# PHI Pathogen species MAG.C2.12 MAG.T11.11 MAG.T11.14 MAG.T11.1 MAG.T13.20 MAG.T11.24 MAG.T11.25 MAG.T11.56 MAG.T11.57 MAG.T12.26 MAG.T13.29 MAG.T11.59 MAG.T11.72 MAG.T11.77 MAG.T12.46 MAG.T12.69 MAG.T13.57 MAG.T13.59 MAG.T13.60 MAG.T13.71 MAG.T13.83 MAG.T13.85 MAG.T23.60 MAG.T21.30 MAG.T13.90 MAG.T21.39 MAG.T21.70 MAG.T22.48 MAG.T22.49 MAG.T22.36 MAG.T23.20 MAG.T23.24 MAG.T23.71 Acidovorax avenae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Acidovorax citrulli 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 3.0 5.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 2.0 1.0 0.0 3.0 0.0 0.0 1.0 Acidovorax oryzae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 2.0 3.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Acinetobacter baumannii 2.0 1.0 5.0 2.0 1.0 1.0 1.0 0.0 3.0 5.0 6.0 1.0 2.0 1.0 3.0 0.0 1.0 1.0 1.0 3.0 2.0 1.0 1.0 0.0 1.0 3.0 3.0 2.0 1.0 3.0 3.0 1.0 0.0 Acinetobacter nosocomialis 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 Actinobacillus pleuropneumoniae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 2.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Agrobacterium tumefaciens 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 Alternaria alternata 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Alternaria brassicicola 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Alternaria longipes 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Aspergillus fumigatus 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 3.0 4.0 0.0 1.0 1.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 2.0 2.0 1.0 0.0 Aspergillus nidulans 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Bacillus cereus 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 2.0 0.0 Beauveria bassiana 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Bordetella pertussis 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 0.0 Borreliella burgdorferi 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Botrytis cinerea 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 Brucella abortus 1.0 1.0 3.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 4.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 3.0 1.0 2.0 3.0 0.0 0.0 Brucella melitensis 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.0 0.0 Burkholderia cenocepacia 0.0 1.0 2.0 2.0 2.0 0.0 3.0 0.0 1.0 1.0 7.0 2.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 2.0 2.0 0.0 3.0 2.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Burkholderia glumae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 5.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 5.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 Burkholderia pseudomallei 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Candida albicans 1.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 1.0 Cercospora apii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Cercospora beticola 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Citrobacter rodentium 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Claviceps purpurea 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 Clostridioides difficile 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Colletotrichum graminicola 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 Colletotrichum higginsianum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Colletotrichum lagenaria 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Corynebacterium diphtheriae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Cryptococcus neoformans 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Dickeya dadantii 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.0 6.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.0 0.0 6.0 0.0 5.0 1.0 0.0 0.0 Dickeya oryzae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 2.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Dickeya solani 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Dickeya zeae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Edwardsiella ictaluri 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Edwardsiella tarda 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Enterococcus faecalis 5.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 3.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Erwinia amylovora 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 5.0 5.0 2.0 0.0 5.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 1.0 1.0 0.0 2.0 5.0 1.0 4.0 1.0 5.0 3.0 1.0 0.0 Escherichia coli 1.0 0.0 5.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 8.0 15.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.0 1.0 7.0 0.0 6.0 3.0 0.0 0.0 Exserohilum turcicum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Flavobacterium psychrophilum 2.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Francisella tularensis 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 2.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 3.0 0.0 1.0 0.0 Fusarium asiaticum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Fusarium fujikuroi 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 Fusarium graminearum 0.0 1.0 2.0 2.0 3.0 1.0 4.0 1.0 2.0 2.0 4.0 3.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 2.0 1.0 2.0 2.0 2.0 2.0 1.0 1.0 1.0 3.0 4.0 2.0 0.0 2.0 4.0 0.0 Fusarium oxysporum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Fusarium verticillioides 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Glaesserella parasuis 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Haemophilus ducreyi 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Haemophilus influenzae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Helicobacter pylori 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 2.0 0.0 1.0 2.0 1.0 0.0 1.0 1.0 2.0 2.0 1.0 2.0 1.0 2.0 0.0 1.0 0.0 2.0 2.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 Kingella kingae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Klebsiella pneumoniae 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 1.0 3.