map01100 M00555 R02565,R02566 RC00080 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC042_1314.EC042_0345,iECOK1_1307.ECOK1_0306,iECS88_1305.ECS88_0320,iECSF_1327.ECSF_0290 Bacteria 1MU1V@1224,1RMBQ@1236,3Z0Z8@583,COG1012@1,COG1012@2 NA|NA|NA C Involved in the biosynthesis of the osmoprotectant glycine betaine. Catalyzes the reversible oxidation of betaine aldehyde to the corresponding acid Z1_02702 529507.PMI1459 0.0 1146.3 Proteus betA GO:0001505,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0006091,GO:0006113,GO:0006575,GO:0006577,GO:0006578,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008812,GO:0009058,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016614,GO:0019285,GO:0019695,GO:0031455,GO:0031456,GO:0034641,GO:0042133,GO:0042398,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0050896,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0097164,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.1.99.1 ko:K00108 ko00260,ko01100,map00260,map01100 M00555 R01025 RC00087 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1679,iECDH10B_1368.ECDH10B_0298,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0299,iECH74115_1262.ECH74115_0373,iECOK1_1307.ECOK1_0305,iECS88_1305.ECS88_0319,iECSP_1301.ECSP_0366,iECs_1301.ECs0357,iEcDH1_1363.EcDH1_3295,iEcolC_1368.EcolC_3312,iG2583_1286.G2583_0415,iJN746.PP_5064,iJO1366.b0311,iUMN146_1321.UM146_15745,iY75_1357.Y75_RS01610,iZ_1308.Z0398 Bacteria 1MV19@1224,1RMD2@1236,3Z1NN@583,COG2303@1,COG2303@2 NA|NA|NA C Involved in the biosynthesis of the osmoprotectant glycine betaine. Catalyzes the oxidation of choline to betaine aldehyde and betaine aldehyde to glycine betaine at the same rate Z1_02703 529507.PMI1458 7.6e-225 786.2 Proteus codB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K10974 ko00000,ko02000 2.A.39.1 iECW_1372.ECW_m0414,iEKO11_1354.EKO11_3506,iEcE24377_1341.EcE24377A_0360,iWFL_1372.ECW_m0414 Bacteria 1NS07@1224,1RNHG@1236,3Z20M@583,COG1457@1,COG1457@2 NA|NA|NA F Permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin Z1_02704 529507.PMI1457 1e-248 865.5 Proteus codA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004131,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006208,GO:0006209,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009112,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0019239,GO:0019439,GO:0019858,GO:0034641,GO:0035888,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044281,GO:0046113,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.5.4.1 ko:K01485 ko00240,ko00330,ko01100,map00240,map00330,map01100 R00974,R01411,R02922 RC00074,RC00514,RC00809 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_0343,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0368 Bacteria 1MX34@1224,1RMPF@1236,3Z1VD@583,COG0402@1,COG0402@2 NA|NA|NA F Amidohydrolase family Z1_02705 529507.PMI1456 2.7e-87 327.8 Proteus hit ko:K02503 ko00000,ko04147 Bacteria 1R7GK@1224,1S0R0@1236,3Z2UT@583,COG0537@1,COG0537@2 NA|NA|NA FG Diadenosine tetraphosphate Z1_02706 529507.PMI1455 7.9e-177 626.3 Proteus hemB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004655,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030312,GO:0033013,GO:0033014,GO:0034641,GO:0042168,GO:0042440,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.2.1.24 ko:K01698 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,map00860,map01100,map01110,map01120 M00121 R00036 RC00918,RC01781 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iECABU_c1320.ECABU_c04500,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0398,iJN746.PP_2913,ic_1306.c0477 Bacteria 1MWMW@1224,1RP6Q@1236,3Z1A5@583,COG0113@1,COG0113@2 NA|NA|NA H Delta-aminolevulinic acid dehydratase Z1_02707 529507.PMI1454 2.3e-57 228.0 Proteus Bacteria 1NJ6J@1224,1SJCN@1236,2DTEH@1,33K08@2,3Z2VQ@583 NA|NA|NA Z1_02708 529507.PMI1453 6.6e-31 139.4 Proteus yecF Bacteria 1N71V@1224,1SCS7@1236,2E5U3@1,330IE@2,3Z2Y4@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2594) Z1_02709 529507.PMI1452 4.1e-148 530.8 Proteus nnrD GO:0003674,GO:0003824,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016854,GO:0052855,GO:0052856,GO:0052857 4.2.1.136,5.1.99.6 ko:K17758,ko:K17759 ko00000,ko01000 Bacteria 1MU1Q@1224,1RMPS@1236,3Z1S5@583,COG0063@1,COG0063@2 NA|NA|NA H Catalyzes the dehydration of the S-form of NAD(P)HX at the expense of ADP, which is converted to AMP. Together with NAD(P)HX epimerase, which catalyzes the epimerization of the S- and R-forms, the enzyme allows the repair of both epimers of NAD(P)HX, a damaged form of NAD(P)H that is a result of enzymatic or heat-dependent hydration Z1_02710 529507.PMI1451 2.8e-70 271.2 Proteus uspF ko:K11932,ko:K14061 ko00000 Bacteria 1RA7K@1224,1S4FM@1236,3Z2IA@583,COG0589@1,COG0589@2 NA|NA|NA T Universal stress protein family Z1_02711 529507.PMI1450 6.9e-56 223.0 Proteus Bacteria 1N7HB@1224,1S6RP@1236,2E3V1@1,32YSA@2,3Z31F@583 NA|NA|NA Z1_02712 529507.PMI1449 7.5e-71 273.1 Proteus uspG GO:0003674,GO:0003824,GO:0004017,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009165,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0018117,GO:0018130,GO:0018175,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0032879,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036211,GO:0040012,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046777,GO:0046940,GO:0050145,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051270,GO:0055086,GO:0065007,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576,GO:2000145 ko:K11932,ko:K14061 ko00000 Bacteria 1RF44@1224,1S4Z0@1236,3Z2MA@583,COG0589@1,COG0589@2 NA|NA|NA T Universal stress protein family Z1_02713 529507.PMI1448 1.7e-122 445.3 Gammaproteobacteria yidX Bacteria 1RJVW@1224,1S89V@1236,2BBJI@1,3253A@2 NA|NA|NA Z1_02714 529507.PMI1447 1.7e-69 268.5 Proteus Bacteria 1NC0V@1224,1SF3E@1236,2E59A@1,3301M@2,3Z3G1@583 NA|NA|NA Z1_02715 529507.PMI1446 4.6e-210 736.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1MV1J@1224,1RZRR@1236,COG1106@1,COG1106@2 NA|NA|NA S AAA ATPase domain Z1_02716 529507.PMI1445 7.9e-114 416.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1RCQH@1224,1S254@1236,28PKE@1,2ZC9W@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4435) Z1_02717 529507.PMI1444 5e-145 520.4 Proteus yjjP GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0008150,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015744,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944 Bacteria 1NH2X@1224,1RN1Q@1236,3Z1BK@583,COG2966@1,COG2966@2 NA|NA|NA S Putative threonine/serine exporter Z1_02718 529507.PMI1443 2.5e-80 304.7 Proteus yjjB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0009628,GO:0010033,GO:0010243,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015744,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071944,GO:1901652,GO:1901698,GO:1901700 Bacteria 1RAWK@1224,1S2KX@1236,3Z2WS@583,COG3610@1,COG3610@2 NA|NA|NA S Threonine/Serine exporter, ThrE Z1_02719 529507.PMI1442 1.1e-23 115.2 Proteus Bacteria 1NJ2R@1224,1SI7N@1236,2ENAQ@1,33FYE@2,3Z344@583 NA|NA|NA Z1_02720 529507.PMI1441 9.9e-196 689.1 Proteus endA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016888,GO:0016893,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0042597,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 3.1.21.1 ko:K01150 ko00000,ko01000 Bacteria 1MXQM@1224,1RPX9@1236,3Z1UP@583,COG2356@1,COG2356@2 NA|NA|NA L Endonuclease I Z1_02721 529507.PMI1440 1.6e-81 308.5 Proteus Bacteria 1QG57@1224,1TDI1@1236,3Z30K@583,COG2020@1,COG2020@2 NA|NA|NA O methyltransferase activity Z1_02722 529507.PMI1439 3.9e-142 510.8 Proteus phoH GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008144,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044464,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 ko:K06217 ko00000 Bacteria 1PNF2@1224,1RNZ7@1236,3Z15Z@583,COG1702@1,COG1702@2 NA|NA|NA T AAA domain Z1_02723 529507.PMI1438 4.4e-67 260.4 Proteus Z012_06975 Bacteria 1MZJ4@1224,1SA1N@1236,3Z2Q2@583,COG3152@1,COG3152@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF805) Z1_02724 529507.PMI1437 1.7e-159 568.5 Proteus viuB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009237,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016722,GO:0016723,GO:0019536,GO:0019725,GO:0019748,GO:0030003,GO:0033212,GO:0034641,GO:0042592,GO:0043603,GO:0044237,GO:0046483,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051186,GO:0052851,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0098771,GO:1901360,GO:1901564 Bacteria 1R4TD@1224,1RY01@1236,3Z13E@583,COG2375@1,COG2375@2 NA|NA|NA P Siderophore-interacting FAD-binding domain Z1_02725 529507.PMI1436 4e-22 109.8 Proteus Bacteria 1NGXN@1224,1T8M3@1236,2DR70@1,33AGH@2,3Z343@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2474) Z1_02726 529507.PMI1435 1.2e-188 665.6 Proteus cioB 1.10.3.14 ko:K00426 ko00190,ko01100,ko02020,map00190,map01100,map02020 M00153 R11325 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.3 Bacteria 1MURP@1224,1RN0N@1236,3Z285@583,COG1294@1,COG1294@2 NA|NA|NA C Cytochrome bd terminal oxidase subunit II Z1_02727 529507.PMI1434 2.4e-253 880.9 Proteus cioA 1.10.3.14 ko:K00425 ko00190,ko01100,ko02020,map00190,map01100,map02020 M00153 R11325 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.3 Bacteria 1MV60@1224,1RN2U@1236,3Z234@583,COG1271@1,COG1271@2 NA|NA|NA C to quinol oxidase subunit I K00425 Z1_02728 529507.PMI1433 1e-270 938.7 Proteus ydcR GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 2.7.7.65 ko:K21023 ko02025,map02025 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MV6F@1224,1RMQ0@1236,3Z16Y@583,COG1167@1,COG1167@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor Z1_02729 529507.PMI1432 8.6e-105 386.3 Proteus Bacteria 1MWA1@1224,1T02P@1236,3Z347@583,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA P LysE type translocator Z1_02730 529507.PMI1431 5.6e-80 303.5 Proteus lrp_3 ko:K03719,ko:K05800 ko00000,ko03000,ko03036 Bacteria 1MX7R@1224,1RPGA@1236,3Z1GZ@583,COG1522@1,COG1522@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix ASNC type Z1_02731 529507.PMI1430 2.6e-146 524.6 Proteus hmuV 1.14.15.20,3.6.3.33,3.6.3.34 ko:K02013,ko:K06074,ko:K21480 ko00860,ko01100,ko01110,ko02010,map00860,map01100,map01110,map02010 M00240,M00241 R11579 RC01270 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.13,3.A.1.14 Bacteria 1RD7N@1224,1RPUV@1236,3Z2QB@583,COG4559@1,COG4559@2 NA|NA|NA P Hemin import ATP-binding protein HmuV Z1_02732 529507.PMI1429 1.5e-175 622.1 Proteus hmuU GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02015 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MV9W@1224,1RMDF@1236,3Z0Z7@583,COG0609@1,COG0609@2 NA|NA|NA P FecCD transport family Z1_02733 529507.PMI1428 3.6e-143 514.2 Proteus hmuT ko:K02016 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1QTSV@1224,1RNCT@1236,3Z1CQ@583,COG4558@1,COG4558@2 NA|NA|NA P Periplasmic binding protein Z1_02734 529507.PMI1427 5.3e-195 686.8 Proteus hmuS ko:K02016,ko:K07225 ko02010,map02010 M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.14 Bacteria 1MW28@1224,1RP3D@1236,3Z3C2@583,COG3720@1,COG3720@2 NA|NA|NA P Haemin-degrading HemS.ChuX domain Z1_02735 529507.PMI1426 0.0 1364.4 Proteus hmuR ko:K16087 ko00000,ko02000 1.B.14.2 Bacteria 1MX42@1224,1RQ2K@1236,3Z13C@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA P Psort location OuterMembrane, score 9.92 Z1_02736 529507.PMI1425 0.0 1483.4 Proteus hxuC ko:K16087 ko00000,ko02000 1.B.14.2 Bacteria 1MX42@1224,1RQ2K@1236,3Z10N@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA P receptor Z1_02737 529507.PMI1424 7.1e-25 119.4 Bacteria hemP Bacteria COG4256@1,COG4256@2 NA|NA|NA P Hemin uptake protein Z1_02738 529507.PMI1423 2.4e-195 688.0 Proteus aroH GO:0003674,GO:0003824,GO:0003849,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019438,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.54 ko:K01626 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024 M00022 R01826 RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSbBS512_1146.SbBS512_E1908 Bacteria 1MU5Q@1224,1RMAA@1236,3Z0ZQ@583,COG0722@1,COG0722@2 NA|NA|NA E Stereospecific condensation of phosphoenolpyruvate (PEP) and D-erythrose-4-phosphate (E4P) giving rise to 3-deoxy-D- arabino-heptulosonate-7-phosphate (DAHP) Z1_02739 529507.PMI1422 2.8e-157 561.2 Proteus ydiA GO:0003674,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0030234,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0098772 2.7.11.33,2.7.4.28 ko:K09773 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUHU@1224,1RPHX@1236,3Z1FT@583,COG1806@1,COG1806@2 NA|NA|NA H Bifunctional serine threonine kinase and phosphorylase involved in the regulation of the phosphoenolpyruvate synthase (PEPS) by catalyzing its phosphorylation dephosphorylation Z1_02740 529507.PMI1421 0.0 1562.4 Proteus ppsA GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006094,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008986,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016781,GO:0019318,GO:0019319,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046364,GO:0046872,GO:0071704,GO:1901576 2.7.9.2 ko:K01007 ko00620,ko00680,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00620,map00680,map00720,map01100,map01120,map01200 M00173,M00374 R00199 RC00002,RC00015 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEcE24377_1341.EcE24377A_1919,iYL1228.KPN_02160 Bacteria 1MU0R@1224,1RP3T@1236,3Z268@583,COG0574@1,COG0574@2,COG1080@1,COG1080@2 NA|NA|NA H Phosphoenolpyruvate synthase Z1_02741 529507.PMI1420 3.6e-194 684.1 Proteus ydiK GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K03548 ko00000,ko02000 2.A.86.1 Bacteria 1MVX7@1224,1RNN1@1236,3Z1F0@583,COG0628@1,COG0628@2 NA|NA|NA S AI-2E family transporter Z1_02742 529507.PMI1419 0.0 2035.4 Proteus ydiJ GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363 Bacteria 1MU6Y@1224,1RQX2@1236,3Z15E@583,COG0247@1,COG0247@2,COG0277@1,COG0277@2 NA|NA|NA C FAD linked oxidase, C-terminal domain protein Z1_02743 529507.PMI1418 1.3e-72 278.9 Proteus menI GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009233,GO:0009234,GO:0009237,GO:0009238,GO:0009239,GO:0009712,GO:0009713,GO:0009987,GO:0016289,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0018130,GO:0018958,GO:0019184,GO:0019290,GO:0019438,GO:0019540,GO:0019748,GO:0034641,GO:0042180,GO:0042181,GO:0042802,GO:0043043,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044550,GO:0046189,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0061522,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1901661,GO:1901663 3.1.2.28 ko:K19222 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00116 R07262 RC00004,RC00174 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1RGVP@1224,1S5WY@1236,3Z2RF@583,COG2050@1,COG2050@2 NA|NA|NA Q Thioesterase superfamily Z1_02744 529507.PMI1417 3e-110 404.4 Proteus Bacteria 1QCPV@1224,1T8FQ@1236,2BHZK@1,32C45@2,3Z2T4@583 NA|NA|NA Z1_02745 529507.PMI1416 2.3e-65 254.6 Proteus sufA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005506,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008198,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016226,GO:0019538,GO:0022607,GO:0031163,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540,GO:0051604,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097428,GO:1901564 ko:K05997,ko:K13628 ko00000,ko03016 Bacteria 1RH6T@1224,1S5XD@1236,3Z2MQ@583,COG0316@1,COG0316@2 NA|NA|NA S Iron-sulphur cluster biosynthesis Z1_02746 529507.PMI1415 6.6e-292 1009.2 Proteus sufB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009536,GO:0009842,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0022607,GO:0031163,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051539,GO:0051540,GO:0071840 ko:K07033,ko:K09014 ko00000 iAPECO1_1312.APECO1_760,iECH74115_1262.ECH74115_2397,iECSF_1327.ECSF_1543,iECSP_1301.ECSP_2250,iUTI89_1310.UTI89_C1875,ic_1306.c2078 Bacteria 1MVKY@1224,1RQ65@1236,3Z1WK@583,COG0719@1,COG0719@2 NA|NA|NA O Uncharacterized protein family (UPF0051) Z1_02747 529507.PMI1414 3e-136 491.1 Proteus sufC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006790,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0022607,GO:0031163,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051186,GO:0071840 ko:K09013 ko00000,ko02000 iECH74115_1262.ECH74115_2396,iECIAI1_1343.ECIAI1_1734,iECIAI39_1322.ECIAI39_1376,iECSP_1301.ECSP_2249,iECs_1301.ECs2389,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1514,iG2583_1286.G2583_2077,iSFV_1184.SFV_1705,iSFxv_1172.SFxv_1919,iSSON_1240.SSON_1474,iS_1188.S1844,iZ_1308.Z2710 Bacteria 1MUGK@1224,1RPFE@1236,3Z25M@583,COG0396@1,COG0396@2 NA|NA|NA O ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_02748 529507.PMI1413 1.3e-246 858.6 Proteus sufD GO:0006790,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0022607,GO:0031163,GO:0040007,GO:0043207,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044403,GO:0044419,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0052173,GO:0052200,GO:0052564,GO:0052572,GO:0071840,GO:0075136 ko:K07033,ko:K09015 ko00000 iB21_1397.B21_01640,iECBD_1354.ECBD_1964,iECB_1328.ECB_01650,iECD_1391.ECD_01650,iUMNK88_1353.UMNK88_2144 Bacteria 1MVK0@1224,1RP2A@1236,3Z14Q@583,COG0719@1,COG0719@2 NA|NA|NA O Uncharacterized protein family (UPF0051) Z1_02749 529507.PMI1412 3.2e-239 833.9 Proteus sufS GO:0001887,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006464,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009000,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016226,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019538,GO:0019842,GO:0022607,GO:0030170,GO:0031071,GO:0031162,GO:0031163,GO:0036094,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0070279,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564 2.8.1.7,4.4.1.16 ko:K01766,ko:K11717 ko00450,ko01100,map00450,map01100 R03599,R11528 RC00961,RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_757,iEC55989_1330.EC55989_1847,iECED1_1282.ECED1_1879,iECO111_1330.ECO111_2149,iECO26_1355.ECO26_2408,iECOK1_1307.ECOK1_1800,iECS88_1305.ECS88_1730,iECW_1372.ECW_m1847,iEKO11_1354.EKO11_2095,iUMN146_1321.UM146_08755,iUTI89_1310.UTI89_C1872,iWFL_1372.ECW_m1847 Bacteria 1MUPD@1224,1RNIY@1236,3Z191@583,COG0520@1,COG0520@2 NA|NA|NA H Cysteine desulfurases mobilize the sulfur from L- cysteine to yield L-alanine, an essential step in sulfur metabolism for biosynthesis of a variety of sulfur-containing biomolecules. Component of the suf operon, which is activated and required under specific conditions such as oxidative stress and iron limitation. Acts as a potent selenocysteine lyase in vitro, that mobilizes selenium from L-selenocysteine. Selenocysteine lyase activity is however unsure in vivo Z1_02750 529507.PMI1411 5.5e-74 283.5 Proteus sufE GO:0003674,GO:0006464,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0030234,GO:0031162,GO:0031163,GO:0036211,GO:0043085,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0050790,GO:0050896,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097163,GO:0098772,GO:0140104,GO:1901564 2.8.1.7,4.4.1.16 ko:K02426,ko:K11717 ko00450,ko01100,map00450,map01100 R03599,R11528 RC00961,RC01789,RC02313 ko00000,ko00001,ko01000 iSBO_1134.SBO_1451,iSFV_1184.SFV_1702,iSF_1195.SF1708,iSFxv_1172.SFxv_1916,iS_1188.S1841,iSbBS512_1146.SbBS512_E1880 Bacteria 1RI8F@1224,1S65C@1236,3Z2ND@583,COG2166@1,COG2166@2 NA|NA|NA S Fe-S metabolism associated domain Z1_02751 529507.PMI1410 1.1e-172 612.5 Proteus ycfS GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008234,GO:0008236,GO:0008238,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016755,GO:0016787,GO:0016807,GO:0017171,GO:0018104,GO:0019538,GO:0030203,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043164,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0070004,GO:0070008,GO:0070011,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071972,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K16291,ko:K19234,ko:K19235,ko:K19236 ko01503,map01503 ko00000,ko00001,ko01002,ko01011 Bacteria 1MVYT@1224,1RMNC@1236,3Z1VT@583,COG1376@1,COG1376@2 NA|NA|NA S L,D-transpeptidase catalytic domain Z1_02752 529507.PMI1409 2.7e-22 110.9 Proteus yajI ko:K06078 ko00000,ko01011 Bacteria 1MZCW@1224,1S8YB@1236,3Z2Y6@583,COG4238@1,COG4238@2 NA|NA|NA M Lipoprotein leucine-zipper Z1_02753 529507.PMI1408 4.2e-112 410.6 Proteus cbh 3.5.1.24 ko:K01442 ko00120,ko00121,ko01100,map00120,map00121,map01100 R02797,R03975,R03977,R04486,R04487,R05835 RC00090,RC00096 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N4JD@1224,1RZ9V@1236,3Z1XR@583,COG3049@1,COG3049@2 NA|NA|NA M Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family Z1_02754 529507.PMI1408 3.1e-80 304.3 Proteus cbh 3.5.1.24 ko:K01442 ko00120,ko00121,ko01100,map00120,map00121,map01100 R02797,R03975,R03977,R04486,R04487,R05835 RC00090,RC00096 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N4JD@1224,1RZ9V@1236,3Z1XR@583,COG3049@1,COG3049@2 NA|NA|NA M Linear amide C-N hydrolases, choloylglycine hydrolase family Z1_02755 529507.PMI1407 6.6e-278 962.6 Proteus gadB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004351,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006807,GO:0006873,GO:0006885,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009064,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0019725,GO:0019752,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030641,GO:0042592,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0045852,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051453,GO:0051454,GO:0055067,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0098771,GO:1901564,GO:1901605 4.1.1.15 ko:K01580 ko00250,ko00410,ko00430,ko00650,ko01100,ko01110,ko01120,ko02024,ko04727,ko04940,map00250,map00410,map00430,map00650,map01100,map01110,map01120,map02024,map04727,map04940 M00027 R00261,R00489,R01682,R02466 RC00299 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MX25@1224,1RNSQ@1236,3Z3DV@583,COG0076@1,COG0076@2 NA|NA|NA E Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain Z1_02756 34506.g727 1.8e-279 968.0 Eukaryota GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015174,GO:0015179,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039,GO:1990822 Eukaryota COG0531@1,KOG1286@2759 NA|NA|NA E amino acid transport Z1_02757 529507.PMI1405 3.7e-260 903.7 Proteus pyk GO:0001871,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004743,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006116,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006734,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009986,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019674,GO:0019693,GO:0019752,GO:0022607,GO:0030246,GO:0030247,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042802,GO:0042866,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0055086,GO:0055114,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:2001065 2.7.1.40,2.7.7.4 ko:K00873,ko:K00958 ko00010,ko00230,ko00261,ko00450,ko00620,ko00920,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04922,ko04930,ko05165,ko05203,ko05230,map00010,map00230,map00261,map00450,map00620,map00920,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04922,map04930,map05165,map05203,map05230 M00001,M00002,M00049,M00050,M00176,M00596 R00200,R00430,R00529,R01138,R01858,R02320,R04929 RC00002,RC00015,RC02809,RC02889 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 iECO103_1326.ECO103_1819,iPC815.YPO2393 Bacteria 1MU21@1224,1RMW3@1236,3Z0WT@583,COG0469@1,COG0469@2 NA|NA|NA G Belongs to the pyruvate kinase family Z1_02760 529507.PMI1404 4.2e-253 880.2 Proteus mdtK GO:0000302,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0006857,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015238,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034614,GO:0035442,GO:0035672,GO:0035673,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042887,GO:0042891,GO:0042895,GO:0042938,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0070887,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071916,GO:0071944,GO:1901700,GO:1901701,GO:1904680 ko:K03327 ko00000,ko02000 2.A.66.1 Bacteria 1MUAM@1224,1RP5M@1236,3Z1NA@583,COG0534@1,COG0534@2 NA|NA|NA P Multidrug efflux pump that functions probably as a Na( ) drug antiporter Z1_02761 529507.PMI1403 5.5e-118 430.3 Proteus ribE GO:0003674,GO:0003824,GO:0004746,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016765,GO:0017144,GO:0018130,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042726,GO:0042727,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.9 ko:K00793 ko00740,ko01100,ko01110,map00740,map01100,map01110 M00125 R00066 RC00958,RC00960 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c19160,iECP_1309.ECP_1609,ic_1306.c2056 Bacteria 1MUMB@1224,1RMSY@1236,3Z0XQ@583,COG0307@1,COG0307@2 NA|NA|NA H Lumazine binding domain Z1_02762 529507.PMI1402 1e-231 808.9 Proteus cfa 2.1.1.317,2.1.1.79 ko:K00574,ko:K20238 ko00000,ko01000 Bacteria 1MX3U@1224,1RNID@1236,3Z0VN@583,COG2230@1,COG2230@2 NA|NA|NA M Mycolic acid cyclopropane synthetase Z1_02763 529507.PMI1401 3.6e-219 767.3 Proteus ydhC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1N196@1224,1RPMD@1236,3Z26C@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator superfamily Z1_02764 529507.PMI1400 5e-178 630.2 Proteus ydhB ko:K10972 ko00000,ko03000 Bacteria 1P293@1224,1RPK0@1236,3Z17F@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02765 529507.PMI1399 5.7e-194 683.3 Proteus purR GO:0001130,GO:0001131,GO:0001141,GO:0001217,GO:0002054,GO:0002057,GO:0002060,GO:0003674,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006140,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010563,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0030808,GO:0030809,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0036094,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0045936,GO:0045980,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051174,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0062012,GO:0062014,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1900371,GO:1900372,GO:1900542,GO:1900543,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02529,ko:K03604 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVUR@1224,1RN2K@1236,3Z11K@583,COG1609@1,COG1609@2 NA|NA|NA K Is the main repressor of the genes involved in the de novo synthesis of purine nucleotides, regulating purB, purC, purEK, purF, purHD, purL, purMN and guaBA expression. PurR is allosterically activated to bind its cognate DNA by binding the purine corepressors, hypoxanthine or guanine, thereby effecting transcription repression Z1_02766 529507.PMI1397 1.2e-108 399.1 Proteus sodB GO:0000302,GO:0000303,GO:0000305,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004784,GO:0006801,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010035,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016721,GO:0019430,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034614,GO:0042221,GO:0044237,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071450,GO:0071451,GO:0072593,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901700,GO:1901701,GO:1990748 1.15.1.1,3.1.11.6 ko:K03601,ko:K04564 ko03430,ko04013,ko04068,ko04146,ko04211,ko04212,ko04213,ko05016,map03430,map04013,map04068,map04146,map04211,map04212,map04213,map05016 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVW2@1224,1RP7X@1236,3Z1N0@583,COG0605@1,COG0605@2 NA|NA|NA C Destroys radicals which are normally produced within the cells and which are toxic to biological systems Z1_02767 529507.PMI1396 1.7e-140 505.4 Proteus Z012_10580 ko:K07090 ko00000 Bacteria 1R3V4@1224,1RVNC@1236,3Z15C@583,COG0730@1,COG0730@2 NA|NA|NA S Sulfite exporter TauE/SafE Z1_02769 1280001.BAOA01000022_gene560 4.9e-62 244.2 Vibrionales VPA1299 Bacteria 1RJDN@1224,1S8GI@1236,1XXA9@135623,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K COG1309 Transcriptional regulator Z1_02770 471881.PROPEN_04238 2e-94 351.7 Gammaproteobacteria FolA Bacteria 1RH02@1224,1S2UN@1236,COG0262@1,COG0262@2 NA|NA|NA H dihydrofolate reductase Z1_02771 529507.PMI1394 2.5e-58 231.1 Proteus grxD GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051540 ko:K07390 ko00000,ko03029,ko03110 iPC815.YPO2383,iYL1228.KPN_01992 Bacteria 1MZ4V@1224,1S640@1236,3Z2Q8@583,COG0278@1,COG0278@2 NA|NA|NA C Glutaredoxin Z1_02772 529507.PMI1393 4.7e-122 443.7 Proteus rnt GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004540,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0031123,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042780,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043628,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0140098,GO:1901360 ko:K03683 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUPK@1224,1RMMH@1236,3Z0X4@583,COG0847@1,COG0847@2 NA|NA|NA L Trims short 3' overhangs of a variety of RNA species, leaving a one or two nucleotide 3' overhang. Responsible for the end-turnover of tRNA specifically removes the terminal AMP residue from uncharged tRNA (tRNA-C-C-A). Also appears to be involved in tRNA biosynthesis Z1_02773 529507.PMI1392 5e-69 266.9 Proteus gloA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004462,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006518,GO:0006575,GO:0006749,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016151,GO:0016829,GO:0016846,GO:0019243,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046185,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901575,GO:1901615 4.4.1.5 ko:K01759 ko00620,map00620 R02530 RC00004,RC00740 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_733,iECABU_c1320.ECABU_c19040,iECED1_1282.ECED1_1851,iECNA114_1301.ECNA114_1699,iECOK1_1307.ECOK1_1770,iECP_1309.ECP_1597,iECS88_1305.ECS88_1700,iECSF_1327.ECSF_1514,iLF82_1304.LF82_0861,iNRG857_1313.NRG857_08275,iUMN146_1321.UM146_08895,iUTI89_1310.UTI89_C1842,ic_1306.c2044 Bacteria 1RCYX@1224,1S1Z9@1236,3Z2K7@583,COG0346@1,COG0346@2 NA|NA|NA H Catalyzes the conversion of hemimercaptal, formed from methylglyoxal and glutathione, to S-lactoylglutathione Z1_02774 529507.PMI1391 1.3e-37 161.8 Proteus ydhL ko:K06938 ko00000 Bacteria 1NGD5@1224,1SCBM@1236,3Z2Y0@583,COG3313@1,COG3313@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1289) Z1_02775 529507.PMI1390 1.5e-71 275.4 Proteus slyA GO:0001067,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031333,GO:0031334,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044212,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000142,GO:2000143,GO:2000144,GO:2001141 ko:K06075 ko00000,ko03000 Bacteria 1N78T@1224,1S26B@1236,3Z2MI@583,COG1846@1,COG1846@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein Z1_02776 529507.PMI1389 9.6e-56 223.0 Proteus slyB GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K06077 ko00000 Bacteria 1RA1D@1224,1S202@1236,3Z2MU@583,COG3133@1,COG3133@2 NA|NA|NA M Glycine zipper 2TM domain Z1_02777 529507.PMI1388 9.2e-214 749.2 Proteus anmK GO:0003674,GO:0003824,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0044237 2.7.1.170,4.2.1.126 ko:K07106,ko:K09001 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R08555 RC00397,RC00746 ko00000,ko00001,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c18930,iECED1_1282.ECED1_1841,ic_1306.c2032 Bacteria 1MV4E@1224,1RNTZ@1236,3Z28R@583,COG2377@1,COG2377@2 NA|NA|NA F Catalyzes the specific phosphorylation of 1,6-anhydro-N- acetylmuramic acid (anhMurNAc) with the simultaneous cleavage of the 1,6-anhydro ring, generating MurNAc-6-P. Is required for the utilization of anhMurNAc either imported from the medium or derived from its own cell wall murein, and thus plays a role in cell wall recycling Z1_02778 529507.PMI1387 2.7e-125 454.5 Proteus pdxH GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004733,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008614,GO:0008615,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009443,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016491,GO:0016638,GO:0016641,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019842,GO:0032553,GO:0032991,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042301,GO:0042364,GO:0042802,GO:0042803,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046483,GO:0046983,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617,GO:1902444 1.4.3.5 ko:K00275 ko00750,ko01100,ko01120,map00750,map01100,map01120 M00124 R00277,R00278,R01710,R01711 RC00048,RC00116 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1NZUU@1224,1RMQ2@1236,3Z2I8@583,COG0259@1,COG0259@2 NA|NA|NA H pyridoxamine 5'-phosphate oxidase Z1_02779 529507.PMI1386 4e-245 853.6 Proteus tyrS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004831,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006437,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.1 ko:K01866 ko00970,map00970 M00359,M00360 R02918 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016,ko03029 iAF1260.b1637,iBWG_1329.BWG_1452,iECDH10B_1368.ECDH10B_1771,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1581,iECH74115_1262.ECH74115_2349,iECIAI39_1322.ECIAI39_1418,iECNA114_1301.ECNA114_1685,iECO103_1326.ECO103_1778,iECO111_1330.ECO111_2107,iECO26_1355.ECO26_2366,iECSE_1348.ECSE_1760,iECSF_1327.ECSF_1500,iECSP_1301.ECSP_2202,iECUMN_1333.ECUMN_1928,iECW_1372.ECW_m1805,iECs_1301.ECs2346,iEKO11_1354.EKO11_2137,iETEC_1333.ETEC_1672,iEcDH1_1363.EcDH1_2003,iEcE24377_1341.EcE24377A_1847,iEcHS_1320.EcHS_A1713,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1562,iEcolC_1368.EcolC_1992,iJO1366.b1637,iSFV_1184.SFV_1654,iSF_1195.SF1662,iSSON_1240.SSON_1519,iSbBS512_1146.SbBS512_E1829,iUMNK88_1353.UMNK88_2097,iWFL_1372.ECW_m1805,iY75_1357.Y75_RS08585 Bacteria 1MVUQ@1224,1RPKC@1236,3Z2G8@583,COG0162@1,COG0162@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of tyrosine to tRNA(Tyr) in a two-step reaction tyrosine is first activated by ATP to form Tyr- AMP and then transferred to the acceptor end of tRNA(Tyr) Z1_02780 529507.PMI1385 9.5e-166 589.3 Proteus pdxY GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008478,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009443,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042802,GO:0042816,GO:0042817,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043094,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 2.7.1.35 ko:K00868 ko00750,ko01100,map00750,map01100 R00174,R01909,R02493 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_1723 Bacteria 1MVC9@1224,1RMIE@1236,3Z0V6@583,COG2240@1,COG2240@2 NA|NA|NA H Pyridoxal kinase involved in the salvage pathway of pyridoxal 5'-phosphate (PLP). Catalyzes the phosphorylation of pyridoxal to PLP Z1_02781 529507.PMI1384 8.5e-113 412.9 Proteus gst GO:0000302,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004364,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009636,GO:0010035,GO:0016740,GO:0016765,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042542,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:1901700 2.5.1.18 ko:K00799 ko00480,ko00980,ko00982,ko00983,ko01524,ko05200,ko05204,ko05225,ko05418,map00480,map00980,map00982,map00983,map01524,map05200,map05204,map05225,map05418 R03522,R07002,R07003,R07004,R07023,R07024,R07025,R07026,R07069,R07070,R07083,R07084,R07091,R07092,R07093,R07094,R07100,R07113,R07116,R08280,R09409,R11905 RC00004,RC00069,RC00840,RC00948,RC01704,RC01705,RC01706,RC01758,RC01759,RC01765,RC01767,RC01769,RC02243,RC02527,RC02939,RC02940,RC02942,RC02943,RC02944 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 1.A.12.2.2,1.A.12.3.2 Bacteria 1MY47@1224,1RRI3@1236,3Z22N@583,COG0625@1,COG0625@2 NA|NA|NA H Glutathione S-transferase, C-terminal domain Z1_02782 529507.PMI1383 4.6e-143 513.8 Proteus fabI GO:0003674,GO:0003824,GO:0004312,GO:0004318,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016628,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0022607,GO:0030497,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0055114,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072330,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.3.1.10,1.3.1.9 ko:K00208 ko00061,ko00333,ko00780,ko01100,ko01130,ko01212,map00061,map00333,map00780,map01100,map01130,map01212 M00083,M00572 R01404,R04429,R04430,R04724,R04725,R04955,R04956,R04958,R04959,R04961,R04962,R04966,R04967,R04969,R04970,R07765,R10118,R10122,R11671 RC00052,RC00076,RC00120 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iECUMN_1333.ECUMN_1592 Bacteria 1MV05@1224,1RNMW@1236,3Z1IF@583,COG0623@1,COG0623@2 NA|NA|NA I Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase Z1_02783 529507.PMI1382 3.5e-146 524.2 Proteus sapF GO:0000166,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015489,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0017076,GO:0022857,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034220,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0072488,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098655,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902047 ko:K19230 ko01503,ko02010,map01503,map02010 M00739 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5.5 Bacteria 1MU09@1224,1RMEI@1236,3Z0UV@583,COG1123@1,COG4172@2 NA|NA|NA P ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_02784 529507.PMI1381 2.3e-192 677.9 Proteus sapD GO:0000166,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015489,GO:0015672,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0017076,GO:0022857,GO:0030001,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034220,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071804,GO:0071805,GO:0072488,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902047 ko:K19229 ko01503,ko02010,map01503,map02010 M00739 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5.5 iYL1228.KPN_01288 Bacteria 1MU09@1224,1RMEI@1236,3Z36D@583,COG1123@1,COG4172@2 NA|NA|NA P dipeptide ABC transporter, ATP-binding Z1_02785 529507.PMI1380 1.3e-141 509.2 Proteus sapC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015489,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098655,GO:1902047 ko:K19228 ko01503,ko02010,map01503,map02010 M00739 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5.5 Bacteria 1QUAT@1224,1T1RQ@1236,3Z1Q4@583,COG4171@1,COG4171@2 NA|NA|NA V Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_02786 529507.PMI1379 1.1e-170 605.9 Proteus sapB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015489,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098655,GO:1902047 ko:K19227 ko01503,ko02010,map01503,map02010 M00739 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5.5 Bacteria 1QUAU@1224,1T1RR@1236,3Z0WM@583,COG4168@1,COG4168@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_02787 34506.g704 0.0 1130.2 Rhabditida Nematoda 1M8NR@119089,39PPU@33154,3CQX2@33208,3E73M@33213,40RIM@6231,4157U@6236,COG1132@1,KOG0058@2759 NA|NA|NA T Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_02788 34506.g703 1.6e-188 665.2 Bilateria Metazoa 2D1W3@1,2SJH7@2759,3AH8V@33154,3BWT4@33208,3DEV7@33213 NA|NA|NA S Bacterial regulatory protein, Fis family Z1_02789 529507.PMI1376 3.7e-109 401.0 Proteus pspA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005543,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006355,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008289,GO:0009266,GO:0009271,GO:0009408,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009898,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016020,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031234,GO:0031323,GO:0031326,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043207,GO:0043433,GO:0044092,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048519,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051090,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051704,GO:0051707,GO:0060187,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098552,GO:0098562,GO:0098586,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03969 ko00000 Bacteria 1NC7S@1224,1RS0G@1236,3Z2S4@583,COG1842@1,COG1842@2 NA|NA|NA KT PspA/IM30 family Z1_02790 529507.PMI1375 6.6e-34 149.4 Proteus pspB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03970 ko00000,ko02048 Bacteria 1N769@1224,1SCNV@1236,2CJWQ@1,32YI2@2,3Z2Y7@583 NA|NA|NA S Phage shock protein B Z1_02791 529507.PMI1374 7.3e-56 223.0 Proteus pspC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0016020,GO:0019222,GO:0044464,GO:0048518,GO:0050789,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071944 ko:K03973 ko00000,ko02048,ko03000 Bacteria 1N085@1224,1S98J@1236,3Z3FT@583,COG1983@1,COG1983@2 NA|NA|NA KT PspC domain Z1_02792 529507.PMI1373 6.4e-38 162.9 Proteus pspD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009271,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0016020,GO:0043207,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051707,GO:0071944,GO:0098586 ko:K03971 ko00000 Bacteria 1N8V6@1224,1SGH4@1236,2C1SN@1,32YQQ@2,3Z317@583 NA|NA|NA S Phage shock protein PspD (Phageshock_PspD) Z1_02793 529507.PMI1372 1.3e-270 938.3 Proteus ycjX ko:K06918 ko00000 Bacteria 1MX6E@1224,1RQ05@1236,3Z1KQ@583,COG3106@1,COG3106@2 NA|NA|NA S YcjX-like family, DUF463 Z1_02794 529507.PMI1371 1.2e-191 675.6 Proteus ycjF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K06883,ko:K08990 ko00000 Bacteria 1MU8S@1224,1RND9@1236,3Z1Q3@583,COG3768@1,COG3768@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF697) Z1_02795 529507.PMI1370 2.5e-71 274.6 Proteus Bacteria 1QCUD@1224,1T8MI@1236,29E10@1,300YZ@2,3Z34U@583 NA|NA|NA Z1_02796 529507.PMI1369 1.1e-300 1038.5 Proteus tyrR GO:0000166,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0017076,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03721 ko00000,ko03000 Bacteria 1QTS3@1224,1RNAI@1236,3Z196@583,COG3283@1,COG3283@2 NA|NA|NA K PAS domain Z1_02797 529507.PMI1368 1.1e-86 325.9 Proteus tpx GO:0003674,GO:0003824,GO:0004601,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008379,GO:0009405,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015036,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0016684,GO:0019725,GO:0020012,GO:0030312,GO:0030682,GO:0032843,GO:0033554,GO:0034599,GO:0042221,GO:0042592,GO:0043207,GO:0044403,GO:0044413,GO:0044415,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045454,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051409,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051805,GO:0051807,GO:0051832,GO:0051834,GO:0051920,GO:0052060,GO:0052173,GO:0052200,GO:0052376,GO:0052551,GO:0052564,GO:0052565,GO:0052572,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0071944,GO:0075136,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1990748 1.11.1.15 ko:K11065 ko00000,ko01000 Bacteria 1RAJ9@1224,1S263@1236,3Z146@583,COG2077@1,COG2077@2 NA|NA|NA O Thiol-specific peroxidase that catalyzes the reduction of hydrogen peroxide and organic hydroperoxides to water and alcohols, respectively. Plays a role in cell protection against oxidative stress by detoxifying peroxides Z1_02798 529507.PMI1367 0.0 1090.9 Proteus mppA GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006857,GO:0008150,GO:0015833,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0042886,GO:0042939,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705 ko:K02035,ko:K15580 ko01501,ko02010,ko02024,map01501,map02010,map02024 M00239,M00439 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.5,3.A.1.5.1,3.A.1.5.18,3.A.1.5.19,3.A.1.5.25 iUMNK88_1353.UMNK88_1667 Bacteria 1P91R@1224,1RN57@1236,3Z256@583,COG4166@1,COG4166@2 NA|NA|NA E Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle Z1_02799 529507.PMI1366 4.5e-100 370.5 Proteus ko:K16078 ko00000,ko02000 1.B.6.2.2 Bacteria 1PBVN@1224,1T8GR@1236,3Z2V8@583,COG3637@1,COG3637@2 NA|NA|NA M Outer membrane protein beta-barrel domain Z1_02800 529507.PMI1365 2.8e-57 227.6 Proteus ko:K09712 ko00000 Bacteria 1N6JT@1224,1SC04@1236,3Z2W8@583,COG3042@1,COG3042@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4377) Z1_02801 529507.PMI1364 2.6e-180 637.9 Proteus zntB GO:0000041,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005385,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006829,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015318,GO:0015562,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0022883,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046583,GO:0046873,GO:0046915,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070838,GO:0071577,GO:0071944,GO:0072509,GO:0072511,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K03284,ko:K16074 ko00000,ko02000 1.A.35.1,1.A.35.3,1.A.35.4 Bacteria 1MW8W@1224,1RRTZ@1236,3Z16V@583,COG0598@1,COG0598@2 NA|NA|NA P CorA-like Mg2+ transporter protein Z1_02802 529507.PMI1363 5.3e-175 620.2 Proteus ttcA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 6.3.4.19 ko:K04075,ko:K14058 R09597 RC02633,RC02634 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MW5Q@1224,1RN2H@1236,3Z1BH@583,COG0037@1,COG0037@2 NA|NA|NA H Catalyzes the ATP-dependent 2-thiolation of cytidine in position 32 of tRNA, to form 2-thiocytidine (s(2)C32). The sulfur atoms are provided by the cysteine cysteine desulfurase (IscS) system Z1_02803 529507.PMI1362 1.3e-111 409.1 Proteus leuE GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015190,GO:0015318,GO:0015658,GO:0015711,GO:0015803,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015820,GO:0015849,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0042968,GO:0042970,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K11250 ko00000,ko02000 2.A.76.1.5 Bacteria 1RA1G@1224,1RSYH@1236,3Z2UI@583,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA E LysE type translocator Z1_02805 529507.PMI1361 1.9e-49 201.4 Proteus ycnE ko:K06996 ko00000 Bacteria 1N2D2@1224,1S90Q@1236,3Z3HP@583,COG1359@1,COG1359@2 NA|NA|NA S Antibiotic biosynthesis monooxygenase Z1_02806 529507.PMI1360 5.9e-67 260.0 Gammaproteobacteria yaeR ko:K08234 ko00000 Bacteria 1RGZ8@1224,1S66M@1236,COG0346@1,COG0346@2 NA|NA|NA E glyoxalase bleomycin resistance protein dioxygenase Z1_02807 529507.PMI1359 1.7e-96 358.6 Proteus ko:K16078 ko00000,ko02000 1.B.6.2.2 Bacteria 1N7TP@1224,1SEKP@1236,3Z2PF@583,COG3637@1,COG3637@2 NA|NA|NA M Enterobacterial Ail/Lom protein Z1_02808 529507.PMI1358 8.1e-54 216.1 Proteus yciU ko:K09901 ko00000 Bacteria 1RE1F@1224,1S43E@1236,3Z2RP@583,COG3099@1,COG3099@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function, DUF440 Z1_02809 529507.PMI1357 1e-281 975.3 Proteus cls GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006650,GO:0006655,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0008808,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0019637,GO:0030572,GO:0032048,GO:0032049,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0045017,GO:0046471,GO:0046474,GO:0046486,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 2.7.8.8 ko:K00998,ko:K06131 ko00260,ko00564,ko01100,ko01110,map00260,map00564,map01100,map01110 M00093 R01800,R07390 RC00002,RC00017,RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSDY_1059.SDY_1307 Bacteria 1MWUW@1224,1RPQG@1236,3Z0UM@583,COG1502@1,COG1502@2 NA|NA|NA I Catalyzes the reversible phosphatidyl group transfer from one phosphatidylglycerol molecule to another to form cardiolipin (CL) (diphosphatidylglycerol) and glycerol Z1_02810 529507.PMI1356 9.1e-23 112.1 Proteus Bacteria 1NDZD@1224,1SE3J@1236,2EAF9@1,337QU@2,3Z3IW@583 NA|NA|NA Z1_02811 529507.PMI1355 3.6e-94 351.3 Proteus tonB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03832 ko00000,ko02000 2.C.1.1 Bacteria 1MXBE@1224,1RMI4@1236,3Z2DN@583,COG0810@1,COG0810@2 NA|NA|NA U Interacts with outer membrane receptor proteins that carry out high-affinity binding and energy dependent uptake into the periplasmic space of specific substrates. It could act to transduce energy from the cytoplasmic membrane to specific energy- requiring processes in the outer membrane, resulting in the release into the periplasm of ligands bound by these outer membrane proteins Z1_02812 529507.PMI1354 1.2e-73 282.3 Proteus yciA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006637,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009259,GO:0009987,GO:0016289,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033865,GO:0033875,GO:0034032,GO:0034641,GO:0035383,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0047617,GO:0051186,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564 ko:K10806 ko01040,map01040 ko00000,ko00001,ko01000,ko01004 Bacteria 1MZAZ@1224,1SA9N@1236,3Z0UR@583,COG1607@1,COG1607@2 NA|NA|NA I Thioesterase superfamily Z1_02813 529507.PMI1353 9.1e-113 412.9 Proteus ispZ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K06190 ko00000 Bacteria 1NWIZ@1224,1RQAB@1236,3Z2Q4@583,COG2917@1,COG2917@2 NA|NA|NA D probably involved in intracellular septation Z1_02814 529507.PMI1352 0.0 1122.1 Proteus sulP ko:K03321 ko00000,ko02000 2.A.53.3 Bacteria 1MWDF@1224,1SYC8@1236,3Z11P@583,COG0659@1,COG0659@2 NA|NA|NA P COG0659 Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) Z1_02815 529507.PMI1351 1.6e-129 468.8 Proteus yciC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1PYD0@1224,1RQC3@1236,28JC8@1,2Z96Y@2,3Z2MV@583 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0259) Z1_02816 529507.PMI1350 5.8e-120 436.8 Proteus ompW GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07275 ko00000 Bacteria 1NUZJ@1224,1RRRC@1236,3Z0ZY@583,COG3047@1,COG3047@2 NA|NA|NA M OmpW family Z1_02817 529507.PMI1349 7.1e-47 193.0 Proteus osmY_1 ko:K04065 ko00000 Bacteria 1N0SU@1224,1S926@1236,3Z2P6@583,COG2823@1,COG2823@2 NA|NA|NA S BON domain Z1_02818 529507.PMI1348 1.7e-145 521.9 Proteus trpA GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004834,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 4.2.1.20 ko:K01695 ko00260,ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00260,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00023 R00674,R02340,R02722 RC00209,RC00210,RC00700,RC00701,RC02868 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECED1_1282.ECED1_1467,iECP_1309.ECP_1308 Bacteria 1MXJV@1224,1RMGN@1236,3Z1W8@583,COG0159@1,COG0159@2 NA|NA|NA E The alpha subunit is responsible for the aldol cleavage of indoleglycerol phosphate to indole and glyceraldehyde 3- phosphate Z1_02819 529507.PMI1347 1.7e-226 791.6 Proteus trpB GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004834,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 4.2.1.20 ko:K01696 ko00260,ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00260,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00023 R00674,R02340,R02722 RC00209,RC00210,RC00700,RC00701,RC02868 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECSF_1327.ECSF_1239,iPC815.YPO2204 Bacteria 1MUS8@1224,1RP4D@1236,3Z1IT@583,COG0133@1,COG0133@2 NA|NA|NA E The beta subunit is responsible for the synthesis of L- tryptophan from indole and L-serine Z1_02820 529507.PMI1346 3.7e-257 893.6 Proteus trpF GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004425,GO:0004640,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 4.1.1.48,4.2.1.160,4.2.1.20,5.3.1.24 ko:K01609,ko:K01696,ko:K01817,ko:K13498,ko:K22100 ko00260,ko00400,ko00790,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00260,map00400,map00790,map01100,map01110,map01130,map01230 M00023,M00840 R00674,R02340,R02722,R03508,R03509,R11072 RC00209,RC00210,RC00700,RC00701,RC00944,RC00945,RC02868,RC03343 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN678.trpF,iPC815.YPO2205,iSBO_1134.SBO_1804,iSDY_1059.SDY_1330 Bacteria 1MW5K@1224,1RNYH@1236,3Z0YW@583,COG0134@1,COG0134@2,COG0135@1,COG0135@2 NA|NA|NA E Indole-3-glycerol phosphate synthase Z1_02821 529507.PMI1345 1.5e-183 648.7 Proteus trpD GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003921,GO:0003922,GO:0004048,GO:0004049,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005950,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006177,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016884,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042278,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0042451,GO:0042455,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046037,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046219,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901070,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901657,GO:1901659,GO:1902494 2.4.2.18,4.1.3.27 ko:K00766,ko:K13497 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00023 R00985,R00986,R01073 RC00010,RC00440,RC02148,RC02414 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSBO_1134.SBO_1803,iSbBS512_1146.SbBS512_E1488,iYL1228.KPN_01256 Bacteria 1MUPV@1224,1RNXV@1236,3Z17C@583,COG0547@1,COG0547@2 NA|NA|NA F Catalyzes the transfer of the phosphoribosyl group of 5- phosphorylribose-1-pyrophosphate (PRPP) to anthranilate to yield N-(5'-phosphoribosyl)-anthranilate (PRA) Z1_02822 529507.PMI1344 3.8e-110 404.1 Proteus trpG GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004048,GO:0004049,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005950,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 2.4.2.18,2.6.1.85,4.1.3.27 ko:K01658,ko:K01664,ko:K13497 ko00400,ko00405,ko00790,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,ko02025,map00400,map00405,map00790,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024,map02025 M00023 R00985,R00986,R01073,R01716 RC00010,RC00440,RC01418,RC02148,RC02414 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iIT341.HP1281,iSBO_1134.SBO_1803,iSbBS512_1146.SbBS512_E1488,iYL1228.KPN_01256 Bacteria 1RAKJ@1224,1RREB@1236,3Z173@583,COG0512@1,COG0512@2 NA|NA|NA EH Peptidase C26 Z1_02823 529507.PMI1343 8e-296 1022.3 Proteus trpE GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004049,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005950,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494 4.1.3.27 ko:K01657 ko00400,ko00405,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,ko02025,map00400,map00405,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024,map02025 M00023 R00985,R00986 RC00010,RC02148,RC02414 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iG2583_1286.G2583_1603,iIT341.HP1282 Bacteria 1MVBJ@1224,1RMSE@1236,3Z1Y8@583,COG0147@1,COG0147@2 NA|NA|NA H Anthranilate synthase component I, N terminal region Z1_02824 34506.g717 4.1e-161 573.9 Bilateria Metazoa 2QUA5@2759,3AK7Q@33154,3C034@33208,3DG5M@33213,COG0613@1 NA|NA|NA S hydrolase activity, acting on ester bonds Z1_02825 529507.PMI1341 1.9e-115 421.8 Proteus yciO GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.7.7.87 ko:K07566 R10463 RC00745 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MVPM@1224,1RNU8@1236,3Z2SK@583,COG0009@1,COG0009@2 NA|NA|NA J Telomere recombination Z1_02826 34506.g716 2.4e-167 594.7 Bilateria Metazoa 2QT4T@2759,3AI1M@33154,3BX47@33208,3DDK8@33213,COG1187@1 NA|NA|NA J S4 RNA-binding domain Z1_02827 529507.PMI1339 2.7e-182 644.4 Proteus Bacteria 1RI8U@1224,1S8IM@1236,2DMGH@1,32RD8@2,3Z0YK@583 NA|NA|NA Z1_02828 34506.g715 5.7e-106 390.2 Eukaryota Eukaryota 2SS8N@2759,COG2109@1 NA|NA|NA H ATP:corrinoid adenosyltransferase BtuR/CobO/CobP Z1_02829 34506.g714 1e-139 502.7 Bilateria Metazoa 3A6K7@33154,3BT19@33208,3DFHT@33213,COG1028@1,KOG0725@2759 NA|NA|NA Q KR domain Z1_02830 529507.PMI1336 1.8e-187 661.8 Proteus sohB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564 ko:K04773,ko:K04774 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUXE@1224,1RNN9@1236,3Z1Y5@583,COG0616@1,COG0616@2 NA|NA|NA OU Peptidase family S49 N-terminal Z1_02831 529507.PMI1335 7.4e-39 166.0 Proteus yciN GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N8PV@1224,1S938@1236,2CK10@1,32SBA@2,3Z2YF@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2498) Z1_02832 529507.PMI1334 0.0 1731.1 Proteus topA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003917,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006265,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016853,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051276,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 5.99.1.2 ko:K03168 ko00000,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MUFZ@1224,1RNZ2@1236,3Z0UQ@583,COG0550@1,COG0550@2 NA|NA|NA L Releases the supercoiling and torsional tension of DNA, which is introduced during the DNA replication and transcription, by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. Introduces a single-strand break via transesterification at a target site in duplex DNA. