样本在存储、运输及测序的过程中均有可能被污染,从而导致测序数据中出现其他物种的转录本(外源污染)或其他类型的RNA序列(内源污染)。我们使用FastQ Screen检测经过fastp过滤后的序列是否存在上述两类污染。
Human | Mouse | Rat | Drosophila | Worm | Yeast | Arabidopsis | Ecoli | rRNA | MT | PhiX | Lambda | Vectors | Adapters | |
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test1_1 | 1.03 | 1.27 | 1.35 | 0.95 | 0.33 | 0.41 | 0.35 | 0.00 | 0.14 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.02 |
test2_1 | 0.91 | 1.09 | 1.19 | 0.83 | 0.26 | 0.32 | 0.29 | 0.00 | 0.10 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.01 |
test3_1 | 0.88 | 1.07 | 1.14 | 0.85 | 0.28 | 0.34 | 0.28 | 0.00 | 0.09 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.00 |
test4_1 | 1.02 | 1.27 | 1.36 | 0.95 | 0.34 | 0.47 | 0.45 | 0.00 | 0.23 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.01 |
test5_1 | 0.86 | 1.04 | 1.13 | 0.75 | 0.28 | 0.33 | 0.31 | 0.00 | 0.16 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.08 | 0.01 |
test6_1 | 1.00 | 1.21 | 1.22 | 0.89 | 0.33 | 0.36 | 0.28 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | 0.01 |
test7_1 | 0.96 | 1.16 | 1.22 | 0.87 | 0.30 | 0.34 | 0.23 | 0.00 | 0.07 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.00 |
test8_1 | 0.95 | 1.19 | 1.24 | 0.90 | 0.29 | 0.36 | 0.29 | 0.00 | 0.12 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.00 |
test9_1 | 0.97 | 1.18 | 1.26 | 0.90 | 0.31 | 0.37 | 0.24 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.00 |
test1_2 | 1.21 | 1.47 | 1.55 | 0.87 | 0.59 | 0.38 | 0.36 | 0.00 | 0.17 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.01 |
test2_2 | 1.12 | 1.39 | 1.43 | 0.80 | 0.52 | 0.31 | 0.30 | 0.01 | 0.12 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.32 | 0.00 |
test3_2 | 1.18 | 1.37 | 1.45 | 0.84 | 0.57 | 0.32 | 0.25 | 0.00 | 0.09 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.00 |
test4_2 | 1.17 | 1.40 | 1.51 | 0.92 | 0.53 | 0.44 | 0.43 | 0.00 | 0.22 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.26 | 0.00 |
test5_2 | 1.16 | 1.40 | 1.46 | 0.84 | 0.57 | 0.38 | 0.32 | 0.00 | 0.16 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.01 |
test6_2 | 1.30 | 1.62 | 1.68 | 0.96 | 0.69 | 0.37 | 0.29 | 0.00 | 0.10 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.44 | 0.00 |
test7_2 | 1.15 | 1.43 | 1.47 | 0.85 | 0.57 | 0.32 | 0.23 | 0.00 | 0.08 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.34 | 0.00 |
test8_2 | 1.25 | 1.52 | 1.60 | 0.88 | 0.63 | 0.41 | 0.30 | 0.00 | 0.13 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.36 | 0.00 |
test9_2 | 1.22 | 1.50 | 1.60 | 0.89 | 0.56 | 0.34 | 0.24 | 0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.00 |