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 2.0 2.0 0.0 2.0 2.0 1.0 0.0 Legionella pneumophila 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 1.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 Leptospira interrogans 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Listeria monocytogenes 7.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 3.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 2.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Lonsdalea quercina 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Magnaporthe oryzae 0.0 0.0 3.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 2.0 1.0 3.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 3.0 1.0 2.0 1.0 0.0 0.0 3.0 2.0 0.0 Metarhizium acridum 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 Metarhizium anisopliae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Metarhizium robertsii 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 Mycobacterium avium 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Mycobacterium canettii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Mycobacterium marinum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Mycobacterium tuberculosis 1.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 60.0 0.0 1.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 15.0 0.0 2.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 Mycobacteroides abscessus 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Mycolicibacterium smegmatis 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 8.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 2.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Neisseria meningitidis 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Orbilia oligospora 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Pantoea ananatis 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 Pantoea stewartii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Paracidovorax citrulli 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 2.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Parastagonospora nodorum 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Pectobacterium atrosepticum 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Pectobacterium carotovorum 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 Porphyromonas gingivalis 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 2.0 1.0 1.0 1.0 2.0 0.0 0.0 1.0 Proteus mirabilis 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Pseudomonas aeruginosa 6.0 0.0 8.0 1.0 2.0 4.0 2.0 2.0 1.0 28.0 19.0 2.0 3.0 6.0 2.0 4.0 5.0 2.0 1.0 2.0 1.0 1.0 3.0 1.0 1.0 14.0 4.0 9.0 4.0 13.0 6.0 4.0 1.0 Pseudomonas cichorii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Pseudomonas fluorescens 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Pseudomonas savastanoi 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Pseudomonas syringae 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 5.0 7.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 3.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 Ralstonia solanacearum 3.0 1.0 4.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 5.0 7.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 5.0 4.0 9.0 0.0 4.0 3.0 0.0 0.0 Saccharomyces cerevisiae 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Salmonella enterica 9.0 2.0 6.0 1.0 3.0 3.0 2.0 2.0 4.0 21.0 25.0 3.0 3.0 6.0 4.0 1.0 3.0 2.0 1.0 4.0 2.0 2.0 2.0 4.0 4.0 14.0 4.0 17.0 5.0 20.0 10.0 2.0 1.0 Sclerotinia sclerotiorum 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Shigella flexneri 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Staphylococcus aureus 10.0 3.0 1.0 1.0 2.0 3.0 0.0 2.0 2.0 3.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 4.0 2.0 2.0 2.0 1.0 0.0 2.0 1.0 1.0 2.0 1.0 3.0 3.0 2.0 5.0 3.0 2.0 1.0 Stenotrophomonas maltophilia 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Streptococcus agalactiae 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Streptococcus pneumoniae 2.0 0.0 1.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 Streptococcus pyogenes 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Streptococcus suis 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Toxoplasma gondii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Ustilaginoidea virens 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Ustilago maydis 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 Verticillium dahliae 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Vibrio alginolyticus 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Vibrio campbellii 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Vibrio cholerae 9.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 8.0 4.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 4.0 1.0 3.0 0.0 4.0 1.0 0.0 0.0 Vibrio tasmaniensis 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 Xanthomonas albilineans 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Xanthomonas campestris 5.0 0.0 7.0 0.0 0.0 4.0 0.0 0.0 0.0 8.0 10.0 0.0 1.0 4.0 0.0 1.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 13.0 3.0 8.0 1.0 31.0 4.0 2.0 1.0 Xanthomonas citri 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 4.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 3.0 1.0 7.0 1.0 0.0 0.0 Xanthomonas oryzae 8.0 0.0 6.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 8.0 16.0 0.0 0.0 4.0 0.0 3.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 1.0 10.0 8.0 11.0 0.0 28.0 4.0 3.0 0.0 Xylella fastidiosa 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Yersinia enterocolitica 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 1.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 Yersinia pestis 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 2.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 Yersinia ruckeri 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0 0.0 Zymoseptoria tritici 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.0 0.0