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand. The free DNA strand then undergoes passage around the unbroken strand, thus removing DNA supercoils. Finally, in the religation step, the DNA 3'-OH attacks the covalent intermediate to expel the active-site tyrosine and restore the DNA phosphodiester backbone Z1_02833 529507.PMI1333 2.9e-77 294.7 Proteus sodC GO:0005575,GO:0005623,GO:0042597,GO:0044464 1.15.1.1 ko:K04565 ko04146,ko04213,ko05014,ko05016,ko05020,map04146,map04213,map05014,map05016,map05020 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RGV4@1224,1S6KW@1236,3Z1M1@583,COG2032@1,COG2032@2 NA|NA|NA P Destroys radicals which are normally produced within the cells and which are toxic to biological systems Z1_02837 529507.PMI1322 1.8e-181 641.7 Proteus cysB GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010165,GO:0010212,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0097159,GO:1901363 ko:K13634 ko00000,ko03000 Bacteria 1MU8N@1224,1RN7T@1236,3Z1J4@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02838 529507.PMI1321 5.9e-149 533.5 Proteus Bacteria 1N20G@1224,1S918@1236,2BW5K@1,32T1P@2,3Z28C@583 NA|NA|NA Z1_02839 529507.PMI1320 0.0 1784.6 Proteus acnA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003730,GO:0003824,GO:0003994,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006097,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019541,GO:0019679,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046459,GO:0046487,GO:0046872,GO:0046914,GO:0047456,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350,GO:0097159,GO:1901363 4.2.1.3 ko:K01681 ko00020,ko00630,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,map00020,map00630,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230 M00009,M00010,M00012,M00173,M00740 R01324,R01325,R01900 RC00497,RC00498,RC00618 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_436,iECOK1_1307.ECOK1_1491,iECS88_1305.ECS88_1416,iJN746.PP_2112,iUMN146_1321.UM146_10390,iUTI89_1310.UTI89_C1547 Bacteria 1MU9T@1224,1RN5I@1236,3Z20P@583,COG1048@1,COG1048@2 NA|NA|NA C Catalyzes the isomerization of citrate to isocitrate via cis-aconitate Z1_02840 529507.PMI1319 5.8e-208 730.3 Proteus ydcK Bacteria 1PV23@1224,1TKKN@1236,3Z3IS@583,COG1044@1,COG1044@2 NA|NA|NA M Catalyzes the N-acylation of UDP-3-O-acylglucosamine using 3-hydroxyacyl-ACP as the acyl donor. Is involved in the biosynthesis of lipid A, a phosphorylated glycolipid that anchors the lipopolysaccharide to the outer membrane of the cell Z1_02841 529507.PMI1318 2.6e-149 534.6 Proteus metQ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02072,ko:K02073 ko02010,map02010 M00238 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.24 Bacteria 1MUVY@1224,1RSKH@1236,3Z394@583,COG1464@1,COG1464@2 NA|NA|NA P NLPA lipoprotein Z1_02842 529507.PMI1317 5.6e-109 400.2 Proteus ribA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003933,GO:0003935,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006771,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009110,GO:0009231,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016798,GO:0016799,GO:0016810,GO:0016814,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019238,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042726,GO:0042727,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046483,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 3.5.4.25 ko:K01497 ko00740,ko00790,ko01100,ko01110,ko02024,map00740,map00790,map01100,map01110,map02024 M00125 R00425 RC00293,RC02504 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_437,iPC815.YPO2222,iSbBS512_1146.SbBS512_E1505,iUTI89_1310.UTI89_C1548 Bacteria 1MWZR@1224,1RMFX@1236,3Z1H2@583,COG0807@1,COG0807@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of GTP to 2,5-diamino-6- ribosylamino-4(3H)-pyrimidinone 5'-phosphate (DARP), formate and pyrophosphate Z1_02843 529507.PMI1316 1e-125 456.1 Proteus pgpB 3.1.3.27,3.1.3.4,3.1.3.81,3.6.1.27 ko:K01096 ko00564,ko01100,map00564,map01100 R02029 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWW4@1224,1RNSB@1236,3Z24W@583,COG0671@1,COG0671@2 NA|NA|NA I Acid phosphatase homologues Z1_02844 529507.PMI1315 1.4e-42 178.7 Proteus lapA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008653,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1903509 ko:K08992 ko00000 Bacteria 1MZGX@1224,1S9X9@1236,3Z2V6@583,COG3771@1,COG3771@2 NA|NA|NA S Involved in the assembly of lipopolysaccharide (LPS) Z1_02845 529507.PMI1314 6.7e-223 779.6 Proteus lapB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008653,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046872,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1903509 ko:K19804 ko00000 Bacteria 1MVDP@1224,1RP29@1236,3Z0X2@583,COG2956@1,COG2956@2 NA|NA|NA P Modulates cellular lipopolysaccharide (LPS) levels by regulating LpxC, which is involved in lipid A biosynthesis. May act by modulating the proteolytic activity of FtsH towards LpxC. May also coordinate assembly of proteins involved in LPS synthesis at the plasma membrane Z1_02846 529507.PMI1313 1.1e-135 489.2 Proteus pyrF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004590,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019856,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.1.1.23 ko:K01591 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00051 R00965 RC00409 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO103_1326.ECO103_1444,iECSF_1327.ECSF_1264,iSFV_1184.SFV_1294,iSF_1195.SF1285,iSFxv_1172.SFxv_1457,iS_1188.S1368,ic_1306.c1750 Bacteria 1MW2C@1224,1RNJR@1236,3Z298@583,COG0284@1,COG0284@2 NA|NA|NA F Catalyzes the decarboxylation of orotidine 5'- monophosphate (OMP) to uridine 5'-monophosphate (UMP) Z1_02847 529507.PMI1312 8.9e-53 212.6 Proteus yciH GO:0001731,GO:0002181,GO:0002183,GO:0002188,GO:0002190,GO:0002192,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003743,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043024,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0065003,GO:0070992,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0097159,GO:0110017,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K03113 ko03013,map03013 ko00000,ko00001,ko03012 Bacteria 1MZ8T@1224,1S929@1236,3Z2UJ@583,COG0023@1,COG0023@2 NA|NA|NA J Translation initiation factor SUI1 Z1_02848 529507.PMI1311 0.0 1309.7 Proteus rnb GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006401,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0008859,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016896,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 3.1.13.1 ko:K01147 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1P563@1224,1RP5G@1236,3Z15J@583,COG4776@1,COG4776@2 NA|NA|NA J Involved in mRNA degradation. Hydrolyzes single-stranded polyribonucleotides processively in the 3' to 5' direction Z1_02849 529507.PMI1310 1.3e-119 435.6 Proteus nth GO:0000702,GO:0000703,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003906,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006285,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016798,GO:0016799,GO:0019104,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034644,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051716,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071482,GO:0071704,GO:0090304,GO:0104004,GO:0140097,GO:1901360 4.2.99.18 ko:K10773 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUYQ@1224,1RMHU@1236,3Z201@583,COG0177@1,COG0177@2 NA|NA|NA L DNA repair enzyme that has both DNA N-glycosylase activity and AP-lyase activity. The DNA N-glycosylase activity releases various damaged pyrimidines from DNA by cleaving the N- glycosidic bond, leaving an AP (apurinic apyrimidinic) site. The AP-lyase activity cleaves the phosphodiester bond 3' to the AP site by a beta-elimination, leaving a 3'-terminal unsaturated sugar and a product with a terminal 5'-phosphate Z1_02850 529507.PMI1309 2.6e-121 441.4 Proteus rnfE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 2.3.1.243,4.2.99.18 ko:K02560,ko:K03613,ko:K10773 ko00540,ko01100,ko03410,map00540,map01100,map03410 M00060 R05075 RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko03400 iHN637.CLJU_RS05585 Bacteria 1MW6N@1224,1RMEH@1236,3Z1AX@583,COG4660@1,COG4660@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02851 529507.PMI1308 6.7e-113 413.3 Proteus rnfG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 ko:K03612,ko:K03613 ko00000 Bacteria 1RDEP@1224,1RPAD@1236,3Z2HK@583,COG4659@1,COG4659@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02852 529507.PMI1307 9.5e-200 702.6 Proteus rnfD GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 1.6.5.8 ko:K00347,ko:K03614 ko00000,ko01000 Bacteria 1MVY6@1224,1RMEU@1236,3Z287@583,COG4658@1,COG4658@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02853 529507.PMI1306 0.0 1076.6 Proteus rnfC GO:0003674,GO:0003824,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016651,GO:0055114 ko:K03615 ko00000 Bacteria 1QTUI@1224,1RMIM@1236,3Z119@583,COG4656@1,COG4656@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02854 529507.PMI1305 4.8e-103 380.6 Proteus rnfB GO:0003674,GO:0003824,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016651,GO:0055114 1.12.98.1 ko:K00441,ko:K03616 ko00680,ko01100,ko01120,map00680,map01100,map01120 R03025 RC02628 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MUWU@1224,1RNSJ@1236,3Z2B3@583,COG2878@1,COG2878@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02855 529507.PMI1304 8.4e-94 349.7 Proteus rnfA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 ko:K03617 ko00000 Bacteria 1MU8X@1224,1RQDN@1236,3Z168@583,COG4657@1,COG4657@2 NA|NA|NA C Part of a membrane complex involved in electron transport Z1_02856 529507.PMI1303 3.1e-78 297.7 Proteus ydgK GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RCYV@1224,1S3X8@1236,29D1G@1,2ZZZI@2,3Z34Q@583 NA|NA|NA S Membrane Z1_02857 529507.PMI1302 3.5e-199 700.7 Proteus ydgJ 1.1.1.371 ko:K16044 ko00562,ko01120,map00562,map01120 R09954 RC00182 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MU8F@1224,1RNKY@1236,3Z1AH@583,COG0673@1,COG0673@2 NA|NA|NA S oxidoreductase YdgJ Z1_02858 529507.PMI1301 7.9e-177 626.3 Proteus yfeH ko:K14347 ko00000,ko02000,ko04147 2.A.93.1 Bacteria 1MUMM@1224,1RN2S@1236,3Z28D@583,COG0385@1,COG0385@2 NA|NA|NA S SBF-like CPA transporter family (DUF4137) Z1_02859 529507.PMI1300 6.2e-185 653.3 Proteus add GO:0003674,GO:0003824,GO:0004000,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006144,GO:0006152,GO:0006154,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009113,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009164,GO:0009165,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009987,GO:0015949,GO:0015950,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019239,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0032261,GO:0033554,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0034656,GO:0042278,GO:0042440,GO:0042451,GO:0042454,GO:0042455,GO:0042737,GO:0043094,GO:0043096,GO:0043101,GO:0043103,GO:0043173,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046085,GO:0046100,GO:0046101,GO:0046102,GO:0046103,GO:0046112,GO:0046128,GO:0046129,GO:0046130,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046700,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072523,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901658,GO:1901659 3.5.4.4 ko:K01488 ko00230,ko01100,ko05340,map00230,map01100,map05340 R01560,R02556 RC00477 ko00000,ko00001,ko01000 iSFV_1184.SFV_1640,iSF_1195.SF1648,iSFxv_1172.SFxv_1849,iS_1188.S1780 Bacteria 1MWBV@1224,1RNVI@1236,3Z1M2@583,COG1816@1,COG1816@2 NA|NA|NA F Adenosine/AMP deaminase Z1_02860 529507.PMI1298 3.3e-180 637.5 Proteus Bacteria 1QDZ4@1224,1RZ30@1236,3Z19B@583,COG2304@1,COG2304@2 NA|NA|NA S von Willebrand factor (vWF) type A domain Z1_02861 529507.PMI1297 1.1e-308 1065.1 Proteus ydgA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0042802 Bacteria 1MYKE@1224,1RRAU@1236,3Z2H3@583,COG5339@1,COG5339@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF945) Z1_02862 529507.PMI1296 1.3e-265 921.8 Proteus fumC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004333,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006106,GO:0006108,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0045333,GO:0050896,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350 4.2.1.2 ko:K01679 ko00020,ko00620,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko04934,ko05200,ko05211,map00020,map00620,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map04934,map05200,map05211 M00009,M00011,M00173,M00376 R01082 RC00443 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MUQI@1224,1RNUS@1236,3Z142@583,COG0114@1,COG0114@2 NA|NA|NA C Involved in the TCA cycle. Catalyzes the stereospecific interconversion of fumarate to L-malate Z1_02863 529507.PMI1295 2.3e-170 604.7 Proteus tus GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006274,GO:0006275,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008156,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043111,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045005,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051171,GO:0051172,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071807,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090329,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576,GO:2000104,GO:2000112,GO:2000113 ko:K10748 ko00000,ko03032 Bacteria 1NE22@1224,1RS77@1236,28I61@1,2Z895@2,3Z2MX@583 NA|NA|NA L DNA replication terminus site-binding protein (Ter protein) Z1_02865 529507.PMI1294 2.5e-223 781.2 Proteus ynfM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K08224 ko00000,ko02000 2.A.1.36 Bacteria 1MWFH@1224,1RPAT@1236,3Z1JY@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Sugar (and other) transporter Z1_02866 529507.PMI1293 4.8e-168 597.0 Proteus ynfL GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 Bacteria 1MXRP@1224,1RQP1@1236,3Z13K@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02867 529507.PMI1292 6.7e-226 789.6 Proteus mlc GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576 ko:K02565,ko:K15545 ko00000,ko03000 Bacteria 1MX6M@1224,1RNZ1@1236,3Z29U@583,COG1940@1,COG1940@2 NA|NA|NA GK ROK family Z1_02868 529507.PMI1291 3.7e-125 454.1 Proteus bioD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004141,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.3.3 ko:K01935 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R03182 RC00868 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1NPX5@1224,1RRRI@1236,3Z1FD@583,COG0132@1,COG0132@2 NA|NA|NA H Catalyzes a mechanistically unusual reaction, the ATP- dependent insertion of CO2 between the N7 and N8 nitrogen atoms of 7,8-diaminopelargonic acid (DAPA) to form an ureido ring Z1_02869 529507.PMI1290 9.4e-36 155.6 Proteus ynfD Bacteria 1N0CU@1224,1S9NS@1236,2CTGV@1,32STG@2,3Z30A@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1161) Z1_02870 529507.PMI1289 4.6e-58 230.3 Proteus ynfB GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1N0YE@1224,1S9BH@1236,2CSJ8@1,32SRB@2,3Z2S3@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1283) Z1_02871 529507.PMI1288 2.9e-139 501.1 Proteus ydfG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006208,GO:0006212,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009112,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0017144,GO:0019860,GO:0031132,GO:0034641,GO:0035527,GO:0042737,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044270,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046113,GO:0046483,GO:0046700,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 1.1.1.381 ko:K16066 ko00240,ko00260,ko01100,map00240,map00260,map01100 R09289,R10851,R10852 RC00087,RC00525,RC03288 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MUF8@1224,1RMKM@1236,3Z1UB@583,COG4221@1,COG4221@2 NA|NA|NA S Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase Z1_02872 529507.PMI1286 1.1e-30 138.7 Proteus osmB ko:K04062 ko00000 Bacteria 1N0HV@1224,1S93Y@1236,2CMW8@1,32SFP@2,3Z30W@583 NA|NA|NA M Glycine zipper 2TM domain Z1_02873 529507.PMI1285 1.2e-85 322.4 Bacteria Bacteria 2CGJ0@1,2ZE4D@2 NA|NA|NA Z1_02874 529507.PMI1284 1.3e-90 339.0 Gammaproteobacteria ko:K03824,ko:K04766 ko00000,ko01000 Bacteria 1N4R3@1224,1S9FB@1236,COG3153@1,COG3153@2 NA|NA|NA S Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02875 471881.PROPEN_04719 4.9e-29 135.6 Proteus Bacteria 1QN1P@1224,1TKEG@1236,2AYBJ@1,31QE8@2,3Z3E0@583 NA|NA|NA Z1_02876 1141662.OOA_15937 3.4e-69 267.7 Providencia ko:K06887 ko00000 Bacteria 1N6DY@1224,1SA2B@1236,3Z8ZS@586,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system effector, Hcp1 family Z1_02877 529507.PMI1278 3.3e-32 143.7 Gammaproteobacteria ko:K06889 ko00000 Bacteria 1R53B@1224,1S0TS@1236,COG1073@1,COG1073@2 NA|NA|NA E COG1073 Hydrolases of the alpha beta superfamily Z1_02878 529507.PMI1277 1.5e-46 192.2 Proteus IV02_09080 GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0005488,GO:0097159,GO:1901363 ko:K06867 ko00000 Bacteria 1N7DG@1224,1SCBE@1236,3Z30G@583,COG4628@1,COG4628@2 NA|NA|NA S DNA-binding protein VF530 Z1_02879 529507.PMI1276 4.9e-226 790.0 Proteus xylR GO:0003674,GO:0003700,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0140110,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 5.3.1.12 ko:K01812,ko:K02529,ko:K16210 ko00040,ko01100,map00040,map01100 M00061,M00631 R01482,R01983 RC00376 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000,ko03000 2.A.2.5 Bacteria 1NYTD@1224,1RNGZ@1236,3Z21J@583,COG1609@1,COG1609@2,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_02880 529507.PMI1275 4e-228 797.0 Proteus Z012_05710 4.4.1.8 ko:K14155 ko00270,ko00450,ko01100,ko01110,ko01230,map00270,map00450,map01100,map01110,map01230 R00782,R01286,R02408,R04941 RC00056,RC00069,RC00382,RC00488,RC00710,RC01245,RC02303 ko00000,ko00001,ko01000,ko01007 Bacteria 1MY33@1224,1RP58@1236,3Z128@583,COG1168@1,COG1168@2 NA|NA|NA E Bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities Z1_02881 529507.PMI1274 1.2e-266 925.2 Proteus nhaC ko:K03315 ko00000,ko02000 2.A.35 Bacteria 1MVDF@1224,1RS40@1236,3Z17D@583,COG1757@1,COG1757@2 NA|NA|NA C Na+/H+ antiporter family Z1_02882 529507.PMI1273 2.4e-261 907.5 Proteus xylA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005975,GO:0005996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009045,GO:0009056,GO:0016052,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0019321,GO:0019323,GO:0042732,GO:0042843,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046365,GO:0071704,GO:1901575 5.3.1.5 ko:K01805 ko00040,ko00051,ko01100,map00040,map00051,map01100 R00878,R01432 RC00376,RC00516 ko00000,ko00001,ko01000 iECO26_1355.ECO26_5036,iHN637.CLJU_RS08960,iPC815.YPO4038 Bacteria 1MXS2@1224,1RN5Y@1236,3Z2C5@583,COG2115@1,COG2115@2 NA|NA|NA G Belongs to the xylose isomerase family Z1_02883 34506.g985 2.4e-283 980.7 Bilateria Metazoa 3AEWP@33154,3BZ4E@33208,3DD3R@33213,COG0554@1,KOG2517@2759 NA|NA|NA G FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain Z1_02884 529507.PMI1271 7.8e-103 379.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1RET0@1224,1S8J4@1236,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA E threonine efflux protein Z1_02885 529507.PMI1270 6.2e-36 156.4 Proteus Bacteria 1N3UT@1224,1SCPE@1236,2ECDS@1,336C2@2,3Z32N@583 NA|NA|NA S YjbD family (DUF3811) Z1_02886 529507.PMI1269 5.1e-195 686.8 Proteus ltaE 4.1.2.48 ko:K01620 ko00260,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00260,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 R00751,R06171 RC00312,RC00372 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWCR@1224,1RRGS@1236,3Z1BP@583,COG2008@1,COG2008@2 NA|NA|NA E Catalyzes the cleavage of L-allo-threonine and L- threonine to glycine and acetaldehyde Z1_02887 529507.PMI1268 1.2e-255 888.6 Proteus yegD ko:K04046,ko:K18640 ko00000,ko03110,ko04812 1.A.33 Bacteria 1MXBT@1224,1RN4U@1236,3Z28A@583,COG0443@1,COG0443@2 NA|NA|NA O Hsp70 protein Z1_02888 529507.PMI1267 6.6e-74 283.1 Proteus Bacteria 1MYH3@1224,1T1C0@1236,2C9TE@1,32RPW@2,3Z2QE@583 NA|NA|NA Z1_02889 529507.PMI1266 2.8e-271 940.6 Proteus ttgC Bacteria 1MWX5@1224,1S06I@1236,3Z3C5@583,COG1538@1,COG1538@2 NA|NA|NA MU Outer membrane efflux protein Z1_02890 529507.PMI1265 0.0 1160.2 Proteus mdtO ko:K15547 ko00000,ko02000 2.A.85.6.1 Bacteria 1R0HK@1224,1RQSH@1236,3Z0WA@583,COG1289@1,COG1289@2 NA|NA|NA S Resistance protein Z1_02891 529507.PMI1264 8.4e-185 652.9 Proteus mdtN_2 ko:K03543,ko:K15549 M00701 ko00000,ko00002,ko02000 8.A.1.1,8.A.1.1.3 Bacteria 1MWG0@1224,1RP22@1236,3Z1FS@583,COG1566@1,COG1566@2 NA|NA|NA V Barrel-sandwich domain of CusB or HlyD membrane-fusion Z1_02892 529507.PMI1263 1.5e-43 181.8 Proteus Bacteria 1PK3R@1224,1TE1E@1236,2A93Z@1,30Y82@2,3Z3I4@583 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family Z1_02893 529507.PMI1262 1.4e-209 735.3 Proteus selU GO:0001887,GO:0002097,GO:0002098,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016785,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043828,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0070329,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 ko:K06917 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1N4T5@1224,1RPFP@1236,3Z2BW@583,COG2603@1,COG2603@2 NA|NA|NA H Catalyzes the transfer of selenium from selenophosphate for conversion of 2-thiouridine to 2-selenouridine at the wobble position in tRNA Z1_02894 1124991.MU9_2200 8.7e-97 360.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVPR@1224,1RQGQ@1236,COG1680@1,COG1680@2 NA|NA|NA V COG1680 Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins Z1_02895 529507.PMI1261 1.5e-203 715.3 Gammaproteobacteria mdtL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015893,GO:0016020,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K07552,ko:K08163,ko:K18552 br01600,ko00000,ko01504,ko02000 2.A.1.2,2.A.1.2.22,2.A.1.2.3 Bacteria 1P8JD@1224,1T1SC@1236,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major facilitator Superfamily Z1_02896 529507.PMI1260 6.6e-184 649.8 Gammaproteobacteria yidZ GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 Bacteria 1R4F5@1224,1RRRX@1236,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K HTH-type transcriptional regulator YidZ Z1_02897 529507.PMI1259 1.5e-258 898.3 Proteus mtaD Bacteria 1MVPA@1224,1RN13@1236,3Z1YJ@583,COG0402@1,COG0402@2 NA|NA|NA F Amidohydrolase family Z1_02898 529507.PMI1258 5.6e-77 293.5 Proteus yaiI ko:K09768 ko00000 Bacteria 1RCZA@1224,1S3QM@1236,3Z1UM@583,COG1671@1,COG1671@2 NA|NA|NA S Uncharacterized BCR, YaiI/YqxD family COG1671 Z1_02899 529507.PMI1257 3.9e-295 1020.0 Proteus ybiT GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0050896 ko:K06158 ko00000,ko03012 Bacteria 1MU37@1224,1RPN9@1236,3Z1MU@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ABC transporter ATP-binding protein YbiT K01957 Z1_02900 529507.PMI1256 5.2e-176 623.6 Proteus Bacteria 1QGNQ@1224,1TE3T@1236,2ATFF@1,31IZ0@2,3Z3K5@583 NA|NA|NA Z1_02901 529507.PMI1255 2.3e-107 394.8 Proteus Bacteria 1R4IA@1224,1S5SR@1236,3Z37P@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, tetR family Z1_02902 529507.PMI1254 1.1e-267 928.7 Proteus Bacteria 1MWXZ@1224,1RPIM@1236,3Z360@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA P Sugar (and other) transporter Z1_02903 529507.PMI1253 2e-158 565.1 Proteus Bacteria 1PUCV@1224,1RU5B@1236,3Z35S@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_02904 529507.PMI1252 4.6e-67 260.4 Proteus accA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003989,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009317,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016421,GO:0016874,GO:0016885,GO:0019752,GO:0032787,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576,GO:1902494 2.1.3.15,6.4.1.2 ko:K01962,ko:K01963 ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00376 R00742,R04386 RC00040,RC00253,RC00367 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_1607 Bacteria 1MURN@1224,1RNN8@1236,3Z396@583,COG0825@1,COG0825@2 NA|NA|NA I acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha Z1_02905 529507.PMI1252 8.2e-83 313.2 Proteus accA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003989,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009317,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016421,GO:0016874,GO:0016885,GO:0019752,GO:0032787,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576,GO:1902494 2.1.3.15,6.4.1.2 ko:K01962,ko:K01963 ko00061,ko00620,ko00640,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,map00061,map00620,map00640,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212 M00082,M00376 R00742,R04386 RC00040,RC00253,RC00367 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iJN746.PP_1607 Bacteria 1MURN@1224,1RNN8@1236,3Z396@583,COG0825@1,COG0825@2 NA|NA|NA I acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha Z1_02906 529507.PMI1251 1.1e-209 735.7 Proteus ydeE GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006857,GO:0008150,GO:0015833,GO:0016020,GO:0022857,GO:0035442,GO:0035672,GO:0035673,GO:0042886,GO:0042887,GO:0042938,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071916,GO:0071944,GO:1904680 Bacteria 1N0KT@1224,1RYZC@1236,3Z1X5@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_02907 529507.PMI1250 1.2e-157 562.4 Proteus Bacteria 1PG2U@1224,1RXND@1236,3Z3FN@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_02908 529507.PMI1249 1.3e-101 375.6 Proteus Bacteria 1MXGM@1224,1SWV5@1236,3Z35R@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02909 529507.PMI1248 2.4e-242 844.3 Proteus mdeA 2.5.1.48,4.4.1.11,4.4.1.8 ko:K01739,ko:K01760,ko:K01761 ko00270,ko00450,ko00920,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00270,map00450,map00920,map01100,map01110,map01130,map01230 M00017 R00654,R00782,R00999,R01286,R01288,R02408,R02508,R03217,R03260,R04770,R04941,R04944,R04945,R04946 RC00020,RC00056,RC00069,RC00196,RC00348,RC00382,RC00420,RC00488,RC00710,RC01209,RC01210,RC01245,RC02303,RC02848,RC02866 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU57@1224,1RMCV@1236,3Z1VW@583,COG0626@1,COG0626@2 NA|NA|NA E Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme Z1_02910 529507.PMI1247 3.6e-143 514.2 Proteus metQ ko:K02072,ko:K02073 ko02010,map02010 M00238 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.24 Bacteria 1MY0V@1224,1RR0C@1236,3Z26R@583,COG1464@1,COG1464@2 NA|NA|NA P NLPA lipoprotein Z1_02911 529507.PMI1246 1.1e-87 329.3 Proteus Bacteria 1QCPT@1224,1T8FM@1236,2AQ3R@1,31F90@2,3Z2SV@583 NA|NA|NA Z1_02912 529507.PMI1245 6.5e-66 256.5 Proteus Bacteria 1N8EC@1224,1S4UR@1236,3Z2P1@583,COG3755@1,COG3755@2 NA|NA|NA S Lysozyme inhibitor LprI Z1_02913 529507.PMI1244 9.9e-67 259.2 Gammaproteobacteria gloA_3 Bacteria 1RH3J@1224,1S60C@1236,COG0346@1,COG0346@2 NA|NA|NA E glyoxalase bleomycin resistance protein dioxygenase Z1_02914 529507.PMI1243 3.7e-207 727.2 Proteus ddl GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008716,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0016020,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0030203,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.4 ko:K01921 ko00473,ko00550,ko01100,ko01502,map00473,map00550,map01100,map01502 R01150 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iAF1260.b0381,iB21_1397.B21_00332,iBWG_1329.BWG_0265,iE2348C_1286.E2348C_0317,iEC042_1314.EC042_0413,iEC55989_1330.EC55989_0386,iECBD_1354.ECBD_3283,iECB_1328.ECB_00328,iECDH10B_1368.ECDH10B_0338,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0367,iECD_1391.ECD_00328,iECH74115_1262.ECH74115_0453,iECIAI1_1343.ECIAI1_0377,iECIAI39_1322.ECIAI39_0301,iECO103_1326.ECO103_0356,iECO111_1330.ECO111_0411,iECO26_1355.ECO26_0414,iECSE_1348.ECSE_0401,iECSP_1301.ECSP_0441,iECs_1301.ECs0431,iETEC_1333.ETEC_0434,iEcDH1_1363.EcDH1_3227,iEcE24377_1341.EcE24377A_0406,iEcHS_1320.EcHS_A0447,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0410,iEcolC_1368.EcolC_3251,iJO1366.b0381,iJR904.b0381,iSF_1195.SF0232,iSFxv_1172.SFxv_0245,iS_1188.S0254,iUMNK88_1353.UMNK88_429,iY75_1357.Y75_RS01965,iZ_1308.Z0477 Bacteria 1MUTB@1224,1RMTM@1236,3Z2G4@583,COG1181@1,COG1181@2 NA|NA|NA F Cell wall formation Z1_02915 529507.PMI1242 0.0 1117.4 Proteus tlrC ko:K06158,ko:K18230 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko01504,ko02000,ko03012 3.A.1.120 Bacteria 1MX6Y@1224,1RNT8@1236,3Z3CX@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_02916 529507.PMI1241 7e-53 213.0 Proteus yqfB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09900 ko00000 Bacteria 1NBAT@1224,1SG96@1236,3Z2TI@583,COG3097@1,COG3097@2 NA|NA|NA S ASCH Z1_02917 529507.PMI1240 1.3e-162 578.9 Proteus ada GO:0001130,GO:0003674,GO:0003700,GO:0003824,GO:0003908,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006304,GO:0006307,GO:0006355,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008172,GO:0008213,GO:0008270,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018125,GO:0018193,GO:0018198,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032259,GO:0033554,GO:0034641,GO:0035510,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044728,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070988,GO:0071704,GO:0080090,GO:0080111,GO:0090304,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901564,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 2.1.1.63,3.2.2.21 ko:K00567,ko:K03490,ko:K10778,ko:K13529,ko:K13530,ko:K15051 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000,ko03400 Bacteria 1N2YQ@1224,1RPR3@1236,3Z1IX@583,COG0350@1,COG0350@2,COG2169@1,COG2169@2 NA|NA|NA FL 6-O-methylguanine DNA methyltransferase, ribonuclease-like domain Z1_02918 529507.PMI1239 1e-105 389.4 Proteus alkA 2.1.1.63,3.2.2.21 ko:K00567,ko:K01247 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MX9C@1224,1S3CY@1236,3Z2WT@583,COG0122@1,COG0122@2 NA|NA|NA L Helix-hairpin-helix DNA-binding motif class 1 Z1_02919 529507.PMI1238 2.5e-112 411.4 Gammaproteobacteria MA20_21430 ko:K07006 ko00000 Bacteria 1MWG9@1224,1RQJ6@1236,COG3576@1,COG3576@2 NA|NA|NA S 5'-phosphate oxidase Z1_02920 529507.PMI1237 3.2e-110 404.4 Proteus leuE ko:K11250 ko00000,ko02000 2.A.76.1.5 Bacteria 1RA1G@1224,1RSYH@1236,3Z2MC@583,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA E LysE type translocator Z1_02921 529507.PMI1236 3.3e-146 524.2 Proteus Bacteria 1RHZS@1224,1S6D7@1236,3Z25V@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02922 529507.PMI1235 7.1e-68 263.1 Proteus yabJ 3.5.99.10 ko:K09022 R11098,R11099 RC03275,RC03354 ko00000,ko01000 Bacteria 1N30R@1224,1S91A@1236,3Z3E6@583,COG0251@1,COG0251@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease L-PSP Z1_02923 529507.PMI1234 1.8e-181 641.7 Proteus srr 4.3.1.19 ko:K01754 ko00260,ko00290,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00290,map01100,map01110,map01130,map01200,map01230 M00570 R00220,R00996 RC00418,RC02600 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVWJ@1224,1RPGU@1236,3Z3BN@583,COG1171@1,COG1171@2 NA|NA|NA E Pyridoxal-phosphate dependent enzyme Z1_02924 529507.PMI1233 1.6e-171 608.6 Proteus 4.1.3.3,4.3.3.7 ko:K01639,ko:K01714 ko00261,ko00300,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01230,map00261,map00300,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01230 M00016,M00525,M00526,M00527 R01811,R10147 RC00159,RC00600,RC03062,RC03063 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1R4AY@1224,1RRPJ@1236,3Z1EX@583,COG0329@1,COG0329@2 NA|NA|NA EM Dihydrodipicolinate synthetase family Z1_02925 529507.PMI1232 9.8e-109 399.4 Proteus yloV 2.7.1.121 ko:K05879,ko:K07030 ko00561,ko01100,map00561,map01100 R01012 RC00015,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RK17@1224,1SPDK@1236,3Z1UA@583,COG1461@1,COG1461@2 NA|NA|NA S Dak2 Z1_02926 529507.PMI1231 1.2e-185 655.6 Proteus dhaK 2.7.1.121,2.7.1.28,2.7.1.29,4.6.1.15 ko:K00863,ko:K05878 ko00051,ko00561,ko00680,ko01100,ko01120,ko01200,ko04622,map00051,map00561,map00680,map01100,map01120,map01200,map04622 M00344 R01011,R01012,R01059 RC00002,RC00015,RC00017 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVSR@1224,1RNRQ@1236,3Z24Z@583,COG2376@1,COG2376@2 NA|NA|NA G Dak1 domain Z1_02927 529507.PMI1230 7.4e-243 846.3 Proteus MA20_15815 ko:K07793 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.80.1 Bacteria 1MUKR@1224,1RMQB@1236,3Z0XA@583,COG3333@1,COG3333@2 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter TctA family Z1_02928 529507.PMI1229 1.1e-69 269.2 Proteus Bacteria 1NDSP@1224,1SEXM@1236,338YZ@2,3Z2T8@583,arCOG10722@1 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter TctB family Z1_02929 585.DR95_829 1.9e-167 595.1 Proteus MA20_15805 Bacteria 1MU58@1224,1RSC6@1236,3Z38K@583,COG3181@1,COG3181@2 NA|NA|NA S Tripartite tricarboxylate transporter family receptor Z1_02930 585.DR95_828 4e-202 710.7 Proteus rbsK 2.7.1.15,2.7.1.4 ko:K00847,ko:K00852,ko:K02444 ko00030,ko00051,ko00500,ko00520,ko01100,map00030,map00051,map00500,map00520,map01100 R00760,R00867,R01051,R02750,R03920 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000,ko03000 Bacteria 1NU3X@1224,1SMNV@1236,3Z3CV@583,COG0524@1,COG0524@2,COG1349@1,COG1349@2 NA|NA|NA H Phosphomethylpyrimidine kinase Z1_02931 585.DR95_821 0.0 1603.6 Proteus dmsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009061,GO:0009390,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0022900,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0031237,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098567,GO:1902494 1.8.5.3 ko:K07306 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 5.A.3.3 iECSE_1348.ECSE_0952,iZ_1308.Z1240 Bacteria 1NR6J@1224,1RMVE@1236,3Z3AK@583,COG0243@1,COG0243@2 NA|NA|NA C Molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 domain Z1_02932 585.DR95_820 1.9e-120 438.3 Proteus dmsB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009061,GO:0009389,GO:0009390,GO:0009897,GO:0009986,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016667,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0031237,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098567,GO:1902494 ko:K07307,ko:K07311 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 iPC815.YPO3324 Bacteria 1MU5T@1224,1RPIC@1236,3Z2DF@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C Dimethylsulfoxide reductase, chain B Z1_02933 585.DR95_819 9.1e-137 493.0 Proteus dmsC ko:K07308 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1PA8U@1224,1RRGH@1236,3Z37M@583,COG3302@1,COG3302@2 NA|NA|NA S DMSO reductase anchor subunit (DmsC) Z1_02934 471881.PROPEN_03958 2.8e-103 381.3 Proteus dmsD Bacteria 1RF2Y@1224,1S3Q8@1236,3Z39W@583,COG3381@1,COG3381@2 NA|NA|NA S Required for biogenesis assembly of DMSO reductase, but not for the interaction of the DmsA signal peptide with the Tat system. May be part of a chaperone cascade complex that facilitates a folding-maturation pathway for the substrate protein Z1_02935 585.DR95_817 3.1e-67 261.2 Gammaproteobacteria guaD 3.5.4.33 ko:K11991 R10223 RC00477 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1RHM4@1224,1S4RE@1236,COG0590@1,COG0590@2 NA|NA|NA FJ deaminase Z1_02936 585.DR95_816 1.9e-52 212.6 Proteus ko:K06867 ko00000 Bacteria 1N952@1224,1RPZA@1236,3Z3CB@583,COG0666@1,COG0666@2 NA|NA|NA FJ Ankyrin repeats (many copies) Z1_02937 34506.g1393 4.9e-299 1033.1 Eukaryota Eukaryota 2D1FP@1,2SHY6@2759 NA|NA|NA S Potassium-transporting ATPase A subunit Z1_02938 471874.PROSTU_01542 3.1e-300 1037.3 Providencia kdpB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008556,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015079,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031004,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0034220,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046873,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071944,GO:0090533,GO:0090662,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0099131,GO:0099132,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 3.6.3.12 ko:K01547 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko01000 3.A.3.7 iAF987.Gmet_2434,iECNA114_1301.ECNA114_0634,iECSF_1327.ECSF_0632 Bacteria 1MU7D@1224,1RPPF@1236,3Z83S@586,COG2216@1,COG2216@2 NA|NA|NA P Part of the high-affinity ATP-driven potassium transport (or Kdp) system, which catalyzes the hydrolysis of ATP coupled with the electrogenic transport of potassium into the cytoplasm. This subunit is responsible for energy coupling to the transport system Z1_02939 585.DR95_812 9.9e-74 283.1 Proteus kdpC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006813,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008556,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015079,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015672,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019829,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031004,GO:0031224,GO:0032991,GO:0034220,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046873,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071804,GO:0071805,GO:0071944,GO:0090533,GO:0090662,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0099131,GO:0099132,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 3.6.3.12 ko:K01548 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko01000 3.A.3.7 iEcE24377_1341.EcE24377A_0722,ic_1306.c0781 Bacteria 1RABG@1224,1S2B0@1236,3Z3DR@583,COG2156@1,COG2156@2 NA|NA|NA P K+-transporting ATPase, c chain Z1_02940 529507.PMI1227 0.0 1751.1 Proteus Bacteria 1MUZQ@1224,1RMZT@1236,3Z1TE@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T Osmosensitive K+ channel His kinase sensor domain Z1_02941 529507.PMI1226 2.1e-128 464.9 Proteus Bacteria 1MWZ5@1224,1RNY2@1236,3Z261@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_02942 529507.PMI1225 4.5e-200 703.7 Proteus yhhJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MUIA@1224,1RQSE@1236,3Z23P@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 family transporter protein Z1_02943 529507.PMI1224 0.0 1773.1 Proteus rbbA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006417,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019222,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034250,GO:0042623,GO:0043021,GO:0043024,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045727,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0060187,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071944,GO:0080090,GO:1990904,GO:2000112 ko:K01990,ko:K13926 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1QTT9@1224,1T1GD@1236,3Z1A1@583,COG0842@1,COG0842@2,COG1129@1,COG1129@2 NA|NA|NA P AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_02944 529507.PMI1223 1.2e-186 659.1 Proteus yhiI GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K01993 ko00000 Bacteria 1MUG6@1224,1RS3I@1236,3Z19J@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Secretion protein Z1_02945 529507.PMI1222 2.7e-175 621.3 Proteus iaaA 3.4.19.5,3.5.1.1 ko:K01424,ko:K13051 ko00250,ko00460,ko01100,ko01110,map00250,map00460,map01100,map01110 R00485 RC00010,RC02798 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1MWFC@1224,1RNUR@1236,3Z0VQ@583,COG1446@1,COG1446@2 NA|NA|NA E Asparaginase Z1_02946 529507.PMI1221 1.5e-186 658.7 Proteus Bacteria 1R7M0@1224,1RYKU@1236,3Z2EW@583,COG4974@1,COG4974@2 NA|NA|NA L Belongs to the 'phage' integrase family Z1_02947 529507.PMI1220 4.2e-283 979.9 Proteus amn GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008714,GO:0016787,GO:0016798,GO:0016799,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 3.2.2.4 ko:K01241 ko00230,map00230 R00182 RC00063,RC00318 ko00000,ko00001,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c22520,iECOK1_1307.ECOK1_2159,iECP_1309.ECP_1955,iETEC_1333.ETEC_2095,iNRG857_1313.NRG857_09950,iUMN146_1321.UM146_07225,ic_1306.c2444 Bacteria 1MUMQ@1224,1RNZ4@1236,3Z1TX@583,COG0775@1,COG0775@2 NA|NA|NA F Catalyzes the hydrolysis of the N-glycosidic bond of AMP to form adenine and ribose 5-phosphate. Involved in regulation of AMP concentrations Z1_02949 529507.PMI1218 1.6e-155 555.4 Proteus ko:K07088 ko00000 Bacteria 1N1X9@1224,1RY7R@1236,3Z10K@583,COG0679@1,COG0679@2 NA|NA|NA S Sodium Bile acid symporter family Z1_02950 529507.PMI1217 2.2e-87 328.2 Proteus ko:K03830 ko00000,ko01000 Bacteria 1RI07@1224,1S7S4@1236,3Z2I0@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_02951 529507.PMI1216 6.4e-79 300.1 Proteus Bacteria 1QCSQ@1224,1T8JJ@1236,2B3N7@1,31WBM@2,3Z319@583 NA|NA|NA Z1_02952 529507.PMI1215 1.6e-131 475.3 Gammaproteobacteria ko:K06889 ko00000 Bacteria 1PIRE@1224,1S0TY@1236,COG1506@1,COG1506@2 NA|NA|NA E Prolyl oligopeptidase family Z1_02953 529507.PMI1215 2.7e-45 187.6 Gammaproteobacteria ko:K06889 ko00000 Bacteria 1PIRE@1224,1S0TY@1236,COG1506@1,COG1506@2 NA|NA|NA E Prolyl oligopeptidase family Z1_02955 529507.PMI1214 2.3e-295 1020.8 Proteus ahpF GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008785,GO:0009321,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0032991,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071949,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1990204 ko:K03387 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUKD@1224,1RNC7@1236,3Z0W4@583,COG3634@1,COG3634@2 NA|NA|NA C alkyl hydroperoxide reductase F52A protein subunit F K03387 Z1_02956 529507.PMI1213 1e-104 386.0 Proteus ahpC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004601,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006950,GO:0006979,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009267,GO:0009321,GO:0009605,GO:0009636,GO:0009970,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010033,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0016684,GO:0019725,GO:0030003,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032843,GO:0032991,GO:0033194,GO:0033195,GO:0033212,GO:0033214,GO:0033554,GO:0042221,GO:0042592,GO:0042594,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0071496,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098771,GO:0098869,GO:1901700,GO:1902494,GO:1990204,GO:1990748 1.11.1.15 ko:K03386 ko04214,map04214 ko00000,ko00001,ko01000,ko04147 Bacteria 1MWPY@1224,1RN4S@1236,3Z1JH@583,COG0450@1,COG0450@2 NA|NA|NA C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin Z1_02957 529507.PMI1212 8.2e-117 426.4 Proteus Bacteria 1RIRF@1224,1SBZ2@1236,2BTG3@1,32NND@2,3Z2RR@583 NA|NA|NA Z1_02958 529507.PMI1211 4.7e-20 102.8 Proteus Bacteria 1QG9A@1224,1TDND@1236,2AT47@1,31IKC@2,3Z350@583 NA|NA|NA Z1_02959 529507.PMI1210 2e-125 455.3 Proteus yqjI Bacteria 1RHSE@1224,1S255@1236,3Z1CF@583,COG1695@1,COG1695@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator PadR-like family Z1_02960 529507.PMI1209 0.0 1236.1 Proteus Bacteria 1MWUX@1224,1RQ8G@1236,3Z163@583,COG0076@1,COG0076@2 NA|NA|NA E decarboxylase Z1_02961 529507.PMI1208 7e-192 676.4 Proteus ppsC 1.6.5.5 ko:K00344 ko00000,ko01000 Bacteria 1MX8A@1224,1RPRD@1236,3Z2EJ@583,COG0604@1,COG0604@2 NA|NA|NA C Zinc-binding dehydrogenase Z1_02962 529507.PMI1207 1.5e-166 592.0 Proteus nifJ 1.18.1.2,1.19.1.1,1.2.7.1,1.2.7.3,1.3.7.1 ko:K00176,ko:K00528,ko:K03737,ko:K20449 ko00010,ko00020,ko00620,ko00650,ko00720,ko00760,ko01100,ko01120,ko01130,ko01200,map00010,map00020,map00620,map00650,map00720,map00760,map01100,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00173,M00307,M00620 R01196,R01197,R03164,R10159,R10866 RC00004,RC02422,RC02742,RC02833 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1QUES@1224,1T1W6@1236,3Z1QK@583,COG1149@1,COG1149@2,COG2768@1,COG2768@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S dicluster domain Z1_02963 529507.PMI1206 4.6e-152 543.9 Proteus ko:K07308 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1RDNF@1224,1S5JZ@1236,3Z15X@583,COG3302@1,COG3302@2 NA|NA|NA S DMSO reductase anchor subunit (DmsC) Z1_02964 529507.PMI1205 1.7e-124 451.8 Proteus dmsB ko:K07307 ko00920,map00920 R09501 RC02555 ko00000,ko00001,ko02000 5.A.3.3 Bacteria 1MU1B@1224,1SYHX@1236,3Z299@583,COG0437@1,COG0437@2 NA|NA|NA C 4Fe-4S binding domain Z1_02965 34506.g882 0.0 1622.1 Eukaryota Eukaryota 2D3KY@1,2SRZB@2759 NA|NA|NA S Molybdopterin oxidoreductase Z1_02966 529507.PMI1203 1.2e-137 495.7 Proteus fnr GO:0000302,GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006091,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009061,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0015980,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032991,GO:0032993,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0045893,GO:0045935,GO:0048037,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071731,GO:0080090,GO:0097159,GO:0097366,GO:0140110,GO:1901363,GO:1901698,GO:1901700,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K01420 ko00000,ko03000 Bacteria 1MVGE@1224,1RPTB@1236,3Z1WQ@583,COG0664@1,COG0664@2 NA|NA|NA K Cyclic nucleotide-monophosphate binding domain Z1_02967 34506.g607 8.4e-184 649.4 Bilateria Metazoa 2D21V@1,2SK49@2759,3AFUR@33154,3BXTQ@33208,3DD3N@33213 NA|NA|NA S Universal stress protein family Z1_02968 529507.PMI1201 3.1e-251 874.0 Proteus pntB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006740,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008746,GO:0008750,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016652,GO:0019362,GO:0019637,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034641,GO:0036094,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0051186,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072524,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564 1.6.1.2 ko:K00325 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R00112 RC00001 ko00000,ko00001,ko01000 iSBO_1134.SBO_1534,iYL1228.KPN_01527 Bacteria 1MUP4@1224,1RMR4@1236,3Z0VW@583,COG1282@1,COG1282@2 NA|NA|NA C The transhydrogenation between NADH and NADP is coupled to respiration and ATP hydrolysis and functions as a proton pump across the membrane Z1_02969 529507.PMI1200 1.6e-269 934.9 Proteus pntA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006740,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008746,GO:0008750,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016652,GO:0019362,GO:0019637,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034641,GO:0036094,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046983,GO:0048037,GO:0050661,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051287,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072524,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564 1.6.1.2 ko:K00324 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R00112 RC00001 ko00000,ko00001,ko01000 iEcE24377_1341.EcE24377A_1810 Bacteria 1MVXU@1224,1RN23@1236,3Z0XP@583,COG3288@1,COG3288@2 NA|NA|NA C The transhydrogenation between NADH and NADP is coupled to respiration and ATP hydrolysis and functions as a proton pump across the membrane Z1_02970 529507.PMI1199 1.5e-172 612.1 Proteus ydgH Bacteria 1MWCS@1224,1RN42@1236,28I6Q@1,2Z89M@2,3Z2GU@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1471) Z1_02971 529507.PMI1198 1.9e-248 864.8 Proteus ydgI GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03758 ko00000,ko02000 2.A.3.2 iAPECO1_1312.APECO1_688,iECOK1_1307.ECOK1_1723,iECS88_1305.ECS88_1650,iUMN146_1321.UM146_09140,iUTI89_1310.UTI89_C1793 Bacteria 1MUA2@1224,1RNND@1236,3Z1D1@583,COG0531@1,COG0531@2 NA|NA|NA E aromatic amino acid transport protein AroP K03293 Z1_02972 529507.PMI1197 7.5e-87 326.6 Bacteria Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_02973 529507.PMI1196 9.4e-121 439.5 Bacteria ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU pilus organization Z1_02974 529507.PMI1195 0.0 1550.4 Gammaproteobacteria ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Usher protein Z1_02975 529507.PMI1194 2.6e-183 647.9 Bacteria Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_02977 529507.PMI1192 0.0 2534.6 Proteus hrpA GO:0003674,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0070035,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:1901360 3.6.4.13 ko:K03578 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUEQ@1224,1RMU1@1236,3Z21I@583,COG1643@1,COG1643@2 NA|NA|NA L ATP-dependent helicase Z1_02978 529507.PMI1191 2.9e-108 397.9 Proteus azoR ko:K01118 ko00000,ko01000 Bacteria 1P59R@1224,1S337@1236,3Z352@583,COG1182@1,COG1182@2 NA|NA|NA C Catalyzes the reductive cleavage of azo bond in aromatic azo compounds to the corresponding amines. Requires NADH, but not NADPH, as an electron donor for its activity Z1_02979 529507.PMI1190 5.3e-90 337.0 Proteus Bacteria 1QG8E@1224,1TDMG@1236,3Z34J@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02980 529507.PMI1187 1e-122 446.0 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1QEDW@1224,1TB1E@1236,3Z2YY@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili and flagellar-assembly chaperone, PapD N-terminal domain Z1_02981 529507.PMI1186 0.0 1136.3 Proteus ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z1WA@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_02982 529507.PMI1186 2e-94 351.7 Proteus ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z1WA@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU Outer membrane usher protein Z1_02983 529507.PMI1185 1.2e-103 382.5 Proteus ko:K07349 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1QNIB@1224,1TM4J@1236,3Z3II@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_02984 529507.PMI1184 2e-52 211.5 Proteus ydbL ko:K09978 ko00000 Bacteria 1N6R1@1224,1SC8V@1236,3Z2TM@583,COG3784@1,COG3784@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1318) Z1_02985 529507.PMI1183 7e-27 125.9 Proteus Bacteria 1QG6F@1224,1TDJA@1236,2E371@1,31GGG@2,3Z330@583 NA|NA|NA S YnbE-like lipoprotein Z1_02986 529507.PMI1182 0.0 1762.7 Proteus ydbH GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07114 ko00000,ko02000 1.A.13.2.2,1.A.13.2.3 Bacteria 1MUT7@1224,1RQ5W@1236,3Z1XC@583,COG2911@1,COG2911@2 NA|NA|NA S Dicarboxylate transport Z1_02987 529507.PMI1181 5e-187 660.2 Proteus ldhA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004457,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006066,GO:0006067,GO:0006082,GO:0006083,GO:0006089,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006103,GO:0006105,GO:0006113,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008720,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015942,GO:0015980,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019318,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019660,GO:0019664,GO:0019666,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034308,GO:0034641,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046483,GO:0046496,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051287,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070404,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072524,GO:0097159,GO:1901135,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901615 1.1.1.28 ko:K03778 ko00620,ko01120,map00620,map01120 R00704 RC00044 ko00000,ko00001,ko01000 iPC815.YPO2329,iSFV_1184.SFV_1805,iSF_1195.SF1814,iSFxv_1172.SFxv_2031,iS_1188.S1459 Bacteria 1MVSS@1224,1RMWR@1236,3Z2BU@583,COG1052@1,COG1052@2 NA|NA|NA C D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain Z1_02988 529507.PMI1180 5.2e-199 700.7 Proteus tar ko:K03406,ko:K05874,ko:K05875,ko:K05877 ko02020,ko02030,map02020,map02030 ko00000,ko00001,ko02035 Bacteria 1MU9B@1224,1RMH0@1236,3Z1ZQ@583,COG0840@1,COG0840@2 NA|NA|NA NT chemotaxis, protein Z1_02989 529507.PMI1179 4.2e-115 420.6 Proteus tetC ko:K19047 ko00000,ko03000 Bacteria 1NB8F@1224,1S91K@1236,3Z1PM@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory proteins, tetR family Z1_02990 529507.PMI1178 7.6e-174 616.3 Proteus ko:K05804,ko:K13653,ko:K19056 M00647,M00767 ko00000,ko00002,ko03000,ko03036 Bacteria 1MWTF@1224,1RQMF@1236,3Z2D2@583,COG2207@1,COG2207@2,COG3708@1,COG3708@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_02991 529507.PMI1177 3.2e-172 610.9 Proteus ko:K06889 ko00000 Bacteria 1QU8Y@1224,1T1W5@1236,3Z2XR@583,COG2267@1,COG2267@2 NA|NA|NA I BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal Z1_02992 529507.PMI1176 1.1e-118 432.6 Proteus ybbL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019725,GO:0030003,GO:0042592,GO:0044464,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098771 ko:K02065,ko:K02068 ko02010,map02010 M00210,M00211,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27 Bacteria 1NZKM@1224,1RQ94@1236,3Z1AQ@583,COG4619@1,COG4619@2 NA|NA|NA S Rad17 cell cycle checkpoint protein Z1_02993 529507.PMI1175 9.7e-130 469.5 Proteus ybbM GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015075,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019725,GO:0022857,GO:0030003,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042592,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0098771 ko:K02069 M00211 ko00000,ko00002,ko02000 9.B.25.1 Bacteria 1MV2N@1224,1RSGA@1236,3Z2DJ@583,COG0390@1,COG0390@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0014) Z1_02994 529507.PMI1174 7.6e-87 326.2 Proteus ycgN ko:K09160 ko00000 Bacteria 1RHMX@1224,1S5XU@1236,3Z1SK@583,COG2983@1,COG2983@2 NA|NA|NA S Putative zinc- or iron-chelating domain Z1_02995 529507.PMI1173 1.1e-121 442.6 Proteus ycgM Bacteria 1MVFA@1224,1RN6Y@1236,3Z2FW@583,COG0179@1,COG0179@2 NA|NA|NA Q Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family Z1_02996 529507.PMI1172 7.9e-213 746.1 Proteus mltB ko:K08305 ko00000,ko01000,ko01011 GH103 Bacteria 1MUZ3@1224,1RMQ6@1236,3Z25Z@583,COG2951@1,COG2951@2 NA|NA|NA M Transglycosylase SLT domain Z1_02997 529507.PMI1171 4.2e-46 190.3 Proteus ycgL ko:K09902 ko00000 Bacteria 1N83J@1224,1SCCD@1236,3Z30B@583,COG3100@1,COG3100@2 NA|NA|NA S YcgL domain Z1_02998 529507.PMI1170 1.2e-123 449.1 Proteus minC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0007346,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010564,GO:0032465,GO:0032954,GO:0032955,GO:0042802,GO:0044087,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051726,GO:0060187,GO:0065007,GO:1901891,GO:1902412,GO:1903436 ko:K03610,ko:K09749 ko00000,ko03036,ko04812 Bacteria 1RHVN@1224,1S6K8@1236,3Z2Q7@583,COG0850@1,COG0850@2 NA|NA|NA D Cell division inhibitor that blocks the formation of polar Z ring septums. Rapidly oscillates between the poles of the cell to destabilize FtsZ filaments that have formed before they mature into polar Z rings. Prevents FtsZ polymerization Z1_02999 529507.PMI1169 4.1e-147 