样本在存储、运输及测序的过程中均有可能被污染,从而导致测序数据中出现其他物种的转录本(外源污染)或其他类型的RNA序列(内源污染)。我们使用FastQ Screen检测经过fastp过滤后的序列是否存在上述两类污染。

Human Mouse Rat Drosophila Worm Yeast Arabidopsis Ecoli rRNA MT PhiX Lambda Vectors Adapters
test1_1 1.03 1.27 1.35 0.95 0.33 0.41 0.35 0.00 0.14 0.00 0.0 0.0 0.05 0.02
test2_1 0.91 1.09 1.19 0.83 0.26 0.32 0.29 0.00 0.10 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01
test3_1 0.88 1.07 1.14 0.85 0.28 0.34 0.28 0.00 0.09 0.00 0.0 0.0 0.02 0.00
test4_1 1.02 1.27 1.36 0.95 0.34 0.47 0.45 0.00 0.23 0.00 0.0 0.0 0.07 0.01
test5_1 0.86 1.04 1.13 0.75 0.28 0.33 0.31 0.00 0.16 0.00 0.0 0.0 0.08 0.01
test6_1 1.00 1.21 1.22 0.89 0.33 0.36 0.28 0.00 0.10 0.00 0.0 0.0 0.09 0.01
test7_1 0.96 1.16 1.22 0.87 0.30 0.34 0.23 0.00 0.07 0.01 0.0 0.0 0.05 0.00
test8_1 0.95 1.19 1.24 0.90 0.29 0.36 0.29 0.00 0.12 0.00 0.0 0.0 0.04 0.00
test9_1 0.97 1.18 1.26 0.90 0.31 0.37 0.24 0.00 0.10 0.00 0.0 0.0 0.02 0.00
test1_2 1.21 1.47 1.55 0.87 0.59 0.38 0.36 0.00 0.17 0.00 0.0 0.0 0.33 0.01
test2_2 1.12 1.39 1.43 0.80 0.52 0.31 0.30 0.01 0.12 0.00 0.0 0.0 0.32 0.00
test3_2 1.18 1.37 1.45 0.84 0.57 0.32 0.25 0.00 0.09 0.00 0.0 0.0 0.33 0.00
test4_2 1.17 1.40 1.51 0.92 0.53 0.44 0.43 0.00 0.22 0.00 0.0 0.0 0.26 0.00
test5_2 1.16 1.40 1.46 0.84 0.57 0.38 0.32 0.00 0.16 0.00 0.0 0.0 0.33 0.01
test6_2 1.30 1.62 1.68 0.96 0.69 0.37 0.29 0.00 0.10 0.01 0.0 0.0 0.44 0.00
test7_2 1.15 1.43 1.47 0.85 0.57 0.32 0.23 0.00 0.08 0.00 0.0 0.0 0.34 0.00
test8_2 1.25 1.52 1.60 0.88 0.63 0.41 0.30 0.00 0.13 0.00 0.0 0.0 0.36 0.00
test9_2 1.22 1.50 1.60 0.89 0.56 0.34 0.24 0.00 0.10 0.00 0.0 0.0 0.33 0.00