527.3 Proteus minD GO:0000166,GO:0000910,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007049,GO:0007059,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009898,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022402,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032506,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036214,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051179,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051782,GO:0060187,GO:0061640,GO:0065007,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901265,GO:1901363 ko:K03609 ko00000,ko03036,ko04812 Bacteria 1MUEU@1224,1RNJ0@1236,3Z1MV@583,COG2894@1,COG2894@2 NA|NA|NA D Anion-transporting ATPase Z1_03000 529507.PMI1168 1.7e-41 174.9 Proteus minE GO:0000278,GO:0000281,GO:0000910,GO:0000917,GO:0000918,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007049,GO:0007346,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010564,GO:0016020,GO:0016043,GO:0022402,GO:0022607,GO:0032465,GO:0032506,GO:0032954,GO:0032955,GO:0042802,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051301,GO:0051302,GO:0051726,GO:0061640,GO:0065007,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090529,GO:1901891,GO:1902410,GO:1902412,GO:1903047,GO:1903436 ko:K03608 ko00000,ko03036,ko04812 Bacteria 1N6QD@1224,1SC8W@1236,3Z2V0@583,COG0851@1,COG0851@2 NA|NA|NA D Prevents the cell division inhibition by proteins MinC and MinD at internal division sites while permitting inhibition at polar sites. This ensures cell division at the proper site by restricting the formation of a division septum at the midpoint of the long axis of the cell Z1_03001 529507.PMI1167 2.2e-215 754.6 Proteus rnd GO:0000175,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004532,GO:0004540,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008408,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016896,GO:0033890,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0140098,GO:1901360 3.1.13.5 ko:K03684 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MURV@1224,1RPBP@1236,3Z1B2@583,COG0349@1,COG0349@2 NA|NA|NA J Exonuclease involved in the 3' processing of various precursor tRNAs. Initiates hydrolysis at the 3'-terminus of an RNA molecule and releases 5'-mononucleotides Z1_03002 529507.PMI1166 0.0 1120.9 Proteus fadD GO:0001676,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004467,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006635,GO:0006637,GO:0006644,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006790,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009062,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009259,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009898,GO:0009987,GO:0015645,GO:0016020,GO:0016042,GO:0016054,GO:0016405,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016878,GO:0019395,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0030258,GO:0031406,GO:0032787,GO:0033293,GO:0033865,GO:0033875,GO:0034032,GO:0034440,GO:0034641,GO:0035383,GO:0036041,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044242,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046395,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051186,GO:0055086,GO:0055114,GO:0070538,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072329,GO:0072521,GO:0090407,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901575,GO:1901576 6.2.1.3 ko:K01897 ko00061,ko00071,ko01100,ko01212,ko02024,ko03320,ko04146,ko04216,ko04714,ko04920,map00061,map00071,map01100,map01212,map02024,map03320,map04146,map04216,map04714,map04920 M00086 R01280 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko04147 4.C.1.1 iSF_1195.SF1423,iSFxv_1172.SFxv_1611,iS_1188.S1538 Bacteria 1MU6G@1224,1RMQ4@1236,3Z2GG@583,COG0318@1,COG0318@2 NA|NA|NA IQ AMP-binding enzyme Z1_03003 529507.PMI1165 6.1e-108 396.7 Proteus slp GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0016020,GO:0019867,GO:0042802 ko:K07285 ko00000 Bacteria 1MZ8C@1224,1S9UB@1236,3Z2IV@583,COG3065@1,COG3065@2 NA|NA|NA M Outer membrane lipoprotein Slp family Z1_03004 529507.PMI1164 1.6e-126 458.8 Proteus yeaZ GO:0002949,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006508,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016787,GO:0019538,GO:0030312,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070011,GO:0070525,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901564 2.3.1.234 ko:K01409,ko:K14742 R10648 RC00070,RC00416 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MXPH@1224,1RPYX@1236,3Z0YA@583,COG1214@1,COG1214@2 NA|NA|NA O Glycoprotease family Z1_03005 529507.PMI1163 0.0 1266.5 Proteus dinG GO:0003674,GO:0003824,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006301,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:1901360 3.6.4.12 ko:K03722 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVCU@1224,1RMNX@1236,3Z1XI@583,COG1199@1,COG1199@2 NA|NA|NA KL helicase Z1_03006 529507.PMI1162 1.7e-57 228.4 Proteus yoaB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1MZ5K@1224,1S5WM@1236,3Z2PV@583,COG0251@1,COG0251@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease L-PSP Z1_03007 529507.PMI1161 1.8e-161 575.1 Proteus CT0995 Bacteria 1QRSG@1224,1RUX2@1236,3Z367@583,COG0702@1,COG0702@2 NA|NA|NA GM NmrA-like family Z1_03008 529507.PMI1159 1.2e-52 212.2 Proteus mdtI GO:0003674,GO:0005215,GO:0005326,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006836,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015199,GO:0015203,GO:0015220,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015606,GO:0015651,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015838,GO:0015846,GO:0015848,GO:0015871,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031460,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072349,GO:0072488,GO:0098655,GO:1902047,GO:1903711 ko:K03297,ko:K11742 M00711 ko00000,ko00002,ko02000 2.A.7.1,2.A.7.1.9 Bacteria 1RIBK@1224,1S68D@1236,3Z2TY@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Catalyzes the excretion of spermidine Z1_03009 529507.PMI1158 6.7e-67 260.0 Proteus mdtJ GO:0003674,GO:0005215,GO:0005326,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006836,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0015075,GO:0015101,GO:0015199,GO:0015203,GO:0015220,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015606,GO:0015651,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015838,GO:0015846,GO:0015848,GO:0015871,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031460,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072349,GO:0072488,GO:0098655,GO:1902047,GO:1903711 ko:K11743 M00711 ko00000,ko00002,ko02000 2.A.7.1.9 iAPECO1_1312.APECO1_683,iB21_1397.B21_01559,iBWG_1329.BWG_1415,iEC042_1314.EC042_1748,iEC55989_1330.EC55989_1765,iECBD_1354.ECBD_2046,iECB_1328.ECB_01569,iECDH10B_1368.ECDH10B_1733,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1543,iECD_1391.ECD_01569,iECED1_1282.ECED1_1769,iECH74115_1262.ECH74115_2310,iECIAI1_1343.ECIAI1_1650,iECNA114_1301.ECNA114_1647,iECO111_1330.ECO111_2069,iECO26_1355.ECO26_2304,iECOK1_1307.ECOK1_1718,iECP_1309.ECP_1544,iECS88_1305.ECS88_1645,iECSE_1348.ECSE_1721,iECSF_1327.ECSF_1460,iECSP_1301.ECSP_2164,iECW_1372.ECW_m1765,iECs_1301.ECs2306,iEKO11_1354.EKO11_2178,iETEC_1333.ETEC_1634,iEcDH1_1363.EcDH1_2043,iEcE24377_1341.EcE24377A_1807,iEcHS_1320.EcHS_A1674,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1599,iEcolC_1368.EcolC_2030,iG2583_1286.G2583_1994,iJO1366.b1600,iLF82_1304.LF82_1301,iNRG857_1313.NRG857_08015,iSBO_1134.SBO_1536,iSDY_1059.SDY_1553,iSFV_1184.SFV_1615,iSF_1195.SF1621,iSFxv_1172.SFxv_1817,iSSON_1240.SSON_1560,iS_1188.S1753,iSbBS512_1146.SbBS512_E1786,iUMN146_1321.UM146_09165,iUMNK88_1353.UMNK88_2059,iUTI89_1310.UTI89_C1788,iWFL_1372.ECW_m1765,iY75_1357.Y75_RS08390,iZ_1308.Z2594 Bacteria 1RJKJ@1224,1S6SR@1236,3Z2W7@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA U Catalyzes the excretion of spermidine Z1_03010 529507.PMI1157 8.8e-289 998.8 Proteus zwf GO:0003674,GO:0003824,GO:0004345,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006081,GO:0006098,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007267,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009372,GO:0009987,GO:0010699,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019318,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019693,GO:0023052,GO:0034641,GO:0042802,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051156,GO:0051186,GO:0051704,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072524,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564 1.1.1.363,1.1.1.49 ko:K00036 ko00030,ko00480,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko05230,map00030,map00480,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map05230 M00004,M00006,M00008 R00835,R02736,R10907 RC00001,RC00066 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 e_coli_core.b1852,iAF1260.b1852,iBWG_1329.BWG_1666,iE2348C_1286.E2348C_1977,iEC042_1314.EC042_2019,iECABU_c1320.ECABU_c21130,iECDH10B_1368.ECDH10B_1993,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1798,iECED1_1282.ECED1_2057,iECIAI39_1322.ECIAI39_1198,iECNA114_1301.ECNA114_1899,iECO26_1355.ECO26_2690,iECP_1309.ECP_1796,iECSF_1327.ECSF_1710,iECUMN_1333.ECUMN_2149,iECW_1372.ECW_m2026,iEKO11_1354.EKO11_1918,iEcDH1_1363.EcDH1_1789,iEcE24377_1341.EcE24377A_2082,iEcHS_1320.EcHS_A1944,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1335,iEcolC_1368.EcolC_1780,iG2583_1286.G2583_2304,iJO1366.b1852,iJR904.b1852,iLF82_1304.LF82_3733,iNRG857_1313.NRG857_09280,iSDY_1059.SDY_1138,iWFL_1372.ECW_m2026,iY75_1357.Y75_RS09725,iYL1228.KPN_02367,ic_1306.c2265 Bacteria 1MUN0@1224,1RN76@1236,3Z27D@583,COG0364@1,COG0364@2 NA|NA|NA G Catalyzes the oxidation of glucose 6-phosphate to 6- phosphogluconolactone Z1_03011 529507.PMI1156 3.6e-146 524.2 Proteus hexR GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001131,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033554,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K15835,ko:K19337 ko00000,ko03000 Bacteria 1MV3U@1224,1RNC4@1236,3Z1IG@583,COG1737@1,COG1737@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain, rpiR family Z1_03012 529507.PMI1155 2.1e-263 914.4 Proteus pyk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004743,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006096,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0022607,GO:0032787,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0040007,GO:0042802,GO:0042866,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046700,GO:0046939,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0055086,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576 2.7.1.40 ko:K00873 ko00010,ko00230,ko00620,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04922,ko04930,ko05165,ko05203,ko05230,map00010,map00230,map00620,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04922,map04930,map05165,map05203,map05230 M00001,M00002,M00049,M00050 R00200,R00430,R01138,R01858,R02320 RC00002,RC00015 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 e_coli_core.b1854,iAF1260.b1854,iB21_1397.B21_01813,iBWG_1329.BWG_1668,iEC042_1314.EC042_2021,iECBD_1354.ECBD_1784,iECB_1328.ECB_01825,iECDH10B_1368.ECDH10B_1995,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1801,iECD_1391.ECD_01825,iECO103_1326.ECO103_2044,iECO111_1330.ECO111_2362,iECO26_1355.ECO26_2692,iECUMN_1333.ECUMN_2152,iETEC_1333.ETEC_1887,iEcDH1_1363.EcDH1_1786,iEcE24377_1341.EcE24377A_2084,iEcHS_1320.EcHS_A1947,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1332,iEcolC_1368.EcolC_1778,iG2583_1286.G2583_2306,iJO1366.b1854,iJR904.b1854,iSBO_1134.SBO_1162,iSSON_1240.SSON_1294,iSbBS512_1146.SbBS512_E2130,iUMNK88_1353.UMNK88_2326,iY75_1357.Y75_RS09740 Bacteria 1MU21@1224,1RMW3@1236,3Z1SB@583,COG0469@1,COG0469@2 NA|NA|NA G Pyruvate kinase Z1_03013 529507.PMI1154 2.2e-195 688.0 Proteus lpxM GO:0003674,GO:0003824,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019637,GO:0019752,GO:0036103,GO:0036104,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046467,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.3.1.241,2.3.1.242,2.3.1.243 ko:K02517,ko:K02560,ko:K12974 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R05075,R05146,R10906 RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iECABU_c1320.ECABU_c21170,iECIAI39_1322.ECIAI39_1194,ic_1306.c2269 Bacteria 1N9ZJ@1224,1RRI7@1236,3Z12K@583,COG1560@1,COG1560@2 NA|NA|NA M Catalyzes the transfer of myristate from myristoyl-acyl carrier protein (ACP) to Kdo(2)-(lauroyl)-lipid IV(A) to form Kdo(2)-lipid A Z1_03014 529507.PMI1153 1.6e-249 868.2 Proteus yebA GO:0000270,GO:0000920,GO:0001896,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0006022,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008219,GO:0008233,GO:0008237,GO:0009987,GO:0012501,GO:0016787,GO:0019538,GO:0030203,GO:0043170,GO:0044238,GO:0051301,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901564 ko:K19304,ko:K21472 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1MVTF@1224,1RM7S@1236,3Z188@583,COG0739@1,COG0739@2 NA|NA|NA M Opacity-associated protein A LysM-like domain Z1_03015 529507.PMI1152 1.4e-170 605.5 Proteus znuA GO:0000041,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006829,GO:0008150,GO:0008270,GO:0030001,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051179,GO:0051234,GO:0070838,GO:0072511 ko:K09815 ko02010,map02010 M00242 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15.3,3.A.1.15.5 iECs_1301.ECs2567,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1329,iPC815.YPO2061,iZ_1308.Z2909 Bacteria 1QTTI@1224,1RMRJ@1236,3Z1GN@583,COG4531@1,COG4531@2 NA|NA|NA P Zinc-uptake complex component A periplasmic Z1_03016 529507.PMI1151 3.3e-132 477.6 Proteus znuC GO:0000041,GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005385,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006829,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008324,GO:0015075,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034220,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043492,GO:0046873,GO:0046915,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070838,GO:0071577,GO:0072509,GO:0072511,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1901265,GO:1901363 ko:K02074,ko:K09817,ko:K11607 ko02010,map02010 M00242,M00244,M00317 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.15,3.A.1.15.3,3.A.1.15.5,3.A.1.15.7,3.A.1.15.9 iSFV_1184.SFV_1859,iSF_1195.SF1867,iSFxv_1172.SFxv_2092,iS_1188.S1934 Bacteria 1MUDW@1224,1RPJT@1236,3Z1PU@583,COG1121@1,COG1121@2 NA|NA|NA P Part of the ABC transporter complex ZnuABC involved in zinc import. Responsible for energy coupling to the transport system Z1_03017 529507.PMI1150 2.8e-116 424.9 Proteus znuB GO:0000006,GO:0000041,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005385,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006829,GO:0008150,GO:0008324,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010043,GO:0015075,GO:0015318,GO:0016020,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0034220,GO:0042221,GO:0044464,GO:0046873,GO:0046915,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070838,GO:0071577,GO:0071944,GO:0072509,GO:0072511,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K02075,ko:K09816 ko02010,map02010 M00242,M00244 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15,3.A.1.15.3,3.A.1.15.5 iEC042_1314.EC042_2026,iECABU_c1320.ECABU_c21210,iECED1_1282.ECED1_2064,iECNA114_1301.ECNA114_1921,iECSF_1327.ECSF_1717,iECUMN_1333.ECUMN_2157,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1327,iG2583_1286.G2583_2311,iSSON_1240.SSON_1282,iYL1228.KPN_02374,ic_1306.c2273 Bacteria 1MVC2@1224,1RPYF@1236,3Z0X1@583,COG1108@1,COG1108@2 NA|NA|NA P ABC 3 transport family Z1_03018 529507.PMI1148 9e-22 109.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1N6F6@1224,1SNQV@1236,2E13J@1,32WIZ@2 NA|NA|NA Z1_03019 529507.PMI1145 4.4e-45 186.8 Bacteria Bacteria 2F7ZQ@1,340DD@2 NA|NA|NA Z1_03021 585.DR95_3583 0.0 1857.0 Proteus Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,3Z39C@583,COG3209@1,COG3209@2,COG4104@1,COG4104@2 NA|NA|NA M RHS protein Z1_03022 585.DR95_3582 4.2e-149 534.3 Proteus Bacteria 1R3ZF@1224,1TKUP@1236,3Z3G5@583,COG5351@1,COG5351@2 NA|NA|NA S Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2169) Z1_03023 529507.PMI1118 0.0 1286.9 Proteus tssI ko:K11904 ko03070,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MU7Q@1224,1RMZS@1236,3Z3CY@583,COG3501@1,COG3501@2 NA|NA|NA S vgr_GE Rhs element Vgr family protein Z1_03024 529507.PMI1117 5.6e-97 360.1 Proteus hcp ko:K06887,ko:K11903 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1MXFB@1224,1RNKQ@1236,3Z351@583,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system effector, Hcp Z1_03025 529507.PMI1116 1.3e-185 655.6 Proteus ruvB GO:0000725,GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007154,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009378,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0031668,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048476,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360 3.6.4.12 ko:K03551 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MU38@1224,1RNWY@1236,3Z1Q0@583,COG2255@1,COG2255@2 NA|NA|NA L The RuvA-RuvB complex in the presence of ATP renatures cruciform structure in supercoiled DNA with palindromic sequence, indicating that it may promote strand exchange reactions in homologous recombination. RuvAB is a helicase that mediates the Holliday junction migration by localized denaturation and reannealing Z1_03026 529507.PMI1115 1e-105 389.4 Proteus ruvA GO:0000217,GO:0000400,GO:0000724,GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009314,GO:0009378,GO:0009379,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017111,GO:0022607,GO:0031668,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0033202,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048476,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051276,GO:0051289,GO:0051716,GO:0065003,GO:0071103,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1902494 3.6.4.12 ko:K03550 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MWJR@1224,1RMET@1236,3Z21A@583,COG0632@1,COG0632@2 NA|NA|NA L The RuvA-RuvB complex in the presence of ATP renatures cruciform structure in supercoiled DNA with palindromic sequence, indicating that it may promote strand exchange reactions in homologous recombination. RuvAB is a helicase that mediates the Holliday junction migration by localized denaturation and reannealing. RuvA stimulates, in the presence of DNA, the weak ATPase activity of RuvB Z1_03027 529507.PMI1114 7.3e-89 333.2 Proteus ruvC GO:0000725,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006281,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008821,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016889,GO:0016894,GO:0031297,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045005,GO:0046483,GO:0048476,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071932,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901576 3.1.22.4 ko:K01159 ko03440,map03440 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUJI@1224,1RQPJ@1236,3Z1ZC@583,COG0817@1,COG0817@2 NA|NA|NA L Nuclease that resolves Holliday junction intermediates in genetic recombination. Cleaves the cruciform structure in supercoiled DNA by nicking to strands with the same polarity at sites symmetrically opposed at the junction in the homologous arms and leaves a 5'-terminal phosphate and a 3'-terminal hydroxyl group Z1_03028 529507.PMI1113 4.4e-135 487.3 Proteus yebC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896 Bacteria 1MW3X@1224,1RP5N@1236,3Z26S@583,COG0217@1,COG0217@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_03029 529507.PMI1112 2.4e-77 294.7 Proteus nudB GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008828,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009396,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019177,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0046655,GO:0046656,GO:0046872,GO:0047429,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.3.1.181,3.6.1.13,3.6.1.55,3.6.1.67 ko:K01515,ko:K03574,ko:K03801,ko:K08310 ko00230,ko00785,ko00790,ko01100,map00230,map00785,map00790,map01100 M00126 R01054,R04638,R07766,R07769 RC00002,RC00039,RC00992,RC02867 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iSFV_1184.SFV_1867,iSF_1195.SF1875,iSFxv_1172.SFxv_2099,iS_1188.S1941,iY75_1357.Y75_RS09795,iYL1228.KPN_02379 Bacteria 1RH6N@1224,1S20Q@1236,3Z305@583,COG0494@1,COG0494@2 NA|NA|NA L NUDIX domain Z1_03030 529507.PMI1111 0.0 1176.8 Proteus aspS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004815,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006422,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.12 ko:K01876 ko00970,map00970 M00359,M00360 R05577 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016,ko03029 iJN678.aspS,iSFV_1184.SFV_1868 Bacteria 1MUXB@1224,1RNMI@1236,3Z1FB@583,COG0173@1,COG0173@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of L-aspartate to tRNA(Asp) in a two-step reaction L-aspartate is first activated by ATP to form Asp-AMP and then transferred to the acceptor end of tRNA(Asp) Z1_03031 529507.PMI1110 3.6e-64 250.8 Proteus yecN GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07136 ko00000 Bacteria 1RDHP@1224,1S3PN@1236,3Z2NM@583,COG3788@1,COG3788@2 NA|NA|NA S MAPEG family Z1_03032 34506.g263 3.5e-140 504.2 Bilateria Metazoa 2EAI4@1,2SGRX@2759,39AK6@33154,3BXP2@33208,3DFEC@33213 NA|NA|NA S O-methyltransferase Z1_03033 529507.PMI1108 2.3e-192 677.9 Proteus cmoB GO:0002097,GO:0002098,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016765,GO:0022607,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 ko:K15257 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MVSK@1224,1RMQY@1236,3Z1YZ@583,COG0500@1,COG0500@2 NA|NA|NA J Catalyzes carboxymethyl transfer from carboxy-S- adenosyl-L-methionine (Cx-SAM) to 5-hydroxyuridine (ho5U) to form 5-carboxymethoxyuridine (cmo5U) at position 34 in tRNAs Z1_03034 529507.PMI1107 2.6e-166 591.3 Proteus yheS_2 Bacteria 1MV25@1224,1RNM9@1236,3Z15K@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains Z1_03035 529507.PMI1107 2.7e-73 281.2 Proteus yheS_2 Bacteria 1MV25@1224,1RNM9@1236,3Z15K@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains Z1_03036 529507.PMI1106 0.0 1085.1 Bacteria lprO Bacteria 2F81I@1,340F0@2 NA|NA|NA S Phosphodiester glycosidase Z1_03037 529507.PMI1105 1.5e-138 498.8 Proteus cutC GO:0006873,GO:0006875,GO:0006878,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0019725,GO:0030003,GO:0042221,GO:0042592,GO:0046688,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0055065,GO:0055070,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0065007,GO:0065008,GO:0098771 ko:K06201 ko00000 Bacteria 1MV5W@1224,1RMC1@1236,3Z2M3@583,COG3142@1,COG3142@2 NA|NA|NA P Participates in the control of copper homeostasis Z1_03038 529507.PMI1104 7.5e-100 369.8 Proteus yecM GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09907 ko00000 Bacteria 1RB98@1224,1RYG4@1236,3Z2IZ@583,COG3102@1,COG3102@2 NA|NA|NA S YecM protein Z1_03039 529507.PMI1103 0.0 1146.0 Proteus argS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004814,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006420,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.19 ko:K01887 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03646 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016,ko03029 iECABU_c1320.ECABU_c21380,iECNA114_1301.ECNA114_1940,iECSE_1348.ECSE_2111,iECSF_1327.ECSF_1736,iEcolC_1368.EcolC_1756,iJN746.PP_5089,iLF82_1304.LF82_0128,iNRG857_1313.NRG857_09405,iUMNK88_1353.UMNK88_2348,ic_1306.c2291 Bacteria 1MU4J@1224,1RPRC@1236,3Z1SY@583,COG0018@1,COG0018@2 NA|NA|NA J Arginyl tRNA synthetase N terminal dom Z1_03040 529507.PMI1102 1.6e-42 178.3 Proteus Bacteria 1QCQS@1224,1T8GS@1236,2AD6I@1,312VD@2,3Z2V9@583 NA|NA|NA Z1_03041 529507.PMI1101 5.6e-278 963.0 Proteus murJ GO:0000270,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015647,GO:0015648,GO:0015835,GO:0015836,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022857,GO:0022884,GO:0030203,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033036,GO:0034203,GO:0034204,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046836,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0061024,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097035,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901264,GO:1901505,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K03980 ko00000,ko01011,ko02000 2.A.66.4 iECO103_1326.ECO103_1114 Bacteria 1MUH0@1224,1RMXX@1236,3Z2EV@583,COG0728@1,COG0728@2 NA|NA|NA S Involved in peptidoglycan biosynthesis. Transports lipid-linked peptidoglycan precursors from the inner to the outer leaflet of the cytoplasmic membrane Z1_03042 529507.PMI1100 4.5e-111 407.1 Proteus rimJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004596,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006474,GO:0006807,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008999,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019538,GO:0031365,GO:0034212,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043543,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051604,GO:0071704,GO:1901564 2.3.1.128 ko:K03790 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MVG4@1224,1RQPX@1236,3Z1T5@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_03043 529507.PMI1099 7.1e-220 769.6 Proteus mdtH GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K06610,ko:K08162 ko00000,ko02000 2.A.1.1.27,2.A.1.2.21 Bacteria 1QS3U@1224,1RNJ6@1236,3Z1U9@583,COG0477@1,COG0477@2 NA|NA|NA U Major Facilitator Superfamily Z1_03044 529507.PMI1098 1.9e-95 355.1 Proteus yceB Bacteria 1PWBU@1224,1RPR9@1236,2CFK9@1,2Z7KF@2,3Z2IN@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1439) Z1_03045 529507.PMI1097 7.1e-98 363.2 Proteus ycdY GO:0001539,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0040011,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048870,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051674,GO:0051716,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 Bacteria 1Q3A7@1224,1RP51@1236,3Z2Q0@583,COG3381@1,COG3381@2 NA|NA|NA S Nitrate reductase delta subunit Z1_03046 529507.PMI1096 1.3e-113 415.6 Proteus ko:K07394 ko00000 Bacteria 1RD3H@1224,1S40I@1236,3Z2RG@583,COG3751@1,COG3751@2 NA|NA|NA O 2OG-Fe(II) oxygenase Z1_03047 529507.PMI1095 0.0 1792.7 Proteus Bacteria 1NP2R@1224,1SIXB@1236,2ERE3@1,33IZP@2,3Z1FG@583 NA|NA|NA Z1_03048 529507.PMI1094 2.7e-182 644.4 Proteus ghrA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016618,GO:0030267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114 1.1.1.79,1.1.1.81 ko:K12972 ko00260,ko00620,ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,map00260,map00620,map00630,map01100,map01110,map01120 R00465,R01388,R01392,R02527 RC00031,RC00042,RC00670 ko00000,ko00001,ko01000 iECOK1_1307.ECOK1_1138,iECS88_1305.ECS88_1044,iUMN146_1321.UM146_12160 Bacteria 1MW1U@1224,1RRQE@1236,3Z2FU@583,COG0111@1,COG0111@2 NA|NA|NA C D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain Z1_03050 529507.PMI1093 2e-305 1054.3 Proteus sulP GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005310,GO:0005326,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006836,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008272,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015116,GO:0015138,GO:0015141,GO:0015171,GO:0015172,GO:0015179,GO:0015183,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015556,GO:0015698,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015741,GO:0015744,GO:0015800,GO:0015807,GO:0015810,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070778,GO:0071422,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072348,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:1901682,GO:1902358,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03321 ko00000,ko02000 2.A.53.3 iSbBS512_1146.SbBS512_E1370 Bacteria 1MVWV@1224,1RMCN@1236,3Z23K@583,COG0659@1,COG0659@2 NA|NA|NA P Sulfate permease family Z1_03051 529507.PMI1092 7.4e-40 169.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1N85C@1224,1T0NH@1236,COG4453@1,COG4453@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1778) Z1_03052 529507.PMI1091 3.1e-183 647.5 Proteus yhcC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540 ko:K07139 ko00000 Bacteria 1MUYF@1224,1RP94@1236,3Z1YU@583,COG1242@1,COG1242@2 NA|NA|NA S Radical_SAM C-terminal domain Z1_03053 529507.PMI1090 1.9e-158 565.1 Proteus kdsA GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005996,GO:0006082,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008676,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016051,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019294,GO:0019752,GO:0022607,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046364,GO:0046394,GO:0046400,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 2.5.1.55 ko:K01627 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00063 R03254 RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1MV91@1224,1RMGQ@1236,3Z1S8@583,COG2877@1,COG2877@2 NA|NA|NA F DAHP synthetase I family Z1_03054 529507.PMI1089 4.1e-147 527.3 Proteus ychA Bacteria 1MVJQ@1224,1RQ7V@1236,3Z1R6@583,COG2912@1,COG2912@2 NA|NA|NA S Transglutaminase-like superfamily Z1_03055 529507.PMI1088 1e-156 559.3 Proteus prmC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006464,GO:0006479,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008213,GO:0008276,GO:0008757,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0016043,GO:0016740,GO:0016741,GO:0018364,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022411,GO:0032259,GO:0032984,GO:0034641,GO:0034645,GO:0036009,GO:0036211,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050789,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.297,2.1.1.298 ko:K02493,ko:K02835,ko:K07320 R10806 RC00003,RC03279 ko00000,ko01000,ko03009,ko03012 Bacteria 1MXCQ@1224,1RNGK@1236,3Z2EM@583,COG2890@1,COG2890@2 NA|NA|NA J Methylates the class 1 translation termination release factors RF1 PrfA and RF2 PrfB on the glutamine residue of the universally conserved GGQ motif Z1_03056 529507.PMI1087 1.1e-190 672.5 Proteus prfA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003747,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006415,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008079,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016149,GO:0019538,GO:0022411,GO:0032984,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043624,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02835,ko:K15034 ko00000,ko03012 Bacteria 1MV28@1224,1RM7Q@1236,3Z1G7@583,COG0216@1,COG0216@2 NA|NA|NA J peptide chain release factor Z1_03057 529507.PMI1086 4.8e-227 793.5 Proteus hemA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006536,GO:0006725,GO:0006778,GO:0006779,GO:0006782,GO:0006783,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008883,GO:0009058,GO:0009064,GO:0009288,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016620,GO:0016903,GO:0018130,GO:0019353,GO:0019438,GO:0019752,GO:0033013,GO:0033014,GO:0033526,GO:0034641,GO:0042168,GO:0042440,GO:0042597,GO:0042802,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044464,GO:0046148,GO:0046483,GO:0046501,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055040,GO:0055114,GO:0071704,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 1.2.1.70 ko:K02407,ko:K02492 ko00860,ko01100,ko01110,ko01120,ko02040,map00860,map01100,map01110,map01120,map02040 M00121 R04109 RC00055,RC00149 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02035 iECNA114_1301.ECNA114_1375,iECSF_1327.ECSF_1186,iSB619.SA_RS08420,iUTI89_1310.UTI89_C1404 Bacteria 1MU41@1224,1RNQ8@1236,3Z1H5@583,COG0373@1,COG0373@2 NA|NA|NA H glutamyl-tRNA reductase Z1_03058 529507.PMI1085 1.4e-118 432.2 Proteus lolB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006807,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009279,GO:0010876,GO:0016020,GO:0019538,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0033218,GO:0034613,GO:0042157,GO:0042277,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044462,GO:0044464,GO:0044872,GO:0044873,GO:0044874,GO:0051179,GO:0051641,GO:0051668,GO:0070727,GO:0071704,GO:0071723,GO:0071944,GO:0072657,GO:1901564 ko:K02494 ko00000 Bacteria 1N02T@1224,1S91E@1236,3Z1QA@583,COG3017@1,COG3017@2 NA|NA|NA M Plays a critical role in the incorporation of lipoproteins in the outer membrane after they are released by the LolA protein Z1_03059 529507.PMI1084 3.5e-168 597.4 Proteus ispE GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005524,GO:0006629,GO:0006720,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008299,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0050515,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901576 2.1.1.182,2.7.1.148 ko:K00919,ko:K02528,ko:K16924 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096,M00582 R05634,R10716 RC00002,RC00003,RC01439,RC03257 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000,ko03009 3.A.1.29 iEC55989_1330.EC55989_1304,iLJ478.TM1383,iYO844.BSU00460 Bacteria 1MVU3@1224,1RP23@1236,3Z1JM@583,COG1947@1,COG1947@2 NA|NA|NA F Catalyzes the phosphorylation of the position 2 hydroxy group of 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol Z1_03060 529507.PMI1083 9.6e-172 609.4 Proteus prs GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004749,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006015,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009165,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016778,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042301,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046390,GO:0046391,GO:0046483,GO:0046872,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0072522,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.6.1 ko:K00948 ko00030,ko00230,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00030,map00230,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230 M00005 R01049 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b1207,iAPECO1_1312.APECO1_323,iB21_1397.B21_01192,iBWG_1329.BWG_1032,iE2348C_1286.E2348C_1330,iEC042_1314.EC042_1264,iEC55989_1330.EC55989_1303,iECABU_c1320.ECABU_c14780,iECBD_1354.ECBD_2414,iECB_1328.ECB_01182,iECDH10B_1368.ECDH10B_1260,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1146,iECD_1391.ECD_01182,iECED1_1282.ECED1_1355,iECH74115_1262.ECH74115_1688,iECIAI1_1343.ECIAI1_1228,iECIAI39_1322.ECIAI39_1543,iECNA114_1301.ECNA114_1372,iECO103_1326.ECO103_1309,iECO111_1330.ECO111_1536,iECO26_1355.ECO26_1720,iECOK1_1307.ECOK1_1360,iECP_1309.ECP_1255,iECS88_1305.ECS88_1275,iECSE_1348.ECSE_1257,iECSF_1327.ECSF_1183,iECSP_1301.ECSP_1597,iECUMN_1333.ECUMN_1504,iECW_1372.ECW_m1293,iECs_1301.ECs1712,iEKO11_1354.EKO11_2647,iETEC_1333.ETEC_1311,iEcDH1_1363.EcDH1_2440,iEcE24377_1341.EcE24377A_1355,iEcHS_1320.EcHS_A1312,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1935,iEcolC_1368.EcolC_2419,iG2583_1286.G2583_1478,iJO1366.b1207,iJR904.b1207,iLF82_1304.LF82_1744,iLJ478.TM1628,iNRG857_1313.NRG857_06180,iSBO_1134.SBO_1860,iSDY_1059.SDY_1256,iSSON_1240.SSON_1971,iUMN146_1321.UM146_11025,iUMNK88_1353.UMNK88_1523,iUTI89_1310.UTI89_C1401,iWFL_1372.ECW_m1293,iY75_1357.Y75_RS06300,ic_1306.c1665 Bacteria 1MW21@1224,1RMUC@1236,3Z2DY@583,COG0462@1,COG0462@2 NA|NA|NA F Involved in the biosynthesis of the central metabolite phospho-alpha-D-ribosyl-1-pyrophosphate (PRPP) via the transfer of pyrophosphoryl group from ATP to 1-hydroxyl of ribose-5-phosphate (Rib-5-P) Z1_03061 529507.PMI1082 4.5e-45 186.8 Proteus ychH GO:0000302,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0033554,GO:0034599,GO:0034614,GO:0035690,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042542,GO:0042710,GO:0044010,GO:0044011,GO:0044764,GO:0046677,GO:0046686,GO:0050896,GO:0051703,GO:0051704,GO:0051716,GO:0070301,GO:0070887,GO:0071236,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071276,GO:0090605,GO:0090609,GO:0097237,GO:1901700,GO:1901701 Bacteria 1MZI6@1224,1S8Y3@1236,2DB54@1,32TWR@2,3Z2TV@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2583) Z1_03062 529507.PMI1081 7.9e-108 396.4 Proteus pth GO:0003674,GO:0003824,GO:0004045,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006508,GO:0006515,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019538,GO:0030163,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0051603,GO:0052689,GO:0071704,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.1.1.29 ko:K01056 ko00000,ko01000,ko03012 Bacteria 1MX1P@1224,1RPK3@1236,3Z2VS@583,COG0193@1,COG0193@2 NA|NA|NA J The natural substrate for this enzyme may be peptidyl- tRNAs which drop off the ribosome during protein synthesis Z1_03063 529507.PMI1080 7.6e-205 719.5 Proteus ychF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004857,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0030234,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043023,GO:0043086,GO:0044092,GO:0044424,GO:0044464,GO:0044877,GO:0050790,GO:0050896,GO:0065007,GO:0065009,GO:0098772 ko:K06942 ko00000,ko03009 Bacteria 1MVM4@1224,1RMBI@1236,3Z0XN@583,COG0012@1,COG0012@2 NA|NA|NA J ATPase that binds to both the 70S ribosome and the 50S ribosomal subunit in a nucleotide-independent manner Z1_03064 34506.g796 1.2e-105 389.4 Rhabditida Nematoda 1M774@119089,2RUH5@2759,39GM2@33154,3C0QT@33208,3DH12@33213,40PPX@6231,415TA@6236,COG3209@1 NA|NA|NA M RHS Repeat Z1_03065 34506.g796 4.3e-21 106.7 Rhabditida Nematoda 1M774@119089,2RUH5@2759,39GM2@33154,3C0QT@33208,3DH12@33213,40PPX@6231,415TA@6236,COG3209@1 NA|NA|NA M RHS Repeat Z1_03066 529507.PMI1067 4.1e-95 354.0 Bacteria Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_03068 529507.PMI1065 3.4e-89 334.3 Bacteria yadL Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_03069 529507.PMI1064 2.9e-190 671.0 Bacteria Bacteria COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_03070 529507.PMI1063 2.3e-119 434.9 Proteus ko:K07346,ko:K12519 ko00000,ko02035,ko02044,ko03110 Bacteria 1RFTM@1224,1S4DY@1236,3Z3G0@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA NU Pili assembly chaperone PapD, C-terminal domain Z1_03071 529507.PMI1062 0.0 1560.4 Proteus Bacteria 1R5NY@1224,1RUUI@1236,3Z3B3@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU PapC N-terminal domain Z1_03072 529507.PMI1061 2.8e-88 331.3 Gammaproteobacteria ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1NC7G@1224,1SDRA@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_03073 529507.PMI1060 1.1e-40 172.2 Gammaproteobacteria ko:K20374 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1P6GB@1224,1SVA0@1236,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain Z1_03074 529507.PMI1059 3.7e-159 567.4 Proteus budA GO:0003674,GO:0003824,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0047605 4.1.1.5 ko:K01575 ko00650,ko00660,map00650,map00660 R02948 RC00812 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWDZ@1224,1RM8Q@1236,3Z0ZD@583,COG3527@1,COG3527@2 NA|NA|NA Q Alpha-acetolactate decarboxylase Z1_03075 529507.PMI1058 0.0 1105.5 Proteus alsS 2.2.1.6 ko:K01652 ko00290,ko00650,ko00660,ko00770,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00290,map00650,map00660,map00770,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00570 R00006,R00014,R00226,R03050,R04672,R04673,R08648 RC00027,RC00106,RC01192,RC02744,RC02893 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU6U@1224,1RR00@1236,3Z1Z9@583,COG0028@1,COG0028@2 NA|NA|NA H Belongs to the TPP enzyme family Z1_03076 529507.PMI1057 1.5e-81 308.9 Proteus ko:K03975 ko00000 Bacteria 1RJUB@1224,1S813@1236,3Z2HU@583,COG0586@1,COG0586@2 NA|NA|NA S SNARE associated Golgi protein Z1_03077 529507.PMI1056 2.3e-190 671.4 Proteus ko:K07080 ko00000 Bacteria 1NSTZ@1224,1RP8B@1236,3Z15D@583,COG2358@1,COG2358@2 NA|NA|NA S NMT1-like family Z1_03078 529507.PMI1055 0.0 1190.3 Proteus Bacteria 1MUNB@1224,1RMH7@1236,3Z1HU@583,COG4666@1,COG4666@2 NA|NA|NA S TRAP transporter, 4TM 12TM fusion Z1_03079 529507.PMI1054 1.9e-124 451.8 Proteus ko:K05799 ko00000,ko03000 Bacteria 1R68P@1224,1S3JS@1236,3Z1IS@583,COG2186@1,COG2186@2 NA|NA|NA K FadR C-terminal domain Z1_03080 529507.PMI1053 7.5e-230 802.7 Proteus lhgO 1.1.99.2 ko:K00109,ko:K15736 ko00650,map00650 R03534 RC00031 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N0QB@1224,1RN24@1236,3Z2B0@583,COG0579@1,COG0579@2 NA|NA|NA S FAD dependent oxidoreductase Z1_03081 529507.PMI1052 1.2e-64 252.3 Proteus pqrA ko:K05804,ko:K13652,ko:K13653 M00647,M00767 ko00000,ko00002,ko03000,ko03036 Bacteria 1REVN@1224,1S5F2@1236,3Z2KS@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_03082 529507.PMI1051 1.8e-195 688.3 Proteus lplA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009106,GO:0009107,GO:0009108,GO:0009249,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016979,GO:0017118,GO:0018065,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032787,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051604,GO:0071704,GO:0072330,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 6.3.1.20 ko:K03800 ko00785,ko01100,map00785,map01100 R07770,R07771,R11143 RC00043,RC00070,RC00090,RC00992,RC02896 ko00000,ko00001,ko01000 iBWG_1329.BWG_4078,iE2348C_1286.E2348C_4684,iECDH10B_1368.ECDH10B_4544,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_4242,iEcDH1_1363.EcDH1_3612,iJO1366.b4386,iSDY_1059.SDY_4647,iY75_1357.Y75_RS22890 Bacteria 1N1T8@1224,1RMGI@1236,3Z1YW@583,COG0095@1,COG0095@2 NA|NA|NA H Catalyzes both the ATP-dependent activation of exogenously supplied lipoate to lipoyl-AMP and the transfer of the activated lipoyl onto the lipoyl domains of lipoate-dependent enzymes Z1_03083 529507.PMI1050 9e-91 339.7 Proteus nlpC 3.4.17.13 ko:K13694,ko:K13695 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1N0EE@1224,1RR2X@1236,3Z2J6@583,COG0791@1,COG0791@2 NA|NA|NA M NlpC/P60 family Z1_03084 529507.PMI1049 1.6e-67 261.9 Proteus arnF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010041,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K12962,ko:K12963 ko01503,map01503 M00721 ko00000,ko00001,ko00002,ko01005,ko02000 2.A.7,2.A.7.22 iECUMN_1333.ECUMN_2601,iSF_1195.SF2337,iS_1188.S2471 Bacteria 1N7ZX@1224,1SCDW@1236,3Z2PI@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA P Translocates 4-amino-4-deoxy-L-arabinose- phosphoundecaprenol (alpha-L-Ara4N-phosphoundecaprenol) from the cytoplasmic to the periplasmic side of the inner membrane Z1_03085 529507.PMI1048 6.1e-52 209.9 Proteus arnE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010041,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K03297,ko:K12962,ko:K12963 ko01503,map01503 M00721 ko00000,ko00001,ko00002,ko01005,ko02000 2.A.7,2.A.7.1,2.A.7.22 iEC55989_1330.EC55989_2505,iECABU_c1320.ECABU_c25920,iLF82_1304.LF82_3058,iNRG857_1313.NRG857_11450,ic_1306.c2800 Bacteria 1N25R@1224,1S928@1236,3Z31W@583,COG2076@1,COG2076@2 NA|NA|NA U Translocates 4-amino-4-deoxy-L-arabinose- phosphoundecaprenol (alpha-L-Ara4N-phosphoundecaprenol) from the cytoplasmic to the periplasmic side of the inner membrane Z1_03086 529507.PMI1047 0.0 1098.6 Proteus arnT 2.4.2.43 ko:K07264 ko01503,map01503 M00721 R09773,R09774,R09781 RC00005 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003,ko01005 Bacteria 1NMIZ@1224,1RMA2@1236,3Z1IM@583,COG1807@1,COG1807@2 NA|NA|NA I Catalyzes the transfer of the L-Ara4N moiety of the glycolipid undecaprenyl phosphate-alpha-L-Ara4N to lipid A. The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_03087 529507.PMI1046 5.7e-174 616.7 Proteus arnD GO:0005575,GO:0008150,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010041,GO:0016020,GO:0042221,GO:0050896 ko:K13014 ko00520,ko01503,map00520,map01503 M00721,M00761 R07662 RC00323,RC01575 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iAF987.Gmet_0882,iB21_1397.B21_02141,iBWG_1329.BWG_2029,iEC042_1314.EC042_2499,iECBD_1354.ECBD_1403,iECB_1328.ECB_02182,iECDH10B_1368.ECDH10B_2416,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2192,iECD_1391.ECD_02182,iECO103_1326.ECO103_2722,iECO111_1330.ECO111_3006,iECO26_1355.ECO26_3246,iECUMN_1333.ECUMN_2597,iECW_1372.ECW_m2447,iEKO11_1354.EKO11_1508,iETEC_1333.ETEC_2390,iEcDH1_1363.EcDH1_1402,iEcHS_1320.EcHS_A2401,iEcolC_1368.EcolC_1393,iJO1366.b2256,iSFV_1184.SFV_2326,iSSON_1240.SSON_2317,iUMNK88_1353.UMNK88_2808,iWFL_1372.ECW_m2447,iY75_1357.Y75_RS11830 Bacteria 1N8Q4@1224,1RQ0R@1236,3Z2G2@583,COG0726@1,COG0726@2 NA|NA|NA G Catalyzes the deformylation of 4-deoxy-4-formamido-L- arabinose-phosphoundecaprenol to 4-amino-4-deoxy-L-arabinose- phosphoundecaprenol. The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_03088 529507.PMI1045 0.0 1346.3 Proteus arnA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006040,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016831,GO:0018130,GO:0019438,GO:0022607,GO:0033319,GO:0033320,GO:0034214,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046349,GO:0046483,GO:0046677,GO:0048037,GO:0048040,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051287,GO:0055086,GO:0055114,GO:0065003,GO:0070403,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0099618,GO:0099619,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:2001313,GO:2001315 1.1.1.305,2.1.2.13,2.1.2.9,5.1.3.2 ko:K00604,ko:K01784,ko:K10011,ko:K12449,ko:K21332 ko00052,ko00520,ko00523,ko00670,ko00970,ko01100,ko01130,ko01503,map00052,map00520,map00523,map00670,map00970,map01100,map01130,map01503 M00361,M00362,M00632,M00721,M00761 R00291,R01384,R01386,R02984,R03940,R07658,R07660,R11472 RC00026,RC00165,RC00289,RC00508,RC01575,RC01811,RC01812 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iPC815.YPO2420,iSFV_1184.SFV_2325 Bacteria 1MXKV@1224,1RNJD@1236,3Z2BY@583,COG0223@1,COG0223@2,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA I Bifunctional enzyme that catalyzes the oxidative decarboxylation of UDP-glucuronic acid (UDP-GlcUA) to UDP-4-keto- arabinose (UDP-Ara4O) and the addition of a formyl group to UDP-4- amino-4-deoxy-L-arabinose (UDP-L-Ara4N) to form UDP-L-4-formamido- arabinose (UDP-L-Ara4FN). The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_03089 529507.PMI1044 3e-176 624.4 Proteus arnC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0044464,GO:0071944,GO:0099621 2.4.2.53 ko:K10012 ko00520,ko01503,map00520,map01503 M00721,M00761 R07661 RC00005,RC02954 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko02000 4.D.2.1.8 GT2 iAPECO1_1312.APECO1_4307,iE2348C_1286.E2348C_2398,iECABU_c1320.ECABU_c25880,iECED1_1282.ECED1_2720,iECOK1_1307.ECOK1_2490,iECP_1309.ECP_2297,iECS88_1305.ECS88_2403,iLF82_1304.LF82_0138,iNRG857_1313.NRG857_11430,iUMN146_1321.UM146_05530,iUTI89_1310.UTI89_C2536,ic_1306.c2796 Bacteria 1MWE5@1224,1RPCE@1236,3Z1DS@583,COG0463@1,COG0463@2 NA|NA|NA M Catalyzes the transfer of 4-deoxy-4-formamido-L- arabinose from UDP to undecaprenyl phosphate. The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_03090 529507.PMI1043 8.2e-218 762.7 Proteus arnB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008144,GO:0008483,GO:0016740,GO:0016769,GO:0019842,GO:0030170,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0097159,GO:0099620,GO:1901363 2.6.1.87 ko:K07806 ko00520,ko01503,ko02020,map00520,map01503,map02020 M00721,M00761 R07659 RC00006,RC01514 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko01007 iSFxv_1172.SFxv_2574 Bacteria 1MUPN@1224,1RMCS@1236,3Z1W6@583,COG0399@1,COG0399@2 NA|NA|NA M Catalyzes the conversion of UDP-4-keto-arabinose (UDP- Ara4O) to UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose (UDP-L-Ara4N). The modified arabinose is attached to lipid A and is required for resistance to polymyxin and cationic antimicrobial peptides Z1_03091 529507.PMI1042 4e-136 490.7 Proteus btuD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008144,GO:0008150,GO:0015238,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015420,GO:0015889,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019898,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0035461,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051181,GO:0051184,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0090482,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 3.6.3.33 ko:K06074 ko02010,map02010 M00241 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.13 iEC042_1314.EC042_1876,iEC55989_1330.EC55989_1877,iECIAI1_1343.ECIAI1_1765,iECIAI39_1322.ECIAI39_1344,iECSE_1348.ECSE_1834,iECUMN_1333.ECUMN_2000,iECW_1372.ECW_m1878,iEKO11_1354.EKO11_2066,iETEC_1333.ETEC_1742,iEcE24377_1341.EcE24377A_1928,iEcHS_1320.EcHS_A1789,iEcSMS35_1347.EcSMS35_1481,iEcolC_1368.EcolC_1922,iSDY_1059.SDY_1804,iSFV_1184.SFV_1514,iSF_1195.SF1522,iSFxv_1172.SFxv_1705,iSSON_1240.SSON_1449,iS_1188.S1639,iUMNK88_1353.UMNK88_2172,iWFL_1372.ECW_m1878 Bacteria 1NXS9@1224,1RRMD@1236,3Z12X@583,COG4138@1,COG4138@2 NA|NA|NA H ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_03092 529507.PMI1041 7.3e-173 613.2 Proteus btuC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015238,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015420,GO:0015889,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0035461,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042802,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051180,GO:0051181,GO:0051184,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0090482,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K06073 ko02010,map02010 M00241 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.13 iECO103_1326.ECO103_1855,iECO111_1330.ECO111_2181,iECO26_1355.ECO26_2440,iECW_1372.ECW_m1880,iEKO11_1354.EKO11_2064,iEcHS_1320.EcHS_A1791,iEcolC_1368.EcolC_1920,iWFL_1372.ECW_m1880 Bacteria 1R34H@1224,1RR7W@1236,3Z179@583,COG4139@1,COG4139@2 NA|NA|NA P FecCD transport family Z1_03093 529507.PMI1040 3e-47 194.1 Proteus himA GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001216,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032774,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2001141 ko:K04764 ko00000,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1RH5Z@1224,1S61Z@1236,3Z2ZD@583,COG0776@1,COG0776@2 NA|NA|NA K This protein is one of the two subunits of integration host factor, a specific DNA-binding protein that functions in genetic recombination as well as in transcriptional and translational control Z1_03094 529507.PMI1039 0.0 1578.5 Proteus pheT GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004826,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006432,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009328,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902494 6.1.1.20 ko:K01890 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03660 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iG2583_1286.G2583_2160,iPC815.YPO2428 Bacteria 1MWKS@1224,1RMIH@1236,3Z2CR@583,COG0072@1,COG0072@2,COG0073@1,COG0073@2 NA|NA|NA J B3/4 domain Z1_03095 529507.PMI1038 3.5e-185 654.1 Proteus pheS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004826,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006432,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009328,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902494 6.1.1.20 ko:K01889 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03660 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iJN746.PP_2469,iSSON_1240.SSON_1444,iYL1228.KPN_02176 Bacteria 1MVD7@1224,1RN22@1236,3Z2EZ@583,COG0016@1,COG0016@2 NA|NA|NA J Belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family. Phe-tRNA synthetase alpha subunit type 1 subfamily Z1_03096 529507.PMI1037 3.1e-54 217.6 Proteus rplT GO:0000027,GO:0000900,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006355,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0030371,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045182,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070180,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0090079,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903506,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K02887 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RGU2@1224,1S3P3@1236,3Z2SW@583,COG0292@1,COG0292@2 NA|NA|NA J Binds directly to 23S ribosomal RNA and is necessary for the in vitro assembly process of the 50S ribosomal subunit. It is not involved in the protein synthesizing functions of that subunit Z1_03097 529507.PMI1036 2.1e-28 131.0 Proteus rpmI GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0015934,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:1990904 ko:K02916 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1N6V4@1224,1SCHI@1236,3Z31D@583,COG0291@1,COG0291@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein L35 Z1_03098 529507.PMI1035 1.4e-53 215.3 Proteus infC GO:0000049,GO:0001731,GO:0002181,GO:0002183,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003743,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022411,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031334,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032790,GO:0032984,GO:0032988,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043024,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043254,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045727,GO:0045948,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070992,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901193,GO:1901195,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903008,GO:1904688,GO:1904690,GO:1990856,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000765,GO:2000767 ko:K02520 ko00000,ko03012,ko03029 Bacteria 1RDD2@1224,1S4E6@1236,3Z2PT@583,COG0290@1,COG0290@2 NA|NA|NA J IF-3 binds to the 30S ribosomal subunit and shifts the equilibrum between 70S ribosomes and their 50S and 30S subunits in favor of the free subunits, thus enhancing the availability of 30S subunits on which protein synthesis initiation begins Z1_03099 529507.PMI1034 0.0 1324.7 Proteus thrS GO:0000166,GO:0000900,GO:0002161,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004829,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006418,GO:0006435,GO:0006446,GO:0006450,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016874,GO:0016875,GO:0017076,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0030371,GO:0030554,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045182,GO:0045947,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048027,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0052689,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090079,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2000112,GO:2000113 6.1.1.3 ko:K01868 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03663 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iPC815.YPO2433,iSDY_1059.SDY_1814 Bacteria 1MUP2@1224,1RMYE@1236,3Z21G@583,COG0441@1,COG0441@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of threonine to tRNA(Thr) in a two-step reaction L-threonine is first activated by ATP to form Thr-AMP and then transferred to the acceptor end of tRNA(Thr) Z1_03100 529507.PMI1033 2.1e-176 624.8 Gammaproteobacteria ydeQ ko:K07350 ko00000,ko02035,ko02044 Bacteria 1RCUS@1224,1S3EA@1236,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU cell adhesion Z1_03101 529507.PMI1032 7.6e-126 456.4 Proteus ko:K02529 ko00000,ko03000 Bacteria 1QUDV@1224,1SA0D@1236,3Z2S6@583,COG4977@1,COG4977@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_03102 529507.PMI1031 6e-55 219.9 Proteus csaA GO:0000049,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0017101,GO:0017102,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.10,6.1.1.20,6.1.1.6 ko:K01874,ko:K01890,ko:K04566,ko:K06878 ko00450,ko00970,map00450,map00970 M00359,M00360 R03658,R03659,R03660,R04773 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 Bacteria 1RGU7@1224,1S6NH@1236,3Z2RU@583,COG0073@1,COG0073@2 NA|NA|NA J Putative tRNA binding domain Z1_03103 529507.PMI1030 6.6e-110 403.3 Proteus Bacteria 1MXEE@1224,1S427@1236,3Z1DZ@583,COG1670@1,COG1670@2 NA|NA|NA J Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_03104 529507.PMI1029 1.5e-124 452.2 Proteus marC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K05595 ko00000,ko02000 2.A.95.1 Bacteria 1MV1C@1224,1RPM8@1236,3Z1VB@583,COG2095@1,COG2095@2 NA|NA|NA U MarC family integral membrane protein Z1_03105 529507.PMI1028 1.1e-127 462.6 Proteus emtA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008932,GO:0008933,GO:0009279,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016757,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0061783,GO:0071944 ko:K08306,ko:K08308,ko:K08309 ko00000,ko01000,ko01011 GH23 iAF1260.b1193,iB21_1397.B21_01178,iBWG_1329.BWG_1018,iECBD_1354.ECBD_2429,iECB_1328.ECB_01168,iECDH10B_1368.ECDH10B_1246,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1132,iECD_1391.ECD_01168,iEcDH1_1363.EcDH1_2455,iEcolC_1368.EcolC_2432,iJO1366.b1193,iUMNK88_1353.UMNK88_1507,iY75_1357.Y75_RS06225 Bacteria 1MWFU@1224,1RRJC@1236,3Z1EA@583,COG0741@1,COG0741@2 NA|NA|NA M Transglycosylase SLT domain Z1_03106 529507.PMI1027 1e-170 605.9 Proteus sitA GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0042221,GO:0042597,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071281 ko:K09818,ko:K11601,ko:K11604,ko:K11704,ko:K19971,ko:K19975,ko:K19976 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00243,M00316,M00317,M00318,M00791,M00792 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15,3.A.1.15.1,3.A.1.15.14,3.A.1.15.15,3.A.1.15.2,3.A.1.15.6,3.A.1.15.7,3.A.1.15.9 iECED1_1282.ECED1_1296 Bacteria 1MVW9@1224,1RRM3@1236,3Z1PI@583,COG0803@1,COG0803@2 NA|NA|NA P Zinc-uptake complex component A periplasmic Z1_03107 34506.g964 3.3e-166 590.9 Eukaryota Eukaryota COG1131@1,KOG0061@2759 NA|NA|NA V ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances Z1_03108 529507.PMI1025 1.7e-157 562.0 Proteus sitC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010043,GO:0016020,GO:0042221,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071281,GO:0071944 ko:K11602,ko:K11605,ko:K11606 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00316,M00317 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15.1,3.A.1.15.7,3.A.1.15.9 iECED1_1282.ECED1_1294,iECP_1309.ECP_1190,iPC815.YPO2441 Bacteria 1MY5X@1224,1RPCD@1236,3Z1EM@583,COG1108@1,COG1108@2 NA|NA|NA P ABC 3 transport family Z1_03109 529507.PMI1024 1.5e-147 528.9 Proteus sitD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010043,GO:0016020,GO:0042221,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071281,GO:0071944 ko:K11602,ko:K11606 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00316,M00317 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.15.1,3.A.1.15.7,3.A.1.15.9 iEC042_1314.EC042_1518 Bacteria 1MVC2@1224,1RPBE@1236,3Z1UQ@583,COG1108@1,COG1108@2 NA|NA|NA P ABC 3 transport family Z1_03110 529507.PMI1023 1.9e-174 618.2 Proteus yniA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0044237 Bacteria 1MVHX@1224,1RRC5@1236,3Z2BJ@583,COG3001@1,COG3001@2 NA|NA|NA G Fructosamine kinase Z1_03111 529507.PMI1022 1.5e-92 345.5 Proteus yniB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1QISB@1224,1RP93@1236,28IJC@1,2Z8K9@2,3Z290@583 NA|NA|NA S YniB-like protein Z1_03112 529507.PMI1021 1.3e-119 435.6 Proteus yniC GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003850,GO:0004346,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050084,GO:0050286,GO:0050308,GO:0050309 3.1.3.23 ko:K19270 ko00000,ko01000 Bacteria 1NF90@1224,1RNP8@1236,3Z1PW@583,COG0637@1,COG0637@2 NA|NA|NA S Haloacid dehalogenase-like hydrolase Z1_03113 529507.PMI1020 1.1e-103 382.5 Proteus ydjM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016020,GO:0031668,GO:0033554,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071944 ko:K07038 ko00000 Bacteria 1Q0WR@1224,1RU1K@1236,3Z1JU@583,COG1988@1,COG1988@2 NA|NA|NA S LexA-binding, inner membrane-associated putative hydrolase Z1_03114 529507.PMI1019 1.2e-239 835.5 Proteus ydjN GO:0000099,GO:0000101,GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006791,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015179,GO:0015184,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015811,GO:0015849,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072348,GO:0072349,GO:0098656,GO:1901682,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K06956 ko00000 Bacteria 1R3F8@1224,1RMHV@1236,3Z1KV@583,COG1823@1,COG1823@2 NA|NA|NA U Belongs to the dicarboxylate amino acid cation symporter (DAACS) (TC 2.A.23) family Z1_03115 529507.PMI1018 4.9e-154 550.4 Proteus htpX GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004222,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008237,GO:0008270,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0019538,GO:0031224,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 ko:K03799 M00743 ko00000,ko00002,ko01000,ko01002 Bacteria 1MUV4@1224,1RMN0@1236,3Z1Y9@583,COG0501@1,COG0501@2 NA|NA|NA O Peptidase family M48 Z1_03116 529507.PMI1017 1e-267 928.7 Proteus Bacteria 1MY4U@1224,1S019@1236,28JSK@1,2Z9I0@2,3Z1GT@583 NA|NA|NA S outer membrane porin, OprD family Z1_03117 529507.PMI1016 0.0 1338.9 Proteus prc GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006508,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016787,GO:0019538,GO:0023052,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564 3.4.21.102 ko:K03797 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU39@1224,1RMSR@1236,3Z1NE@583,COG0793@1,COG0793@2 NA|NA|NA M tail-specific protease precursor (protease RE) (PRC protein) K03797 Z1_03118 529507.PMI1015 2.9e-109 401.4 Proteus proQ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003725,GO:0003727,GO:0003729,GO:0003730,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0006974,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007231,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010608,GO:0010958,GO:0019222,GO:0023052,GO:0032879,GO:0032890,GO:0032892,GO:0033554,GO:0033592,GO:0034057,GO:0034762,GO:0034764,GO:0034765,GO:0034767,GO:0042538,GO:0042710,GO:0043269,GO:0043270,GO:0044010,GO:0044070,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044764,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051952,GO:0051954,GO:0051955,GO:0051957,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070881,GO:0071214,GO:0071470,GO:0071472,GO:0071474,GO:0071475,GO:0097159,GO:0097617,GO:0104004,GO:1901363,GO:1902834,GO:1902836,GO:1903789,GO:1903793,GO:1903959,GO:1903961,GO:1904062,GO:1904064 ko:K03607 ko00000 Bacteria 1N68T@1224,1RP4S@1236,3Z2C1@583,COG3109@1,COG3109@2 NA|NA|NA J RNA chaperone with significant RNA binding, RNA strand exchange and RNA duplexing activities. May regulate ProP activity through an RNA-based, post-transcriptional mechanism Z1_03119 529507.PMI1014 2.6e-91 341.3 Proteus yebR GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016671,GO:0033745,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114 1.8.4.14 ko:K08968 ko00270,map00270 R02025 RC00639 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RDBM@1224,1S6QU@1236,3Z21C@583,COG1956@1,COG1956@2 NA|NA|NA T Domain present in phytochromes and cGMP-specific phosphodiesterases. Z1_03120 529507.PMI1013 1.5e-228 798.5 Proteus yebS GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K03808 ko00000 Bacteria 1MWG1@1224,1RM9Z@1236,3Z1VZ@583,COG2995@1,COG2995@2 NA|NA|NA S Paraquat-inducible protein A Z1_03121 529507.PMI1012 0.0 1525.4 Proteus yebT GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010876,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0033036,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0071702,GO:0071840,GO:0071944,GO:0120009 ko:K06192 ko00000 Bacteria 1MU1T@1224,1RN89@1236,3Z1UF@583,COG3008@1,COG3008@2 NA|NA|NA Q MlaD protein Z1_03122 529507.PMI1011 5.3e-42 176.4 Proteus yebV Bacteria 1N1QN@1224,1S96J@1236,2D1TW@1,32TBC@2,3Z2XU@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1480) Z1_03123 529507.PMI1010 1.8e-56 224.9 Proteus yebY GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1N3F9@1224,1SAPJ@1236,2DMVD@1,32TXR@2,3Z2VD@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2511) Z1_03124 529507.PMI1009 9.5e-161 572.8 Proteus yebZ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07245 ko00000,ko02000 9.B.62.1 Bacteria 1P1D5@1224,1RYS7@1236,3Z27M@583,COG1276@1,COG1276@2 NA|NA|NA P copper resistance protein Z1_03125 529507.PMI1008 1.2e-64 252.3 Proteus yobA GO:0005575,GO:0005623,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464 ko:K07156 ko00000,ko02000 9.B.62.2 Bacteria 1N8SS@1224,1S9EF@1236,3Z2IQ@583,COG2372@1,COG2372@2 NA|NA|NA S CopC domain Z1_03126 529507.PMI1007 4.9e-90 337.0 Proteus ftnA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004322,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006873,GO:0006875,GO:0006879,GO:0006880,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008199,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0016491,GO:0016722,GO:0016724,GO:0019725,GO:0030003,GO:0033554,GO:0042221,GO:0042592,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046916,GO:0048878,GO:0050801,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051235,GO:0051238,GO:0051641,GO:0051651,GO:0051716,GO:0055065,GO:0055072,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071281,GO:0097577,GO:0098771 1.16.3.2 ko:K02217 ko00000,ko01000 Bacteria 1R9ZC@1224,1RYVB@1236,3Z10P@583,COG1528@1,COG1528@2 NA|NA|NA P Iron-storage protein Z1_03127 529507.PMI1006 1.7e-70 271.9 Proteus uspF ko:K11932,ko:K14061 ko00000 Bacteria 1MZYI@1224,1S8ZY@1236,3Z2VY@583,COG0589@1,COG0589@2 NA|NA|NA T Universal stress protein family Z1_03128 529507.PMI1005 1.1e-65 255.8 Proteus yigF GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1RK5D@1224,1S717@1236,2AMA3@1,31C50@2,3Z33H@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2628) Z1_03129 529507.PMI1004 4.4e-100 370.5 Proteus cyaB 4.6.1.1 ko:K05873 ko00230,map00230 R00089,R00434 RC00295 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RBPX@1224,1S2EK@1236,3Z2UP@583,COG1437@1,COG1437@2 NA|NA|NA F CYTH domain Z1_03130 529507.PMI1003 3.3e-135 487.6 Proteus ycdX GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006928,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0040011,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0071973,GO:0071978,GO:0097588 ko:K04477 ko00000 Bacteria 1MYXV@1224,1RRE9@1236,3Z257@583,COG1387@1,COG1387@2 NA|NA|NA E DNA polymerase alpha chain like domain Z1_03131 529507.PMI1000 7.2e-74 283.1 Proteus hicB ko:K18843 ko00000,ko02048 Bacteria 1N5M5@1224,1S7IB@1236,3Z2W5@583,COG1598@1,COG1598@2 NA|NA|NA S HicB_like antitoxin of bacterial toxin-antitoxin system Z1_03132 529507.PMI0999 2.6e-163 581.3 Proteus lip 3.1.1.3 ko:K01046 ko00561,ko01100,map00561,map01100 M00098 R02250,R02687 RC00020,RC00037,RC00041,RC00094 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1NB6J@1224,1RS95@1236,3Z1U3@583,COG1075@1,COG1075@2 NA|NA|NA S Alpha beta hydrolase Z1_03133 529507.PMI0998 1.4e-65 255.4 Proteus Bacteria 1QD1B@1224,1T8W2@1236,2BIPB@1,32CWH@2,3Z3IB@583 NA|NA|NA S Phage antitermination protein Q Z1_03134 529507.PMI0997 1.1e-144 519.2 Proteus map 3.4.11.18 ko:K01265 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MU99@1224,1RMHN@1236,3Z27Y@583,COG0024@1,COG0024@2 NA|NA|NA J Removes the N-terminal methionine from nascent proteins. The N-terminal methionine is often cleaved when the second residue in the primary sequence is small and uncharged (Met-Ala-, Cys, Gly, Pro, Ser, Thr, or Val) Z1_03135 529507.PMI0996 7.9e-28 129.0 Proteus Bacteria 1N707@1224,1SCST@1236,2E30J@1,32Y12@2,3Z31K@583 NA|NA|NA S ParD-like antitoxin of type II bacterial toxin-antitoxin system Z1_03136 529507.PMI0995 3e-104 384.4 Proteus Bacteria 1RD7P@1224,1S3SW@1236,3Z2W0@583,COG3911@1,COG3911@2 NA|NA|NA S AAA domain Z1_03137 529507.PMI0994 5.7e-36 156.4 Proteus Bacteria 1QGKU@1224,1TE1H@1236,2ATDW@1,31IX6@2,3Z3I5@583 NA|NA|NA Z1_03138 529507.PMI0993 2.4e-71 274.6 Proteus Bacteria 1QD1D@1224,1T8W4@1236,2AQAV@1,31FGV@2,3Z3ID@583 NA|NA|NA Z1_03139 529507.PMI0992 9.8e-40 169.1 Proteus Bacteria 1QGJY@1224,1TE06@1236,2ATD4@1,31IWB@2,3Z3GM@583 NA|NA|NA S Family of unknown function (DUF5339) Z1_03140 529507.PMI0991 2.4e-33 147.5 Proteus ko:K09794 ko00000 Bacteria 1N760@1224,1SD65@1236,3Z32B@583,COG2841@1,COG2841@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF465) Z1_03141 585.DR95_1121 2.7e-11 73.9 Proteus Bacteria 1PBCX@1224,1SW7X@1236,28XZI@1,2ZJVA@2,3Z3JS@583 NA|NA|NA Z1_03142 529507.PMI0989 3.1e-189 667.5 Proteus ybgA Bacteria 1MXYZ@1224,1RNMF@1236,3Z0ZX@583,COG1683@1,COG1683@2,COG3272@1,COG3272@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF523) Z1_03143 529507.PMI0988 1.7e-23 114.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1PADY@1224,1SUEV@1236,2CGID@1,2ZVZN@2 NA|NA|NA Z1_03144 529507.PMI0987 1.2e-61 242.3 Gammaproteobacteria yjbR Bacteria 1N2XA@1224,1S4QU@1236,COG2315@1,COG2315@2 NA|NA|NA S protein conserved in bacteria Z1_03145 529507.PMI0986 2.1e-125 454.9 Proteus Bacteria 1QUDW@1224,1T1V9@1236,3Z2SE@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA Q Methyltransferase domain Z1_03146 529507.PMI0985 3.3e-249 867.1 Proteus ibrA Bacteria 1NBDM@1224,1RYRP@1236,3Z2BB@583,COG3969@1,COG3969@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF3440) Z1_03147 529507.PMI0984 3e-116 424.5 Proteus ibrB ko:K03497 ko00000,ko03000,ko03036,ko04812 Bacteria 1R5VN@1224,1RZ7C@1236,3Z1MB@583,COG1475@1,COG1475@2 NA|NA|NA K ParB-like nuclease domain Z1_03148 529507.PMI0982 1.4e-34 151.8 Proteus Bacteria 1RFET@1224,1SVYG@1236,3Z3GS@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_03150 529507.PMI0978 7.6e-97 359.8 Gammaproteobacteria 2.7.1.48,3.1.3.18 ko:K00876,ko:K01091 ko00240,ko00630,ko00983,ko01100,ko01110,ko01130,map00240,map00630,map00983,map01100,map01110,map01130 R00513,R00516,R00517,R00962,R00964,R00967,R00968,R00970,R01334,R01548,R01549,R01880,R02091,R02096,R02097,R02327,R02332,R02371,R02372,R08232 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RM33@1224,1S89Q@1236,COG0572@1,COG0572@2 NA|NA|NA F uridine kinase Z1_03152 529507.PMI0976 3.5e-149 534.3 Gammaproteobacteria ytfG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114 1.6.5.2 ko:K19267 ko00130,ko01110,map00130,map01110 R02964,R03643,R03816 RC00819 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW44@1224,1RPD9@1236,COG0702@1,COG0702@2 NA|NA|NA GM NmrA family Z1_03153 529507.PMI0975 3.8e-63 247.3 Gammaproteobacteria ytfH Bacteria 1MZ6N@1224,1S5WB@1236,COG1733@1,COG1733@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_03154 529507.PMI0974 3.7e-76 290.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1P3CP@1224,1SSPN@1236,2FE18@1,3461F@2 NA|NA|NA Z1_03155 529507.PMI0973 1e-78 299.3 Proteus ibp ko:K04080,ko:K13993 ko04141,map04141 ko00000,ko00001,ko03110 Bacteria 1RH2X@1224,1S4BP@1236,3Z1BN@583,COG0071@1,COG0071@2 NA|NA|NA O Hsp20/alpha crystallin family Z1_03156 529507.PMI0972 8.8e-33 145.6 Proteus cspA GO:0001072,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003723,GO:0003727,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043242,GO:0043244,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0060567,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1N6Q5@1224,1SCA7@1236,3Z3GJ@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K Cold shock protein domain Z1_03157 529507.PMI0971 2.4e-217 761.1 Proteus Bacteria 1MVAA@1224,1S2VM@1236,3Z377@583,COG1073@1,COG1073@2 NA|NA|NA S Secretory lipase Z1_03158 529507.PMI1921 3.5e-33 149.4 Proteus Bacteria 1QN1P@1224,1TKEG@1236,2AYBJ@1,31QE8@2,3Z3E0@583 NA|NA|NA Z1_03159 529507.PMI0322 1.2e-15 88.2 Proteus ko:K07483,ko:K07497 ko00000 Bacteria 1N1HQ@1224,1SBAR@1236,3Z3HG@583,COG2963@1,COG2963@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_03160 220341.16504865 3.7e-19 101.3 Salmonella Bacteria 1P0MV@1224,1SSW9@1236,2FK2G@1,34BQN@2,3ZN8R@590 NA|NA|NA Z1_03161 1443113.LC20_02592 4.1e-125 454.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1NYA1@1224,1SQ2R@1236,2E2J7@1,32XNR@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4238) Z1_03162 1440052.EAKF1_ch2014c 2e-57 229.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1P63B@1224,1ST5W@1236,2FF7J@1,3475I@2 NA|NA|NA Z1_03163 471881.PROPEN_00029 2.8e-31 140.6 Proteus Bacteria 1QCUF@1224,1T8MJ@1236,29E14@1,300Z3@2,3Z34W@583 NA|NA|NA Z1_03164 471881.PROPEN_00029 9.3e-22 108.6 Proteus Bacteria 1QCUF@1224,1T8MJ@1236,29E14@1,300Z3@2,3Z34W@583 NA|NA|NA Z1_03165 34506.g298 2.7e-23 114.0 Rhabditida Nematoda 1M0NH@119089,39U85@33154,3BP87@33208,3DE30@33213,40QZ1@6231,4172G@6236,COG0473@1,KOG0785@2759 NA|NA|NA E Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase Z1_03166 471874.PROSTU_00920 2.4e-22 114.4 Gammaproteobacteria prtS 3.4.21.96 ko:K01361 ko00000,ko01000,ko01002,ko03110 Bacteria 1N940@1224,1SCVN@1236,COG1196@1,COG1196@2 NA|NA|NA D YadA-like membrane anchor domain Z1_03167 529507.PMI0532 7.2e-09 65.9 Proteus Bacteria 1QGJD@1224,1TDZI@1236,3Z3FK@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_03168 585.DR95_2341 3.5e-15 87.8 Proteus osmY GO:0005575,GO:0005623,GO:0006457,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009987,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464,GO:0050896,GO:0061077 ko:K04065 ko00000 Bacteria 1QG7F@1224,1TDKF@1236,3Z33Y@583,COG2823@1,COG2823@2 NA|NA|NA S BON domain Z1_03169 585.DR95_1149 0.0 2052.7 Proteus sca1 Bacteria 1R7KR@1224,1S1E5@1236,3Z35Y@583,COG1196@1,COG1196@2,COG4723@1,COG4723@2,COG4733@1,COG4733@2 NA|NA|NA D Fibronectin type 3 domain Z1_03170 585.DR95_2795 5.3e-71 273.5 Proteus Bacteria 1NAB6@1224,1SCSA@1236,2E30K@1,32Y13@2,3Z2JV@583 NA|NA|NA Z1_03171 218493.SBG_2846 6.7e-27 126.7 Salmonella Bacteria 1PZU1@1224,1TJA2@1236,2EJTH@1,3184X@2,3ZNCH@590 NA|NA|NA S YecR-like lipoprotein Z1_03172 529507.PMI0938 4.8e-105 387.1 Proteus Bacteria 1N45M@1224,1SAVD@1236,2E0A0@1,32VXE@2,3Z1V4@583 NA|NA|NA Z1_03173 471881.PROPEN_00039 1.4e-107 395.6 Proteus Bacteria 1RGC2@1224,1S4CP@1236,2DKZG@1,31055@2,3Z1DN@583 NA|NA|NA Z1_03174 529507.PMI0936 0.0 1907.9 Proteus sca1 Bacteria 1RC1T@1224,1S3EN@1236,3Z1J2@583,COG1196@1,COG1196@2,COG5281@1,COG5281@2 NA|NA|NA D Phage-related minor tail protein Z1_03175 529507.PMI0935 2.2e-27 127.5 Proteus pilT Bacteria 1N9JZ@1224,1SCHH@1236,3Z32K@583,COG0401@1,COG0401@2 NA|NA|NA S Proteolipid membrane potential modulator Z1_03176 529507.PMI0934 8.9e-39 165.6 Proteus Bacteria 1NJC7@1224,1ST1E@1236,2EUU5@1,33N9Q@2,3Z2X2@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF4035) Z1_03177 585.DR95_1155 6.7e-69 266.5 Proteus Bacteria 1P9BT@1224,1SVFQ@1236,28ZGR@1,2ZM85@2,3Z2IY@583 NA|NA|NA Z1_03178 585.DR95_1156 6.6e-119 433.3 Proteus Bacteria 1N25E@1224,1SPRB@1236,2E1CQ@1,32WS8@2,3Z1GA@583 NA|NA|NA Z1_03179 585.DR95_1157 5.5e-53 213.4 Proteus Bacteria 1NI4V@1224,1SSA2@1236,2DTM0@1,33KV2@2,3Z2PR@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF3168) Z1_03180 529507.PMI0930 5.8e-77 293.5 Proteus Bacteria 1N0Y0@1224,1T6AP@1236,2DZMG@1,32VDV@2,3Z1XF@583 NA|NA|NA S Bacteriophage HK97-gp10, putative tail-component Z1_03181 529507.PMI0929 3.9e-56 223.8 Proteus Bacteria 1NHB4@1224,1TM0T@1236,3Z3EB@583,COG5614@1,COG5614@2 NA|NA|NA S Phage head-tail joining protein Z1_03182 585.DR95_2784 4.1e-52 210.3 Proteus Bacteria 1P198@1224,1SREG@1236,2FIK7@1,34AC8@2,3Z2TF@583 NA|NA|NA S Phage gp6-like head-tail connector protein Z1_03183 585.DR95_1161 2.4e-212 744.6 Proteus xkdG Bacteria 1MYMH@1224,1RR5E@1236,3Z1RK@583,COG4653@1,COG4653@2 NA|NA|NA S Phage capsid family Z1_03184 529507.PMI0926 7.6e-123 446.4 Proteus ko:K06904 ko00000 Bacteria 1N2D8@1224,1S089@1236,3Z241@583,COG3740@1,COG3740@2 NA|NA|NA S Caudovirus prohead serine protease Z1_03185 529507.PMI0925 2.3e-245 854.4 Proteus Bacteria 1MUP5@1224,1RPB0@1236,3Z27C@583,COG4695@1,COG4695@2 NA|NA|NA S Phage portal protein Z1_03186 529507.PMI0924 0.0 1190.6 Proteus Bacteria 1MW7K@1224,1RP8Z@1236,3Z22E@583,COG4626@1,COG4626@2 NA|NA|NA S Phage Terminase Z1_03187 471881.PROPEN_00057 2.3e-81 308.1 Proteus Bacteria 1RBBT@1224,1S1YI@1236,3Z1XV@583,COG3747@1,COG3747@2 NA|NA|NA L Phage terminase, small subunit Z1_03188 585.DR95_1166 1.2e-60 238.8 Proteus ko:K07451 ko00000,ko01000,ko02048 Bacteria 1N7SV@1224,1S61H@1236,3Z2NS@583,COG1403@1,COG1403@2 NA|NA|NA V HNH nucleases Z1_03190 585.DR95_1167 1e-74 286.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1R6Q9@1224,1RSD1@1236,2DBPD@1,2ZA8M@2 NA|NA|NA S KilA-N Z1_03191 529507.PMI0921 3e-54 218.0 Proteus ko:K14744 ko00000,ko01000 Bacteria 1N10F@1224,1SCW4@1236,2DP4N@1,330HV@2,3Z2Q6@583 NA|NA|NA S Bacteriophage Rz lysis protein Z1_03192 471881.PROPEN_02401 2.2e-17 94.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1P9K9@1224,1SVMX@1236,2CB5E@1,2ZKDQ@2 NA|NA|NA Z1_03193 471881.PROPEN_02402 4.4e-77 293.9 Proteus rrrD GO:0001906,GO:0001907,GO:0003674,GO:0003796,GO:0003824,GO:0004553,GO:0008150,GO:0016032,GO:0016787,GO:0016798,GO:0019048,GO:0019058,GO:0019076,GO:0031640,GO:0035821,GO:0035890,GO:0035891,GO:0039633,GO:0040011,GO:0044003,GO:0044004,GO:0044364,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044659,GO:0044661,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051817,GO:0051818,GO:0051883,GO:0052126,GO:0052192,GO:0061783 3.2.1.17 ko:K01185 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZJD@1224,1S6BA@1236,3Z2AH@583,COG3772@1,COG3772@2 NA|NA|NA G Lysozyme Z1_03194 471881.PROPEN_00067 1.1e-40 172.2 Proteus Bacteria 1NG7G@1224,1SG47@1236,2ECNU@1,336KK@2,3Z2WK@583 NA|NA|NA Z1_03195 585.DR95_1173 2.4e-66 258.1 Proteus Bacteria 1RKVX@1224,1S8NJ@1236,2B0DD@1,31SQM@2,3Z2M4@583 NA|NA|NA Z1_03197 529507.PMI0488 1.2e-91 342.4 Proteus yagU ko:K08996 ko00000 Bacteria 1PZZB@1224,1TEHS@1236,3Z3ET@583,COG3477@1,COG3477@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1440) Z1_03198 585.DR95_3500 3.6e-59 234.2 Gammaproteobacteria ybcQ GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0008150,GO:0009987,GO:0042710,GO:0044010,GO:0044764,GO:0051704,GO:0097159,GO:1901363 Bacteria 1RFJS@1224,1S64B@1236,2CAXP@1,2ZQA6@2 NA|NA|NA S Antitermination protein Q Z1_03199 34506.g5961 1.5e-70 272.7 Bilateria Metazoa 3ABXI@33154,3BVM8@33208,3DI7P@33213,COG1278@1,KOG3070@2759 NA|NA|NA J Cold shock protein domain Z1_03200 529507.PMI0484 4.1e-80 303.9 Proteus Bacteria 1QJDG@1224,1THCK@1236,2AVR7@1,31MIH@2,3Z3J1@583 NA|NA|NA Z1_03201 529507.PMI0483 1.6e-260 904.8 Proteus dnaB 3.6.4.12 ko:K02314 ko03030,ko04112,map03030,map04112 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032 Bacteria 1MUG9@1224,1RYUJ@1236,3Z39N@583,COG0305@1,COG0305@2 NA|NA|NA L DnaB-like helicase N terminal domain Z1_03202 529507.PMI0482 3.4e-135 487.6 Gammaproteobacteria ko:K19505,ko:K21885 ko00000,ko03000 Bacteria 1RGKD@1224,1S53G@1236,COG0640@1,COG0640@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain Z1_03204 529507.PMI0481 2.9e-57 227.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NAX8@1224,1SD0Y@1236,2EEGI@1,338AC@2 NA|NA|NA Z1_03205 199310.c1547 4.5e-13 80.1 Escherichia ko:K07729 ko00000,ko03000 Bacteria 1QFBE@1224,1TCHV@1236,3XREH@561,COG1476@1,COG1476@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_03206 585.DR95_3493 5.1e-74 284.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1QC0U@1224,1RYY2@1236,COG1974@1,COG1974@2 NA|NA|NA K Peptidase S24-like Z1_03207 585.DR95_3492 1.3e-57 228.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1MZK1@1224,1S9TU@1236,2D2Z4@1,32TDX@2 NA|NA|NA S Psort location Cytoplasmic, score 8.96 Z1_03208 1168549.I6R9C4_9CAUD 2.9e-61 241.5 Caudovirales Viruses 4QF4F@10239,4QS7D@28883,4R0DT@35237 NA|NA|NA Z1_03210 634500.EbC_31660 4.8e-43 181.0 Gammaproteobacteria clpP 3.4.21.92 ko:K01358 ko04112,ko04212,map04112,map04212 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Bacteria 1N6H3@1224,1SNC4@1236,COG0740@1,COG0740@2 NA|NA|NA OU clp protease Z1_03212 520999.PROVALCAL_00644 3.7e-11 73.6 Providencia Bacteria 1QGW5@1224,1TEC6@1236,2ATMG@1,31J5Y@2,3ZAAA@586 NA|NA|NA Z1_03214 343509.SG0930 5.1e-73 280.8 Gammaproteobacteria ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RC22@1224,1S2A9@1236,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L ERF superfamily Z1_03215 1484157.PSNIH2_13560 1.2e-59 236.1 Pantoea ssb GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0030234,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RCWT@1224,1S3WP@1236,3VYXI@53335,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L Plays an important role in DNA replication, recombination and repair. Binds to ssDNA and to an array of partner proteins to recruit them to their sites of action during DNA metabolism Z1_03216 585.DR95_1188 2.7e-41 174.1 Proteus Bacteria 1NAP7@1224,1SDE7@1236,2E6QN@1,331AV@2,3Z2Z3@583 NA|NA|NA S Excisionase-like protein Z1_03217 585.DR95_1189 2.9e-215 754.2 Proteus int3 Bacteria 1MX7E@1224,1RNX5@1236,3Z0WH@583,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Phage integrase family Z1_03218 529507.PMI0891 3.8e-240 837.0 Proteus icd GO:0003674,GO:0003824,GO:0004448,GO:0004450,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006091,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0022900,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0055114 1.1.1.42 ko:K00031 ko00020,ko00480,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,ko04146,map00020,map00480,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230,map04146 M00009,M00010,M00173,M00740 R00267,R00268,R01899 RC00001,RC00084,RC00114,RC00626,RC02801 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 e_coli_core.b1136,iAF1260.b1136,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1071,iEcDH1_1363.EcDH1_2511,iJO1366.b1136,iJR904.b1136,iY75_1357.Y75_RS05930,iYL1228.KPN_01144 Bacteria 1MW3J@1224,1RNMD@1236,3Z282@583,COG0538@1,COG0538@2 NA|NA|NA C Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase Z1_03219 529507.PMI0890 2.9e-116 424.5 Proteus rluE GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022613,GO:0031118,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.19,5.4.99.20,5.4.99.22 ko:K06178,ko:K06181,ko:K06183 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1R9VV@1224,1S1ZX@1236,3Z2G3@583,COG1187@1,COG1187@2 NA|NA|NA J RNA pseudouridylate synthase Z1_03220 529507.PMI0889 4e-83 313.9 Proteus nudJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004787,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017110,GO:0017111 3.6.1.55 ko:K03574,ko:K12152 ko00000,ko01000,ko03400 iSbBS512_1146.SbBS512_E1312 Bacteria 1N03W@1224,1S970@1236,3Z2NA@583,COG1051@1,COG1051@2 NA|NA|NA F NUDIX domain Z1_03221 529507.PMI0888 3.8e-212 743.8 Proteus mnmA GO:0001510,GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004808,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016782,GO:0016783,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.8.1.13 ko:K00566 ko04122,map04122 R08700 RC02313,RC02315 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUT1@1224,1RMAK@1236,3Z1F2@583,COG0482@1,COG0482@2 NA|NA|NA J Catalyzes the 2-thiolation of uridine at the wobble position (U34) of tRNA(Lys), tRNA(Glu) and tRNA(Gln), leading to the formation of s(2)U34, the first step of tRNA-mnm(5)s(2)U34 synthesis. Sulfur is provided by IscS, via a sulfur-relay system. Binds ATP and its substrate tRNAs Z1_03222 529507.PMI0887 4.4e-112 410.6 Proteus hflD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009898,GO:0016020,GO:0019897,GO:0019898,GO:0031234,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098562 4.3.2.2 ko:K01756,ko:K07153 ko00230,ko00250,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00250,map01100,map01110,map01130 M00048,M00049 R01083,R04559 RC00379,RC00444,RC00445 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1RI8B@1224,1RPCC@1236,3Z1V1@583,COG2915@1,COG2915@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF489) Z1_03223 529507.PMI0886 3.2e-261 907.1 Proteus purB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004018,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016840,GO:0016842,GO:0033554,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716 4.3.2.2 ko:K01756 ko00230,ko00250,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00250,map01100,map01110,map01130 M00048,M00049 R01083,R04559 RC00379,RC00444,RC00445 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b1131,iBWG_1329.BWG_0979,iE2348C_1286.E2348C_1272,iEC042_1314.EC042_1202,iECABU_c1320.ECABU_c13450,iECDH10B_1368.ECDH10B_1203,iECP_1309.ECP_1126,iECUMN_1333.ECUMN_1375,iETEC_1333.ETEC_1255,iEcHS_1320.EcHS_A1251,iEcolC_1368.EcolC_2472,iJO1366.b1131,iJR904.b1131,iLF82_1304.LF82_1774,iNRG857_1313.NRG857_05460,iY75_1357.Y75_RS05905,ic_1306.c1510 Bacteria 1MV4B@1224,1RN93@1236,3Z11V@583,COG0015@1,COG0015@2 NA|NA|NA F Adenylosuccinate lyase C-terminal Z1_03224 529507.PMI0885 2.1e-120 438.3 Proteus Bacteria 1N0YI@1224,1RMWT@1236,3Z28J@583,COG0745@1,COG0745@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulatory protein, C terminal Z1_03225 529507.PMI0884 2e-277 961.1 Proteus Bacteria 1QTVU@1224,1RPFY@1236,3Z26B@583,COG0642@1,COG2205@2 NA|NA|NA T PhoQ Sensor Z1_03226 529507.PMI0883 4.6e-229 800.0 Proteus ycfD GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0018193,GO:0018195,GO:0019538,GO:0030961,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0071704,GO:1901564 1.14.11.47 ko:K18850 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MW30@1224,1RN2Q@1236,3Z172@583,COG2850@1,COG2850@2 NA|NA|NA S A domain family that is part of the cupin metalloenzyme superfamily. Z1_03227 585.DR95_1199 1.2e-08 65.9 Proteus Bacteria 1QD1T@1224,1T8WM@1236,2ADUY@1,313KR@2,3Z3J4@583 NA|NA|NA Z1_03228 529507.PMI0882 6.4e-240 836.3 Proteus pepT GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0009987,GO:0016787,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034701,GO:0043170,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045148,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.4.11.4 ko:K01258 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MV7D@1224,1RMKZ@1236,3Z1SW@583,COG2195@1,COG2195@2 NA|NA|NA E peptidase Z1_03229 529507.PMI0881 1.8e-164 585.1 Proteus cobB GO:0002252,GO:0002376,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006464,GO:0006476,GO:0006807,GO:0006935,GO:0006950,GO:0006952,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019213,GO:0019538,GO:0033558,GO:0034979,GO:0034983,GO:0035601,GO:0036048,GO:0036049,GO:0036055,GO:0036211,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0050896,GO:0051607,GO:0051704,GO:0051707,GO:0071704,GO:0098542,GO:0098732,GO:0140096,GO:1901564 ko:K12410 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUK1@1224,1RMX5@1236,3Z1DC@583,COG0846@1,COG0846@2 NA|NA|NA K NAD-dependent lysine deacetylase and desuccinylase that specifically removes acetyl and succinyl groups on target proteins. Modulates the activities of several proteins which are inactive in their acylated form Z1_03230 529507.PMI0880 3.8e-224 783.9 Proteus lolE GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008104,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044872,GO:0044873,GO:0044874,GO:0051179,GO:0051641,GO:0070727,GO:0071944,GO:0072657,GO:0098796,GO:0098797 ko:K02004,ko:K09808 ko02010,map02010 M00255,M00258 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1,3.A.1.125 Bacteria 1MVV7@1224,1RMP9@1236,3Z1YV@583,COG4591@1,COG4591@2 NA|NA|NA M MacB-like periplasmic core domain Z1_03231 529507.PMI0879 1.6e-123 448.7 Proteus lolD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006807,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0015031,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019538,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042157,GO:0042160,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042886,GO:0042953,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044238,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044872,GO:0044873,GO:0044874,GO:0045184,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0055085,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072657,GO:0089705,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351,GO:1990778 ko:K09810 ko02010,map02010 M00255 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.125 Bacteria 1MVSQ@1224,1RMWK@1236,3Z2DB@583,COG1136@1,COG1136@2 NA|NA|NA V Part of the ABC transporter complex LolCDE involved in the translocation of Z1_03232 529507.PMI0878 3.2e-209 734.2 Proteus lolC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0016020,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044872,GO:0044873,GO:0044874,GO:0051179,GO:0051641,GO:0070727,GO:0071944,GO:0072657,GO:0089705,GO:0098796,GO:0098797,GO:1990778 ko:K02004,ko:K09808 ko02010,map02010 M00255,M00258 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1,3.A.1.125 Bacteria 1MVV7@1224,1RMP9@1236,3Z2GR@583,COG4591@1,COG4591@2 NA|NA|NA M Lipoprotein releasing system transmembrane protein Z1_03233 529507.PMI0877 0.0 2276.5 Proteus mfd GO:0000715,GO:0000716,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006283,GO:0006289,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0015616,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019899,GO:0031323,GO:0031326,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043175,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051276,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070063,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03723 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MUXG@1224,1RNCU@1236,3Z1X1@583,COG1197@1,COG1197@2 NA|NA|NA L Couples transcription and DNA repair by recognizing RNA polymerase (RNAP) stalled at DNA lesions. Mediates ATP-dependent release of RNAP and its truncated transcript from the DNA, and recruitment of nucleotide excision repair machinery to the damaged site Z1_03234 529507.PMI0876 8.9e-92 342.8 Proteus ycfJ GO:0008150,GO:0043900,GO:0050789,GO:0050794,GO:0065007,GO:1900190 Bacteria 1QFTR@1224,1TD42@1236,3Z29B@583,COG3134@1,COG3134@2 NA|NA|NA N Outer membrane lipoprotein Z1_03235 529507.PMI0875 6.9e-245 852.8 Proteus ndh GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003954,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008137,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016655,GO:0019646,GO:0022900,GO:0022904,GO:0030964,GO:0032991,GO:0036094,GO:0042592,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044464,GO:0045333,GO:0048037,GO:0048878,GO:0050136,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050801,GO:0055065,GO:0055070,GO:0055076,GO:0055080,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0097159,GO:0098771,GO:0098796,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494 1.6.99.3 ko:K03885 ko00190,map00190 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_2051,iPC815.YPO1617 Bacteria 1MX96@1224,1RM9I@1236,3Z117@583,COG1252@1,COG1252@2 NA|NA|NA C Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase Z1_03236 529507.PMI0874 3.5e-102 377.5 Proteus ycfP GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K07000 ko00000 Bacteria 1NV1Y@1224,1RPQX@1236,3Z1B4@583,COG3150@1,COG3150@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family (UPF0227) Z1_03237 529507.PMI0873 1.7e-190 671.8 Proteus nagZ GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004553,GO:0004563,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006022,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009254,GO:0009273,GO:0009987,GO:0015929,GO:0016787,GO:0016798,GO:0030203,GO:0042546,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901135,GO:1901564 2.7.8.7,3.2.1.21,3.2.1.52 ko:K00997,ko:K01207,ko:K05349 ko00460,ko00500,ko00520,ko00531,ko00770,ko00940,ko01100,ko01110,ko01501,map00460,map00500,map00520,map00531,map00770,map00940,map01100,map01110,map01501 M00628 R00022,R00026,R01625,R02558,R02887,R02985,R03527,R04949,R04998,R05963,R07809,R07810,R10035,R10039,R10040,R10831 RC00002,RC00049,RC00059,RC00171,RC00262,RC00397,RC00451,RC00714,RC00746,RC01248 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 GH3 iSFV_1184.SFV_1127,iUMN146_1321.UM146_11790 Bacteria 1MVAJ@1224,1RMQF@1236,3Z1C7@583,COG1472@1,COG1472@2 NA|NA|NA M Plays a role in peptidoglycan recycling by cleaving the terminal beta-1,4-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) from peptide-linked peptidoglycan fragments, giving rise to free GlcNAc, anhydro-N-acetylmuramic acid and anhydro-N-acetylmuramic acid-linked peptides Z1_03238 529507.PMI0872 2.9e-173 614.4 Proteus thiK GO:0003674,GO:0003824,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019165,GO:0044237 2.7.1.89 ko:K07251 ko00730,ko01100,map00730,map01100 R02134 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_1198,iEC042_1314.EC042_1176,iECED1_1282.ECED1_1249,iECO111_1330.ECO111_1383,iECO26_1355.ECO26_1439,iECUMN_1333.ECUMN_1284 Bacteria 1MURU@1224,1RNUN@1236,3Z1PV@583,COG0510@1,COG0510@2 NA|NA|NA H Catalyzes the phosphorylation of thiamine to thiamine phosphate Z1_03239 529507.PMI0871 4.5e-87 327.4 Proteus lpoB GO:0000270,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006807,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019867,GO:0019899,GO:0030203,GO:0030234,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031241,GO:0031975,GO:0034645,GO:0042546,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098772,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K07337,ko:K21008 ko02025,map02025 ko00000,ko00001 Bacteria 1QFS9@1224,1RSK3@1236,3Z1Q1@583,COG3417@1,COG3417@2 NA|NA|NA M Regulator of peptidoglycan synthesis that is essential for the function of penicillin-binding protein 1B (PBP1b) Z1_03240 529507.PMI0870 1.2e-67 262.3 Proteus ycfL GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1N0YQ@1224,1SFHR@1236,3Z2P8@583,COG5633@1,COG5633@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1425) Z1_03241 529507.PMI0869 8.2e-60 236.1 Proteus hinT GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006524,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009078,GO:0009080,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019478,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043530,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046144,GO:0046395,GO:0046416,GO:0046436,GO:0055130,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 ko:K02503 ko00000,ko04147 Bacteria 1RDCJ@1224,1S3QE@1236,3Z2PA@583,COG0537@1,COG0537@2 NA|NA|NA FG HIT domain Z1_03242 529507.PMI0868 1.1e-144 519.2 Proteus ycfH GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004536,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901575 ko:K03424 ko00000,ko01000 Bacteria 1MUC0@1224,1RP6E@1236,3Z1B9@583,COG0084@1,COG0084@2 NA|NA|NA L TatD related DNase Z1_03243 529507.PMI0867 6.9e-189 666.4 Proteus holB GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042575,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02341 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MY1W@1224,1RNYA@1236,3Z0XD@583,COG0470@1,COG0470@2 NA|NA|NA L DNA polymerase III, delta subunit, C terminal Z1_03244 529507.PMI0866 2.6e-112 411.4 Proteus tmk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004798,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006227,GO:0006233,GO:0006235,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009041,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009132,GO:0009133,GO:0009138,GO:0009139,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009147,GO:0009148,GO:0009165,GO:0009186,GO:0009189,GO:0009196,GO:0009197,GO:0009200,GO:0009202,GO:0009211,GO:0009212,GO:0009219,GO:0009221,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046072,GO:0046075,GO:0046077,GO:0046385,GO:0046483,GO:0046940,GO:0050145,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.4.9 ko:K00943 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00053 R02094,R02098 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECABU_c1320.ECABU_c13120,ic_1306.c1370 Bacteria 1MV9C@1224,1S26C@1236,3Z1X4@583,COG0125@1,COG0125@2 NA|NA|NA F Phosphorylation of dTMP to form dTDP in both de novo and salvage pathways of dTTP synthesis Z1_03245 529507.PMI0865 3.6e-188 664.1 Proteus mltG GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008932,GO:0008933,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016740,GO:0016757,GO:0030203,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043170,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0061783,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901564 ko:K07082 ko00000 Bacteria 1MUQF@1224,1RMWD@1236,3Z3AE@583,COG1559@1,COG1559@2 NA|NA|NA S Functions as a peptidoglycan terminase that cleaves nascent peptidoglycan strands endolytically to terminate their elongation Z1_03246 529507.PMI0864 2.6e-157 561.2 Proteus pabC GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008696,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016830,GO:0016833,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042558,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044281,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0070279,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564 2.6.1.42,4.1.3.38 ko:K00826,ko:K02619 ko00270,ko00280,ko00290,ko00770,ko00790,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00270,map00280,map00290,map00770,map00790,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00019,M00036,M00119,M00570 R01090,R01214,R02199,R05553,R10991 RC00006,RC00036,RC01843,RC02148 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iAPECO1_1312.APECO1_177,iE2348C_1286.E2348C_1188,iECED1_1282.ECED1_1239,iECNA114_1301.ECNA114_1153,iECOK1_1307.ECOK1_1203,iECS88_1305.ECS88_1110,iECSF_1327.ECSF_0995,iECUMN_1333.ECUMN_1273,iJN746.PP_1917,iPC815.YPO1603,iUMN146_1321.UM146_11845,iUTI89_1310.UTI89_C1222,ic_1306.c1366 Bacteria 1MZAK@1224,1RPPG@1236,3Z2BF@583,COG0115@1,COG0115@2 NA|NA|NA EH Amino-transferase class IV Z1_03247 529507.PMI0863 2.4e-231 807.7 Proteus fabF GO:0003674,GO:0003824,GO:0004312,GO:0004315,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033817,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 2.3.1.179 ko:K09458 ko00061,ko00780,ko01100,ko01212,map00061,map00780,map01100,map01212 M00083,M00572 R04355,R04726,R04952,R04957,R04960,R04963,R04968,R07762,R10115,R10119 RC00039,RC02728,RC02729,RC02888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iAF1260.b1095,iAPECO1_1312.APECO1_176,iB21_1397.B21_01099,iBWG_1329.BWG_0943,iE2348C_1286.E2348C_1187,iEC042_1314.EC042_1165,iEC55989_1330.EC55989_1207,iECABU_c1320.ECABU_c13085,iECBD_1354.ECBD_2506,iECB_1328.ECB_01091,iECDH10B_1368.ECDH10B_1167,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1030,iECD_1391.ECD_01091,iECED1_1282.ECED1_1238,iECH74115_1262.ECH74115_1474,iECIAI1_1343.ECIAI1_1130,iECIAI39_1322.ECIAI39_2066,iECO103_1326.ECO103_1140,iECO111_1330.ECO111_1372,iECO26_1355.ECO26_1428,iECOK1_1307.ECOK1_1202,iECP_1309.ECP_1087,iECS88_1305.ECS88_1109,iECSE_1348.ECSE_1159,iECSF_1327.ECSF_0994,iECSP_1301.ECSP_1396,iECUMN_1333.ECUMN_1270,iECW_1372.ECW_m1203,iECs_1301.ECs1473,iEKO11_1354.EKO11_2739,iETEC_1333.ETEC_1160,iEcDH1_1363.EcDH1_2552,iEcE24377_1341.EcE24377A_1216,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2032,iG2583_1286.G2583_1355,iJO1366.b1095,iJR904.b1095,iLF82_1304.LF82_0607,iNRG857_1313.NRG857_05280,iSF_1195.SF1099,iSFxv_1172.SFxv_1251,iS_1188.S1179,iUMN146_1321.UM146_11850,iWFL_1372.ECW_m1203,iY75_1357.Y75_RS05720,iZ_1308.Z1734,ic_1306.c1365 Bacteria 1MU1X@1224,1RMDE@1236,3Z14J@583,COG0304@1,COG0304@2 NA|NA|NA I Catalyzes the condensation reaction of fatty acid synthesis by the addition to an acyl acceptor of two carbons from malonyl-ACP Z1_03248 406817.XNC1_2734 1.8e-31 141.4 Gammaproteobacteria acpP GO:0000035,GO:0000036,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016053,GO:0019637,GO:0019752,GO:0019842,GO:0031177,GO:0032787,GO:0033218,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044620,GO:0046394,GO:0046467,GO:0046493,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051192,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072341,GO:0090407,GO:0140104,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 ko:K02078 ko00000,ko00001 Bacteria 1MZ4P@1224,1S8X4@1236,COG0236@1,COG0236@2 NA|NA|NA IQ Carrier of the growing fatty acid chain in fatty acid biosynthesis Z1_03249 529507.PMI0861 2.1e-126 458.4 Proteus Bacteria 1MU6X@1224,1RMBB@1236,3Z1GK@583,COG1028@1,COG1028@2 NA|NA|NA IQ KR domain Z1_03250 529507.PMI0860 5.8e-169 600.1 Proteus fabD GO:0003674,GO:0003824,GO:0004312,GO:0004314,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016417,GO:0016419,GO:0016420,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 2.3.1.39 ko:K00645 ko00061,ko00333,ko01100,ko01130,ko01212,map00061,map00333,map01100,map01130,map01212 M00082 R01626,R11671 RC00004,RC00039,RC02727 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iEcE24377_1341.EcE24377A_1213,iJN746.PP_1913,iPC815.YPO1598 Bacteria 1MV6N@1224,1RNH3@1236,3Z13H@583,COG0331@1,COG0331@2 NA|NA|NA I Acyl transferase domain Z1_03251 529507.PMI0859 7.9e-174 616.3 Proteus fabH GO:0003674,GO:0003824,GO:0004312,GO:0004315,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033818,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 2.3.1.180 ko:K00648 ko00061,ko01100,ko01212,map00061,map01100,map01212 M00082,M00083 R10707 RC00004,RC02729,RC02888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iAF1260.b1091,iAPECO1_1312.APECO1_172,iBWG_1329.BWG_0939,iE2348C_1286.E2348C_1183,iEC55989_1330.EC55989_1203,iECABU_c1320.ECABU_c13040,iECDH10B_1368.ECDH10B_1163,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_1026,iECED1_1282.ECED1_1234,iECH74115_1262.ECH74115_1470,iECIAI39_1322.ECIAI39_2070,iECO103_1326.ECO103_1136,iECO111_1330.ECO111_1368,iECO26_1355.ECO26_1424,iECOK1_1307.ECOK1_1198,iECP_1309.ECP_1083,iECS88_1305.ECS88_1105,iECSP_1301.ECSP_1392,iECW_1372.ECW_m1199,iECs_1301.ECs1469,iEKO11_1354.EKO11_2743,iETEC_1333.ETEC_1156,iEcDH1_1363.EcDH1_2556,iEcE24377_1341.EcE24377A_1212,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2036,iG2583_1286.G2583_1351,iJO1366.b1091,iJR904.b1091,iLF82_1304.LF82_0609,iNRG857_1313.NRG857_05260,iSSON_1240.SSON_1111,iSbBS512_1146.SbBS512_E2233,iUMN146_1321.UM146_11870,iUMNK88_1353.UMNK88_1361,iUTI89_1310.UTI89_C1216,iWFL_1372.ECW_m1199,iY75_1357.Y75_RS05700,iZ_1308.Z1730,ic_1306.c1360 Bacteria 1MU9N@1224,1RNIR@1236,3Z1MI@583,COG0332@1,COG0332@2 NA|NA|NA I Catalyzes the condensation reaction of fatty acid synthesis by the addition to an acyl acceptor of two carbons from malonyl-ACP. Catalyzes the first condensation reaction which initiates fatty acid synthesis and may therefore play a role in governing the total rate of fatty acid production. Possesses both acetoacetyl-ACP synthase and acetyl transacylase activities. Its substrate specificity determines the biosynthesis of branched- chain and or straight-chain of fatty acids Z1_03252 529507.PMI0858 1.4e-184 652.1 Proteus plsX GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006629,GO:0006644,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008654,GO:0009058,GO:0009987,GO:0019637,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044424,GO:0044464,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901576 2.3.1.15 ko:K03621 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R09380 RC00004,RC00039,RC00041 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iEcDH1_1363.EcDH1_2557,iSFxv_1172.SFxv_1246,iY75_1357.Y75_RS05695 Bacteria 1MVM3@1224,1RM7R@1236,3Z25K@583,COG0416@1,COG0416@2 NA|NA|NA I Catalyzes the reversible formation of acyl-phosphate (acyl-PO(4)) from acyl- acyl-carrier-protein (acyl-ACP). This enzyme utilizes acyl-ACP as fatty acyl donor, but not acyl-CoA Z1_03253 406817.XNC1_2739 4.6e-24 116.3 Gammaproteobacteria rpmF GO:0000027,GO:0000302,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016043,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042221,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050896,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901700,GO:1990904 ko:K02911 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011,ko03029 Bacteria 1N6RF@1224,1SC9G@1236,COG0333@1,COG0333@2 NA|NA|NA J Belongs to the bacterial ribosomal protein bL32 family Z1_03254 529507.PMI0856 5.4e-95 353.6 Proteus yceD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0040007,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K07040 ko00000 Bacteria 1PGKW@1224,1RRK3@1236,3Z1CH@583,COG1399@1,COG1399@2 NA|NA|NA S Uncharacterized ACR, COG1399 Z1_03255 529507.PMI0855 1.1e-107 396.0 Proteus maf GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0030312,GO:0044464,GO:0047429,GO:0071944 1.1.1.25,2.1.1.190 ko:K00014,ko:K03215,ko:K06287 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R02413 RC00206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009 Bacteria 1RDA9@1224,1S3TQ@1236,3Z19I@583,COG0424@1,COG0424@2 NA|NA|NA D Maf-like protein Z1_03256 529507.PMI0854 1e-66 259.2 Proteus Bacteria 1NN05@1224,1SI2V@1236,2EH3H@1,33AVH@2,3Z2TT@583 NA|NA|NA Z1_03257 529507.PMI0853 1.2e-174 619.0 Proteus rluC GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022613,GO:0031118,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.24 ko:K06179 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MVDX@1224,1RPAN@1236,3Z1B6@583,COG0564@1,COG0564@2 NA|NA|NA J Pseudouridine synthase Z1_03258 529507.PMI0852 0.0 1923.7 Proteus rne GO:0000287,GO:0000966,GO:0000967,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004540,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006401,GO:0006402,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008312,GO:0008995,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016072,GO:0016787,GO:0016788,GO:0017151,GO:0019222,GO:0019439,GO:0019899,GO:0022607,GO:0022613,GO:0034470,GO:0034471,GO:0034641,GO:0034655,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043462,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0048519,GO:0050789,GO:0050790,GO:0051095,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0051336,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0097159,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575,GO:1902280 3.1.26.12 ko:K08300 ko03018,map03018 M00394 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009,ko03019 Bacteria 1MV65@1224,1RMDS@1236,3Z13B@583,COG1530@1,COG1530@2 NA|NA|NA J Endoribonuclease that plays a central role in RNA processing and decay. Required for the maturation of 5S and 16S rRNAs and the majority of tRNAs. Also involved in the degradation of most mRNAs Z1_03259 529507.PMI0851 2.5e-53 214.5 Proteus yeeX GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09802 ko00000 Bacteria 1RH0U@1224,1S6XT@1236,3Z2T1@583,COG2926@1,COG2926@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF496) Z1_03260 529507.PMI0850 2.9e-224 784.3 Gammaproteobacteria lacY ko:K02532,ko:K08167 M00713,M00714 ko00000,ko00002,ko01504,ko02000 2.A.1.3,2.A.1.5 Bacteria 1QV89@1224,1T29Q@1236,COG0738@1,COG0738@2 NA|NA|NA G Major facilitator superfamily Z1_03261 549.BW31_04921 4.1e-42 177.6 Pantoea fosB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004364,GO:0008150,GO:0016740,GO:0016765,GO:0042221,GO:0046677,GO:0050896 2.5.1.18 ko:K11210,ko:K21265 ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1RH6K@1224,1S68V@1236,3W27S@53335,COG0346@1,COG0346@2 NA|NA|NA E Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily Z1_03262 529507.PMI0848 2.3e-281 974.2 Proteus sbcB GO:0000175,GO:0000287,GO:0000738,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004527,GO:0004529,GO:0004532,GO:0004536,GO:0004540,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006308,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008296,GO:0008297,GO:0008310,GO:0008408,GO:0008852,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016796,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016895,GO:0016896,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034655,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0051575,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090503,GO:0097159,GO:0140097,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901363,GO:1901575 3.1.11.1 ko:K01141 ko03430,map03430 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MV0U@1224,1RM85@1236,3Z11Y@583,COG2925@1,COG2925@2 NA|NA|NA L exodeoxyribonuclease I (exonuclease I) (DNA deoxyribophosphodiesterase) K01141 Z1_03263 529507.PMI0847 0.0 1199.9 Proteus dld GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004457,GO:0004458,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009898,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016898,GO:0016901,GO:0019516,GO:0019752,GO:0019897,GO:0019898,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031234,GO:0032787,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050662,GO:0051990,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0071949,GO:0097159,GO:0098552,GO:0098562,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901615 1.1.5.12 ko:K03777 ko00620,ko01120,map00620,map01120 R00704,R11591 RC00044 ko00000,ko00001,ko01000 iEcHS_1320.EcHS_A2268,iPC815.YPO1177 Bacteria 1MVG7@1224,1RN5V@1236,3Z0YY@583,COG0277@1,COG0277@2 NA|NA|NA C D-lactate dehydrogenase Z1_03264 529507.PMI0846 1.1e-164 585.9 Proteus Bacteria 1NUAB@1224,1RNYQ@1236,3Z2SF@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K LysR substrate binding domain Z1_03265 529507.PMI0845 0.0 1078.9 Proteus ipdC 4.1.1.74 ko:K04103 ko00380,ko01100,map00380,map01100 R01974 RC00506 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW2F@1224,1RQFY@1236,3Z1GG@583,COG3961@1,COG3961@2 NA|NA|NA GH Thiamine pyrophosphate enzyme Z1_03266 529507.PMI3382 1.1e-225 788.9 Gammaproteobacteria Z012_11195 ko:K07496 ko00000 Bacteria 1MUU0@1224,1RS1J@1236,COG0675@1,COG0675@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_03267 529507.PMI3034 1.5e-73 282.0 Gammaproteobacteria ko:K07491 ko00000 Bacteria 1RDD7@1224,1S4R2@1236,COG1943@1,COG1943@2 NA|NA|NA L Transposase Z1_03268 529507.PMI0843 6.6e-254 882.9 Proteus yeeF GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006928,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008519,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015101,GO:0015203,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015295,GO:0015318,GO:0015489,GO:0015672,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015846,GO:0015847,GO:0016020,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0034220,GO:0040011,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051674,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072488,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1902047,GO:1902600 ko:K14052 ko00000,ko02000 2.A.3.1.13 Bacteria 1MXNJ@1224,1RMKV@1236,3Z1Z4@583,COG0531@1,COG0531@2 NA|NA|NA E Amino acid permease Z1_03269 529507.PMI0842 0.0 1293.1 Proteus cirA ko:K16089 ko00000,ko02000 1.B.14.1,1.B.14.10 Bacteria 1MUC1@1224,1RNHR@1236,3Z2C4@583,COG1629@1,COG4771@2 NA|NA|NA P TonB dependent receptor Z1_03270 529507.PMI0841 6.4e-279 966.1 Proteus lysP GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0022607,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042802,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0046982,GO:0046983,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051259,GO:0051260,GO:0055085,GO:0065003,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071840,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03293,ko:K11733 ko00000,ko02000 2.A.3.1,2.A.3.1.2 iSBO_1134.SBO_2171,iYL1228.KPN_02594 Bacteria 1QTSM@1224,1RNI2@1236,3Z16Q@583,COG0833@1,COG0833@2 NA|NA|NA E Amino acid permease Z1_03271 529507.PMI0840 1.9e-161 575.1 Proteus yeiE GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 Bacteria 1MWVU@1224,1RPT8@1236,3Z1R7@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_03272 34506.g809 2.3e-193 681.4 Opisthokonta Opisthokonta 2RXXQ@2759,3ADVS@33154,COG2855@1 NA|NA|NA S Conserved hypothetical protein 698 Z1_03273 529507.PMI0838 4.4e-160 570.5 Proteus nfo GO:0000726,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003906,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006284,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008833,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016888,GO:0016893,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042578,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:0140097,GO:1901360 3.1.21.2 ko:K01151 ko03410,map03410 ko00000,ko00001,ko01000,ko03400 Bacteria 1MX4Y@1224,1RQ60@1236,3Z1FW@583,COG0648@1,COG0648@2 NA|NA|NA L Endonuclease IV plays a role in DNA repair. It cleaves phosphodiester bonds at apurinic or apyrimidinic sites (AP sites) to produce new 5'-ends that are base-free deoxyribose 5-phosphate residues. It preferentially attacks modified AP sites created by bleomycin and neocarzinostatin Z1_03274 529507.PMI0837 3.9e-77 293.9 Proteus rppH_2 3.6.1.55 ko:K03574 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1RF2T@1224,1S44A@1236,3Z2UC@583,COG1051@1,COG1051@2 NA|NA|NA F NUDIX domain Z1_03275 529507.PMI0836 5.4e-223 780.0 Proteus mtr GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015711,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03834,ko:K03835,ko:K03837 ko00000,ko02000 2.A.42.1.1,2.A.42.1.2,2.A.42.2.1 Bacteria 1MWGI@1224,1RMME@1236,3Z1U0@583,COG0814@1,COG0814@2 NA|NA|NA U Tryptophan/tyrosine permease family Z1_03276 529507.PMI0835 3.1e-101 374.4 Proteus efp GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003746,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006414,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02356 ko00000,ko03012 Bacteria 1NWY9@1224,1RQ0N@1236,3Z26F@583,COG0231@1,COG0231@2 NA|NA|NA J Elongation factor P (EF-P) OB domain Z1_03277 529507.PMI0834 1.6e-54 218.4 Proteus Bacteria 1QCRY@1224,1T8ID@1236,2AQ57@1,31FAK@2,3Z2Z7@583 NA|NA|NA Z1_03278 529507.PMI0833 1.6e-51 208.4 Proteus Bacteria 1QG8Z@1224,1TDN1@1236,2AKFR@1,31B7F@2,3Z34V@583 NA|NA|NA Z1_03279 529507.PMI0832 1.7e-131 475.3 Proteus lpxT GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0022607,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044464,GO:0045229,GO:0050380,GO:0061024,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944 2.7.4.29 ko:K19803 R11186 RC00002 ko00000,ko01000,ko01005 iAPECO1_1312.APECO1_4380,iSBO_1134.SBO_2150 Bacteria 1MW7A@1224,1RPKF@1236,3Z1I2@583,COG0671@1,COG0671@2 NA|NA|NA I Involved in the modification of the lipid A domain of lipopolysaccharides (LPS). Transfers a phosphate group from undecaprenyl pyrophosphate (C55-PP) to lipid A to form lipid A 1- diphosphate. Contributes to the recycling of undecaprenyl phosphate (C55-P) Z1_03280 529507.PMI0831 4.6e-106 390.6 Proteus spr GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0006022,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009254,GO:0016787,GO:0019538,GO:0030203,GO:0043170,GO:0044238,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901564 3.4.17.13 ko:K13694,ko:K13695 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1N0EE@1224,1RR2X@1236,3Z25B@583,COG0791@1,COG0791@2 NA|NA|NA M NlpC/P60 family Z1_03281 529507.PMI0830 2.5e-61 241.1 Proteus yejG Bacteria 1RHRA@1224,1S625@1236,2ATGA@1,31IZZ@2,3Z2Z4@583 NA|NA|NA S YejG-like protein Z1_03282 529507.PMI0829 2.9e-210 737.6 Proteus bcr GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006857,GO:0008150,GO:0015833,GO:0016020,GO:0022857,GO:0035442,GO:0035672,GO:0035673,GO:0042886,GO:0042887,GO:0042938,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071916,GO:0071944,GO:1904680 ko:K07552 ko00000,ko02000 2.A.1.2 Bacteria 1MW19@1224,1RMSZ@1236,3Z24B@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_03283 529507.PMI0828 2.3e-130 471.5 Proteus rsuA GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022613,GO:0031118,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.19,5.4.99.20,5.4.99.22 ko:K06178,ko:K06181,ko:K06183 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1MU6M@1224,1RQA9@1236,3Z1W7@583,COG1187@1,COG1187@2 NA|NA|NA J S4 RNA-binding domain Z1_03284 529507.PMI0827 0.0 1201.0 Proteus yejH GO:0003674,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010212,GO:0010501,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051301,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:1901360 ko:K19789 ko00000,ko03400 Bacteria 1MV9F@1224,1RNAN@1236,3Z202@583,COG1061@1,COG1061@2 NA|NA|NA L helicase superfamily c-terminal domain Z1_03285 529507.PMI0826 4.2e-46 190.3 Proteus rplY GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008097,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015934,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K02897 ko03010,map03010 M00178 ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RDH0@1224,1S46A@1236,3Z2WB@583,COG1825@1,COG1825@2 NA|NA|NA J This is one of the proteins that binds to the 5S RNA in the ribosome where it forms part of the central protuberance Z1_03286 529507.PMI0825 3.6e-185 654.1 Proteus ndpA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003723,GO:0003727,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0009295,GO:0042802,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043590,GO:0044424,GO:0044464,GO:0097159,GO:1901363 ko:K06899 ko00000,ko03036 Bacteria 1NXJU@1224,1RP8N@1236,3Z21M@583,COG3081@1,COG3081@2 NA|NA|NA S 37-kD nucleoid-associated bacterial protein Z1_03287 529507.PMI0824 3.6e-32 143.7 Proteus yejL GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09904 ko00000 Bacteria 1MZ9I@1224,1S8XQ@1236,3Z30V@583,COG3082@1,COG3082@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1414) Z1_03288 529507.PMI0823 0.0 1149.0 Proteus yejM GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07014 ko00000 Bacteria 1MX6X@1224,1RPAU@1236,3Z1VU@583,COG3083@1,COG3083@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF3413) Z1_03290 471874.PROSTU_03320 1.2e-93 349.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1RECX@1224,1S49M@1236,COG1280@1,COG1280@2 NA|NA|NA E threonine efflux protein Z1_03291 529507.PMI0814 5.1e-107 393.7 Gammaproteobacteria ydeN ko:K07002 ko00000 Bacteria 1RKTI@1224,1S66T@1236,COG3545@1,COG3545@2 NA|NA|NA S esterase of the alpha beta hydrolase fold Z1_03293 529507.PMI0812 2.8e-142 511.1 Gammaproteobacteria cmoA ko:K15256 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1R0SU@1224,1T4PE@1236,COG2890@1,COG2890@2 NA|NA|NA J Methyltransferase domain Z1_03294 529507.PMI0811 3.5e-27 126.7 Proteus Bacteria 1QGMQ@1224,1TE2I@1236,2ATEJ@1,31IY0@2,3Z3JB@583 NA|NA|NA Z1_03296 529507.PMI0810 4.9e-66 257.3 Proteus cigR Bacteria 1N3PU@1224,1S15B@1236,3Z2YX@583,COG5455@1,COG5455@2 NA|NA|NA S response to cobalt ion Z1_03297 529507.PMI0809 4.1e-141 507.3 Proteus 2.1.1.301 ko:K21459 ko00000,ko01000 Bacteria 1PVTT@1224,1T1VC@1236,3Z134@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA Q Methyltransferase domain Z1_03298 529507.PMI0808 1.1e-175 622.5 Proteus lpxL 2.3.1.241,2.3.1.242,2.3.1.243 ko:K02517,ko:K02560,ko:K12974 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R05075,R05146,R10906 RC00037,RC00039 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1MVNI@1224,1RMZ5@1236,3Z2A1@583,COG1560@1,COG1560@2 NA|NA|NA M Lipid A biosynthesis Z1_03299 529507.PMI0807 2e-32 144.4 Proteus cspA GO:0001072,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003723,GO:0003727,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031554,GO:0031564,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0043242,GO:0043244,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0060567,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1N6Q5@1224,1SCA7@1236,3Z2YN@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K Cold shock protein domain Z1_03300 34506.g768 5e-159 567.0 Opisthokonta Opisthokonta 28JUJ@1,2QS8H@2759,3ADH9@33154 NA|NA|NA S Alpha/beta hydrolase family Z1_03301 529507.PMI0805 7.8e-52 209.5 Proteus Bacteria 1RM6D@1224,1S7FP@1236,3Z2UV@583,COG3895@1,COG3895@2 NA|NA|NA S Membrane-bound lysozyme-inhibitor of c-type lysozyme Z1_03302 529507.PMI0804 2.6e-166 591.3 Proteus ykgA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009438,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016070,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019172,GO:0019243,GO:0019249,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032774,GO:0032787,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0046185,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 ko:K05804,ko:K13653 M00647,M00767 ko00000,ko00002,ko03000,ko03036 Bacteria 1MWTF@1224,1S19K@1236,3Z1RN@583,COG2207@1,COG2207@2,COG3708@1,COG3708@2 NA|NA|NA K Integron-associated effector binding protein Z1_03303 34506.g769 2.6e-288 997.3 Eukaryota Eukaryota 2RZ1C@2759,COG4690@1 NA|NA|NA E Peptidase family C69 Z1_03304 529507.PMI0802 3.8e-145 520.8 Gammaproteobacteria dkgB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004033,GO:0006081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0042180,GO:0042182,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046185,GO:0047681,GO:0051596,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901575,GO:1990002 1.1.1.346 ko:K06222 ko00000,ko01000 iEcolC_1368.EcolC_3458 Bacteria 1MWFS@1224,1RMX6@1236,COG0656@1,COG0656@2 NA|NA|NA S reductase Z1_03305 529507.PMI0801 2.8e-160 571.2 Proteus yafC GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010212,GO:0010467,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019438,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050896,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 Bacteria 1MU7H@1224,1RPF8@1236,3Z1E3@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_03306 529507.PMI0800 6.7e-50 203.0 Proteus cbpM GO:0003674,GO:0004857,GO:0008150,GO:0030234,GO:0043086,GO:0044092,GO:0050790,GO:0065007,GO:0065009,GO:0098772 ko:K18997 ko00000,ko03036 Bacteria 1N0AR@1224,1S9HZ@1236,3Z2UX@583,COG0789@1,COG0789@2 NA|NA|NA K MerR HTH family regulatory protein Z1_03307 529507.PMI0799 2.4e-178 631.3 Proteus cbpA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003681,GO:0005488,GO:0097159,GO:1901363 ko:K03686,ko:K04082,ko:K05516 ko00000,ko03029,ko03036,ko03110 Bacteria 1MUZ4@1224,1RP09@1236,3Z10G@583,COG0484@1,COG0484@2 NA|NA|NA O displays overlapping activities with DnaJ, but functions under different conditions, probably acting as a molecular chaperone in an adaptive response to environmental stresses other than heat shock. Lacks autonomous chaperone activity Z1_03308 529507.PMI0798 7.7e-60 236.1 Proteus yeaR Bacteria 1RFYQ@1224,1S4B0@1236,3Z3FQ@583,COG3615@1,COG3615@2 NA|NA|NA P Domain of unknown function (DUF1971) Z1_03309 529507.PMI0797 9.2e-56 222.6 Proteus Bacteria 1NENK@1224,1T6NM@1236,2BFDU@1,31DUA@2,3Z3GQ@583 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF1869) Z1_03311 529507.PMI0795 4.8e-96 357.1 Gammaproteobacteria ttr ko:K19113 ko00261,ko01130,map00261,map01130 R10893 RC00004,RC00064 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RBE6@1224,1S916@1236,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K histone acetyltransferase HPA2 and related acetyltransferases Z1_03313 529507.PMI0794 3.9e-56 223.8 Proteus tusE GO:0002097,GO:0002098,GO:0002143,GO:0003674,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0034227,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097163,GO:0140104,GO:1901360 ko:K11179 ko04122,map04122 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Bacteria 1RGVG@1224,1S5ZA@1236,3Z2SZ@583,COG2920@1,COG2920@2 NA|NA|NA H Part of a sulfur-relay system Z1_03314 529507.PMI0793 3.1e-49 200.7 Proteus acyP GO:0003674,GO:0003824,GO:0003998,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818 3.6.1.7 ko:K01512 ko00620,ko00627,ko01120,map00620,map00627,map01120 R00317,R01421,R01515 RC00043 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1QJ6I@1224,1TH44@1236,3Z2UK@583,COG1254@1,COG1254@2 NA|NA|NA C Acylphosphatase Z1_03315 529507.PMI0792 4e-53 213.8 Proteus hspQ ko:K11940 ko00000,ko03036 Bacteria 1RGWN@1224,1S62D@1236,3Z2PW@583,COG3785@1,COG3785@2 NA|NA|NA S Involved in the degradation of certain denaturated proteins, including DnaA, during heat shock stress Z1_03316 529507.PMI0791 1e-69 269.2 Proteus yccU GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.5.1.49 ko:K01740,ko:K06929 ko00270,ko01100,map00270,map01100 R01287,R04859 RC00020,RC02821,RC02848 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1N03D@1224,1S3T2@1236,3Z2KR@583,COG1832@1,COG1832@2 NA|NA|NA S CoA binding domain Z1_03317 529507.PMI0790 1e-81 309.3 Proteus mgsA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008929,GO:0009058,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016838,GO:0019242,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0071704,GO:1901576 4.2.3.3 ko:K01734 ko00640,ko01120,map00640,map01120 R01016 RC00424 ko00000,ko00001,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_1153,iYL1228.KPN_00992 Bacteria 1RD3D@1224,1S3XN@1236,3Z30F@583,COG1803@1,COG1803@2 NA|NA|NA G Methylglyoxal synthase Z1_03318 529507.PMI0789 0.0 1351.7 Proteus helD GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0032392,GO:0032508,GO:0032991,GO:0033202,GO:0034641,GO:0042623,GO:0043138,GO:0043140,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051276,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140097,GO:1901360,GO:1902494 3.6.4.12 ko:K03658 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVWI@1224,1RN1N@1236,3Z1D9@583,COG0210@1,COG0210@2 NA|NA|NA L DNA helicase IV / RNA helicase N terminal Z1_03319 529507.PMI0788 0.0 1411.7 Proteus yccS GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MWR1@1224,1RNIJ@1236,3Z26P@583,COG1289@1,COG1289@2 NA|NA|NA S Membrane Z1_03320 529507.PMI0787 2e-109 401.7 Proteus sxy GO:0006355,GO:0006810,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009290,GO:0009292,GO:0009294,GO:0009605,GO:0009889,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010468,GO:0010556,GO:0015931,GO:0019219,GO:0019222,GO:0030420,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031344,GO:0031346,GO:0031668,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044093,GO:0044764,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050657,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051027,GO:0051090,GO:0051091,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051252,GO:0051704,GO:0051716,GO:0060255,GO:0060491,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071702,GO:0071705,GO:0080090,GO:0098657,GO:1903506,GO:1903656,GO:1903658,GO:2000112,GO:2001141 ko:K07343 ko00000 Bacteria 1RDWD@1224,1S496@1236,3Z32W@583,COG3070@1,COG3070@2 NA|NA|NA K TfoX N-terminal domain Z1_03321 529507.PMI0786 3e-96 357.8 Proteus sulA GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008150,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010564,GO:0010948,GO:0031333,GO:0031668,GO:0032271,GO:0032272,GO:0032465,GO:0032466,GO:0033554,GO:0034260,GO:0043086,GO:0043087,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044092,GO:0045786,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051302,GO:0051336,GO:0051346,GO:0051716,GO:0051726,GO:0051782,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:1903664,GO:1903665,GO:2000241,GO:2000242,GO:2000244,GO:2000245 ko:K13053,ko:K14160 ko00000,ko03036,ko03400 Bacteria 1RD22@1224,1RYWE@1236,3Z23G@583,COG5404@1,COG5404@2 NA|NA|NA D Component of the SOS system and an inhibitor of cell division. Accumulation of SulA causes rapid cessation of cell division and the appearance of long, non-septate filaments. In the presence of GTP, binds a polymerization-competent form of FtsZ in a 1 1 ratio, thus inhibiting FtsZ polymerization and therefore preventing it from participating in the assembly of the Z ring. This mechanism prevents the premature segregation of damaged DNA to daughter cells during cell division Z1_03322 529507.PMI0785 1.2e-197 695.7 Proteus ompA GO:0000746,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009597,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0009987,GO:0015267,GO:0015288,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016032,GO:0019058,GO:0019867,GO:0022803,GO:0022829,GO:0022857,GO:0030260,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033554,GO:0034220,GO:0042802,GO:0043207,GO:0044403,GO:0044409,GO:0044419,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046718,GO:0046930,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051716,GO:0051806,GO:0051828,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098796 ko:K03286,ko:K03640 ko00000,ko02000 1.B.6,2.C.1.2 iECIAI1_1343.ECIAI1_0998,iECNA114_1301.ECNA114_1035,iECSF_1327.ECSF_0871,iUTI89_1310.UTI89_C1022 Bacteria 1N6EM@1224,1RMJ7@1236,3Z1M5@583,COG2885@1,COG2885@2,COG3637@1,COG3637@2 NA|NA|NA M OmpA family Z1_03323 529507.PMI0784 7.8e-80 303.1 Proteus matP GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005694,GO:0006996,GO:0007059,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0032991,GO:0032993,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043565,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044446,GO:0044464,GO:0051276,GO:0051301,GO:0071840,GO:0097047,GO:0097159,GO:1901363 ko:K09911 ko00000 Bacteria 1RA57@1224,1S28S@1236,3Z11T@583,COG3120@1,COG3120@2 NA|NA|NA D Required for spatial organization of the terminus region of the chromosome (Ter macrodomain) during the cell cycle. Prevents early segregation of duplicated Ter macrodomains during cell division. Binds specifically to matS, which is a 13 bp signature motif repeated within the Ter macrodomain Z1_03324 529507.PMI0783 0.0 1168.7 Proteus ycbZ ko:K04770 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1MWGB@1224,1RMPC@1236,3Z29A@583,COG1067@1,COG1067@2 NA|NA|NA O protease La homolog, YcbZ of Escherichia coli K04770 Z1_03325 529507.PMI0782 9.5e-97 359.4 Proteus fabA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008693,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016863,GO:0019171,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034017,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0047451,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901576 4.2.1.59,5.3.3.14 ko:K01716 ko00061,ko01100,ko01212,map00061,map01100,map01212 M00083 R04428,R04535,R04537,R04544,R04568,R04954,R04965,R07639 RC00831,RC01078,RC01095 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 iAF1260.b0954,iB21_1397.B21_00965,iBWG_1329.BWG_0806,iE2348C_1286.E2348C_0940,iEC042_1314.EC042_1039,iECBD_1354.ECBD_2641,iECB_1328.ECB_00958,iECDH10B_1368.ECDH10B_1024,iECD_1391.ECD_00958,iECED1_1282.ECED1_0977,iECH74115_1262.ECH74115_1118,iECIAI1_1343.ECIAI1_0995,iECIAI39_1322.ECIAI39_2193,iECNA114_1301.ECNA114_1032,iECO103_1326.ECO103_1000,iECO111_1330.ECO111_1022,iECO26_1355.ECO26_1081,iECOK1_1307.ECOK1_1013,iECS88_1305.ECS88_0975,iECSF_1327.ECSF_0868,iECSP_1301.ECSP_1060,iECUMN_1333.ECUMN_1143,iECW_1372.ECW_m1064,iECs_1301.ECs1038,iEKO11_1354.EKO11_2876,iETEC_1333.ETEC_1024,iEcE24377_1341.EcE24377A_1068,iEcHS_1320.EcHS_A1063,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2166,iEcolC_1368.EcolC_2642,iG2583_1286.G2583_1189,iJO1366.b0954,iJR904.b0954,iLF82_1304.LF82_0604,iSBO_1134.SBO_2277,iSDY_1059.SDY_0927,iSF_1195.SF0954,iSSON_1240.SSON_0958,iSbBS512_1146.SbBS512_E2362,iUMNK88_1353.UMNK88_1108,iWFL_1372.ECW_m1064,iY75_1357.Y75_RS04955,iZ_1308.Z1304,ic_1306.c1090 Bacteria 1MWV8@1224,1RP6W@1236,3Z25G@583,COG0764@1,COG0764@2 NA|NA|NA I Necessary for the introduction of cis unsaturation into fatty acids. Catalyzes the dehydration of (3R)-3-hydroxydecanoyl- ACP to E-(2)-decenoyl-ACP and then its isomerization to Z-(3)- decenoyl-ACP. Can catalyze the dehydratase reaction for beta- hydroxyacyl-ACPs with saturated chain lengths up to 16 0, being most active on intermediate chain length Z1_03326 529507.PMI0781 4.1e-25 119.8 Proteus rmf GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032055,GO:0032268,GO:0032269,GO:0033554,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043024,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043555,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044464,GO:0044877,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:2000112,GO:2000113 ko:K03812 ko00000,ko03009 Bacteria 1N761@1224,1SCIC@1236,3Z32E@583,COG3130@1,COG3130@2 NA|NA|NA J During stationary phase, converts 70S ribosomes to an inactive dimeric form (100S ribosomes) Z1_03327 471881.PROPEN_04575 1e-53 216.1 Proteus 3.4.13.21 ko:K05995,ko:K06888 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1N2T4@1224,1S2GH@1236,3Z3EY@583,COG4405@1,COG4405@2 NA|NA|NA S ASCH Z1_03328 529507.PMI0778 3.4e-103 380.9 Proteus ymbA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030288,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031225,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0036405,GO:0036406,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944,GO:0098552 ko:K09857 ko00000 Bacteria 1PJIN@1224,1RQTB@1236,3Z2CH@583,COG3009@1,COG3009@2 NA|NA|NA S ABC-type transport auxiliary lipoprotein component Z1_03329 529507.PMI0777 0.0 1081.6 Proteus pqiB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010876,GO:0016043,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0042597,GO:0042802,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0071702,GO:0071840,GO:0120009 ko:K02067,ko:K06192 ko02010,map02010 M00210,M00669,M00670 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.27 Bacteria 1MU1T@1224,1RN89@1236,3Z1X3@583,COG1463@1,COG1463@2,COG3008@1,COG3008@2 NA|NA|NA Q MlaD protein Z1_03330 529507.PMI0776 9.2e-242 842.4 Proteus pqiA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03808 ko00000 Bacteria 1MWG1@1224,1RM9Z@1236,3Z24N@583,COG2995@1,COG2995@2 NA|NA|NA S Paraquat-inducible protein A Z1_03331 529507.PMI0775 0.0 1240.7 Proteus uup GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010528,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051171,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070894,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363 ko:K15738 ko00000,ko02000 3.A.1.120.6 Bacteria 1MU37@1224,1RPCU@1236,3Z1P7@583,COG0488@1,COG0488@2 NA|NA|NA S ABC transporter C-terminal domain Z1_03332 529507.PMI0774 0.0 1417.1 Proteus rlmL GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008170,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008649,GO:0008757,GO:0008990,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016423,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0030488,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036265,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070043,GO:0070475,GO:0070476,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.173,2.1.1.191,2.1.1.264,2.1.1.72 ko:K00571,ko:K06969,ko:K07444,ko:K12297 R07234 RC00003 ko00000,ko01000,ko02048,ko03009 Bacteria 1MUQM@1224,1RNMH@1236,3Z0YP@583,COG0116@1,COG0116@2,COG1092@1,COG1092@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the guanine in position 2445 (m2G2445) and the guanine in position 2069 (m7G2069) of 23S rRNA Z1_03333 529507.PMI0773 2.8e-218 764.2 Proteus ycbX GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009404,GO:0009407,GO:0009636,GO:0009987,GO:0019748,GO:0042221,GO:0044237,GO:0044248,GO:0050896,GO:0098754 1.14.12.17 ko:K05916,ko:K07140 ko05132,map05132 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MXN2@1224,1RMN7@1236,3Z1Z8@583,COG1018@1,COG1018@2,COG3217@1,COG3217@2 NA|NA|NA C MOSC N-terminal beta barrel domain Z1_03334 529507.PMI0772 3.4e-100 370.9 Proteus zapC GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0032153,GO:0042802,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051302,GO:0065007 ko:K18657 ko00000,ko03036 Bacteria 1N1DT@1224,1RYK3@1236,28I7M@1,2Z8AH@2,3Z13X@583 NA|NA|NA D Contributes to the efficiency of the cell division process by stabilizing the polymeric form of the cell division protein FtsZ. Acts by promoting interactions between FtsZ protofilaments and suppressing the GTPase activity of FtsZ Z1_03335 529507.PMI0771 4.6e-188 663.7 Proteus pyrD GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004152,GO:0004158,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0010181,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016634,GO:0016635,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019856,GO:0032553,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046390,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 1.3.1.14,1.3.5.2 ko:K00254,ko:K02823,ko:K17828 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00051 R01868,R01869 RC00051 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC042_1314.EC042_1029,iECIAI39_1322.ECIAI39_2202,iECUMN_1333.ECUMN_1134,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2174,iPC815.YPO1415,iYL1228.KPN_00974 Bacteria 1MU7C@1224,1RMCP@1236,3Z16Z@583,COG0167@1,COG0167@2 NA|NA|NA F Catalyzes the conversion of dihydroorotate to orotate with quinone as electron acceptor Z1_03336 529507.PMI0770 3.1e-192 677.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NBWK@1224,1RY9R@1236,COG4804@1,COG4804@2 NA|NA|NA L nuclease activity Z1_03337 529507.PMI0769 0.0 1735.3 Proteus pepN GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008235,GO:0008237,GO:0008238,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016787,GO:0019538,GO:0033218,GO:0034641,GO:0042277,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043171,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0070006,GO:0070011,GO:0071704,GO:0071944,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 3.4.11.2 ko:K01256 ko00480,ko01100,map00480,map01100 R00899,R04951 RC00096,RC00141 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 iECIAI1_1343.ECIAI1_0973,iECO103_1326.ECO103_0977,iECP_1309.ECP_0944,iECSE_1348.ECSE_0993,iECW_1372.ECW_m1042,iEKO11_1354.EKO11_2898,iWFL_1372.ECW_m1042 Bacteria 1MUCI@1224,1RMA7@1236,3Z223@583,COG0308@1,COG0308@2 NA|NA|NA E aminopeptidase N Z1_03338 529507.PMI0767 2.7e-235 820.8 Proteus pncB GO:0000183,GO:0001302,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004516,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006325,GO:0006342,GO:0006348,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006734,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0007568,GO:0007569,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009435,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016043,GO:0016458,GO:0016874,GO:0016879,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019357,GO:0019358,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019365,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019674,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032502,GO:0034641,GO:0034654,GO:0040029,GO:0043094,GO:0043173,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045814,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046497,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051276,GO:0055086,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072524,GO:0072525,GO:0080090,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 6.3.4.21 ko:K00763 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R01724 RC00033 ko00000,ko00001,ko01000 iAF1260.b0931,iBWG_1329.BWG_0783,iECDH10B_1368.ECDH10B_1001,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0882,iECIAI39_1322.ECIAI39_2216,iETEC_1333.ETEC_0999,iEcDH1_1363.EcDH1_2712,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2189,iJO1366.b0931,iJR904.b0931,iUMNK88_1353.UMNK88_1085,iY75_1357.Y75_RS04840 Bacteria 1MV8U@1224,1RQWS@1236,3Z2XH@583,COG1488@1,COG1488@2 NA|NA|NA F Nicotinate phosphoribosyltransferase Z1_03339 529507.PMI0766 5.4e-272 943.0 Proteus asnS GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004816,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006421,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0017076,GO:0019538,GO:0019752,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.22 ko:K01893 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03648 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iSDY_1059.SDY_2327 Bacteria 1MWFV@1224,1RMU4@1236,3Z2D1@583,COG0017@1,COG0017@2 NA|NA|NA J tRNA synthetases class II (D, K and N) Z1_03340 529507.PMI0765 4.3e-203 713.8 Proteus ompF GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K09476,ko:K14062 ko01501,ko02020,map01501,map02020 M00746 ko00000,ko00001,ko00002,ko01504,ko02000 1.B.1.1,1.B.1.1.1 Bacteria 1MVRY@1224,1RNBS@1236,3Z1PQ@583,COG3203@1,COG3203@2 NA|NA|NA M Gram-negative porin Z1_03341 529507.PMI0764 8.5e-226 789.3 Proteus aspC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004069,GO:0004838,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006558,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009094,GO:0009095,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0017144,GO:0019438,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0033585,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0048037,GO:0050662,GO:0070279,GO:0070547,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902221,GO:1902223 2.6.1.1,2.6.1.57 ko:K00813,ko:K00832 ko00220,ko00250,ko00270,ko00330,ko00350,ko00360,ko00400,ko00401,ko00950,ko00960,ko01100,ko01110,ko01130,ko01210,ko01230,map00220,map00250,map00270,map00330,map00350,map00360,map00400,map00401,map00950,map00960,map01100,map01110,map01130,map01210,map01230 M00024,M00025,M00034,M00040 R00355,R00694,R00734,R00896,R01731,R02433,R02619,R05052,R07396,R10845 RC00006,RC00036 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iPC815.YPO1410,iSFxv_1172.SFxv_1000 Bacteria 1MUT0@1224,1RN02@1236,3Z10H@583,COG1448@1,COG1448@2 NA|NA|NA E Aminotransferase class I and II Z1_03342 529507.PMI0762 6.1e-198 696.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1N4SH@1224,1SZVV@1236,2DMJQ@1,32S16@2 NA|NA|NA Z1_03343 406817.XNC1_3349 1.3e-71 276.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RACP@1224,1S35G@1236,28YG2@1,2ZKAC@2 NA|NA|NA Z1_03344 406817.XNC1_3348 2.9e-59 234.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,COG3209@1,COG3209@2,COG4104@1,COG4104@2 NA|NA|NA M COG3209 Rhs family protein Z1_03345 291112.PAU_01169 1.4e-34 152.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1P04N@1224,1SRTE@1236,2FEGQ@1,346G9@2 NA|NA|NA Z1_03348 471874.PROSTU_01165 1.8e-80 305.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NIR5@1224,1SNPF@1236,2DR1U@1,339TE@2 NA|NA|NA Z1_03349 471874.PROSTU_01164 5.1e-46 190.3 Gammaproteobacteria Bacteria 1PG2K@1224,1SU9P@1236,COG3209@1,COG3209@2 NA|NA|NA M A nuclease family of the HNH/ENDO VII superfamily with conserved AHH Z1_03351 61647.LG71_25545 2.1e-23 115.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1N46W@1224,1SBX0@1236,2DMV8@1,32TX1@2 NA|NA|NA Z1_03352 264730.PSPPH_5072 3e-37 161.4 Pseudomonas syringae group Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,1Z4VW@136849,COG3209@1,COG3209@2,COG4104@1,COG4104@2 NA|NA|NA M RHS family Z1_03354 1166016.W5S_0053 3.6e-26 125.2 Pectobacterium Bacteria 1MT7I@122277,1P1V8@1224,1SSMM@1236,2CETA@1,344ZY@2 NA|NA|NA Z1_03355 1073999.BN137_3159 1.5e-26 125.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,COG3209@1,COG3209@2 NA|NA|NA M COG3209 Rhs family protein Z1_03356 471874.PROSTU_00590 6.3e-134 483.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,COG3209@1,COG3209@2 NA|NA|NA M COG3209 Rhs family protein Z1_03357 1220589.CD32_20860 3.5e-30 137.5 Bacteria Bacteria 28UAF@1,2ZGFX@2 NA|NA|NA Z1_03359 529507.PMI0761 3.6e-51 207.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,COG3209@1,COG3209@2 NA|NA|NA M COG3209 Rhs family protein Z1_03360 319224.Sputcn32_2884 1.4e-24 119.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1NGU6@1224,1SJ10@1236,COG0457@1,COG0457@2 NA|NA|NA S Tetratricopeptide repeat Z1_03361 291112.PAU_00952 2.2e-27 129.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1RK3G@1224,1S7C8@1236,2B6KK@1,31ZJ0@2 NA|NA|NA Z1_03362 471874.PROSTU_00590 0.0 1820.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVV1@1224,1SKYM@1236,COG3209@1,COG3209@2 NA|NA|NA M COG3209 Rhs family protein Z1_03363 471874.PROSTU_00589 1e-53 216.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1RIEY@1224,1SB4N@1236,COG5435@1,COG5435@2 NA|NA|NA S Pfam:DUF1795 Z1_03364 529507.PMI0751 0.0 1227.6 Proteus tssI ko:K11904 ko03070,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MU7Q@1224,1RMZS@1236,3Z3CY@583,COG3501@1,COG3501@2 NA|NA|NA S vgr_GE Rhs element Vgr family protein Z1_03365 529507.PMI1117 5.6e-97 360.1 Proteus hcp ko:K06887,ko:K11903 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1MXFB@1224,1RNKQ@1236,3Z351@583,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system effector, Hcp Z1_03366 529507.PMI0749 6e-72 276.9 Proteus tssB ko:K11901 ko02025,map02025 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1RBNB@1224,1S2BT@1236,3Z338@583,COG3516@1,COG3516@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system, VipA, VC_A0107 or Hcp2 Z1_03367 529507.PMI0748 5.9e-285 986.1 Proteus evpB ko:K11900 ko02025,map02025 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MU5C@1224,1RNP7@1236,3Z0UX@583,COG3517@1,COG3517@2 NA|NA|NA S Type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108, tail sheath Z1_03368 529507.PMI0747 8.5e-75 286.2 Proteus ko:K11905 M00334 ko00000,ko00002,ko02044 Bacteria 1RE8H@1224,1S45J@1236,3Z3FP@583,COG3518@1,COG3518@2 NA|NA|NA S Gene 25-like lysozyme Z1_03369 529507.PMI0746 0.0 1180.2 Proteus vasA ko:K11896 M00334 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MUY4@1224,1RPK4@1236,3Z2V1@583,COG3519@1,COG3519@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system, TssF Z1_03370 529507.PMI0745 4.5e-199 700.3 Proteus impH ko:K11895 ko02025,map02025 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MWVS@1224,1RQD5@1236,3Z35Z@583,COG3520@1,COG3520@2 NA|NA|NA S Type VI secretion, TssG Z1_03371 529507.PMI0744 4.5e-241 840.1 Proteus impI ko:K11894,ko:K11913 ko02025,ko03070,map02025,map03070 ko00000,ko00001,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MUKE@1224,1RQGW@1236,3Z3CN@583,COG3456@1,COG3456@2 NA|NA|NA T conserved protein, contains FHA domain Z1_03372 529507.PMI0743 4.8e-99 367.1 Proteus vasD ko:K11906 ko03070,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MX5E@1224,1S83T@1236,3Z3F2@583,COG3521@1,COG3521@2 NA|NA|NA M Type VI secretion lipoprotein, VasD, EvfM, TssJ, VC_A0113 Z1_03373 529507.PMI0742 1.3e-259 901.7 Proteus impJ ko:K11893 ko02025,map02025 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MXKE@1224,1RNCB@1236,3Z33D@583,COG3522@1,COG3522@2 NA|NA|NA S Bacterial Type VI secretion, VC_A0110, EvfL, ImpJ, VasE Z1_03374 529507.PMI0741 1.7e-139 501.9 Proteus vasF ko:K11892 ko03070,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MU13@1224,1S2PW@1236,3Z34D@583,COG3455@1,COG3455@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system protein DotU Z1_03375 529507.PMI0740 0.0 1725.3 Proteus clpV ko:K03696,ko:K11907 ko01100,ko02025,ko03070,map01100,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044,ko03110 3.A.23.1 Bacteria 1MVBH@1224,1RMZH@1236,3Z0WU@583,COG0542@1,COG0542@2 NA|NA|NA O ATPase family associated with various cellular activities (AAA) Z1_03376 529507.PMI0739 6e-143 513.5 Proteus Bacteria 1R5N3@1224,1S0HS@1236,3Z39X@583,COG3829@1,COG3829@2 NA|NA|NA KT transcription factor binding Z1_03377 529507.PMI0738 1.1e-118 432.6 Proteus vasI ko:K11909 ko00000,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1N3SX@1224,1SBDD@1236,2C9Y5@1,32RR9@2,3Z3EX@583 NA|NA|NA S Type VI secretion system VasI, EvfG, VC_A0118 Z1_03378 529507.PMI0737 1e-276 958.7 Proteus vasJ ko:K11910 M00334 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1MWDQ@1224,1RQXI@1236,3Z3DA@583,COG3515@1,COG3515@2 NA|NA|NA S Type VI secretion, EvfE, EvfF, ImpA, BimE, VC_A0119, VasJ Z1_03379 529507.PMI0736 0.0 2345.5 Proteus icmF ko:K11891,ko:K12210 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 3.A.23.1,3.A.7.9.1 Bacteria 1MV3D@1224,1RPQ2@1236,3Z3BY@583,COG3523@1,COG3523@2 NA|NA|NA S ImcF-related N-terminal domain Z1_03380 529507.PMI0735 3.9e-259 900.2 Proteus ko:K11911 M00334 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1Q02U@1224,1RQNJ@1236,3Z32D@583,COG3515@1,COG3515@2 NA|NA|NA S ImpA, N-terminal, type VI secretion system Z1_03381 529507.PMI0734 0.0 1186.8 Proteus ko:K11896 M00334 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.23.1 Bacteria 1RBQB@1224,1S2HB@1236,3Z3C7@583,COG3519@1,COG3519@2 NA|NA|NA S Type VI secretion system, TssF Z1_03382 529507.PMI0733 2e-85 321.6 Proteus ko:K06887,ko:K11903 ko02025,ko03070,map02025,map03070 M00334 ko00000,ko00001,ko00002,ko02044 Bacteria 1NU11@1224,1SN57@1236,3Z3FU@583,COG3157@1,COG3157@2 NA|NA|NA S VI_effect_Hcp1 type VI secretion system effector, Hcp1 family protein Z1_03383 529507.PMI0732 1.5e-128 465.3 Proteus ycbL GO:0003674,GO:0003824,GO:0004416,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006089,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009438,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0019243,GO:0019752,GO:0032787,GO:0042180,GO:0042182,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046185,GO:0051596,GO:0061727,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901615 3.1.2.6 ko:K01069 ko00620,map00620 R01736 RC00004,RC00137 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MUDN@1224,1RMMG@1236,3Z2JF@583,COG0491@1,COG0491@2 NA|NA|NA S COG0491 Zn-dependent hydrolases, including glyoxylases Z1_03384 529507.PMI0731 2e-100 371.7 Proteus ycbK ko:K02395 ko00000,ko02035 Bacteria 1MWW2@1224,1RS5K@1236,3Z2VM@583,COG3108@1,COG3108@2 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF882) Z1_03385 529507.PMI0730 0.0 1131.7 Proteus ycbB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008234,GO:0008236,GO:0008238,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016755,GO:0016787,GO:0016807,GO:0017171,GO:0019538,GO:0033554,GO:0042546,GO:0043164,GO:0043170,GO:0044036,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070004,GO:0070008,GO:0070011,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071972,GO:0140096,GO:1901564 ko:K21470 ko00000,ko01002,ko01011 Bacteria 1MV14@1224,1RQR7@1236,3Z21N@583,COG2989@1,COG2989@2 NA|NA|NA S Putative peptidoglycan binding domain Z1_03386 529507.PMI0729 4.8e-131 473.8 Proteus aphA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003993,GO:0004647,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042578,GO:0042597,GO:0044237,GO:0044464,GO:0048037 3.1.3.2 ko:K03788 ko00740,ko01100,map00740,map01100 R00548 RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_4476,iYL1228.KPN_04442 Bacteria 1PRRA@1224,1RP0N@1236,3Z253@583,COG3700@1,COG3700@2 NA|NA|NA S HAD superfamily, subfamily IIIB (Acid phosphatase) Z1_03387 529507.PMI0728 2e-123 448.4 Proteus cat 2.3.1.28 ko:K19271 br01600,ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1NJRF@1224,1RYYX@1236,3Z2R4@583,COG4845@1,COG4845@2 NA|NA|NA H This enzyme is an effector of chloramphenicol resistance in bacteria Z1_03388 529507.PMI0727 0.0 2665.6 Proteus mukB GO:0000166,GO:0000793,GO:0000796,GO:0000819,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006323,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007062,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0017076,GO:0019001,GO:0022402,GO:0030261,GO:0030554,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032561,GO:0032991,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044815,GO:0051276,GO:0051301,GO:0071103,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098813,GO:1901265,GO:1901363 3.5.4.40 ko:K03632,ko:K18286 ko00130,ko01110,map00130,map01110 R10695 RC00477 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036 Bacteria 1MUWM@1224,1RPFF@1236,3Z23Q@583,COG3096@1,COG3096@2 NA|NA|NA D cell division protein MukB K03632 Z1_03389 529507.PMI0726 2.1e-118 431.8 Proteus mukE GO:0005575,GO:0007059,GO:0008150,GO:0009295,GO:0009987 ko:K03804,ko:K21006 ko02025,map02025 ko00000,ko00001,ko03036 Bacteria 1MXYN@1224,1RRBE@1236,3Z1GP@583,COG3095@1,COG3095@2 NA|NA|NA D Involved in chromosome condensation, segregation and cell cycle progression. May participate in facilitating chromosome segregation by condensation DNA from both sides of a centrally located replisome during cell division. Probably acts via its interaction with MukB and MukF Z1_03390 529507.PMI0725 3.4e-247 860.5 Proteus mukF GO:0005575,GO:0009295 ko:K03633 ko00000,ko03036 Bacteria 1N0D6@1224,1RN7P@1236,3Z262@583,COG3006@1,COG3006@2 NA|NA|NA D Involved in chromosome condensation, segregation and cell cycle progression. May participate in facilitating chromosome segregation by condensation DNA from both sides of a centrally located replisome during cell division. Not required for mini-F plasmid partitioning. Probably acts via its interaction with MukB and MukE. Overexpression results in anucleate cells. It has a calcium binding activity Z1_03391 529507.PMI0724 6.3e-145 520.0 Proteus cmoM GO:0001510,GO:0002097,GO:0002098,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016300,GO:0016740,GO:0016741,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097697,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 ko:K06219,ko:K20444 ko00000,ko01000,ko01005,ko02000 4.D.1.3 GT2,GT4 Bacteria 1MY0S@1224,1RP69@1236,3Z1RD@583,COG2227@1,COG2227@2 NA|NA|NA J Catalyzes the methylation of 5-carboxymethoxyuridine (cmo5U) to form 5-methoxycarbonylmethoxyuridine (mcmo5U) at position 34 in tRNAs Z1_03392 529507.PMI0723 2.5e-147 528.1 Proteus ycbC GO:0000270,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006022,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0030203,GO:0031224,GO:0042546,GO:0043164,GO:0043170,GO:0044085,GO:0044425,GO:0044464,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901564 Bacteria 1MVW8@1224,1RNZC@1236,3Z2F9@583,COG1434@1,COG1434@2 NA|NA|NA S DUF218 domain Z1_03393 529507.PMI0722 9.2e-141 506.1 Proteus kdsB GO:0000271,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005996,GO:0006082,GO:0006629,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008690,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0019294,GO:0019752,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046364,GO:0046394,GO:0046400,GO:0046401,GO:0046872,GO:0070567,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901576,GO:1903509 2.7.7.38 ko:K00979 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00063 R03351,R11396 RC00152,RC00910 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iAF1260.b0918,iB21_1397.B21_00929,iBWG_1329.BWG_0770,iECBD_1354.ECBD_2677,iECB_1328.ECB_00922,iECDH10B_1368.ECDH10B_0988,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0869,iECD_1391.ECD_00922,iETEC_1333.ETEC_0986,iEcDH1_1363.EcDH1_2725,iEcHS_1320.EcHS_A1025,iEcolC_1368.EcolC_2678,iJO1366.b0918,iJR904.b0918,iPC815.YPO1400,iUMNK88_1353.UMNK88_1071,iY75_1357.Y75_RS04770 Bacteria 1MUUU@1224,1RMAE@1236,3Z15G@583,COG1212@1,COG1212@2 NA|NA|NA F Activates KDO (a required 8-carbon sugar) for incorporation into bacterial lipopolysaccharide in Gram-negative bacteria Z1_03394 529507.PMI0721 1.3e-26 124.8 Proteus ycaR GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.7.1.130 ko:K00912,ko:K09791 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R04657 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 Bacteria 1N6Y2@1224,1SCFF@1236,3Z3I9@583,COG2835@1,COG2835@2 NA|NA|NA S Trm112p-like protein Z1_03395 529507.PMI0720 5.8e-32 142.9 Proteus cspA ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1N931@1224,1SCA8@1236,3Z34Y@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K 'Cold-shock' DNA-binding domain Z1_03396 529507.PMI0719 5.2e-192 676.8 Proteus lpxK GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005975,GO:0005976,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006644,GO:0006664,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0008653,GO:0008654,GO:0009029,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009103,GO:0009244,GO:0009245,GO:0009247,GO:0009311,GO:0009312,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016051,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019637,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044464,GO:0046401,GO:0046467,GO:0046493,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901269,GO:1901271,GO:1901576,GO:1903509 2.7.1.130 ko:K00912 ko00540,ko01100,map00540,map01100 M00060 R04657 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005 iBWG_1329.BWG_0767,iECDH10B_1368.ECDH10B_0985,iPC815.YPO1396 Bacteria 1MU8G@1224,1RMMW@1236,3Z1G2@583,COG1663@1,COG1663@2 NA|NA|NA F Transfers the gamma-phosphate of ATP to the 4'-position of a tetraacyldisaccharide 1-phosphate intermediate (termed DS-1- P) to form tetraacyldisaccharide 1,4'-bis-phosphate (lipid IVA) Z1_03397 529507.PMI0718 0.0 1107.0 Proteus msbA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006855,GO:0006869,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008289,GO:0008559,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015221,GO:0015238,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015437,GO:0015893,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022884,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034040,GO:0034204,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042802,GO:0042908,GO:0042910,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0061024,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071702,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097035,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901264,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901505,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K02021,ko:K06147,ko:K11085 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 3.A.1.106,3.A.1.109,3.A.1.110,3.A.1.112,3.A.1.113,3.A.1.117,3.A.1.21 iJN746.PP_4935,iPC815.YPO1395,iUMN146_1321.UM146_12980 Bacteria 1MUBM@1224,1RMUR@1236,3Z1QI@583,COG1132@1,COG1132@2 NA|NA|NA V Involved in lipid A export and possibly also in glycerophospholipid export and for biogenesis of the outer membrane. Transmembrane domains (TMD) form a pore in the inner membrane and the ATP-binding domain (NBD) is responsible for energy generation Z1_03398 529507.PMI0717 0.0 1555.4 Proteus ycaI GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02238 M00429 ko00000,ko00002,ko02044 3.A.11.1,3.A.11.2 Bacteria 1MUKF@1224,1RMW6@1236,3Z38X@583,COG0658@1,COG0658@2,COG2333@1,COG2333@2 NA|NA|NA S DNA internalization-related competence protein ComEC Rec2 Z1_03399 529507.PMI0716 1e-47 195.7 Proteus himD GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010556,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1903506,GO:2001141 ko:K05788 ko00000,ko03032,ko03036,ko03400 Bacteria 1MZ7M@1224,1S8XZ@1236,3Z2VH@583,COG0776@1,COG0776@2 NA|NA|NA K This protein is one of the two subunits of integration host factor, a specific DNA-binding protein that functions in genetic recombination as well as in transcriptional and translational control Z1_03400 529507.PMI0715 7.9e-310 1068.9 Proteus rpsA GO:0000028,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015935,GO:0016043,GO:0017148,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000765,GO:2000766 1.17.7.4 ko:K02945,ko:K03527 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,ko03010,map00900,map01100,map01110,map01130,map03010 M00096,M00178 R05884,R08210 RC01137,RC01487 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03011 Bacteria 1MVAV@1224,1RMFY@1236,3Z1T3@583,COG0539@1,COG0539@2 NA|NA|NA J thus facilitating recognition of the initiation point. It is needed to translate mRNA with a short Shine-Dalgarno (SD) purine-rich sequence Z1_03401 529507.PMI0714 6.8e-119 433.3 Proteus cmk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004127,GO:0004592,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006573,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009081,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009165,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010165,GO:0010212,GO:0015939,GO:0015940,GO:0015949,GO:0016053,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033317,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042364,GO:0042398,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046939,GO:0046940,GO:0050145,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072330,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 1.17.7.4,2.5.1.19,2.7.1.26,2.7.4.25,2.7.7.2,6.3.2.1 ko:K00800,ko:K00945,ko:K02945,ko:K03527,ko:K03977,ko:K11753,ko:K13799 ko00240,ko00400,ko00410,ko00740,ko00770,ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko03010,map00240,map00400,map00410,map00740,map00770,map00900,map01100,map01110,map01130,map01230,map03010 M00022,M00052,M00096,M00119,M00125,M00178 R00158,R00161,R00512,R00549,R01665,R02473,R03460,R05884,R08210 RC00002,RC00017,RC00096,RC00141,RC00350,RC01137,RC01487 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009,ko03011 iPC815.YPO1391,iSDY_1059.SDY_2348 Bacteria 1MUUD@1224,1RNKT@1236,3Z1Y0@583,COG0283@1,COG0283@2 NA|NA|NA F Belongs to the cytidylate kinase family. Type 1 subfamily Z1_03402 529507.PMI0713 1.4e-242 845.1 Proteus aroA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003866,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009423,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019752,GO:0043436,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0071704,GO:1901576 2.5.1.19 ko:K00800 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022 R03460 RC00350 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC042_1314.EC042_0998,iECNA114_1301.ECNA114_0940,iECSF_1327.ECSF_0829,iPC815.YPO1390 Bacteria 1MWMK@1224,1RQ8U@1236,3Z0YF@583,COG0128@1,COG0128@2 NA|NA|NA E Catalyzes the transfer of the enolpyruvyl moiety of phosphoenolpyruvate (PEP) to the 5-hydroxyl of shikimate-3- phosphate (S3P) to produce enolpyruvyl shikimate-3-phosphate and inorganic phosphate Z1_03403 529507.PMI0711 5.6e-208 729.9 Proteus serC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004648,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006553,GO:0006563,GO:0006564,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009085,GO:0009089,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0033359,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0042816,GO:0042819,GO:0042822,GO:0042823,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046184,GO:0046394,GO:0046451,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0070279,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901615,GO:1901617 2.6.1.52 ko:K00831 ko00260,ko00680,ko00750,ko01100,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00680,map00750,map01100,map01120,map01130,map01200,map01230 M00020,M00124 R04173,R05085 RC00006,RC00036 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iEcE24377_1341.EcE24377A_1004,iPC815.YPO1389,iYL1228.KPN_00935 Bacteria 1MUB5@1224,1RMKU@1236,3Z1YC@583,COG1932@1,COG1932@2 NA|NA|NA H Catalyzes the reversible conversion of 3- phosphohydroxypyruvate to phosphoserine and of 3-hydroxy-2-oxo-4- phosphonooxybutanoate to phosphohydroxythreonine Z1_03404 529507.PMI0710 1.4e-254 885.2 Proteus GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0015562,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042891,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 Bacteria 1MX1Q@1224,1RYQ3@1236,3Z1MY@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Z1_03405 529507.PMI0709 2.2e-187 661.8 Proteus Bacteria 1QCVZ@1224,1T8PM@1236,3Z38Q@583,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U haemagglutination activity domain Z1_03406 529507.PMI0708 5.2e-187 660.2 Proteus ansB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004067,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006528,GO:0006530,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009064,GO:0009065,GO:0009066,GO:0009068,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016054,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0019752,GO:0022607,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042597,GO:0042802,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:0072329,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 3.5.1.1,3.5.1.38 ko:K01424,ko:K05597 ko00220,ko00250,ko00460,ko00471,ko01100,ko01110,ko02020,map00220,map00250,map00460,map00471,map01100,map01110,map02020 R00256,R00485,R01579 RC00010,RC02798 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MWIR@1224,1RNPN@1236,3Z2HS@583,COG0252@1,COG0252@2 NA|NA|NA EJ Asparaginase Z1_03407 529507.PMI0707 0.0 1186.8 Proteus ycaO GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018193,GO:0018197,GO:0018198,GO:0018339,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0047429,GO:0047693,GO:0071704,GO:1901564 ko:K09136 ko00000,ko03009 Bacteria 1MV7K@1224,1RN47@1236,3Z19C@583,COG1944@1,COG1944@2 NA|NA|NA S YcaO cyclodehydratase, ATP-ad Mg2+-binding Z1_03408 529507.PMI0706 2.7e-157 561.2 Proteus focA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006855,GO:0008028,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015499,GO:0015711,GO:0015718,GO:0015724,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042802,GO:0042891,GO:0042895,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03459,ko:K06212,ko:K21993 ko00000,ko02000 1.A.16.1.1,1.A.16.1.2,1.A.16.1.3,1.A.16.2 iB21_1397.B21_02346,iECBD_1354.ECBD_1196,iECB_1328.ECB_02384,iECD_1391.ECD_02384,iECIAI39_1322.ECIAI39_2632,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2639,iSF_1195.SF0899,iS_1188.S0963 Bacteria 1MU0W@1224,1RQ6K@1236,3Z1GW@583,COG2116@1,COG2116@2 NA|NA|NA P Formate/nitrite transporter Z1_03409 529507.PMI0705 0.0 1523.5 Proteus pflB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006566,GO:0006567,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008861,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009066,GO:0009068,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016407,GO:0016408,GO:0016453,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 2.3.1.54 ko:K00656 ko00620,ko00640,ko00650,ko01100,ko01120,map00620,map00640,map00650,map01100,map01120 R00212,R06987 RC00004,RC01181,RC02742,RC02833 ko00000,ko00001,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_1064,iECIAI39_1322.ECIAI39_2245,iECSP_1301.ECSP_1007,iECs_1301.ECs0986,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2218,iG2583_1286.G2583_1138,iSDY_1059.SDY_2358,iZ_1308.Z1248 Bacteria 1MWBF@1224,1RM96@1236,3Z2AP@583,COG1882@1,COG1882@2 NA|NA|NA C formate acetyltransferase Z1_03410 529507.PMI0704 2.1e-145 521.5 Proteus pflA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016491,GO:0018307,GO:0019538,GO:0033554,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043364,GO:0043365,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070283,GO:0071704,GO:1901564 1.97.1.4 ko:K04069 R04710 ko00000,ko01000 iECOK1_1307.ECOK1_0925,iEcE24377_1341.EcE24377A_0980,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2219,iYL1228.KPN_00930 Bacteria 1NQC1@1224,1RNCR@1236,3Z1XU@583,COG1180@1,COG1180@2 NA|NA|NA C Activation of pyruvate formate-lyase under anaerobic conditions by generation of an organic free radical, using S- adenosylmethionine and reduced flavodoxin as cosubstrates to produce 5'-deoxy-adenosine Z1_03411 529507.PMI0703 3.5e-147 527.7 Proteus Bacteria 1R8RR@1224,1S0TC@1236,3Z2KN@583,COG5473@1,COG5473@2 NA|NA|NA Z1_03412 529507.PMI0702 4.6e-199 700.3 Proteus allD GO:0000255,GO:0000256,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009040,GO:0009056,GO:0009442,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0017144,GO:0034641,GO:0042737,GO:0043603,GO:0043605,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044270,GO:0046483,GO:0046700,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 1.1.1.350 ko:K00073 ko00230,ko01120,map00230,map01120 R02935,R02936 RC00169 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_0560 Bacteria 1MWQY@1224,1RSKW@1236,3Z1RT@583,COG2055@1,COG2055@2 NA|NA|NA C Belongs to the LDH2 MDH2 oxidoreductase family Z1_03413 529507.PMI0701 7.7e-60 236.1 Proteus Bacteria 1P17K@1224,1SS84@1236,2C2TB@1,343UI@2,3Z2U0@583 NA|NA|NA Z1_03414 529507.PMI0700 1.7e-243 848.2 Proteus serS GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004828,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006434,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009069,GO:0009070,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016070,GO:0016259,GO:0016260,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042802,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 6.1.1.11 ko:K01875 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03662,R08218 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iAF987.Gmet_3528,iSDY_1059.SDY_2368 Bacteria 1MUJF@1224,1RNAQ@1236,3Z1ET@583,COG0172@1,COG0172@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of serine to tRNA(Ser). Is also able to aminoacylate tRNA(Sec) with serine, to form the misacylated tRNA L-seryl-tRNA(Sec), which will be further converted into selenocysteinyl-tRNA(Sec) Z1_03415 529507.PMI0699 9.5e-253 879.0 Proteus rarA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005657,GO:0005694,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0030894,GO:0032991,GO:0032993,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901576 ko:K07478 ko00000 Bacteria 1MUVS@1224,1RPBY@1236,3Z1P9@583,COG2256@1,COG2256@2 NA|NA|NA L polynucleotide enzyme with nucleotide triphosphate hydrolase domain K07478 Z1_03416 529507.PMI0698 7.9e-111 406.4 Proteus lolA GO:0002790,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008565,GO:0009306,GO:0009987,GO:0015031,GO:0015833,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032940,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042597,GO:0042886,GO:0042953,GO:0042954,GO:0044464,GO:0044872,GO:0044873,GO:0044874,GO:0045184,GO:0046903,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0072321,GO:0072322,GO:0072323,GO:0072657 ko:K03634 ko00000 Bacteria 1PXDV@1224,1S9FW@1236,3Z18P@583,COG2834@1,COG2834@2 NA|NA|NA M Participates in the translocation of lipoproteins from the inner membrane to the outer membrane. Only forms a complex with a lipoprotein if the residue after the N-terminal Cys is not an aspartate (The Asp acts as a targeting signal to indicate that the lipoprotein should stay in the inner membrane) Z1_03417 529507.PMI0697 0.0 2358.2 Proteus ftsK GO:0000920,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006355,GO:0006950,GO:0006970,GO:0007059,GO:0008094,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009651,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0015616,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0033676,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043565,GO:0044093,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045893,GO:0045935,GO:0046677,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051301,GO:0051716,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070887,GO:0071236,GO:0071944,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03466 ko00000,ko03036 3.A.12 Bacteria 1MVPI@1224,1RM9A@1236,3Z15R@583,COG1674@1,COG1674@2 NA|NA|NA D cell division protein Z1_03418 471881.PROPEN_04657 1.2e-85 322.4 Proteus lrp GO:0000976,GO:0001067,GO:0001101,GO:0001130,GO:0001216,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006355,GO:0006520,GO:0006522,GO:0006524,GO:0006551,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009063,GO:0009078,GO:0009080,GO:0009081,GO:0009082,GO:0009098,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016053,GO:0016054,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032991,GO:0032993,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043200,GO:0043201,GO:0043436,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046394,GO:0046395,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901606,GO:1901607,GO:1901698,GO:1901700,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03719 ko00000,ko03000,ko03036 Bacteria 1MX7R@1224,1RPGA@1236,3Z18G@583,COG1522@1,COG1522@2 NA|NA|NA K Lrp/AsnC ligand binding domain Z1_03419 529507.PMI0695 5.7e-180 636.7 Proteus trxB GO:0000166,GO:0001666,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004791,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009628,GO:0009636,GO:0009987,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016209,GO:0016491,GO:0016651,GO:0016667,GO:0016668,GO:0019725,GO:0036094,GO:0036293,GO:0040007,GO:0042221,GO:0042592,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045454,GO:0048037,GO:0050660,GO:0050661,GO:0050662,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070402,GO:0070482,GO:0070887,GO:0097159,GO:0097237,GO:0098754,GO:0098869,GO:1901265,GO:1901363,GO:1990748 1.8.1.9 ko:K00384,ko:K03671 ko00450,ko04621,ko05418,map00450,map04621,map05418 R02016,R03596,R09372 RC00013,RC02518,RC02873 ko00000,ko00001,ko01000,ko03110 iNJ661.Rv3913,iPC815.YPO1374 Bacteria 1MV15@1224,1RMEX@1236,3Z2MP@583,COG0492@1,COG0492@2 NA|NA|NA C Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase Z1_03420 529507.PMI0694 0.0 1124.4 Proteus cydD GO:0000101,GO:0003333,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005319,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006857,GO:0006865,GO:0006869,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015833,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019725,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032973,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033228,GO:0034040,GO:0034220,GO:0034635,GO:0034775,GO:0035443,GO:0035672,GO:0042592,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042883,GO:0042886,GO:0042939,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045454,GO:0046942,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051234,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072348,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098796,GO:0098797,GO:0140115,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903712,GO:1903825,GO:1904949,GO:1905039,GO:1990351 ko:K16013 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.129 iEC042_1314.EC042_0979,iECUMN_1333.ECUMN_1082,iETEC_1333.ETEC_0955 Bacteria 1QU1N@1224,1RNPI@1236,3Z21H@583,COG4988@1,COG4988@2 NA|NA|NA P thiol reductant ABC exporter, CydD subunit Z1_03421 529507.PMI0693 0.0 1112.8 Proteus cydC GO:0000101,GO:0003333,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006857,GO:0006865,GO:0008150,GO:0009889,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015833,GO:0015849,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019222,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032973,GO:0032991,GO:0033228,GO:0034220,GO:0034635,GO:0034775,GO:0035443,GO:0035672,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042883,GO:0042886,GO:0042939,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051179,GO:0051181,GO:0051193,GO:0051234,GO:0055085,GO:0065007,GO:0070453,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0072348,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098796,GO:0098797,GO:0140115,GO:1901401,GO:1901463,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903712,GO:1903825,GO:1904949,GO:1905039,GO:1990351 ko:K16012 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.129 iEC55989_1330.EC55989_0931,iECIAI1_1343.ECIAI1_0926,iECO103_1326.ECO103_0929,iECO111_1330.ECO111_0954,iECSE_1348.ECSE_0944,iECW_1372.ECW_m0996,iEKO11_1354.EKO11_2951,iSDY_1059.SDY_2375,iWFL_1372.ECW_m0996 Bacteria 1QU1P@1224,1RQD7@1236,3Z1AD@583,COG4987@1,COG4987@2 NA|NA|NA P thiol reductant ABC exporter, CydC subunit Z1_03422 529507.PMI0692 1.7e-133 481.9 Proteus aat GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008914,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016755,GO:0016787,GO:0019538,GO:0043170,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044464,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 2.3.2.6 ko:K00684 R03813,R11443,R11444 RC00055,RC00064 ko00000,ko01000 Bacteria 1R9W8@1224,1S1ZB@1236,3Z2B7@583,COG2360@1,COG2360@2 NA|NA|NA O Functions in the N-end rule pathway of protein degradation where it conjugates Leu, Phe and, less efficiently, Met from aminoacyl-tRNAs to the N-termini of proteins containing an N-terminal arginine or lysine Z1_03423 1141662.OOA_09573 4e-33 146.7 Providencia infA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003743,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006412,GO:0006413,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008135,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0019538,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0071704,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K02518 ko00000,ko03012 Bacteria 1MZFU@1224,1S8WZ@1236,3Z9GA@586,COG0361@1,COG0361@2 NA|NA|NA J One of the essential components for the initiation of protein synthesis. Stabilizes the binding of IF-2 and IF-3 on the 30S subunit to which N-formylmethionyl-tRNA(fMet) subsequently binds. Helps modulate mRNA selection, yielding the 30S pre- initiation complex (PIC). Upon addition of the 50S ribosomal subunit IF-1, IF-2 and IF-3 are released leaving the mature 70S translation initation complex Z1_03424 529507.PMI0690 0.0 1465.7 Proteus clpA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004176,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0009987,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019538,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042623,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043335,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0070011,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564 ko:K03694 ko00000,ko03110 Bacteria 1MV8B@1224,1RMH3@1236,3Z20V@583,COG0542@1,COG0542@2 NA|NA|NA O ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA Z1_03425 529507.PMI0689 1.7e-53 214.9 Proteus clpS GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0050896,GO:0051087 ko:K06891 ko00000 Bacteria 1MZU8@1224,1S8Z7@1236,3Z2YM@583,COG2127@1,COG2127@2 NA|NA|NA S Involved in the modulation of the specificity of the ClpAP-mediated ATP-dependent protein degradation Z1_03426 529507.PMI0688 2.3e-33 147.5 Proteus cspD GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003723,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006275,GO:0006355,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008156,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009991,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031667,GO:0042594,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03704 ko00000,ko03000 Bacteria 1N6Q5@1224,1SCA7@1236,3Z2Y8@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K Cold shock protein domain Z1_03427 529507.PMI0687 0.0 1225.3 Proteus macB GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008559,GO:0015238,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017076,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0042802,GO:0042891,GO:0042895,GO:0042908,GO:0042910,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046618,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098796,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902495,GO:1990195,GO:1990196,GO:1990351 ko:K02003,ko:K02004,ko:K05685 ko02010,map02010 M00258,M00709 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1,3.A.1.122.1,3.A.1.122.12 Bacteria 1MU45@1224,1RNUJ@1236,3Z1SJ@583,COG0577@1,COG0577@2,COG1136@1,COG1136@2 NA|NA|NA V Part of the tripartite efflux system MacAB-TolC. MacB is a non-canonical ABC transporter that contains transmembrane domains (TMD), which form a pore in the inner membrane, and an ATP-binding domain (NBD), which is responsible for energy generation. Confers resistance against macrolides Z1_03428 529507.PMI0686 9.5e-195 686.0 Proteus macA GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015238,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019898,GO:0022857,GO:0031224,GO:0032991,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042802,GO:0042891,GO:0042895,GO:0044425,GO:0044464,GO:0046618,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098796,GO:1902495,GO:1990195,GO:1990196,GO:1990351 ko:K02005,ko:K13888 M00709 ko00000,ko00002,ko02000 8.A.1 Bacteria 1MU8D@1224,1RN0E@1236,3Z12R@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Belongs to the membrane fusion protein (MFP) (TC 8.A.1) family Z1_03429 529507.PMI0685 0.0 1112.8 Proteus ybjD GO:0000731,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0018130,GO:0019438,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071704,GO:0071897,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 ko:K07459 ko00000 Bacteria 1N2CB@1224,1RQN2@1236,3Z1QZ@583,COG3593@1,COG3593@2 NA|NA|NA L Protein of unknown function (DUF2813) Z1_03430 529507.PMI0684 2.2e-157 561.6 Proteus ybjE GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015174,GO:0015179,GO:0015189,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015562,GO:0015661,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0034639,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902022,GO:1902475,GO:1903401,GO:1903825,GO:1905039,GO:1990822 Bacteria 1MYMF@1224,1RP7N@1236,3Z0Z4@583,COG2431@1,COG2431@2 NA|NA|NA S membrane Z1_03431 529507.PMI0683 1e-281 975.3 Proteus ybjT GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MW54@1224,1RNS7@1236,3Z2GD@583,COG0702@1,COG0702@2 NA|NA|NA GM Epimerase dehydratase Z1_03432 529507.PMI0682 1e-131 476.1 Proteus artP GO:0003333,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005275,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015424,GO:0015426,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015809,GO:0015837,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031263,GO:0032991,GO:0033283,GO:0033284,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043090,GO:0043190,GO:0043492,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055052,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0089718,GO:0097638,GO:0098533,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098657,GO:0098739,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902023,GO:1902475,GO:1902494,GO:1902495,GO:1903400,GO:1903825,GO:1903826,GO:1904949,GO:1905039,GO:1990351,GO:1990822 ko:K10000 ko02010,map02010 M00229 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.3.3 iAF1260.b0864,iB21_1397.B21_00875,iBWG_1329.BWG_0717,iE2348C_1286.E2348C_0861,iEC042_1314.EC042_0955,iEC55989_1330.EC55989_0909,iECABU_c1320.ECABU_c09050,iECBD_1354.ECBD_2730,iECB_1328.ECB_00869,iECDH10B_1368.ECDH10B_0934,iECD_1391.ECD_00869,iECED1_1282.ECED1_0829,iECH74115_1262.ECH74115_1024,iECIAI1_1343.ECIAI1_0903,iECIAI39_1322.ECIAI39_0844,iECNA114_1301.ECNA114_0806,iECO111_1330.ECO111_0933,iECO26_1355.ECO26_0991,iECOK1_1307.ECOK1_0866,iECP_1309.ECP_0879,iECS88_1305.ECS88_0882,iECSE_1348.ECSE_0922,iECSF_1327.ECSF_0789,iECSP_1301.ECSP_0967,iECUMN_1333.ECUMN_1057,iECs_1301.ECs0947,iETEC_1333.ETEC_0931,iEcDH1_1363.EcDH1_2778,iEcE24377_1341.EcE24377A_0937,iEcHS_1320.EcHS_A0968,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0892,iEcolC_1368.EcolC_2732,iG2583_1286.G2583_1098,iJO1366.b0864,iJR904.b0864,iLF82_1304.LF82_0156,iNRG857_1313.NRG857_03900,iPC815.YPO1352,iSBO_1134.SBO_0798,iSFV_1184.SFV_0849,iSF_1195.SF0818,iSFxv_1172.SFxv_0886,iSSON_1240.SSON_0849,iS_1188.S0860,iSbBS512_1146.SbBS512_E2467,iUMN146_1321.UM146_13330,iY75_1357.Y75_RS04495,iYL1228.KPN_00897,iZ_1308.Z1094,ic_1306.c0997 Bacteria 1MU9Q@1224,1RMB1@1236,3Z1AP@583,COG1126@1,COG1126@2 NA|NA|NA E AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system Z1_03433 529507.PMI0681 1.6e-134 485.3 Proteus artI GO:0005575,GO:0005623,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0044464 ko:K09997 ko02010,map02010 M00229 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3.3 iLF82_1304.LF82_0153,iNRG857_1313.NRG857_03895,iPC815.YPO1351 Bacteria 1MXIA@1224,1RPXK@1236,3Z18W@583,COG0834@1,COG0834@2 NA|NA|NA ET Belongs to the bacterial solute-binding protein 3 family Z1_03434 529507.PMI0680 1.1e-124 452.6 Proteus artQ GO:0003333,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015809,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043090,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0089718,GO:0097638,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098657,GO:0098739,GO:1902023,GO:1902475,GO:1903400,GO:1903825,GO:1903826,GO:1905039,GO:1990822 ko:K02029,ko:K09999 ko02010,map02010 M00229,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.3 iAF1260.b0862,iB21_1397.B21_00873,iBWG_1329.BWG_0715,iE2348C_1286.E2348C_0859,iEC55989_1330.EC55989_0907,iECABU_c1320.ECABU_c09030,iECBD_1354.ECBD_2732,iECB_1328.ECB_00867,iECDH10B_1368.ECDH10B_0932,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0814,iECD_1391.ECD_00867,iECH74115_1262.ECH74115_1022,iECIAI1_1343.ECIAI1_0901,iECIAI39_1322.ECIAI39_0842,iECNA114_1301.ECNA114_0804,iECO103_1326.ECO103_0906,iECO111_1330.ECO111_0931,iECO26_1355.ECO26_0989,iECSE_1348.ECSE_0920,iECSF_1327.ECSF_0787,iECSP_1301.ECSP_0965,iECW_1372.ECW_m0970,iECs_1301.ECs0945,iEKO11_1354.EKO11_2974,iETEC_1333.ETEC_0929,iEcDH1_1363.EcDH1_2780,iEcE24377_1341.EcE24377A_0935,iEcHS_1320.EcHS_A0966,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0890,iEcolC_1368.EcolC_2734,iG2583_1286.G2583_1096,iJO1366.b0862,iJR904.b0862,iLF82_1304.LF82_0157,iNRG857_1313.NRG857_03890,iSBO_1134.SBO_0796,iSFV_1184.SFV_0847,iSF_1195.SF0816,iSFxv_1172.SFxv_0884,iSSON_1240.SSON_0847,iS_1188.S0858,iUMNK88_1353.UMNK88_958,iWFL_1372.ECW_m0970,iY75_1357.Y75_RS04485,iZ_1308.Z1092,ic_1306.c0995 Bacteria 1NH6Q@1224,1RPY2@1236,3Z20K@583,COG4215@1,COG4215@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_03435 529507.PMI0679 4.2e-113 414.1 Proteus artM GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015802,GO:0015807,GO:0015809,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043090,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0089718,GO:0097638,GO:0098655,GO:0098656,GO:0098657,GO:0098739,GO:1902023,GO:1902475,GO:1903400,GO:1903825,GO:1903826,GO:1905039,GO:1990822 ko:K02029,ko:K09998 ko02010,map02010 M00229,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.3 iAF1260.b0861,iAPECO1_1312.APECO1_1232,iB21_1397.B21_00872,iBWG_1329.BWG_0714,iE2348C_1286.E2348C_0858,iEC042_1314.EC042_0952,iEC55989_1330.EC55989_0906,iECABU_c1320.ECABU_c09020,iECBD_1354.ECBD_2733,iECB_1328.ECB_00866,iECDH10B_1368.ECDH10B_0931,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0813,iECD_1391.ECD_00866,iECED1_1282.ECED1_0826,iECH74115_1262.ECH74115_1021,iECIAI1_1343.ECIAI1_0900,iECIAI39_1322.ECIAI39_0841,iECNA114_1301.ECNA114_0803,iECO103_1326.ECO103_0905,iECO111_1330.ECO111_0930,iECO26_1355.ECO26_0988,iECOK1_1307.ECOK1_0863,iECP_1309.ECP_0876,iECS88_1305.ECS88_0879,iECSE_1348.ECSE_0919,iECSF_1327.ECSF_0786,iECSP_1301.ECSP_0964,iECW_1372.ECW_m0969,iECs_1301.ECs0944,iEKO11_1354.EKO11_2975,iETEC_1333.ETEC_0928,iEcDH1_1363.EcDH1_2781,iEcE24377_1341.EcE24377A_0934,iEcHS_1320.EcHS_A0965,iEcolC_1368.EcolC_2735,iG2583_1286.G2583_1095,iJO1366.b0861,iJR904.b0861,iLF82_1304.LF82_0155,iNRG857_1313.NRG857_03885,iPC815.YPO1349,iSBO_1134.SBO_0795,iSFV_1184.SFV_0846,iSF_1195.SF0815,iSFxv_1172.SFxv_0883,iS_1188.S0857,iSbBS512_1146.SbBS512_E2470,iUMN146_1321.UM146_13345,iUMNK88_1353.UMNK88_957,iUTI89_1310.UTI89_C0864,iWFL_1372.ECW_m0969,iY75_1357.Y75_RS04480,iZ_1308.Z1091,ic_1306.c0994 Bacteria 1QV6B@1224,1RNC2@1236,3Z1XM@583,COG4160@1,COG4160@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_03436 529507.PMI0678 1.1e-214 752.3 Proteus rumB GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016436,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0046483,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.189,2.1.1.190 ko:K03212,ko:K03215 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1N8DN@1224,1RMX4@1236,3Z1Z2@583,COG2265@1,COG2265@2 NA|NA|NA J Catalyzes the formation of 5-methyl-uridine at position 747 (m5U747) in 23S rRNA Z1_03437 529507.PMI0677 1.4e-84 318.9 Proteus ybjN GO:0001558,GO:0008150,GO:0009297,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010212,GO:0010639,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030308,GO:0031344,GO:0031345,GO:0032879,GO:0033043,GO:0040008,GO:0040012,GO:0040013,GO:0043711,GO:0043900,GO:0043901,GO:0044085,GO:0044087,GO:0045926,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051270,GO:0051271,GO:0060491,GO:0065007,GO:0071840,GO:1900190,GO:1900191,GO:1900231,GO:1900232,GO:1902021,GO:1902115,GO:1902116,GO:1902201,GO:1902208,GO:1902209,GO:2000145,GO:2000146 Bacteria 1RAPN@1224,1S261@1236,2DC0R@1,2ZC96@2,3Z2WP@583 NA|NA|NA S sensory transduction regulator Z1_03438 529507.PMI0676 7.6e-46 189.5 Proteus ybjC GO:0001101,GO:0005575,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009635,GO:0009636,GO:0010033,GO:0016020,GO:0042221,GO:0050896,GO:0097305,GO:1901422,GO:1901562,GO:1901700 Bacteria 1NB1Y@1224,1SCQF@1236,2E45I@1,32Z1J@2,3Z2VX@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1418) Z1_03439 529507.PMI0675 2.8e-44 184.1 Proteus grxA 1.17.4.1 ko:K00526,ko:K03674,ko:K03676 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00053 R02017,R02018,R02019,R02024 RC00613 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03110,ko03400 iAF1260.b0849,iB21_1397.B21_00860,iBWG_1329.BWG_0702,iEC55989_1330.EC55989_0894,iECBD_1354.ECBD_2745,iECB_1328.ECB_00854,iECDH10B_1368.ECDH10B_0919,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0801,iECD_1391.ECD_00854,iECO111_1330.ECO111_0918,iECO26_1355.ECO26_0976,iECSE_1348.ECSE_0907,iECW_1372.ECW_m0957,iEKO11_1354.EKO11_2987,iETEC_1333.ETEC_0916,iEcDH1_1363.EcDH1_2793,iEcE24377_1341.EcE24377A_0921,iJO1366.b0849,iSBO_1134.SBO_0783,iSFV_1184.SFV_0834,iSF_1195.SF0802,iSFxv_1172.SFxv_0871,iSSON_1240.SSON_0834,iS_1188.S0845,iSbBS512_1146.SbBS512_E2483,iWFL_1372.ECW_m0957,iY75_1357.Y75_RS04415 Bacteria 1RGZ7@1224,1S5ZP@1236,3Z2TJ@583,COG0695@1,COG0695@2 NA|NA|NA O Glutaredoxin-like domain (DUF836) Z1_03440 529507.PMI0674 8.1e-78 296.2 Proteus yjbQ Bacteria 1RH13@1224,1S3VP@1236,3Z2IB@583,COG0432@1,COG0432@2 NA|NA|NA S Uncharacterised protein family UPF0047 Z1_03441 529507.PMI0673 4.2e-112 410.6 Proteus ybjG GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0042221,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050380,GO:0050896,GO:0071944 3.6.1.27 ko:K19302 ko00550,map00550 R05627 RC00002 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iEC042_1314.EC042_0932 Bacteria 1R56P@1224,1RRTS@1236,3Z17X@583,COG0671@1,COG0671@2 NA|NA|NA I Acid phosphatase homologues Z1_03442 529507.PMI0672 1.2e-241 842.0 Proteus sdaC GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03834,ko:K03835,ko:K03837 ko00000,ko02000 2.A.42.1.1,2.A.42.1.2,2.A.42.2.1 iAPECO1_1312.APECO1_3735,iE2348C_1286.E2348C_3063,iECABU_c1320.ECABU_c30650,iECED1_1282.ECED1_3249,iECNA114_1301.ECNA114_2835,iECOK1_1307.ECOK1_3172,iECP_1309.ECP_2778,iECS88_1305.ECS88_3065,iECSF_1327.ECSF_2587,iEcSMS35_1347.EcSMS35_2936,iLF82_1304.LF82_2096,iNRG857_1313.NRG857_13695,iPC815.YPO1321,iSDY_1059.SDY_3013,iUMN146_1321.UM146_02585,iUTI89_1310.UTI89_C3167,iYL1228.KPN_03139,ic_1306.c3364 Bacteria 1NQFA@1224,1RQ8Q@1236,3Z1DW@583,COG0814@1,COG0814@2 NA|NA|NA E Tryptophan/tyrosine permease family Z1_03443 529507.PMI0671 1.1e-258 898.7 Proteus sdaB GO:0003674,GO:0003824,GO:0003941,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006563,GO:0006565,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009063,GO:0009069,GO:0009071,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016829,GO:0016840,GO:0016841,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046395,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901605,GO:1901606 4.3.1.17 ko:K01752 ko00260,ko00270,ko01100,ko01110,ko01130,ko01200,ko01230,map00260,map00270,map01100,map01110,map01130,map01200,map01230 R00220,R00590 RC00331,RC02600 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MUZN@1224,1RMJZ@1236,3Z39M@583,COG1760@1,COG1760@2 NA|NA|NA E Serine dehydratase alpha chain Z1_03444 529507.PMI0670 0.0 1107.4 Proteus fhs GO:0000096,GO:0000097,GO:0000105,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004329,GO:0004477,GO:0004488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006144,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006555,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006730,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009086,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009112,GO:0009113,GO:0009256,GO:0009257,GO:0009396,GO:0009987,GO:0015939,GO:0015940,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016645,GO:0016646,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0016874,GO:0016879,GO:0018130,GO:0019238,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0042398,GO:0042440,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043648,GO:0043650,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046112,GO:0046148,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046653,GO:0046654,GO:0051186,GO:0051188,GO:0052803,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.5.1.5,3.5.4.9,6.3.4.3 ko:K00288,ko:K01938 ko00670,ko00720,ko01100,ko01120,ko01200,map00670,map00720,map01100,map01120,map01200 M00140,M00141,M00377 R00943,R01220,R01655 RC00026,RC00111,RC00202,RC00578 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 Bacteria 1MUR8@1224,1RME6@1236,3Z215@583,COG2759@1,COG2759@2 NA|NA|NA F Belongs to the formate--tetrahydrofolate ligase family Z1_03445 529507.PMI0669 1.7e-226 791.6 Proteus dacC 3.4.16.4 ko:K07258 ko00550,ko01100,map00550,map01100 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1MUU7@1224,1RMJA@1236,3Z35B@583,COG1686@1,COG1686@2 NA|NA|NA M penicillin-binding protein 6 precursor (D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction C) (DD-pept (DD-carboxypeptidase) (PBP-6)idase) K07258 Z1_03446 529507.PMI0668 6.8e-118 429.9 Proteus yliJ GO:0003674,GO:0003824,GO:0004364,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016740,GO:0016765,GO:0030611,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0055114 2.5.1.18 ko:K00799 ko00480,ko00980,ko00982,ko00983,ko01524,ko05200,ko05204,ko05225,ko05418,map00480,map00980,map00982,map00983,map01524,map05200,map05204,map05225,map05418 R03522,R07002,R07003,R07004,R07023,R07024,R07025,R07026,R07069,R07070,R07083,R07084,R07091,R07092,R07093,R07094,R07100,R07113,R07116,R08280,R09409,R11905 RC00004,RC00069,RC00840,RC00948,RC01704,RC01705,RC01706,RC01758,RC01759,RC01765,RC01767,RC01769,RC02243,RC02527,RC02939,RC02940,RC02942,RC02943,RC02944 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 1.A.12.2.2,1.A.12.3.2 Bacteria 1RA4M@1224,1S2K3@1236,3Z2P3@583,COG0625@1,COG0625@2 NA|NA|NA O Glutathione S-transferase, N-terminal domain protein Z1_03447 529507.PMI0667 6.4e-156 556.6 Proteus yeeZ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1MWVJ@1224,1RNDT@1236,3Z1G4@583,COG0451@1,COG0451@2 NA|NA|NA GM COG0451 Nucleoside-diphosphate-sugar epimerases Z1_03448 529507.PMI0665 4.6e-163 580.5 Proteus hisG GO:0000105,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003879,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 2.4.2.17 ko:K00765 ko00340,ko01100,ko01110,ko01230,map00340,map01100,map01110,map01230 M00026 R01071 RC02819,RC03200 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECSF_1327.ECSF_1909 Bacteria 1MUCY@1224,1RNAX@1236,3Z1DD@583,COG0040@1,COG0040@2 NA|NA|NA F ATP phosphoribosyltransferase Z1_03449 529507.PMI0664 1.3e-238 832.0 Proteus hisD GO:0000105,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004399,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0030145,GO:0034641,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0052803,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.23,1.1.1.308 ko:K00013,ko:K15509 ko00340,ko01100,ko01110,ko01230,map00340,map01100,map01110,map01230 M00026 R01158,R01163,R03012 RC00099,RC00242,RC00463 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_2362,iG2583_1286.G2583_2541,iUTI89_1310.UTI89_C2293,ic_1306.c2547 Bacteria 1MUUF@1224,1RMZD@1236,3Z0WJ@583,COG0141@1,COG0141@2 NA|NA|NA E Catalyzes the sequential NAD-dependent oxidations of L- histidinol to L-histidinaldehyde and then to L-histidine Z1_03450 529507.PMI0663 8.7e-201 706.1 Proteus hisC GO:0000105,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004400,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.23,2.6.1.9 ko:K00013,ko:K00817 ko00340,ko00350,ko00360,ko00400,ko00401,ko00960,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00340,map00350,map00360,map00400,map00401,map00960,map01100,map01110,map01130,map01230 M00026 R00694,R00734,R01158,R01163,R03012,R03243 RC00006,RC00099,RC00242,RC00463,RC00888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iECO111_1330.ECO111_2745,iSDY_1059.SDY_2220,iSSON_1240.SSON_2092 Bacteria 1MW7I@1224,1RP4T@1236,3Z2BR@583,COG0079@1,COG0079@2 NA|NA|NA E Belongs to the class-II pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase family. Histidinol-phosphate aminotransferase subfamily Z1_03451 529507.PMI0662 4.4e-205 720.3 Proteus hisB GO:0000105,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004401,GO:0004424,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034200,GO:0034641,GO:0040007,GO:0042578,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 1.1.1.23,2.6.1.9,3.1.3.15,3.1.3.82,3.1.3.83,4.2.1.19 ko:K00013,ko:K00817,ko:K01089,ko:K01693,ko:K03273 ko00340,ko00350,ko00360,ko00400,ko00401,ko00540,ko00960,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00340,map00350,map00360,map00400,map00401,map00540,map00960,map01100,map01110,map01130,map01230 M00026,M00064 R00694,R00734,R01158,R01163,R03012,R03013,R03243,R03457,R05647,R09771 RC00006,RC00017,RC00099,RC00242,RC00463,RC00888,RC00932 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01005,ko01007 iECO111_1330.ECO111_2746,iECS88_1305.ECS88_2121,iJN746.PP_0289,iLJ478.TM1039,iSB619.SA_RS14130,iUMNK88_1353.UMNK88_2570 Bacteria 1MWBS@1224,1RPA9@1236,3Z0X3@583,COG0131@1,COG0131@2,COG0241@1,COG0241@2 NA|NA|NA E Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase Z1_03452 529507.PMI0661 1.8e-107 395.2 Proteus hisH GO:0000105,GO:0000107,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009382,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494,GO:1990234 ko:K02501 ko00340,ko01100,ko01110,ko01230,map00340,map01100,map01110,map01230 M00026 R04558 RC00010,RC01190,RC01943 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECED1_1282.ECED1_2372,iPC815.YPO1545,iYL1228.KPN_02479 Bacteria 1MU4X@1224,1RRP3@1236,3Z258@583,COG0118@1,COG0118@2 NA|NA|NA E IGPS catalyzes the conversion of PRFAR and glutamine to IGP, AICAR and glutamate. The HisH subunit provides the glutamine amidotransferase activity that produces the ammonia necessary to HisF for the synthesis of IGP and AICAR Z1_03453 529507.PMI0660 4.8e-134 483.8 Proteus hisA GO:0000105,GO:0000162,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003949,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006568,GO:0006576,GO:0006586,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009308,GO:0009309,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042401,GO:0042430,GO:0042435,GO:0043436,GO:0044106,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046219,GO:0046394,GO:0046483,GO:0050896,GO:0051716,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 5.3.1.16 ko:K01814 ko00340,ko01100,ko01110,ko01230,map00340,map01100,map01110,map01230 M00026 R04640 RC00945 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSBO_1134.SBO_0850,iSDY_1059.SDY_2217 Bacteria 1MW6S@1224,1RN3M@1236,3Z1E0@583,COG0106@1,COG0106@2 NA|NA|NA E Tryptophan synthase alpha chain Z1_03454 529507.PMI0659 3.8e-142 510.8 Proteus hisF GO:0000105,GO:0000107,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009382,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016763,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019752,GO:0032991,GO:0034641,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0052803,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902494,GO:1990234 3.5.4.19,3.6.1.31 ko:K01663,ko:K02500,ko:K11755 ko00340,ko01100,ko01110,ko01230,map00340,map01100,map01110,map01230 M00026 R04035,R04037,R04558 RC00002,RC00010,RC01055,RC01190,RC01943 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECO111_1330.ECO111_2749,iEcolC_1368.EcolC_1617,iHN637.CLJU_RS05755,iLJ478.TM1036,iSB619.SA_RS14115,iYL1228.KPN_02481 Bacteria 1MUS0@1224,1RPJQ@1236,3Z2EF@583,COG0107@1,COG0107@2 NA|NA|NA E IGPS catalyzes the conversion of PRFAR and glutamine to IGP, AICAR and glutamate. The HisF subunit catalyzes the cyclization activity that produces IGP and AICAR from PRFAR using the ammonia provided by the HisH subunit Z1_03455 529507.PMI0658 2.8e-111 407.9 Proteus hisI GO:0000105,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004635,GO:0004636,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006547,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019238,GO:0019438,GO:0019752,GO:0030312,GO:0034641,GO:0040007,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043207,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0052803,GO:0071704,GO:0071944,GO:0075136,GO:0075139,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607 3.5.4.19,3.5.4.25,3.6.1.31,5.3.1.16 ko:K01496,ko:K01497,ko:K01523,ko:K01814,ko:K11755 ko00340,ko00740,ko00790,ko01100,ko01110,ko01230,ko02024,map00340,map00740,map00790,map01100,map01110,map01230,map02024 M00026,M00125 R00425,R04035,R04037,R04640 RC00002,RC00293,RC00945,RC01055,RC02504 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_0880,iECW_1372.ECW_m2186,iEKO11_1354.EKO11_1768,iHN637.CLJU_RS05760,iSB619.SA_RS14110,iUMN146_1321.UM146_06665,iWFL_1372.ECW_m2186 Bacteria 1MW67@1224,1RMV4@1236,3Z24F@583,COG0139@1,COG0139@2,COG0140@1,COG0140@2 NA|NA|NA E Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase Z1_03456 529507.PMI0657 8e-213 746.1 Proteus yiaY GO:0003674,GO:0003824,GO:0004022,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008743,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0055114 1.1.1.1 ko:K13954 ko00010,ko00071,ko00350,ko00625,ko00626,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01220,map00010,map00071,map00350,map00625,map00626,map01100,map01110,map01120,map01130,map01220 R00623,R00754,R04880,R05233,R05234,R06917,R06927 RC00050,RC00088,RC00099,RC00116,RC00649 ko00000,ko00001,ko01000 iSF_1195.SF3627,iS_1188.S4141 Bacteria 1MVPH@1224,1RMVU@1236,3Z13A@583,COG1454@1,COG1454@2 NA|NA|NA C Iron-containing alcohol dehydrogenase Z1_03457 529507.PMI0656 7.7e-88 329.7 Proteus yeaK GO:0002161,GO:0002196,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006417,GO:0006450,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0016070,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032268,GO:0032270,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0045727,GO:0045903,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0052689,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:2000112 ko:K03976,ko:K19055 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1R9YR@1224,1S27F@1236,3Z2K3@583,COG2606@1,COG2606@2 NA|NA|NA S Aminoacyl-tRNA editing domain Z1_03458 529507.PMI0655 8.2e-268 929.1 Proteus gnd GO:0003674,GO:0003824,GO:0004616,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006081,GO:0006082,GO:0006098,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006739,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016052,GO:0016054,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0019362,GO:0019520,GO:0019521,GO:0019637,GO:0019682,GO:0019693,GO:0019752,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044262,GO:0044275,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046176,GO:0046177,GO:0046395,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046983,GO:0051156,GO:0051186,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072329,GO:0072524,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901575 1.1.1.343,1.1.1.44 ko:K00033 ko00030,ko00480,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00030,map00480,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00004,M00006 R01528,R10221 RC00001,RC00539 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECS88_1305.ECS88_2128,iECW_1372.ECW_m2189,iEKO11_1354.EKO11_1765,iPC815.YPO1541,iWFL_1372.ECW_m2189 Bacteria 1MVV8@1224,1RM7P@1236,3Z2AF@583,COG0362@1,COG0362@2 NA|NA|NA H Catalyzes the oxidative decarboxylation of 6- phosphogluconate to ribulose 5-phosphate and CO(2), with concomitant reduction of NADP to NADPH Z1_03459 529507.PMI0653 3.6e-288 996.9 Proteus yoaE_1 ko:K03699 ko00000,ko02042 Bacteria 1QTUN@1224,1RMTY@1236,3Z14G@583,COG1253@1,COG1253@2 NA|NA|NA P Integral membrane protein TerC family Z1_03460 529507.PMI0652 9.8e-234 815.8 Proteus dcuC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005310,GO:0005342,GO:0005469,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006066,GO:0006067,GO:0006082,GO:0006083,GO:0006089,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006103,GO:0006105,GO:0006113,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006855,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008509,GO:0008514,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009126,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015138,GO:0015141,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015318,GO:0015556,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015741,GO:0015744,GO:0015849,GO:0015893,GO:0015942,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019318,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019660,GO:0019664,GO:0019666,GO:0019693,GO:0019752,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032787,GO:0034220,GO:0034308,GO:0034641,GO:0042221,GO:0042493,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051186,GO:0051234,GO:0055085,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071422,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072521,GO:0072524,GO:0098656,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901615,GO:1903825,GO:1905039 ko:K03326 ko00000,ko02000 2.A.61.1 Bacteria 1MWBG@1224,1RQB2@1236,3Z1NX@583,COG3069@1,COG3069@2 NA|NA|NA C Tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctM component Z1_03461 529507.PMI0651 0.0 1232.6 Proteus asmA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0016020,GO:0032386,GO:0032879,GO:0032880,GO:0033157,GO:0044464,GO:0050789,GO:0051049,GO:0051223,GO:0060341,GO:0065007,GO:0070201,GO:0071944,GO:0090087,GO:0090313,GO:1903533,GO:1903827,GO:1905475 ko:K07289,ko:K07290 ko00000 9.B.121 Bacteria 1NVUY@1224,1RPFM@1236,3Z1DH@583,COG2982@1,COG2982@2 NA|NA|NA M AsmA family Z1_03462 529507.PMI0650 1.3e-107 395.6 Proteus dcd GO:0003674,GO:0003824,GO:0004170,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006220,GO:0006244,GO:0006253,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008829,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009117,GO:0009141,GO:0009143,GO:0009147,GO:0009149,GO:0009166,GO:0009200,GO:0009204,GO:0009211,GO:0009213,GO:0009219,GO:0009223,GO:0009262,GO:0009264,GO:0009314,GO:0009394,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0016817,GO:0016818,GO:0018130,GO:0019239,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019692,GO:0033973,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046065,GO:0046386,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046700,GO:0047429,GO:0050896,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072529,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901292,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575,GO:1901576 3.5.4.13 ko:K01494 ko00240,ko01100,map00240,map01100 M00053 R00568,R02325 RC00074 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO1525 Bacteria 1MV2J@1224,1RMCD@1236,3Z14K@583,COG0717@1,COG0717@2 NA|NA|NA F Belongs to the dCTP deaminase family Z1_03463 529507.PMI0649 4.2e-118 430.6 Proteus udk GO:0003674,GO:0003824,GO:0004849,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006206,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006222,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008655,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009173,GO:0009174,GO:0009218,GO:0009220,GO:0009224,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0018130,GO:0019205,GO:0019206,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019693,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042455,GO:0043094,GO:0043097,GO:0043174,GO:0043771,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046035,GO:0046049,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046390,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.7.1.48 ko:K00876 ko00240,ko00983,ko01100,map00240,map00983,map01100 R00513,R00516,R00517,R00962,R00964,R00967,R00968,R00970,R01548,R01549,R01880,R02091,R02096,R02097,R02327,R02332,R02371,R02372,R08232 RC00002,RC00017 ko00000,ko00001,ko01000 iSBO_1134.SBO_0893 Bacteria 1MWCH@1224,1RNZG@1236,3Z1ZB@583,COG0572@1,COG0572@2 NA|NA|NA F Phosphoribulokinase / Uridine kinase family Z1_03464 529507.PMI0648 3e-209 734.2 Proteus mrp GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K03593 ko00000,ko03029,ko03036 Bacteria 1MU7R@1224,1RMJF@1236,3Z1JQ@583,COG0489@1,COG0489@2 NA|NA|NA D Binds and transfers iron-sulfur (Fe-S) clusters to target apoproteins. Can hydrolyze ATP Z1_03465 529507.PMI0646 0.0 1341.3 Proteus metG GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004825,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006431,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.10,6.1.1.20 ko:K01874,ko:K01890,ko:K06878 ko00450,ko00970,map00450,map00970 M00359,M00360 R03659,R03660,R04773 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iEC042_1314.EC042_2346,iECUMN_1333.ECUMN_2446 Bacteria 1MUBY@1224,1RMYM@1236,3Z139@583,COG0073@1,COG0073@2,COG0143@1,COG0143@2 NA|NA|NA J Is required not only for elongation of protein synthesis but also for the initiation of all mRNA translation through initiator tRNA(fMet) aminoacylation Z1_03466 529507.PMI0645 1.8e-78 298.5 Proteus lrgA GO:0000270,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006022,GO:0006026,GO:0006027,GO:0006807,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008565,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009253,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0030203,GO:0033036,GO:0042886,GO:0043170,GO:0044464,GO:0045184,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0071944,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K05338,ko:K06518 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 1.E.14.1,1.E.14.2 Bacteria 1NAY3@1224,1SD5V@1236,3Z2NC@583,COG1380@1,COG1380@2 NA|NA|NA S LrgA family Z1_03467 529507.PMI0644 4.5e-118 430.6 Proteus yohK GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1MV81@1224,1RS5C@1236,3Z2CV@583,COG1346@1,COG1346@2 NA|NA|NA M LrgB-like family Z1_03468 529507.PMI0643 1.3e-165 589.0 Proteus cdd GO:0001882,GO:0001884,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004126,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006213,GO:0006216,GO:0006217,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008655,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009120,GO:0009164,GO:0009972,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0018130,GO:0019239,GO:0019438,GO:0019439,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0034656,GO:0036094,GO:0042454,GO:0042802,GO:0043094,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046087,GO:0046092,GO:0046121,GO:0046125,GO:0046127,GO:0046131,GO:0046133,GO:0046135,GO:0046483,GO:0046700,GO:0046872,GO:0046914,GO:0047844,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0072529,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901658 3.5.4.5 ko:K01489 ko00240,ko00983,ko01100,map00240,map00983,map01100 R01878,R02485,R08221 RC00074,RC00514 ko00000,ko00001,ko01000 iECO103_1326.ECO103_2618 Bacteria 1MY2R@1224,1RMRX@1236,3Z1MF@583,COG0295@1,COG0295@2 NA|NA|NA F This enzyme scavenges exogenous and endogenous cytidine and 2'-deoxycytidine for UMP synthesis Z1_03469 529507.PMI0642 0.0 1127.5 Proteus maeA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004470,GO:0004471,GO:0004473,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006094,GO:0006108,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009987,GO:0016051,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016615,GO:0016616,GO:0019318,GO:0019319,GO:0019752,GO:0032787,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046364,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576 1.1.1.38 ko:K00027 ko00620,ko01200,ko02020,map00620,map01200,map02020 R00214 RC00105 ko00000,ko00001,ko01000 iSbBS512_1146.SbBS512_E1742 Bacteria 1MU0A@1224,1RQ11@1236,3Z12J@583,COG0281@1,COG0281@2 NA|NA|NA C malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) K00027 Z1_03470 529507.PMI0641 2.4e-130 471.5 Proteus sanA GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044464,GO:0050896,GO:0071944 ko:K03748 ko00000 Bacteria 1MURW@1224,1RMG7@1236,3Z1QG@583,COG2949@1,COG2949@2 NA|NA|NA S DUF218 domain Z1_03471 529507.PMI0640 1.7e-210 738.4 Proteus yeiB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K07148 ko00000 Bacteria 1MWHW@1224,1RQ08@1236,3Z0WB@583,COG2311@1,COG2311@2 NA|NA|NA S Membrane Z1_03472 529507.PMI0639 7.3e-118 429.9 Proteus folE GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003933,GO:0003934,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006066,GO:0006082,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006729,GO:0006732,GO:0006760,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016814,GO:0017076,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019001,GO:0019238,GO:0019438,GO:0019751,GO:0019752,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0034311,GO:0034312,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042558,GO:0042559,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046146,GO:0046165,GO:0046173,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901615,GO:1901617 2.7.6.3,3.5.4.16 ko:K00950,ko:K01495 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126,M00841,M00842,M00843 R00428,R03503,R04639,R05046,R05048 RC00002,RC00017,RC00263,RC00294,RC00323,RC00945,RC01188 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iNJ661.Rv3609c Bacteria 1MY3N@1224,1RMQM@1236,3Z2IC@583,COG0302@1,COG0302@2 NA|NA|NA H GTP cyclohydrolase I Z1_03473 529507.PMI0638 8.4e-218 762.7 Proteus yjiJ Bacteria 1MW6T@1224,1RMHC@1236,3Z2AS@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Uncharacterised MFS-type transporter YbfB Z1_03474 529507.PMI0637 7.3e-236 822.8 Proteus moeA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006464,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0018315,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019720,GO:0032324,GO:0034641,GO:0036211,GO:0042040,GO:0042278,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046039,GO:0046128,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0055086,GO:0061598,GO:0061599,GO:0070566,GO:0071704,GO:0072521,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657 2.10.1.1 ko:K03750 ko00790,ko01100,map00790,map01100 R09735 RC03462 ko00000,ko00001,ko01000 iEcHS_1320.EcHS_A0885 Bacteria 1MVD5@1224,1RMQU@1236,3Z2CE@583,COG0303@1,COG0303@2 NA|NA|NA H Probable molybdopterin binding domain Z1_03475 529507.PMI0636 3.8e-142 510.8 Proteus moeB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0043170,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0061605,GO:0070566,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.7.73,2.7.7.80 ko:K03148,ko:K21029 ko00730,ko01100,ko04122,map00730,map01100,map04122 R07459 RC00043 ko00000,ko00001,ko01000 iECIAI1_1343.ECIAI1_0865,iECW_1372.ECW_m0884,iEKO11_1354.EKO11_3059,iETEC_1333.ETEC_0893,iEcE24377_1341.EcE24377A_0897,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0851,iWFL_1372.ECW_m0884 Bacteria 1MW7H@1224,1RPJ3@1236,3Z1P8@583,COG0476@1,COG0476@2 NA|NA|NA H ThiF family Z1_03476 529507.PMI0635 0.0 1142.1 Proteus nfdA Bacteria 1MWP2@1224,1RNB7@1236,3Z16D@583,COG1574@1,COG1574@2 NA|NA|NA S Amidohydrolase family Z1_03477 529507.PMI0634 4.2e-80 303.9 Proteus Bacteria 1RI1R@1224,1S8CT@1236,3Z2PE@583,COG0454@1,COG0456@2 NA|NA|NA K Acetyltransferase (GNAT) domain Z1_03478 529507.PMI0633 6.8e-104 383.3 Proteus yvdD 3.2.2.10 ko:K06966 ko00230,ko00240,map00230,map00240 R00182,R00510 RC00063,RC00318 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RD59@1224,1S4C3@1236,3Z23E@583,COG1611@1,COG1611@2 NA|NA|NA S Possible lysine decarboxylase Z1_03479 529507.PMI0632 1.1e-153 549.3 Proteus rhtA GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006820,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015195,GO:0015238,GO:0015318,GO:0015562,GO:0015565,GO:0015711,GO:0015804,GO:0015807,GO:0015826,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0034639,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K11939 ko00000,ko02000 2.A.7.3.6 iNRG857_1313.NRG857_03645 Bacteria 1MXR7@1224,1RPFH@1236,3Z1BC@583,COG5006@1,COG5006@2 NA|NA|NA S EamA-like transporter family Z1_03480 529507.PMI0631 6e-88 330.1 Proteus dps GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005575,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008199,GO:0009295,GO:0009605,GO:0009991,GO:0031667,GO:0042594,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0097159,GO:1901363 ko:K04047 ko00000,ko03036 Bacteria 1RAC5@1224,1RR4N@1236,3Z1FV@583,COG0783@1,COG0783@2 NA|NA|NA P Ferritin-like domain Z1_03481 529507.PMI0630 0.0 1407.9 Proteus dinG GO:0003674,GO:0003678,GO:0003824,GO:0004003,GO:0004386,GO:0005488,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007154,GO:0008026,GO:0008094,GO:0008150,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016043,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0031668,GO:0032392,GO:0032508,GO:0033554,GO:0033677,GO:0033680,GO:0042623,GO:0048037,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051716,GO:0070035,GO:0071103,GO:0071496,GO:0071840,GO:0140097,GO:0140098 3.6.4.12 ko:K03722 ko00000,ko01000,ko03400 Bacteria 1MVCU@1224,1RMNX@1236,3Z160@583,COG1199@1,COG1199@2 NA|NA|NA L helicase Z1_03482 529507.PMI0629 3.8e-165 587.4 Proteus Bacteria 1PR6U@1224,1RQ7J@1236,3Z1UW@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_03483 529507.PMI0628 1.3e-257 895.2 Proteus Bacteria 1R5UM@1224,1RS1P@1236,3Z2C0@583,COG2079@1,COG2079@2 NA|NA|NA S MmgE/PrpD family Z1_03484 529507.PMI0627 1.3e-257 895.2 Proteus purB2 4.3.2.2 ko:K01756 ko00230,ko00250,ko01100,ko01110,ko01130,map00230,map00250,map01100,map01110,map01130 M00048,M00049 R01083,R04559 RC00379,RC00444,RC00445 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MXNN@1224,1RS00@1236,3Z1B8@583,COG0015@1,COG0015@2 NA|NA|NA F Adenylosuccinate lyase C-terminus Z1_03485 529507.PMI0626 5.8e-227 793.1 Proteus metC 2.5.1.48,4.4.1.11,4.4.1.8 ko:K01739,ko:K01760,ko:K01761 ko00270,ko00450,ko00920,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00270,map00450,map00920,map01100,map01110,map01130,map01230 M00017 R00654,R00782,R00999,R01286,R01288,R02408,R02508,R03217,R03260,R04770,R04941,R04944,R04945,R04946 RC00020,RC00056,RC00069,RC00196,RC00348,RC00382,RC00420,RC00488,RC00710,RC01209,RC01210,RC01245,RC02303,RC02848,RC02866 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MU9E@1224,1RQI0@1236,3Z1NP@583,COG0626@1,COG0626@2 NA|NA|NA E Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme Z1_03486 529507.PMI0625 2.5e-237 827.8 Proteus dcuD ko:K03326 ko00000,ko02000 2.A.61.1 Bacteria 1MWBG@1224,1RQB2@1236,3Z1D5@583,COG3069@1,COG3069@2 NA|NA|NA C C4-dicarboxylate anaerobic carrier Z1_03487 529507.PMI0623 2.5e-163 581.3 Proteus sseA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004792,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0007154,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0016784,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0042221,GO:0042262,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046677,GO:0050896,GO:0051716,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 2.8.1.1,2.8.1.2 ko:K01011 ko00270,ko00920,ko01100,ko01120,ko04122,map00270,map00920,map01100,map01120,map04122 R01931,R03105,R03106 RC00214 ko00000,ko00001,ko01000 iECs_1301.ECs3387,iZ_1308.Z3788 Bacteria 1MW4B@1224,1RSQ3@1236,3Z17S@583,COG2897@1,COG2897@2 NA|NA|NA P Rhodanese Homology Domain Z1_03488 529507.PMI0622 3.9e-16 90.5 Proteus yeaQ Bacteria 1N72W@1224,1S8YP@1236,3Z34H@583,COG2261@1,COG2261@2 NA|NA|NA S transglycosylase associated protein Z1_03489 529507.PMI0621 2.6e-177 627.9 Proteus dusC GO:0000049,GO:0000166,GO:0002943,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010181,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016491,GO:0016627,GO:0017150,GO:0032553,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901363 ko:K05541 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUSM@1224,1RMMM@1236,3Z1TK@583,COG0042@1,COG0042@2 NA|NA|NA H Catalyzes the synthesis of 5,6-dihydrouridine (D), a modified base found in the D-loop of most tRNAs, via the reduction of the C5-C6 double bond in target uridines. Specifically modifies U16 in tRNAs Z1_03490 529507.PMI0620 4.5e-258 896.7 Proteus rhlE GO:0003674,GO:0003724,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010501,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0034622,GO:0034641,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050896,GO:0065003,GO:0070035,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:1901360 3.6.4.13 ko:K11927 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03019 Bacteria 1MU49@1224,1RMWA@1236,3Z2G9@583,COG0513@1,COG0513@2 NA|NA|NA F DEAD-box RNA helicase involved in ribosome assembly. Has RNA-dependent ATPase activity and unwinds double-stranded RNA Z1_03491 529507.PMI0619 6.5e-125 453.4 Proteus ybiH GO:0003674,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0031333,GO:0031334,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043254,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000142,GO:2000143,GO:2000144,GO:2001141 Bacteria 1NDME@1224,1RQQB@1236,3Z14U@583,COG1309@1,COG1309@2 NA|NA|NA K Domain of unknown function (DUF1956) Z1_03492 529507.PMI0618 1.4e-178 632.1 Proteus ybhG GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0016020,GO:0042221,GO:0044464,GO:0046677,GO:0050896,GO:0071944 ko:K01993 ko00000 Bacteria 1MUG6@1224,1RP16@1236,3Z1AZ@583,COG0845@1,COG0845@2 NA|NA|NA M Secretion protein Z1_03493 529507.PMI0617 0.0 1167.9 Proteus ybhF GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015562,GO:0015893,GO:0016020,GO:0022857,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K01990,ko:K13926 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MUX3@1224,1RMM4@1236,3Z14X@583,COG1131@1,COG1131@2 NA|NA|NA V ABC transporter Z1_03494 529507.PMI0616 2.6e-203 714.5 Proteus ybhS GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006855,GO:0008150,GO:0015562,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MW5R@1224,1RPB4@1236,3Z1YN@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 family transporter protein Z1_03495 529507.PMI0615 4.3e-195 687.2 Proteus ybhR GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006855,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015562,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0033554,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0071944 ko:K01992 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1MW5R@1224,1SYDD@1236,3Z1WH@583,COG0842@1,COG0842@2 NA|NA|NA V ABC-2 family transporter protein Z1_03496 529507.PMI0614 9.6e-116 422.9 Proteus ybhL GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K06890 ko00000 Bacteria 1MU69@1224,1RN8Q@1236,3Z1S6@583,COG0670@1,COG0670@2 NA|NA|NA S Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 Z1_03498 529507.PMI0613 3.7e-84 317.4 Proteus moaE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006163,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006753,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009141,GO:0009144,GO:0009150,GO:0009199,GO:0009205,GO:0009259,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019720,GO:0030366,GO:0032324,GO:0034641,GO:0042278,GO:0043170,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046039,GO:0046128,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0055086,GO:0071704,GO:0072521,GO:0090407,GO:1901068,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657 2.8.1.12 ko:K03635 ko00790,ko01100,ko04122,map00790,map01100,map04122 R09395 RC02507 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1305,iEC042_1314.EC042_0869,iEC55989_1330.EC55989_0828,iECABU_c1320.ECABU_c08270,iECED1_1282.ECED1_0750,iECIAI1_1343.ECIAI1_0820,iECIAI39_1322.ECIAI39_0761,iECNA114_1301.ECNA114_0717,iECO103_1326.ECO103_0820,iECO111_1330.ECO111_0846,iECO26_1355.ECO26_0911,iECOK1_1307.ECOK1_0787,iECP_1309.ECP_0799,iECS88_1305.ECS88_0802,iECSE_1348.ECSE_0839,iECSF_1327.ECSF_0711,iECW_1372.ECW_m0841,iEKO11_1354.EKO11_3101,iEcE24377_1341.EcE24377A_0848,iG2583_1286.G2583_1013,iLF82_1304.LF82_1369,iNRG857_1313.NRG857_03500,iSSON_1240.SSON_0764,iUMN146_1321.UM146_13720,iUTI89_1310.UTI89_C0785,iWFL_1372.ECW_m0841,ic_1306.c0867 Bacteria 1RGUX@1224,1S5YH@1236,3Z1F4@583,COG0314@1,COG0314@2 NA|NA|NA H MoaE protein Z1_03499 529507.PMI0612 1.8e-37 161.4 Proteus moaD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006732,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0043170,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.7.7.77,2.8.1.12 ko:K03636,ko:K03752,ko:K21142 ko00790,ko01100,ko04122,map00790,map01100,map04122 R09395,R11581 RC02507 ko00000,ko00001,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_0736,iEC55989_1330.EC55989_0827,iG2583_1286.G2583_1012,iLF82_1304.LF82_1368,iNRG857_1313.NRG857_03495,iSFV_1184.SFV_0767,iSF_1195.SF0734,iSFxv_1172.SFxv_0800,iSSON_1240.SSON_0763,iS_1188.S0775 Bacteria 1N0IE@1224,1S8S1@1236,3Z346@583,COG1977@1,COG1977@2 NA|NA|NA H Involved in sulfur transfer in the conversion of molybdopterin precursor Z to molybdopterin Z1_03500 529507.PMI0611 2e-80 305.1 Proteus moaC GO:0002682,GO:0002683,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0006732,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016829,GO:0016849,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0022607,GO:0031347,GO:0031348,GO:0034214,GO:0035821,GO:0040007,GO:0042802,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043545,GO:0043933,GO:0044003,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044403,GO:0044413,GO:0044414,GO:0044419,GO:0045088,GO:0045824,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048583,GO:0048585,GO:0050776,GO:0050777,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0051259,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051707,GO:0051817,GO:0051832,GO:0051833,GO:0052031,GO:0052037,GO:0052167,GO:0052170,GO:0052173,GO:0052200,GO:0052255,GO:0052261,GO:0052306,GO:0052309,GO:0052552,GO:0052553,GO:0052561,GO:0052562,GO:0052564,GO:0052572,GO:0061799,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0075136,GO:0080134,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.6.1.17 ko:K03637 ko00790,ko01100,ko04122,map00790,map01100,map04122 R11372 RC03425 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1RCYZ@1224,1S3ST@1236,3Z2PN@583,COG0315@1,COG0315@2 NA|NA|NA H Catalyzes the conversion of (8S)-3',8-cyclo-7,8- dihydroguanosine 5'-triphosphate to cyclic pyranopterin monophosphate (cPMP) Z1_03501 529507.PMI0610 2.5e-191 674.5 Proteus moaA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0006777,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0018130,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019720,GO:0043170,GO:0043545,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051189,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 4.1.99.22 ko:K03639 ko00790,ko01100,ko04122,map00790,map01100,map04122 R09394 RC03420 ko00000,ko00001,ko01000 Bacteria 1MW3W@1224,1RR68@1236,3Z1AK@583,COG2896@1,COG2896@2 NA|NA|NA H Molybdenum cofactor biosynthesis protein A Z1_03502 529507.PMI0609 3.7e-168 597.4 Proteus ybhK Bacteria 1NW3K@1224,1RQP9@1236,3Z150@583,COG0391@1,COG0391@2 NA|NA|NA S Gluconeogenesis factor Z1_03503 529507.PMI0608 3.6e-174 617.5 Proteus Bacteria 1NA1N@1224,1T86Y@1236,2EC04@1,335ZE@2,3Z2EG@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1266) Z1_03504 529507.PMI0607 0.0 1297.7 Proteus uvrB GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009380,GO:0009628,GO:0032991,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050896,GO:1902494,GO:1905347,GO:1905348,GO:1990391 ko:K03702,ko:K08999 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko03400 Bacteria 1MUFK@1224,1RN6Z@1236,3Z1VV@583,COG0556@1,COG0556@2 NA|NA|NA L damaged site, the DNA wraps around one UvrB monomer. DNA wrap is dependent on ATP binding by UvrB and probably causes local melting of the DNA helix, facilitating insertion of UvrB beta-hairpin between the DNA strands. Then UvrB probes one DNA strand for the presence of a lesion. If a lesion is found the UvrA subunits dissociate and the UvrB-DNA preincision complex is formed. This complex is subsequently bound by UvrC and the second UvrB is released. If no lesion is found, the DNA wraps around the other UvrB subunit that will check the other stand for damage Z1_03505 529507.PMI0606 4.3e-129 467.2 Proteus bioD GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004141,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0017076,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032787,GO:0034641,GO:0035639,GO:0036094,GO:0042364,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0046872,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.3.3 ko:K01935 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R03182 RC00868 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC55989_1330.EC55989_0821,iECIAI1_1343.ECIAI1_0813,iECO103_1326.ECO103_0813,iECO111_1330.ECO111_0839,iECO26_1355.ECO26_0904,iECSE_1348.ECSE_0831,iECW_1372.ECW_m0833,iEKO11_1354.EKO11_3108,iEcE24377_1341.EcE24377A_0841,iSFV_1184.SFV_0761,iSSON_1240.SSON_0757,iWFL_1372.ECW_m0833,ic_1306.c0858 Bacteria 1RDRK@1224,1RSHS@1236,3Z22M@583,COG0132@1,COG0132@2 NA|NA|NA H Catalyzes a mechanistically unusual reaction, the ATP- dependent insertion of CO2 between the N7 and N8 nitrogen atoms of 7,8-diaminopelargonic acid (DAPA) to form an ureido ring Z1_03506 529507.PMI0605 1.2e-143 515.8 Proteus bioC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004141,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008757,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0010340,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0032259,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0052689,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.1.1.197 ko:K02169 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00572 R09543 RC00003,RC00460 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECP_1309.ECP_0791,iSBO_1134.SBO_0664,iSFV_1184.SFV_0760,iSF_1195.SF0727,iSFxv_1172.SFxv_0792,iSSON_1240.SSON_0756,iS_1188.S0768,iSbBS512_1146.SbBS512_E2575 Bacteria 1PA5F@1224,1RY7A@1236,3Z0XX@583,COG0500@1,COG2226@2 NA|NA|NA H Converts the free carboxyl group of a malonyl-thioester to its methyl ester by transfer of a methyl group from S-adenosyl- L-methionine (SAM). It allows to synthesize pimeloyl-ACP via the fatty acid synthetic pathway Z1_03507 529507.PMI0604 2.5e-222 777.7 Proteus bioF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008710,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0032787,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0070279,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.3.1.47,2.8.1.6 ko:K00652,ko:K01012 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R01078,R03210,R10124 RC00004,RC00039,RC00441,RC02725 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iEC55989_1330.EC55989_0819,iECO111_1330.ECO111_0837,iECO26_1355.ECO26_0902,iSDY_1059.SDY_0830 Bacteria 1MVVH@1224,1RNS6@1236,3Z1E5@583,COG0156@1,COG0156@2 NA|NA|NA H Catalyzes the decarboxylative condensation of pimeloyl- acyl-carrier protein and L-alanine to produce 8-amino-7- oxononanoate (AON), acyl-carrier protein , and carbon dioxide Z1_03508 529507.PMI0603 4.4e-194 683.7 Proteus bioB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004076,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0030312,GO:0032787,GO:0034641,GO:0042364,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051539,GO:0051540,GO:0070283,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072330,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.8.1.6 ko:K01012 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R01078 RC00441 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iNJ661.Rv1589,iZ_1308.Z0994 Bacteria 1MVFF@1224,1RMEQ@1236,3Z22X@583,COG0502@1,COG0502@2 NA|NA|NA H Catalyzes the conversion of dethiobiotin (DTB) to biotin by the insertion of a sulfur atom into dethiobiotin via a radical- based mechanism Z1_03509 529507.PMI0602 1.2e-238 832.0 Proteus bioA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004015,GO:0005488,GO:0006082,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006768,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0009058,GO:0009102,GO:0009108,GO:0009110,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016769,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019752,GO:0019842,GO:0030170,GO:0032787,GO:0034641,GO:0036094,GO:0042364,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051186,GO:0051188,GO:0070279,GO:0071704,GO:0072330,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.6.1.62 ko:K00833 ko00780,ko01100,map00780,map01100 M00123,M00573,M00577 R03231 RC00006,RC00887 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007 iIT341.HP0976,iUTI89_1310.UTI89_C0772,iZ_1308.Z0993 Bacteria 1MU2N@1224,1RP0W@1236,3Z1NG@583,COG0161@1,COG0161@2 NA|NA|NA H Catalyzes the transfer of the alpha-amino group from S- adenosyl-L-methionine (SAM) to 7-keto-8-aminopelargonic acid (KAPA) to form 7,8-diaminopelargonic acid (DAPA). It is the only animotransferase known to utilize SAM as an amino donor Z1_03510 529507.PMI0601 6.3e-190 669.8 Proteus pgl GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0016787,GO:0016788,GO:0017057,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0052689 3.1.1.31 ko:K07404 ko00030,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00030,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00004,M00006,M00008 R02035 RC00537 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iSSON_1240.SSON_0741 Bacteria 1MWGS@1224,1RNX2@1236,3Z22U@583,COG2706@1,COG2706@2 NA|NA|NA G Lactonase, 7-bladed beta-propeller Z1_03511 529507.PMI0600 1.1e-155 555.8 Proteus ybhA GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006793,GO:0006796,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019203,GO:0033883,GO:0042578,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050308 iECSP_1301.ECSP_0819,iECs_1301.ECs0794,iG2583_1286.G2583_0932,iZ_1308.Z0936 Bacteria 1PGMI@1224,1RPYI@1236,3Z0WP@583,COG0561@1,COG0561@2 NA|NA|NA S Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase Z1_03512 34506.g813 3.6e-199 700.7 Eukaryota GO:0006935,GO:0008150,GO:0009605,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042330,GO:0050896 3.6.3.44 ko:K05657,ko:K05658 ko02010,ko04976,ko05206,ko05226,map02010,map04976,map05206,map05226 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000,ko04090,ko04147 3.A.1.201 Eukaryota COG1132@1,KOG0058@2759 NA|NA|NA V ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances Z1_03513 529507.PMI0598 8.2e-120 436.4 Proteus modB GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944 3.6.3.29 ko:K02017,ko:K02018,ko:K15496 ko02010,map02010 M00189,M00423 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.6.5,3.A.1.8 iECO103_1326.ECO103_0752 Bacteria 1MUXR@1224,1RRDV@1236,3Z0V0@583,COG4149@1,COG4149@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_03514 529507.PMI0597 3.7e-137 494.2 Proteus modA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008509,GO:0015075,GO:0015098,GO:0015103,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015412,GO:0015689,GO:0015698,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0030151,GO:0030288,GO:0030313,GO:0030973,GO:0031975,GO:0034220,GO:0042597,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043225,GO:0043492,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0098656,GO:0099133,GO:1901359 ko:K02020 ko02010,map02010 M00189 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.8 iAF987.Gmet_0512,iECO111_1330.ECO111_0773,iPC815.YPO1145 Bacteria 1MVNA@1224,1RN71@1236,3Z0X7@583,COG0725@1,COG0725@2 NA|NA|NA P molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein Z1_03515 529507.PMI0596 9.4e-15 85.1 Proteus acrZ Bacteria 1NHYI@1224,1SGXU@1236,2EGRQ@1,33AHW@2,3Z33W@583 NA|NA|NA U AcrA-AcrB-AcrZ-TolC is a drug efflux protein complex with a broad substrate specificity. This protein binds to AcrB and is required for efflux of some but not all substrates, suggesting it may influence the specificity of drug export Z1_03516 529507.PMI0595 9.6e-141 506.1 Proteus modE GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K02019,ko:K05772 ko02010,map02010 M00186 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000,ko03000 3.A.1.6.2,3.A.1.6.4 Bacteria 1P9SX@1224,1RMES@1236,3Z2XT@583,COG2005@1,COG2005@2,COG3585@1,COG3585@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_03517 585.DR95_1519 4.8e-51 207.6 Proteus Bacteria 1PZJ8@1224,1T8N5@1236,2DP2D@1,303XC@2,3Z3I0@583 NA|NA|NA S Pfam:DUF1436 Z1_03518 585.DR95_1519 8e-25 119.0 Proteus Bacteria 1PZJ8@1224,1T8N5@1236,2DP2D@1,303XC@2,3Z3I0@583 NA|NA|NA S Pfam:DUF1436 Z1_03519 585.DR95_1519 7.9e-22 109.8 Proteus Bacteria 1PZJ8@1224,1T8N5@1236,2DP2D@1,303XC@2,3Z3I0@583 NA|NA|NA S Pfam:DUF1436 Z1_03520 585.DR95_1519 6.7e-47 193.7 Proteus Bacteria 1PZJ8@1224,1T8N5@1236,2DP2D@1,303XC@2,3Z3I0@583 NA|NA|NA S Pfam:DUF1436 Z1_03521 1141663.OOC_17952 1.2e-66 259.6 Providencia Bacteria 1Q07F@1224,1TEBF@1236,2E73I@1,32EDR@2,3ZA8I@586 NA|NA|NA Z1_03522 529507.PMI0593 0.0 1569.7 Proteus ko:K15125 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko00536 Bacteria 1MX2K@1224,1RNRK@1236,3Z1SC@583,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U Psort location OuterMembrane, score Z1_03524 529507.PMI0593 0.0 1201.4 Proteus ko:K15125 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko00536 Bacteria 1MX2K@1224,1RNRK@1236,3Z1SC@583,COG3210@1,COG3210@2 NA|NA|NA U Psort location OuterMembrane, score Z1_03525 529507.PMI0592 6.2e-293 1012.7 Proteus hpmB ko:K07326,ko:K11017 ko03070,ko05133,map03070,map05133 ko00000,ko00001,ko02042,ko02044 1.B.20 Bacteria 1MXF6@1224,1RP05@1236,3Z1K8@583,COG2831@1,COG2831@2 NA|NA|NA U Haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB Z1_03526 529507.PMI0591 2.6e-277 960.7 Proteus modF GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0008144,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 3.6.3.21,3.6.3.34 ko:K02013,ko:K02028,ko:K05776 ko02010,map02010 M00189,M00236,M00240 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.14,3.A.1.3 Bacteria 1MVVM@1224,1RMXK@1236,3Z110@583,COG1119@1,COG1119@2 NA|NA|NA P ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_03527 529507.PMI0590 4.1e-141 507.3 Proteus gpmA GO:0001871,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004619,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006082,GO:0006090,GO:0006091,GO:0006094,GO:0006096,GO:0006109,GO:0006139,GO:0006140,GO:0006163,GO:0006164,GO:0006165,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006754,GO:0006757,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009132,GO:0009135,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009144,GO:0009145,GO:0009150,GO:0009152,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009165,GO:0009166,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009179,GO:0009185,GO:0009199,GO:0009201,GO:0009205,GO:0009206,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009894,GO:0009986,GO:0009987,GO:0010675,GO:0016051,GO:0016052,GO:0016053,GO:0016310,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019220,GO:0019222,GO:0019318,GO:0019319,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019438,GO:0019439,GO:0019637,GO:0019693,GO:0019752,GO:0030246,GO:0030247,GO:0031323,GO:0031329,GO:0032787,GO:0034248,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0034655,GO:0042866,GO:0043436,GO:0043455,GO:0043456,GO:0043470,GO:0043471,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044270,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046031,GO:0046034,GO:0046364,GO:0046390,GO:0046394,GO:0046434,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046538,GO:0046700,GO:0046939,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051174,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051193,GO:0051196,GO:0055086,GO:0060255,GO:0062012,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0072521,GO:0072522,GO:0072524,GO:0072525,GO:0080090,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901292,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901361,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901575,GO:1901576,GO:1902031,GO:2001065 5.4.2.11 ko:K01834 ko00010,ko00260,ko00680,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01230,ko04922,ko05230,map00010,map00260,map00680,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01230,map04922,map05230 M00001,M00002,M00003 R01518 RC00536 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04147 Bacteria 1MUVE@1224,1RNCX@1236,3Z0ZA@583,COG0588@1,COG0588@2 NA|NA|NA F Belongs to the phosphoglycerate mutase family. BPG- dependent PGAM subfamily Z1_03528 529507.PMI0589 2.6e-202 711.1 Proteus aroG GO:0003674,GO:0003824,GO:0003849,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019438,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.54 ko:K01626 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024 M00022 R01826 RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_0684,iECSF_1327.ECSF_0680,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0777,iLF82_1304.LF82_0146,iNRG857_1313.NRG857_03335,iYL1228.KPN_00758 Bacteria 1MU5Q@1224,1RMAA@1236,3Z3BI@583,COG0722@1,COG0722@2 NA|NA|NA H Stereospecific condensation of phosphoenolpyruvate (PEP) and D-erythrose-4-phosphate (E4P) giving rise to 3-deoxy-D- arabino-heptulosonate-7-phosphate (DAHP) Z1_03529 529507.PMI0588 3.3e-127 461.1 Proteus pnuC GO:0003674,GO:0005215,GO:0005337,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0008150,GO:0015858,GO:0015931,GO:0015932,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034257,GO:0034258,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:1901264,GO:1901505,GO:1901642 ko:K03811 ko00000,ko02000 4.B.1.1 iSDY_1059.SDY_0695 Bacteria 1MXN4@1224,1RMZE@1236,3Z1DB@583,COG3201@1,COG3201@2 NA|NA|NA H Nicotinamide mononucleotide transporter Z1_03530 529507.PMI0587 3.1e-164 584.3 Proteus ko:K05593 ko00000,ko01000,ko01504 Bacteria 1RDT4@1224,1S4NT@1236,29W5C@1,30HQC@2,3Z1AW@583 NA|NA|NA H Streptomycin adenylyltransferase Z1_03533 529507.PMI0586 2.3e-99 368.6 Proteus cpoB GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0042597,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044464,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051301,GO:0065003,GO:0071840 3.5.1.28 ko:K01448 ko01503,map01503 M00727 R04112 RC00064,RC00141 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01011,ko03036 Bacteria 1MUSV@1224,1RQWA@1236,3Z2SY@583,COG1729@1,COG1729@2 NA|NA|NA D Mediates coordination of peptidoglycan synthesis and outer membrane constriction during cell division Z1_03534 529507.PMI0585 7.2e-86 323.2 Proteus pal GO:0005575,GO:0005623,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032153,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0051301,GO:0071944,GO:0098552 ko:K03640 ko00000,ko02000 2.C.1.2 Bacteria 1MZTV@1224,1S8RG@1236,3Z1RY@583,COG2885@1,COG2885@2 NA|NA|NA M OmpA family Z1_03535 529507.PMI0584 1.1e-165 589.7 Proteus tolB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009719,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0015031,GO:0015833,GO:0015893,GO:0017038,GO:0019534,GO:0019904,GO:0022857,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031975,GO:0032153,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042597,GO:0042886,GO:0042891,GO:0043213,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045184,GO:0046677,GO:0046678,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0070887,GO:0071236,GO:0071237,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071705,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1901998 ko:K03641 ko00000,ko02000 2.C.1.2 Bacteria 1MV09@1224,1RMCY@1236,3Z17R@583,COG0823@1,COG0823@2 NA|NA|NA U Involved in the TonB-independent uptake of proteins Z1_03536 529507.PMI0583 5.2e-97 361.3 Proteus tolA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009719,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0015031,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016032,GO:0017038,GO:0019058,GO:0019904,GO:0030260,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0033036,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042891,GO:0043213,GO:0044403,GO:0044409,GO:0044419,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046677,GO:0046678,GO:0046718,GO:0046790,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051301,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051806,GO:0051828,GO:0070887,GO:0071236,GO:0071237,GO:0071310,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0097718,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701 ko:K03646 ko00000,ko02000 2.C.1.2 Bacteria 1MVQS@1224,1RP2V@1236,3Z1X0@583,COG3064@1,COG3064@2 NA|NA|NA M membrane spanning protein TolA K03646 Z1_03537 529507.PMI0582 5.4e-66 256.9 Proteus tolR GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032153,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042891,GO:0043213,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944 ko:K03560 ko00000,ko02000 1.A.30.2.2 Bacteria 1MZ6M@1224,1S8RS@1236,3Z2UA@583,COG0848@1,COG0848@2 NA|NA|NA U Biopolymer transport protein ExbD/TolR Z1_03538 529507.PMI0581 6.9e-119 433.3 Proteus tolQ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008104,GO:0008150,GO:0015031,GO:0015833,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0017038,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031975,GO:0032153,GO:0033036,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042886,GO:0042891,GO:0043213,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045184,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944 ko:K03562 ko01120,map01120 ko00000,ko02000 1.A.30.2.2 Bacteria 1NCWW@1224,1RMD4@1236,3Z0VT@583,COG0811@1,COG0811@2 NA|NA|NA U MotA/TolQ/ExbB proton channel family Z1_03539 529507.PMI0580 2.7e-67 261.2 Proteus ybgC GO:0003674,GO:0003824,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790 ko:K07107,ko:K12500 ko00000,ko01000,ko01004 iECP_1309.ECP_0747,iSDY_1059.SDY_0684 Bacteria 1MZH6@1224,1S93F@1236,3Z2IU@583,COG0824@1,COG0824@2 NA|NA|NA S Thioesterase-like superfamily Z1_03540 529507.PMI0579 4.3e-68 263.8 Proteus Bacteria 1ND59@1224,1SJHY@1236,3Z33I@583,COG4460@1,COG4460@2 NA|NA|NA S protein conserved in bacteria Z1_03541 529507.PMI0578 5.7e-242 843.2 Proteus Bacteria 1NDP5@1224,1RPAK@1236,3Z1RZ@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_03542 529507.PMI0577 1.7e-162 578.6 Proteus ptxR Bacteria 1QY35@1224,1RNAV@1236,3Z1KR@583,COG0583@1,COG0583@2 NA|NA|NA K Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family Z1_03543 529507.PMI0576 1.3e-44 185.3 Proteus ybgE iECW_1372.ECW_m0790,iWFL_1372.ECW_m0790 Bacteria 1MZDH@1224,1SA3Q@1236,3Z2VE@583,COG3790@1,COG3790@2 NA|NA|NA S Cyd operon protein YbgE (Cyd_oper_YbgE) Z1_03544 529507.PMI0575 1e-11 74.7 Proteus ybgT GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016679,GO:0019867,GO:0031224,GO:0031226,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0055114,GO:0071944 1.10.3.14 ko:K00424 ko00190,ko02020,map00190,map02020 M00153 ko00000,ko00001,ko01000 3.D.4.3 Bacteria 1NGDQ@1224,1TDMV@1236,3Z34R@583,COG4890@1,COG4890@2 NA|NA|NA S Membrane bound YbgT-like protein Z1_03545 529507.PMI0574 8.3e-218 762.7 Proteus cydB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0019646,GO:0020037,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046906,GO:0048037,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363 1.10.3.14 ko:K00426 ko00190,ko01100,ko02020,map00190,map01100,map02020 M00153 R11325 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.3 iPC815.YPO1118,iYO844.BSU38750 Bacteria 1MURP@1224,1RP7F@1236,3Z1HR@583,COG1294@1,COG1294@2 NA|NA|NA C cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II Z1_03546 529507.PMI0573 7.2e-297 1025.8 Proteus cydA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016491,GO:0016679,GO:0019646,GO:0020037,GO:0022900,GO:0022904,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032991,GO:0044237,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046906,GO:0048037,GO:0055114,GO:0070069,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363 1.10.3.14 ko:K00425 ko00190,ko01100,ko02020,map00190,map01100,map02020 M00153 R11325 RC00061 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 3.D.4.3 iPC815.YPO1117,iSFxv_1172.SFxv_0621,iS_1188.S0577 Bacteria 1MV60@1224,1RN2U@1236,3Z17H@583,COG1271@1,COG1271@2 NA|NA|NA C Cytochrome bd terminal oxidase subunit I Z1_03547 529507.PMI0572 2.3e-159 568.2 Proteus sucD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009361,GO:0009987,GO:0016310,GO:0019538,GO:0032991,GO:0036211,GO:0042709,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045239,GO:0046777,GO:0071704,GO:1901564,GO:1902494 6.2.1.5 ko:K01902,ko:K02381 ko00020,ko00640,ko00660,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00640,map00660,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00173,M00374,M00620 R00405,R02404 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_0608 Bacteria 1MUGA@1224,1RM7Y@1236,3Z10W@583,COG0074@1,COG0074@2 NA|NA|NA C Succinyl-CoA synthetase functions in the citric acid cycle (TCA), coupling the hydrolysis of succinyl-CoA to the synthesis of either ATP or GTP and thus represents the only step of substrate-level phosphorylation in the TCA. The alpha subunit of the enzyme binds the substrates coenzyme A and phosphate, while succinate binding and nucleotide specificity is provided by the beta subunit Z1_03548 529507.PMI0571 8.7e-215 752.7 Proteus sucC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004774,GO:0004775,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009361,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016874,GO:0016877,GO:0016878,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0032991,GO:0042709,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045239,GO:0045333,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350,GO:1902494 6.2.1.5 ko:K01903 ko00020,ko00640,ko00660,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00640,map00660,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00173,M00374,M00620 R00405,R02404 RC00004,RC00014 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iPC815.YPO1115,iUMNK88_1353.UMNK88_764 Bacteria 1MVCE@1224,1RMSU@1236,3Z237@583,COG0045@1,COG0045@2 NA|NA|NA F Succinyl-CoA synthetase functions in the citric acid cycle (TCA), coupling the hydrolysis of succinyl-CoA to the synthesis of either ATP or GTP and thus represents the only step of substrate-level phosphorylation in the TCA. The beta subunit provides nucleotide specificity of the enzyme and binds the substrate succinate, while the binding sites for coenzyme A and phosphate are found in the alpha subunit Z1_03549 529507.PMI0570 1.4e-220 771.9 Proteus sucB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004149,GO:0005488,GO:0005504,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008289,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016417,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016748,GO:0016751,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0031405,GO:0031406,GO:0032991,GO:0033293,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045239,GO:0045240,GO:0045252,GO:0045333,GO:0048037,GO:0050662,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901363,GO:1901681,GO:1902494,GO:1990204,GO:1990234 2.3.1.61 ko:K00658 ko00020,ko00310,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00310,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00032 R02570,R02571,R08549 RC00004,RC02727,RC02833 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_2766,iAPECO1_1312.APECO1_1352,iECED1_1282.ECED1_0696,iECOK1_1307.ECOK1_0726,iECS88_1305.ECS88_0752,iLF82_1304.LF82_2196,iNRG857_1313.NRG857_03235,iUMN146_1321.UM146_13990,iUTI89_1310.UTI89_C0722 Bacteria 1MUJD@1224,1RME0@1236,3Z24I@583,COG0508@1,COG0508@2 NA|NA|NA C The 2-oxoglutarate dehydrogenase complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate to succinyl-CoA and CO(2) Z1_03550 34506.g1594 0.0 1886.7 Rhabditida Nematoda 1M0MY@119089,3AIIV@33154,3BZ3U@33208,3DDXU@33213,40QY7@6231,41725@6236,COG0479@1,COG0567@1,KOG0450@2759,KOG3049@2759 NA|NA|NA CG 2-oxoglutarate dehydrogenase N-terminus Z1_03551 529507.PMI0568 3.1e-138 497.7 Proteus sdhB GO:0000104,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0022900,GO:0022904,GO:0032991,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045281,GO:0045282,GO:0045333,GO:0048037,GO:0051536,GO:0051537,GO:0051538,GO:0051539,GO:0051540,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071944,GO:0072350,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1902494,GO:1990204 1.3.5.1,1.3.5.4 ko:K00240,ko:K00245 ko00020,ko00190,ko00620,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko02020,map00020,map00190,map00620,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map02020 M00009,M00011,M00149,M00150,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 e_coli_core.b0724,iAF1260.b0724,iBWG_1329.BWG_0583,iEC042_1314.EC042_0742,iECDH10B_1368.ECDH10B_0791,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0683,iECUMN_1333.ECUMN_0802,iEcDH1_1363.EcDH1_2911,iJO1366.b0724,iJR904.b0724,iY75_1357.Y75_RS03765 Bacteria 1MVHS@1224,1RNWR@1236,3Z0UH@583,COG0479@1,COG0479@2 NA|NA|NA C 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain Z1_03552 529507.PMI0567 0.0 1198.3 Proteus sdhA GO:0000104,GO:0000166,GO:0001539,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006113,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009061,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019752,GO:0022607,GO:0022900,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032991,GO:0033554,GO:0036094,GO:0040011,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044780,GO:0044781,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045281,GO:0045282,GO:0045283,GO:0045284,GO:0045333,GO:0048037,GO:0048870,GO:0050660,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051674,GO:0051716,GO:0055114,GO:0070469,GO:0070470,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071949,GO:0071973,GO:0072350,GO:0097159,GO:0097588,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1990204 1.3.5.1,1.3.5.4 ko:K00239 ko00020,ko00190,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko05134,map00020,map00190,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map05134 M00009,M00011,M00149,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iE2348C_1286.E2348C_0603,iJN746.PP_4191,iPC815.YPO1111 Bacteria 1MU5M@1224,1RMU2@1236,3Z175@583,COG1053@1,COG1053@2 NA|NA|NA C Belongs to the FAD-dependent oxidoreductase 2 family. FRD SDH subfamily Z1_03553 529507.PMI0566 9.8e-50 202.6 Proteus sdhD GO:0000104,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016999,GO:0017004,GO:0017144,GO:0019752,GO:0020037,GO:0022607,GO:0022900,GO:0032991,GO:0034622,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045273,GO:0045274,GO:0045281,GO:0045282,GO:0045333,GO:0046906,GO:0048037,GO:0055114,GO:0065003,GO:0070469,GO:0070470,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072350,GO:0097159,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098803,GO:1901363,GO:1902494,GO:1990204 ko:K00242 ko00020,ko00190,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00190,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00149,M00173 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002 e_coli_core.b0722,iAF1260.b0722,iAPECO1_1312.APECO1_1356,iB21_1397.B21_00671,iBWG_1329.BWG_0581,iE2348C_1286.E2348C_0602,iEC042_1314.EC042_0740,iECABU_c1320.ECABU_c07680,iECBD_1354.ECBD_2938,iECB_1328.ECB_00682,iECDH10B_1368.ECDH10B_0789,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0681,iECD_1391.ECD_00682,iECED1_1282.ECED1_0692,iECIAI1_1343.ECIAI1_0696,iECIAI39_1322.ECIAI39_0680,iECNA114_1301.ECNA114_0658,iECO103_1326.ECO103_0716,iECO111_1330.ECO111_0739,iECO26_1355.ECO26_0783,iECOK1_1307.ECOK1_0722,iECP_1309.ECP_0734,iECS88_1305.ECS88_0748,iECSE_1348.ECSE_0782,iECSF_1327.ECSF_0655,iECUMN_1333.ECUMN_0800,iECW_1372.ECW_m0777,iEKO11_1354.EKO11_3157,iETEC_1333.ETEC_0733,iEcDH1_1363.EcDH1_2913,iEcE24377_1341.EcE24377A_0749,iEcHS_1320.EcHS_A0770,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0735,iEcolC_1368.EcolC_2933,iJO1366.b0722,iJR904.b0722,iLF82_1304.LF82_2100,iNRG857_1313.NRG857_03215,iSBO_1134.SBO_0580,iSDY_1059.SDY_0660,iSFV_1184.SFV_0613,iSF_1195.SF0575,iSFxv_1172.SFxv_0634,iSSON_1240.SSON_0673,iS_1188.S0588,iUMN146_1321.UM146_14010,iUMNK88_1353.UMNK88_758,iUTI89_1310.UTI89_C0718,iWFL_1372.ECW_m0777,iY75_1357.Y75_RS03755,ic_1306.c0800 Bacteria 1MZR9@1224,1S9TS@1236,3Z2QN@583,COG2142@1,COG2142@2 NA|NA|NA C Membrane-anchoring subunit of succinate dehydrogenase (SDH) Z1_03554 529507.PMI0565 7.3e-43 179.5 Proteus sdhC GO:0000104,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008177,GO:0009055,GO:0009060,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016635,GO:0017004,GO:0020037,GO:0022607,GO:0022900,GO:0034622,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046906,GO:0048037,GO:0048038,GO:0048039,GO:0055114,GO:0065003,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363 ko:K00241 ko00020,ko00190,ko00650,ko00720,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00020,map00190,map00650,map00720,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00009,M00011,M00149,M00173,M00374,M00376 R02164 RC00045 ko00000,ko00001,ko00002 iSF_1195.SF0576,iS_1188.S0589 Bacteria 1RIGZ@1224,1S5ZE@1236,3Z2NF@583,COG2009@1,COG2009@2 NA|NA|NA C Succinate dehydrogenase/Fumarate reductase transmembrane subunit Z1_03555 529507.PMI0564 5.7e-252 876.3 Proteus gltA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 2.3.3.1 ko:K01647 ko00020,ko00630,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,map00020,map00630,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230 M00009,M00010,M00012,M00740 R00351 RC00004,RC00067 br01601,ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iIT341.HP0026,iYL1228.KPN_00727 Bacteria 1MUKX@1224,1RNDK@1236,3Z1SS@583,COG0372@1,COG0372@2 NA|NA|NA H Citrate synthase, C-terminal domain Z1_03556 529507.PMI0563 7.6e-143 513.1 Proteus Bacteria 1P1ZP@1224,1RSND@1236,3Z1W4@583,COG2207@1,COG2207@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix, arabinose operon control protein Z1_03557 529507.PMI0562 1.4e-196 692.2 Proteus bcr1 ko:K02030,ko:K07552 M00236 ko00000,ko00002,ko02000 2.A.1.2,3.A.1.3 Bacteria 1N1R8@1224,1RQPQ@1236,3Z1UC@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA P drug resistance transporter, Bcr CflA subfamily Z1_03558 529507.PMI0561 0.0 2440.6 Proteus molR 3.4.24.3 ko:K01387 ko00000,ko01000,ko01002,ko02042 Bacteria 1R4FD@1224,1RRAR@1236,3Z267@583,COG1413@1,COG1413@2 NA|NA|NA C Domain of unknown function (DUF4132) Z1_03559 529507.PMI0560 2.9e-204 717.6 Proteus yehL ko:K03924 ko00000,ko01000 Bacteria 1QDUZ@1224,1RQGT@1236,3Z23H@583,COG0714@1,COG0714@2 NA|NA|NA S AAA domain (dynein-related subfamily) Z1_03560 529507.PMI0559 0.0 1712.6 Proteus Bacteria 1Q79N@1224,1RZ2Q@1236,3Z0X9@583,COG1916@1,COG1916@2 NA|NA|NA Z1_03561 529507.PMI0558 8.6e-207 726.1 Proteus Bacteria 1MW56@1224,1RQ93@1236,3Z29I@583,COG2425@1,COG2425@2 NA|NA|NA S VWA domain containing CoxE-like protein Z1_03562 529507.PMI0557 0.0 1369.0 Proteus yehQ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 Bacteria 1R92N@1224,1RQVR@1236,3Z1CX@583,COG4715@1,COG4715@2 NA|NA|NA S Zinc finger, swim domain protein Z1_03563 529507.PMI0556 6.2e-142 510.0 Proteus ybgI GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0010212,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0050896 3.5.4.16 ko:K22391 ko00790,ko01100,map00790,map01100 M00126 R00428,R04639,R05046,R05048 RC00263,RC00294,RC00323,RC00945,RC01188 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1MVUN@1224,1RNBU@1236,3Z2N6@583,COG0327@1,COG0327@2 NA|NA|NA S NIF3 (NGG1p interacting factor 3) Z1_03564 529507.PMI0555 3.2e-32 143.7 Proteus ybfA GO:0008150,GO:0009314,GO:0009628,GO:0050896 Bacteria 1N75R@1224,1SCNU@1236,2E70C@1,331J8@2,3Z2Y2@583 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF2517) Z1_03565 529507.PMI0554 7.4e-43 179.5 Gammaproteobacteria ko:K07726 ko00000,ko03000 Bacteria 1N155@1224,1S8UJ@1236,COG2944@1,COG2944@2 NA|NA|NA K transcriptional regulator Z1_03566 529507.PMI0553 1.1e-50 205.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1N7N5@1224,1S7H6@1236,COG4737@1,COG4737@2 NA|NA|NA S RelE toxin of RelE / RelB toxin-antitoxin system Z1_03567 529507.PMI0549 8.3e-87 326.2 Proteus yehS Bacteria 1RD33@1224,1S3ZU@1236,3Z1WB@583,COG4807@1,COG4807@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1456) Z1_03568 529507.PMI0548 0.0 1092.8 Proteus pgm GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004614,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005977,GO:0005978,GO:0005996,GO:0006006,GO:0006012,GO:0006073,GO:0006091,GO:0006112,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009250,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016051,GO:0016052,GO:0016853,GO:0016866,GO:0016868,GO:0019318,GO:0019320,GO:0019388,GO:0033692,GO:0034637,GO:0034645,GO:0043170,GO:0044042,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046365,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901575,GO:1901576 5.4.2.2 ko:K01835 ko00010,ko00030,ko00052,ko00230,ko00500,ko00520,ko00521,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,map00010,map00030,map00052,map00230,map00500,map00520,map00521,map01100,map01110,map01120,map01130 M00549 R00959,R01057,R08639 RC00408 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1376,iECED1_1282.ECED1_0670,iECNA114_1301.ECNA114_0627,iECOK1_1307.ECOK1_0699,iECP_1309.ECP_0709,iECS88_1305.ECS88_0725,iJN678.pgm,iLF82_1304.LF82_1632,iNRG857_1313.NRG857_03110,iUMN146_1321.UM146_14115,iYL1228.KPN_00711 Bacteria 1MU5S@1224,1RPDV@1236,3Z180@583,COG0033@1,COG0033@2 NA|NA|NA G phosphoglucomutase K01835 Z1_03569 529507.PMI0547 4.5e-97 360.5 Proteus seqA GO:0000819,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003688,GO:0003690,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006275,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007062,GO:0008150,GO:0008156,GO:0009314,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010385,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0016043,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022402,GO:0022607,GO:0030174,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032297,GO:0032991,GO:0032993,GO:0042802,GO:0043565,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044729,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051276,GO:0051289,GO:0060255,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090143,GO:0090329,GO:0097159,GO:0098813,GO:1901363,GO:1990097,GO:1990837,GO:2000104,GO:2000112,GO:2000113 ko:K03645 ko00000,ko03032,ko03036 Bacteria 1MUW8@1224,1RQ83@1236,3Z2PQ@583,COG3057@1,COG3057@2 NA|NA|NA L Negative regulator of replication initiation, which contributes to regulation of DNA replication and ensures that replication initiation occurs exactly once per chromosome per cell cycle. Binds to pairs of hemimethylated GATC sequences in the oriC region, thus preventing assembly of replication proteins and re- initiation at newly replicated origins. Repression is relieved when the region becomes fully methylated Z1_03570 529507.PMI0546 1.1e-144 519.2 Proteus ybfF GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0052689 ko:K01175 ko00000,ko01000 Bacteria 1R9X7@1224,1S2CW@1236,3Z0ZP@583,COG0596@1,COG0596@2 NA|NA|NA S PGAP1-like protein Z1_03571 529507.PMI0545 1.4e-44 185.3 Proteus ybfE GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0009987,GO:0033554,GO:0050896,GO:0051716 Bacteria 1MZBR@1224,1S9W6@1236,2DB8J@1,32TX0@2,3Z2VF@583 NA|NA|NA S Ribbon-helix-helix protein, copG family Z1_03572 471881.PROPEN_04902 6e-99 366.7 Proteus fldA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K03839 ko00000 iJN678.isiB Bacteria 1MX7F@1224,1RMNT@1236,3Z20Z@583,COG0716@1,COG0716@2 NA|NA|NA C Low-potential electron donor to a number of redox enzymes Z1_03573 529507.PMI0543 1.7e-81 308.5 Proteus fur GO:0000976,GO:0001067,GO:0001130,GO:0001216,GO:0001217,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003690,GO:0003700,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0008150,GO:0008270,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009891,GO:0009892,GO:0009893,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010558,GO:0010604,GO:0010605,GO:0010628,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031328,GO:0032991,GO:0032993,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043565,GO:0044212,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045934,GO:0045935,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051253,GO:0051254,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903507,GO:1903508,GO:1990837,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03711,ko:K09823 ko02024,map02024 ko00000,ko00001,ko03000 Bacteria 1RDWJ@1224,1S4H7@1236,3Z294@583,COG0735@1,COG0735@2 NA|NA|NA K Ferric uptake regulator family Z1_03574 598467.BrE312_1775 8.7e-23 112.5 Gammaproteobacteria hicB Bacteria 1MZYR@1224,1SAHX@1236,COG4226@1,COG4226@2 NA|NA|NA S protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters Z1_03575 34506.g1380 1.5e-282 978.0 Bilateria Metazoa 2C471@1,2SJ8F@2759,3AJ1D@33154,3BX2P@33208,3DDGM@33213 NA|NA|NA T outer membrane porin, OprD family Z1_03576 529507.PMI0539 0.0 1142.1 Proteus glnS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004819,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006425,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.18 ko:K01886 ko00970,ko01100,map00970,map01100 M00359,M00360 R03652 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iECIAI39_1322.ECIAI39_0637 Bacteria 1MUC8@1224,1RQ7G@1236,3Z1QX@583,COG0008@1,COG0008@2 NA|NA|NA J tRNA synthetases class I (E and Q), anti-codon binding domain Z1_03577 529507.PMI0538 1.1e-15 88.2 Proteus 2.7.7.7 ko:K02345 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1NB5J@1224,1SDHW@1236,2CFYS@1,332IJ@2,3Z3J9@583 NA|NA|NA L DNA polymerase III, theta subunit Z1_03578 529507.PMI0536 7.9e-86 323.2 Proteus fimA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009289,GO:0042995,GO:0044464 ko:K07345 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02035,ko02044 Bacteria 1N55X@1224,1SANE@1236,3Z34F@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Type-1 fimbrial protein, A Z1_03579 585.DR95_2801 4.4e-132 477.2 Proteus focC ko:K15540 ko00000 Bacteria 1RBUW@1224,1S2UZ@1236,3Z37E@583,COG3121@1,COG3121@2 NA|NA|NA M Pili assembly chaperone Z1_03580 585.DR95_2800 0.0 1651.3 Proteus Z012_00755 ko:K07347 ko05133,map05133 ko00000,ko00001,ko02000,ko02035,ko02044 1.B.11.3 Bacteria 1MUHE@1224,1RMPU@1236,3Z1WV@583,COG3188@1,COG3188@2 NA|NA|NA NU usher protein Z1_03581 585.DR95_2799 6.4e-204 716.5 Proteus Bacteria 1N9A4@1224,1T0XM@1236,3Z37Z@583,COG3539@1,COG3539@2 NA|NA|NA NU Fimbrial protein Z1_03582 585.DR95_2798 5.8e-46 189.9 Proteus Bacteria 1QGJD@1224,1TDZI@1236,3Z3FK@583,COG1396@1,COG1396@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_03583 529507.PMI0941 3.8e-15 86.7 Proteus Bacteria 1QCYH@1224,1T8SK@1236,2CB8H@1,31FEV@2,3Z3D4@583 NA|NA|NA Z1_03584 529507.PMI0530 1.2e-36 158.7 Proteus Bacteria 1QD25@1224,1T8X4@1236,2DIS9@1,3041A@2,3Z3JN@583 NA|NA|NA Z1_03587 529507.PMI0527 0.0 2560.8 Proteus sca1 Bacteria 1MXXZ@1224,1RNFD@1236,3Z3KB@583,COG1196@1,COG1196@2,COG4733@1,COG4733@2 NA|NA|NA D Putative phage tail protein Z1_03588 406817.XNC1_1998 1.1e-83 316.2 Gammaproteobacteria Bacteria 1RD21@1224,1S1ZN@1236,COG4723@1,COG4723@2 NA|NA|NA S lambda tail assembly I Z1_03589 529507.PMI0525 8.9e-138 496.1 Gammaproteobacteria 3.5.1.28 ko:K01449,ko:K21471 R04112 RC00064,RC00141 ko00000,ko01000,ko01002,ko01011 Bacteria 1N05J@1224,1RPP6@1236,COG0791@1,COG0791@2,COG1310@1,COG1310@2 NA|NA|NA M NLP P60 protein Z1_03590 529507.PMI0524 2.8e-142 511.1 Proteus L Bacteria 1RB56@1224,1RVAC@1236,3Z3HZ@583,COG4672@1,COG4672@2 NA|NA|NA S Phage minor tail protein L Z1_03591 529507.PMI0523 1.7e-57 228.4 Gammaproteobacteria Bacteria 1MZYW@1224,1S9IT@1236,COG4718@1,COG4718@2 NA|NA|NA S minor tail family protein Z1_03594 520999.PROVALCAL_02297 1e-12 79.0 Providencia Bacteria 1QGY9@1224,1TEEK@1236,2AQ2P@1,31F7U@2,3ZAF9@586 NA|NA|NA Z1_03595 529507.PMI0519 0.0 1717.2 Gammaproteobacteria sca1 Bacteria 1MU81@1224,1RS6P@1236,COG1196@1,COG1196@2 NA|NA|NA D tail length tape measure Z1_03597 471874.PROSTU_03749 9.5e-28 131.0 Providencia ko:K03466 ko00000,ko03036 3.A.12 Bacteria 1P3K4@1224,1SR8F@1236,3Z9QS@586,COG1674@1,COG1674@2 NA|NA|NA D COG1674 DNA segregation ATPase FtsK SpoIIIE and related proteins Z1_03598 529507.PMI0514 4.6e-36 156.8 Gammaproteobacteria ko:K21495 ko00000,ko02048 Bacteria 1R3H4@1224,1T67Y@1236,COG4691@1,COG4691@2 NA|NA|NA S Arc-like DNA binding domain Z1_03599 529507.PMI0513 9.9e-21 105.1 Proteus Bacteria 1P4JI@1224,1STG0@1236,296KZ@1,2ZTWA@2,3Z3K6@583 NA|NA|NA Z1_03600 529507.PMI0512 7.2e-155 553.1 Proteobacteria ant Bacteria 1QXC9@1224,COG3617@1,COG3617@2 NA|NA|NA K BRO family, N-terminal domain Z1_03601 1051985.l11_04460 4.9e-49 201.8 Proteobacteria Bacteria 1NXW5@1224,2BZWN@1,342Z4@2 NA|NA|NA Z1_03602 1124991.MU9_2891 2.1e-22 110.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1NKUN@1224,1STAF@1236,2EMEJ@1,33F3D@2 NA|NA|NA Z1_03603 1124991.MU9_2892 1.8e-36 158.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1NDWR@1224,1SG54@1236,2C91S@1,338RV@2 NA|NA|NA Z1_03605 529507.PMI0509 4.5e-45 186.8 Gammaproteobacteria Bacteria 1NIEM@1224,1SEXK@1236,2EGMV@1,33AE0@2 NA|NA|NA S Phage related hypothetical protein (DUF1799) Z1_03606 529507.PMI0508 7.9e-51 206.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1MYWF@1224,1S8HK@1236,2BP8W@1,32I0F@2 NA|NA|NA S Phage tail assembly chaperone Z1_03607 529507.PMI0507 2.3e-116 424.9 Gammaproteobacteria BB2227 Bacteria 1R8WN@1224,1T0IM@1236,COG5492@1,COG5492@2 NA|NA|NA N Phage tail tube protein, TTP Z1_03608 529507.PMI0506 5.9e-70 270.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1N8IA@1224,1SE8U@1236,2DNVE@1,32ZC4@2 NA|NA|NA S Bacteriophage related domain of unknown function Z1_03609 529507.PMI0505 4.6e-100 370.5 Gammaproteobacteria Bacteria 1RAWH@1224,1S3F5@1236,28RH4@1,2ZDW4@2 NA|NA|NA Z1_03610 529507.PMI0504 3.3e-61 240.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1RIAC@1224,1S8B1@1236,2A15P@1,30PBM@2 NA|NA|NA Z1_03611 529507.PMI0503 2.5e-83 314.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1PBDU@1224,1S02H@1236,2D485@1,32TGJ@2 NA|NA|NA Z1_03612 529507.PMI0501 8.5e-176 622.9 Proteus Bacteria 1PN2A@1224,1RVPE@1236,3Z3I7@583,COG5492@1,COG5492@2 NA|NA|NA N domain, Protein Z1_03613 529507.PMI0500 7.1e-133 479.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1PS44@1224,1RRB1@1236,28IWE@1,2Z8UQ@2 NA|NA|NA Z1_03615 529507.PMI0499 8.9e-209 732.6 Proteus Bacteria 1PUNX@1224,1SPVV@1236,3Z3KA@583,COG2369@1,COG2369@2 NA|NA|NA S Phage Mu protein F like protein Z1_03616 529507.PMI0498 3e-259 900.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1MX3D@1224,1RQQR@1236,28KYW@1,2ZAE8@2 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4055) Z1_03617 529507.PMI0497 8.6e-300 1035.4 Proteus Bacteria 1R2FH@1224,1RN1F@1236,3Z3CD@583,COG4626@1,COG4626@2 NA|NA|NA S Terminase Z1_03618 529507.PMI0496 7.4e-101 373.2 Proteus ko:K07474 ko00000 Bacteria 1QUEH@1224,1T1W1@1236,3Z365@583,COG3728@1,COG3728@2 NA|NA|NA L DNA packaging Z1_03620 529507.PMI0494 2.1e-31 141.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1NMTR@1224,1SGAN@1236,2EH9C@1,33B17@2 NA|NA|NA Z1_03621 529507.PMI0493 1.2e-103 382.5 Proteus Bacteria 1N0VX@1224,1SACX@1236,3Z3JR@583,COG3617@1,COG3617@2 NA|NA|NA K BRO family, N-terminal domain Z1_03622 529507.PMI0492 1.5e-77 295.4 Proteus ko:K14744 ko00000,ko01000 Bacteria 1N10F@1224,1SCW4@1236,2DP4N@1,330HV@2,3Z2Q6@583 NA|NA|NA S Bacteriophage Rz lysis protein Z1_03623 529507.PMI0491A 1.4e-19 101.3 Proteus Bacteria 1P9K9@1224,1SVMX@1236,2CB5E@1,2ZKDQ@2,3Z32H@583 NA|NA|NA Z1_03624 529507.PMI0491 8.6e-81 306.2 Proteus rrrD GO:0001906,GO:0001907,GO:0003674,GO:0003796,GO:0003824,GO:0004553,GO:0008150,GO:0016032,GO:0016787,GO:0016798,GO:0019048,GO:0019058,GO:0019076,GO:0031640,GO:0035821,GO:0035890,GO:0035891,GO:0039633,GO:0040011,GO:0044003,GO:0044004,GO:0044364,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044659,GO:0044661,GO:0051701,GO:0051704,GO:0051817,GO:0051818,GO:0051883,GO:0052126,GO:0052192,GO:0061783 3.2.1.17 ko:K01185 ko00000,ko01000 Bacteria 1MZJD@1224,1S6BA@1236,3Z2AH@583,COG3772@1,COG3772@2 NA|NA|NA G Lysozyme Z1_03625 471881.PROPEN_00067 1.6e-39 168.3 Proteus Bacteria 1NG7G@1224,1SG47@1236,2ECNU@1,336KK@2,3Z2WK@583 NA|NA|NA Z1_03626 529507.PMI0489 1.4e-69 268.9 Proteus Bacteria 1RKVX@1224,1S8NJ@1236,2B0DD@1,31SQM@2,3Z2M4@583 NA|NA|NA Z1_03627 529507.PMI0488 4e-95 354.0 Proteus yagU ko:K08996 ko00000 Bacteria 1PZZB@1224,1TEHS@1236,3Z3ET@583,COG3477@1,COG3477@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1440) Z1_03628 529507.PMI0487 8.5e-116 422.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1MVG8@1224,1RQPN@1236,28HCQ@1,2Z7PH@2 NA|NA|NA S Phage antitermination protein Q Z1_03629 529507.PMI0486 1e-62 245.7 Proteus Bacteria 1RH5J@1224,1S7I6@1236,3Z3HB@583,COG4570@1,COG4570@2 NA|NA|NA L Endodeoxyribonuclease RusA Z1_03630 529507.PMI0485 3.1e-49 200.7 Gammaproteobacteria ybcO Bacteria 1N2ZM@1224,1S9DB@1236,2D7I9@1,32TP3@2 NA|NA|NA S phage protein Z1_03631 529507.PMI0484 1.3e-81 308.9 Proteus Bacteria 1QJDG@1224,1THCK@1236,2AVR7@1,31MIH@2,3Z3J1@583 NA|NA|NA Z1_03632 529507.PMI0483 6.4e-265 919.5 Proteus dnaB 3.6.4.12 ko:K02314 ko03030,ko04112,map03030,map04112 ko00000,ko00001,ko01000,ko03032 Bacteria 1MUG9@1224,1RYUJ@1236,3Z39N@583,COG0305@1,COG0305@2 NA|NA|NA L DnaB-like helicase N terminal domain Z1_03633 529507.PMI0482 6.2e-137 493.4 Gammaproteobacteria ko:K19505,ko:K21885 ko00000,ko03000 Bacteria 1RGKD@1224,1S53G@1236,COG0640@1,COG0640@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix domain Z1_03635 529507.PMI0481 7.6e-58 229.6 Gammaproteobacteria Bacteria 1NAX8@1224,1SD0Y@1236,2EEGI@1,338AC@2 NA|NA|NA Z1_03636 520999.PROVALCAL_00635 2.2e-28 131.0 Gammaproteobacteria ko:K07729 ko00000,ko03000 Bacteria 1N8JD@1224,1SD27@1236,COG1476@1,COG1476@2 NA|NA|NA K Helix-turn-helix XRE-family like proteins Z1_03637 520999.PROVALCAL_00636 1.3e-103 382.5 Providencia Bacteria 1QC0U@1224,1RYY2@1236,3ZADA@586,COG1974@1,COG1974@2 NA|NA|NA K Peptidase S24-like Z1_03638 472759.Nhal_3522 6.8e-19 100.9 Bacteria Bacteria COG4226@1,COG4226@2 NA|NA|NA K protein encoded in hypervariable junctions of pilus gene clusters Z1_03642 529507.PMI0474 3.3e-27 127.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1P5KR@1224,1SUDA@1236,299J6@1,2ZWMP@2 NA|NA|NA Z1_03645 529507.PMI0473 5.1e-41 173.3 Proteus Bacteria 1P384@1224,1SSDP@1236,2DYPI@1,34AK4@2,3Z3HS@583 NA|NA|NA Z1_03647 529507.PMI0470 4.9e-22 110.2 Proteus Bacteria 1QGK4@1224,1TE0E@1236,29W3X@1,30HNQ@2,3Z3GT@583 NA|NA|NA Z1_03648 585.DR95_349 6.4e-76 290.0 Proteus rlmD 2.1.1.190,2.1.1.191 ko:K03215,ko:K06969,ko:K14292 ko03013,map03013 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 Bacteria 1RDWK@1224,1S3U5@1236,3Z2GJ@583,COG1092@1,COG1092@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the guanine in position 2445 (m2G2445) and the guanine in position 2069 (m7G2069) of 23S rRNA Z1_03651 343509.SG0930 3.3e-72 278.1 Gammaproteobacteria ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RC22@1224,1S2A9@1236,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L ERF superfamily Z1_03652 1484157.PSNIH2_13560 2.4e-60 238.4 Pantoea ssb GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006281,GO:0006298,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0007154,GO:0008047,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009432,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0030234,GO:0031668,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042802,GO:0043085,GO:0043170,GO:0044093,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0050790,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0065009,GO:0071496,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097159,GO:0098772,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 ko:K03111 ko03030,ko03430,ko03440,map03030,map03430,map03440 ko00000,ko00001,ko03029,ko03032,ko03400 Bacteria 1RCWT@1224,1S3WP@1236,3VYXI@53335,COG0629@1,COG0629@2 NA|NA|NA L Plays an important role in DNA replication, recombination and repair. Binds to ssDNA and to an array of partner proteins to recruit them to their sites of action during DNA metabolism Z1_03656 585.DR95_338 2.1e-24 117.9 Gammaproteobacteria Bacteria 1P1JF@1224,1SS1M@1236,2FKHQ@1,34C4W@2 NA|NA|NA Z1_03657 585.DR95_337 2.3e-78 298.1 Gammaproteobacteria Bacteria 1R553@1224,1RZ8I@1236,COG4725@1,COG4725@2 NA|NA|NA KT Belongs to the MT-A70-like family Z1_03659 529507.PMI0456 5e-187 660.2 Proteus ko:K21039 ko00000,ko01000 Bacteria 1MX7E@1224,1RNX5@1236,3Z0WH@583,COG0582@1,COG0582@2 NA|NA|NA L Phage integrase family Z1_03660 529507.PMI0455 0.0 1278.8 Proteus nagE GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0006810,GO:0006950,GO:0006974,GO:0008150,GO:0008643,GO:0009401,GO:0009987,GO:0015144,GO:0015764,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0022804,GO:0022857,GO:0033554,GO:0034219,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0071702,GO:0090563,GO:0090586,GO:1901264 2.7.1.193,2.7.1.199,2.7.1.201,2.7.1.208,2.7.1.211 ko:K02755,ko:K02756,ko:K02757,ko:K02777,ko:K02778,ko:K02779,ko:K02790,ko:K02791,ko:K02802,ko:K02803,ko:K02804,ko:K02809,ko:K02810,ko:K02818,ko:K02819,ko:K20107,ko:K20108,ko:K20116,ko:K20117,ko:K20118 ko00010,ko00500,ko00520,ko02026,ko02060,ko05111,map00010,map00500,map00520,map02026,map02060,map05111 M00265,M00266,M00267,M00268,M00269,M00270,M00271,M00272,M00303,M00806,M00809 R00811,R02738,R02780,R04111,R04394,R05132,R05199,R08559 RC00017,RC03206 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 4.A.1.1.1,4.A.1.1.11,4.A.1.1.12,4.A.1.1.13,4.A.1.1.14,4.A.1.1.15,4.A.1.1.2,4.A.1.1.3,4.A.1.1.5,4.A.1.1.7,4.A.1.1.9,4.A.1.2.1,4.A.1.2.10,4.A.1.2.11,4.A.1.2.12,4.A.1.2.13,4.A.1.2.2,4.A.1.2.4,4.A.1.2.5,4.A.1.2.6,4.A.1.2.8,4.A.1.2.9 iECP_1309.ECP_0691,iSB619.SA_RS08720 Bacteria 1MY1V@1224,1RMYZ@1236,3Z28M@583,COG1263@1,COG1263@2,COG1264@1,COG1264@2,COG2190@1,COG2190@2 NA|NA|NA G PTS system, N-acetylglucosamine-specific Z1_03661 529507.PMI0454 4e-150 537.3 Proteus nagB GO:0003674,GO:0003824,GO:0004342,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006040,GO:0006044,GO:0006046,GO:0006047,GO:0006048,GO:0006054,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009058,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009987,GO:0016054,GO:0016787,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016861,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019239,GO:0019262,GO:0019438,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034654,GO:0042737,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046348,GO:0046349,GO:0046395,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:1901071,GO:1901072,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901575,GO:1901576 3.1.1.31,3.5.99.6 ko:K01057,ko:K02564 ko00030,ko00520,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,map00030,map00520,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200 M00004,M00006,M00008 R00765,R02035 RC00163,RC00537 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iZ_1308.Z0825 Bacteria 1MVEA@1224,1RQ2V@1236,3Z1ZF@583,COG0363@1,COG0363@2 NA|NA|NA G Catalyzes the reversible isomerization-deamination of glucosamine 6-phosphate (GlcN6P) to form fructose 6-phosphate (Fru6P) and ammonium ion Z1_03662 529507.PMI0453 1.5e-222 778.5 Proteus nagA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0006040,GO:0006044,GO:0006046,GO:0006054,GO:0006082,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0008448,GO:0009056,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016054,GO:0016787,GO:0016810,GO:0016811,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0019213,GO:0019262,GO:0019752,GO:0022607,GO:0042737,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043436,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0046348,GO:0046395,GO:0046872,GO:0046914,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0065003,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901071,GO:1901072,GO:1901135,GO:1901136,GO:1901575 3.5.1.25 ko:K01443 ko00520,ko01130,map00520,map01130 R02059 RC00166,RC00300 ko00000,ko00001,ko01000 iEcolC_1368.EcolC_2979,iYL1228.KPN_00698 Bacteria 1MW8Y@1224,1RMRV@1236,3Z19H@583,COG1820@1,COG1820@2 NA|NA|NA G Belongs to the metallo-dependent hydrolases superfamily. NagA family Z1_03663 529507.PMI0452 8.6e-229 799.3 Proteus nagC GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0006355,GO:0008150,GO:0009889,GO:0010468,GO:0010556,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031326,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0097159,GO:1901363,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 2.1.1.303 ko:K02003,ko:K02565,ko:K04096,ko:K07058,ko:K09720,ko:K15545,ko:K20421 ko01059,ko01130,map01059,map01130 M00258,M00830 R10963 RC00003,RC00392 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000,ko03000 3.A.1 Bacteria 1NFM0@1224,1RNEA@1236,3Z20B@583,COG1321@1,COG1321@2,COG1940@1,COG1940@2 NA|NA|NA K ROK family Z1_03671 529507.PMI0451 4.6e-42 176.8 Proteus frmR ko:K21600 ko00000,ko03000 Bacteria 1N6ZN@1224,1SCK3@1236,3Z2XA@583,COG1937@1,COG1937@2 NA|NA|NA S Metal-sensitive transcriptional repressor Z1_03672 529507.PMI0450 1.4e-214 751.9 Proteus adhC GO:0003674,GO:0003824,GO:0004022,GO:0004024,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009056,GO:0009636,GO:0009987,GO:0010033,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016616,GO:0016999,GO:0017001,GO:0017144,GO:0042221,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044281,GO:0044282,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046185,GO:0046292,GO:0046294,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050896,GO:0051716,GO:0051903,GO:0055114,GO:0070887,GO:0071704,GO:0097237,GO:0098754,GO:0110095,GO:0110096,GO:1901575,GO:1901700,GO:1901701,GO:1990748 1.1.1.1,1.1.1.284 ko:K00121 ko00010,ko00071,ko00350,ko00625,ko00626,ko00680,ko00830,ko00980,ko00982,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01220,ko05204,map00010,map00071,map00350,map00625,map00626,map00680,map00830,map00980,map00982,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01220,map05204 R00623,R00754,R02124,R04880,R05233,R05234,R06917,R06927,R06983,R07105,R08281,R08306,R08310 RC00050,RC00087,RC00088,RC00099,RC00116,RC00649,RC01715,RC01734,RC02273 ko00000,ko00001,ko01000 iEC042_1314.EC042_0393,iEC55989_1330.EC55989_0365,iECH74115_1262.ECH74115_0431,iECIAI1_1343.ECIAI1_0357,iECIAI39_1322.ECIAI39_0322,iECO103_1326.ECO103_0338,iECO111_1330.ECO111_0392,iECO26_1355.ECO26_0392,iECSE_1348.ECSE_0381,iECSP_1301.ECSP_0420,iECUMN_1333.ECUMN_0399,iECW_1372.ECW_m0434,iECs_1301.ECs0411,iEKO11_1354.EKO11_3486,iETEC_1333.ETEC_0412,iEcE24377_1341.EcE24377A_0381,iEcHS_1320.EcHS_A0421,iEcolC_1368.EcolC_3269,iG2583_1286.G2583_0469,iSSON_1240.SSON_0335,iSbBS512_1146.SbBS512_E0271,iUMNK88_1353.UMNK88_407,iWFL_1372.ECW_m0434,iZ_1308.Z0456 Bacteria 1MUK4@1224,1RNQ4@1236,3Z187@583,COG1062@1,COG1062@2 NA|NA|NA C alcohol dehydrogenase class III (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (FDH) (FALDH) K00001 K00121 Z1_03673 529507.PMI0449 3.6e-162 577.4 Proteus fghA GO:0003674,GO:0003824,GO:0006081,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016790,GO:0016999,GO:0017144,GO:0018738,GO:0044237,GO:0044281,GO:0046292,GO:0071704 3.1.2.12 ko:K01070,ko:K09795 ko00680,ko01120,ko01200,map00680,map01120,map01200 R00527 RC00167,RC00320 ko00000,ko00001,ko01000 CE1 iAF1260.b0355,iBWG_1329.BWG_0244,iECDH10B_1368.ECDH10B_0310,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0342,iEcDH1_1363.EcDH1_3251,iG2583_1286.G2583_0468,iJO1366.b0355,iY75_1357.Y75_RS01830 Bacteria 1MUID@1224,1RMR3@1236,3Z2HT@583,COG0627@1,COG0627@2 NA|NA|NA S S-formylglutathione hydrolase Z1_03674 529507.PMI0448 7.7e-227 792.7 Proteus ubiF GO:0003674,GO:0003824,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006743,GO:0006744,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008682,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009987,GO:0016491,GO:0016705,GO:0042180,GO:0042181,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055114,GO:0071704,GO:1901576,GO:1901661,GO:1901663 ko:K03184,ko:K03185,ko:K18800 ko00130,ko01100,ko01110,map00130,map01100,map01110 M00117 R04987,R04989,R06146,R08768,R08773,R08775 RC00046,RC01254,RC02670 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF1260.b0662,iBWG_1329.BWG_0533,iE2348C_1286.E2348C_0555,iECDH10B_1368.ECDH10B_0731,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0631,iETEC_1333.ETEC_0690,iEcDH1_1363.EcDH1_2964,iEcHS_1320.EcHS_A0709,iJO1366.b0662,iJR904.b0662,iSBO_1134.SBO_0526,iSbBS512_1146.SbBS512_E0585,iUMNK88_1353.UMNK88_700,iY75_1357.Y75_RS03450 Bacteria 1MU6I@1224,1RND5@1236,3Z2BS@583,COG0654@1,COG0654@2 NA|NA|NA C FAD binding domain Z1_03675 529507.PMI0447 1.3e-273 948.3 Proteus miaB GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016740,GO:0016782,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0035596,GO:0035597,GO:0035600,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048037,GO:0050497,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 2.8.4.3 ko:K06168 R10645,R10646,R10647 RC00003,RC00980,RC03221,RC03222 ko00000,ko01000,ko03016 Bacteria 1MURS@1224,1RMD8@1236,3Z12U@583,COG0621@1,COG0621@2 NA|NA|NA J Catalyzes the methylthiolation of N6- (dimethylallyl)adenosine (i(6)A), leading to the formation of 2- methylthio-N6-(dimethylallyl)adenosine (ms(2)i(6)A) at position 37 in tRNAs that read codons beginning with uridine Z1_03676 529507.PMI0446 2.8e-196 691.0 Proteus ybeZ GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K06217 ko00000 Bacteria 1MVDV@1224,1RP2Y@1236,3Z1ZX@583,COG1702@1,COG1702@2 NA|NA|NA T PhoH-like protein Z1_03677 529507.PMI0445 1.4e-83 315.5 Proteus ybeY GO:0000469,GO:0000478,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004521,GO:0004540,GO:0005488,GO:0006139,GO:0006355,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016151,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016892,GO:0016894,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0022613,GO:0030490,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031554,GO:0031564,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043244,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051171,GO:0051252,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1903506,GO:2000112,GO:2001141 2.6.99.2,3.5.4.5 ko:K01489,ko:K03474,ko:K03595,ko:K07042 ko00240,ko00750,ko00983,ko01100,map00240,map00750,map00983,map01100 M00124 R01878,R02485,R05838,R08221 RC00074,RC00514,RC01476 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009,ko03029 Bacteria 1MZ67@1224,1S6BS@1236,3Z194@583,COG0319@1,COG0319@2 NA|NA|NA J Single strand-specific metallo-endoribonuclease involved in late-stage 70S ribosome quality control and in maturation of the 3' terminus of the 16S rRNA Z1_03678 34506.g815 4.9e-162 577.0 Bilateria Metazoa 3AFDH@33154,3BYUB@33208,3DEXN@33213,COG1253@1,KOG2118@2759 NA|NA|NA S Transporter associated domain Z1_03679 529507.PMI0443 6.1e-285 986.1 Proteus lnt GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0019538,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034645,GO:0036211,GO:0042157,GO:0042158,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071704,GO:0071944,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K03820 ko00000,ko01000 GT2 iEcSMS35_1347.EcSMS35_0678,iSbBS512_1146.SbBS512_E0590 Bacteria 1MUBU@1224,1RM8M@1236,3Z29Z@583,COG0815@1,COG0815@2 NA|NA|NA M Transfers the fatty acyl group on membrane lipoproteins Z1_03680 529507.PMI0442 4e-127 460.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1P411@1224,1SUX0@1236,2C8QM@1,2ZTAC@2 NA|NA|NA Z1_03681 529507.PMI0441 9.5e-94 349.4 Proteus scsD ko:K03671 ko04621,ko05418,map04621,map05418 ko00000,ko00001,ko03110 Bacteria 1RHPC@1224,1S4C9@1236,3Z2JH@583,COG0526@1,COG0526@2 NA|NA|NA CO Thioredoxin-like Z1_03682 529507.PMI0440 3.1e-125 454.5 Proteus bdbD ko:K08344 ko00000,ko02000 5.A.1.5 Bacteria 1MY3H@1224,1S1X0@1236,3Z29F@583,COG1651@1,COG1651@2 NA|NA|NA O DSBA-like thioredoxin domain Z1_03683 529507.PMI0439 0.0 1331.6 Proteus dsbD 1.8.1.8 ko:K04084,ko:K08344 ko00000,ko01000,ko02000,ko03110 5.A.1.1,5.A.1.5 Bacteria 1MU8W@1224,1RPF7@1236,3Z1GX@583,COG4232@1,COG4232@2,COG4233@1,COG4233@2 NA|NA|NA CO Disulphide bond corrector protein DsbC Z1_03684 529507.PMI0438 3.6e-64 250.8 Proteus Bacteria 1NKQ6@1224,1SHU5@1236,2EK8H@1,33DYV@2,3Z2RS@583 NA|NA|NA Z1_03685 529507.PMI0437 3.5e-163 580.9 Proteus gltI GO:0003333,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006836,GO:0006855,GO:0006865,GO:0008150,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015800,GO:0015807,GO:0015813,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016595,GO:0016597,GO:0030288,GO:0030313,GO:0031406,GO:0031975,GO:0034220,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042597,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043177,GO:0044464,GO:0046942,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0070335,GO:0070778,GO:0071702,GO:0071705,GO:0098656,GO:1902475,GO:1903825,GO:1905039 ko:K10001 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00230 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 iECH74115_1262.ECH74115_0748,iECSE_1348.ECSE_0725,iECSP_1301.ECSP_0707,iECW_1372.ECW_m0710,iECs_1301.ECs0694,iEKO11_1354.EKO11_3211,iG2583_1286.G2583_0819,iSFV_1184.SFV_0671,iSF_1195.SF0626,iS_1188.S0648,iWFL_1372.ECW_m0710,iZ_1308.Z0805 Bacteria 1MV5D@1224,1RPBX@1236,3Z1BB@583,COG0834@1,COG0834@2 NA|NA|NA ET Bacterial periplasmic substrate-binding proteins Z1_03686 529507.PMI0436 4e-133 480.7 Proteus gltJ GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02029,ko:K10003,ko:K10040 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00228,M00230,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 iJN746.PP_1070 Bacteria 1MUVX@1224,1RMTK@1236,3Z2K1@583,COG0765@1,COG0765@2 NA|NA|NA P 3-TM region, His Glu Gln Arg opine family Z1_03687 529507.PMI0435 7.2e-113 413.3 Proteus gltK GO:0003333,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005342,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006865,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015171,GO:0015318,GO:0015711,GO:0015849,GO:0016020,GO:0022857,GO:0034220,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0098656,GO:1901998,GO:1903825,GO:1905039 ko:K02029,ko:K10002 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00230,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 iEcHS_1320.EcHS_A0698,iEcolC_1368.EcolC_2992,iSF_1195.SF0628,iSFxv_1172.SFxv_0695,iS_1188.S0650 Bacteria 1MV3I@1224,1RNX3@1236,3Z1RE@583,COG0765@1,COG0765@2 NA|NA|NA P Binding-protein-dependent transport system inner membrane component Z1_03688 529507.PMI0434 1.8e-130 471.9 Proteus gltL GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0008144,GO:0017076,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0035639,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363 3.6.3.21 ko:K02028,ko:K10004 ko02010,ko02020,map02010,map02020 M00230,M00236 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.3,3.A.1.3.19,3.A.1.3.4 iAPECO1_1312.APECO1_1411,iE2348C_1286.E2348C_0545,iECOK1_1307.ECOK1_0655,iECP_1309.ECP_0675,iECS88_1305.ECS88_0687,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0673,iUMN146_1321.UM146_14290,iUTI89_1310.UTI89_C0648 Bacteria 1MU9Q@1224,1RMX1@1236,3Z2SG@583,COG1126@1,COG1126@2 NA|NA|NA E (ABC) transporter Z1_03689 529507.PMI0433 0.0 1769.6 Proteus leuS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004823,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006429,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.4 ko:K01869 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03657 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016,ko03029 iECOK1_1307.ECOK1_0652,iECS88_1305.ECS88_0684,iNRG857_1313.NRG857_02925,iPC815.YPO2610 Bacteria 1MV47@1224,1RP14@1236,3Z18U@583,COG0495@1,COG0495@2 NA|NA|NA J leucine-tRNA synthetase (leucine--tRNA ligase) (LEURS) K01869 Z1_03690 529507.PMI0432 8.8e-93 346.3 Proteus lptE GO:0001530,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0008289,GO:0009279,GO:0009987,GO:0010876,GO:0015920,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0033036,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045229,GO:0051179,GO:0051234,GO:0061024,GO:0071702,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097367,GO:1901264 ko:K03643 ko00000,ko02000 1.B.42.1 iECH74115_1262.ECH74115_0730,iECSP_1301.ECSP_0694,iECs_1301.ECs0679,iG2583_1286.G2583_0804,iZ_1308.Z0788 Bacteria 1N0JN@1224,1SAG4@1236,3Z1A8@583,COG2980@1,COG2980@2 NA|NA|NA M Together with LptD, is involved in the assembly of lipopolysaccharide (LPS) at the surface of the outer membrane. Required for the proper assembly of LptD. Binds LPS and may serve as the LPS recognition site at the outer membrane Z1_03691 529507.PMI0431 1.4e-195 688.7 Proteus holA GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006261,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009360,GO:0009987,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042575,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046483,GO:0061695,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 2.7.7.7 ko:K02340 ko00230,ko00240,ko01100,ko03030,ko03430,ko03440,map00230,map00240,map01100,map03030,map03430,map03440 M00260 R00375,R00376,R00377,R00378 RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Bacteria 1MWYT@1224,1RQRE@1236,3Z276@583,COG1466@1,COG1466@2 NA|NA|NA L DNA polymerase III, delta subunit Z1_03692 529507.PMI0430 1.4e-129 468.8 Proteus nadD GO:0000309,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004515,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006531,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009108,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009435,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016779,GO:0018130,GO:0019355,GO:0019359,GO:0019362,GO:0019363,GO:0019365,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019674,GO:0019752,GO:0034355,GO:0034627,GO:0034628,GO:0034641,GO:0034654,GO:0043094,GO:0043173,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051186,GO:0051188,GO:0055086,GO:0070566,GO:0071704,GO:0072524,GO:0072525,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605 2.7.7.18,3.5.4.4,3.6.1.55 ko:K00969,ko:K01488,ko:K03574 ko00230,ko00760,ko01100,ko05340,map00230,map00760,map01100,map05340 M00115 R00137,R01560,R02556,R03005 RC00002,RC00477 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iECUMN_1333.ECUMN_0733,iJN746.PP_4810,iPC815.YPO2607,iSbBS512_1146.SbBS512_E0612 Bacteria 1RD0J@1224,1RP00@1236,3Z16W@583,COG1057@1,COG1057@2 NA|NA|NA H Catalyzes the reversible adenylation of nicotinate mononucleotide (NaMN) to nicotinic acid adenine dinucleotide (NaAD) Z1_03693 529507.PMI0429 2.3e-136 491.5 Proteus ybgA Bacteria 1MXYZ@1224,1RNMF@1236,3Z2RQ@583,COG3272@1,COG3272@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF1722) Z1_03694 529507.PMI0428 1.1e-52 212.2 Proteus rsfS GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006417,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0017148,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0034248,GO:0034249,GO:0043021,GO:0043023,GO:0044087,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:0090069,GO:0090071,GO:2000112,GO:2000113 2.7.7.18 ko:K00969,ko:K09710 ko00760,ko01100,map00760,map01100 M00115 R00137,R03005 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03009 Bacteria 1MZEF@1224,1S8W3@1236,3Z2QW@583,COG0799@1,COG0799@2 NA|NA|NA J Functions as a ribosomal silencing factor. Interacts with ribosomal protein L14 (rplN), blocking formation of intersubunit bridge B8. Prevents association of the 30S and 50S ribosomal subunits and the formation of functional ribosomes, thus repressing translation Z1_03695 471881.PROPEN_04951 3.1e-86 324.3 Proteus rlmH GO:0000154,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046483,GO:0046983,GO:0070037,GO:0070038,GO:0070475,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.177 ko:K00783 ko00000,ko01000,ko03009 Bacteria 1R9Z2@1224,1S1ZY@1236,3Z2C7@583,COG1576@1,COG1576@2 NA|NA|NA J Specifically methylates the pseudouridine at position 1915 (m3Psi1915) in 23S rRNA Z1_03696 529507.PMI0426 0.0 1275.0 Proteus mrdA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004180,GO:0004185,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006024,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0008238,GO:0008360,GO:0008658,GO:0009002,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009252,GO:0009273,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031406,GO:0033218,GO:0033293,GO:0034645,GO:0036094,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045229,GO:0046677,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070008,GO:0070011,GO:0070589,GO:0071554,GO:0071555,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0071972,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901681 3.4.16.4 ko:K05515 ko00550,ko01501,map00550,map01501 ko00000,ko00001,ko01000,ko01011 iAF987.Gmet_0928,iEcE24377_1341.EcE24377A_0661,iPC815.YPO2604 Bacteria 1MV8C@1224,1RN9H@1236,3Z19Z@583,COG0768@1,COG0768@2 NA|NA|NA M Catalyzes cross-linking of the peptidoglycan cell wall Z1_03697 529507.PMI0425 4.7e-202 710.3 Proteus mrdB ko:K05837 ko00000,ko03036 Bacteria 1MUK3@1224,1RMEJ@1236,3Z19V@583,COG0772@1,COG0772@2 NA|NA|NA M Peptidoglycan polymerase that is essential for cell wall elongation Z1_03698 529507.PMI0424 4.9e-155 553.9 Proteus rlpA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03642,ko:K03749 ko00000 Bacteria 1MZ8S@1224,1RMCG@1236,3Z2H6@583,COG0797@1,COG0797@2,COG3147@1,COG3147@2 NA|NA|NA M Lytic transglycolase Z1_03699 529507.PMI0423 3.5e-227 793.9 Proteus dacA GO:0000270,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004175,GO:0004180,GO:0004185,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006022,GO:0006508,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008236,GO:0008238,GO:0008360,GO:0008658,GO:0009002,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016787,GO:0017171,GO:0019538,GO:0022603,GO:0022604,GO:0030203,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031406,GO:0033218,GO:0033293,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0044036,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0051128,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070008,GO:0070011,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:0140096,GO:1901135,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901681 3.4.16.4 ko:K07258 ko00550,ko01100,map00550,map01100 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko01011 iSFV_1184.SFV_0694,iYL1228.KPN_00664 Bacteria 1MUU7@1224,1RMJA@1236,3Z1X9@583,COG1686@1,COG1686@2 NA|NA|NA M Penicillin-binding protein 5, C-terminal domain Z1_03700 529507.PMI0422 3.4e-42 177.2 Proteus ybeD GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464 ko:K09158 ko00000 Bacteria 1RGV5@1224,1S61Y@1236,3Z3HD@583,COG2921@1,COG2921@2 NA|NA|NA S Protein of unknown function (DUF493) Z1_03701 529507.PMI0421 5.4e-118 430.3 Proteus lipB GO:0003674,GO:0003824,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009106,GO:0009107,GO:0009108,GO:0009249,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016053,GO:0016415,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0016772,GO:0016779,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016979,GO:0018065,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032787,GO:0033819,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048519,GO:0050789,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051604,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0072330,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 2.3.1.181 ko:K03801 ko00785,ko01100,map00785,map01100 R07766,R07769 RC00039,RC00992,RC02867 ko00000,ko00001,ko01000 iECSF_1327.ECSF_0569,iSFV_1184.SFV_0696,iSFxv_1172.SFxv_0718 Bacteria 1MU6A@1224,1RMXQ@1236,3Z18R@583,COG0321@1,COG0321@2 NA|NA|NA H Catalyzes the transfer of endogenously produced octanoic acid from octanoyl-acyl-carrier-protein onto the lipoyl domains of lipoate-dependent enzymes. Lipoyl-ACP can also act as a substrate although octanoyl-ACP is likely to be the physiological substrate Z1_03702 529507.PMI0420 3.7e-187 660.6 Proteus lipA GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006464,GO:0006629,GO:0006631,GO:0006633,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008610,GO:0009058,GO:0009106,GO:0009107,GO:0009108,GO:0009249,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016782,GO:0016783,GO:0016992,GO:0018065,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0019538,GO:0019752,GO:0032787,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046483,GO:0048037,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051536,GO:0051539,GO:0051540,GO:0051604,GO:0070283,GO:0071704,GO:0072330,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901576 2.8.1.8 ko:K03644 ko00785,ko01100,map00785,map01100 R07767,R07768 RC01978 ko00000,ko00001,ko01000 iAPECO1_1312.APECO1_1427,iB21_1397.B21_00586,iBWG_1329.BWG_0499,iE2348C_1286.E2348C_0528,iEC55989_1330.EC55989_0620,iECABU_c1320.ECABU_c06820,iECBD_1354.ECBD_3023,iECB_1328.ECB_00597,iECDH10B_1368.ECDH10B_0589,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_0597,iECD_1391.ECD_00597,iECED1_1282.ECED1_0624,iECH74115_1262.ECH74115_0716,iECIAI1_1343.ECIAI1_0611,iECIAI39_1322.ECIAI39_0603,iECNA114_1301.ECNA114_0567,iECO103_1326.ECO103_0635,iECO111_1330.ECO111_0658,iECO26_1355.ECO26_0702,iECOK1_1307.ECOK1_0638,iECP_1309.ECP_0658,iECS88_1305.ECS88_0669,iECSE_1348.ECSE_0695,iECSF_1327.ECSF_0567,iECSP_1301.ECSP_0681,iECUMN_1333.ECUMN_0720,iECW_1372.ECW_m0682,iECs_1301.ECs0666,iEKO11_1354.EKO11_3238,iETEC_1333.ETEC_0656,iEcDH1_1363.EcDH1_2998,iEcE24377_1341.EcE24377A_0652,iEcHS_1320.EcHS_A0679,iEcSMS35_1347.EcSMS35_0648,iEcolC_1368.EcolC_3017,iG2583_1286.G2583_0791,iJO1366.b0628,iLF82_1304.LF82_1199,iNRG857_1313.NRG857_02855,iSBO_1134.SBO_0492,iSDY_1059.SDY_0550,iSF_1195.SF0653,iSFxv_1172.SFxv_0720,iSSON_1240.SSON_0582,iS_1188.S0675,iSbBS512_1146.SbBS512_E0542,iUMN146_1321.UM146_14375,iUMNK88_1353.UMNK88_663,iUTI89_1310.UTI89_C0631,iWFL_1372.ECW_m0682,iY75_1357.Y75_RS03275,ic_1306.c0718 Bacteria 1MVRD@1224,1RMAT@1236,3Z0Z2@583,COG0320@1,COG0320@2 NA|NA|NA H Catalyzes the radical-mediated insertion of two sulfur atoms into the C-6 and C-8 positions of the octanoyl moiety bound to the lipoyl domains of lipoate-dependent enzymes, thereby converting the octanoylated domains into lipoylated derivatives Z1_03703 529507.PMI0419 5.3e-65 253.4 Proteus crcB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0008150,GO:0008509,GO:0015075,GO:0015103,GO:0015318,GO:0015698,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944,GO:0098656,GO:0098660,GO:0098661,GO:1903424,GO:1903425 ko:K06199 ko00000,ko02000 1.A.43.1,1.A.43.2,1.A.43.3 Bacteria 1MZNH@1224,1S9GR@1236,3Z2S9@583,COG0239@1,COG0239@2 NA|NA|NA D Important for reducing fluoride concentration in the cell, thus reducing its toxicity Z1_03704 220341.16506003 1.4e-44 186.0 Gammaproteobacteria Bacteria 1P0WI@1224,1SRM2@1236,2C5QM@1,345FM@2 NA|NA|NA Z1_03705 529507.PMI0418 9.6e-32 142.1 Proteus cspE GO:0001072,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003697,GO:0003723,GO:0003727,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006355,GO:0006950,GO:0008143,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031554,GO:0031564,GO:0043242,GO:0043244,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0060567,GO:0065007,GO:0070717,GO:0080090,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K03704 ko00000,ko03000 iECW_1372.ECW_m0678,iWFL_1372.ECW_m0678 Bacteria 1N6Q5@1224,1SCA7@1236,3Z3I2@583,COG1278@1,COG1278@2 NA|NA|NA K Cold shock protein domain Z1_03706 529507.PMI0417 8.1e-87 326.2 Proteus ogt 2.1.1.63 ko:K00567,ko:K10778 ko00000,ko01000,ko03000,ko03400 Bacteria 1N2YQ@1224,1S68H@1236,3Z2KB@583,COG0350@1,COG0350@2 NA|NA|NA H Involved in the cellular defense against the biological effects of O6-methylguanine (O6-MeG) and O4-methylthymine (O4-MeT) in DNA. Repairs the methylated nucleobase in DNA by stoichiometrically transferring the methyl group to a cysteine residue in the enzyme. This is a suicide reaction the enzyme is irreversibly inactivated Z1_03707 529507.PMI0416 1.5e-35 154.8 Proteus nrdH GO:0003674,GO:0003824,GO:0006091,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009055,GO:0009893,GO:0009987,GO:0016491,GO:0019222,GO:0019725,GO:0022900,GO:0042592,GO:0043085,GO:0044093,GO:0044237,GO:0045454,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051341,GO:0051353,GO:0055114,GO:0065007,GO:0065008,GO:0065009 ko:K06191 ko00000 Bacteria 1N7YD@1224,1SCFR@1236,3Z318@583,COG0695@1,COG0695@2 NA|NA|NA O Glutaredoxin Z1_03708 529507.PMI0415 1.8e-71 275.0 Proteus nrdI GO:0000166,GO:0003674,GO:0005488,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0010039,GO:0010181,GO:0019538,GO:0032553,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042221,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0048037,GO:0050662,GO:0050896,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071248,GO:0071281,GO:0071704,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564 ko:K03647 ko00000 Bacteria 1RGYF@1224,1S3ZY@1236,3Z2KI@583,COG1780@1,COG1780@2 NA|NA|NA F Probably involved in ribonucleotide reductase function Z1_03709 529507.PMI0414 0.0 1410.2 Proteus nrdE GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004748,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005971,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009117,GO:0009165,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016020,GO:0016491,GO:0016725,GO:0016728,GO:0017076,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0030554,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051063,GO:0055086,GO:0055114,GO:0061731,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090407,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901265,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990204 1.17.4.1 ko:K00525 ko00230,ko00240,ko01100,map00230,map00240,map01100 M00053 R02017,R02018,R02019,R02024 RC00613 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03400 iAPECO1_1312.APECO1_3846,iYO844.BSU17380 Bacteria 1MUJ8@1224,1RQQ6@1236,3Z24J@583,COG0209@1,COG0209@2 NA|NA|NA F ribonucleoside-diphosphate reductase Z1_03710 34506.g709 2e-185 654.8 Bilateria Metazoa 3AIVB@33154,3BYZI@33208,3DF1Q@33213,COG1678@1,KOG1567@2759 NA|NA|NA F Ribonucleotide reductase, small chain Z1_03711 529507.PMI0412 7.5e-222 776.2 Proteus proV GO:0000166,GO:0003674,GO:0004888,GO:0005034,GO:0005215,GO:0005275,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008144,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015837,GO:0015838,GO:0016020,GO:0016021,GO:0017076,GO:0022857,GO:0023052,GO:0030554,GO:0031224,GO:0031460,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0032991,GO:0035639,GO:0036094,GO:0038023,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0055085,GO:0060089,GO:0065007,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0097159,GO:0097367,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1901265,GO:1901363,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 3.6.3.32 ko:K02000 ko02010,map02010 M00208 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02000 3.A.1.12 iAF1260.b2677,iB21_1397.B21_02497,iBWG_1329.BWG_2420,iEC042_1314.EC042_2875,iEC55989_1330.EC55989_2945,iECBD_1354.ECBD_1042,iECB_1328.ECB_02533,iECDH1ME8569_1439.ECDH1ME8569_2593,iECD_1391.ECD_02533,iECED1_1282.ECED1_3132,iECIAI1_1343.ECIAI1_2773,iECO103_1326.ECO103_3218,iECO111_1330.ECO111_3401,iECO26_1355.ECO26_3746,iECSE_1348.ECSE_2930,iECW_1372.ECW_m2874,iEKO11_1354.EKO11_1094,iETEC_1333.ETEC_2874,iEcDH1_1363.EcDH1_1006,iEcE24377_1341.EcE24377A_2958,iEcolC_1368.EcolC_1029,iG2583_1286.G2583_3325,iJO1366.b2677,iJR904.b2677,iPC815.YPO2647,iSBO_1134.SBO_2839,iSbBS512_1146.SbBS512_E3202,iUMNK88_1353.UMNK88_3346,iWFL_1372.ECW_m2874,iY75_1357.Y75_RS13940,iYL1228.KPN_03008 Bacteria 1MU86@1224,1RN2R@1236,3Z0Z0@583,COG4175@1,COG4175@2 NA|NA|NA P ATPases associated with a variety of cellular activities Z1_03712 529507.PMI0411 3e-197 694.5 Proteus proW GO:0003674,GO:0005215,GO:0005275,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006836,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0009628,GO:0015695,GO:0015696,GO:0015697,GO:0015837,GO:0015838,GO:0015871,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031460,GO:0032991,GO:0043190,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072337,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K02001,ko:K02002 ko02010,map02010 M00208 ko00000,ko00001,ko00002,ko02000 3.A.1.12 iEcSMS35_1347.EcSMS35_2800 Bacteria 1MUM4@1224,1RPQS@1236,3Z1W2@583,COG4176@1,COG4176@2 NA|NA|NA P ABC-type proline glycine betaine transport system, permease component Z1_03713 34506.g638 4.2e-194 683.7 Bilateria Metazoa 2EEUU@1,2SK5X@2759,3AHTE@33154,3BYWN@33208,3DFSN@33213 NA|NA|NA T Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system Z1_03714 529507.PMI0409 0.0 1620.1 Proteus tdhA GO:0005575,GO:0005623,GO:0009279,GO:0016020,GO:0019867,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031975,GO:0044462,GO:0044464,GO:0071944 ko:K02014,ko:K16087 ko00000,ko02000 1.B.14,1.B.14.2 Bacteria 1NI9R@1224,1RS0I@1236,3Z35F@583,COG1629@1,COG1629@2 NA|NA|NA P TonB dependent receptor Z1_03715 529507.PMI0408 1.3e-216 758.8 Proteus ygaY Bacteria 1MVVW@1224,1RMXR@1236,3Z10V@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP Major Facilitator Superfamily Z1_03716 529507.PMI0407 2.7e-91 341.3 Proteus mprA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006355,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0018130,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0042221,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0046677,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097659,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 ko:K15974 M00701 ko00000,ko00002,ko03000 Bacteria 1NWZ4@1224,1RPCJ@1236,3Z1I5@583,COG1846@1,COG1846@2 NA|NA|NA K helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein Z1_03717 529507.PMI0406 2.1e-103 381.7 Gammaproteobacteria Bacteria 1QK2B@1224,1RYRR@1236,COG1335@1,COG1335@2 NA|NA|NA Q Hydrolase Z1_03718 529507.PMI0405 1.7e-205 721.8 Proteus mdtG ko:K05820,ko:K08161 ko00000,ko02000 2.A.1.2.20,2.A.1.27 Bacteria 1MUBP@1224,1RNXS@1236,3Z2FN@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA EGP MFS_1 like family Z1_03719 529507.PMI0404 3.1e-113 414.5 Bacteria Bacteria COG1802@1,COG1802@2 NA|NA|NA K Transcriptional regulator Z1_03720 529507.PMI0403 7.4e-214 749.6 Proteus emrA GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0009897,GO:0009986,GO:0016020,GO:0031224,GO:0031226,GO:0031233,GO:0031237,GO:0042802,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0071944,GO:0098552,GO:0098567 ko:K03543 M00701 ko00000,ko00002,ko02000 8.A.1.1 Bacteria 1MU7I@1224,1RMAD@1236,3Z206@583,COG1566@1,COG1566@2 NA|NA|NA V multidrug resistance efflux pump Z1_03721 529507.PMI0402 5.1e-284 983.0 Proteus emrB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0008150,GO:0009636,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0042221,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071944 ko:K03446 M00701 ko00000,ko00002,ko02000 2.A.1.3 Bacteria 1MU1I@1224,1RNTG@1236,3Z2DK@583,COG0477@1,COG2814@2 NA|NA|NA P Major Facilitator Superfamily Z1_03722 529507.PMI0401 2.8e-191 674.5 Proteus yfiF GO:0000154,GO:0000451,GO:0000453,GO:0001510,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008171,GO:0008173,GO:0008649,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016435,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022613,GO:0031167,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0070039,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140102,GO:1901360 2.1.1.185,2.1.1.34 ko:K00556,ko:K03214,ko:K03218 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 Bacteria 1MXGV@1224,1RNWQ@1236,3Z165@583,COG0566@1,COG0566@2 NA|NA|NA H RNA 2'-O ribose methyltransferase substrate binding Z1_03723 529507.PMI0400 2.2e-196 691.4 Proteus ko:K18015 ko00000,ko01000,ko01002 Bacteria 1QCUT@1224,1T8N2@1236,2ADFR@1,3135T@2,3Z35N@583 NA|NA|NA Z1_03724 529507.PMI0399 2.8e-128 464.5 Proteus yfiP ko:K05812 ko00000 Bacteria 1N8XY@1224,1RS6H@1236,3Z2MK@583,COG3148@1,COG3148@2 NA|NA|NA S DTW Z1_03725 529507.PMI0398 0.0 1737.6 Proteus yfiQ GO:0003674,GO:0003824,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006979,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019538,GO:0022607,GO:0032459,GO:0032462,GO:0034212,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043254,GO:0043412,GO:0043543,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051289,GO:0052858,GO:0061733,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:1901564 6.2.1.13 ko:K01905,ko:K09181,ko:K22224 ko00010,ko00620,ko00640,ko01100,ko01120,map00010,map00620,map00640,map01100,map01120 R00229,R00920 RC00004,RC00012,RC00014 ko00000,ko00001,ko01000,ko01004 Bacteria 1MW98@1224,1RPXX@1236,3Z1KB@583,COG0045@1,COG0045@2,COG0454@1,COG0456@2,COG1042@1,COG1042@2 NA|NA|NA CK CoA binding domain Z1_03726 529507.PMI0397 1.6e-257 894.8 Proteus pssA GO:0003674,GO:0003824,GO:0003882,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016780,GO:0017169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0071944 2.7.8.8 ko:K00998,ko:K06131 ko00260,ko00564,ko01100,ko01110,map00260,map00564,map01100,map01110 M00093 R01800,R07390 RC00002,RC00017,RC02795 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECH74115_1262.ECH74115_3822,iECSP_1301.ECSP_3532,iYL1228.KPN_02908 Bacteria 1MVPU@1224,1RN1V@1236,3Z1YK@583,COG1502@1,COG1502@2 NA|NA|NA I Phospholipase D. Active site motifs. Z1_03727 529507.PMI0396 6.2e-60 236.5 Proteus yfiM ko:K05811 ko00000 Bacteria 1N1EG@1224,1S9DQ@1236,3Z2U7@583,COG5544@1,COG5544@2 NA|NA|NA S Predicted periplasmic lipoprotein (DUF2279) Z1_03733 529507.PMI0395 0.0 1639.4 Proteus clpB GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006950,GO:0006986,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0010033,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0035966,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042802,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896 ko:K03694,ko:K03695 ko04213,map04213 ko00000,ko00001,ko03110 Bacteria 1MURH@1224,1RN55@1236,3Z38B@583,COG0542@1,COG0542@2 NA|NA|NA O Part of a stress-induced multi-chaperone system, it is involved in the recovery of the cell from heat-induced damage, in cooperation with DnaK, DnaJ and GrpE Z1_03734 529507.PMI0394 9.2e-138 496.1 Proteus yfiH GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005507,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0008150,GO:0008152,GO:0016491,GO:0016679,GO:0016682,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043167,GO:0043169,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046872,GO:0046914,GO:0046983,GO:0055114 ko:K05810 ko00000,ko01000 Bacteria 1MW2H@1224,1RNV4@1236,3Z1A4@583,COG1496@1,COG1496@2 NA|NA|NA S Multi-copper polyphenol oxidoreductase laccase Z1_03735 529507.PMI0393 6.6e-184 649.8 Proteus rluD GO:0000027,GO:0000154,GO:0000455,GO:0001522,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009982,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016853,GO:0016866,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0031118,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 5.4.99.23,5.4.99.28,5.4.99.29 ko:K06177,ko:K06180 ko00000,ko01000,ko03009,ko03016 iE2348C_1286.E2348C_2868,iECED1_1282.ECED1_3035,iECSF_1327.ECSF_2432 Bacteria 1MUBN@1224,1RN7F@1236,3Z10Z@583,COG0564@1,COG0564@2 NA|NA|NA J Responsible for synthesis of pseudouridine from uracil Z1_03736 529507.PMI0392 4.9e-131 473.8 Proteus bamD GO:0005575,GO:0005623,GO:0008104,GO:0008150,GO:0009279,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019867,GO:0022607,GO:0030312,GO:0030313,GO:0031224,GO:0031230,GO:0031241,GO:0031246,GO:0031975,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0043163,GO:0043165,GO:0044085,GO:0044091,GO:0044425,GO:0044462,GO:0044464,GO:0045184,GO:0045229,GO:0051179,GO:0051205,GO:0051234,GO:0051641,GO:0061024,GO:0070727,GO:0071709,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0098552,GO:0098796,GO:1990063 ko:K05807,ko:K08309 ko00000,ko01000,ko01011,ko02000 1.B.33.1 GH23 Bacteria 1MVS5@1224,1RSE6@1236,3Z1AU@583,COG4105@1,COG4105@2 NA|NA|NA M Part of the outer membrane protein assembly complex, which is involved in assembly and insertion of beta-barrel proteins into the outer membrane. Constitutes, with BamA, the core component of the assembly machinery Z1_03737 529507.PMI0391 2.4e-53 214.5 Proteus hpf GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006448,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009266,GO:0009409,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0015935,GO:0017148,GO:0019222,GO:0022626,GO:0022627,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034249,GO:0043021,GO:0043022,GO:0043024,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045900,GO:0045947,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0065007,GO:0080090,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113 ko:K05808,ko:K05809 ko00000,ko03009 Bacteria 1RD2Y@1224,1S6GT@1236,3Z2RE@583,COG1544@1,COG1544@2 NA|NA|NA J Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein Z1_03738 529507.PMI0390 2.1e-213 748.0 Proteus pheA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004106,GO:0004664,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006558,GO:0006570,GO:0006571,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009094,GO:0009095,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016835,GO:0016836,GO:0016853,GO:0016866,GO:0017144,GO:0019438,GO:0019752,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902221,GO:1902223 1.3.1.12,2.3.1.79,2.5.1.54,4.2.1.51,5.4.99.5 ko:K00661,ko:K03856,ko:K04092,ko:K04093,ko:K04516,ko:K04518,ko:K14170,ko:K14187 ko00400,ko00401,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map00401,map01100,map01110,map01130,map01230 M00022,M00024,M00025 R00691,R01373,R01715,R01728,R01826 RC00125,RC00360,RC00435,RC03116 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECNA114_1301.ECNA114_2667 Bacteria 1MU60@1224,1RNRD@1236,3Z1S9@583,COG0077@1,COG0077@2,COG1605@1,COG1605@2 NA|NA|NA E Psort location Cytoplasmic, score Z1_03739 529507.PMI0389 5.1e-243 846.7 Proteus dcuB GO:0003674,GO:0005215,GO:0005310,GO:0005342,GO:0005469,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006820,GO:0006835,GO:0006855,GO:0008150,GO:0008509,GO:0008514,GO:0015075,GO:0015138,GO:0015141,GO:0015238,GO:0015291,GO:0015297,GO:0015318,GO:0015556,GO:0015711,GO:0015740,GO:0015741,GO:0015744,GO:0015849,GO:0015893,GO:0016020,GO:0016021,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0031226,GO:0034220,GO:0042221,GO:0042493,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046942,GO:0046943,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071422,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098656,GO:1903825,GO:1905039 ko:K07791,ko:K07792 ko02020,map02020 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.13.1 iUMNK88_1353.UMNK88_4987 Bacteria 1MVHH@1224,1RPTE@1236,3Z10R@583,COG2704@1,COG2704@2 NA|NA|NA S Responsible for the transport of C4-dicarboxylates from the periplasm across the inner membrane Z1_03742 529507.PMI0388 1.3e-207 728.8 Proteus tyrA GO:0000166,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004106,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006558,GO:0006570,GO:0006571,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0008977,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009094,GO:0009095,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016053,GO:0016491,GO:0016627,GO:0016628,GO:0016853,GO:0016866,GO:0017144,GO:0019438,GO:0019752,GO:0036094,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0046417,GO:0048037,GO:0050662,GO:0051287,GO:0055114,GO:0070403,GO:0071704,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901265,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1902221,GO:1902223 1.3.1.12,1.3.1.13,1.3.1.43,5.4.99.5 ko:K00210,ko:K00211,ko:K00220,ko:K04092,ko:K04093,ko:K04517,ko:K14187 ko00400,ko00401,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,map00400,map00401,map01100,map01110,map01130,map01230 M00024,M00025,M00040 R00732,R01715,R01728,R01730 RC00125,RC03116 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECUMN_1333.ECUMN_2925 Bacteria 1MVUT@1224,1RQB3@1236,3Z1GU@583,COG0287@1,COG0287@2,COG1605@1,COG1605@2 NA|NA|NA E T-protein Z1_03743 529507.PMI0387 3.7e-207 727.2 Proteus aroF GO:0003674,GO:0003824,GO:0003849,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006082,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009072,GO:0009073,GO:0009987,GO:0016053,GO:0016740,GO:0016765,GO:0019438,GO:0019752,GO:0042802,GO:0043436,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046394,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 2.5.1.54 ko:K01626 ko00400,ko01100,ko01110,ko01130,ko01230,ko02024,map00400,map01100,map01110,map01130,map01230,map02024 M00022 R01826 RC00435 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iAF987.Gmet_2375,iAPECO1_1312.APECO1_3932,iECOK1_1307.ECOK1_2946,iECS88_1305.ECS88_2787,iUMN146_1321.UM146_03705,iUTI89_1310.UTI89_C2934 Bacteria 1MU5Q@1224,1RMAA@1236,3Z212@583,COG0722@1,COG0722@2 NA|NA|NA H phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, Tyr-sensitive (phospho-2-keto-3-deoxyheptonate aldolase) (DAHP synthetase) K01626 Z1_03744 529507.PMI0386 3.2e-56 224.2 Proteus rplS GO:0000027,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0016020,GO:0016043,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042273,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0065003,GO:0070180,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097159,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02884 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 Bacteria 1RH3A@1224,1S5XX@1236,3Z2R0@583,COG0335@1,COG0335@2 NA|NA|NA J This protein is located at the 30S-50S ribosomal subunit interface and may play a role in the structure and function of the aminoacyl-tRNA binding site Z1_03745 529507.PMI0385 9.7e-143 512.7 Proteus trmD GO:0000287,GO:0001510,GO:0002939,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009019,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016423,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016772,GO:0016779,GO:0030488,GO:0032259,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040007,GO:0042802,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0050518,GO:0052906,GO:0070567,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 2.1.1.228,4.6.1.12 ko:K00554,ko:K01770 ko00900,ko01100,ko01110,ko01130,map00900,map01100,map01110,map01130 M00096 R00597,R05637 RC00002,RC00003,RC00334,RC01440 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03016 Bacteria 1MUN1@1224,1RMWC@1236,3Z1PD@583,COG0336@1,COG0336@2 NA|NA|NA J Belongs to the RNA methyltransferase TrmD family Z1_03746 529507.PMI0384 9.3e-103 379.4 Proteus rimM GO:0000028,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0030490,GO:0034470,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034660,GO:0040007,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0090304,GO:1901360 ko:K02860 ko00000,ko03009 Bacteria 1MWQR@1224,1RNJ2@1236,3Z1AC@583,COG0806@1,COG0806@2 NA|NA|NA J An accessory protein needed during the final step in the assembly of 30S ribosomal subunit, possibly for assembly of the head region. Probably interacts with S19. Essential for efficient processing of 16S rRNA. May be needed both before and after RbfA during the maturation of 16S rRNA. It has affinity for free ribosomal 30S subunits but not for 70S ribosomes Z1_03747 471881.PROPEN_02624 4.8e-38 163.3 Proteus rpsP GO:0000028,GO:0000217,GO:0000400,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003735,GO:0003824,GO:0004518,GO:0004519,GO:0004520,GO:0004536,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015935,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016787,GO:0016788,GO:0019538,GO:0022607,GO:0022613,GO:0022618,GO:0022626,GO:0022627,GO:0032991,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042254,GO:0042255,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0065003,GO:0070925,GO:0071704,GO:0071826,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0090305,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904 ko:K02959 ko03010,map03010 M00178 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011,ko03029 Bacteria 1MZCT@1224,1S8RT@1236,3Z2UU@583,COG0228@1,COG0228@2 NA|NA|NA J Ribosomal protein S16 Z1_03748 529507.PMI0382 2.6e-234 817.8 Proteus ffh GO:0000166,GO:0001882,GO:0001883,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005618,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006605,GO:0006612,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0019001,GO:0030312,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0035639,GO:0036094,GO:0040007,GO:0042886,GO:0043167,GO:0043168,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046907,GO:0048500,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072657,GO:0090150,GO:0097159,GO:0097367,GO:1901265,GO:1901363,GO:1990904 3.6.5.4 ko:K03106 ko02024,ko03060,ko03070,map02024,map03060,map03070 M00335 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko02044 3.A.5.1,3.A.5.2,3.A.5.7,3.A.5.8,3.A.5.9 Bacteria 1MVIA@1224,1RMU9@1236,3Z2GF@583,COG0541@1,COG0541@2 NA|NA|NA U Involved in targeting and insertion of nascent membrane proteins into the cytoplasmic membrane. Binds to the hydrophobic signal sequence of the ribosome-nascent chain (RNC) as it emerges from the ribosomes. The SRP-RNC complex is then targeted to the cytoplasmic membrane where it interacts with the SRP receptor FtsY. Interaction with FtsY leads to the transfer of the RNC complex to the Sec translocase for insertion into the membrane, the hydrolysis of GTP by both Ffh and FtsY, and the dissociation of the SRP-FtsY complex into the individual components Z1_03749 529507.PMI0381 3.1e-139 501.1 Proteus ypjD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 Bacteria 1R3YD@1224,1RPUQ@1236,3Z16N@583,COG4137@1,COG4137@2 NA|NA|NA S Cytochrome C assembly protein Z1_03750 529507.PMI0380 1e-229 802.4 Proteus yfjD GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0044464,GO:0071944 ko:K03699 ko00000,ko02042 Bacteria 1NZ99@1224,1RNCE@1236,3Z1R5@583,COG4536@1,COG4536@2 NA|NA|NA P CBS domain-containing protein K00638 Z1_03751 529507.PMI0379 2.6e-94 351.3 Proteus luxS GO:0000096,GO:0000097,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006520,GO:0006534,GO:0006555,GO:0006575,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006790,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007267,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008652,GO:0009058,GO:0009066,GO:0009067,GO:0009069,GO:0009086,GO:0009116,GO:0009119,GO:0009372,GO:0009987,GO:0010699,GO:0016053,GO:0016829,GO:0016846,GO:0017144,GO:0019284,GO:0019752,GO:0023052,GO:0033353,GO:0034641,GO:0042278,GO:0043094,GO:0043102,GO:0043436,GO:0043768,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044272,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044764,GO:0046128,GO:0046394,GO:0046439,GO:0046483,GO:0046498,GO:0046500,GO:0051186,GO:0051704,GO:0055086,GO:0071265,GO:0071267,GO:0071704,GO:0072521,GO:1901135,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901607,GO:1901657 4.4.1.21 ko:K07173 ko00270,ko01100,ko01230,ko02024,ko02026,ko05111,map00270,map01100,map01230,map02024,map02026,map05111 M00609 R01291 RC00069,RC01929 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iECIAI39_1322.ECIAI39_2877,iPC815.YPO3300 Bacteria 1MWQF@1224,1RMDZ@1236,3Z1P0@583,COG1854@1,COG1854@2 NA|NA|NA H Involved in the synthesis of autoinducer 2 (AI-2) which is secreted by bacteria and is used to communicate both the cell density and the metabolic potential of the environment. The regulation of gene expression in response to changes in cell density is called quorum sensing. Catalyzes the transformation of S-ribosylhomocysteine (RHC) to homocysteine (HC) and 4,5- dihydroxy-2,3-pentadione (DPD) Z1_03752 529507.PMI0378 2.2e-311 1073.5 Proteus gshA GO:0003674,GO:0003824,GO:0004357,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006518,GO:0006575,GO:0006749,GO:0006750,GO:0006790,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006970,GO:0006972,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009628,GO:0009987,GO:0010035,GO:0010038,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0019184,GO:0034641,GO:0042221,GO:0042398,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044272,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046685,GO:0046689,GO:0046872,GO:0050896,GO:0051186,GO:0051188,GO:0051716,GO:0070887,GO:0071241,GO:0071243,GO:0071248,GO:0071288,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.3.2.2 ko:K01919 ko00270,ko00480,ko01100,map00270,map00480,map01100 M00118 R00894,R10993 RC00064,RC00090 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 iEC042_1314.EC042_2885 Bacteria 1MW9B@1224,1RPNQ@1236,3Z1M0@583,COG2918@1,COG2918@2 NA|NA|NA H Glutamate-cysteine ligase Z1_03759 471881.PROPEN_02640 2e-25 120.9 Proteus csrA GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003729,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005979,GO:0006109,GO:0006139,GO:0006417,GO:0006446,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010608,GO:0010629,GO:0010675,GO:0010677,GO:0010906,GO:0010962,GO:0016070,GO:0016071,GO:0017148,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032268,GO:0032269,GO:0032881,GO:0032885,GO:0034248,GO:0034249,GO:0034641,GO:0043170,GO:0043255,GO:0043467,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045719,GO:0045912,GO:0045947,GO:0046483,GO:0048027,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051246,GO:0051248,GO:0060255,GO:0062012,GO:0065007,GO:0070873,GO:0070874,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:2000112,GO:2000113 ko:K03563 ko02020,ko02025,ko02026,ko05111,map02020,map02025,map02026,map05111 ko00000,ko00001,ko03019 Bacteria 1N6PG@1224,1SCB4@1236,3Z2ZE@583,COG1551@1,COG1551@2 NA|NA|NA J Could accelerate the degradation of some genes transcripts potentially through selective RNA binding Z1_03760 529507.PMI0376 6.1e-109 400.2 Proteus alaS GO:0001130,GO:0001131,GO:0001141,GO:0001217,GO:0002161,GO:0002196,GO:0003674,GO:0003700,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004813,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006355,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006419,GO:0006450,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009451,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0016070,GO:0016597,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019752,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031406,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0036094,GO:0042802,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043412,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0052689,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0106074,GO:0140098,GO:0140101,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 6.1.1.7 ko:K01872 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03038 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016 iECABU_c1320.ECABU_c29670,iECED1_1282.ECED1_3146,iEcHS_1320.EcHS_A2833,iJN746.PP_4474 Bacteria 1MU9A@1224,1RMWZ@1236,3Z0YZ@583,COG0013@1,COG0013@2 NA|NA|NA J Catalyzes the attachment of alanine to tRNA(Ala) in a two-step reaction alanine is first activated by ATP to form Ala- AMP and then transferred to the acceptor end of tRNA(Ala). Also edits incorrectly charged Ser-tRNA(Ala) and Gly-tRNA(Ala) via its editing domain # 3517 queries scanned # Total time (seconds): 53.0047090054 # Rate: 66.35 q/s